检索结果-内蒙古大学图书馆

中国组织工程研究 2023年第35期27卷 5653-5658页

作者：李欣儒柴世凡李蔚然蔡红艳叶育采李硕侯萌王昭君山西医科大学山西省太原市030000 山西医科大学生理学系细胞生理学教育部重点实验室山西省细胞生理学重点实验室山西省太原市030000 山西医科大学基础医学院微生物与免疫教研室山西省太原市030000 山西医科大学附属第二医院山西省太原市030001

背景:阿尔茨海默病的机制挖掘十分重要,通过生物信息学对阿尔茨海默病潜在治疗靶点的研究,可以为阿尔茨海默病治疗提供良好的指示作用。目的:使用生物信息学分析方法筛选与阿尔茨海默病发病机制相关的基因并在动物水平加以实验验证。方... 详细信息

背景:阿尔茨海默病的机制挖掘十分重要,通过生物信息学对阿尔茨海默病潜在治疗靶点的研究,可以为阿尔茨海默病治疗提供良好的指示作用。目的:使用生物信息学分析方法筛选与阿尔茨海默病发病机制相关的基因并在动物水平加以实验验证。方法:利用GEO在线数据库筛选差异基因;利用DAVID在线数据库进行GO/KEGG富集分析;使用STRING数据库进行蛋白互作网络的构建;使用HPA数据库判断目的蛋白在人体中的分布情况;最后使用免疫荧光技术和免疫印迹技术验证分析蛋白表达情况。结果与结论:①利用GEO在线数据库内数据集GSE48350获取阿尔茨海默病与健康人群的基因芯片,使用GEO2R在线分析平台分析两个人群的差异基因,其中上调基因42个,下调基因131个;②GO基因功能注释分析结果显示差异基因主要位于突触前、运输囊泡和胞外囊泡;介导神经递质释放和突触小泡功能等生物进程;参与磷脂结合、受体-配体活性和网格蛋白结合等分子功能的构成;③KEGG通路分析结果显示差异基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用、γ-氨基丁酸神经突触与逆行内源性大麻素信号等突触功能相关信号通路;④结合蛋白互作网络筛选出5个上调关键基因:CLU、GFAP、CD44、FOS、ANXA1;5个下调关键基因:GABRG2、SYT1、SYN2、KCNC1、SLC32A1;⑤实验证实在阿尔茨海默病小鼠模型的海马组织中GABRG2、KCNC1、SLC32A1表达显著下调;⑥结果提示上述3个基因可以作为治疗和诊断阿尔茨海默病的潜在基因,为阿尔茨海默病的治疗提供重要的线索,亦可以作为阿尔茨海默病与癫痫的共治疗靶点。

关键词： GEO数据库阿尔茨海默病癫痫生物信息学 GABRG2 KCNC1 SLC32A1

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新型隐球菌临床菌株中CNAG＿01032基因的鉴定和功能研究

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菌物学报 2019年第8期38卷 1341-1349页

作者：邱文兰咏哲王迪黄劲廖万清康颖倩贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州贵阳550025 贵州省微生物与人类健康关系研究人才基地暨贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室贵州贵阳550025 贵州医科大学生物化学与分子生物学教研室贵州贵阳550025 第二军医大学上海长征医院真菌学研究所上海200003

新型隐球菌是一种具有荚膜的重要临床致病真菌。本课题组在前期工作中发现CNAG01032基因可能引起不同来源菌株的表型差异,本研究在此基础上以新型隐球菌临床来源菌株IFM56800(C1)、IFM56769(C2)为背景构建CNAG01032基因敲除突变体,并检... 详细信息

新型隐球菌是一种具有荚膜的重要临床致病真菌。本课题组在前期工作中发现CNAG01032基因可能引起不同来源菌株的表型差异,本研究在此基础上以新型隐球菌临床来源菌株IFM56800(C1)、IFM56769(C2)为背景构建CNAG01032基因敲除突变体,并检测突变株和野生型菌株经典毒力因子变化情况;使用API 20C AUX测试系统测试突变株和野生型菌株对19种糖的利用情况;使用尾静脉注射法感染BALB/c雌性小鼠进行致病性检测。结果显示:成功构建以临床株C1、C2为背景的CNAG-01032基因敲除突变株;突变株在37℃生长、黑色素产生与野生型菌株无显著差异,但荚膜厚度分别比C1、C2减少16.4%、18.2%;两基因敲除菌株均不能分解利用纤维二糖;致病性与野生型菌株无显著差异。新型隐球菌CNAG01032基因可能参与临床来源菌株IFM56800、IFM56769的荚膜合成和纤维二糖的代谢。

关键词：病原性真菌基因敲除荚膜纤维二糖

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脂蛋白SA2275抗体治疗金黄色葡萄球菌脑脓肿的实验初探

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第三军医大学学报 2020年第16期42卷 1655-1662页

作者：郑颖杨裔彭华刚饶一凡胡珍胡启文钟莲梅饶贤才尚伟龙周人杰昆明医科大学第一附属医院神经内科昆明650032 陆军军医大学(第三军医大学)基础医学院微生物学教研室重庆市微生物工程实验室重庆400038 西南大学生命科学学院现代生物医药研究所三峡库区生态环境与生物资源省部共建国家重点实验室培育基地重庆400715 陆军军医大学(第三军医大学)第二附属医院急诊部重庆400037

目的探讨脂蛋白特异性抗体通过血脑屏障及其在抑制金黄色葡萄球菌脑脓肿形成中的作用。方法利用大肠埃希菌表达并纯化重组金葡菌脂蛋白SA2275,制备特异性小鼠多克隆抗体(anti-SA2275)。制作金葡菌感染脑脓肿模型,利用ELISA法检测经腹腔... 详细信息

目的探讨脂蛋白特异性抗体通过血脑屏障及其在抑制金黄色葡萄球菌脑脓肿形成中的作用。方法利用大肠埃希菌表达并纯化重组金葡菌脂蛋白SA2275,制备特异性小鼠多克隆抗体(anti-SA2275)。制作金葡菌感染脑脓肿模型,利用ELISA法检测经腹腔注射的anti-SA2275在小鼠脑组织中的滴度,评估抗体通过血脑屏障的能力;再利用梯度稀释细菌计数法检测脑脓肿中的细菌载量,对脑脓肿进行连续病理切片检测脑脓肿的大小,评价抗体anti-SA2275治疗金葡菌脑脓肿的效果。结果成功获得高纯度SA2275重组蛋白;免疫小鼠获得anti-SA2275,效价为1:51200;anti-SA2275注射金葡菌脑脓肿模型小鼠后,在动物脑组织中检测到抗体的存在;治疗组小鼠脑脓肿大小和菌载量显著低于阴性对照组。结论在金葡菌感染小鼠所致的脑脓肿形成过程中,脂蛋白SA2275特异性抗体可以通过血脑屏障分布至脑组织,显著抑制脑脓肿的形成及细菌的定植,具有治疗金葡菌脑脓肿的应用前景。

关键词：金黄色葡萄球菌脑脓肿抗体血脑屏障

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贵州黔南喀斯特洞穴放线菌抗菌活性筛选及差异研究

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贵州医科大学学报 2019年第5期44卷 519-523,535页

作者：牛雪可兰永哲李文均曹煜黄劲廖万清康颖倩贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州贵阳550025 贵州医科大学贵州省微生物与人类健康关系研究人才基地暨贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室贵州贵阳550025 中山大学生命科学学院广东广州510275 贵州医科大学附院皮肤科贵州贵阳550004 第二军医大学上海长征医院真菌学研究所上海200003

目的:探索贵州黔南荔波喀斯特地区洞穴放线菌资源,筛选具有抗菌活性的放线菌菌株。方法:采集贵州荔波茂兰喀斯特森林无名洞穴内土壤样品,采用纯培养的方法分离菌株,并扩增其16SrRNA基因、筛选其中放线菌;使用3种培养基发酵,管碟法对放... 详细信息

目的:探索贵州黔南荔波喀斯特地区洞穴放线菌资源,筛选具有抗菌活性的放线菌菌株。方法:采集贵州荔波茂兰喀斯特森林无名洞穴内土壤样品,采用纯培养的方法分离菌株,并扩增其16SrRNA基因、筛选其中放线菌;使用3种培养基发酵,管碟法对放线菌进行抗菌活性检测。结果:共分离出35株放线菌,分属于3个目、5科、9个属、22个种,红球菌属为优势菌属(45.7%);42.8%的菌株对至少一种测试菌具有抗菌活性;使用AM3及ISP5培养基获得具有抗性发酵液的比例均占53.3%,RA培养基只有33.3%的发酵液具有抗性。结论:贵州黔南喀斯特无名洞穴内存在丰富的具备潜在抗菌活性的放线菌资源,不同的发酵培养条件影响放线菌抗菌活性。

关键词：喀斯特放线菌抗菌活性培养条件筛选贵州

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贵州省某热泉中可培养细菌的多样性及不同温度胁迫下的变化

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贵州医科大学学报 2019年第5期44卷 513-518页

作者：牛雪可邱文兰永哲李文均廖万清沈志平余能彬邹成刚康颖倩贵州医科大学基础医学院微生物学教研室贵州贵阳550025 贵州省微生物与人类健康关系研究人才基地暨贵州省普通高校病原生物学特色重点实验室贵州贵阳550025 中山大学生命科学学院广东广州510275 第二军医大学上海长征医院真菌学研究所上海200003 贵州正业国际工程企业管理集团有限公司贵州贵阳550000 云南大学云南生物资源保护利用国家重点实验室云南昆明650091

目的:研究贵州省某未开发热泉中可培养细菌的多样性及在不同温度胁迫下细菌的变化情况。方法:采用R2A培养基,分别置于70、65、60、55、50、45、37以及25℃下对热泉细菌进行培养,涂布法对所培养细菌进行分离鉴定,采用最大拟自然法法构建1... 详细信息

目的:研究贵州省某未开发热泉中可培养细菌的多样性及在不同温度胁迫下细菌的变化情况。方法:采用R2A培养基,分别置于70、65、60、55、50、45、37以及25℃下对热泉细菌进行培养,涂布法对所培养细菌进行分离鉴定,采用最大拟自然法法构建16srRNA系统发育树,比较不同温度胁迫下,可培养细菌多样性的差异。结果:共分离得到243株可培养细菌,归属于25个种、20个属、5个纲以及3个门;在属间水平上,α-变形菌纲细菌的多样性最为丰富;在菌株数量上,α-变形菌纲属于优势类群;不同温度培养下,所得到的优势菌不同,在60、55、50、45、37以及25℃6种培养温度下分离出的菌株在群落分布上呈现明显的差异,37℃细菌群落多样性最丰富。结论:该热泉中微生物多样性丰富,未发现的新类群;温度对群落的组成有显著影响,温度可能与生物多样性变化相关。

关键词：热泉细菌培养生物多样性温度胁迫贵州

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HIV-1／HCV合并感染者中HCV基因亚型流行情况调查

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中华流行病学杂志 2009年第7期30卷 663-667页

作者：刘静杨洋宫菊丽张子宁张旻王亚男姜拥军戚中田潘启超钟平尚红中国医科大学附属第一医院卫生部艾滋病免疫学重点实验室沈阳110001 解放军第二军医大学微生物教研室上海市预防医学研究院艾滋病病毒免疫研究室

目的了解中国部分地区HIV-1和HCV合并感染人群中HCV基因亚型的流行、分布及其与HIV-1感染疾病进展的关系。方法对186份获自河南、云南、新疆、吉林和辽宁省HW-1／HCV合并感染人群标本（HCV病毒载量〉1000cop／ml），用反转录巢式聚合酶... 详细信息

目的了解中国部分地区HIV-1和HCV合并感染人群中HCV基因亚型的流行、分布及其与HIV-1感染疾病进展的关系。方法对186份获自河南、云南、新疆、吉林和辽宁省HW-1／HCV合并感染人群标本（HCV病毒载量〉1000cop／ml），用反转录巢式聚合酶链反应方法扩增血浆HCV核心基因区并进行基因亚型分型，同时检测HIV-1和HCV载量以及CD4＋T细胞计数。结果（1）HCV不同基因亚型比例分别为1a（1．7％）、1b（39．9％）、2a（17．9％）、3a（10．4％）、3b（15．6％）、6a（1．2％）、6n（6．4％）和6型未鉴定亚型（7．5％）。HCV2a和1b主要流行于河南省既往有偿献血浆人员中；3a和3b亚型主要流行于新疆和云南静脉注射吸毒者（IDU）中；HCV6型主要流行于云南吸毒人员中。（2）1b亚型的HCVRNA水平显著高于非1b亚型，但在HIV-1载量和CD4＋T细胞数方面差异无统计学意义。2a亚型的HIV-IRNA和HCVRNA水平显著低于非2a亚型。结论HW-1／HCV合并感染人群中HCV基因亚型的流行和分布与流行地区和感染途径有关。新的HCV6型亚型病毒株已经在合并感染的IDU人群中流行。尚未发现HCV基因亚型与HIV感染疾病进展之间的关系。

关键词：丙型肝炎病毒人免疫缺陷病毒合并感染基因亚型

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HIV-1 HXB2株蛋白酶的原核表达、纯化及其Gag蛋白CAP2NC的切割活性分析

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第二军医大学学报 2008年第4期29卷 365-370页

作者：陈铭潘欣贾建安何俊蒋少华陈璐姚静娟陈秋莉曹洁潘卫第二军医大学基础部微生物学教研室上海200433 安徽医科大学病理学教研室合肥230032 第二军医大学长征医院感染科上海200003

目的:原核表达、纯化HIV-1型HXB2株蛋白酶(protease,PR),用于对HIV-1 Gag P2/NC蛋白酶切割位点序列随机突变的噬菌体展示文库的切割筛选及构建新的蛋白酶抑制剂(protease inhibitor,PI)类药物体外筛选模型。方法:根据HIV-1 HXB2株PR DN... 详细信息

目的:原核表达、纯化HIV-1型HXB2株蛋白酶(protease,PR),用于对HIV-1 Gag P2/NC蛋白酶切割位点序列随机突变的噬菌体展示文库的切割筛选及构建新的蛋白酶抑制剂(protease inhibitor,PI)类药物体外筛选模型。方法:根据HIV-1 HXB2株PR DNA序列设计引物,在PR序列上游添加自切割位点MGTVSFNF 8个氨基酸编码获得PR107 DNA编码序列,将PR107 DNA克隆至原核表达载体pET-32a,序列测定后转化大肠杆菌BL21 DE3进行诱导表达。表达产物经用Ni-NTA亲和柱纯化,经复性后,进行靶蛋白CAP2NC切割试验,SDS-PAGE检测切割结果。结果:成功合成了使用大肠杆菌偏好密码子的HIV-1 PRl07的DNA编码序列,序列测定显示其编码氨基酸序列与原始序列完全一致;成功构建了HIV-1 PR原核表达质粒pETa2a—PR107,转化大肠杆菌BL21 DE3经IPTG诱导后,表达出相对分子质量为30 000的HIV-1 PR融合蛋白,纯化的目的蛋白浓度为2.54 mg/ml;纯化蛋白经复性后具有对底物蛋白CAP2NC的切割活性,该作用能被PI药物抑制。结论:成功构建大肠杆菌偏好密码子带自切割位点的HIV-1 PR原核表达载体pET32a—PR107,在大肠杆菌中表达,经纯化复性获得了具有切割活性的HIV-1 PR融合蛋白。

关键词： HIV 蛋白酶基因表达切割

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双歧三联活菌治疗肠易激综合征的临床多中心研究

双歧三联活菌治疗肠易激综合征的临床多中心研究

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第六届全国儿科微生态学学术会议暨儿科微生态学新进展学习班

作者：上海市双歧三联活菌协作组徐正婕王兴鹏江石湖袁耀宗刘文忠谢渭芬李兆申洪秀华交通大学附属上海市第一人民医院消化科上海第二医科大学附属瑞金医院消化科上海第二医科大学附属仁济医院消化研究所第二军医大学附属长征医院消化科第二军医大学附属长海医院消化科第二医科大学微生物教研室

目的观察双歧三联活菌对腹泻型肠易激综合征(IBS)的疗效和安全性。方法采用多中心、随机、开放的临床试验。97例腹泻型IBS患者口服双歧三联活菌胶囊27d。记录并量化治疗前、后患者的症状和大便性状,检查血、尿、粪常规,记录治疗中的不... 详细信息

目的观察双歧三联活菌对腹泻型肠易激综合征(IBS)的疗效和安全性。方法采用多中心、随机、开放的临床试验。97例腹泻型IBS患者口服双歧三联活菌胶囊27d。记录并量化治疗前、后患者的症状和大便性状,检查血、尿、粪常规,记录治疗中的不良事件;7例患者服药前后前后进行选择性粪细菌培养。结果口服双歧三联活菌27d后,患者各项IBS症状评分明显下降,各项症状改善率为74.2%～87.6%,大便Bristol评分显著下降。粪细菌培养显示口服双歧三联活菌使乳杆菌和肠球菌在肠道定植。不良事件2例,与服药无关。结论双歧三联活菌可明显改善腹泻型IBS的症状,且安全性高,耐受性好。

关键词：肠易激综合征双歧三联活菌

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噬菌体展示耐药突变HIV-1蛋白酶敏感切割位点六肽随机文库的构建

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中国药理学通报 2007年第3期23卷 403-406页

作者：卢海妹周波潘卫贾建安王锦红温宗梅何俊陈露邓松华安徽医科大学病理生理学教研室合肥230032 第二军医大学基础医学部微生物学教研室上海200433

目的构建耐药性突变HIV-1蛋白酶(protease PR)敏感切割位点序列体外噬菌体筛选模型,研究HIV-1蛋白酶耐药性突变与敏感切割序列的关系。方法用含随机核苷酸序列的引物PCR方法对HIV-1gag基因上的CAP2片段的PR切割位点处的氨基酸序列进行... 详细信息

目的构建耐药性突变HIV-1蛋白酶(protease PR)敏感切割位点序列体外噬菌体筛选模型,研究HIV-1蛋白酶耐药性突变与敏感切割序列的关系。方法用含随机核苷酸序列的引物PCR方法对HIV-1gag基因上的CAP2片段的PR切割位点处的氨基酸序列进行随机化,再将重组CAP2片段和NC片段拼接克隆于噬菌体展示载体LD3-pCANT-AB5S上,建立HIV-1蛋白酶靶蛋白切割位点随机化的噬菌体展示文库。结果该噬菌体展示文库库容量为2.6×106,滴度为4.1×1015TU·L-1,CAP2片段插入率为47.8%;序列分析显示切割位点中随机化的核苷酸与氨基酸均呈随机性分布。结论成功地构建HIV-1蛋白酶的敏感切割序列噬菌体筛选文库,为筛选到突变PR敏感切割序列噬菌体及研究耐药HIV-1蛋白酶抑制剂与突变PR的关系打下基础。

关键词：人类免疫缺陷病毒-1 蛋白酶耐药突变噬菌体展示文库

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钩端螺旋体蛋白质相互作用网络预测与系统分析

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科学通报 2006年第9期51卷 1049-1057页

作者：孙景春徐晋麟曹建平刘琪郭晓奎石铁流李亦学上海交通大学生命科学技术学院上海200240 电子科技大学生物医学工程系成都610054 上海第二医科大学病原微生物教研室上海200025 上海生命科学院生命信息中心生物信息中心上海200031

问号钩端螺旋体是一种致病菌,能够引起人畜共患病．该细菌全基因组序列测序的完成,为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础．本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵子法)来预测钩端... 详细信息

问号钩端螺旋体是一种致病菌,能够引起人畜共患病．该细菌全基因组序列测序的完成,为从全蛋白质组学的角度分析蛋白质相互作用网络提供了基础．本研究通过整合4种计算方法(基因融合法、基因邻居法、系统发生谱法和操纵子法)来预测钩端螺旋体赖株蛋白质相互作用网络．对运动和趋化系统、信号传导系统、脂多糖生物合成以及黏附、侵袭等有关蛋白质之间的相互作用进行了详细分析．除此以外,根据蛋白质的相互作用网络以及功能分类,预测了203个未知蛋白质可能的功能．这不仅为进一步研究钩端螺旋体赖株的致病机制提供了一个资料,也为在基因组范围内应用生物信息学方法研究微生物提供了一个实例．

关键词：问号钩端螺旋体蛋白质相互作用网络基因融合法基因邻居法系统发生谱法操纵子法

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