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引起2017年兰州市一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的CV-A2的基因特征分析

病毒学报 2024年第3期40卷 574-579页

作者：陈建华于德山武海卓赵哲赵晓虹张勇张晓曙甘肃省疾病预防控制中心甘肃省传染病病原学重点实验室兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法... 详细信息

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法进行肠道病毒型别鉴定。根据VP1区核苷酸差异选择3个毒株进行二代测序,获取全基因组序列。使用MEGA软件(版本号11.0)进行病毒的核苷酸,氨基酸相似性分析,VP1区的氨基酸突变位点分析,并构建系统发育树,使用Simplot(版本号3.5.1)软件进行病毒重组分析。本次疫情中分离到的毒株鉴定为柯萨奇病毒A2型(Coxsackievirus A 2, CV-A2),分子分型显示属于D基因型,且VP1区第102位氨基酸发生了丙氨酸到甘氨酸(A102G)的突变,与省内2014-2015年分离到的两株CV-A2毒株在该位置的突变不同。重组分析发现,病毒在P2区和P3区发生了以CV-A4为主的重组事件。本次疫情的致病病原体CV-A2存在着VP1区氨基酸A102G的特征性变异及P2区和P3区的重组,需要加强对肠道病毒的变异和重组的监测和研究,以提升预警能力。

关键词：疱疹性咽峡炎柯萨奇病毒A2型基因组特征性突变重组变异分子流行病学

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广东省2020年首次报道E基因型柯萨奇病毒B组3型的鉴定及基因特征分析

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病毒学报 2022年第1期38卷 57-63页

作者：杨倩曾汉日郑焕英严冬梅祝双利宋洋王东艳韩振志李冀琛张勇许文波世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生和健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 广东省疾病预防控制中心广州511430 潍坊医学院医学微生物教研室潍坊261053

柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)是肠道病毒中流行较为广泛的血清型之一,在全球多个国家和地区曾报道儿童急性心肌炎、无菌性脑膜炎、手足口病等的暴发流行,严重威胁儿童健康和公共卫生安全。本研究对广东省2020年手足口病患... 详细信息

柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)是肠道病毒中流行较为广泛的血清型之一,在全球多个国家和地区曾报道儿童急性心肌炎、无菌性脑膜炎、手足口病等的暴发流行,严重威胁儿童健康和公共卫生安全。本研究对广东省2020年手足口病患者标本中分离到的8株CVB3进行基因特征和进化分析,结果显示分离到的8株CVB3 VP1区核苷酸序列相似性为98.2%~99.5%,与原型株Nancy的核苷酸序列相似性在77.9%~78.5%之间,与其他CVB3中国大陆流行株的核苷酸序列相似性为79.6%~82.2%。8株CVB3均为E基因型,为广东省首次报道。8株CVB3分离株在进化树上聚集,提示病毒发生了局部传播。全基因组序列分析提示2株广东CVB3分离株在非结构蛋白区有重组现象的发生。本研究为E基因型CVB3在我国的流行传播和疾病防控提供基础资料。

关键词：柯萨奇病毒B组3型基因特征手足口病 E基因型

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中国内地地区埃可病毒25型全基因组进化与重组分析

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病毒学报 2023年第4期39卷 1008-1016页

作者：王晓艺李世康寸建萍施勇刘莹莹卫海燕张勇王雯慧肖金波宋洋严冬梅杨倩孙强冀天娇许文波安徽理工大学医学院淮南232001 世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生和健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 湖南省疾病预防控制中心长沙410005 云南省疾病预防控制中心昆明650100 江西省疾病控制预防中心南昌330006 河北省疾病预防控制中心石家庄050000 河南省疾病预防控制中心郑州450000 山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院济南250117

埃可病毒25型(Echovirus 25,E25)属于肠道病毒B组(Enterovirus B,EV⁃B),其在临床上可引起包括手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD),无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM),急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)等在内的多种疾病。本文从全国HFMD监测网络选取了2009⁃2018年的18株E25毒株进行全基因组测序,将所得全长序列及GenBank上目前已发表的E25全长序列,以及EV⁃B组其它原型株全长序列分别构建全基因组和各编码区的亲缘进化树,并依据不同进化分支选取具有代表性的两株E25毒株进行重组分析。结果显示,中国内地地区E25在P1区具有更高的亲缘关系,而P2和P3区建树中各出现了两个分支,且在每个分支上,与多个EV⁃B组的原型株具有较高的核苷酸同源性,提示E25可能存在多种重组模式。此外所选的两株毒株均与EV⁃B的其它血清型流行株在P2及P3不同区域发生重组,且重组的模式不相同,因此中国内地地区的E25至少存在两种重组模式,并且致病力可能与基因的重组有关。通过本研究的分析,进一步的揭示中国内地地区E25的重组特征,对其进化变异及后续的预防与治疗具有重要意义。

关键词：埃可病毒25型全基因组基因重组

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广州市生活污水中埃可病毒11型循环动态变化及基因特征分析

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病毒学报 2022年第5期38卷 1108-1116页

作者：黄淑芬张薇陈美钟郭雪祝双利李彩霞曾汉日方苓张勇郑焕英邓小玲南方医科大学公共卫生学院广州510515 广东省疾病预防控制中心广东新发突发传染病防治工作站广州511430 世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021... 详细信息

埃可病毒11型(Echovirus 11,E11)属于B组肠道病毒,是最常见的人类肠道病毒(Enterovirus,EV)之一,是引起无菌性脑膜炎,新生儿感染的重要病原体之一。为探讨广州市生活污水监测中E11分离株循环动态变化及其基因组特征,本研究对2009-2021年广州市生活污水EV监测获得的E11分离株进行VP1区基因扩增及测序,结合2019年广东省发生的两起E11新生儿感染事件及部分散发病例中获得的E11分离株,与全球E11参考株进行序列相似性分析和系统发生学分析。结果显示,2009-2021年生活污水EV监测中E11分离株的核苷酸及氨基酸相似性分别为72.8%~99.3%和84.5%~99.6%。监测发现,广州市2018-2019年在污水中检出大量E11,与两起新生儿感染事件及散发病例的分离株核苷酸相似性高达96.2%~99.2%,但序列间仍存在差异,两起新生儿感染及散发病例感染的毒株为不同来源。通过系统进化树分析发现,2018-2019年污水E11分离株及两起新生儿感染与散发病例E11亲缘关系较近,分子分型结果均为E11 D5基因型。2017年及以前的污水分离株以A1基因型为主,但也有C3和D5基因型,2018年开始则以D5基因型为主,与同时期EV感染病例基因型结果一致。而在2021年污水中则发现了E11 E基因型,但广州暂未有该基因型的感染病例报道,仍需持续进行病例和环境监测。结果表明,生活污水监测能够及时反映EV在环境和人群中的循环动态变化,对EV引起的相关疾病起到预测预警作用。

关键词：埃可病毒11型污水监测基因特征循环动态变化

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中国2017-2019年<15岁儿童急性弛缓性麻痹病例监测

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中国疫苗和免疫 2021年第2期27卷 152-156,172页

作者：杨宏樊春祥祝双利王富珍李媛秋唐林温宁中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室/世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206

目的评价中国2017-2019年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测质量和维持无脊髓灰质炎(脊灰)状态。方法通过中国AFP病例监测信息管理系统收集2017-2019年AFP病例信息,进行描述性流行病学分析。结果中国2017年、2018年... 详细信息

目的评价中国2017-2019年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测质量和维持无脊髓灰质炎(脊灰)状态。方法通过中国AFP病例监测信息管理系统收集2017-2019年AFP病例信息,进行描述性流行病学分析。结果中国2017年、2018年和2019年<15岁儿童非脊灰AFP病例报告发生率分别为2.33/10万(5278例)、2.31/10万(5292例)和2.23/10万(5183例),合格粪便标本采集率分别为92.71%、92.10%和92.34%。各年AFP病例中脊灰疫苗全程免疫分别占93.99%、95.63%和95.76%。2017-2019年未检出脊灰野病毒。2017年河南省和山东省、2018年江苏省、2019年四川省和吉林省检出疫苗衍生脊灰病毒。结论中国2017-2019年AFP病例监测系统保持高质量运转,继续维持无脊灰状态。

关键词：脊髓灰质炎急性弛缓性麻痹监测

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2023年河南省急性弛缓性麻痹病例中非脊髓灰质炎肠道病毒病原学及流行病学分析

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病毒学报 2025年第3期 634-644页

作者：杨建辉张明瑜张璐豆巧华白祎然马雅婷郭永豪张勇河南省疾病预防控制中心河南省免疫预防医学重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室

为了解2023年河南省急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中非脊髓灰质炎肠道病毒（Nonpolio enterovirus,NPEV）的病原学及流行病学特征，为AFP的防控以及治疗提供理论支持。本研究采集2023年报告的AFP病例双份粪便标本... 详细信息

为了解2023年河南省急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）病例中非脊髓灰质炎肠道病毒（Nonpolio enterovirus,NPEV）的病原学及流行病学特征，为AFP的防控以及治疗提供理论支持。本研究采集2023年报告的AFP病例双份粪便标本进行病毒分离培养，对检出的NPEV毒株VP1区进行核苷酸序列测定和分析，使用mafft v7.526和MEGA 5.1软件对序列进行比对和遗传进化分析。使用SPSS 26软件对数据进行统计分析。结果显示2023年河南省报告706例AFP病例，报告发病率为3.13/10万，共检出25株NPEV，检出率为3.54%(25/706），其中20株为A组肠道病毒（Enterovirus A,EV-A），占比为80%,5株为B组肠道病毒（Enterovirus B,EV-B），占比为20.00%，未检出C组和D组肠道病毒。EV-A中共有6个血清型，其中柯萨奇病毒A4(Coxsackievirus,CVA4）检出数最多（均为C基因型），检出率为35.00%(7/20），其次为CVA10（均为C基因型），检出率为30.00%(6/20),EV-B均为CVB2（均为D基因型），三种血清型均与手足口病例中检出的的毒株关系较近。不同人群之中，3～5岁组AFP病例报告率最高，为30.45%(215/706),0～2岁组中NPEV检出率最高，为5.46%(10/183），男女发病数比为1.37:1，不同性别之间NPEV检出率差异无统计学意义（P>0.05）。在地区分布上，EV-A分布最为广泛，其中CVA4主要分布在豫北、豫中和豫西，CVA10主要分布在豫北、豫中和豫南，EV-B主要分布在豫东和豫南。在时间分布上，夏秋两季检出率较高，冬春季检出率相对较低，其中EV-A呈现双峰，最高峰出现在10月份，EV-B主要发生在6-8月份。以上结果表明，2023年河南省分离的NPEV以EV-A中的CVA4和CVA10为主要血清型，且分布最为广泛，相比往年以EV-B为主要血清型发生了显著变化，后期应继续对NPEV进行监测，为NPEV可能引起的疾病的暴发流行预测预警提供基线数据。

关键词：急性弛缓性麻痹非脊髓灰质炎肠道病毒病原学特征

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柯萨奇病毒A组2型江苏分离株(JS16-80)全基因组序列分析

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病毒学报 2018年第5期34卷 512-518页

作者：杨倩严冬梅张勇樊欢嵇红冀天娇宋洋许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206 江苏省疾病预防控制中心南京210009

柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS... 详细信息

柯萨奇病毒A组2型(CV-A2)是引起手足口病和疱疹性咽峡炎暴发流行的重要病原体。本文选取中国大陆流行的D基因型代表毒株JS16-80/JS/CHN/2016(简写JS16-80)进行全基因组序列测定和分析,了解其基因特征,并进行重组和进化分析。结果提示,JS16-80在非结构蛋白P2和P3多区段均有出现重组现象,并且多个A组肠道病毒血清型参与了非结构蛋白的重组。本研究可帮助了解CV-A2的全基因组特征和重组特点,进一步为CV-A2重组对其进化和潜在致病力的影响提供基础数据。

关键词：手足口病(HFMD) 柯萨奇病毒A组2型(CV-A2) 全基因组序列基因重组

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中国2016年急性弛缓性麻痹病例监测分析

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中国疫苗和免疫 2018年第2期24卷 160-164页

作者：樊春祥杨宏温宁祝双利苏琪茹马超郝利新尹遵栋王华庆中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生和计划生育委员会-医学病毒学和病毒病重点实验室、世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206

目的分析2016年中国（未包括中国香港特别行政区、澳门特别行政区和台湾）急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）监测质量。方法使用描述流行病学方法对通过中国AFP病例监测信息报告管理系统报告的2016年全国AFP病例数据进行... 详细信息

目的分析2016年中国（未包括中国香港特别行政区、澳门特别行政区和台湾）急性弛缓性麻痹（Acute flaccid paralysis,AFP）监测质量。方法使用描述流行病学方法对通过中国AFP病例监测信息报告管理系统报告的2016年全国AFP病例数据进行分析。结果 2016年中国共报告5 691例〈15岁儿童非脊髓灰质炎（脊灰）AFP病例,报告发病率为2.52/10万。AFP病例报告后48h内调查率为99.63%,合格粪便标本采集率为91.90%,粪便标本7d内送达率为97.68%,省级脊灰实验室粪便标本分离结果 14d内反馈率为95.49%。结论 2016年中国AFP监测仍然保持较高质量,国家级监测敏感性和及时性符合维持无脊灰状态的要求。

关键词：急性弛缓性麻痹监测

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中国2014年脊髓灰质炎实验室网络的运转与评价

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中国疫苗和免疫 2017年第1期23卷 1-7页

作者：祝双利朱晖范钦张勇王东艳严冬梅李晓嫘樊春祥许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生和计划生育委员会医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206 中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050

目的评价中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2014年脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(Polio Laboratory Network,PLN)运转情况,为中国维持无脊灰状态提供病毒学依据。方法对中国急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)... 详细信息

目的评价中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2014年脊髓灰质炎(脊灰)实验室网络(Polio Laboratory Network,PLN)运转情况,为中国维持无脊灰状态提供病毒学依据。方法对中国急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测信息报告管理系统中31个省份报告的AFP病例和国家脊灰实验室(National Polio Laboratory,NPL)的监测数据进行分析,对PLN的各项运转指标进行评价。结果 2014年中国PLN共报告5 751例AFP病例,收到5 688例AFP病例的11 363份粪便标本;14天内双份粪便标本的采集率为92.16%,合格粪便标本采集率为91.65%,病毒分离结果 18天内反馈率为97.62%。从5 688例粪便标本中132例(2.32%)分离到脊灰病毒(Poliovirus,PV);590例(10.37%)分离到非脊灰肠道病毒(NPEV)。2014年NPL收到省级脊灰实验室送检的分离自AFP病例及其接触者、非AFP病例、健康人的292株L20 B细胞阳性分离物,262株为PV,21株为NPEV,9株为非肠道病毒(Non-enterovirus,NEV)。262株PV中,7株为疫苗衍生脊灰病毒(Vaccine-derived poliovirus,VDPV),来自内蒙古、山西、河北和湖南;未发现脊灰野病毒(Wild poliovirus,WPV)。从脊灰病毒外环境监测采集的污水标本中分离到4株VDPV。2014年NPL和31个省级CDC脊灰实验室都通过了世界卫生组织(WHO)粪便标本肠道病毒的新检测流程的能力验证标本考核。NPL和8个省级CDC脊灰实验室接受并通过了WHO现场评估认证,其他省级实验室接受了信函认证。结论中国PLN 2014年运转正常,未发现WPV,为维持中国无脊灰状态、早期发现VDPV或VDPV病例、早期采取应对措施阻断其传播提供了重要的病毒学依据。

关键词：脊髓灰质炎网络运转脊髓灰质炎病毒,疫苗衍生脊髓灰质炎病毒

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中国2014-2015年急性弛缓性麻痹病例监测信息报告管理系统数据分析

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中国疫苗和免疫 2017年第2期23卷 121-126页

作者：樊春祥杨宏温宁苏琪茹马超郝利新祝双利王华庆中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生和计划生育委员会医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206

目的评价中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)2014年和2015年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测信息报告管理系统(AFP Surveillance Information Reporting and Management System,AFPSIRMS)运转质量。方法采用描述流行病学方法分析通过AFPSIRMS收集的2014年和2015年AFP病例数据。结果中国2014年和2015年通过AFPSIRMS收集的AFP病例数分别为5 758例和5 217例,<15岁儿童非脊髓灰质炎(脊灰)AFP病例报告发病率分别为2.56/10万和2.31/10万,AFP病例报告后48h内调查率均为99%,合格粪便标本采集率均为92%,粪便标本7d内送达率均为97%,2014年省级疾病预防控制中心(CDC)脊灰实验室粪便标本分离结果 18d内反馈率为97%,2015年省级CDC脊灰实验室粪便标本分离结果 14d内反馈率为96%。结论中国2014年和2015年AFPSIRMS保持较高质量运转,各项国家级监测指标均达到维持无脊灰的要求。

关键词：急性弛缓性麻痹病例监测信息报告管理系统数据分析

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