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第10届全国实验血液学会议

作者：陈赛娟上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室

近20年来,上海血液学研究所应用全反式维甲酸(ATRA)作为分化诱导剂治疗急性早幼粒细胞性白血病(APL)获得了重大突破,使肿瘤细胞逆转的设想从理论走向实践,也使ATRA治疗APL成为肿瘤诱导分化疗法最成功的典范。分子研究阐明ATRA与As2O3的... 详细信息

近20年来,上海血液学研究所应用全反式维甲酸(ATRA)作为分化诱导剂治疗急性早幼粒细胞性白血病(APL)获得了重大突破,使肿瘤细胞逆转的设想从理论走向实践,也使ATRA治疗APL成为肿瘤诱导分化疗法最成功的典范。分子研究阐明ATRA与As2O3的作用靶点均为异常转录因子 PML-RARα,但前者通过针对RARα受体,后者通过PML SUMO化后使PML-RARα致病蛋白发生降解,进而诱导APL细胞分化或凋亡。由于ATRA和As2O3作用途径不同且无交叉耐药,最近本研究组对初发APL进行了联合用药的随机临床试验,结果显示,在随访18个月后,20例接受ATRA

关键词：白血病靶向治疗基因产物

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SH3BGRL3:一个APL中维甲酸调节基因的NMR结构及其表达研究

SH3BGRL3:一个APL中维甲酸调节基因的NMR结构及其表达研究

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第10届全国实验血液学会议

作者：张露沈树红许超郑培烝郜恒骏施蕴渝张庆华上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室中国科技大学生命科学学院上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室生物芯片上海国家工程研究中心中国科技大学生命科学学院上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室

全反式维甲酸(all trans retinoic acid ATRA)是目前治疗急性早幼粒细胞性白血病(acute prome olocytic leukemia APL)的首选药物。它可以诱导APL细胞的分化及抑制白血病细胞的增殖。已知 ATRA对参与白血病细胞分化的许多基因起调节作用... 详细信息

全反式维甲酸(all trans retinoic acid ATRA)是目前治疗急性早幼粒细胞性白血病(acute prome olocytic leukemia APL)的首选药物。它可以诱导APL细胞的分化及抑制白血病细胞的增殖。已知 ATRA对参与白血病细胞分化的许多基因起调节作用,但对基因调控网络的作用机制还不十分清楚。是硫氧还蛋白(TRX)超家族的新成员。我们在运用基因表达谱芯片技术研究维甲酸对APL细胞基因表达调控网络研究中,发现了SH3BGRL3(SH3 domain binding glutamic acid-rich like 3)基因

关键词：维甲酸 APL 急性早幼粒细胞性白血病 SH3BGRL3 NMR

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差异表达甲胎蛋白肝细胞肝癌的亚细胞比较蛋白质组学研究

差异表达甲胎蛋白肝细胞肝癌的亚细胞比较蛋白质组学研究

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中国蛋白质组学第三届学术大会

作者：孙玉琳赵慧楠王英何洪智张养军周兰萍黄颖锋刘芳钱小红赵晓航医学基因组学国家重点实验室上海血液学研究所瑞金医院上海第二医科大学军事医学科学院放射医学研究所

目的:肝细胞肝癌是我国第二种常见恶性肿瘤,其恶性程度高、预后差,因此早期诊断和筛查具有重要意义。α-甲胎蛋白(α-AFP)是胚胎期最重要的血清蛋白之一,它参与细胞基因表达调控、增生、分化和凋亡等重要的生理过程,出生后,其表达水平... 详细信息

目的:肝细胞肝癌是我国第二种常见恶性肿瘤,其恶性程度高、预后差,因此早期诊断和筛查具有重要意义。α-甲胎蛋白(α-AFP)是胚胎期最重要的血清蛋白之一,它参与细胞基因表达调控、增生、分化和凋亡等重要的生理过程,出生后,其表达水平迅速下降乃至消失。成人血浆中AFP浓度升高往往与多种肝脏疾病有关,目前,血浆中AFP水平广泛用于肝细胞肝癌(hepatocellular cavcinoma,HCC)的筛查和诊断,但仍有20-30%的HCC患者血清AFP水平并不升高,由此可见,临床上迫切需要找到更为敏感、特异的,能与AFP联用从而提高HCC诊断灵敏度和特异度的肿瘤标志

关键词：肝细胞肝癌甲胎蛋白 AFP 比较蛋白质组学差异表达

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在转录组和蛋白质组水平对维甲酸/三氧化二砷诱导早幼粒细胞性白血病细胞分化/凋亡的系统研究

在转录组和蛋白质组水平对维甲酸/三氧化二砷诱导早幼粒细胞性白...

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中国蛋白质组学第三届学术大会

作者：张群业张小伟鲁静黄秋花郑培烝张济陈赛娟陈竺医学基因组学国家重点实验室上海血液学研究所瑞金医院上海第二医科大学中科院上海生命科学院健康中心

肿瘤细胞对于有效的治疗药物的反应是十分复杂的,要充分理解这种反应的复杂性和动力学就必须要求有高通量、假设驱动的能够在时间和空间水平对蛋白质和基因进行定量研究的方法。在临床上,维甲酸和三氧化二砷联合应用对于治疗急性早幼粒... 详细信息

肿瘤细胞对于有效的治疗药物的反应是十分复杂的,要充分理解这种反应的复杂性和动力学就必须要求有高通量、假设驱动的能够在时间和空间水平对蛋白质和基因进行定量研究的方法。在临床上,维甲酸和三氧化二砷联合应用对于治疗急性早幼粒细胞性白血病有很强的协同增效作用,可以使大多数经过常规化疗后的病人获得很高质量的无病生存。为了揭示这一现象的机制,更加深入的理解维甲酸和三氧化二砷单独和联合治疗作用所涉及的调控网络的变化,我们综合使用cDNA芯片,

关键词：三氧化二砷联合治疗早幼粒细胞性白血病维甲酸细胞分化

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全反式维甲酸诱导NB4细胞分化蛋白组中蛋白修饰及Isoforms变化的初步研究

全反式维甲酸诱导NB4细胞分化蛋白组中蛋白修饰及Isoforms变化的...

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中国蛋白质组学第三届学术大会

作者：张小伟张群业鲁静黄秋花上海第二医科大学瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室中科院上海生命科学院健康中心

蛋白质修饰是体内蛋白质功能重要的调控方式,包括蛋白质的磷酸化,糖基化,SUMO化等。细胞接受内外刺激后,可以直接通过蛋白质的修饰,使蛋白迅速活化或失活,界导生物学反应。蛋白Isoforms是基因组中同一个基因转录后的不同剪切本或转录时... 详细信息

蛋白质修饰是体内蛋白质功能重要的调控方式,包括蛋白质的磷酸化,糖基化,SUMO化等。细胞接受内外刺激后,可以直接通过蛋白质的修饰,使蛋白迅速活化或失活,界导生物学反应。蛋白Isoforms是基因组中同一个基因转录后的不同剪切本或转录时应用了不同的启动子的蛋白质。研究表明40%—79%人类基因具有不同的mRNA转录。蛋白的修饰以及蛋白的Isoforms在细胞的生长、分化、增殖、调亡的过程中发生动态的时空特异的调变过程。我们应用2D凝胶电泳对全反式维甲酸诱导急性早幼粒细胞白血病NB4细胞株分化进行蛋白组研究,对差异表达蛋白进行质谱鉴定,数据

关键词：全反式维甲酸 NB4 Isoforms 细胞分化初步研究

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小鼠造血组织卵黄囊与胎肝的基因表达谱初步研究

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中华血液学杂志 2004年第5期25卷 266-268页

作者：周隽张庆华王龙房静王海红陈赛娟陈竺上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室200025

目的　以C5 7BL/6小鼠胚胎期造血组织卵黄囊与胎肝为对象 ,识别在不同的发育阶段c kit+ 与Sca 1 + 早期造血细胞的变化 ,以及在基因表达水平上的主要特点 ,了解造血组织在原始造血向永久造血转移阶段造血能力变化的机制。方法　用流式... 详细信息

目的　以C5 7BL/6小鼠胚胎期造血组织卵黄囊与胎肝为对象 ,识别在不同的发育阶段c kit+ 与Sca 1 + 早期造血细胞的变化 ,以及在基因表达水平上的主要特点 ,了解造血组织在原始造血向永久造血转移阶段造血能力变化的机制。方法　用流式细胞仪计数分离到的单个细胞中c kit+ 与Sca 1 + 细胞的比例 ,以总RNA建立的cDNA文库通过随机测序的方法 ,识别这些细胞总体的基因表达情况。结果　随胚胎发育 ,卵黄囊和胎肝中的Sca 1 + 细胞比例逐步升高 ,交配后 9～ 1 2d卵黄囊Sca 1 + 细胞比例为 0 .2 4 %～ 2 .5 0 % ,而卵黄囊中c kit+ 细胞的比例有明显下降 ,交配后 9～ 1 2d卵黄囊c kit+ 细胞比例为 6 .1 0 %～ 1 .77% ;对交配后第 9天和第 1 2天的卵黄囊和交配后第 1 2天的胎肝 3个文库的部分基因测序 ,识别的已知功能基因显示表达量较高的基因为各型珠蛋白 ,且以胚胎型为主。结论　细胞表面标志和基因表达的水平测定显示胚胎期的红系造血相对较为活跃 ;

关键词：小鼠造血组织卵黄囊胎肝基因表达谱胎儿

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白血病致病基因产物靶向治疗:从急性早幼粒到其他类型白血病

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中国科学（C辑） 2004年第6期34卷 487-500页

作者：周光飚董颖王月英印彤亢卉陈竺陈赛娟上海第二医科大学附属瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室上海200025

近20年来,上海血液学研究所应用全反式维甲酸(ATRA)作为分化诱导剂治疗急性早幼粒细胞性白血病(APL)获得了重大突破,使肿瘤细胞逆转的设想从理论走向实践,也使ATRA治疗APL成为肿瘤诱导分化疗法最成功的典范.本研究组在国际上首先发现了... 详细信息

近20年来,上海血液学研究所应用全反式维甲酸(ATRA)作为分化诱导剂治疗急性早幼粒细胞性白血病(APL)获得了重大突破,使肿瘤细胞逆转的设想从理论走向实践,也使ATRA治疗APL成为肿瘤诱导分化疗法最成功的典范.本研究组在国际上首先发现了APL变异型染色体易位t(11;17)(q23;q21),并克隆了APL特异的染色体易位t(15;17),t(11;17)和t(5;17)所形成的PML-RARα,PLZF-RARα与NPM-RARα融合基因,建立了APL系列转基因小鼠,证实了其在白血病发病中的作用.核受体共抑制物(CoR)与PML-RARα形成的复合物受ATRA调控,而ATRA不能使PLZF-RARα与CoR形成的复合物发生解离,不仅从分子水平阐明了ATRA治疗APL疗效的差异,还开辟了针对细胞转录调控治疗的新途径.从1994年起,本研究组应用三氧化二砷(As2O3)治疗复发的APL取得成功,完全缓解率可达70%-80%,还发现As2O3对APL的治疗呈剂量依赖性的双重作用,即小剂量时诱导细胞发生部分分化,而较高剂量时诱导细胞凋亡.进一步研究发现,As2O3可使PML的第160位赖氨酸与泛素样SUMO-1结合,导致PML-RARα降解.虽然ATRA与As2O3的作用靶点均为异常转录因子PML-RARα,但前者通过针对RARα受体,后者通过PMLSUMO化后使PML-RARα致病蛋白发生降解,进而诱导APL细胞分化或凋亡.由于ATRA和As2O3作用途径?

关键词：治疗 ATRA APL As2O3 白血病复发致病基因酶活性发生赖氨酸

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ATRA诱导上调基因RIG-C的cDNA克隆和序列分析及蛋白表达

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上海第二医科大学学报 2004年第2期24卷 77-80页

作者：印彤黄秋花张吉旺熊慧张庆华上海第二医科大学瑞金医院上海血液学研究所医学基因组学国家重点实验室上海200025

目的克隆和表达维甲酸诱导上调的新基因RIG-C。方法运用Blast、pfam等生物信息学手段对RIG-C的全长cDNA序列进行结构与功能预测;将RIG-C全长阅读框架插入原核表达载体pET22b中,在JM109(DE3)菌株中进行诱导表达;将全长RIG-C插入真核表... 详细信息

目的克隆和表达维甲酸诱导上调的新基因RIG-C。方法运用Blast、pfam等生物信息学手段对RIG-C的全长cDNA序列进行结构与功能预测;将RIG-C全长阅读框架插入原核表达载体pET22b中,在JM109(DE3)菌株中进行诱导表达;将全长RIG-C插入真核表达的绿荧光蛋白载体pEGFP-C1中,转染NIH3T3细胞以观察RIG-C的亚细胞定位。结果 RIG-C基因cDNA全长1266 bp,编码421个氨基酸,N端具有多个WD40结构域,C端有一个SOCS家族典型结构。原核表达的RIG-C蛋白大小约45 kd,NIH 3T3细胞表达的RIG-C定位于细胞浆。结论克隆和表达了新基因RIG-C,为进一步研究其生物学功能和蛋白质的空间结构奠定了基础。

关键词： ATRA 诱导上调基因 RIG-C cDNA 克隆序列分析蛋白表达

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基因芯片技术及其应用现状的浅思

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中华内分泌代谢杂志 2004年第6期20卷 487-489页

作者：宋怀东上海第二医科大学附属瑞金医院医学基因组学国家重点实验室上海市内分泌代谢病研究所200025

基因芯片技术是一种新近发展的新技术 ,在许多不同领域里都有广泛的应用 ,用基因芯片作为基本技术进行内分泌临床与基础研究的论文也日益增多 ,但基因芯片应用的本身仍存在一些问题 ,如样品的制备和处理 ,芯片结果的分析等。本文主要就... 详细信息

基因芯片技术是一种新近发展的新技术 ,在许多不同领域里都有广泛的应用 ,用基因芯片作为基本技术进行内分泌临床与基础研究的论文也日益增多 ,但基因芯片应用的本身仍存在一些问题 ,如样品的制备和处理 ,芯片结果的分析等。本文主要就芯片的应用及其局限性等方面进行分析 ,并进一步探讨如何解决这些问题。

关键词：基因芯片技术内分泌科学寡核苷酸序列分析基因组测序

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CPP-SOM整合cDNA基因芯片平台的建立

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中华医学遗传学杂志 2004年第5期21卷 422-425页

作者：郑培烝赵春军杜艳芝陈赛娟陈竺张济张庆华王侃侃上海第二医科大学附属瑞金医院医学基因组学国家重点实验室上海血液学研究所福建医科大学附属协和医院200025 福建医科大学附属协和医院

目的　在转录组水平全面迅速地了解疾病发生和药物作用的分子机理 ,以及寻找潜在的治疗靶标。方法　通过建立基因芯片平台 ,用全反式维甲酸诱导急性早幼粒细胞白血病来源的 NB4细胞分化作为模型 ,并应用自主开发的自组织图结合成分平面... 详细信息

目的　在转录组水平全面迅速地了解疾病发生和药物作用的分子机理 ,以及寻找潜在的治疗靶标。方法　通过建立基因芯片平台 ,用全反式维甲酸诱导急性早幼粒细胞白血病来源的 NB4细胞分化作为模型 ,并应用自主开发的自组织图结合成分平面展示 (componentplane presentation integrated self-organizing map,CPP- SOM)的方法对数据进行初步分析。结果　建立的 c DNA芯片共有 12 6 30条克隆 ,其中已知基因 94 36条。应用该芯片进行实验 ,结果重复性好、准确性高。CPP- SOM不仅可以将功能相关的基因进行聚类 ,而且可以动态性地从全基因组水平观察药物作用过程中基因的表达变化。结论　我们建立的芯片平台是稳定、可靠的技术平台 ,CPP- SOM是一种新型有效的芯片数据的处理方法。

关键词： CPP-SOM 整合cDNA 基因芯片自组织图成分平面展示

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