检索结果-内蒙古大学图书馆

白血病．淋巴瘤 2024年第10期33卷 610-616页

作者：许晶万雪莹任方刚冯劲宜王宏伟山西医科大学医学细胞生物与遗传学教研室太原030001 山西医科大学第二医院血液病研究所太原030001

目的探讨原发性骨髓纤维化(PMF)相关基因和信号通路及其可能临床意义。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载3个PMF的mRNA表达数据集(GSE26049、GSE61629、GSE53482),包括55个PMF患者和58个对照者外周血样本数据,应用在线工具GEO2R鉴定PM... 详细信息

目的探讨原发性骨髓纤维化(PMF)相关基因和信号通路及其可能临床意义。方法从基因表达综合(GEO)数据库下载3个PMF的mRNA表达数据集(GSE26049、GSE61629、GSE53482),包括55个PMF患者和58个对照者外周血样本数据,应用在线工具GEO2R鉴定PMF患者和对照者间差异表达基因(DEG),对3个数据集共同DEG进行基因本体(GO)注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并构建蛋白互作(PPI)网络,通过cytoHubba程序中MCC方法和Degree方法分别计算PPI网络中各共同DEG的关键节点,选取排名前10的核心(hub)基因,从中获得两种方法共同hub基因。回顾性收集2017年9月至2021年6月就诊于山西医科大学第二医院的25例PMF患者和10例对照者(造血干细胞移植正常供体或缺铁性贫血患者)的外周血样本,采用反转录-荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测各样本中上述筛选的共同hub基因表达水平,对两组间各基因在转录水平上的表达进行比较。结果从3个数据集中筛选出PMF患者和对照者间239个共同DEG,包括153个下调DEG和86个上调DEG。GO富集分析显示,共同的下调DEG在转录、翻译和成纤维细胞增殖的负调控等生物过程显著富集,上调DEG主要富集在蛋白泛素化和泛素依赖的蛋白分解代谢等过程。KEGG通路分析显示,上调的共同DEG和下调的共同DEG富集在PI3K/Akt信号通路、癌症通路和癌症转录调控异常等方面。MCC方法和Degree方法排名前10的hub基因中有8个是两方法共有的,包括6个下调共同DEG(TP53、MYC、ATM、FYN、PTPRC、ATRX)和2个上调共同DEG(VEGFA、FOXO3)。这8个共同hub基因主要参与PI3K/Akt信号通路、细胞周期和癌症转录调控信号通路。对临床样本进行RT-qPCR检测显示,与对照组相比,PMF患者6个下调的共同DEG mRNA相对表达量低,但差异均无统计学意义(均P>0.05);PMF组2个上调的共同DEG mRNA相对表达量高,差异均有统计学意义(U值分别为33.00、36.00,P值分别为0.021、0.033)。结论通过生物信息学和临床标本验证发现PMF患者VEGFA和FOXO3上调,2个基因主要参与PI3K/Akt信号通路、细胞周期和癌症转录调控信号通路,可能与PMF发生相关,可能成为潜在的治疗靶点。

关键词：原发性骨髓纤维化分子生物学计算生物学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

肿瘤抗血管生成治疗耐药机制

引用

遗传 2024年第11期46卷 911-919页

作者：闫旭郭影孙冬琳吴楠金焰中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) 哈尔滨150081 哈尔滨医科大学医学遗传学研究室哈尔滨150081

血管生成指的是通过内皮细胞的迁移、增殖和分化,从现有血管网络中形成新的血管网络的过程。这一过程对于实体肿瘤的生长和扩散至关重要,尤其是在肿瘤体积超过2 mm^(3)之后,新生的血管网络为肿瘤提供了至关重要的氧气、营养及生长因子... 详细信息

血管生成指的是通过内皮细胞的迁移、增殖和分化,从现有血管网络中形成新的血管网络的过程。这一过程对于实体肿瘤的生长和扩散至关重要,尤其是在肿瘤体积超过2 mm^(3)之后,新生的血管网络为肿瘤提供了至关重要的氧气、营养及生长因子。抗血管生成已经成为临床常用靶向治疗肿瘤的方案之一。首个抗血管生成药物贝伐单抗已广泛应用于多种实体肿瘤治疗,但由于获得性耐药现象,疗效仅能维持1~2年。即使血管内皮细胞的基因组相对稳定,不易产生耐药性,但临床实践中仍观察到多种类型的耐药现象,这表明抗血管生成治疗的耐药问题仍然是一个具有挑战性的研究领域。本文主要综述了肿瘤抗血管生成治疗耐药机制的最新进展,并探讨了抗肿瘤血管生成治疗的新前景,以期为临床实践提供有力的理论支持和指导。

关键词：肿瘤耐药抗血管生成血管共选择血管拟态血管套叠

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于原发癌灶T2WI的影像组学特征预测局部进展期直肠癌新辅助治疗疗效及多种分类器效能比较

引用

磁共振成像 2023年第11期14卷 77-83页

作者：胡鸿博赵升姜昊姜慧杰蔺雪张莹哈尔滨医科大学附属第二医院放射科哈尔滨150086 哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室哈尔滨150086

目的3.0 T MRI影像数据具有评估局部进展期直肠癌(locally advanced rectal cancer,LARC)术前新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)疗效临床价值,但是构建模型多种机器学习间的比较并没有被探究过。我们将比较4种常用的机... 详细信息

目的3.0 T MRI影像数据具有评估局部进展期直肠癌(locally advanced rectal cancer,LARC)术前新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)疗效临床价值,但是构建模型多种机器学习间的比较并没有被探究过。我们将比较4种常用的机器学习方法在评估直肠癌新辅助治疗疗效临床价值的效能。材料与方法回顾性分析2021年9月至2023年1月于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊经病理检查证实的LARC并行nCRT的病例共160例,按8∶2比例分为训练集及验证集。分别建立支持向量机(support vector machines,SVM)、朴素贝叶斯(naive Bayes,NB)、神经网络(neural network,NN)、卷积神经网络(convolutional neural networks,CNN)四种分类器模型,采用DeLong检验比较受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线的差异,对4种分类器诊断效能进行评估比较。结果2组患者年龄、性别差异无统计学意义(P>0.05)。通过最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)算法得到9个与治疗效果分组相关的特征,9个特征在病理完全缓解(pathological complete response,pCR)/病理非完全缓解(non-pathological complete response,non-pCR)中有差异,但差异不具有统计学意义(P>0.05)。SVM模型在训练集的ROC曲线下面积为0.9150,评估nCRT效果最为显著。结论基于磁共振高分辨T2WI的纹理特征,通过SVM、NB、NN、CNN分类器模型可以对直肠癌nCRT疗效进行评估,其中SVM分类器模型诊断效能最佳。基于高分辨T2WI的影像组学可以评估LARC患者nCRT治疗效果。

关键词：直肠癌磁共振成像影像组学机器学习支持向量机

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

环状RNA circACTN4促进乳腺癌细胞增殖、侵袭和转移的研究

引用

陆军军医大学学报 2022年第7期44卷 639-647页

作者：欧小强陈俊霞重庆医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室重庆400016

目的探讨环状RNA circACTN4(hsa_circ_0050900)在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖、侵袭和转移的影响。方法利用环状RNA芯片分析4对乳腺癌组织和癌旁组织的circRNA表达谱,并用实时荧光定量PCR验证circACTN4的相对表达水平;用circAC... 详细信息

目的探讨环状RNA circACTN4(hsa_circ_0050900)在乳腺癌中的表达及其对乳腺癌细胞增殖、侵袭和转移的影响。方法利用环状RNA芯片分析4对乳腺癌组织和癌旁组织的circRNA表达谱,并用实时荧光定量PCR验证circACTN4的相对表达水平;用circACTN4过表达质粒及对照质粒分别转染乳腺癌细胞MCF-7/MDA-MB-231,采用CCK-8实验、EdU实验、平板克隆实验、细胞划痕实验、Transwell迁移和侵袭实验研究circACTN4在乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭中的作用;Western blot检测circACTN4对CCND1、CCND2和CDK4蛋白表达的影响;在裸鼠体内探讨circACTN4对移植瘤生长转移的影响。结果CircACTN4在乳腺癌组织中的表达高于癌旁组织(P<0.01),在乳腺癌细胞中的表达高于正常乳腺上皮细胞(P<0.01)。上调circACTN4可增强乳腺癌细胞增殖、迁移和侵袭(P<0.05),提高CCND1、CCND2和CDK4蛋白的表达(P<0.01)。体内实验结果表明:上调circACTN4可促进移植瘤生长与转移,与对照组相比,circACTN4组肿瘤微血管密度显著增加(P<0.05),肺转移结节数量明显增多(P<0.05)。结论circACTN4在乳腺癌组织和细胞显著高表达,可增强乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭,并在体内促进移植瘤的生长与转移。

关键词： circRNA circACTN4 乳腺癌移植瘤

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

苦荞蛋白源肽AFYRW对脂多糖诱导的人脐静脉内皮细胞损伤的影响

引用

食品科学 2023年第3期44卷 155-161页

作者：肖怡左婕邓艳张礼林王筑婷莫晓川许庆忠李红梅贵州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室贵州贵阳550025

目的:探讨苦荞蛋白源肽AFYRW在脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的血管内皮细胞损伤中的作用。方法:采用LPS诱导人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cells,HUVECs)建立血管内皮细胞炎症损伤模型;采用CCK8试剂盒检测A... 详细信息

目的:探讨苦荞蛋白源肽AFYRW在脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导的血管内皮细胞损伤中的作用。方法:采用LPS诱导人脐静脉内皮细胞(human umbilical vein endothelial cells,HUVECs)建立血管内皮细胞炎症损伤模型;采用CCK8试剂盒检测AFYRW对细胞增殖活力的影响;Western blot检测血管细胞黏附分子-1(vascular cell adhension molecule-1,VCAM-1)、细胞内黏附分子-1(intercellular adhension molecule-1,ICAM-1)、白细胞介素(interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、内皮型一氧化氮合酶(endothelial nitric oxide synthase,e NOS)、诱导型一氧化氮合酶(inducible nitricoxide synthase,iNOS)水平及核因子-κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)p65的磷酸化水平;酶法检测一氧化氮(nitric oxide,NO)的含量变化;单核细胞黏附实验检测HUVECs的黏附性。结果:AFYRW明显提高了细胞的生存活力,降低VCAM-1、ICAM-1、IL-6、TNF-α、iNOS蛋白的相对表达量,减少了NO含量和单核细胞对内皮细胞的黏附,抑制NF-κB的活性。结论:AFYRW对LPS诱导的HUVECs炎症具有改善作用,其机制可能与抑制NF-κB的活性有关。

关键词：炎症生物活性肽苦荞脂多糖人脐静脉内皮细胞

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

引用

中华微生物学和免疫学杂志 2025年第1期45卷 53-63页

作者：汤婷李钰博张昕彤胡艳芬吴昊朱剑军李莉刘铭山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室太原030001 济宁医学院附属医院生殖医学科济宁272000

目的在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中构建线粒体相关基因(mitochondria-related genes,Mito-RGs)模型,基于模型预测HCC免疫、预后和治疗特征,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法从癌症基因组图谱数据库中获得肝细胞癌的表... 详细信息

目的在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中构建线粒体相关基因(mitochondria-related genes,Mito-RGs)模型,基于模型预测HCC免疫、预后和治疗特征,为HCC的诊断和治疗提供新思路。方法从癌症基因组图谱数据库中获得肝细胞癌的表达谱和相应的临床信息。采用单变量Cox回归、最小绝对收缩和选择算子回归和多变量Cox回归构建基于Mito-RGs的HCC预后模型并在国际癌症基因组协会的日本乙型肝炎病毒/丙型肝炎病毒患者项目数据集中进行验证。GO和KEGG富集分析研究高低危组差异表达基因富集的信号通路。使用CIBERSORT对免疫浸润进行评估。单细胞数据研究HCC样本高低危组中免疫细胞的比例及与细胞增殖之间的关系。Cellminer评估风险评分模型与药物敏感性之间的关系。结果构建了包含7个Mito-RGs(DTYMK、ACADS、HMGCS2、CYP27A1、TOMM40L、STOM和AKR1B10)的HCC风险预后模型,高危组HCC患者预后更差。高低危组差异表达基因中上调的基因富集在细胞周期和代谢相关通路。单细胞数据显示,高危组中CD8^(+)T细胞、巨噬细胞和单核细胞及增殖细胞占比更高。CIBERSORT分析结果提示Tregs细胞、M0巨噬细胞在高危组中的丰度较高,而CD8^(+)T、CD4^(+)记忆T细胞等丰度较低。药物敏感性预测在高危组对髓系细胞白血病-1蛋白抑制剂、长春新碱、磷脂酰肌醇激酶β亚型抑制剂和极光激酶A抑制剂更敏感,而曲美替尼、司美替尼、细胞外调节蛋白激酶抑制剂和丝裂原活化的细胞外信号调节激酶抑制剂则在低风险组更有效。结论构建的Mito-RGs模型能较好地评估HCC患者预后及免疫细胞浸润程度。

关键词：肝细胞癌线粒体相关基因癌症基因组图谱转录组测序预后

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

FSHR基因多态性、BMI及性激素与多囊卵巢综合征发病风险的相关性分析

引用

解放军医学杂志 2024年第1期49卷 50-56页

作者：昝志芳土增荣王淇蓉段毓刘建兵李莉山西医科大学基础医学院医学细胞生物与遗传学教研室山西太原030001 山西医科大学第一医院生殖医学科山西太原030001

目的探讨体重指数(BMI)、性激素及卵泡刺激素受体(FSHR)基因rs2268361和rs2349415位点的单核苷酸多态性(SNP)与多囊卵巢综合征(PCOS)发病风险的相关性。方法收集2021年3-8月山西医科大学第一医院生殖医学科门诊就诊的213例PCOS患者(PCOS... 详细信息

目的探讨体重指数(BMI)、性激素及卵泡刺激素受体(FSHR)基因rs2268361和rs2349415位点的单核苷酸多态性(SNP)与多囊卵巢综合征(PCOS)发病风险的相关性。方法收集2021年3-8月山西医科大学第一医院生殖医学科门诊就诊的213例PCOS患者(PCOS组)与207名健康对照者(对照组)的外周血,随机收集PCOS组与对照组各32例卵泡液。计算PCOS组与对照组的BMI;采用免疫化学发光法检测两组外周血卵泡刺激素(FSH)、黄体生成素(LH)、雌二醇(E_(2))、睾酮(T)、孕酮(P)和泌乳素(PRL)水平;采用聚合酶链式反应(PCR)和高分辨熔解曲线(HRM)分析两组FSHR基因rs2268361和rs2349415位点多态性;采用实时定量PCR检测两组外周血及卵巢颗粒细胞FSHR mRNA表达水平。结果LH与LH/FSH呈明显正相关(r=0.88,P<0.05);PCOS组BMI、E2、LH、LH/FSH、T水平明显高于对照组(P<0.05),FSH水平明显低于对照组(P<0.001);HRM分析显示,PCOS组rs2349415位点CC、CT、TT基因型频率分别为55.9%、34.3%和9.8%,对照组分别为68.6%、23.2%和8.2%,PCOS组C、T等位基因频率分别为73.0%、27.0%,对照组分别为80.2%、19.8%,两组基因型频率及等位基因频率比较差异均有统计学意义(P<0.05);PCOS组卵巢颗粒细胞中FSHR mRNA表达水平明显高于对照组(P=0.004),其中rs2349415 TT基因型FSHR mRNA表达水平高于CC(P=0.002)和CT基因型(P=0.035)。结论高水平的BMI、LH、E2及rs2349415位点T等位基因可增加PCOS的发病风险。

关键词：多囊卵巢综合征卵泡刺激素受体单核苷酸多态性性激素

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

基于生物信息学分析胃癌双微体中增强子的调控机制

引用

遗传 2025年第5期47卷 558-572页

作者：安梦婷郭冠麟吴杰孙文靖贾学渊哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室哈尔滨150081 中国遗传资源保护与疾病防控教育部重点实验室(哈尔滨医科大学) 哈尔滨150081

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制,本... 详细信息

胃癌(gastric cancer,GC)在全球范围内的发病率和死亡率均居高位。双微体(double minutes,DMs)是一种染色体外的环状染色体,常携带有癌基因或耐药基因,其与肿瘤发生及耐药性密切相关。为深入探索双微体在胃癌发展中的作用及调控机制,本研究利用生物信息学方法通过分析CCLE细胞系数据库和TCGA实体瘤数据库中的基因组拷贝数变异数据,总结含双微体肿瘤样本的基因组特征,依此特征对胃癌样本进行分类。接着使用FANTOM5数据库、R包“GenomicRanges”、Bedtools工具以及MEME SUITE分析胃癌双微体上增强子及其调控的靶基因的功能。然后利用CIBERSORT包和GDSC药物数据库对TCGA中含和不含的胃癌样本进行免疫细胞浸润分析和耐药分析。研究显示,胃癌中的双微体基因组特征包括一类拷贝数超过10且长度≥50kb的基因组片段。双微体增强子的调控作用影响了耐药性和肿瘤免疫,其中增强子-转录因子-靶基因的调控回路扰动也与肿瘤免疫相关。进一步分析发现,双微体增强子调控的靶基因不仅导致了免疫相关基因表达的改变,还使得胃癌样本对常见化疗药物展现出更强的不敏感性,并且耐药相关靶基因在含双微体的胃癌样本中高表达并与不良预后密切相关。综上所述,该项研究为含有双微体的胃癌个体治疗提供了新的见解。

关键词：双微体增强子胃癌肿瘤免疫肿瘤耐药性生物信息学

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

弹性蛋白酶调节中性粒细胞炎性募集的功能研究

引用

中国免疫学杂志 2024年第3期40卷 449-455页

作者：刘洋孟玲范思佳任春光张欢重庆医科大学基础医学院细胞与遗传教研室发育生物学研究室重庆400016

目的:探索中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)对中性粒细胞炎性募集的影响。方法:采用外源性弹性蛋白酶抑制剂西维来司钠盐预处理小鼠骨髓来源的中性粒细胞,通过腹膜炎过继性迁移、细胞体外趋化、流动室黏附、免疫荧光染色、细胞伸展等实验,检测N... 详细信息

目的:探索中性粒细胞弹性蛋白酶(NE)对中性粒细胞炎性募集的影响。方法:采用外源性弹性蛋白酶抑制剂西维来司钠盐预处理小鼠骨髓来源的中性粒细胞,通过腹膜炎过继性迁移、细胞体外趋化、流动室黏附、免疫荧光染色、细胞伸展等实验,检测NE的抑制对中性粒细胞体内炎性募集、体外趋化、牢固黏附、细胞极化与伸展能力的影响;利用流式细胞术及鲁米诺化学发光系统检测NE的抑制对中性粒细胞吞噬及活性氧(ROS)释放能力的影响。结果:西维来司钠盐预处理显著减弱了中性粒细胞体内炎性募集(P<0.001);减弱了中性粒细胞在体外趋化过程中对催化剂方向性的感知(P<0.05),减慢了趋化速率(P<0.05),降低了趋化距离(P<0.05);减少了中性粒细胞在炎性内皮细胞表面形成牢固黏附的能力(P<0.000 1),抑制了中性粒细胞对细菌的吞噬能力(P<0.01);但对中性粒细胞的伸展、极化及ROS的释放均无显著影响。结论:NE的抑制显著损害了中性粒细胞在体内外的炎性募集级联反应及吞噬作用,但对中性粒细胞的伸展、极化、ROS释放等功能无显著影响。

关键词：中性粒细胞弹性蛋白酶西维来司钠盐炎性募集

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

癌-睾丸抗原23诱导上皮-间充质转化和细胞骨架重塑促进肝细胞癌细胞迁移和侵袭

引用

基因组学与应用生物学 2023年第10期42卷 1127-1136页

作者：周振鲁徐鹏姚家丽吴圣明黄秒唐文杨哲胡启平广西医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学教研室南宁530021

本研究旨在探讨过表达癌-睾丸抗原23(cancer-testis antigen 23,CT23)对肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)细胞迁移、侵袭及上皮-间充质转化(epithelial-mesenchymal transition, EMT)的影响。基于在线数据库(TCGA、 GEO、 HPA)分析CT23在HCC组织和正常肝组织中的表达;建立稳定过表达CT23的人肝癌细胞Huh7,通过划痕实验和Transwell实验分别检测细胞迁移和侵袭能力,并观察细胞形态;采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)探究CT23影响的通路及机制;利用免疫荧光检测纤维状肌动蛋白(filamentous actin, F-actin)分布;利用Western blot检测EMT标记蛋白表达。结果显示,CT23在HCC组织中高表达,并且CT23高表达在EMT和细胞骨架重塑过程显著富集。过表达CT23能促进细胞迁移和侵袭,呈现EMT形态学改变,EMT标志蛋白表达改变,如E-cadherin表达下调、 N-cadherin和Vimentin表达上调,以及F-actin组装加强。上述结果表明过表达CT23促进HCC细胞的迁移和侵袭,其机制可能与EMT和细胞骨架重塑相关。

关键词：肝细胞癌癌-睾丸抗原23 迁移侵袭上皮-间充质转化细胞骨架

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：