检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2023年第4期39卷 1815-1824页

作者：徐小放杨春德舒坤贤袁新普李默程朱云平陈涛重庆邮电大学计算机科学与技术学院重庆400065 军事科学院军事医学研究院生命组学研究所国家蛋白质科学中心(北京)北京蛋白质组研究中心蛋白质组学国家重点实验室北京102206 重庆邮电大学大数据生物智能重庆市重点实验室重庆400065 解放军总医院第一医学中心普通外科医学部北京102206 国防科技大学计算机学院量子信息研究所兼高性能计算国家重点实验室湖南长沙410073

抗菌肽(antimicrobial peptides,AMPs)广泛存在于生命体中,是一种具有广谱抗菌活性、免疫调节功能的小分子多肽。抗菌肽不易产生耐药性,适用范围广,具有极大的临床价值,是传统抗生素的有力竞争者。识别抗菌肽是抗菌肽研究领域中的重要... 详细信息

抗菌肽(antimicrobial peptides,AMPs)广泛存在于生命体中,是一种具有广谱抗菌活性、免疫调节功能的小分子多肽。抗菌肽不易产生耐药性,适用范围广,具有极大的临床价值,是传统抗生素的有力竞争者。识别抗菌肽是抗菌肽研究领域中的重要研究方向,湿实验法在进行大规模抗菌肽识别时存在成本高、效率低、周期长等难点,计算机辅助识别法是抗菌肽识别手段的重要补充,如何提升准确率是其中的关键问题。蛋白质序列可以被近似地看作是由氨基酸组成的语言,运用自然语言处理(natural language processing,NLP)技术可能提取到丰富的特征。本文将自然语言处理领域中的预训练模型BERT和微调结构Text-CNN结合,对蛋白质语言进行建模,提供了开源可用的抗菌肽识别工具,并与已发表的5种抗菌肽识别工具进行了比较。结果表明,优化“预训练-微调”策略带来了准确率、敏感度、特异性和马修相关系数的整体提升,为进一步研究抗菌肽识别算法提供了新思路。

关键词：蛋白质抗菌肽语言模型预训练

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面向异质性医学图像处理的深度学习算法综述

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软件学报 2023年第10期34卷 4870-4915页

作者：马梓博米悦张波张征吴静云黄海文王文东网络与交换国家重点实验室(北京邮电大学) 北京100876 北京邮电大学计算机学院北京100876 北京邮电大学现代邮政学院北京100876 北京邮电大学国际学院北京100876 北京大学第一医院医学影像科北京100034 北京大学第一医院泌尿外科北京100034 北京大学泌尿外科研究所北京100034 国家泌尿男生殖系肿瘤研究中心北京100034

近年来深度学习技术在诸多计算机视觉任务上取得了令人瞩目的进步,也让越来越多的研究者尝试将其应用于医学图像处理领域,如面向高通量医学图像(CT、MRI)的解剖结构分割等,旨在为医生提供诊断辅助,提高其阅片效率.由于训练医学图像处理... 详细信息

近年来深度学习技术在诸多计算机视觉任务上取得了令人瞩目的进步,也让越来越多的研究者尝试将其应用于医学图像处理领域,如面向高通量医学图像(CT、MRI)的解剖结构分割等,旨在为医生提供诊断辅助,提高其阅片效率.由于训练医学图像处理的深度学习模型同样需要大量的标注数据,同一医疗机构的数据往往不能满足需求,而受设备和采集协议的差异的影响,不同医疗机构的数据具有很大的异质性,这导致通过某些医疗机构的数据训练得到模型很难在其他医疗机构的数据上取得可靠的结果.此外,不同的医疗数据在患者个体病情阶段的分布上也往往是十分不均匀的,这同样会降低模型的可靠性.为了减少数据异质性的影响,提高模型的泛化能力,域适应、多站点学习等技术应运而生.其中域适应技术作为迁移学习中的研究热点,旨在将源域上学习的知识迁移到未标记的目标域数据上;多站点学习和数据非独立同分布的联邦学习技术则旨在在多个数据集上学习一个共同的表示,以提高模型的鲁棒性.从域适应、多站点学习和数据非独立同分布的联邦学习技术入手,对近年来的相关方法和相关数据集进行了综述、分类和总结,为相关研究提供参考.

关键词：医学图像处理深度学习数据异质性域适应多站点学习联邦学习

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基于锥形线束CT数据的智能颈椎骨龄评估系统的建立

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浙江大学学报（医学版） 2021年第2期50卷 187-194页

作者：冯筱妍卢诗娟李一鸣林军浙江大学医学院附属第一医院口腔科浙江杭州310003 浙江大学计算机辅助设计与图形学国家重点实验室浙江杭州310058

目的:建立智能颈椎骨龄评估系统,初步评估基于锥形线束CT数据的智能颈椎骨龄评估系统的可靠性和临床应用价值。方法:选取60例生长发育期(8~16岁)儿童同时段拍摄的侧位体层片和锥形线束CT作为实验数据。在锥形线束CT上通过Otsu算法提取... 详细信息

目的:建立智能颈椎骨龄评估系统,初步评估基于锥形线束CT数据的智能颈椎骨龄评估系统的可靠性和临床应用价值。方法:选取60例生长发育期(8~16岁)儿童同时段拍摄的侧位体层片和锥形线束CT作为实验数据。在锥形线束CT上通过Otsu算法提取患者的面部区域,使用三维最小二乘法获得一个矢状面,并在此矢状面上应用超像素算法来对图像进行分割以获取颈椎区域,随后分别进行人工定点与形态学算法的自动定点,对两组坐标数据进行一致性检验。根据颈椎骨龄分期指南的定义,进行算法设计,建立智能颈椎骨龄评估系统。同时通过同期的侧位体层片进行人工颈椎骨龄判读。采用加权Kappa一致性检验及Gamma相关度检验比较人工侧位体层片颈椎骨龄判读结果与智能颈椎骨龄评估结果,判断智能颈椎骨龄预测系统的临床应用价值。结果:基于锥形线束CT数据自动化捕捉的颈椎形态整体上具有较高的形态识别度,在预测13个点中的8个拐点时,自动定点与人工定点在X轴和Y轴上的Wilcoxon检验结果差异均无统计学意义(均P>0.05)。同时,智能系统的颈椎骨龄评估结果与人工识别结果有较强的一致性和相关性(加权Kappa值0.877,Gamma值0.991,均P<0.05)。结论:基于锥形线束CT数据进行的自动化颈椎形态捕捉和智能颈椎骨龄预测系统有一定的可靠性,自动化程度高,具有一定的临床应用价值。

关键词：颈椎骨龄智能评估锥形线束计算机断层扫描术侧位体层片

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内镜经鼻蝶经终板入路暴露三脑室的解剖与临床研究

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临床神经外科杂志 2025年第1期22卷 31-34页

作者：谢强谢涛孙崇璟张晓彪李文生李泽阳刘腾飞柳双陈品杨翰涛复旦大学附属中山医院神经外科上海200032 复旦大学基础医学院解剖与组织胚胎学系上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室

目的通过内镜经鼻蝶扩大入路暴露终板,切开终板进入第三脑室的解剖操作,探讨该入路的解剖特点。方法应用福尔马林固定的成人头颅标本9例,模拟内镜经鼻经鞍结节蝶骨平台扩大入路,0°内镜观察视交叉上下间隙,暴露视交叉上方终板膜,切... 详细信息

目的通过内镜经鼻蝶扩大入路暴露终板,切开终板进入第三脑室的解剖操作,探讨该入路的解剖特点。方法应用福尔马林固定的成人头颅标本9例,模拟内镜经鼻经鞍结节蝶骨平台扩大入路,0°内镜观察视交叉上下间隙,暴露视交叉上方终板膜,切开终板后观察三脑室内解剖标志。结果该入路通过鞍底、鞍结节及蝶骨平台骨质的磨除,切开硬膜的范围由鞍底至蝶骨平台。解剖视交叉池蛛网膜后,自上而下暴露额叶直回、视交叉、垂体上动脉、垂体柄、鞍膈、垂体等结构。在视交叉上向后解剖终板池可暴露两侧大脑前动脉、前交通动脉、回返动脉及其下方的终板膜。打开终板膜后,进入三脑室前部,可暴露三脑室前部孟氏孔及脉络丛、中间块、两侧的丘脑和三脑室后部后联合、髓纹、脉络膜、导水管上口。结论内镜经鼻运用视交叉上间隙经终板入路可充分暴露三脑室,但对于三脑室底的显露存在困难。

关键词：内镜经鼻蝶经终板入路三脑室

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重度牙周炎患者4年自然进展失牙的多因素分析

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北京大学学报（医学版） 2023年第1期55卷 70-77页

作者：温静欧阳翔英裴喜燕邱善湧刘健如刘文逸曹采方北京大学口腔医学院·口腔医院牙周科国家口腔医学中心国家口腔疾病临床医学研究中心口腔生物材料和数字诊疗装备国家工程研究中心口腔数字医学北京市重点实验室国家卫生健康委员会口腔医学计算机应用工程技术研究中心国家药品监督管理局口腔生物材料重点实验室北京100081 北京大学口腔医学院·口腔医院第一门诊部北京100034

目的:评估中国农村重度牙周炎患者4年自然进展不同失牙数人群的基线特征,分析影响失牙数量的相关因素。方法:纳入15~44岁的217名重度牙周炎患者,通过问卷调查、临床检查和影像学检查,分析其4年自然进展失牙情况,计算磨牙缺失数、有牙周... 详细信息

目的:评估中国农村重度牙周炎患者4年自然进展不同失牙数人群的基线特征,分析影响失牙数量的相关因素。方法:纳入15~44岁的217名重度牙周炎患者,通过问卷调查、临床检查和影像学检查,分析其4年自然进展失牙情况,计算磨牙缺失数、有牙周膜增宽(widened periodontal ligament space,WPDL)的牙数、有根尖病变的牙数等牙周疾病和龋病相关的基线指标,比较不同失牙数人群的基线特征,并进一步分析影响不同失牙数的相关因素。结果:在4年自然进展后,失牙共103颗,年人均失牙(0.12±0.38)颗。其中,无失牙组有174人,失牙1~2颗组有34人,失牙≥3颗组有9人。磨牙缺失最多,尖牙缺失最少。与新发失牙数显著呈正相关的基线指标包括骨吸收>50%的牙数、骨吸收>65%的牙数、探诊深度(probing depth,PD)≥5 mm的牙数百分数、PD≥7 mm的牙数百分数、临床附着丧失≥5 mm的牙数百分数、有骨下袋的牙数、有WPDL的牙数和有根尖周病变的牙数。多元有序Logistic回归分析结果显示,骨吸收>50%的牙数(OR=1.550)、基线磨牙缺失数(OR=1.774)、有WPDL的牙数(1~2颗:OR=1.415;≥3颗:OR=13.105)、有根尖周病变的牙数(1~2颗:OR=4.393;≥3颗:OR=9.526)和龋/残根的牙数(OR=3.028)显著增加了新发失牙和多颗新发失牙的风险。结论:在4年自然进展后,中国农村中青年的重度牙周炎患者失牙和多颗失牙风险与骨吸收>50%的牙数、基线磨牙缺失数、有WPDL的牙数、有根尖周病变的牙数和龋/残根的牙数显著相关。

关键词：牙周炎自然进展失牙齿数

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准二维湿颗粒体系融化过程中的结构与缺陷

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物理学报 2021年第11期70卷 239-247页

作者：王蓬孔平李然华云松厚美瑛孙其诚上海理工大学医疗器械与食品学院上海200093 上海健康医学院分子影像学重点实验室上海201318 上海理工大学光电信息与计算机工程学院上海215300 中国科学院物理研究所北京100190 清华大学土木水利学院北京100084

研究颗粒体系中的结构与缺陷对于研究固-液融化的物理机制具有重要的价值.本文实验研究了垂直振动下单层湿颗粒在固-液融化过程中的结构与缺陷.根据实验及理论分析构建了湿颗粒体系的接触模型,量化了准二维湿颗粒体系融化过程中颗粒的... 详细信息

研究颗粒体系中的结构与缺陷对于研究固-液融化的物理机制具有重要的价值.本文实验研究了垂直振动下单层湿颗粒在固-液融化过程中的结构与缺陷.根据实验及理论分析构建了湿颗粒体系的接触模型,量化了准二维湿颗粒体系融化过程中颗粒的结构变化.然后以颗粒为点建立Voronoi图对颗粒体系的"相"转变进行研究,并引入了局部体积分数来确定融化过程中缺陷变化的临界状态.实验结果表明,颗粒系统在团簇的边缘开始发生缺陷,并呈现链状的缺陷对向中心蔓延的现象.并且,颗粒发生缺陷时七相缺陷颗粒的局部体积分数显著减小,明显小于五相缺陷和六角相颗粒的局部体积分数.对局部体积分数的分析表明,当最小局部体积分数φ≤0.6652时发生缺陷,当φ≤0.4872时颗粒系统发生从固体到液体的转变.

关键词：固-液融化缺陷湿颗粒局部体积分数

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数字化制作简易口内哥特式弓在全口义齿修复正中关系确定中的应用

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北京大学学报（医学版） 2023年第1期55卷 101-107页

作者：周团锋杨雪王睿捷程明轩张华韦金奇北京大学口腔医院·口腔医学院第一门诊部国家口腔医学中心国家口腔疾病临床医学研究中心口腔生物材料和数字诊疗装备国家工程研究中心口腔数字医学北京市重点实验室国家卫生健康委员会口腔医学计算机应用工程技术研究中心国家药品监督管理局口腔生物材料重点实验室北京100034

目的:验证数字化制作简易口内哥特式弓与传统口内哥特式弓在全口义齿修复正中关系确定中的一致性。方法:选择门诊无牙颌患者10例,分别采用数字化制作简易口内哥特式弓(T1)与传统口内哥特式弓(T2)两种方法确定每例的正中关系;记录两种方... 详细信息

目的:验证数字化制作简易口内哥特式弓与传统口内哥特式弓在全口义齿修复正中关系确定中的一致性。方法:选择门诊无牙颌患者10例,分别采用数字化制作简易口内哥特式弓(T1)与传统口内哥特式弓(T2)两种方法确定每例的正中关系;记录两种方法临床操作时间的差异;扫描两种上下无牙颌石膏模型的正中关系,将Standard Triangle Language(STL)文件导入Geomagic studio软件中,上无牙颌模型多点完全最佳拟合后,测量T1组与T2组下颌中线区和磨牙区垂直向及唇(颊)舌向最大位置偏差;临床试戴牙时观察T1组与T2组口内有无中线偏斜和后牙区咬合是否稳定。结果:T1、T2组临床确定正中关系时间分别为(41.90±2.64)min和(57.50±2.37)min,配对t检验,P<0.01,差异有统计学意义;T1组与T2组在下颌中线区唇舌向的最大位置偏差为(0.32±0.14)mm,垂直向的最大位置偏差为(0.40±0.23)mm;磨牙区颊舌向的最大位置偏差为(0.35±0.23)mm,垂直向的最大位置偏差为(0.33±0.20)mm,在垂直向及水平向,T1组下颌相对T2组下颌的最大位置偏差均控制在0.5 mm内。在临床试戴牙过程中,T1组及T2组均未发现全口义齿中线偏离及翘动、摆动等稳定性不良现象。结论:数字化制作简易口内哥特式弓可以用于临床全口义齿修复正中关系的确定,不仅可以节约临床操作时间,而且也能保证正中关系的准确性。

关键词：数字化制作口内哥特式弓全口义齿正中关系

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内镜经枕天幕经松果体隐窝入路暴露三脑室的解剖与临床研究

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临床神经外科杂志 2024年第6期21卷 602-606,611页

作者：谢涛孙崇璟张晓彪李文生李泽阳刘腾飞柳双陈品杨翰涛上海市老年医学中心神经外科上海200032 复旦大学附属中山医院神经外科复旦大学基础医学院解剖与组织胚胎学系上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室

目的通过解剖研究,探讨内镜经枕天幕经松果体隐窝入路暴露三脑室的可行性及范围。方法应用福尔马林固定的成人头颅标本9例,行内镜后纵裂经枕经天幕入路暴露松果体区,0°内镜观察四叠体池蛛网膜,解剖蛛网膜后暴露Galen静脉及属支... 详细信息

目的通过解剖研究,探讨内镜经枕天幕经松果体隐窝入路暴露三脑室的可行性及范围。方法应用福尔马林固定的成人头颅标本9例,行内镜后纵裂经枕经天幕入路暴露松果体区,0°内镜观察四叠体池蛛网膜,解剖蛛网膜后暴露Galen静脉及属支的走行分布及大脑后动脉及分支的走行。经松果体隐窝向上移位松果体后观察三脑室暴露范围和其内解剖标志。回顾性分析应用该入路切除三脑室内肿瘤1例的临床资料。结果该入路通过中线旁1 cm,垂直于横窦上7 cm的竖型直切口,制作跨上矢状窦骨窗。沿后纵裂向外侧牵开枕叶暴露天幕。在直窦外侧1 cm切开天幕至游离缘,牵开天幕后,暴露四叠体池的外上方蛛网膜,剪开片状蛛网膜后,进一步分离基底静脉与小脑前中央静脉间隙蛛网膜,暴露大脑后动脉及脉络膜后内侧动脉。见松果体,上下丘、丘脑枕等结构。将松果体自后联合向上移位进入三脑室,见中间块、丘脑、室间孔及脉络膜(丛)、前联合、终板、三脑室底等结构。临床病例中,三脑室内丘脑胶质瘤经松果体隐窝向上移位松果体后切除肿瘤,暴露三脑室全貌直面三脑室底。术后患者症状消失,无并发症,随访6个月未见肿瘤复发。结论内镜经枕天幕入路可充分暴露松果体区,经松果体隐窝入路可至三脑室内,此入路从后方可充分暴露三脑室全貌特别是三脑室底部。临床运用此入路可顺利处理三脑室内病变。

关键词：内镜经枕天幕入路松果体隐窝三脑室

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预训练深度学习神经网络模型在鉴别中枢神经系统肿瘤中的应用价值

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中华神经外科杂志 2024年第4期40卷 378-384页

作者：王俊康王率伊刘济源张建新刘斌李哲胡锦渠李志鹏欧绍武王军中国医科大学附属第一医院神经外科沈阳110001 大连民族大学计算机科学与工程学院大连116600 大连理工大学软件学院国际信息与软件学院大连116620 大连理工大学-立命馆大学健康医疗智能计算联合研究中心大连116620 中山大学生物医学工程学院广东省传感技术与生物医疗仪器重点实验室深圳518107

目的构建基于MRI T1加权增强序列的预训练深度学习神经网络模型,并验证其鉴别诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)、胶质母细胞瘤(GBM)、脑转移瘤(BM)的效能。方法回顾性分析2015年1月至2022年6月于中国医科大学附属第一医院神经外科... 详细信息

目的构建基于MRI T1加权增强序列的预训练深度学习神经网络模型,并验证其鉴别诊断原发性中枢神经系统淋巴瘤(PCNSL)、胶质母细胞瘤(GBM)、脑转移瘤(BM)的效能。方法回顾性分析2015年1月至2022年6月于中国医科大学附属第一医院神经外科行手术治疗、术后经病理学检查确诊为PCNSL、GBM、BM的患者。按筛选标准共纳入149例,其中PCNSL43例、GBM62例、BM44例,随机划分为训练集和测试集。获取影像学数据后采用Slicer软件勾画感兴趣区域并进行预处理,基于EfficientNetV2构建深度学习神经网络模型,使用迁移学习方法在ImageNet上进行预训练和微调后,分别于训练集、测试集上训练和验证模型,计算其鉴别3种疾病的准确率、精确率、召回率(灵敏度)、特异度、F1分数,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线,计算ROC曲线下面积(AUC)以评估其诊断效能。结果应用该模型总的诊断准确率为89.4%,平均AUC为0.96;该模型被用于鉴别诊断PCNSL、GBM、BM的灵敏度分别为0.893.0.936、0.778,特异度分别为0.996、0.877、0.955,F1分数分别为0.940.0.900.0.778,AUC(95%CI)分别为0.98(0.946~0.997)0.96(0.932~0.986)、0.95(0.905~0.980)。结论初步研究表明,本研究建立的预训练深度学习神经网络模型对PCNSL、GBM、BM有较优异的诊断效能。

关键词：中枢神经系统肿瘤诊断,鉴别淋巴瘤胶质母细胞瘤脑转移瘤深度学习

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神经内镜枕下中线入路暴露第四脑室解剖研究

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临床神经外科杂志 2025年第1期22卷 26-30页

作者：孙崇璟陈品谢涛刘腾飞柳双杨乔乔李文生张晓彪复旦大学附属中山医院神经外科上海200032 复旦大学上海医学院人体解剖学与组织胚胎学系上海市医学图像处理与计算机辅助手术重点实验室

目的通过解剖观察内镜下经枕下中线入路暴露第四脑室的解剖结构,探讨该术式的可行性。方法使用9例福尔马林固定的尸头标本,模拟神经内镜经枕下中线入路显露第四脑室,观察解剖过程中的关键结构及暴露范围。结果该入路通过枕下正中直切口... 详细信息

目的通过解剖观察内镜下经枕下中线入路暴露第四脑室的解剖结构,探讨该术式的可行性。方法使用9例福尔马林固定的尸头标本,模拟神经内镜经枕下中线入路显露第四脑室,观察解剖过程中的关键结构及暴露范围。结果该入路通过枕下正中直切口暴露双侧枕骨鳞部,扩大枕大孔后缘后制作双侧枕骨骨瓣。解剖枕大池蛛网膜,将小脑扁桃体外侧移位,显露第四脑室正中孔、脉络膜、脉络丛及四脑室下顶部等结构。通过四脑室正中孔引入内镜即可显露菱形窝、上髓帆、小脑上脚和中脚以及中脑导水管等结构,内镜下单纯的四脑室内解剖可视化无需打开膜髓帆结构。打开膜帆结构可扩大显露外侧隐窝,双侧打开可全程显露第四脑室底部、顶部及侧隐窝。结论神经内镜枕下中线入路可直接暴露第四脑室和脑干背侧结构,利用内镜技术的深入照明和宽广视角,可在不切除寰椎后弓的情况下清晰暴露第四脑室底部结构,联合膜髓帆切开可进一步扩展手术视角。

关键词：神经内镜枕下中线入路第四脑室解剖研究

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