目的·评估白细胞介素-1B(interleukin-1B,IL-1B)-511C/T基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)发生风险的关联。方法·检索PubMed、Web of Science、Scopus和Embase数据库中已公开发表的关于IL-1B-511C/T基因多态性与...
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目的·评估白细胞介素-1B(interleukin-1B,IL-1B)-511C/T基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)发生风险的关联。方法·检索PubMed、Web of Science、Scopus和Embase数据库中已公开发表的关于IL-1B-511C/T基因多态性与冠心病的病例对照研究。检索时间为各数据库建库至2021年6月。由2名研究人员独立进行文献筛选及数据提取。提取的数据包括第一作者姓名、发表年份、研究对象的种族、匹配因素、对照组来源、基因分型方法、样本量、基因型计数、等位基因计数、是否满足哈迪-温伯格平衡定律。采用Stata 16.0软件进行meta分析。结果·共纳入9篇文献,包括2190例冠心病患者和2385例对照者。Meta分析结果显示,IL-1B-511C/T基因多态性与冠心病发生风险间无明显统计学相关(T vs C:OR=1.21,95%CI 0.91~1.61;TT+CT vs CC:OR=1.24,95%CI 0.88~1.75;CC+CT vs TT:OR=1.28,95%CI 0.86~1.90)。亚组分析结果显示,在中国人群中与携带C等位基因和CC基因型的个体相比,携带T等位基因和TT+CT基因型的个体发生冠心病的风险分别增加了85%和116%(T vs C:OR=1.85,95%CI 1.02~3.36;TT+CT vs CC:OR=2.16,95%CI 1.10~4.24)。在以医院为基础的病例对照研究中,与携带CC+CT基因型的人群相比,携带TT基因型的人群发生冠心病的风险增加了59%(OR=1.59,95%CI 1.03~2.47)。结论·IL-1B-511C/T基因多态性与冠心病发生风险间无明显关联。在中国人群中,携带T等位基因和TT+TC基因型的个体的冠心病发生风险较高。
目的:通过生物信息学分析以及细胞生物学实验研究角蛋白6A(keratin6A,KRT6A)对胰腺导管癌(PDAC)诊断、预后判断、免疫微环境以及PDAC细胞 PANC1增殖、凋亡等生物学行为的影响。方法:通过GEPIA平台整合TCGA(The Cancer Genome At...
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目的:通过生物信息学分析以及细胞生物学实验研究角蛋白6A(keratin6A,KRT6A)对胰腺导管癌(PDAC)诊断、预后判断、免疫微环境以及PDAC细胞 PANC1增殖、凋亡等生物学行为的影响。方法:通过GEPIA平台整合TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库与GTEx(Genotype-Tissue)数据库中的数据,分析KTRT6A在PDAC组织中的表达情况,并通过CIBERSORT工具分析KRT6A表达与PDAC组织中免疫细胞浸润的相关性,然后通过GSEA方法研究与KRT6A基因表达相关的肿瘤信号通路。选取长海医院病理科保存的60例PDAC患者的癌与癌旁组织标本进行免疫组化分析,验证KRT6A在肿瘤组织中表达情况;通过干扰RNA抑制PANC1细胞中KRT6A基因的表达,通过CCK-8实验以及流式细胞术检测KRT6A对PDAC细胞的增殖、凋亡的影响。结果:利用TCGA与GTEx数据库数据分析发现,KRT6A在人PDAC组织中高表达,且与患者较差的生存期存在关联(P=0.015)。利用CIBERSORT软件以及GSEA分析发现,KRT6A高表达的PDAC组织中M2型巨噬细胞浸润性增高(P=0.034),且与Wnt通路(NES:1.7359272,P<0.05)、磷酸戊糖途径(PPP)代谢途径(NES:1.5613053,P<0.05)等信号通路上调有关(P<0.05或P<0.01);免疫组化结果进一步验证了PDAC组织中KRT6A高表达(P<0.001)。增殖和凋亡实验发现,干扰KRT6A能够显著抑制PANC1细胞的增殖(P<0.05)以及凋亡(P<0.001)。结论:KRT6A在人PDAC组织中呈高表达,敲降其表达能够抑制PANC1细胞的增殖和凋亡,具有作为PDAC诊断与预后判断新靶标的潜力。
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