检索结果-内蒙古大学图书馆

色谱 2021年第6期39卷 578-587页

作者：张梦婷张育露王浩江李宁李波肖虹卞伟蔡宗苇山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室山西太原030001 山西医科大学第一医院病理科山西太原030001 香港浸会大学化学系环境与生物分析国家重点实验室中国香港999077

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,其发病率在世界范围内呈现上升趋势,是威胁女性健康的重要疾病之一。随着现代医学技术的快速发展,早期有效的诊断和筛查方法能够改善乳腺癌患者生存率和提高其生活质量。由于乳腺癌肿瘤具有非常显著的异质... 详细信息

乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤,其发病率在世界范围内呈现上升趋势,是威胁女性健康的重要疾病之一。随着现代医学技术的快速发展,早期有效的诊断和筛查方法能够改善乳腺癌患者生存率和提高其生活质量。由于乳腺癌肿瘤具有非常显著的异质性,这对于诊断和筛查带来了较大困难,亟须在肿瘤演进时间信息中,继续引入生物分子的空间信息,从而对其异质性、肿瘤微环境等进行准确的追踪。质谱成像技术,可在免标记的前提下利用离子质荷比的特性发现生物组织中的各种分子,并研究这些分子的时间和空间信息,对其进行准确的定性、定量和空间定位。目前,通过质谱成像技术可直接获取药物及其代谢物、内源性代谢物、脂质、多肽和蛋白质等在组织中的空间分布信息,为肿瘤分子分型诊断和确认以及相关抗肿瘤药物的筛选提供了新的思路和研究方向。该综述以乳腺癌相关的生物样品制备和研究进展为主要内容,从小分子样本、大分子样本、石蜡包埋样本、基质喷涂方式、常用离子源等方面阐述质谱成像中样本制备的重要性以及样品制备过程中存在的难点问题。同时,以细胞模型、动物模型和临床肿瘤标本为研究对象,汇总了质谱成像技术在乳腺癌方面的应用进展,并进行了展望,为开展癌症精准分型研究和药物药效的快速筛查提供了重要依据。

关键词：质谱成像技术样品前处理乳腺癌

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基于生物信息学对扩张型心肌病与慢性心力衰竭共同生物标志物的预测

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解剖学杂志 2022年第5期45卷 439-444页

作者：黄青青李书珍杜晶晶石笑娜李克研锦州医科大学附属第一医院心血管内科锦州121000 锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室锦州121000

目的:通过生物信息学的方法预测扩张型心肌病(DCM)与慢性心力衰竭(CHF)发病的共同生物标志物,为临床上2种疾病的发病及相关性奠定理论基础。方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载芯片数据GSE3585,此为DCM和正常对照组原始数据... 详细信息

目的:通过生物信息学的方法预测扩张型心肌病(DCM)与慢性心力衰竭(CHF)发病的共同生物标志物,为临床上2种疾病的发病及相关性奠定理论基础。方法:从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库下载芯片数据GSE3585,此为DCM和正常对照组原始数据,同时下载芯片数据GSE76701,此为CHF和对照组原始数据。通过R软件分析获得DCM和CHF发病的差异表达基因,并获得2种疾病发病的共同差异表达基因,进一步对共同差异表达基因进行GO和KEGG富集分析,构建差异表达基因的PPI相互作用网络图,获得扩张型心肌病和心衰发病的共同关键基因。结果:DCM的差异表达基因有240个,其中141个上调基因,99个下调基因,CHF的差异表达基因有654个,其中355个上调基因,299个下调基因。DCM和CHF共同的差异表达基因有36个,其中19个上调基因,17个下调基因。GO分析显示,差异表达基因主要集中在12种不同的生理、病理过程中,KEGG分析获得差异表达基因参与的主要信号通路为5条,预测7个关键差异表达基因,分别为:CD163、KYVE1、MRC1、VSIG4、FCER1G、S100A9、F13A1。结论:该研究初步探讨了DCM与CHF两种疾病发病分子机制,获得了两种疾病发病的共同差异表达基因,仍需进一步的实验研究对基因的表达和临床病理特征的相关性进行验证。

关键词：扩张型心肌病慢性心力衰竭生物信息学差异表达基因

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抗血小板整合素β3抗体诱导内皮细胞凋亡机制的研究

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中国实验血液学杂志 2021年第2期29卷 567-573页

作者：王健玉王明镜孙平孙妍王学哲胡晓梅全日城 LIANG Simon-Xun 锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室辽宁锦州121000 中国中医科学院西苑医院血液科北京100091 济宁市第一人民医院血液科山东济宁272000 锦州医科大学第一附属医院临床检验科辽宁锦州121001 锦州医科大学基础医学院病理解剖教研室辽宁锦州121000

目的:探讨抗血小板整合素β3抗体对人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)的损伤及其相关机制。方法:收集36例慢性免疫性血小板减少症患者的血清,通过流式细胞术和单克隆抗体特异性俘获血小板抗原技术(MAIPA)筛选出含抗整合素β3抗体的患者血清... 详细信息

目的:探讨抗血小板整合素β3抗体对人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)的损伤及其相关机制。方法:收集36例慢性免疫性血小板减少症患者的血清,通过流式细胞术和单克隆抗体特异性俘获血小板抗原技术(MAIPA)筛选出含抗整合素β3抗体的患者血清。用抗整合素β3血清处理HUVEC后,乳酸脱氢酶(LDH)活性测定法检测HUVEC损伤情况,流式细胞术检测HUVEC凋亡情况,逆转录实时荧光定量PCR(RT-q PCR)检测HUVEC凋亡相关基因Bax表达情况,Western blot检测细胞凋亡相关信号通路蛋白Akt和相关蛋白Bax的表达情况。用抗整合素β3血清结合Akt激活剂SC79处理HUVEC后,LDH活性测定法检测HUVEC损伤情况,流式细胞术检测HUVEC的凋亡情况,RT-q PCR检测HUVEC凋亡相关基因Bax的表达情况。结果:从36份患者血清中筛选出5份含抗整合素β3抗体血清,用这些血清处理HUVEC后,细胞外LDH活性增加(P<0.05),细胞凋亡比例增加(P<0.05),Bax蛋白和mRNA表达水平上调(P<0.05),p Akt蛋白表达下调(P<0.05)。抗整合素β3血清结合SC79处理HUVEC后,与单独使用抗整合素β3血清处理组相比,细胞外LDH活性显著降低(P<0.05),HUVEC凋亡比例显著下降(P<0.05),Bax基因表达下降(P<0.05)。结论:抗整合素β3抗体在体外能够引起HUVEC的损伤和凋亡,其作用机制可能与抑制Akt信号通路有关,且Akt激活剂SC79能够在体外抑制抗整合素β3抗体引起的HUVEC损伤和凋亡。

关键词：免疫性血小板减少症抗整合素β3抗体 Akt 凋亡内皮细胞

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单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用与展望

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现代泌尿外科杂志 2022年第4期27卷 356-360页

作者：郑越杨晓峰山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室山西医科大学第一医院泌尿外科山西太原030000

单细胞测序技术能够在单个细胞层面,通过差异表达分析的方式研究肿瘤微环境的致病机制,促进个性化诊疗和精准医学的不断进步。本文将通过总结单细胞测序技术的发展前沿,及其在研究膀胱癌遗传起源、异质性细胞亚群、免疫微环境、当前的... 详细信息

单细胞测序技术能够在单个细胞层面,通过差异表达分析的方式研究肿瘤微环境的致病机制,促进个性化诊疗和精准医学的不断进步。本文将通过总结单细胞测序技术的发展前沿,及其在研究膀胱癌遗传起源、异质性细胞亚群、免疫微环境、当前的治疗手段及检测膀胱癌患者尿液脱落细胞等方面的最新进展,同时探讨近期出现的基于单细胞测序的空间转录组测序技术和时空分子医学展望。

关键词：膀胱癌单细胞测序技术肿瘤微环境肿瘤内异质性

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整合素β1在肝泡型包虫病患者肝脏中的表达及其与临床病理特征的相关性

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中国病原生物学杂志 2021年第5期16卷 552-556页

作者：刘辉杨宁毕晓娟柯颖孙立楚瑨孙涛吕国栋林仁勇新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室

目的检测肝泡型包虫病(AE)患者肝组织中整合素β1(Integrinβ1)的表达水平,并探讨其与患者临床病理特征的相关性。方法取73例AE患者肝脏组织样品及8例正常肝脏样品做石蜡组织切片,采用免疫组织化学染色法检测Integrinβ1的表达情况,分析... 详细信息

目的检测肝泡型包虫病(AE)患者肝组织中整合素β1(Integrinβ1)的表达水平,并探讨其与患者临床病理特征的相关性。方法取73例AE患者肝脏组织样品及8例正常肝脏样品做石蜡组织切片,采用免疫组织化学染色法检测Integrinβ1的表达情况,分析Integrinβ1的表达水平与Child-pugh分级、PNM分型、血管新生等临床病理特征的相关性。结果AE患者病灶近旁及远端肝组织integrinβ1表达显著高于正常肝组织(P<0.01)。相关性分析显示Integrinβ1表达与AE患者PNM分型及新生血管数(Integrinβ1高表达组23.7±10.78,低表达组16.09±7.35)呈正相关(P<0.05),且随着AE病灶范围(P分期)的加重,Integrinβ1呈高表达(P1,0%;P2,13.6%;P3,75.0%;P4,50%)(P<0.01),而与患者年龄、性别、Child-Pugh分级等无显著相关性(均P>0.05)。结论肝泡型包虫病患者的肝组织高表达Integrinβ1,提示Integrinβ1可能参与AE病灶浸润过程,为阐明AE的致病机制和寻找新的药物靶标奠定了基础。

关键词：肝泡型包虫病整合素β1(Integrinβ1) 相关性分析

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新疆株细粒棘球蚴Innexin-unc9ORF的克隆鉴定及蛋白生物信息学分析

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中国病原生物学杂志 2021年第11期16卷 1272-1279页

作者：黎飞海吴军李军张文宝吴川川杨梅新疆医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生教研室新疆乌鲁木齐830011 新疆医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室新疆医科大学第一附属医院临床医学研究院省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室

目的分子克隆新疆株细粒棘球绦虫缝隙连接通道蛋白(也称内联蛋白,EgInnexin unc9,EgInx)的完整开放阅读框(ORF)并鉴定,利用生物信息学软件分析该蛋白的分子特性,为进一步研究EgInx的功能和研制犬抗细粒棘球绦虫疫苗奠定基础。方法从新... 详细信息

目的分子克隆新疆株细粒棘球绦虫缝隙连接通道蛋白(也称内联蛋白,EgInnexin unc9,EgInx)的完整开放阅读框(ORF)并鉴定,利用生物信息学软件分析该蛋白的分子特性,为进一步研究EgInx的功能和研制犬抗细粒棘球绦虫疫苗奠定基础。方法从新疆株细粒棘球蚴中扩增EgInx-ORF全长,克隆到pMD20-T上并测序;利用Expasy ProtParam、ProtScale、SignalP-5.0、TMHMM2.0、NetPhos3.1、ProtCompv9.0、NetSurfP-2.0和SOPMA、SWISS-MODEL等生物信息学分析软件分析EgInx的理化特性、信号肽序列、跨膜结构域、磷酸化位点、蛋白翻译后修饰位点及亚细胞定位、二级结构及三级结构;采用BLAST进行蛋白序列的同源性分析,采用Mega7进行系统进化分析。结果EgInx-ORF全长约1317 bp,编码438个氨基酸残基的EgInx蛋白;该蛋白等电点7.19,不稳定系数48.05,为不稳定蛋白;亲水性平均系数0.086,为疏水性蛋白,存在4个跨膜结构域;该蛋白不含信号肽序列,可能是非分泌跨膜蛋白。EgInx具有42个丝氨酸(Ser)磷酸化位点,29个苏氨酸(Thr)磷酸化位点,10个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;该蛋白有多个翻译后修饰位点,主要定位于细胞膜、高尔基体和线粒体。预测其二级结构以α-螺旋为主,占53.42%;三维结构以八聚体形式组装。EgInx与扁形动物门绦虫纲的多房棘球绦虫(Em)、小口膜壳绦虫(Hm),涡虫纲的东亚三角头涡虫(Dj),吸虫纲的中华枝睾吸虫(Cs)、日本血吸虫(Sj)的Innexin unc 9的氨基酸序列一致性分别为98.14%、58.97%、33.66%、33.11%、33.69%。进化树分析显示,EgInx与Em、Hm的Inx在一个分支上。结论成功克隆了EgInx-ORF,预测EgInx蛋白为疏水性跨膜蛋白,且含有多个磷酸化位点,可为EgInx的功能研究提供参考。

关键词：细粒棘球绦虫内联蛋白克隆生物信息学

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GATA-3小干扰RNA载体对变应性鼻炎小鼠外周血单个核细胞中辅助性T细胞亚群功能的体内调节机制

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中国耳鼻咽喉头颈外科 2023年第10期30卷 646-651页

作者：李玉晓贺铭王天蓉王雨昆明医科大学第一附属医院耳鼻咽喉头颈外科云南昆明650032 中山大学附属第七医院(深圳)耳鼻咽喉科广东深圳517108 昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室云南昆明650500

目的研究RNA干扰(RNA interference,RNAi)介导的GATA-3小干扰RNA载体(si-GATA-3)对变应性鼻炎(AR)小鼠外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中辅助性T细胞1(T-helper 1,Th1)和Th2功能的调节作用。方法构建si-GATA-3,用卵清蛋白构建BALB/c AR模型,si-GATA-3组、si-NC组(无目标基因小干扰RNA的空白对照组)分别用si-GATA-3和si-NC腹腔注射干预AR小鼠,AR组和正常对照组用等量的生理盐水干预。干预结束抽取其外周血,分离PBMCs和血浆。分别用荧光定量PCR和Western blot技术检测PBMCs中GATA-3和T-bet mRNA及其相应蛋白的表达量;用ELISA技术检测血浆中白细胞介素4(IL-4)和干扰素γ(IFN-γ)的含量。结果 si-GATA-3滴度为5×10^(8)TU/ml。成功制备BALB/C小鼠AR模型。si-GATA-3能明显改善AR小鼠的症状。si-GATA-3组PBMCs中GATA-3 mRNA表达明显低于AR组和si-NC组(P<0.01),AR组和si-NC组明显高于正常对照组(P<0.01)。PBMCs中GATA-3蛋白和血浆中IL-4的表达量与GATA-3 mRNA表达相似。si-GATA-3组PBMCs中T-bet mRNA及其蛋白的相对表达均明显高于AR组和si-NC组(P<0.01),AR组和si-NC组二者均明显低于对照组(P<0.01)。si-GATA-3组血浆中IFN-γ的表达量高于正常对照组(P<0.05);AR组与si-NC组中IFN-γ的表达量均明显高于正常对照组和si-GATA-3组(P<0.01)。结论 si-GATA-3能有效改善AR小鼠症状,下调AR小鼠PBMCs中Th2细胞中GATA-3 mRNA、GATA-3蛋白和IL-4的表达,同时上调Th1细胞中T-bet mRNA和T-bet蛋白的表达,纠正Th2/Th1的免疫失衡。

关键词：鼻炎过敏 RNA干扰模型动物小鼠 GATA-3 T-bet 慢病毒载体

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姜黄素通过调控PI3K-Akt信号途径抑制三阴性乳腺癌Hs578T细胞的增殖

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西南医科大学学报 2025年第2期48卷 184-191页

作者：陈泽李梦晗李雪灵张青卢品君何涛甘淋西南医科大学基础医学院肿瘤医学研究所泸州646000 昆明医科大学第一附属医院心血管内科昆明650000 西南医科大学儿科学系泸州646000 西南医科大学附属医院皮肤科泸州646000 西南医科大学附属医院护理部泸州646000 西南医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室泸州646000

目的本研究旨在运用RNA测序和生物信息学等预测姜黄素对三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)Hs578T细胞的抗癌机制,并通过体外实验对潜在的分子机制进行验证。方法用姜黄素处理Hs578T细胞后,采用CCK-8法检测姜黄素对细胞... 详细信息

目的本研究旨在运用RNA测序和生物信息学等预测姜黄素对三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer,TNBC)Hs578T细胞的抗癌机制,并通过体外实验对潜在的分子机制进行验证。方法用姜黄素处理Hs578T细胞后,采用CCK-8法检测姜黄素对细胞增殖能力的影响,使用流式细胞术检测姜黄素对细胞凋亡和周期的影响,再使用Transwell实验检测姜黄素对细胞运动能力的影响。然后进行转录组测序、构建PPI网络和富集分析对姜黄素的抗癌机制进行预测,最后使用蛋白免疫印迹技术检测姜黄素对Hs578T细胞增殖相关蛋白的影响。结果姜黄素作用于Hs578T细胞24 h后,CCK8检测结果提示姜黄素的IC50约为20μmol/L。使用20μmol/L姜黄素刺激的Hs578T细胞为实验组,未进行姜黄素刺激的细胞为对照组。较对照组,实验组结果显示姜黄素能显著抑制Hs578T细胞的增殖能力,具有时间和浓度依赖性;显著诱导细胞凋亡,阻滞细胞周期于G2/M期;显著抑制细胞的迁移和侵袭能力,相较于对照组差异均具有统计学意义(P<0.05)。PPI网络分析的结果显示差异表达基因表达的蛋白质之间具有相互作用关系。转录组测序和生物信息学分析的结果显示,姜黄素通过参与多条信号通路发挥抗癌作用,如癌症中的信号通路、PI3K-Akt信号通路等。蛋白印迹结果显示姜黄素能在Hs578T细胞中显著抑制m TOR、p-Akt、Akt、p-S6、S6蛋白表达。结论姜黄素可能通过抑制PI3K-Akt信号通路相关蛋白的表达来发挥其抗增殖作用,为临床姜黄素治疗TNBC提供了理论依据和实验基础。

关键词：姜黄素三阴性乳腺癌生物信息学 PI3K-Akt

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实用口腔医学杂志 2021年第1期37卷 5-9页

作者：黎哲昊卜歆封琳胡君璧申亮亮关键佳木斯大学附属口腔医院颌面外科 154002 第四军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室陕西中医药大学西安交通大学第一附属医院消化内科

目的:研究肿瘤相关中性粒细胞对人粘液表皮样癌MC3细胞上皮-间质转变(EMT)和侵袭转移过程调控的功能及机制。方法:分离培养C57小鼠骨髓中性粒细胞,Transwell检测肿瘤相关中性粒细胞对MC3侵袭和迁移的影响;Western印迹和Real-time PCR检... 详细信息

目的:研究肿瘤相关中性粒细胞对人粘液表皮样癌MC3细胞上皮-间质转变(EMT)和侵袭转移过程调控的功能及机制。方法:分离培养C57小鼠骨髓中性粒细胞,Transwell检测肿瘤相关中性粒细胞对MC3侵袭和迁移的影响;Western印迹和Real-time PCR检测Vimentin等mRNA和蛋白表达;免疫荧光等检测Vimentin表达。结果:肿瘤相关中性粒细胞中TGF-β表达增加;MC3细胞与中性粒细胞共培养后Vimentin和Snail表达增加;裸鼠体内实验表明中性粒细胞浸润程度与Vimentin表达相关。结论:肿瘤相关中性粒细胞通过TGF-β诱导MC3细胞中Snail表达,并促进肿瘤侵袭和转移。

关键词：人粘液表皮样癌肿瘤相关中性粒细胞上皮-间质转变

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肝细胞癌差异表达的癌—睾丸抗原筛选及表达初步验证

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广西医科大学学报 2022年第4期39卷 589-595页

作者：李晓莹刘畅李鑫薛春红农蔚霞葛盈盈张庆梅谢小薰罗彬曾麒燕广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室南宁530021 广西医科大学基础医学院组织学与胚胎学教研室南宁530021 广西医科大学第一附属医院南宁530021 广西医科大学广西高校生物分子医学研究重点实验室南宁530021

目的:通过生物信息学方法筛选肝细胞肝癌(HCC)相关癌—睾丸抗原(CTA)并进行实验验证,为HCC免疫靶向治疗奠定基础。方法:通过GEPIA数据库筛选HCC中显著差异表达CTA,再用LinkedOmics数据库分析这些CTA与HCC预后的关系,并获取与这些CTA正... 详细信息

目的:通过生物信息学方法筛选肝细胞肝癌(HCC)相关癌—睾丸抗原(CTA)并进行实验验证,为HCC免疫靶向治疗奠定基础。方法:通过GEPIA数据库筛选HCC中显著差异表达CTA,再用LinkedOmics数据库分析这些CTA与HCC预后的关系,并获取与这些CTA正相关的共表达基因集,进一步用DAVID数据库对这些CTA进行功能分析。共收集32例HCC组织,选择其中10例配对癌旁组织,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CTA mRNA表达。结果:通过生物信息学的方法,筛选出HCC中5个显著差异表达且与预后相关的CTA:NUF2、PBK、KIF2C、OIP5和SPA17;进一步对这5个CTA进行功能预测,发现它们主要参与转录及其调控、细胞分裂、纤毛形态发生等生物学过程,涉及细胞周期、剪接体及RNA运输等信号通路。RTqPCR结果显示,NUF2和PBK在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织。结论:CTA NUF2和PBK高表达于HCC,有望成为HCC潜在的治疗靶点。

关键词：肝细胞癌癌睾丸抗原生物信息学分析

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