检索结果-内蒙古大学图书馆

中国医科大学学报 2025年第4期54卷 333-339页

作者：姜吉亮王文涛李乐然尹绍卿付玉荣伊正君山东第二医科大学医学检验学院分子诊断学教研室山东潍坊261053 山东第二医科大学基础医学院病原生物学教研室山东潍坊261053

目的利用生物信息学和多种机器学习算法,筛选出预测结核潜伏感染(LTBI)活化风险的新型标志物并建立风险模型。方法从基因表达综合数据库获取GSE112104和GSE193777数据集,通过差异基因分析和加权基因共表达网络分析筛选与LTBI活化相关的... 详细信息

目的利用生物信息学和多种机器学习算法,筛选出预测结核潜伏感染(LTBI)活化风险的新型标志物并建立风险模型。方法从基因表达综合数据库获取GSE112104和GSE193777数据集,通过差异基因分析和加权基因共表达网络分析筛选与LTBI活化相关的铁死亡相关差异基因(FRG-DEGs)。进一步通过LASSO、SVM-RFE和RF 3种机器学习算法筛选铁死亡相关关键基因(FRG-hubs),并通过验证集和逆转录PCR验证其可靠性。最后,利用R语言建立风险模型。结果在GSE112104数据集中,与LTBI相比,活动性结核病中296个基因显著上调,1569个基因显著下调,LTBI进展者中506个基因显著上调,1132个基因显著下调。WGCNA共得到5个基因共表达模块,其中蓝色模块与LTBI活化相关性最强(cor=0.62,P=0.00004),包含1340个基因。将三者连同728个铁死亡相关基因(FRG)取交集,共得到8个表达趋势一致的FRG-DEGs。3种机器学习算法共筛选出4个FRG-hubs,包括PLA2G6、GLS2、JUN和AMN。逆转录PCR结果显示,随着休眠结核分枝杆菌的活化,FRG-hubs的表达逐渐降低。最后,基于FRG-hubs构建了LTBI活化风险模型,曲线下面积在0.98~1.00之间。结论本研究成功筛选出用于预测LTBI活化风险的新型标志物,并构建了具有良好预测效能的LTBI活化风险模型。

关键词：结核病结核潜伏感染铁死亡风险模型机器学习

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CVB3m激活胞外信号调节激酶(ERK)信号途径

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中国人兽共患病杂志 2004年第5期20卷 387-389页

作者：陈宏新黄孝天吴珺陈淑芸陈洪刘晶星上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室

目的　了解细胞外信号调节激酶 1和 2 (ERK1/2 )途径在柯萨奇病毒B3感染中的作用。方法　感染复数MOI =10的CVB3m或PBS感染生长停滞的HeLa细胞 1小时 ,在指定时间收集细胞裂解液后应用免疫印迹分析感染后不同时间ERK1/2的磷酸化以了解Ra... 详细信息

目的　了解细胞外信号调节激酶 1和 2 (ERK1/2 )途径在柯萨奇病毒B3感染中的作用。方法　感染复数MOI =10的CVB3m或PBS感染生长停滞的HeLa细胞 1小时 ,在指定时间收集细胞裂解液后应用免疫印迹分析感染后不同时间ERK1/2的磷酸化以了解Raf/MEK/ERK途径的活化。结果　CVB3m感染引起HeLa细胞ERK1/2的二次激活。第一次激活在感染后 10min即可检出 ,持续至感染后 1h ,随后P -ERK1/2水平降至基础。在感染后 7h再次激活并一直持续激活至感染后 2 4h ,在感染后 12h达到峰值。结论　CVB3m感染二次激活ERK1/2途径 ,即早期短暂激活和晚期的持续激活。

关键词：柯萨奇病毒细胞外信号调节激酶感染复数

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问号钩体趋化相关基因特征分析

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上海第二医科大学学报 2005年第1期25卷 33-35,73页

作者：霍丽杨宏亮李文俊李振红郭晓奎姜叙诚上海第二医科大学基础医学院病理学教研室上海200025 上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的预测问号钩体黄疸出血群赖型赖株的趋化信号传导途径,并深入分析趋化相关基因。方法使用ProtParamtool,NCBI/Blastp进行蛋白参数分析和结构域分析,使用Clustalw软件进行多序列对比,与大肠埃希菌K-12趋化相关基因进行比较。结果问号... 详细信息

目的预测问号钩体黄疸出血群赖型赖株的趋化信号传导途径,并深入分析趋化相关基因。方法使用ProtParamtool,NCBI/Blastp进行蛋白参数分析和结构域分析,使用Clustalw软件进行多序列对比,与大肠埃希菌K-12趋化相关基因进行比较。结果问号钩体趋化相关基因共30个,分为MCPs和che两组基因,功能与大肠埃希菌趋化相关基因相似,并预测出问号钩体趋化信号传导途径。结论问号钩体趋化相关基因较大肠埃希菌、苍白密螺旋体和伯氏疏螺旋体多,提示其趋化传导途径更为复杂,适应宿主的能力也更强,可能是钩体的重要毒力因子之一。

关键词：钩端螺旋体趋化性信号传导途径生物信息学

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柯萨奇病毒激活ERK信号途径的初步研究

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上海第二医科大学学报 2004年第7期24卷 595-596页

作者：陈宏新陈洪陈淑芸刘晶星上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

柯萨奇病毒B组3型(coxsackievirus B3,CVB3)是引起病毒性心肌炎和扩张性心肌病的主要病原体.CVB3在其感染过程中致细胞产生病变效应,直至死亡.CVB3感染也能引起细胞凋亡[1],但其病变机制尚不清楚.胞外信号调节激酶1/2(extracellular sig... 详细信息

柯萨奇病毒B组3型(coxsackievirus B3,CVB3)是引起病毒性心肌炎和扩张性心肌病的主要病原体.CVB3在其感染过程中致细胞产生病变效应,直至死亡.CVB3感染也能引起细胞凋亡[1],但其病变机制尚不清楚.胞外信号调节激酶1/2(extracellular signal-regulated kinase,ERK1/2)是促分裂原活化蛋白激酶家族中一类,参与了细胞生长、转化、分化以及细胞的生存和死亡等功能的调节[2].ERK途径参与HIV-1等多种病毒基因的表达和复制[3].本研究利用CVB3感染HeLa细胞后以磷酸化ERK1/2说明ERK1/2的活化状况,初步了解CVB3感染与宿主细胞ERK1/2的关系,为进一步阐明CVB3感染后的信号传导途径奠定基础.

关键词：柯萨奇病毒 ERK信号途径胞外信号细胞生长 CVB3 病毒感染

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问号钩端螺旋体全基因组的更新注释

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上海第二医科大学学报 2004年第6期24卷 421-425页

作者：宋卫峰赵蔚郭晓奎上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的对问号钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中未注释的基因进行重新注释,并寻找可能的新致病基因。方法将钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中功能未知的编码序列(CDSs)在BLASTP/NCBI数据库中比较,初步预测基因功... 详细信息

目的对问号钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中未注释的基因进行重新注释,并寻找可能的新致病基因。方法将钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中功能未知的编码序列(CDSs)在BLASTP/NCBI数据库中比较,初步预测基因功能,对可能的致病基因及其编码产物运用多种生物学软件进行深入分析。结果未知CDSs中有82个与NCBI数据库中的编码蛋白序列有很高的同源性,其中LA0063和LA3291编码金属蛋白酶,可能与致病有关。结论通过钩端螺旋体黄疸出血群赖株全基因组数据库中功能未知的CDSs进行定期比对,可以不断完善该数据库的功能注释,同时可以发现新的致病基因,有助于钩端螺旋体病致病机理的最终阐明。

关键词：问号钩端螺旋体基因组皮肤破损染色体

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哺乳动物的促分裂原活化蛋白激酶信号途径

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上海第二医科大学学报 2004年第3期24卷 221-224页

作者：陈宏新刘晶星上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室，上海200025

促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)是一类表达于所有真核细胞的丝氨酸/苏氨酸激酶,能够被诸如细胞因子、生长因子、神经递质、激素、细胞应急以及细胞粘附等各种刺激因素激活。MAPK途径的基本组合包括MAPK、MAPK激酶(MKK)和MAPK激酶激酶(MKKK... 详细信息

促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)是一类表达于所有真核细胞的丝氨酸/苏氨酸激酶,能够被诸如细胞因子、生长因子、神经递质、激素、细胞应急以及细胞粘附等各种刺激因素激活。MAPK途径的基本组合包括MAPK、MAPK激酶(MKK)和MAPK激酶激酶(MKKK)三种保守的成分,由此建立一个连续的激活途径。哺乳动物的MAPK可以大致归纳为5类:ERK1/2(MAPK^(erk1/2))、P38(MAPK^(p38))、JNK(MAPK^(jnk))、ERK3/4(MAPK^(erk3/4))和ERK5(MAPK^(erk5))。MAPK家族在各种细胞活动中具有重要作用,如增殖、分化、发育、转化及凋亡等。文章讨论了哺乳动物MAPK的功能和调节。

关键词：促分裂原活化蛋白激酶信号途径哺乳动物真核细胞细胞外信号

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感染Vero细胞中SARS病原体的电镜观察

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上海第二医科大学学报 2004年第3期24卷 192-194页

作者：朱平陈洪陈新宇陈淑云杨洁张岚易静刘晶星上海第二医科大学基础医学院细胞生物学教研室上海200025 上海第二医科大学基础医学院病原生物学教研室上海200025

目的用透射电子显微镜(TEM)观察严重急性呼吸综合征(SARS)患者感染的Vero细胞,为SARS病原体的分离鉴定提供形态学资料。方法标本为上海市疾病控制中心送检的SARS患者鼻咽拭子接种感染的Vero细胞,对培养液负染色标本和Vero细胞超薄切... 详细信息

目的用透射电子显微镜(TEM)观察严重急性呼吸综合征(SARS)患者感染的Vero细胞,为SARS病原体的分离鉴定提供形态学资料。方法标本为上海市疾病控制中心送检的SARS患者鼻咽拭子接种感染的Vero细胞,对培养液负染色标本和Vero细胞超薄切片标本进行TEM观察。结果在负染色标本和超薄切片标本中均可观察到病毒,病毒颗粒为圆形或椭圆形,外周有冠状排列的纤突,病毒颗粒直径约80～160 nm,纤突长度约20～40 nm。感染细胞的病毒颗粒分布在细胞质中,主要在内质网和空泡内,可见群集的大小较一致的病毒颗粒。结论本例电镜所见病毒颗粒大小、形态与文献报道的SARS冠状病毒(SARS-CoV)相符。

关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒电子显微镜 Vero细胞病原体细胞形态学

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重组Nox1在NIH3T3细胞中的表达及其对活性氧的影响

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上海第二医科大学学报 2005年第5期25卷 471-474页

作者：仓辉邹嫣琼杨洁王毓美王英史桂英易静上海第二医科大学基础医学院细胞生物学教研室上海200025

目的构建Nox1的真核表达载体,探讨其在NIH3T3细胞中表达后对活性氧水平和药物细胞毒易感性的影响。方法构建携带Nox1基因的真核表达载体pcDNA3-Nox1,并将其转染NIH3T3细胞,采用RT-PCR方法检测Nox1在mRNA水平上的表达,检测细胞活性氧和... 详细信息

目的构建Nox1的真核表达载体,探讨其在NIH3T3细胞中表达后对活性氧水平和药物细胞毒易感性的影响。方法构建携带Nox1基因的真核表达载体pcDNA3-Nox1,并将其转染NIH3T3细胞,采用RT-PCR方法检测Nox1在mRNA水平上的表达,检测细胞活性氧和细胞活力。结果RT-PCR显示转染后的NIH3T3细胞可以有效地转录Nox1mRNA,细胞中的活性氧水平明显升高,同时对As2O3细胞毒作用更加敏感。结论含有Nox1cDNA的重组质粒pcDNA3-Nox1转染细胞后可有效表达Nox1,使活性氧水平升高,并因此增加细胞对药物细胞毒的敏感性。

关键词： NIH3T3细胞活性氧表达及 RT-PCR方法真核表达载体 mRNA水平细胞毒作用 As2O3 细胞活力转染细胞重组质粒 cDNA 易感性 1基因 Nox 敏感性药物检测升高

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大黄素提高砷剂抑瘤效果的体内研究

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上海第二医科大学学报 2005年第7期25卷 666-670页

作者：李慧杨洁康迅雷李玲娜易静上海第二医科大学基础医学院细胞生物学教研室上海200025

目的研究大黄素增强砷剂的抑瘤作用,探讨肿瘤细胞敏感性、抗凋亡信号NF-κB激活与氧化还原状态的关系。方法在HeLa细胞移植瘤的动物模型上,应用不同剂量大黄素和砷剂腹腔注射,2周后检测瘤重、体重;留取新鲜组织,检测其抗氧化能力;瘤组... 详细信息

目的研究大黄素增强砷剂的抑瘤作用,探讨肿瘤细胞敏感性、抗凋亡信号NF-κB激活与氧化还原状态的关系。方法在HeLa细胞移植瘤的动物模型上,应用不同剂量大黄素和砷剂腹腔注射,2周后检测瘤重、体重;留取新鲜组织,检测其抗氧化能力;瘤组织分离培养后,用荧光素酶报告基因法和凝胶电泳迁移率分析法,检测NF-κB与DNA结合能力和促进转录能力。结果大黄素增强了砷剂抑制裸鼠移植瘤生长的作用;肿瘤大小与抗氧化能力呈正相关(r=0.826);大黄素能增强砷剂抑制NF-κB结合DNA、促进转录的能力。结论大黄素通过干预肿瘤细胞氧化还原状态,抑制NF-κB结合DNA、促进转录的能力,最终提高砷剂体内抑瘤效果。

关键词：大黄素砷剂细胞氧化还原状态 NF-κB

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阳离子脂质体介导的基因转染真核细胞的研究

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上海第二医科大学学报 2005年第10期25卷 1025-1029页

作者：李劲松叶展赵涵芳陈诗书上海第二医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室上海200025

目的研究高效的阳离子转染NIH3T3的方法.方法以绿色荧光蛋白(GFP)为报告基因,利用流式细胞仪比较三种脂质体转染效果,用不同的细胞融合度、脂质体浓度、脂质体与质粒的比例、转染时间优化转染条件.结果转染效率 LipofectAMINE2000＞Gene... 详细信息

目的研究高效的阳离子转染NIH3T3的方法.方法以绿色荧光蛋白(GFP)为报告基因,利用流式细胞仪比较三种脂质体转染效果,用不同的细胞融合度、脂质体浓度、脂质体与质粒的比例、转染时间优化转染条件.结果转染效率 LipofectAMINE2000＞GenePORTs＞LipofectAMINE.在细胞融合度为60% ～ 70%,脂质体/DNA为3 μL/μg,脂质体的量为3 μL,转染时间为5 h时,转染效率最高.转染结束后表达时间可以达一个月.结论 LipofectAMINE2000转染效率最佳,并优化了其最佳转染条件.

关键词：脂质体转染绿色荧光蛋白

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