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遗传 2021年第1期43卷 4-15页

作者：徐海冬宁博林牟芳李辉王宁农业农村部鸡遗传育种重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室哈尔滨150030 东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

真核生物基因的前体mRNA(pre-mRNA)及一些lncRNA在成熟过程中其3'端会发生剪切和多聚腺苷酸化反应(cleavage and polyadenylation, C/P),C/P的发生需要多聚腺苷酸化信号(polyadenylation signal, PAS)的存在。选择性多聚腺苷酸化(al... 详细信息

真核生物基因的前体mRNA(pre-mRNA)及一些lncRNA在成熟过程中其3'端会发生剪切和多聚腺苷酸化反应(cleavage and polyadenylation, C/P),C/P的发生需要多聚腺苷酸化信号(polyadenylation signal, PAS)的存在。选择性多聚腺苷酸化(alternative cleavage and polyadenylation, APA)是指具有多个PAS的基因,在其mRNA3'端成熟过程中,由于选择不同的PAS,导致产生出多个3'UTR长度和序列组成不同的转录异构体。3'UTR长度和序列的不同会影响mRNA的稳定性、翻译效率、运输和细胞定位等,因此APA是真核生物的一个重要转录后调控方式。近年来,对大量动物、植物及酵母的基因组测序分析发现,APA在真核生物广泛存在,针对APA的生物学效应和调控机制开展了一系列研究。目前已鉴定出许多APA调控的顺式调控元件和反式作用因子。本文重点介绍了APA生物学效应和调控机制的最新研究进展,并探讨了未来APA调控的研究方向。

关键词：基因表达调控选择性多聚腺苷酸化多聚腺苷酸化信号顺式调控元件反式作用因子

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鸡脂肪细胞因子NRG4基因的克隆、表达及启动子分析

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农业生物技术学报 2021年第11期29卷 2129-2138页

作者：郭亚琦王伟佳高智慧牟芳徐海冬李辉王宁农业农村部鸡遗传育种重点实验室黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室东北农业大学动物科学技术学院

神经调节蛋白4 (neuregulin-4, NRG4)是在哺乳动物棕色脂肪组织高度表达的一个细胞因子。NRG4激活ErbB4信号通路参与调控能量平衡和糖脂代谢等。由于鸡(Gallus domesticus)缺乏棕色脂肪组织,目前鸡NRG4的组织表达和功能还不清楚。本研... 详细信息

神经调节蛋白4 (neuregulin-4, NRG4)是在哺乳动物棕色脂肪组织高度表达的一个细胞因子。NRG4激活ErbB4信号通路参与调控能量平衡和糖脂代谢等。由于鸡(Gallus domesticus)缺乏棕色脂肪组织,目前鸡NRG4的组织表达和功能还不清楚。本研究以鸡脂肪组织cDNA为模板,PCR扩增了NRG4基因全长编码区序列,构建了NRG4真核表达载体;以东北农业大学高、低脂双向选择品系肉鸡(NEAUHLF)为实验材料,采用qPCR方法开展了高、低脂系肉鸡NRG4基因的组织表达谱分析;以基因组DNA为模板,PCR扩增了鸡NRG4基因的4个启动子区片段,构建了其启动子报告基因载体,并进行了启动子片段的活性分析。结果显示,鸡NRG4基因编码一个由112个氨基酸组成的蛋白,鸡与人(Homo sapiens)和小鼠(Mus musculus) NRG4氨基酸序列的相似度均较低,分别为57.76%和52.59%。组织表达谱分析显示,鸡NRG4基因在多种组织中表达,其中在肾脏的表达量最高,而在脾脏的表达量最低。高、低脂系肉鸡脂肪组织表达差异分析显示,NRG4基因在高脂系肉鸡嗉囊周围脂肪组织、腹部脂肪组织及肌胃周围脂肪组织中的表达水平都显著高于低脂系肉鸡(P<0.01或P<0.05)。生物信息学分析结果表明,鸡与人和小鼠NRG4基因启动子序列的相似度都很低,但均存在PPARγ和C/EBPα结合位点。启动子报告基因活性检测结果显示,与pGL3-basic空载体相比,NRG4启动子报告基因载体pGL3-NRG4 (-2854/-2076)、pGL3-NRG4 (-1451/+117)均具有较强启动子活性(P<0.01或P<0.05)。本研究为进一步开展鸡NRG4基因在鸡脂肪生成和脂肪组织发育中作用和机制的研究奠定了基础。

关键词：鸡神经调节蛋白4 (NRG4) 脂肪组织基因表达启动子分析

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鸡载脂蛋白A1基因外显子区影响体脂性状的功能性SNP预测

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养禽与禽病防治 2023年第6期 31-37页

作者：王梦蝶袁萌王守志农业农村部鸡遗传育种重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室哈尔滨150030 东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

载脂蛋白A1基因(APOA1)在动物体脂代谢中发挥重要作用。本研究旨在利用生物信息学的方法筛选鸡APOA1基因中具有潜在生物学作用的非同义突变单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)位点,为利用分子标记... 详细信息

载脂蛋白A1基因(APOA1)在动物体脂代谢中发挥重要作用。本研究旨在利用生物信息学的方法筛选鸡APOA1基因中具有潜在生物学作用的非同义突变单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)位点,为利用分子标记辅助选择技术开展鸡体脂性状遗传改良提供理论参考。本研究从dbSNP数据库中提取APOA1基因12个nsSNPs,利用4种生物信息学预测软件(SIFT、PolyPhen-2、SNAP和PhD-SNP)预测其是否为功能性SNPs;使用I-Mutant3.0和MUpro软件分析突变位点氨基酸的稳定性,并对APOA1基因编码的氨基酸序列进行多序列对比和位点保守性预测;最后使用SOPMA和SWISS-MODEL软件预测nsSNPs突变前后蛋白质的二级结构和三级结构的变化。结果表明,V179G(rs732849555)突变位点影响鸡APOA1蛋白质的结构,可能是影响鸡体脂性状的重要功能性SNPs。

关键词：鸡APOA1基因 SNP功能预测生物勿信息学

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高、低脂系肉鸡饲料转化效率与消化系统相关性研究

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东北农业大学学报 2021年第12期52卷 1-8页

作者：宿志勇姜海煦冷丽白雪李玉茂栾鹏李辉程博涵农业农村部鸡遗传育种重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室哈尔滨150030 东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第23世代鸡为试验材料,测定个体饲料转化效率及消化系统相关性状,比较高、低脂系肉鸡饲料转化效率及消化系统相关性状差异,估计上述测定性状遗传参数。测定结果表明,低脂... 详细信息

研究以东北农业大学肉鸡高、低腹脂双向选择品系(简称高、低脂系)第23世代鸡为试验材料,测定个体饲料转化效率及消化系统相关性状,比较高、低脂系肉鸡饲料转化效率及消化系统相关性状差异,估计上述测定性状遗传参数。测定结果表明,低脂系肉鸡饲料转化率(FCR)、剩余采食量(RFI)、十二指肠长度(DL)、空肠长度(JL)均显著低于高脂系(P<0.05),低脂系肉鸡回肠长度(IL)、直肠长度(RL)显著高于高脂系(P<0.05),其他性状差异不显著(P>0.05)。遗传力结果表明,腺肌胃重(GMSW)、JL、IL属于高遗传力性状(0.41≤h^(2)≤0.45),肝脏重(LW)和盲肠长度(CL)属于中等遗传力性状(h^(2)=0.36,0.35),DL和RL属于低遗传力性状(h^(2)=0.09,0)。遗传相关结果表明,FCR与GMSW和JL呈中等程度负遗传相关(r_(g)=-0.35,-0.37),FCR与IL和CL呈较低程度负遗传相关(r_(g)=-0.14,-0.12),FCR与DL呈中等程度正遗传相关(r_(g)=0.25),FCR与LW呈较低程度正遗传相关(r_(g)=0.07);RFI与GMSW呈较高程度负遗传相关(r_(g)=-0.46),RFI与JL呈中等程度负遗传相关(r_(g)=-0.32),RFI与IL、CL呈较低程度负遗传相关(r_(g)=-0.18,-0.10),RFI与LW、DL呈较低程度正遗传相关(r_(g)=0.14,0.14)。推测当选育提高肉鸡饲料转化效率,导致GMSW、JL、IL、CL升高,LW、DL下降。研究结果为完善肉鸡平衡育种体系提供参考依据。

关键词：肉鸡饲料转化效率消化系统遗传参数

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PLINs:参与脂解的脂滴相关蛋白

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东北农业大学学报 2021年第12期52卷 82-89,96页

作者：王宇祥邹亦冲王鑫雨刘捷庞永佳东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030 农业农村部鸡遗传育种重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室哈尔滨150030

脂滴广泛存在于多种组织和细胞中,是细胞内动态细胞器,参与调节机体脂质代谢和动态平衡。在脂滴磷脂单分子层上镶嵌着大量蛋白,称为脂滴相关蛋白,这些蛋白共同调节脂滴各种生理活动。脂滴包被蛋白(Perilipins,PLINs)是脂滴表面含量最多... 详细信息

脂滴广泛存在于多种组织和细胞中,是细胞内动态细胞器,参与调节机体脂质代谢和动态平衡。在脂滴磷脂单分子层上镶嵌着大量蛋白,称为脂滴相关蛋白,这些蛋白共同调节脂滴各种生理活动。脂滴包被蛋白(Perilipins,PLINs)是脂滴表面含量最多蛋白家族,其特异性表达于脂滴表面,充当脂滴表面骨架,并受多种转录因子调控。PLINs具有调节脂质代谢、充当脂滴表面活性剂、参与机体免疫等功能,并与多种脂类疾病相关,了解PLINs功能有助于深入研究脂质调节分子机制。文章从PLINs发现、结构功能、脂质调控等方面对国内外相关研究进展展开综述,为进一步研究PLINs提供参考。

关键词：脂滴相关蛋白 perilipins 脂解自噬

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脂滴包被蛋白的结构、功能及其与脂类疾病关联的研究进展

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中国畜牧杂志 2021年第6期57卷 59-67页

作者：庞永佳翟桂影李瑞李超王宇祥东北农业大学动物科学技术学院黑龙江哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室黑龙江哈尔滨150030 农业农村部鸡遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

脂滴包被蛋白(Perilipin,PLIN1)是PAT蛋白家族成员之一,其特异性地表达于脂滴表面,并受多种转录因子的调控。PLIN1在调控脂肪细胞基础脂解和激素刺激脂解的过程中发挥着重要作用,并且与Fsp27协同作用共同促进脂滴融合。此外,PLIN1还参... 详细信息

脂滴包被蛋白(Perilipin,PLIN1)是PAT蛋白家族成员之一,其特异性地表达于脂滴表面,并受多种转录因子的调控。PLIN1在调控脂肪细胞基础脂解和激素刺激脂解的过程中发挥着重要作用,并且与Fsp27协同作用共同促进脂滴融合。此外,PLIN1还参与机体能量代谢、炎症反应等生物学过程,与多种脂类疾病的发生和发展有重要联系。本文对PLIN1的命名、结构、表达调控、功能以及与相关疾病的关系进行综述,着重总结PLIN1发挥功能的分子机制,为PLIN1的深入研究提供参考。

关键词： PLIN1 脂解脂滴融合疾病

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黑龙江省鹅粪便处理状况分析

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现代畜牧科技 2024年第6期 106-108页

作者：马志刚董佳强依晓红杨坤霍明东黄宇翔王志强邹跃张红杨昊天吕明哲周景明魏念冬张慧陈志峰黑龙江省农业科学院畜牧兽医分院黑龙江齐齐哈尔161005 黑龙江省北大荒集团军川农场有限公司农业科技服务中心黑龙江鹤岗154100 农业农村部鸡遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室黑龙江哈尔滨150030 东北农业大学动物科学技术学院黑龙江哈尔滨150030

鹅粪便已经成为大鹅主产区周边畜禽粪便环境污染的主要来源之一,如果不对鹅粪便进行有效处理,会对当地的生态及人居环境造成影响。该文主要针对鹅粪便处理的目的、当前阶段黑龙江省鹅粪便处理的主要模式及在粪便处理过程中存在的主要问... 详细信息

鹅粪便已经成为大鹅主产区周边畜禽粪便环境污染的主要来源之一,如果不对鹅粪便进行有效处理,会对当地的生态及人居环境造成影响。该文主要针对鹅粪便处理的目的、当前阶段黑龙江省鹅粪便处理的主要模式及在粪便处理过程中存在的主要问题进行分析和阐述,希望对促进黑龙江省鹅产业的健康可持续发展提供帮助。

关键词：鹅粪便处理措施问题分析

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肉鸡TFEB基因的表达特征及其与脂肪细胞溶酶体数量的关系

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农业生物技术学报 2020年第1期28卷 129-138页

作者：高卓然丁然陈耀峰翟祥云李辉杜志强农业部鸡遗传育种重点实验室/黑龙江省普通高等学校动物遗传与繁殖重点实验室/东北农业大学动物科学技术学院

转录因子EB (transcription factor EB, TFEB)在溶酶体表面被哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin, mTOR)磷酸化后,发生核移位进而发挥生物学功能。TFEB与溶酶体生物合成、自噬、脂类物质代谢等都有着密切关系。本研... 详细信息

转录因子EB (transcription factor EB, TFEB)在溶酶体表面被哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin, mTOR)磷酸化后,发生核移位进而发挥生物学功能。TFEB与溶酶体生物合成、自噬、脂类物质代谢等都有着密切关系。本研究以东北农业大学高、低脂双向选择系肉鸡(Gallus gallus)为材料,检测了TFEB基因在肉鸡腹部脂肪组织和脂肪细胞中的表达情况,进行了肉鸡脂肪细胞中TFEB蛋白的免疫荧光定位,同时观察分析了肉鸡脂肪细胞诱导分化过程中溶酶体数量的变化。结果表明,在1、4、7周龄中,TFEB在低脂肉鸡腹脂的表达量均高于在高脂肉鸡腹脂中的表达量,且在4周龄中,TFEB在两系腹脂中的表达量差异显著;TFEB在两系肉鸡原代前脂肪细胞诱导分化过程中表达呈相反的趋势,在高脂系的诱导分化过程中表达量下降,在低脂系的诱导分化过程中表达量升高,同时在爱拔益加(arbor acres, AA)肉鸡原代前脂肪细胞诱导分化过程中TFEB表达量呈下降趋势,且TFEB在诱导至72 h与0 h的表达量差异显著;TFEB蛋白在肉鸡脂肪细胞的细胞质和细胞核上均有分布,且溶酶体的数量在脂肪细胞诱导分化过程中减少。本研究结果为进一步探讨TFEB调控溶酶体生物合成,进而影响肉鸡脂肪代谢的分子机制提供了基础资料。

关键词：肉鸡脂肪代谢转录因子EB(TFEB) 溶酶体

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鸡胰岛素样生长因子2基因(IGF2)外显子区功能性SNP预测与分析

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畜牧兽医学报 2020年第11期51卷 2665-2678页

作者：李玉冬王伟佳李紫薇李瑞楚张长超王宁李辉王守志农业农村部鸡遗传育种重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室哈尔滨150030 东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

旨在采用生物信息学方法筛选鸡IGF2基因中具有潜在生物学功能的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)位点,为开展标记辅助选择改良鸡重要经济性状提供理论参考。本研究从dbSNP数据库中检索出鸡... 详细信息

旨在采用生物信息学方法筛选鸡IGF2基因中具有潜在生物学功能的非同义单核苷酸多态性(non-synonymous single nucleotide polymorphisms,nsSNPs)位点,为开展标记辅助选择改良鸡重要经济性状提供理论参考。本研究从dbSNP数据库中检索出鸡IGF2基因的12个nsSNPs位点,利用生物信息学软件SIFT、Polyphen-2、PhD-SNP和SNAP预测其中可能的功能性SNP;使用I-Mutant3.0和Mupro方法对突变位点的氨基酸稳定性进行分析;对鸡IGF2基因编码的氨基酸序列进行多序列比对和进化位点保守性预测,并结合MutPred2预测突变可能造成的功能后果;最后使用Sopma预测IGF2野生型和突变型的蛋白质二级结构,运用I-TASSER构建它们的蛋白质三级结构。结果发现,rs740391349(E29G)、rs735633122(T30P)、rs739078786(L31P)、rs736255842(E35G)及rs736800980(V37G)这5个nsSNPs可能影响鸡IGF2的蛋白功能,且所有位点突变都会使IGF2蛋白稳定性降低。多序列比对及保守性分析显示,rs740391349(E29G)、rs735633122(T30P)和rs736255842(E35G)为高度保守并暴露的功能性残基,MutPred2与二级结构分析结果表明,rs735633122(T30P)和rs736255842(E35G)这两个位点上的突变都导致了α螺旋百分比下降。三级结构分析表明,rs735633122(T30P)和rs736255842(E35G)这2个nsSNPs均会导致IGF2的蛋白空间结构发生变化。综上所述,T30P和E35G位点突变严重影响鸡IGF2蛋白质的结构,可能是影响鸡生长和体组成性状的重要功能性SNPs。

关键词：鸡 IGF2基因 SNP功能预测生物信息学

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鸡HMG box蛋白1(HBP1)基因启动子区多态性与腹脂率关联分析

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东北农业大学学报 2020年第4期51卷 55-60页

作者：王守志张长超李紫薇王伟佳李玉东王宁李辉农业农村部鸡遗传育种重点实验室哈尔滨150030 黑龙江省普通高等学校动物遗传育种与繁殖重点实验室哈尔滨150030 东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动... 详细信息

为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动窗口法对位于该基因启动子区54个多态性位点构建单倍型,分别开展单位点和单倍型与鸡腹脂率的关联分析。结果表明,HBP1基因启动子区有7个(g.-5335G>A、g.-4354T>A、g.-3328C>T、g.-3327G>A、g.-1013T>C、g.-990G>A和g.-159A>C)位点显著影响肉鸡腹脂率(P<0.05)。此外,等位基因频率分析显示,这些位点等位基因频率在两系间分布存在极显著差异(P<0.0001)。研究结果表明,HBP1基因为影响鸡腹脂率重要候选基因,7个多态性位点为影响鸡腹脂率重要分子标记。

关键词：肉鸡腹脂率 HBP1基因 SNPs

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