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T=题名（书名、题名），A=作者（责任者），K=主题词，P=出版物名称，PU=出版社名称，O=机构（作者单位、学位授予单位、专利申请人），L=中图分类号，C=学科分类号，U=全部字段，Y=年（出版发行年、学位年度、标准发布年）

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AND代表“并且”；OR代表“或者”；NOT代表“不包含”；(注意必须大写,运算符两边需空一格)

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范例一：(K=图书馆学 OR K=情报学) AND A=范并思 AND Y=1982-2016
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白血病样本环行RNA的预测测序与鉴定

白血病样本环行RNA的预测测序与鉴定

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华东地区生物化学与分子生物学学会联合会2017年学术交流会暨安徽省生物化学与分子生物学学会理事会议

作者：鲁博蒋天龙朱兵杨帆杨振宇肖璠聂作明浙江理工大学生命科学学院

环形RNA(circRNA)分子是生物体基因表达过程中普遍存在的一类特定RNA分子,而这些环状的RNA分子往往在过去我们的RNA分离过程中被忽略。近来研究发现,circRNA作为一种重要的调控RNA分子,在生物体生长发育和生物学过程中起重要的调控作用... 详细信息

环形RNA(circRNA)分子是生物体基因表达过程中普遍存在的一类特定RNA分子,而这些环状的RNA分子往往在过去我们的RNA分离过程中被忽略。近来研究发现,circRNA作为一种重要的调控RNA分子,在生物体生长发育和生物学过程中起重要的调控作用。同时,circRNA和多个疾病的发生有重要的关联,在动脉粥样硬化、神经系统紊乱、糖尿病和肿瘤等疾病的发病过程中起重要的调控作用。因此,circRNA的研究对于这些疾病的预防、诊断和治疗具有重要的意义。根据环行RNA的成环特征和内外显子剪切位点边界AG-GU特征序列,我们采用perl语言编写了高通量测序数据中circRNA的预测软件,通过该软件从白血病干细胞样本高通量测序数据(SRA数据库登录号:ERR537970)中预测潜在的环行RNA分子1 33条,这些序列具有成环特征;同时我们提取白血病骨髓组织进行细胞培养,提取培养细胞的总RNA,通过除rRNA试剂盒去除其中的rRNA后进行circRNA的高通量测序,共获得23581445个测序read。采用环形RNA预测软件CIRCexplorer从获得的高通量测序read中预测潜在环形RNA,共获得潜在环行RNA分子178条,随机选取上述获得的10条潜在的环行RNA,设计特异性的正反向PCR引物对,通过正反向PCR进一步开展环形RNA的鉴定,结果显示,在选取的潜在环形RNA中,有6条通过PCR实验鉴定。本结果为环行RNA在白血病机制中的进一步功能研究打下基础。

关键词： RNA 白血病

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中国功能性消化不良专家共识意见(2015年,上海)

中国功能性消化不良专家共识意见(2015年,上海)

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湖北省医学会内科学分会2016年学术会议

消化不良(dyspepsia)是临床常见的一组上腹部症状,包括器质性和功能性两大类病因.本研究针对功能性消化不良进行分析，共分为定义、流行病学、病因和发病机制、诊断和评估、治疗等5大部分共26条。

关键词：功能性消化不良流行病学发病机制诊断技术临床治疗

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胃上皮特异性敲除Smad4导致小鼠胃癌发生

胃上皮特异性敲除Smad4导致小鼠胃癌发生

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第三届“模式生物与人类健康”发育遗传学全国学术研讨会

作者：李修彬王博婧孙彦洵滕艳杨晓军事医学科学院生物工程研究所发育和疾病遗传学研究室

胃癌是一种严重威胁国民健康的常见恶性肿瘤。Smad4作为抑癌基因在胃癌中常出现缺失,突变或者表达下降。以前的研究发现微环境如T细胞Smad4对于维持胃肠道上皮稳态至关重要。但上皮细胞Smad4在胃癌发生发展中的功能未见报道。在本研究... 详细信息

胃癌是一种严重威胁国民健康的常见恶性肿瘤。Smad4作为抑癌基因在胃癌中常出现缺失,突变或者表达下降。以前的研究发现微环境如T细胞Smad4对于维持胃肠道上皮稳态至关重要。但上皮细胞Smad4在胃癌发生发展中的功能未见报道。在本研究中我们利用Cre-loxp系统介导的组织特异性基因敲除技术在小鼠腺胃上皮细胞特异性敲除Smad4基因,并研究Smad4基因敲除对胃癌发生及发展的影响。首先我们研制了一种新的胃上皮细胞特异性Cre重组酶转基因小鼠,

关键词：胃癌发生 Smad4 特异性

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中国肠易激综合征专家共识意见(2015年,上海)

中国肠易激综合征专家共识意见(2015年,上海)

引用

湖北省医学会内科学分会2016年学术会议

IBS是临床常见的一组以腹痛、腹胀、腹部不适伴排便习惯改变为主要症状的临床综合征.2003年我国即制订了IBS诊断与治疗共识意见,2007年又进行了修订.近些年来国内外对于IBS的诊治有了新的认识,特别是我国学者对于IBS的临床实践与研究不... 详细信息

IBS是临床常见的一组以腹痛、腹胀、腹部不适伴排便习惯改变为主要症状的临床综合征.2003年我国即制订了IBS诊断与治疗共识意见,2007年又进行了修订.近些年来国内外对于IBS的诊治有了新的认识,特别是我国学者对于IBS的临床实践与研究不断深入,获得了不少国人的资料.因此,有必要结合我国的研究资料和国际最新的共识意见,对我国IBS共识意见进行更新.本共识意见分为定义与流行病学、病因与发病机制、诊断、治疗等4个部分,共28条.

关键词：肠易激综合征流行病学发病机制诊断技术临床治疗

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林可酰胺类化合物酰胺键形成的关键蛋白CcbD的晶体学初步研究

林可酰胺类化合物酰胺键形成的关键蛋白CcbD的晶体学初步研究

引用

作者：李牡林中国科学院大学

学位级别：硕士

林可霉素（一般指其A组分，Lincomycin A）和天青菌素(Celesticetin)属于林可酰胺类抗生素家族中两个代表性的化合物，二者的化学结构十分相似，生物合成基因簇也高度同源。其分子结构中保守的酰胺键的形成经体内、体外实验证实是由LmbA... 详细信息

林可霉素（一般指其A组分，Lincomycin A）和天青菌素(Celesticetin)属于林可酰胺类抗生素家族中两个代表性的化合物，二者的化学结构十分相似，生物合成基因簇也高度同源。其分子结构中保守的酰胺键的形成经体内、体外实验证实是由LmbA、LmbN以及LmbD三个蛋白共同完成。LmbA是一个腺苷化蛋白;LmbN是一个双结构域蛋白，其N端为一个肽酰载体结构域，C端为一个异构化结构域;LmbD是一个缩合蛋白。由于酰胺键形成过程中的详细机理至今尚不清楚，催化酰胺键形成的关键残基也属未知，因此，我们计划通过功能相同的LmbD蛋白和CcbD蛋白的对比研究，以及二者的晶体结构来阐明林可酰胺键形成的机理。\n 前期研究和尝试表明，LmbD始终无法拿到可溶性的蛋白，于是，我们转而使用LmbD的同源蛋白CcbD来开展相关的实验。但是，CcbD蛋白的表达也存在很多问题:使用大肠杆菌异源表达出来的目的蛋白总是呈现多条带，均一性差，无法进行后续的结晶实验。于是，我们尝试在不同的温度下进行诱导表达，并在不同的温度下进行蛋白纯化，以及尝试使用不同的宿主菌来表达目的蛋白，最后，我们解决了CcbD蛋白表达困难的问题，使用*** Rosetta(DE3)宿主菌在16℃条件下进行诱导表达，能够获得稳定的目的蛋白，并可以进行大量的分离纯化。\n 继而，我通过多步的柱层析法制备了高纯度的蛋白，采用座滴式气相扩散法培养得到了单晶。但是经过一系列优化后，晶体的衍射质量不好。于是，我们进一步尝试对CcbD蛋白截短表达。获得截短体△D1蛋白后，进行体外活性测试，在确定截短体△D1蛋白具有同CcbD全长蛋白相同的生物活性的基础上，再进行晶体筛选，获得单晶后，经过一系列的优化，获得了晶型良好的晶体，不过晶体的衍射情况依然不佳。最后，我们使用硒代的CcbD截短体△D1蛋白单晶，经过一系列优化和冷冻保护剂筛选，最后采用不同浓度的甘油梯度保护，拿得了更好的单晶，并在上海同步辐射光源中心收集到一套3.15(A)的硒代衍射数据，由此确定了CcbD晶体的空间群，晶胞参数等信息。\n 由于CcbD蛋白没有结构已知的同源蛋白，需要通过硒代来寻找相位，相应的工作正在进行中。我们的工作为后期CcbD蛋白催化的酰胺键形成的机理研究打下了坚实的基础，后续实验我们仍在进行，希望通过重新截短，或者采用近年来发展的多套数据整合的方法，解出CcbD蛋白的晶体结构，为酰胺键形成的机理研究提供理论依据。

关键词：林可酰胺化合物酰胺键 CcbD蛋白晶体结构

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溪黄草和狭基线纹香茶菜的化学成分及其生物活性研究

溪黄草和狭基线纹香茶菜的化学成分及其生物活性研究

引用

作者：万俊中国科学院大学

学位级别：硕士

本论文由三章组成，第一章论述了产自四川省峨眉山的唇形科香茶菜属药用植物溪黄草[Isodon serra(Maxim.) Hara]的化学成分及其生物活性研究;第二章论述了产自四川省盐源县的狭基线纹香茶菜[Isodon lophanthoides(Buch.-*** ***)*** ***... 详细信息

本论文由三章组成，第一章论述了产自四川省峨眉山的唇形科香茶菜属药用植物溪黄草[Isodon serra(Maxim.) Hara]的化学成分及其生物活性研究;第二章论述了产自四川省盐源县的狭基线纹香茶菜[Isodon lophanthoides(Buch.-*** ***)*** ***(Benth.)***]的化学成分研究;第三章综述了40余年来对溪黄草药材的化学成分和生物活性的研究进展。　　利用各种分离材料和技术，现代波谱学方法及单晶X-射线衍射等手段，从上述两种香茶菜植物中共分离鉴定了70个化合物，其中新化合物有33个。化合物结构类型涉及二萜（包括对映-贝壳杉烷型、对映-松香烷型、松香烷型及其二聚体、异海松烷型和半日花烷型）、三萜、木脂素、降倍半萜和脂肪酸。新化合物结构类型为二萜和降倍半萜类化合物。从溪黄草中发现了具有罕见1，10-开裂对映-贝壳杉烷型二萜;从狭基线纹香茶菜中发现了罕见的C-20位甲基迁移到C-1位的松香烷型二萜和C-18位甲基迁移到C-3位的松香烷型二萜。以上研究结果进一步丰富了香茶菜属植物二萜化合物的研究内容，同时进一步说明了不同生境下该属植物次生代谢产物的化学多样性。　　对从溪黄草中分离得到的大部分二萜进行了抗肿瘤细胞毒活性和抗炎活性筛选，其中一些化合物表现出较强的活性。如化合物4，13和20对五株人肿瘤细胞均表现出显著的细胞毒活性(IC50=0.67-4.43μM)，且化合物4和20对由LPS诱导的RAW264.7细胞内NO的生成表现出较好的抑制效应(IC50=0.59，0.25μM)。以上研究结果为溪黄草的民间药效物质基础研究奠定了一定的基础，为进一步开展香茶菜属植物中对映-贝壳杉烷型二萜在抗肿瘤方面的应用基础研究提供了新的科学依据。　　第一章溪黄草的化学成分及其生物活性研究　　溪黄草[Isodon serra(Maxim.) Hara]为唇形科香茶菜属植物，主产于长江以南的广东、福建和江浙等省区，为民间用药，于2010年收录进药典中，具有退黄祛湿、凉血散瘀的功效，用于治疗急性黄疸型肝炎、急性胆囊炎、痢疾和肠炎等病症。前人曾对河南、湖北、上海及广东等地产的该种植物进行过化学成分及生物活性的研究，但对四川产的溪黄草却未有相关的研究报道。因此，为了寻找更多具有潜在抗肿瘤和抗炎活性的新颖结构二萜化合物，我们对采自四川省峨眉山地区的溪黄草地上部分次生代谢产物及其生物活性进行了系统性的研究。　　从其70％的丙酮提取物中共分离鉴定了42个化合物，包括二萜类化合物30个，新化合物16个。其中化合物22是具有罕见的1，10-开裂的对映-贝壳杉烷型二萜;化合物7为具有罕见的C-13和C-17同时氧化的对映-贝壳杉烷型二萜。同时，对得到的部分二萜化合物进行了细胞毒活性和抗炎活性筛选，其中，化合物4，13和20对五株肿瘤细胞均表现出显著的细胞毒活性，且化合物4和20表现出较强的抗炎活性。　　第二章狭基线纹香茶菜的化学成分研究　　狭基线纹香茶菜[Isodon lophanthoides(Buch.-*** ***)*** ***(Benth.)***]为香茶菜属植物线纹香茶菜的狭基变种，主产于西藏、云南、四川和甘肃等地。民间常将其作为溪黄草药材的一种替代药材，治疗急性黄疸型肝炎和胆囊炎，并可驱蛔虫。前人曾对产自云南、广西、广东和浙江等地的该种植物进行过化学成分研究，研究表明其主要含三环类二萜化合物，部分化合物具有较强的抗肝炎活性。鉴于前人对该种植物的研究并不深入，为了寻找出活性较好且结构新颖的二萜类化合物，我们对产自四川省凉山州盐源县的狭基线纹香茶菜地上部分开展了系统的化学成分研究。　　从其70％的丙酮提取物中分离鉴定了29个化合物，其中二萜化合物有20个，新化合物有17个，新化合物的结构类型为二萜类（15个）和降倍半萜类（2个）。二萜类化合物的结构类型主要为异海松烷型、对映-异海松烷型、对映-海松烷型、松香烷型及半日花烷型。其中化合物5为C-18位甲基迁移至C-3位的松香烷型二萜，化合物6为C-20位甲基迁移至C-1的松香烷型，化合物7和8是以醚键连接的松香烷二萜二聚体。以上研究结果进一步丰富了对该种植物化学成分的认识。　　第三章溪黄草药材的四种基原植物的化学成分及其生物活性研究进展　　本章综述了40余年来溪黄草药材四种基原植物:溪黄草（Isodon serra）、线纹香茶菜（***）、狭基线纹香茶菜（*** ***）和纤花线纹香茶菜(*** ***)的化学成分及其生物活性的研究状况。

关键词：香茶菜溪黄草生物活性药用植物化学成分

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结核杆菌中转运蛋白MmpL3和牛病毒性腹泻病毒NS3蛋白的结构生物学研究

结核杆菌中转运蛋白MmpL3和牛病毒性腹泻病毒NS3蛋白的结构生物学...

引用

作者：何苗苗中国科学院大学

学位级别：硕士

本文主要从以下几方面进行论述：　　第一部分 MmpL3蛋白调节分枝菌酸运输的结构与分子机制研究　　作为人类生命和健康的主要杀手之一，结核病与人类的斗争历史已经有一百年之久，导致了数亿人的死亡。尽管目前已有多种用于治疗结核的... 详细信息

本文主要从以下几方面进行论述：　　第一部分 MmpL3蛋白调节分枝菌酸运输的结构与分子机制研究　　作为人类生命和健康的主要杀手之一，结核病与人类的斗争历史已经有一百年之久，导致了数亿人的死亡。尽管目前已有多种用于治疗结核的一线和二线药物上市，如抗菌类药物异烟肼(Isoniazid，INH)、乙胺丁醇(Ethambutol，EMB)和吡嗪酰胺(Pyrazinamide)以及抗生素类药物利福平(Rifampicin，RIF)等等，遗憾的是，这些药物都已经被证明具有非常大的毒副作用;而且，由于抗生素类药物的使用方法不当，导致了多重耐药性、极端耐药性及全耐药性结核杆菌的出现，这些因素都不同程度地加剧了结核病治疗的难度。上述情况在中国、印度等发展中国家尤为严重。因此，开发出针对新型靶点且高效特异的新药，对全球范围内控制疾病疫情的发展具有重要意义。　　结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis，Mtb)是引起人类结核病的单一病原菌。该菌细胞壁的结构非常特别，是由分枝菌酸和多糖阿拉伯半乳聚糖在细胞膜外形成的多糖层。由于细胞壁与Mtb的细胞毒力密切相关，涉及它代谢的关键基因是新型抗结核药物靶标的研究重点之一。研究表明，海藻糖单霉菌酸酯（分枝菌酸的主要存在形式之一）的跨膜转运蛋白——结核杆菌大膜蛋白3（mycobacterial membrane protein large3，MmpL3），在分枝菌酸跨膜转运和血红素铁的摄入中有关键的作用。全细胞筛选及结核杆菌突变型菌株研究鉴定出的抗结核菌化合物SQ109、AU1235作用位点均位于MmpL3上。鉴于分枝菌酸的转运及Fe元素的摄入与结核分枝杆菌的存活和毒力的密切关系，所以MmpL3蛋白质结构的解析是为抗结核新药的研发和药物改造提供潜在靶点、为人类有效对抗结核病的重要手段。　　MmpL3蛋白属于耐药结节细胞分化（Resistence/Nodulation/Cell-Division，RND)超家族，它与RND家族已有结构的其它成员之间，例如AcrB，MexB，CusA，MtrD和ZneA等的序列相似性约为30％。笔者希望通过对MmpL3转运蛋白结构的研究，不仅从原子水平阐释分枝菌酸和铁离子跨膜转运的分子机制并为靶向MmpL3的TB治疗提供帮助。　　本研究利用大肠杆菌BL21表达系统，建立了MmpL3稳定的蛋白表达纯化体系。实验证明，在经过亲和层析纯化以及分子排阻层析纯化后的蛋白，其纯度可达到80％以上。对MmpL3蛋白的C端截短改造明显提高了蛋白质的稳定性，改善了蛋白的多位点降解现象。另外，笔者根据蛋白质二级结构预测信息以及其家族成员MmpL11的可溶性胞质结构域D2的晶体结构，进一步对MmpL3截短体的胞外Loop区进行了6×His的突变，大大提高了蛋白的稳定性。本文的研究加深了对MmpL3生化性质的理解，为以后MmpL3的晶体生长和功能研究积累了经验。　　第二部分牛病毒性腹泻病毒中NS3解旋酶的晶体结构　　牛病毒性腹泻病毒（Bovine Viral Diarrhea Virus，BVDV）是黄病毒科（Flaviviridae）瘟病毒属（Pestivirus）的主要成员，更是全世界范围内造成畜牧业巨大经济损失的重要病原体。BVDV主要宿主为牛，以发热、腹泻、咳嗽为主要症状，造成生产、繁殖能力下降，具有高度传染性和致死性。　　BVDV的NS3蛋白分子量大约为76kDa，含有两个相对独立的功能结构区:N端糜蛋白酶样的丝氨酸蛋白酶活性区和C端核苷三磷酸酶/RNA解旋酶（RNA helicase）活性区。NS3蛋白通常以NS2/3和单独的NS3两种形式存在，研究表明，基因重组、插入、突变等都会引起单独的NS3蛋白的表达，从而导致非细胞病变型(non-cytopathogenic，NCP) BVDV向致细胞病变型(cytopathogenic，CP)BVDV的转变因此，NS3蛋白是致细胞病变型(cytopathogenic，CP) BVDV的一个重要分子标志，遗憾的是，至今仍然缺少NS3功能蛋白酶相关的结构生物学研究的报道。　　在这里，笔者通过与上海科技大学免疫化学研究所的石军超同学以及李胜老师的合作，对BVDV的NS3蛋白的解旋酶区域(约53kDa，以下称为bNS3h)进行了克隆的构建及纯化，并解析了2.8A分辨率的bNS3h的晶体结构。通过对不同病毒的NS3解旋酶的序列及结构的比对分析发现，在三个结构域中，D1和D2有更高的保守性，而D2结构域的柔性区域似乎与功能存在更大的相关性。BVDV的NS3晶体结构的解析有助于我们深入了解瘟病毒属NS3解旋酶结构与功能的关系，为揭示NS3在病毒生命活动中的关键作用提供新的结构视角。

关键词：结核杆菌大膜蛋白3 结构分析蛋白表达纯化体系牛病毒性腹泻病毒 NS3蛋白 RNA解旋酶

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基于情感分析的股指预测技术的研究与实现

基于情感分析的股指预测技术的研究与实现

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作者：郭卿国防科学技术大学

学位级别：硕士

行为金融学中的投资者情绪假设告诉我们情绪是会影响投资者的决策制定的,并在相关的实验中验证了投资者的主观情绪会对市场行情产生影响。随着大数据时代的到来,社交网络已经成为一种分享观点和表达情绪的重要场合,对海量的评论数据进... 详细信息

行为金融学中的投资者情绪假设告诉我们情绪是会影响投资者的决策制定的,并在相关的实验中验证了投资者的主观情绪会对市场行情产生影响。随着大数据时代的到来,社交网络已经成为一种分享观点和表达情绪的重要场合,对海量的评论数据进行有效的量化分析可以用来实现对股指预测行为的指导。所以研究将情感分析用于股指预测的技术对探究股市波动的规律具有重要意义。由于基于数值型数据的股市预测模型很难将新闻事件引起的情绪波动考虑在内,而社交网络又为投资者情绪的量化提供了数据源,所以本文需要构造一种将在线文本评论数据与历史数据相结合的预测模型用于股市分析。本文主要通过新浪微博来获取股票投资者的博文评论,并提出了一种面向股市情感词典快速构建的情感分类算法,通过与基于监督式学习的分类算法对比选出最佳的分类器,结果表明基于情感词典的算法取得了最高的一致准确性,高达94%,其次是逻辑归回(LR)算法,准确性达90%。本文基于已经确定的情感分类算法,对投资者在线评论数据与上海综合指数(SCI)进行了关联分析,主要使用皮尔逊方法针对不同类别的情感系数与SCI收盘指数进行了可视化和相关性分析。研究结果表明最大的相关系数高达0.91,均值达0.55,由此表明基于新浪微博量化的投资者情绪与SCI收盘指数具有一定的相关性。本文在情感分类算法研究和相关性分析的基础上,提出了一种将情感系数与回归模型相结合进行SCI收盘指数预测的算法。本文使用两种最佳分类器计算的四种情感系数分别与SCI的5分钟收盘指数相结合进行多元线性回归模型的构建,并与没有使用情感系数的模型进行对比。实验结果表明收盘指数附加投资者情感系数后用于多元线性回归预测模型与没有附加时的效果相比更好一点。本文结尾说明了上述研究的局限性,并探讨了情感分析用于实际投资的挑战。

关键词：文本挖掘监督式学习情感词典时间序列股指预测

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胃上皮特异性敲除Smad4导致小鼠胃癌发生

胃上皮特异性敲除Smad4导致小鼠胃癌发生

引用

第三届"模式生物与人类健康"发育遗传学全国学术研讨会

作者：李修彬王博婧孙彦洵滕艳杨晓军事医学科学院生物工程研究所发育和疾病遗传学研究室

来源：评论

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