检索结果-内蒙古大学图书馆

上海海洋大学学报 2020年第6期29卷 811-819页

作者：许细丹陈红林 MANDAL Biplab Kumar 司周旋王军王成辉上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

以AB系斑马鱼(Danio rerio)为研究对象,应用CRISPR/Cas9基因编辑技术,对纯合亲鱼受精卵进行显微注射,通过编辑损坏Tyr基因的CDS区第二外显子和3′-UTR非poly-A加尾信号区,使基因发生突变,检测基因不同功能区经编辑后对鱼类体色的影响。... 详细信息

以AB系斑马鱼(Danio rerio)为研究对象,应用CRISPR/Cas9基因编辑技术,对纯合亲鱼受精卵进行显微注射,通过编辑损坏Tyr基因的CDS区第二外显子和3′-UTR非poly-A加尾信号区,使基因发生突变,检测基因不同功能区经编辑后对鱼类体色的影响。结果显示:Tyr基因在野生型斑马鱼胚胎的各个发育时期均能正常表达,眼睛出现黑色素时的表达量最高;编辑损坏Tyr基因的CDS区后,突变型斑马鱼的胚胎和仔鱼均未出现黑色素细胞,表现为体表白化,而成鱼会再度出现黑色素细胞,表现为体表黑色条纹断裂。编辑损坏Tyr基因的3′-UTR非poly-A加尾信号区后,突变型胚胎、仔鱼和成鱼均未出现黑色素减褪,黑色素合成未受影响。研究表明,编辑损坏基因的CDS区会对生物表型产生显著影响,而编辑损坏3′-UTR非poly-A加尾信号区对生物表型的影响有限。

关键词： Tyr 基因编辑 CDS 3’-UTR 黑色素 CRISPR/Cas9

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褐牙鲆中miRNAs与甲状腺激素受体TRβ的相互作用研究

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水产科学 2020年第3期39卷 299-305页

作者：刘素萍付元帅喻杰张俊玲施志仪上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海水产养殖工程技术研究中心水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

甲状腺激素通过与其受体结合对褐牙鲆变态起重要的调控作用,而miRNAs通过结合靶基因3′-UTR在转录后水平调节靶基因的表达。为探讨miRNAs在褐牙鲆变态中的作用,通过生物信息学方法预测褐牙鲆TRβ基因3′-UTR存在的miRNAs结合位点,并利用... 详细信息

甲状腺激素通过与其受体结合对褐牙鲆变态起重要的调控作用,而miRNAs通过结合靶基因3′-UTR在转录后水平调节靶基因的表达。为探讨miRNAs在褐牙鲆变态中的作用,通过生物信息学方法预测褐牙鲆TRβ基因3′-UTR存在的miRNAs结合位点,并利用3′-RACE方法克隆TRβ基因的3′-UTR序列,通过体外DNA重组技术构建应用于miRNAs靶向基因检测的双荧光素酶重组报告载体,利用细胞转染和双荧光素酶报告技术分析多个miRNAs与TRβ基因的作用关系。研究结果显示,克隆得到了一段长为437 bp的褐牙鲆TRβ基因的3′-UTR序列,发现3′-UTR序列上存在pol-miR-125a、pol-miR-214、pol-miR-460-5p、pol-miR-138和pol-miR-125a*的结合位点,成功构建了双荧光素酶重组报告载体,命名为pmirGLO-TRβ-3′-UTR。双荧光素酶报告分析结果表明,pol-miR-125a、pol-miR-214、pol-miR-460-5p和pol-miR-138均为作用于褐牙鲆TRβ的靶向miRNAs,而pol-miR-125a*对TRβ基因无直接的调节作用。研究结果将为后续深入研究miRNAs与TRβ在褐牙鲆变态发育中的功能及其作用机制提供基础。

关键词：褐牙鲆 miRNA TRβ pmirGLO-TRβ-3′-UTR 双荧光素酶报告基因技术

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微塑料与多环芳烃菲复合胁迫对七彩神仙鱼稳定同位素和生态化学计量学特征的影响

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水产学报 2020年第10期44卷 1742-1751页

作者：冯晓飒温彬刘君恒张源高建忠陈再忠上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心

为探讨微塑料和多环芳烃菲对七彩神仙鱼生长、能量存储、稳定同位素及生态化学计量学特征的影响,实验设置了3个微塑料浓度(0、100、1 000μg/L)和2个菲水平(0、50μg/L),共3×2个暴露组,进行8周的养殖实验。结果显示:①幼鱼末体质... 详细信息

为探讨微塑料和多环芳烃菲对七彩神仙鱼生长、能量存储、稳定同位素及生态化学计量学特征的影响,实验设置了3个微塑料浓度(0、100、1 000μg/L)和2个菲水平(0、50μg/L),共3×2个暴露组,进行8周的养殖实验。结果显示:①幼鱼末体质量未受微塑料和菲影响,但菲会降低肥满度,且二者对肝体指数有交互影响:50μg/L菲下100μg/L微塑料增加肝体指数,100μg/L微塑料下菲可提高肝体指数。②幼鱼蛋白质含量随菲浓度升高而增加,粗脂肪和碳水化合物均受微塑料和菲交互影响:0μg/L菲下微塑料增加会提高粗脂肪含量,但会降低碳水化合物含量;1 000μg/L微塑料下菲增加会降低粗脂肪含量,但会提高碳水化合物含量。③幼鱼δ13C随微塑料增加而降低,δ15N受二者交互影响,但不同条件下无显著差异。④微塑料会增加幼鱼C含量,菲则增加N含量,而P含量还受二者交互影响,0μg/L菲下100μg/L微塑料降低P含量,而50μg/L菲下1 000μg/L微塑料降低P含量;100μg/L微塑料下菲增加会提高P含量,但1 000μg/L微塑料下菲增加会降低P含量;幼鱼C/N受微塑料和菲单一暴露影响,而N/P和C/P还受二者交互影响。研究表明,微塑料和菲复合胁迫对七彩神仙鱼幼鱼生长和存活未造成显著影响,但可能会通过改变鱼体组织能量存储,导致其稳定同位素和生态化学计量学特征发生变化。

关键词：七彩神仙鱼微塑料菲稳定同位素生态化学计量学

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低鱼粉饲料中添加酶解豆粕对凡纳滨对虾生长性能和抗胁迫机能的影响

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水产学报 2020年第6期44卷 999-1012页

作者：姜德田汪毅黄旭雄王伟隆张圣鑫上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心泰州福益生物科技股份有限公司

为研究在养殖过程中降低鱼粉用量的同时保持凡纳滨对虾良好的生长性能和抗逆能力,实验在含10%鱼粉的基础饲料中,分别添加酶解豆粕(PSM) 0%(A)、2.5%(B)、3.5%(C)、4.5%(D)、5.5%(E)制成5组等氮等能饲料,分别投喂初始体质量为(0.45±... 详细信息

为研究在养殖过程中降低鱼粉用量的同时保持凡纳滨对虾良好的生长性能和抗逆能力,实验在含10%鱼粉的基础饲料中,分别添加酶解豆粕(PSM) 0%(A)、2.5%(B)、3.5%(C)、4.5%(D)、5.5%(E)制成5组等氮等能饲料,分别投喂初始体质量为(0.45±0.02) g的凡纳滨对虾幼虾8周,检测对虾生长性能及抗胁迫机能。结果显示,8周养殖实验结束后,各实验组对虾的终末体质量为14.65～15.38 g/尾,各组间对虾终末均重、成活率和饲料系数指标均无显著性差异;A组对虾肌肉粗蛋白质含量显著低于其他各实验组;C组、D组和E组对虾肌肉粗脂肪含量显著高于A组;各组间灰分和水分均无显著性差异;D组和E组对虾肝胰腺蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶、血清溶菌酶和血清总超氧化物歧化酶活性(T-SOD)均显著高于A组;A组对虾血清丙二醛(MDA)含量显著高于D组和E组。人工急性感染高剂量副溶血性弧菌的胁迫实验中,A组对虾在弧菌感染48和60 h时的累积死亡率均显著高于D组对虾同期的累积死亡率;低剂量副溶血性弧菌人工急性感染后,在凡纳滨对虾鳃组织中检测Toll受体、免疫缺陷(IMD)和溶菌酶3种免疫相关基因的表达量,结果显示,对虾Toll受体、IMD和溶菌酶mRNA表达量最大峰值分别出现在添加酶解豆粕的C组、B组和D组,峰值出现时刻分别为感染后24、42和24 h。研究表明,含10%鱼粉的饲料中添加0%～5.5%酶解豆粕对凡纳滨对虾的生长性能改善效果不显著,酶解豆粕会显著提高凡纳滨对虾肌肉粗蛋白质含量和粗脂肪含量;显著降低对虾血清丙二醛含量;同时也会显著改变凡纳滨对虾对弧菌的抵抗力及其免疫相关基因的时空表达,酶解豆粕添加量达到4.5%时可使养殖的凡纳滨对虾获得最佳的抗弧菌能力。

关键词：凡纳滨对虾酶解豆粕生长性能抗胁迫机能

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三角帆蚌中WNT4基因克隆及表达分析

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上海海洋大学学报 2020年第6期29卷 801-810页

作者：刘斐斐崔晓羽董赛赛段胜华汪桂玲李家乐上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

为进一步了解WNT4在三角帆蚌性别决定过程中的作用,通过RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)技术克隆获得了三角帆蚌WNT4基因的全长cDNA,共1560 bp,其中5′-UTR 396 bp、3′-UTR 24 bp,开放阅读框(ORF)为1140 bp,可以编码379个氨基... 详细信息

为进一步了解WNT4在三角帆蚌性别决定过程中的作用,通过RACE(Rapid-amplification of cDNA ends)技术克隆获得了三角帆蚌WNT4基因的全长cDNA,共1560 bp,其中5′-UTR 396 bp、3′-UTR 24 bp,开放阅读框(ORF)为1140 bp,可以编码379个氨基酸,且该序列含有WNT家族特有结构域。对WNT4的氨基酸序列进行同源性分析后,发现该基因在物种间的进化关系和结构功能具保守性。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析发现WNT4基因在三角帆蚌雌雄多个组织(外套膜、闭壳肌、鳃、性腺、斧足和肝)中均有表达,表明其参与了多样的生物学过程,在鳃、斧足和肝中表达量较高,在性腺、闭壳肌和斧足中雌雄间有显著性差异,且雌性三角帆蚌的性腺、闭壳肌表达量显著高于雄性。原位杂交结果显示,WNT4在雌性三角帆蚌的卵母细胞上有明显的杂交信号,推测WNT4基因与性别决定相关。

关键词：三角帆蚌性别决定 WNT4 qRT-PCR 原位杂交

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不同C/N对绿球藻生长和细胞组分的影响

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上海海洋大学学报 2020年第4期29卷 542-551页

作者：纪鹏王伟隆黄旭雄上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

研究了不同C/N(0∶1、3∶1、6∶1、9∶1、12∶1和15∶1)对绿球藻(Chlorococcum sp.)生长和细胞组分的影响,初始接种密度为300×10^4个/mL,实验进行7 d。结果表明:兼养培养能够显著提高绿球藻细胞密度、特定生长率和生物量(P<0.0... 详细信息

研究了不同C/N(0∶1、3∶1、6∶1、9∶1、12∶1和15∶1)对绿球藻(Chlorococcum sp.)生长和细胞组分的影响,初始接种密度为300×10^4个/mL,实验进行7 d。结果表明:兼养培养能够显著提高绿球藻细胞密度、特定生长率和生物量(P<0.05),当C/N为9∶1时,生物质量浓度达到最大值0.36 g/L;兼养条件下,随着C/N的增加,绿球藻蛋白质和总脂质量分数有所降低,C/N为12∶1时,蛋白质质量分数达到最小值33.76%;C/N为15∶1时,总脂质量分数达到最小值6.67%,显著低于其他各组(P<0.05);碳水化合物质量分数表现为先增加后降低的趋势,在C/N为9∶1时达到最大值30.57%,显著高于其他各组(P<0.05);不同C/N对绿球藻脂肪酸组成和质量分数影响不同,随着C/N的增加,饱和脂肪酸(SFA)和单不饱和脂肪酸(MUFA)质量分数提高,在C/N为15∶1时,分别达到最大值20.72%和14.61%,多不饱和脂肪酸(PUFA)质量分数降低,在C/N为15∶1时,达到最小值64.67%。由此可知,C/N为9∶1可以提高绿球藻生物量,随着C/N的增大有利于SFA和MUFA的合成,但不利于PUFA的合成。

关键词：绿球藻 C/N 生长生物量细胞组分脂肪酸

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不同添加量的聚-β-羟基丁酸酯作为生物絮凝缓释碳源的应用效果

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渔业现代化 2021年第6期48卷 19-27页

作者：吴霞吴长胜王国庆罗国芝谭洪新上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

为探究聚-β-羟基丁酸酯作为生物絮凝系统缓释碳源的适宜添加比例。分别向80 g/m^(3)(A组)、200 g/m^(3)(B组)、320 g/m^(3)(C组)3个试验组添加聚-β-羟基丁酸酯(PHB),进行为期48 d的罗非鱼养殖试验,每4 d进行一次水质监测,试验结束时... 详细信息

为探究聚-β-羟基丁酸酯作为生物絮凝系统缓释碳源的适宜添加比例。分别向80 g/m^(3)(A组)、200 g/m^(3)(B组)、320 g/m^(3)(C组)3个试验组添加聚-β-羟基丁酸酯(PHB),进行为期48 d的罗非鱼养殖试验,每4 d进行一次水质监测,试验结束时检测鱼苗生长情况,取生物絮团进行营养指标检测,将PHB称重后进行扫描电镜及红外光谱检测。结果显示:随着PHB添加量的提高,各组总氨氮(TAN)峰值均逐渐降低,硝酸盐氮(NO-3-N)积累均提高;试验后期,A组可以稳定地将系统碳氮比(DOC/TN)维持在15以上的较高水平;3个试验组中不同PHB添加量对罗非鱼存活率、增重率不产生显著影响(P>0.05);饲料系数C组显著小于A组和B组(P<0.05);不同添加量的PHB作为系统碳源降解损耗差异显著(P<0.05),随着PHB添加量的提高,降解损耗量越高,降解破损程度越低。研究表明,80 g/m^(3)的PHB添加量能在养殖期间维持系统碳氮比在15以上的较高水平,可作为PHB用作生物絮凝系统缓释碳源的适宜添加比例。

关键词：聚-β-羟基丁酸酯生物絮凝碳源溶解性有机碳

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中华绒螯蟹背壳特征识别及其算法研究

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中国海洋大学学报（自然科学版） 2021年第1期51卷 138-146页

作者：邰伟鹏李浩张炳良王春安徽工业大学计算机科学与技术学院安徽马鞍山243000 安徽工业大学信息技术研究院安徽马鞍山243000 天邦食品股份有限公司浙江余姚315400 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室水产科学国家级实验教学示范中心上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

针对现阶段中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)防伪技术准确性差和可靠性低的问题,本文提出一种基于图像匹配的蟹背壳特征识别算法。首先,分割出具有唯一性的中华绒螯蟹背壳图像,用SURF算法提取特征点,然后使用双向FLANN算法与数据库中保... 详细信息

针对现阶段中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)防伪技术准确性差和可靠性低的问题,本文提出一种基于图像匹配的蟹背壳特征识别算法。首先,分割出具有唯一性的中华绒螯蟹背壳图像,用SURF算法提取特征点,然后使用双向FLANN算法与数据库中保存的特征点匹配,以匹配点与最近欧式距离和次近欧式距离匹配点的位置关系作为误匹配检测的依据,采用正确匹配对的占比验证其相似度,以此实现河蟹单体的识别。研究表明,在近似的拍摄条件下,两幅属于同一只蟹的背壳图像相似度可达到0.7以上,而属于不同蟹的背壳图像的相似度则偏低。本研究方法可有效解决目前使用绑在螯足上的二维码或条形码等标识物作为中华绒螯蟹商品蟹溯源及其防伪技术准确性和可靠性差的问题,为商品蟹的单体识别与精准溯源提供一项技术手段。

关键词：中华绒螯蟹背壳特征识别图像处理相似度防伪查询

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急性低氧胁迫和复氧恢复对青田田鱼幼鱼氧化应激和能量代谢的影响

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淡水渔业 2020年第6期50卷 92-98页

作者：齐明侯懿玲刘韬苗艺馨庄淑婷曲宪成刘其根上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

为了解青田田鱼(Cyprinus carpio var qingtianensis)对稻田急性溶氧变化的适应性,本试验将青田田鱼幼鱼进行(0.46±0.19)mg/L低氧胁迫2、4、6 h,之后恢复溶氧(7.75±0.17)mg/L处理2、4、6 h,分析其肝胰脏中氧化应激指标、呼吸... 详细信息

为了解青田田鱼(Cyprinus carpio var qingtianensis)对稻田急性溶氧变化的适应性,本试验将青田田鱼幼鱼进行(0.46±0.19)mg/L低氧胁迫2、4、6 h,之后恢复溶氧(7.75±0.17)mg/L处理2、4、6 h,分析其肝胰脏中氧化应激指标、呼吸代谢酶活以及能量代谢指标变化。结果显示:低氧胁迫过程肝胰脏中超氧化物歧化酶(SOD)和谷胱甘肽-S-转移酶(GST)活力显著升高,丙二醛(MDA)含量显著降低,总谷胱甘肽(T-GSH)含量和还原型谷胱甘肽/氧化型谷胱甘肽比例(GSH/GSSG)先升高后降低;乳酸脱氢酶(LDH)活力显著升高;肝胰脏中糖原(Gn)含量显著降低,肝胰脏中乳酸(LD)、血糖(B-Glu)和血乳酸(B-LD)则显著升高。在复氧恢复过程中,CAT、SOD、GST活力和MDA含量则显著降低而T-GSH和GSH/GSSG显著升高;HK活力显著升高;肝胰脏中Gn含量无显著变化,LD、B-Glu和B-LD含量逐步降低。结果表明急性低氧胁迫和复氧恢复都会对青田田鱼产生氧化应激,但其通过自身启动的抗氧化应激系统和优化供能代谢方式等调控手段,能逐步恢复到正常水平。

关键词：青田田鱼(Cyprinus carpio var qingtianensis) 低氧胁迫复氧恢复氧化应激能量代谢

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七彩神仙鱼脑组织转录组mRNAs差异表达分析

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南方农业学报 2020年第11期51卷 2827-2835页

作者：刘怡南温彬陈再忠水产科学国家级实验教学示范中心(上海海洋大学) 上海201306 上海水产养殖工程技术研究中心(上海海洋大学) 上海201306 农业农村部淡水水产种质资源重点实验室(上海海洋大学) 上海201306

【目的】挖掘七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)脑组织性别差异基因,为揭示脑组织性别相关基因调控繁殖生理机制打下基础。【方法】利用Illumina HiSeq 6000测序平台对七彩神仙鱼雌、雄脑组织样本进行转录组测序分析,经过滤和Trinity组... 详细信息

【目的】挖掘七彩神仙鱼(Symphysodon haraldi)脑组织性别差异基因,为揭示脑组织性别相关基因调控繁殖生理机制打下基础。【方法】利用Illumina HiSeq 6000测序平台对七彩神仙鱼雌、雄脑组织样本进行转录组测序分析,经过滤和Trinity组装获得基因,采用DIAMOND进行功能注释;并选取NR、GO、KEGG、Pfam、Swiss-Prot和eggNOG等数据库进行比对,筛选出差异表达候选基因;随机选取6个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。【结果】从构建的七彩神仙鱼脑组织cDNA文库测序获得337190200条原始数据(Raw reads),经质量筛选后获得34109个基因(平均长度1007.00 bp)和67488个转录本(平均长度694.00 bp)。经生物信息学分析方法筛选,最终获得85个差异表达基因(61个在雄鱼脑组织中高表达,24个在雌鱼脑组织中高表达),包括黑色素浓集激素(MCH)、催乳素释放激素(Prlh)、垂体同源结构域转录因子2(pitx2)、免疫球蛋白家族成员(DSCAM和IGDCC3)、溶质载体(UNC93B1)及醛糖还原酶(AKR1B1)等功能基因。与雌鱼脑组织相比,雄鱼脑组织中涉及细胞突触传递、激素调控、信号传导、黑色素浓集激素、催乳素释放激素、生长激素和G蛋白偶联受体的基因呈下调趋势,而涉及离子运输和免疫反应的基因呈上调趋势。随机选取6个差异表达基因(Prlh、pitx2、MCH、LMX1A、KBP和CRP)进行实时荧光定量PCR验证,结果显示,Prlh、pitx2、MCH、LMX1A和KBP基因在雌鱼脑组织的相对表达量较高,而CRP基因在雄鱼脑组织的相对表达量较高。【结论】MCH、Prlh、pitx2、DSCAM、IGDCC3、UNC93B1、AKR1B1和Nid1等基因在七彩神仙鱼脑组织中呈性别差异表达,可能在调节脑组织类固醇激素形成及配子发生的过程中发挥重要作用,可作为候选基因应用于七彩神仙鱼脑组织性别相关基因调控繁殖生理机制研究。

关键词：七彩神仙鱼转录组脑组织性别差异基因

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