检索结果-内蒙古大学图书馆

华北农学报 2020年第S1期35卷 1-10页

作者：张久坤齐阳阳李立竹宁哓霜刘志华姜振峰李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

株高是影响大豆单株产量的重要性状,明确调控大豆株高的主效基因对利用分子辅助育种手段提高大豆产量具有重要意义。选用株高差异显著的东农594(高秆)为父本,Charleston(矮秆)为母本,杂交构建F2群体和RIL群体,然后选取F2群体的1500个单... 详细信息

株高是影响大豆单株产量的重要性状,明确调控大豆株高的主效基因对利用分子辅助育种手段提高大豆产量具有重要意义。选用株高差异显著的东农594(高秆)为父本,Charleston(矮秆)为母本,杂交构建F2群体和RIL群体,然后选取F2群体的1500个单株中极高和极矮单株各40株和RIL群体的高矮秆单株各20株,分别建立2套高矮秆池;进而利用二代DNA测序技术对亲本进行50×测序,高矮秆池进行20×测序并筛选read读数大于4的高质量可信SNP位点,在F2群体筛选到20187个符合要求的SNP位点、RIL群体筛选到20285个符合要求的SNP位点;最后采用混合群体分离分析(Bulked segregant analysis,BSA)的SNP-index关联分析法和Euclidean distance(ED)关联分析法计算2个群体和株高关联的染色体区间,进而重新计算株高关联染色体的阈值,并筛选2个群体2种方法共同定位到的10个染色体区间作为候选区间,此结果显著降低了全基因组单一阈值鉴定到的染色体区间,提高了定位结果的准确性。最后利用拟南芥和大豆基因组注释信息对株高关联候选区间的SNP位点所对应的基因功能进行分析,共筛选到18个控制株高的候选基因(Glyma.01G214300、Glyma.01G220700、Glyma.02G095600、Glyma.03G158100、Glyma.03g230000、Glyma.04G033800、Glyma.04G063800、Glyma.04g065600、Glyma.04G190800、Glyma.04G210000、Glyma.04G210700、Glyma.04G212900、Glyma.04g227700、Glyma.05G148700、Glyma.09G158400、Glyma.11G100400、Glyma.12G012400、Glyma.15g052400)。结合大豆旺盛生长期(R1期)顶芽的转录组数据筛选控制大豆株高的重要候选基因,Glyma.03g230000、Glyma.04g065600、Glyma.04g227700在大豆株高形成的关键时期R1期高表达,说明这些候选基因和株高发育密切相关,但是还需要遗传转化验证功能。

关键词：大豆株高 BSA法 SNP SSR

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大豆主茎木质素积累规律分析

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华北农学报 2022年第3期37卷 77-85页

作者：李艳燕赵彩桐齐阳阳刘明张书瑞刘志华李文滨姜振峰东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

为明确大豆节间木质素积累规律,深入理解木质素积累与大豆植株抗倒伏间的关系,进而为调控大豆植株表型和抗倒伏大豆新品种选育提供参考依据,选取具有代表性的有限生长习性品种Charleston,按照20,35株/m^(2)的2种密度种植桶栽大豆,在2种... 详细信息

为明确大豆节间木质素积累规律,深入理解木质素积累与大豆植株抗倒伏间的关系,进而为调控大豆植株表型和抗倒伏大豆新品种选育提供参考依据,选取具有代表性的有限生长习性品种Charleston,按照20,35株/m^(2)的2种密度种植桶栽大豆,在2种不同密度下测定主茎的木质素含量,分析Charleston主茎第3节间的细胞伸长区(EZ)和次生细胞壁成熟区(MZ)木质素含量、在木质素合成过程中的4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)、苯丙氨酸转氨酶(PAL)、肉桂酸脱氢酶(CAD)等关键酶活性以及对应基因的表达量。手工切片及分光光度计测定的结果表明,大豆主茎木质素含量由形态学上端向下端逐渐增加。低密度处理主茎中的木质素含量高于高密度。无论是高密度还是低密度处理,单一节间(茎3)木质素含量均为MZ>EZ;低密度处理茎中4CL、PAL、CAD的活性高于高密度处理。2个密度处理下茎中4CL、PAL、CAD活性变化规律较为一致,与基因表达结果相符合。大豆植株主茎中木质素含量受到木质素合成途径中的多种酶调控。木质素合成的关键酶基因多以基因家族形式存在,同一基因家族中的酶基因在同一物种植株的相同部位表达存在差异,同一基因在同一物种的不同组织和器官中的表达情况也不尽相同。

关键词：大豆主茎木质素含量木质素合成关键酶

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大豆生长节间响应温度和外源GA诱导的赤霉素途径关键基因分析

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作物学报 2023年第1期49卷 62-72页

作者：齐阳阳窦汝娜赵彩桐张帜李文滨姜振峰东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

为了解大豆节间在不同温度和外源赤霉素(gibberellic acid,GA)诱导条件下的表型变化规律,分析GA合成重要途径和挖掘调控节间的关键候选基因,本研究将大豆品种Charleston在培养箱条件和室外盆栽条件种植,进行不同温度处理和外源GA涂抹处... 详细信息

为了解大豆节间在不同温度和外源赤霉素(gibberellic acid,GA)诱导条件下的表型变化规律,分析GA合成重要途径和挖掘调控节间的关键候选基因,本研究将大豆品种Charleston在培养箱条件和室外盆栽条件种植,进行不同温度处理和外源GA涂抹处理,利用徒手切片配合显微照相方法,分析大豆节间长度和细胞形态变化;利用液相色谱-质谱联机结合转录组测序方法分析大豆节间GA合成主要通路并挖掘调控节间生长的关键候选基因。结果表明在25℃和30℃条件下,外源涂抹不同浓度GA可以诱导大豆生长节间伸长,随着伸长量的增加,大豆节间都变得纤细。外源GA对细胞作用效果主要为促进伸长,对宽度影响不明显。高温处理对节间的伸长效果高于低温处理。本研究鉴定到GA2氧化酶基因在大豆生长节间表达和较高含量的GA19和GA53,及这2种GA下游的GA20(活性GA前体),以及这条合成途径的活性GA产物GA3也被检测到都存在于细胞伸长区组织,说明从GA前体物质到GA53,再到GA19,通过GA20最终合成GA3是大豆节间生长的一条重要GA合成通路,进一步说明GA2氧化酶在大豆节间生长过程中有重要作用。挖掘到某些DELLA、GA和PIF基因家族成员具有组织表达特异性,为调节大豆节间和株高提供了候选基因。

关键词：大豆生长节间 GA途径 GA-GID1-DELLA

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大豆GmVE2基因克隆及其在大豆籽粒维生素E动态积累中的表达分析

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华北农学报 2020年第3期35卷 24-32页

作者：王伟王俊鲍玉月栗春霞崔智慧韩英鹏李文滨东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

大豆GmVE2基因是一种NAD(P)H脱氢酶,主要存在于高等植物叶绿体类囊体膜上,可参与氧化应激反应以及叶绿体PSⅠ电子循环传递。为了探究其功能,通过RT-PCR方法从东农50中克隆获得GmVE2基因的CDS全长序列。利用ExPASy-ProtParam等在线软件对... 详细信息

大豆GmVE2基因是一种NAD(P)H脱氢酶,主要存在于高等植物叶绿体类囊体膜上,可参与氧化应激反应以及叶绿体PSⅠ电子循环传递。为了探究其功能,通过RT-PCR方法从东农50中克隆获得GmVE2基因的CDS全长序列。利用ExPASy-ProtParam等在线软件对GmVE2蛋白序列进行理化性质分析,预测结果表明,GmVE2基因编码区共编码167个氨基酸,分子式为C904H1326N208O246S10,分子质量为19.364 3 ku,总原子数为2 694,理论等电点(pI)为4.78,脂肪指数为87.01;蛋白正负电荷残基数分别为11和23;GmVE2蛋白的不稳定系数和GRAVY值分别为25.02和0.043,说明该蛋白是稳定的疏水性蛋白;蛋白存在跨膜结构、信号肽和磷酸化位点。将线性植物表达载体与目的片段进行连接,成功构建pCambia3300-GmVE2植物表达载体。通过qRT-PCR技术和高效液相色谱(HPLC)分别对动态籽粒及组织基因表达量和维生素E含量进行测定,结果表明,该基因表达量与生育期籽粒维生素E含量呈负相关(-0.951*),且维生素E含量在绿色组织中显著高于其他组织。本研究对大豆基因GmVE2与维生素E含量的调控关系进行初步研究,为高大豆维生素E含量的大豆新品种选育提供理论和实践基础,为后期研究GmVE2基因功能提供科学依据。

关键词：大豆维生素E GmVE2基因基因克隆功能预测表达分析

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大豆抗病性、产量与品质的相关性

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中国农业科学 2024年第11期57卷 2061-2064页

作者：战宇航王杰李永光韩英鹏东北农业大学大豆研究所/大豆生物学教育部重点实验室/农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室

大豆是重要的粮油兼用作物之一，具有较高的经济价值。大豆抗病性和品质是制约其产量和商品性的关键因素。提高大豆抗病性可有效提高产量，优异品质则直接关系到大豆商品价值和市场竞争力。在大豆已知的200多种病虫害中，有35种病虫害... 详细信息

大豆是重要的粮油兼用作物之一，具有较高的经济价值。大豆抗病性和品质是制约其产量和商品性的关键因素。提高大豆抗病性可有效提高产量，优异品质则直接关系到大豆商品价值和市场竞争力。在大豆已知的200多种病虫害中，有35种病虫害具有较大的危害性[1]。选育和利用抗病品种是防治这些病虫害最经济、安全和绿色有效的措施之一。

关键词：大豆抗病性产量与品质

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大豆GmGBP1基因对转基因烟草幼苗耐热性的影响

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农业生物技术学报 2016年第3期24卷 313-322页

作者：聂腾坤赵琳李文滨丁福全李敏敏杨雪张可欣孙晶哲杜海龙东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室

大豆中受赤霉素诱导的MYB类转录因子结合蛋白1(Glycine max gibberellin-regulated Mybrelated transcription factor binding protein 1,Gm GBP1)基因是斯隆-凯特琳逆转录病毒互作蛋白(SloanKettering retrovirus interacting protein,SKIP)基因的同源基因。Gm GBP1编码的蛋白质不仅参与调控多种植物的非生物胁迫信号转导途径,同时还参与脱落酸、赤霉素等植物激素的信号转导。本研究将大豆Gm GBP1基因转化烟草(Nicotiana tabacum),并使该基因在烟草中过量表达。结果表明,经过48℃处理48h后,野生型烟草(wild-type tobacco,WT)幼苗叶片萎蔫坏死、失绿变黄;过表达大豆Gm GBP1基因的转基因烟草(transgenic tobacco of overexpression Gm GBP1 gene,GBP1ox)幼苗叶片未出现明显变黄。55℃高温处理12 h后,室温恢复生长15 d,GBP1ox烟草幼苗存活率为24.14%,高于WT。经48℃处理48 h后,WT烟草幼苗叶片中的丙二醛(malondialdehyde,MDA)含量是GBP1ox的2.07倍;用二氨基联苯胺(diaminobenzidine,DAB)对高温处理后的烟草幼苗叶片染色,WT烟草幼苗叶片染色面积占叶片总面积的比例为43.66%,显著高于GBP1ox(P<0.05)。对烟草幼苗55℃高温处理3、6、7和8 h时,GBP1ox烟草幼苗叶片中拟南芥锌指结构蛋白12(zinc finger protein of Arabidopsis thaliana 12,ZAT12)基因的相对表达量显著高于WT(P<0.05)。但是高温处理后WT与GBP1ox烟草幼苗叶片中热休克蛋白40(heat shock protein 40,HSP40)基因的相对表达量没有明显差异。上述结果表明,过量表达大豆Gm GBP1基因能在一定程度上提高转基因烟草幼苗的耐热性。本研究为耐热转基因作物新品种的培育提供参考,并为进一步研究大豆Gm GBP1基因的功能提供依据。

关键词：大豆烟草幼苗大豆中受赤霉素诱导的MYB类转录因子结合蛋白基因(Gm GBP1) 斯隆-凯特琳逆转录病毒互作蛋白基因(SKIP) 耐热

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GmXTH22基因启动子序列的克隆及功能分析

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基因组学与应用生物学 2018年第6期37卷 2459-2466页

作者：孙铭阳李永光李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室

利用PCR技术从大豆品种东农50基因组中分离得到了GmXTH22（glyma13g01150）基因启动子片段pGmXTH22,定向替换载体p BI121的CAMV35S组成型启动子,构建表达载体pBI121-pGmXTH22,驱动下游报告基因GUS基因表达,然后将pGmXTH22-GUS-nos切下... 详细信息

利用PCR技术从大豆品种东农50基因组中分离得到了GmXTH22（glyma13g01150）基因启动子片段pGmXTH22,定向替换载体p BI121的CAMV35S组成型启动子,构建表达载体pBI121-pGmXTH22,驱动下游报告基因GUS基因表达,然后将pGmXTH22-GUS-nos切下连接到改造后的p CAMBIA3300中。在The Bio-Analytic Resource for Plant Biology（BAR）中分析GmXTH22的同源基因At XTH14的细胞与组织表达特异性和在不同逆境条件下的表达模式。利用Plant CARE在线启动子预测工具进行分析。利用荧光定量PCR（qRT-PCR）检测了GmXTH22在冷处理下的表达模式。结果表明：At XTH14在细胞壁和根部原形成层表达量最高,并受到低温,盐胁迫等多种逆境诱导。GmXTH22启动子序列中含有多种典型的光、激素和胁迫诱导特异性表达元件。qRT-PCR结果证实GmXTH22的表达受冷胁迫抑制。

关键词：大豆拟南芥组织特异性逆境荧光定量

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大豆GmDAO1基因的功能预测及表达分析

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基因组学与应用生物学 2017年第6期36卷 2480-2485页

作者：李冬梅张宇航李永光李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

本研究通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtDAO1在大豆中的同源基因,获得了GmDAO1基因序列。通过对GmDAO1基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,我们发现GmDAO1基因CDS序列全长951bp,编码316个氨基酸。GmDAO1编码的蛋... 详细信息

本研究通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtDAO1在大豆中的同源基因,获得了GmDAO1基因序列。通过对GmDAO1基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,我们发现GmDAO1基因CDS序列全长951bp,编码316个氨基酸。GmDAO1编码的蛋白为亲水性蛋白,具有1个N-糖基化位点、3个激酶磷酸化位点与1个豆蔻酰化位点。结构域分析表明GmDAO1含有双加氧酶与2OG-Fe(II)加氧酶结构域,是2-酮戊二酸依赖性双加氧酶基因(2-ODD)家族的成员。GmDAO1预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析结果表明DAO1在豆科植物进化过程中比较保守。组织特异性表达分析结果显示GmDAO1在叶片中表达量最低,在根中表达量最高。因此我们推测其可能参与生长素的代谢途径。

关键词：大豆 GmDAO1基因 2-酮戊二酸依赖性双加氧酶生长素生物信息学

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大豆miR172家族成员序列及表达模式初步分析

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基因组学与应用生物学 2015年第6期34卷 1277-1282页

作者：王涛李永光李文滨大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室东北农业大学哈尔滨150030

Micro RNAs(miRNAs)在植物的生长发育以及植物对环境的适应方面发挥了重要的作用,成为近几年研究的热点。mi R172家族是一个保守的mi RNA家族,之前的研究表明mi R172的作用涉及生长期过渡、闭花受精、花器官发育、开花时间调控等方面。... 详细信息

Micro RNAs(miRNAs)在植物的生长发育以及植物对环境的适应方面发挥了重要的作用,成为近几年研究的热点。mi R172家族是一个保守的mi RNA家族,之前的研究表明mi R172的作用涉及生长期过渡、闭花受精、花器官发育、开花时间调控等方面。但是到目前为止,人们对大豆mi R172家族的了解还不是很清楚。本实验通过mi RBase、PLACE数据库及DNAman软件对gma-mi R172家族成员的前体序列、成熟序列、启动子序列进行比较分析,发现gma-mi R172家族成员成熟序列虽然高度保守,但前体序列具有一定的差异,这可能导致了各成员的功能差异;启动子分析显示其启动子含有光反应原件和多种非生物胁迫响应元件,推测其可能参与大豆的开花调控和逆境胁迫响应。通过实时定量PCR分析了大豆mi R172成员的组织特异性表达情况。利用PMRD数据库对gma-mi R172的靶基因进行了生物信息学分析,获得了7个AP2-like类转录因子,参与花器官发育、开花时间调控及非生物胁迫响应的方面。上述结果初步分析了大豆mi R172家族的功能与靶基因,对今后进一步分析研究大豆mi R172家族及其靶基因打下了基础。

关键词：大豆 miR172 序列分析靶基因

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大豆GmNFYB1基因功能预测及表达分析

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基因组学与应用生物学 2015年第5期34卷 1034-1039页

作者：王涛李永光王英琪薄蕾李真李文滨大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室东北农业大学哈尔滨150030

本研究对大豆Gm NFYB1(Glyma02g17310)进行基因功能和表达分析,利用Plant CARE分析启动子元件发现,在基因启动子序列中含有多个与ABA、抗旱、光反应相关的元件。在The Bio-Analytic Resource for Plant Biology数据库中分析了Gm NFYB1... 详细信息

本研究对大豆Gm NFYB1(Glyma02g17310)进行基因功能和表达分析,利用Plant CARE分析启动子元件发现,在基因启动子序列中含有多个与ABA、抗旱、光反应相关的元件。在The Bio-Analytic Resource for Plant Biology数据库中分析了Gm NFYB1的同源基因At NFYB5在不同逆境胁迫和不同激素处理时的基因表达情况,表明该基因表达具有组织表达特异性,参与盐胁迫、渗透胁迫等反应。Gm NFYB1在大豆的q RT-PCR结果表明,该基因受ABA、Na Cl、PEG诱导上调表达,参与大豆抗逆反应。

关键词：大豆 GmNFYB 脱落酸干旱胁迫盐胁迫

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