检索结果-内蒙古大学图书馆

海军军医大学学报 2022年第3期43卷 286-293页

作者：万坤铭谢玮袁梓珂蔡孟成金永生罗鹏飞俞超芹海军军医大学(第二军医大学)基础医学院学员一大队上海200433 海军军医大学(第二军医大学)药学系有机化学教研室上海200433 海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院烧创伤中心上海200433 海军军医大学(第二军医大学)第一附属医院中医妇科上海200433

目的通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库挖掘与乳腺癌预后相关的铁死亡基因,构建乳腺癌预后模型。方法下载TCGA数据库中转录组与临床数据,获取与预后相关的在乳腺癌组织与癌旁正常组织中存在差异表达的铁死亡基因,利用最小绝对收缩和选择算... 详细信息

目的通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库挖掘与乳腺癌预后相关的铁死亡基因,构建乳腺癌预后模型。方法下载TCGA数据库中转录组与临床数据,获取与预后相关的在乳腺癌组织与癌旁正常组织中存在差异表达的铁死亡基因,利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法构建风险评分模型。将TCGA数据库中获取的患者信息作为模型测试集数据,通过ROC曲线评估预后模型的效能,通过单因素与多因素Cox回归分析评价差异表达的铁死亡基因和风险评分能否作为预后因子。利用国际肿瘤基因组协作组(ICGC)数据库与基因表达汇编(GEO)数据库数据作为验证集对该模型进行验证。结果共筛选出51个在乳腺癌组织与癌旁正常组织中存在差异表达的铁死亡基因,单因素Cox回归分析表明11个差异表达的铁死亡基因与乳腺癌预后相关。利用这11个基因构建乳腺癌预后风险评分模型:风险评分=ALOX15×0.11+CHAC1×0.07+CISD1×0.15+CS×0.24+GCLC×0.04+GPX4×(-0.07)+NCOA4×0.17+EMC2×0.30+G6PD×0.19+ACSF2×(-0.04)+SQLE×0.12,ROC曲线分析表明该模型在测试集中预测乳腺癌患者术后2、4、6年生存率的AUC分别为0.678、0.680、0.612,多因素Cox回归分析结果显示预后模型风险评分可作为独立预后因子(HR=3.104,P<0.001)。根据预后模型风险评分是否≥4.277将患者分为高风险组和低风险组,在测试集与验证集中高风险组患者的生存率均低于低风险组患者(P均<0.001)。结论基于铁死亡基因的乳腺癌预后模型具有较好的预测效能,该模型中的铁死亡基因为乳腺癌靶向治疗提供了新的靶点。

关键词：乳腺肿瘤铁死亡预后模型靶向治疗生物信息学

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大学生军训期间睡眠质量及情绪状态调查分析

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智慧健康 2023年第15期9卷 17-20页

作者：罗淑丹张裔俊詹彦斌袁绘杨佳平张萍海军军医大学基础医学院上海200433 东部战区上海201900 海军军医大学第一附属医院脑血管病中心上海200433 海军军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室上海200433

目的调查大学生军训期间睡眠质量及情绪状态,并分析其相关性。方法采用整体抽样调查的方法对某军训期间的大学生进行调查分析。应用匹兹堡睡眠质量指数量表(Pittsburgh sleep quality index,PSQI)、9条目病人健康问卷(Patient Health ... 详细信息

目的调查大学生军训期间睡眠质量及情绪状态,并分析其相关性。方法采用整体抽样调查的方法对某军训期间的大学生进行调查分析。应用匹兹堡睡眠质量指数量表(Pittsburgh sleep quality index,PSQI)、9条目病人健康问卷(Patient Health Questionnaire-9, PHQ-9)、广泛性焦虑量表(Generalized Anxiety Disorder-7-item, GAD-7)和病人健康问卷躯体症状群量表(patient health questionnaire-15, PHQ-15)分别评估其睡眠质量、抑郁、焦虑情绪和躯体化症状。认为PSQI>7分存在睡眠障碍,分析有无睡眠障碍两组间的差异,并分析情绪及躯体化症状与睡眠障碍的相关性。结果共纳入321人,总体睡眠质量均值为(5.69±3.36),有睡眠障碍组(PSQI>7分)88人(27.4%),无睡眠障碍组(PSQI≤7分)233人(72.6%)。有睡眠障碍组抑郁情绪PHQ-9评分(5.76±4.61vs.1.28±2.03,P=0.00)、焦虑情绪GAD-7评分(3.07±4.23vs.0.49±1.16,P=0.00)、躯体化症状PHQ-15评分(5.21±4.75 vs.1.07±1.81,P=0.00)均高于无睡眠障碍组。抑郁评分、焦虑评分和躯体化评分与PSQI总分呈显著正相关(r=0.700,0.500,0.615,P<0.01)。抑郁评分和躯体化评分计入PSQI总分回归方程(F=145.58,P<0.01),预测变异量为45.7%。结论大学生军训期间睡眠障碍发生率较高,抑郁情绪和躯体不适症状影响睡眠质量。高校应重视大学生军训期间的情绪状态和躯体症状,及时干预,改善睡眠质量。

关键词：军训睡眠质量情绪躯体化症状

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质谱成像技术及其在乳腺癌研究中的应用

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色谱 2021年第6期39卷 578-587页

作者：张梦婷张育露王浩江李宁李波肖虹卞伟蔡宗苇山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室山西太原030001 山西医科大学第一医院病理科山西太原030001 香港浸会大学化学系环境与生物分析国家重点实验室中国香港999077

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,其发病率在世界范围内呈现上升趋势,是威胁女性健康的重要疾病之一。随着现代医学技术的快速发展,早期有效的诊断和筛查方法能够改善乳腺癌患者生存率和提高其生活质量。由于乳腺癌肿瘤具有非常显著的异质... 详细信息

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,其发病率在世界范围内呈现上升趋势,是威胁女性健康的重要疾病之一。随着现代医学技术的快速发展,早期有效的诊断和筛查方法能够改善乳腺癌患者生存率和提高其生活质量。由于乳腺癌肿瘤具有非常显著的异质性,这对于诊断和筛查带来了较大困难,亟须在肿瘤演进时间信息中,继续引入生物分子的空间信息,从而对其异质性、肿瘤微环境等进行准确的追踪。质谱成像技术,可在免标记的前提下利用离子质荷比的特性发现生物组织中的各种分子,并研究这些分子的时间和空间信息,对其进行准确的定性、定量和空间定位。目前,通过质谱成像技术可直接获取药物及其代谢物、内源性代谢物、脂质、多肽和蛋白质等在组织中的空间分布信息,为肿瘤分子分型诊断和确认以及相关抗肿瘤药物的筛选提供了新的思路和研究方向。该综述以乳腺癌相关的生物样品制备和研究进展为主要内容,从小分子样本、大分子样本、石蜡包埋样本、基质喷涂方式、常用离子源等方面阐述质谱成像中样本制备的重要性以及样品制备过程中存在的难点问题。同时,以细胞模型、动物模型和临床肿瘤标本为研究对象,汇总了质谱成像技术在乳腺癌方面的应用进展,并进行了展望,为开展癌症精准分型研究和药物药效的快速筛查提供了重要依据。

关键词：质谱成像技术样品前处理乳腺癌

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基于多种癌症的生物信息学分析探究转酮醇酶在耐药中的作用

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生命的化学 2024年第6期44卷 1098-1116页

作者：李松卢占英姜文丽徐尧杨延龙焦炳华卢小玲海军军医大学生物化学与分子生物学教研室上海200433 海军军医大学基础医学院实验教学中心上海200433 海军军医大学第一附属医院中医外科上海200433 海军军医大学中医系上海200433

癌症是目前中国和发达国家主要的死亡原因。随着癌症基因组测序技术的进步与成熟,对癌症相关基因有了更深入的了解,为寻找新的治疗靶点提供了新的可能性。通过生物信息学的研究,结果发现,转酮醇酶(transketolase,TKT)在泛癌的发生和进... 详细信息

癌症是目前中国和发达国家主要的死亡原因。随着癌症基因组测序技术的进步与成熟,对癌症相关基因有了更深入的了解,为寻找新的治疗靶点提供了新的可能性。通过生物信息学的研究,结果发现,转酮醇酶(transketolase,TKT)在泛癌的发生和进展中扮演着关键角色,涉及肿瘤分期和不良预后。大量的数据分析和文献研究揭示了TKT在肿瘤发生中的异常修饰现象,并发现TKT与多种顺铂耐药基因有关。我们对未来充满期待,相信会有更多的TKT抑制剂先导化合物出现,为癌症治疗带来新的希望。

关键词：转酮醇酶泛癌分析 DNA甲基化磷酸化耐药

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基于液相色谱-质谱联用技术探索胃癌的糖肽生物分子标志物

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药学服务与研究 2019年第1期19卷 19-24页

作者：杨楠范国荣海军军医大学药学院药物分析学教研室上海市药物(中药)代谢产物研究重点实验室上海200433 海军青岛特勤疗养中心药剂科山东青岛266072 同济大学医学院药物代谢和药代动力学研究实验室上海200092 上海交通大学附属第一人民医院临床药学科上海200080

目的:探索胃癌病人血清中潜在的N-糖肽生物分子标志物。方法:采用超高效液相色谱串联三重四级杆质谱法(UPLC-QqQ-MS/MS)对胃癌病人和胃炎病人血清中的N-糖肽进行定量分析,通过独立样本t检验与偏最小二乘法(partialleast squares,PLS)对... 详细信息

目的:探索胃癌病人血清中潜在的N-糖肽生物分子标志物。方法:采用超高效液相色谱串联三重四级杆质谱法(UPLC-QqQ-MS/MS)对胃癌病人和胃炎病人血清中的N-糖肽进行定量分析,通过独立样本t检验与偏最小二乘法(partialleast squares,PLS)对数据进行分析。结果:对约60种N-糖肽进行统计分析,找到7个具有显著性差异的N-糖肽,分别为N4400-IgG1、N5400-IgG1、N4410-IgG1、N3500-IgA、N5400-IgA、N5402-IgA和N5501-J。以这7种N-糖肽对测试组进行PLS分析,结果表明胃炎病人和胃癌病人之间已出现一定的分离趋势。结论:本研究发现了胃癌潜在的N-糖肽生物分子标志物。该方法为探索胃癌生物分子标志物提供了有力的技术支持,对胃癌的早期诊断具有重要临床意义。

关键词：胃癌 N-糖肽生物分子标志物色谱法,高效液相质谱法,联用

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LC-MS/MS法研究替诺福韦、拉米夫定和依非韦伦在SD大鼠体内的组织分布

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中南药学 2018年第5期16卷 581-589页

作者：余史丹邬声远蓝丽爱程茹范国荣第二军医大学药学院药物分析学教研室上海市药物(中药)代谢产物研究重点实验室上海200433 同济大学医学院上海200092 上海应用技术大学上海201418 上海交通大学附属第一人民医院临床药学科上海200080

目的建立同时测定SD大鼠组织中替诺福韦、拉米夫定和依非韦伦的LC-MS/MS分析方法,并研究三药联用口服给药后各药物在SD大鼠体内的组织分布。方法以恩曲他滨为内标,通过甲醇沉淀组织样品蛋白,取上清液进行LC-MS/MS分析。采用Agilent ZORB... 详细信息

目的建立同时测定SD大鼠组织中替诺福韦、拉米夫定和依非韦伦的LC-MS/MS分析方法,并研究三药联用口服给药后各药物在SD大鼠体内的组织分布。方法以恩曲他滨为内标,通过甲醇沉淀组织样品蛋白,取上清液进行LC-MS/MS分析。采用Agilent ZORBAX SB-Aq色谱柱(4.6 mm×150 mm,5μm),以水(含25 mmol·L^(-1)醋酸铵+0.1%甲酸)-甲醇为流动相,梯度洗脱,正离子多反应监测(MRM)检测。结果在线性范围内替诺福韦、拉米夫定及依非韦伦的线性关系良好,日内和日间精密度、准确度、回收率、稳定性等均符合生物样品定量分析要求。各药物广泛分布于SD大鼠体内,其中替诺福韦和拉米夫定在肾组织中含量最高,脑组织中最少;依非韦伦在肝组织中含量最高,肺组织中最少。结论本方法快速、灵敏、准确,适用于新型抗艾滋病复方药物在SD大鼠体内的组织分布研究。

关键词： LC-MS/MS 替诺福韦拉米夫定依非韦伦组织分布 SD大鼠

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抗艾滋病药物体内分析方法及药代动力学研究进展

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中南药学 2018年第5期16卷 652-660页

艾滋病(AIDS)是由人类免疫缺陷病毒(HIV)感染引起的重大传染病,抗病毒治疗是目前临床上控制和治疗艾滋病的关键手段。近年来,高效、安全的新型抗艾滋病药物不断研发上市,抗病毒治疗方案得到了进一步优化。本文主要对抗艾滋病药物体内分... 详细信息

艾滋病(AIDS)是由人类免疫缺陷病毒(HIV)感染引起的重大传染病,抗病毒治疗是目前临床上控制和治疗艾滋病的关键手段。近年来,高效、安全的新型抗艾滋病药物不断研发上市,抗病毒治疗方案得到了进一步优化。本文主要对抗艾滋病药物体内分析方法和药代动力学研究进展进行概述,以期为临床治疗药物监测及合理用药提供参考。

关键词：艾滋病抗艾滋病药物体内分析方法药代动力学

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肾缺血／再灌注损伤中近曲小管Legumain表达的研究

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徐州医科大学学报 2017年第5期37卷 281-286页

作者：高帅夏安周侯筱宇郭义峰上海交通大学附属第一人民医院泌尿外科上海200080 徐州医科大学药理学教研室江苏徐州221004 徐州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学研究中心

目的建立小鼠肾缺血／再灌注损伤模型，观察小鼠肾缺血／再灌注后的损伤、Legumain的表达，探讨Legumain在小鼠肾脏缺血／再灌注损伤中的作用及可能机制。方法30只C57BL／6小鼠行右肾切除后随机分为缺血／再灌注损伤组（IRI组）、对照... 详细信息

目的建立小鼠肾缺血／再灌注损伤模型，观察小鼠肾缺血／再灌注后的损伤、Legumain的表达，探讨Legumain在小鼠肾脏缺血／再灌注损伤中的作用及可能机制。方法30只C57BL／6小鼠行右肾切除后随机分为缺血／再灌注损伤组（IRI组）、对照组，夹闭左肾蒂45min缺血，缺血后再灌注不同时间（1h、6h、24h），检测各组小鼠血肌酐、尿素氮水平，观察肾组织形态学变化，免疫组化技术与蛋白印迹分析Legumain的表达。结果IRI组肾脏经过缺血／再灌注后，血肌酐及尿素氮水平在1h、6h、24h再灌注时间点较对照组明显升高（P〈0．05）。IRI组小鼠肾损伤程度较对照组明显加重，表现为肾小管细胞坏死脱落、间质水肿、炎症细胞浸润增多，损伤随着再灌注时间的延长而加重。IRI组肾近曲小管中Legumain的表达较对照组明显增强（P〈0．01）。结论肾缺血后再灌注会造成损伤，导致肾功能下降、肾小管细胞损伤坏死、Legumain表达增强，Legumain的表达变化可能在肾缺血／再灌注损伤中起重要作用。

关键词：肾脏缺血/再灌注损伤 Legumain

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Survivin RNAi联合PsL 5F影响MCF-7细胞增殖和凋亡的研究

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实用癌症杂志 2016年第1期31卷 4-6页

作者：刘轩王润秀吴小云谢富华赣州市肿瘤医院 341000 赣南医学院第一附属医院 341000 赣南医学院生物化学与分子生物学教研室 341000 赣南医学院分析与检测实验教学中心 341000

目的探讨RNAi介导的基因治疗联合天然药物半边旗提取物5F(Ps L 5F)对肿瘤细胞增殖和凋亡的影响。方法采用腺病毒介导Survivin RNAi联合PsL 5F作用乳腺癌细胞MCF-7,免疫印迹法检验Survivin被沉默的程度,通过MTT检测细胞的增殖情况,流式... 详细信息

目的探讨RNAi介导的基因治疗联合天然药物半边旗提取物5F(Ps L 5F)对肿瘤细胞增殖和凋亡的影响。方法采用腺病毒介导Survivin RNAi联合PsL 5F作用乳腺癌细胞MCF-7,免疫印迹法检验Survivin被沉默的程度,通过MTT检测细胞的增殖情况,流式细胞术检测细胞凋亡情况。结果免疫印迹实验发现Survivin蛋白的表达明显被抑制;MTT实验表明联合作用对细胞增殖的抑制作用从单独应用的50.00%(P<0.001),提高到86.12%(P<0.001);流式细胞术也发现联合应用能更大程度地促进细胞的凋亡。结论 Survivin RNAi和PsL 5F联合作用,可显著提高对MCF-7细胞增殖的抑制作用和对细胞凋亡的促进作用,这为肿瘤的综合治疗提供了理论基础和实验室依据。

关键词： Survivin RNA干扰半边旗提取物5F MCF-7细胞

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2型糖尿病易感候选基因在世界不同人群中的多样性比较分析

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遗传 2016年第6期38卷 543-559页

作者：弓弦张超伊利亚斯.艾萨时瑛杨雪唯努尔斯曼古丽.奥斯曼关亚群徐书华新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室乌鲁木齐830000 中科院?马普学会计算生物学伙伴研究所中国科学院计算生物学重点实验室上海200031 中国科学院大学北京100049 新疆医科大学第一附属医院医学检验中心乌鲁木齐830000 上海科技大学生命科学与技术学院上海201210 遗传与发育协同创新中心上海200438

近10年来兴起的全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)相关研究结果获得了大量与2型糖尿病相关的候选易感基因,了解这些候选基因在正常人群中的遗传多样性程度以及在不同人群间的遗传差异,不但有助于阐明2型糖尿病的遗... 详细信息

近10年来兴起的全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)相关研究结果获得了大量与2型糖尿病相关的候选易感基因,了解这些候选基因在正常人群中的遗传多样性程度以及在不同人群间的遗传差异,不但有助于阐明2型糖尿病的遗传机理,而且对于今后在特定人群中进行2型糖尿病发病机制的深入研究具有指导意义。本研究通过对GWAS数据库和相关文献的搜索和整理确定了170个与2型糖尿病相关的基因或基因区域;随后基于千人基因组计划的全基因组测序数据对这些候选基因在世界范围内14个人群间的遗传多样性进行了比较分析;进一步确定了在人群间存在显著差异的易感基因,并分析了这些基因的多样性特征。在所研究的14个世界人群中,2型糖尿病候选易感基因的遗传多样性与基因组范围的平均水平没有显著差异;但其中8个易感基因IL20RA、RNMTL1-NXN、NOTCH2、ADRA2A-BTBD7P2、TBC1D4、RBM38-HMGB1P1、UBE2E2和PPARD在群体间呈现显著差异,其中最明显的是IL20RA基因(FST=0.152),该易感基因在非洲人群和非非洲人群间存在显著等位基因频率和单倍型频率差异。14个人群中易感基因遗传结构差异的主要原因是由于非洲人群与非非洲人群之间的群体遗传结构的不同所造成的。进一步比较东西方人群间的2型糖尿病候选基因遗传结构差异,发现在东西方人群中同样存在明显的群体遗传结构差别,其中DGKB-AGMO(FST=0.173)和JAZF1(FST=0.182)是差异最显著的易感基因。本研究通过对群体间2型糖尿病易感基因遗传结构进行比较,鉴别出一些差异特别显著的易感基因,对今后2型糖尿病易感基因与不同人群间发病率和易感性差异的相关研究提供重要参考。

关键词： 2型糖尿病易感基因遗传多样性单核苷酸多态性世界人群

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