目的探讨SOST基因和低密度脂蛋白5(low density lipoprotein 5,LRP5)基因多态性及突变与石河子地区绝经后2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)女性骨代谢的关系,为绝经后T2DM伴骨质疏松(osteoporosis,OP)的发生给予指导。方法选取...
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目的探讨SOST基因和低密度脂蛋白5(low density lipoprotein 5,LRP5)基因多态性及突变与石河子地区绝经后2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)女性骨代谢的关系,为绝经后T2DM伴骨质疏松(osteoporosis,OP)的发生给予指导。方法选取2018年7月至2019年7月期间在新疆石河子大学医学院第一附属医院内分泌代谢科门诊就诊的135例绝经后女性作为研究对象(45岁≤年龄<87岁),按照骨密度(bone mineral density,BMD)结果分为骨量正常组(n=52)和骨量异常组(n=83),再依据是否伴T2DM分为4个亚组,血糖正常伴骨量正常组(n=26)、血糖正常伴骨量异常组(n=28)、T2DM伴骨量正常组(n=26)及T2DM伴骨量异常组(n=55);记录其年龄等一般基线资料;生化分析仪(全自动性)检测碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)、三酰甘油(triacylglycerol,TG)与空腹血糖(fasting plasma glucose,FPG)等生物化学指标参数;双能X线吸收检测法(dual-energy X-ray absorptiometry,DXA)法检测BMD;飞行时间质谱(time-of-flight mass spectrometry,TOF-MS)法检测LRP5基因与SOST基因位点的多态性。结果在LRP5基因rs901825位点中,与A组相比,D组基因型分布差异有统计学意义(P<0.01);在LRP5基因rs7125942位点中,与A组相比,B组基因型分布差异有统计学意义(P<0.05)。在D组中,SOST基因rs10534024位点,***/***基因型(突变型)的BMD(股骨颈)低于***基因型(野生型)(0.69±0.13 vs 0.76±0.10,P<0.05);LRP5基因rs7125942位点,在TG上,CC基因型(野生型)、CG基因型(突变型)分别为4.12±0.79、3.22±1.04,前者显著偏高(P<0.01)。在B组分析SOST基因rs851054位点发现,在TG上,相较AG/AA基因型(突变型),GG基因型(野生型)显著偏高(2.11±1.19 vs 1.30±0.80,P<0.05)。交互作用:SOST基因rs851054位点与LRP5基因rs7125942位点的交互作用对BMD(股骨颈)产生影响(P<0.05);SOST基因和LRP5基因4个位点的交互作用对BMD(股骨颈)产生影响(P<0.01)。多元线性回归分析:SOST基因rs10534024位点、体质量指数、TG与于BMD(L1-4)水平正向相关;LRP5基因rs7125942位点、绝经年限(BMD股骨颈)水平与负向相关。结论通过调查石河子区域绝经后女性发现,其LRP5基因rs901825位点基因多态性和骨代谢、糖代谢可能相关;在LRP5基因rs7125942位点,基因多态性与骨代谢有关且是BMD降低的危险因素,基因突变可能与脂代谢有关。对石河子区域绝经后女性调查发现,其SOST基因rs10534024位点的基因突变和BMD可能相关。SOST基因和LRP5基因的交互作用可能是BMD(股骨颈)降低的危险因素。
目的 通过生物信息学分析研究索拉非尼(sorafenib)耐药及敏感的肝癌细胞间基因表达的差异,找出关键的差异表达基因,从而预测在肝细胞癌对索拉非尼耐药发生发展中的关键基因。方法 从GEO数据库中下载GSE26391基因数据(包含4个对索拉非尼敏感的肝癌细胞样本,4个对索拉非尼耐药的肝癌细胞样本)。利用Morpheus在线软件分析,筛选出差异表达基因。运用Human Protein Atlas数据库分析差异表达基因乳酸脱氢酶B(LDHB)在肝癌与正常肝组织中的蛋白表达水平。并进一根据LDHB在肝癌患者中的表达高低进行分组后行生存分析。利用在线数据库LinkedOmics分析肝癌中与LDHB表达相关的靶基因。结果 基因芯片GSE26391数据分析显示,相比于对索拉非尼敏感肝癌细胞,在索拉非尼耐药肝癌细胞中LDHB表达上调。Human Protein Atlas数据库分析显示,与正常肝组织相比,LDHB在肝细胞癌组织中表达上调。生存分析显示,LDHB高表达的肝癌患者预后相对较差。LinkedOmics数据库分析显示Vimentin、ZEB1、ZEB2、Snial等EMT相关关键蛋白与LDHB表达正相关。结论 LDHB通过上调Vimentin、ZEB1、ZEB2、Snial蛋白,可能促进EMT的发生,从而介导肝癌中索拉非尼的耐药。
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