检索结果-内蒙古大学图书馆

中国食品添加剂 2023年第5期34卷 76-87页

作者：马建宝卡丽比奴儿·艾尔肯阿力米江·奥布力塔力甫伊再提·外力古丽巴哈尔·卡吾力新疆医科大学药学院药剂教研室乌鲁木齐830011

采用单因素及Box-Behnken响应面设计,以总酚、总黄酮及固形物得率及三者总评“归一值”为评价指标,对罗勒、蒲公英、藿香、玫瑰、陈皮等药材浸提工艺进行优化,最佳提取工艺为:料液比1∶30g/mL,超声20 min,提取温度100℃,提取时间92 min... 详细信息

采用单因素及Box-Behnken响应面设计,以总酚、总黄酮及固形物得率及三者总评“归一值”为评价指标,对罗勒、蒲公英、藿香、玫瑰、陈皮等药材浸提工艺进行优化,最佳提取工艺为:料液比1∶30g/mL,超声20 min,提取温度100℃,提取时间92 min,提取2次,在此条件下总酚、总黄酮、固形物得率为4.46%,7.12%,31.37%;平行验证试验(RSD <2%)表明该工艺稳定、可靠、具有一定的实际运用价值。体外抗氧化活性和安全性试验表明,该水提取物浓度在5 mg/mL时对DPPH、O_(2)-·、·OH等自由基清除率可达88.77%、62.03%、33.96%,对Fe^(3+)亦有一定的还原能力,且具量效关系;雌雄昆明小鼠最大耐受剂量(MTD)均大于10 g/kg,提取物为安全无毒品(MTD≥10g/kg)。本研究结果为开发利用罗勒蒲公英复方固体饮料提供了相应基础,并可为相应保健食品的研发提供参考。

关键词：固体饮料提取工艺 Box-Behnken响应面设计抗氧化

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XGBoost-SHAP机器学习可解释框架用于轻度认知障碍分类研究

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中国卫生统计 2024年第3期41卷 423-429页

作者：易付良陈杜荣杨慧秦瑶韩红娟崔靖白文琳马艺菲张荣余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计教研室 030000 重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的利用机器学习算法对轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)亚型分类有利于患者的个性化治疗,而复杂模型常因分类过程的内部机制不可洞察而饱受诟病,本研究借助可解释技术梳理模型的输出结果,以期为相关领域研究者的决策提供... 详细信息

目的利用机器学习算法对轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)亚型分类有利于患者的个性化治疗,而复杂模型常因分类过程的内部机制不可洞察而饱受诟病,本研究借助可解释技术梳理模型的输出结果,以期为相关领域研究者的决策提供统计支持。方法本研究联合极限梯度提升(eXtreme Gradient Boosting,XGBoost)与沙普利可加性(SHapley Additive exPlanations,SHAP)构建可解释性框架,用于遗忘型MCI(amnestic MCI,aMCI)和非遗忘型MCI(non-amnestic naMCI)的分类,并根据联合框架输出结果进行解读。结果联合框架输出aMCI和naMCI的最佳分界值为0.51,XGBoost分类准确率、灵敏度、特异度、F1值、AUC分别为92.81%、94.94%、90.54%、0.93、0.96。SHAP个性化预测结果,7号和31号示例个体被预测为aMCI的概率分别为0.27和0.91;全局性解释结果,不同个体随着CEREALL、ORIENT、CDRSUM、LCMF、RSUPMAR、RMEDORBF、LPOSCENM等指标的shapley值增大,患aMCI的风险越大,上述指标可以解释为aMCI发生的危险因素,而RENT、MMSEORDA、CRAFTVRS等则相反,可以解释为aMCI发生的保护因素。结论XGBoost-SHAP联合框架用于MCI亚型分类效果较为理想,实现了特定个体不同特征预测效果的比较、不同个体给定特征预测能力的判断,为相关研究者打开了洞察复杂模型内在机制的大门。

关键词：机器学习可解释性极限梯度提升-沙普利可加性轻度认知障碍分类

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倾向性评分与孟德尔随机化国内研究现状

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中华疾病控制杂志 2022年第3期26卷 325-330页

作者：和思敏张雨彭刘庆景佳蕊陈淑婷王文杰高绒绒高雪高倩王彤山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001

混杂偏倚是非随机化研究中偏倚一类的重要来源,对混杂因素的控制是研究中获得可靠结果的保证。本文简要介绍了在非随机化研究中常用的两类混杂控制方法——倾向性评分和孟德尔随机化,并对近年来国内相关研究现状进行综述,为倾向性评分... 详细信息

混杂偏倚是非随机化研究中偏倚一类的重要来源,对混杂因素的控制是研究中获得可靠结果的保证。本文简要介绍了在非随机化研究中常用的两类混杂控制方法——倾向性评分和孟德尔随机化,并对近年来国内相关研究现状进行综述,为倾向性评分匹配和孟德尔随机化的应用提供建议。

关键词：倾向性评分孟德尔随机化混杂控制

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COVID-19相关心肌炎的研究进展

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生理科学进展 2024年第2期55卷 179-184页

作者：李玥霖赵伊帆郝丽英胡慧媛中国医科大学药学院药物毒理学教研室沈阳110122

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)是一种新型冠状病毒,主要感染肺脏造成新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)。近年的临床病例报告了其心血管系统并发症主... 详细信息

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)是一种新型冠状病毒,主要感染肺脏造成新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)。近年的临床病例报告了其心血管系统并发症主要为心肌炎、心律失常、心肌梗死等。其中,COVID-19相关心肌炎症状多样,不同年龄段均可发生,存在延迟发作,且与COVID-19患者的不良预后和死亡率呈正相关。因此,研究其临床特点、潜在发病机制和治疗方法可对未来COVID-19相关心肌炎的防治及药物开发提供新的思路和策略。本文将结合国内外关于COVID-19相关心肌炎的研究进行概述。

关键词： SARS-CoV-2 心肌炎机制治疗进展

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基于FAERS和WHO-VigiAccess数据库的仑卡奈单抗不良事件信号挖掘与分析

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现代药物与临床 2025年第3期40卷 742-749页

作者：郭锡春袁梦梦郝慧慧刘文山丁传华韩秀媛山东第二医科大学附属医院药学部山东潍坊261031 山东第二医科大学附属医院医院感染管理办公室山东潍坊261031

目的挖掘仑卡奈单抗的药品不良事件信号,为合理用药提供参考。方法通过美国食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)和世界卫生组织药品不良反应报告数据库(WHO-VigiAccess)收集2023年第1季度—2024年第4季度的仑卡奈单抗相关不良事... 详细信息

目的挖掘仑卡奈单抗的药品不良事件信号,为合理用药提供参考。方法通过美国食品药品监督管理局不良事件报告系统(FAERS)和世界卫生组织药品不良反应报告数据库(WHO-VigiAccess)收集2023年第1季度—2024年第4季度的仑卡奈单抗相关不良事件报告,利用比例失衡法中的报告比值比(ROR)法和比例报告比值(PRR)法进行数据统计并分析。结果在FAERS数据库和WHO-VigiAccess数据库分别涉及25、23种系统器官分类(SOC),主要为各类神经系统疾病、全身性疾病及给药部位各种反应、精神病类。在FAERS数据库中,报告例数排名靠前的不良事件信号涉及头痛、淀粉样蛋白相关性影像异常水肿/渗出型、淀粉样蛋白相关性影像异常微出血和血铁质沉积型、寒战和疲劳;而WHO-VigiAccess数据库则为头痛、寒战、疲劳、淀粉样蛋白相关性影像异常水肿/渗出型和输液相关反应。2个数据库中信号强度排名靠前的不良事件信号均涉及淀粉样蛋白相关性影像异常、淀粉样蛋白相关性影像异常微出血和血铁质沉积型、淀粉样蛋白相关性影像异常水肿/渗出型、中枢神经系统表面铁沉积症和大脑微出血等首选术语。FAERS数据库显示,大多数病例发生不良事件是在给药第1个月内。结论在使用仑卡奈单抗时,应重点关注老年女性和长期用药患者,并要警惕感染、缺血性卒中等罕见的不良事件。同时也应加强临床用药监护,降低不良事件对患者预后以及生活质量的影响。

关键词：仑卡奈单抗不良事件 FAERS数据库 WHO-VigiAccess数据库淀粉样蛋白相关性影像异常

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猪囊尾蚴排泄分泌抗原LRRC15蛋白对仔猪T细胞免疫应答的影响

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中国病原生物学杂志 2023年第8期18卷 927-933页

作者：李丽竹何威周必英遵义医科大学寄生虫学教研室贵州遵义563000

目的观察猪囊尾蚴排泄分泌抗原LRRC15蛋白对仔猪T细胞免疫应答的影响方法用LRRC15蛋白刺激健康仔猪外周血PBMC和脾脏CD4^(+)T细胞,分析T细胞免疫应答水平:①在PHA处理下,以RPMI 1640、ESA、ConA为对照组,用LRRC15蛋白刺激PBMC,流式检测C... 详细信息

目的观察猪囊尾蚴排泄分泌抗原LRRC15蛋白对仔猪T细胞免疫应答的影响方法用LRRC15蛋白刺激健康仔猪外周血PBMC和脾脏CD4^(+)T细胞,分析T细胞免疫应答水平:①在PHA处理下,以RPMI 1640、ESA、ConA为对照组,用LRRC15蛋白刺激PBMC,流式检测CD4^(+)、CD8^(+)T淋巴细胞数量比例变化,以及CD4^(+)CD25^(+)Foxp3^(+)、CD8^(+)CD25^(+)Foxp3^(+)Treg细胞表达水平;②在有和无LPS存在下,用LRRC15蛋白刺激PBMC,ELISA检测培养上清中IL-10含量;③分别于加入LRRC15蛋白后24、48、72 h检测初始CD4^(+)Th细胞分化情况。分离仔猪脾脏CD4^(+)T细胞并与未成熟髓源性DC共培养,采用ELISA方法检测加入LRRC15蛋白24、48、72 h培养上清中的IL-4、IL-5、IL-10、IL-17、IFN-γ水平。结果LRRC15蛋白刺激PBMC后,CD4^(+)T淋巴细胞数量比例显著增加(P<0.05),并诱导CD4^(+)CD25^(+)Foxp3^(+)、CD8^(+)CD25^(+)Foxp3^(+)Treg表达(均P<0.05),但不能诱导IL-10的分泌。LRRC15蛋白分别作用于CD4^(+)T细胞24、48、72 h,PBMC细胞IL-4、IL-17分泌水平显著降低(均P<0.05);LRRC15蛋白诱导24与48 h相比,PBMC细胞分泌IL-5水平升高(P<0.05);诱导72 h的IL-5水平与48 h时比较差异无统计学意义(P<0.05);LRRC15蛋白诱导IFN-γ水平升高(P<0.05),诱导24、48、72 h时的分泌水平差异无统计学意义(P>0.05);LRRC15蛋白于CD4^(+)T细胞24、48、72 h均不能诱导IL-10分泌(均P>0.05)。结论LRRC15蛋白可诱导仔猪PBMC中CD4^(+)/CD8^(+)T细胞免疫失衡,诱导Treg细胞表达,通过非依赖性IL-10途径发挥免疫抑制作用,并诱导早期Th1型免疫应答和后期Th1/Th2混合型免疫应答。

关键词：猪囊尾蚴排泄分泌抗原 LRRC15蛋白 T细胞免疫应答

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SDAEC算法在单细胞测序数据批次校正中的应用

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中国卫生统计 2024年第4期41卷 501-506页

作者：王文杰李康谢宏宇哈尔滨医科大学卫生统计学教研室 150081 浙江大学医学院附属妇产科医院临床研究中心

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细... 详细信息

目的提出深度堆叠降噪自编码嵌套聚类(stacked denoising auto encoder embedded cluster, SDAEC)算法并用于单细胞mRNA测序(single cell mRNA sequence, scRNA-seq)数据的批次效应移除,对其移除批次效应性能进行评估。方法基于单细胞数据具有高维度、高稀疏性及高度非线性误差特点,通过将单细胞Louvain聚类算法嵌入堆叠降噪自动编码器(stacked denoising auto encoder, SDAE)算法中,形成SDAEC算法,用于单细胞测序数据的批次效应移除。结合实际卵巢癌组织scRNA-seq数据,利用分布邻域嵌入(t-distributed stochastic neighbor embedding, tSNE)、 k最近邻批次效应检测(k-nearest-neighbor batch-effect test, kBET)、调整兰德系数(adjusted rand index, ARI)、标准化互信息(normalized mutual information, NMI)、平均轮廓宽度(average silhouette width, ASW)评价其移除批次效应性能。结果利用SDAEC方法对scRNA-seq数据批次效应移除性能高于Combat、相互最近邻(mutual nearest neighbors, MNN)、分布匹配残差网络(maximum mean discrepancy distribution-matching residual networks, MMD-ResNet)和基于零膨胀负二项的方差提取法(zero-inflated negative binomial-based wanted variation extraction, ZINB-WaVE)。结论 SDAEC算法能够移除scRNA-seq数据的批次效应,提高scRNA-seq数据下游分析的有效性,具有实际应用价值。

关键词：深度堆叠降噪自编码嵌套聚类单细胞测序批次效应卵巢癌

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钙敏感受体在高糖诱导的人眼小梁网细胞损伤中的作用

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中国病理生理杂志 2022年第5期38卷 839-844页

作者：车冰冰孙梦婷王宁宁岑杰李国鹏赵冰冰魏璨哈尔滨医科大学病理生理学教研室黑龙江哈尔滨150086 哈尔滨医科大学附属第二医院黑龙江哈尔滨150086

目的:观察钙敏感受体(CaSR)在高糖(HG)诱导的人眼小梁网细胞(HTMC)损伤中的作用和机制。方法:将HTMC随机分为:对照(control)组(10%胎牛血清-DMEM)、HG组(10%胎牛血清-DMEM+50 mmol/L葡萄糖)、HG+CaSR激动剂NPS R568组(10%胎牛血清-DMEM+50 mmol/L葡萄糖+10μmol/L NPS R568)和HG+CaSR抑制剂Calhex231组(10%胎牛血清-DMEM+50 mmol/L葡萄糖+3μmol/L Calhex231),培养72 h。CCK-8法测量不同浓度的葡萄糖刺激下HTMC活力;试剂盒测定超氧化物歧化酶(SOD)活性和丙二醛(MDA)含量;Western blot检测CaSR、SOD2、凋亡相关蛋白(cleaved caspase-3和Bcl-2)及自噬相关蛋白(ATG7、P62、LC3-I和LC3-Ⅱ)表达;免疫荧光染色观察CaSR细胞定位和表达。结果:葡萄糖浓度为50 mmol/L时,HTMC相对活力由1.00±0.03下降至0.60±0.07(P<0.05);与control组相比,HG使HTMC中CaSR、cleaved caspase-3和P62表达以及MDA含量增加(P<0.05),而SOD活性,SOD2、Bcl-2和ATG7表达,以及LC3-Ⅱ/LC3-I比值下降(P<0.05);NPS R568进一步促进HG诱导的细胞损伤,而Calhex231可减轻上述变化(P<0.05)。结论:CaSR表达参与HG诱导的HTMC损伤,其机制与促进细胞凋亡和氧化应激以及抑制自噬有关。

关键词：钙敏感受体人小梁网细胞高糖细胞凋亡氧化应激自噬

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PRKDC在肝癌中的表达及其与免疫细胞浸润、预后的相关性分析

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中国免疫学杂志 2023年第8期39卷 1687-1693页

作者：余春波李大玉范芳李长福(指导) 遵义医科大学生物化学教研室遵义563000

目的:利用生物信息学方法分析PRKDC在肝癌中的表达及其与肿瘤微环境中免疫细胞浸润、预后的关系。方法:采用Oncomine、UALCAN、HCCDB、HPA、TCGA、Kaplan-Meier、cBioPortal、LinkedOmics、TIMER数据库和R软件包ggstatsplot、IOBR、psych(version 2.1.6)研究PRKDC基因在肝癌组织和正常肝组织中的表达差异,分析基因表达、基因突变与肝癌预后的相关性,并对GO、KEGG通路进行GESA富集分析;分析PRKDC表达与免疫检查点、免疫标志基因、肿瘤免疫细胞浸润、肿瘤微环境中免疫细胞和基质细胞浸润的相关性。结果:肝癌组织PRKDC呈显著高表达,高表达的PRKDC显著缩短肝癌患者OS和DSS,PRKDC基因组改变与肝癌患者OS和DFS无显著相关性;PRKDC表达与B细胞、嗜中性粒细胞、巨噬细胞、CD4+T细胞和树突状细胞呈显著正相关,与多数免疫检查点、免疫标志基因显著相关,与肝癌肿瘤微环境呈显著负相关。结论:PRKDC可作为肝癌诊断、预后和免疫细胞浸润水平的标志物,与免疫检查点、免疫标志基因、免疫细胞浸润性、肿瘤微环境免疫细胞和基质细胞浸润等相关。

关键词： PRKDC 肝癌免疫浸润肿瘤微环境生物信息学

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猪囊尾蚴排泄分泌抗原TPx蛋白的筛选验证、T细胞抗原表位预测及真核表达

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中国病原生物学杂志 2023年第2期18卷 174-179,184页

作者：何威李丽竹孙晓晴罗波周必英遵义医科大学寄生虫学教研室贵州遵义563000

目的在对猪囊尾蚴及其排泄分泌抗原(excretory secretory antigen, ESA)非标定量(label-free quantification, LFQ)蛋白质组学分析的基础上,筛选并验证具有调控T细胞免疫应答功能的硫氧还蛋白过氧化物酶(thioredoxin peroxidase, TPx)... 详细信息

目的在对猪囊尾蚴及其排泄分泌抗原(excretory secretory antigen, ESA)非标定量(label-free quantification, LFQ)蛋白质组学分析的基础上,筛选并验证具有调控T细胞免疫应答功能的硫氧还蛋白过氧化物酶(thioredoxin peroxidase, TPx)蛋白,预测TPx蛋白的亲水性和T细胞抗原表位并进行真核表达。方法对猪囊尾蚴ESA差异蛋白进行基因本体论(gene ontology, GO)富集和生物学功能注释,筛选TPx蛋白。运用平行反应监测技术(parallel reaction monitoring, PRM)验证TPx蛋白。运用Kyte&Doolittle法预测TPx蛋白的亲水性,运用Propred软件预测TPx蛋白T细胞抗原表位。采用基于PCR准确合成(PCR-based accurate synthesis, PAS)方法,全基因合成TPx抗原编码基因并克隆至pcDNA3.4载体,构建重组质粒pcDNA3.4-TPx,转染至HEK293细胞,表达和纯化TPx蛋白。结果根据GO富集和生物学功能注释,筛选出差异表达量最大的TPx蛋白。TPx蛋白经PRM验证,LFQ蛋白质组学与靶向蛋白质组学对TPx蛋白表达量的趋势一致。预测该蛋白为亲水性蛋白,且含有多个可能的优势T淋巴细胞抗原表位。重组质粒pcDNA3.4-TPx构建正确,经SDS-PAGE电泳分析和Western blot鉴定,在细胞培养上清获得相对分子质量约为26×10^(3)的TPx蛋白,且纯化后带有His标签的TPx重组蛋白能被抗His单克隆抗体识别。结论成功实现了对猪囊尾蚴ESA中TPx蛋白的筛选、验证、T细胞抗原表位预测和真核表达,且表达的TPx蛋白具有反应原性,为该蛋白的进一步研究奠定了基础。

关键词：猪囊尾蚴排泄分泌抗原硫氧还蛋白过氧化物酶抗原表位预测真核表达

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