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基因组学与应用生物学 2019年第3期38卷 1058-1064页

作者：王新艳向玉婷张俊玲施志仪上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

Polycomb group complex (PcG)作为发挥转录抑制作用的重要表观遗传调控复合物参与发育、衰老以及肿瘤发生等重要生理过程。Pc G家族成员,包括PRC1 (Polycomb repressive complex 1)与PRC2 (Polycomb repressive complex 2)两种复合物,... 详细信息

Polycomb group complex (PcG)作为发挥转录抑制作用的重要表观遗传调控复合物参与发育、衰老以及肿瘤发生等重要生理过程。Pc G家族成员,包括PRC1 (Polycomb repressive complex 1)与PRC2 (Polycomb repressive complex 2)两种复合物,各组分间功能既协同,又不失特性,色素框同源蛋白(Chromobox homolog CBX)是PRC1的主要核心蛋白,其家族的成员之一CBX2近年来成为研究的热点。本研究综述了CBX2基因的发现、基因和蛋白质的结构组成及其在人和鼠不同组织的表达情况,阐述了CBX2在哺乳动物性发育中的作用及研究进展,发现CBX2除参与PcG复合体发挥转录抑制作用外,还具有基因转录激活作用,它作为哺乳动物性别决定级联中SRY (Sex region of Y chromosome)的上游基因可直接激活靶基因SF1/NR5A1的表达,如果CBX2基因突变或缺失将使雄性小鼠发生性反转,在人类中造成46,XY性发育障碍(disorders of sex development, DSD),为进一步研究CBX2基因在动物性发育调控中的作用提供依据。

关键词： PcG CBX2 性发育

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牙鲆cbx2基因的分子特征与组织表达

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生物技术通报 2019年第4期35卷 69-75页

作者：王新艳张俊玲施志仪上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

为鉴定牙鲆(Paralichthys olivaceus)色素框同源蛋白(Chromobox homolog,CBX)基因cbx2及探讨其在牙鲆性腺中的表达,通过PCR克隆和测序获得了cbx2 cDNA序列;利用多种生物信息学方法在线分析了牙鲆CBX2蛋白质的理化性质与空间结构,并比较... 详细信息

为鉴定牙鲆(Paralichthys olivaceus)色素框同源蛋白(Chromobox homolog,CBX)基因cbx2及探讨其在牙鲆性腺中的表达,通过PCR克隆和测序获得了cbx2 cDNA序列;利用多种生物信息学方法在线分析了牙鲆CBX2蛋白质的理化性质与空间结构,并比较了脊椎动物中cbx2的基因结构、氨基酸同源性、系统进化;运用RT-PCR技术分析了cbx2基因在牙鲆成体不同组织的表达情况。结果表明获得的牙鲆cbx2 cDNA序列包含1 584 bp的开放阅读框,编码527个氨基酸,其蛋白质分子量和等电点分别为56 578.98和10.03,是一种偏碱性的亲水性蛋白,该蛋白无信号肽,无跨膜区域,且编码该蛋白的氨基酸中以丝氨酸(Sr)的含量为最高;空间结构分析发现,牙鲆CBX2蛋白以α螺旋和无规则卷曲为主,其二级结构中含有1个染色质结构域和4个低复杂结构域,该染色质结构域常结合甲基化氨基酸残基。基因结构、氨基酸同源性和系统进化分析表明cbx2基因在脊椎动物进化中较为保守,牙鲆cbx2与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)、青鳉(Oryzias latipes)的基因结构更为相似,其氨基酸同源性与杜氏鰤(Seriola dumerili)最高,为89%。RT-PCR结果显示牙鲆cbx2基因在精巢的表达量最高,卵巢次之,而在其他组织中仅有较低的表达。这些结果提示了cbx2基因在牙鲆的性腺发育中可能具有重要作用。

关键词：牙鲆 cbx2 性腺生物信息学分析 RT-PCR

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光照条件下生物絮凝养殖调控的措施

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上海海洋大学学报 2019年第1期28卷 84-92页

作者：樊利鹏刘文畅谭洪新罗国芝孙大川张南南曹宝鑫上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

运用实验生态学的方法,以阳光工厂化生物絮凝养殖前期水为实验材料,分别探究去细菌捕食者(原生动物等,AC组)、带虾序批添加葡萄糖(GS组)和一次性添加葡萄糖(G组)对水中微食物环的细菌及浮游生物的影响。结果表明,GS组在120 h的轮虫生物... 详细信息

运用实验生态学的方法,以阳光工厂化生物絮凝养殖前期水为实验材料,分别探究去细菌捕食者(原生动物等,AC组)、带虾序批添加葡萄糖(GS组)和一次性添加葡萄糖(G组)对水中微食物环的细菌及浮游生物的影响。结果表明,GS组在120 h的轮虫生物量、浮游植物生物量和叶绿素a含量都显著高于对照组(P<0. 05)和而G组的轮虫生物量、浮游植物生物量在整个实验过程中与对照组无显著性差异(P> 0. 05),因此序批式添加葡萄糖的上行效应比一次性添加更加明显,并且添加大型捕食者的GS组的下行效应不明显。实验组和对照组细菌总数都大于5×10~5个/mL,AC组的细菌总数峰值最高[(13. 10±3. 79)×10~5个/mL],去细菌捕食者后降低了对细菌的捕食压力从而促进了细菌生长。AC组的溶解性有机碳浓度和溶解性总氮浓度一直高于其他组,GS组、G组和对照组的溶解性有机碳、溶解性总氮和磷酸盐浓度的变化趋势基本一致,杀死细菌捕食者释放了大量溶解性有机物,添加适量葡萄糖、投放虾对养殖水质无明显影响。研究结果为阳光型生物絮凝养殖在生产应用上的调控手段提供基础依据。

关键词：上行效应下行效应有机碳源细菌捕食者生物絮凝浮游生物水质

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碳源添加方式对海水生物絮凝系统启动效率的影响

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上海海洋大学学报 2019年第2期28卷 257-266页

作者：柳泽锋罗国芝谭洪新蒙浩焱上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

合理地添加碳源有利于生物絮凝系统的构建。为快速完成海水生物絮凝系统启动,在盐度为30的生物絮凝系统启动阶段探究了3种添加碳源(葡萄糖)方式对启动效率的影响。第一种在实验初始时一次性添加葡萄糖到生物絮凝系统中,使碳与总氮质量... 详细信息

合理地添加碳源有利于生物絮凝系统的构建。为快速完成海水生物絮凝系统启动,在盐度为30的生物絮凝系统启动阶段探究了3种添加碳源(葡萄糖)方式对启动效率的影响。第一种在实验初始时一次性添加葡萄糖到生物絮凝系统中,使碳与总氮质量比达到15以上;第二种在系统运行的第1～10天,每天加入A组所添加葡萄糖总量的10%,此后若氨氮(TAN)上升至1 mg/L以上,则按照C/TAN为6来添加葡萄糖;第三种每天按照C/TAN为6来添加葡萄糖。结果显示:3个处理组的氨氮在实验期间总体上处于较低水平,亚硝酸氮和硝酸氮均有明显积累,但在系统运行第59天时降至最低水平。3组系统中絮体的胞外聚合物和粗蛋白等营养指标均呈现下降趋势。利用高通量测序技术对生物絮体的细菌群落结构进行分析,检测结果表明:3组生物絮体的主要优势菌群都属于变形菌门(Proteobacteria),持续添加碳源能够丰富生物絮凝系统中微生物种类。实验进行第55天时,3个处理组的生物絮凝系统启动完成。实验表明:在启动初始阶段以DOC/TN为15的比例添加葡萄糖及在系统运行期间按DOC/TAN为6的比例添加葡萄糖能够更好地形成生物絮凝系统。

关键词：生物絮凝养殖系统碳氮比碳源添加方式胞外聚合物细菌群落

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应用于pol-miR-26a,26b靶基因检测的psiCHECK-dmrt1-3'UTR报告质粒的建立

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基因组学与应用生物学 2019年第2期38卷 568-573页

作者：徐明琴王前龙王新艳张俊玲孙文慧向玉婷上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

为明确牙鲆雄性性别相关关键基因dmrt1 (doublesex and mab-3-related transcription factor 1)是否为pol-miR-26a、pol-miR-26b作用的靶基因,本研究利用PCR技术克隆了dmrt13'UTR区,并成功引入了特殊限制性内切酶PemⅠ和NotⅠ的识别位点;将得到的dmrt1 3'UTR区片段和psiCHECK-2载体进行双酶切、连接后得到野生型重组质粒;并且利用定点诱变法对dmrt1 3'UTR区进行体外定点诱变,将pol-miR-26a、pol-miR-26b识别的靶序列ACTGAA突变为TGACTT,形成突变型重组质粒。经琼脂糖凝胶电泳鉴定、双酶切及测序分析,成功获得了可用于pol-miR-26a、pol-miR-26b的靶基因dmrt1验证的野生型psiCHECK-dmrt1-3'UTR和突变型psiCHECK-mutated dmrt1-3'UTR的报告质粒,为进一步研究pol-miR-26a、pol-miR-26b的靶基因dmrt1鉴定和功能奠定了基础。

关键词：牙鲆 pol-miR-26a pol-miR-26b dmrt1 psiCHECK-dmrt1-3’UTR,psiCHECK-mutated dmrt1-3’UTR

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利用生物絮团技术对克氏原螯虾的养殖效果初探

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水产学报 2019年第4期43卷 968-977页

作者：李京昊成永旭王海锋黄锦申浩然陈焕根李嘉尧上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室水产科学国家级实验教学示范中心上海水产养殖工程技术研究中心江苏省渔业技术推广中心

为探究将生物絮团技术应用到克氏原螯虾养殖的可能性,本实验利用生物絮团技术和普通饲料投喂2种方式短期养殖体质量为(9.70±0.32) g的克氏原螯虾30 d。比较养殖期间2实验组的水化学指标以及实验结束时2实验组幼虾的生长情况,肌肉... 详细信息

为探究将生物絮团技术应用到克氏原螯虾养殖的可能性,本实验利用生物絮团技术和普通饲料投喂2种方式短期养殖体质量为(9.70±0.32) g的克氏原螯虾30 d。比较养殖期间2实验组的水化学指标以及实验结束时2实验组幼虾的生长情况,肌肉及肝胰腺营养成分组成,胃、肠和肝胰腺组织的消化酶活性,肝胰腺和肌肉组织的抗氧化能力。结果显示,①在养殖期间,絮团组水体总氮(TN)、亚硝态氮(NO 2?-N)、硝态氮(NO 3?-N)的质量浓度均维持在较低的水平。②本实验条件下2实验组虾的终末体质量、增重率(WG)、特定生长率(SGR)、存活率(SR)均无显著差异。③絮团的粗蛋白含量可以达到36.8%,能够满足克氏原螯虾对于蛋白的需求。但絮团的粗脂肪含量较低,这也影响了絮团组幼虾肌肉组织的粗脂肪沉积量。④絮团组幼虾肝胰腺中α-淀粉酶(α-AL)、脂肪酶(LPS)、纤维素酶(CL)活性均显著高于饲料组幼虾,而饲料组幼虾在胃、肠组织中的α-AL活性较高,2实验组幼虾的胃蛋白酶活性无明显差异。⑤絮团组幼虾的抗氧化能力与饲料组幼虾相比,肝胰腺中超氧化物歧化酶(SOD)活性较高,丙二醛(MDA)含量较低,但总抗氧化能力(T-AOC)、过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽还原酶(GR)以及溶菌酶(LZM)无明显差异。研究表明,生物絮团技术在克氏原螯虾的养殖中具有积极作用,可以达到与饲料投喂相同甚至更好的养殖效果。

关键词：克氏原螯虾生物絮团技术生化组成消化酶抗氧化性

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中华绒螯蟹血细胞的原代培养及其管家基因检测

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农业生物技术学报 2019年第9期27卷 1703-1710页

作者：杨鹤岳武成侯鑫王军陈晓雯吴嘉敏王成辉上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室/水产科学国家级实验教学示范中心/上海水产养殖工程技术研究中心

水生甲壳动物血细胞的离体培养已在多种甲壳动物中得到了初步研究,但不同学者在培养基种类、血清浓度和渗透压等关键培养条件的研究中并未达成广泛共识。为探索中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)血细胞原代培养所需的适宜培养基和关键培... 详细信息

水生甲壳动物血细胞的离体培养已在多种甲壳动物中得到了初步研究,但不同学者在培养基种类、血清浓度和渗透压等关键培养条件的研究中并未达成广泛共识。为探索中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)血细胞原代培养所需的适宜培养基和关键培养条件,为后续相关功能基因研究提供基础。本研究分析了5种培养基(1×L-15, 2×L-15, 3×L-15, Sf-900和TC-100培养基)、5个渗透压条件(345, 569, 803,991和1215 m Osm/kg)和5个血清浓度(0%, 5%, 10%, 15%和20%)对中华绒螯蟹血细胞的体外培养效果,并检测了培养细胞的基因表达情况。结果发现:TC-100培养基培养的中华绒螯蟹血细胞形态最佳,存活率最高;以TC-100培养基为基础培养基,筛选出渗透压为991 mOsm/kg和不添加胎牛血清(0%)时培养的细胞形态更好,培养至10 d的成活率仍在50%以上;泛素结合酶E2b基因(ubiquitin-conjugating enzyme E2b, UBE)、泛素/核糖体S27融合蛋白基因(ubiquitin/ribosomal S27 fusion protein, S27)和β-actin共3个管家基因在血细胞培养过程中(0～10 d)均稳定表达。结果表明,本研究筛选的培养基及关键培养条件能更好地培养中华绒螯蟹血细胞,培养的细胞能进行初步的基因功能实验,本研究为中华绒螯蟹基因功能研究提供新的技术手段。

关键词：中华绒螯蟹细胞培养渗透压血清浓度基因表达

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中华绒螯蟹在“蟹龙宫”饲养环境中的个体蜕壳与生长

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上海海洋大学学报 2019年第4期28卷 511-518页

作者：李志华卢德胤刘兆强杨鹤王军王成辉上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

分析'蟹龙宫'饲养中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)在一个蜕壳周期的蜕壳与生长情况。结果发现:'蟹龙宫'饲养中华绒螯蟹蜕壳后体质量平均增长率为33.19%,头胸甲长、头胸甲宽和体高的平均增长率为12.12%~14.97%,平均蜕壳... 详细信息

分析'蟹龙宫'饲养中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)在一个蜕壳周期的蜕壳与生长情况。结果发现:'蟹龙宫'饲养中华绒螯蟹蜕壳后体质量平均增长率为33.19%,头胸甲长、头胸甲宽和体高的平均增长率为12.12%~14.97%,平均蜕壳间期为59.35 d。蜕壳前平均肥满度达60.84%,头胸甲的色度值(RGB)平均为109.17,蜕皮激素(EH)含量达14.18 IU/mL。试验河蟹在蜕壳前生长性状、EH含量和蜕壳间期长短与蜕壳后的增长率不存在显著相关性(P>0.05)。在'蟹龙宫'的个体养殖系统中,中华绒螯蟹的肥满度达60%,蜕皮激素含量升至14 IU/mL时会启动蜕壳。

关键词：中华绒螯蟹个体养殖生长体色肥满度激素

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pH对微生物絮团氨氮转化效率及细菌活性的影响

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上海海洋大学学报 2019年第5期28卷 671-679页

作者：李莉李文清谭洪新罗国芝上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306

研究不同pH(6.5、7.5和8.5)对利用高体革[鱼刺](Scortum barcoo)淡水养殖系统中的固体废弃物培养的微生物絮团的氨氮转化效率和絮团细菌活性效果的影响,实验温度为29~32℃。结果表明,3个处理组均无亚硝酸盐、硝酸盐的明显积累,对活性磷... 详细信息

研究不同pH(6.5、7.5和8.5)对利用高体革[鱼刺](Scortum barcoo)淡水养殖系统中的固体废弃物培养的微生物絮团的氨氮转化效率和絮团细菌活性效果的影响,实验温度为29~32℃。结果表明,3个处理组均无亚硝酸盐、硝酸盐的明显积累,对活性磷的平均去除率分别为1.29、0.92、0.80 mg/(L·d)。pH对絮团氨氮转化有明显影响:实验结束时pH 6.5、pH 7.5、pH 8.5组的总氨氮浓度分别为37.71、12.74、17.55 mg/L,pH 7.5、pH 8.5组氨氮向有机氮转化效率均显著高于pH 6.5组。pH对微生物絮团的总微生物活性、微生物含量、异养细菌及硝化细菌的活性无显著影响。pH 6.5组的微生物絮凝团胞外聚合物(extacellular polymeric substances, EPS)的胞外蛋白质、胞外多糖明显高于其他两组。pH 6.5组的微生物絮团的平均粗蛋白含量为20.61%,高于pH 7.5组(18.83%)和pH 8.5组(19.04%)。结果表明:在6.5~8.5的范围内,pH对微生物絮团氮素转化效率有明显影响,对微生物活性影响不显著;pH为7.5和8.5时更有利于微生物絮团对水体中氨氮的同化。

关键词：生物絮团 pH 水产养殖固体废弃物悬浮式生物反应器氨氮转化

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“全红”和“粉玉”瓯江彩鲤体表组织中差异色素的鉴定

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上海海洋大学学报 2019年第6期28卷 857-864页

作者：杜金星陈红林王军施志仪王成辉上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

为了解“全红”和“粉玉”瓯江彩鲤(Cyprinus carpio ***)体表组织中的差异色素,分别采用分光光度法和高效液相色谱方法对两种体色瓯江彩鲤的皮肤、鳍条和眼睛中的差异色素进行鉴定。分光光度法测定结果表明:“全红”皮肤中类胡萝卜素... 详细信息

为了解“全红”和“粉玉”瓯江彩鲤(Cyprinus carpio ***)体表组织中的差异色素,分别采用分光光度法和高效液相色谱方法对两种体色瓯江彩鲤的皮肤、鳍条和眼睛中的差异色素进行鉴定。分光光度法测定结果表明:“全红”皮肤中类胡萝卜素含量显著高于“粉玉”皮肤(P<0.05),而蝶啶色素不存在显著性差异(P>0.05)。随后通过高效液相色谱法对这两种体色的皮肤、眼睛和鳍条中类胡萝卜素的种类和含量进行鉴定,发现“全红”的皮肤、眼睛和鳍条中含有大量的以酯化形式存在的虾青素和黄体素,以及部分未知的类胡萝卜素,而“粉玉”的这些组织中检测不到虾青素和黄体素等类胡萝卜素。“全红”鳍条中虾青素含量最高为(28.00±3.61)mg/kg,而皮肤中的黄体素含量最高为(62.34±4.93)mg/kg。研究表明:虾青素和黄体素等类胡萝卜素是瓯江彩鲤红色体色的关键色素,蝶啶色素对红色没有作用,瓯江彩鲤白色体色存在类胡萝卜素的缺失现象。

关键词：瓯江彩鲤类胡萝卜素蝶啶色素体色

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