检索结果-内蒙古大学图书馆

中国油料作物学报 2021年第4期43卷 638-647页

作者：苌兴超王雪松张沿政景雅陈龙赵佳梁房庆伟宋春晓李永光李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

泛素化系统通过介导蛋白质的翻译后修饰,参与包括细胞分化、激素应答、生物与非生物胁迫响应等多个生物学过程,其中含有U-box基因的泛素连接酶为泛素化系统的重要酶之一。课题组前期研究发现大豆Glyma.13G115900(GmPUB32)基因编码一个... 详细信息

泛素化系统通过介导蛋白质的翻译后修饰,参与包括细胞分化、激素应答、生物与非生物胁迫响应等多个生物学过程,其中含有U-box基因的泛素连接酶为泛素化系统的重要酶之一。课题组前期研究发现大豆Glyma.13G115900(GmPUB32)基因编码一个泛素连接酶(PUB),其表达量在根中受盐胁迫影响显著。本研究在大豆品种垦丰16中克隆得到大豆U-box家族基因GmPUB32,序列分析结果表明GmPUB32基因的开放阅读框长度为513bp,编码170个氨基酸,在其83-131个氨基酸之间含有一个RING/U-box保守结构域;亚细胞定位分析结果显示GmPUB32蛋白定位于细胞膜与细胞质中;GmPUB32基因在大豆根、茎、叶片与荚果中均能检测到不同程度的表达,在根中表达量最高,GUS组织化学染色进一步明确其在根中发挥主要作用;荧光定量PCR分析结果显示,在200 mmol/L NaCl处理后,与对照相比随着处理时间的延长GmPUB32在根中的表达量呈现出显著的下降趋势,表明GmPUB32可能参与大豆对于盐胁迫的应答过程;通过对过表达GmPUB32的T3拟南芥的盐胁迫耐受性进行分析,结果表明转基因拟南芥的萌发率、子叶绿化率与盐胁迫下的存活率均明显低于野生型,此外,GmPUB32过表达转基因毛状根的生长速率相比野生型也明显受到抑制。由此推断,GmPUB32可能作为负调控因子参与大豆对于盐胁迫的应答过程,降低植物对于盐胁迫的耐受性。

关键词：盐胁迫大豆 U-box 拟南芥

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大豆GmLecRlk基因耐盐功能分析

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中国油料作物学报 2022年第6期44卷 1267-1274页

作者：房庆伟张沿政郑己强李泽阳李月赵佳梁王雪松苌兴超陈龙景雅宋春晓李永光东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

凝集素类受体蛋白激酶属于类受体蛋白激酶(RLKs)家族,在植物的抗病防御反应、生长发育、胞内信号传导以及非生物胁迫反应过程中发挥重要作用。实验室前期对过表达抗逆转录因子GmNFYB1大豆进行转录组测序,获得了差异表达基因GmLecRlk(Gly... 详细信息

凝集素类受体蛋白激酶属于类受体蛋白激酶(RLKs)家族,在植物的抗病防御反应、生长发育、胞内信号传导以及非生物胁迫反应过程中发挥重要作用。实验室前期对过表达抗逆转录因子GmNFYB1大豆进行转录组测序,获得了差异表达基因GmLecRlk(Glyma.07G005700),其开放阅读框长度为546 bp,编码181个氨基酸,蛋白结构域分析显示其含有两个丝氨酸/苏氨酸激酶结构域,属于一种G型凝集素类受体蛋白激酶。实时荧光定量PCR结果显示,GmLecRlk基因在大豆的根、茎、叶、荚中均有不同程度的表达,在根中表达量最高;200 mmol/LNaCl处理下,GmLecRlk的mRNA丰度先降低后升高,在12 h时达到最高值,表明该基因参与大豆对盐胁迫的响应。利用发根农杆菌K599获得GmLecRlk过表达转基因发状根复合植株,在盐胁迫处理下,其存活率高于对照;在拟南芥中异源表达GmLecRlk基因,转基因拟南芥在盐胁迫处理下的萌发率、绿化率和根长均高于野生型拟南芥。综上所述,GmLecRlk参与大豆对盐胁迫的反应,过量表达基因能提高大豆和拟南芥的耐盐性,为培育和改良抗盐大豆新品种提供新的途径和理论指导。

关键词：大豆盐胁迫类受体蛋白激酶拟南芥

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大豆抗倒伏相关性状全基因组关联分析

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东北农业大学学报 2021年第3期52卷 1-12页

作者：李文滨吴航刘冀张翔超郭志文郑立娜赵雪韩英鹏滕卫丽东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

研究以150份大豆种质为试验材料开展2年3点试验,在收获期测定抗倒伏相关性状,并利用RTMGWAS方法作关联分析,共检测到99个显著关联SNP位点,其中48个效应显著位点,解释0.28%~3.38%表型变异;89个与环境互作显著位点,解释0.53%~7.04%表型变... 详细信息

研究以150份大豆种质为试验材料开展2年3点试验,在收获期测定抗倒伏相关性状,并利用RTMGWAS方法作关联分析,共检测到99个显著关联SNP位点,其中48个效应显著位点,解释0.28%~3.38%表型变异;89个与环境互作显著位点,解释0.53%~7.04%表型变异;其中,21个位点主效表型变异解释率高于1%;与6个倒伏相关性状显著关联SNP位点中,与茎粗显著关联SNP位点最多,与抗倒指数显著关联SNP位点最少;获得22个有功能注释基因,根据基因表达量和基因功能注释,推测3个基因(Glyma.18G149700、Glyma.04G244100、Glyma.18G011400)可作为与大豆抗倒伏相关候选基因。

关键词：大豆倒伏性状全基因组关联分析候选基因挖掘

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大豆种质资源苗期耐盐鉴定及遗传多样性分析

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植物遗传资源学报 2024年第6期25卷 945-956页

作者：林峰赵慧艳史飞飞高鹏刘晨煦岳阳金昕张意德李永光韩英鹏赵雪滕卫丽东北农业大学农学院/大豆生物学教育部重点实验室/农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

盐碱地是边际土壤的主要类型之一,利用边际土地耕作是减缓耕地紧缺的有效途径。为筛选耐盐性较强的大豆种质资源,提高盐碱土地大豆产量,本研究对392份来自国内外不同地域的大豆种质资源,采用150 mmol/L NaCl进行苗期盐胁迫处理,采用单... 详细信息

盐碱地是边际土壤的主要类型之一,利用边际土地耕作是减缓耕地紧缺的有效途径。为筛选耐盐性较强的大豆种质资源,提高盐碱土地大豆产量,本研究对392份来自国内外不同地域的大豆种质资源,采用150 mmol/L NaCl进行苗期盐胁迫处理,采用单株分类记载法进行苗期耐盐性鉴定,并利用10个与耐盐基因连锁的SSR标记对高耐及耐盐等级大豆种质资源进行分子辅助鉴定及遗传多样性分析,应用相似性系数分析、聚类分析等方法对高耐及耐盐等级大豆种质资源进行综合评价。结果表明:筛选出58份高耐及耐盐大豆种质资源,包括赤豆1号、东农69等高耐大豆种质资源14份,黑农51、黑河35等耐盐大豆种质资源44份;58份耐盐大豆种质资源分子辅助鉴定表明,绥农1号、合丰50和东大2号携带耐盐等位变异最多,均为6个,标记平均鉴定效率为43.45%,平均准确率为68.46%,其中分子标记Satt201的鉴定效率和鉴定准确率最高,分别为60.34%和96.55%;聚类分析表明,58份大豆种质资源间的相似性系数在0.5385~0.9231之间,平均值为0.6974,相关系数为0.6240,说明58份大豆种质资源大部分遗传关系较近,遗传多样性较低,58份耐盐大豆种质资源并未按地域进行聚类,但一个类群或亚群中大部分种质资源来源地在地理位置上相同或较为接近,可从中筛选亲缘关系较远的大豆种质资源作为亲本,用于培育耐盐大豆新品种奠定遗传基础。

关键词：大豆苗期盐胁迫分子辅助鉴定遗传多样性分析

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大豆重组自交系群体芽期耐盐性状加性与上位性QTL定位

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东北农业大学学报 2022年第4期53卷 1-8页

作者：滕卫丽付雪刘冀张翔超史飞飞王博董莹莹赵雪韩英鹏李文滨东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

研究采用芽期耐盐性状差异显著的东农46和L-100杂交衍生的包含127个家系的F2:12和F2:13重组自交系群体为试验材料,调查耐盐性状:吸胀率(IR)、发芽指数(GI)和发芽率(GR),计算3个相对耐盐指数:相对吸胀率(STIR)、相对发芽指数(STGI)和相... 详细信息

研究采用芽期耐盐性状差异显著的东农46和L-100杂交衍生的包含127个家系的F2:12和F2:13重组自交系群体为试验材料,调查耐盐性状:吸胀率(IR)、发芽指数(GI)和发芽率(GR),计算3个相对耐盐指数:相对吸胀率(STIR)、相对发芽指数(STGI)和相对发芽率(STGR),利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件对3个相对耐盐指数作QTL分析。结果表明,共检测到12个加性QTL,贡献率为4.88%~15.91%,2个位点有重叠区间,3个性状表型贡献率最高QTL分别为qSTIR-9-1(15.91%)、qSTGI-2-1(10.21%)和qSTGR-20-1(12.23%),共检测到108个上位性QTL,贡献率为0.55%~26.59%。该耐盐性状QTL为分子辅助培育抗盐大豆品种奠定基础。

关键词：大豆芽期耐盐性状 QTL

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大豆胞囊线虫病抗性相关AP2/EREBP转录因子生物信息学分析

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东北农业大学学报 2020年第8期51卷 1-8,73页

作者：韩英鹏卜凡珊田利峥姜海鹏赵雪东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用“东农L-10”转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其... 详细信息

AP2/EREBP转录因子家族在植物应对逆境胁迫时发挥重要作用,为进一步了解大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性相关AP2/EREBP家族转录因子生物学功能,研究利用“东农L-10”转录组测序结果,筛选得到14个与抗性相关AP2/EREBP转录因子序列,并对其开展在线生物信息学预测和分析。结果表明,14个转录因子多数为酸性等电点,均属于亲水性蛋白;通过与拟南芥AP2/EREBP转录因子作多序列比对和系谱进化树分析可知,AP2/EREBP转录因子根据其保守结构域特点分为AP2、ERF和DREB等3个亚族,且可分为B3、B5、A2和A5亚类。亚细胞定位预测结果显示AP2/EREBP转录因子发挥重要作用的位置依次为细胞核、线粒体、叶绿体;蛋白质二级结构中氨基酸序列以无规则卷曲为主要组成,α-螺旋次之,β-折叠和β-转角则散布于蛋白质序列中,同一亚族蛋白质三级结构之间无明显差异,而不同亚族之间差异显著,表明大豆胞囊线虫病相关AP2/EREBP转录因子在遗传进化过程中高度保守,其结构和功能可能具有相似性。

关键词：大豆胞囊线虫 AP2/EREBP 转录因子生物信息学

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大豆GmFT5a基因启动子受日长调控模式分析

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东北农业大学学报 2020年第2期51卷 19-25页

作者：赵琳张妍刘颖许崇晶东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

研究构建大豆成花素GmFT5a基因启动子与pGreenII 0800双分子萤光素酶融合植物表达载体,农杆菌注射烟草,通过烟草体内瞬时表达活性试验分析长、短日照条件对GmFT5a启动子表达活性的影响,探讨GmFT5a受日长的表达影响。结果表明,经短日照... 详细信息

研究构建大豆成花素GmFT5a基因启动子与pGreenII 0800双分子萤光素酶融合植物表达载体,农杆菌注射烟草,通过烟草体内瞬时表达活性试验分析长、短日照条件对GmFT5a启动子表达活性的影响,探讨GmFT5a受日长的表达影响。结果表明,经短日照处理的GmFT5a启动子表达活性高于长日照处理。说明短日照诱导GmFT5a启动子表达,进一步说明该基因为光周期调控因子。利用PLANTCARE在线预测工具分析GmFT5a基因启动子序列可知,GmFT5a启动子序列包含BOX 4、G-box、GT1-motif、Gap-box、chs-CMA1a光响应调控元件。由此说明GmFT5a基因可能通过启动子上光响应元件调控参与调控光周期。

关键词：大豆 GmFT5a启动子日长

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基于元分析的大豆胞囊线虫病3号生理小种抗性基因挖掘

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东北农业大学学报 2020年第4期51卷 10-17页

作者：韩英鹏田利峥姜海鹏包冬芳王俊赵雪东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

大豆胞囊线虫病(Soybean cyst nematode,Heterodera glycines Ichinohe)是一种严重影响大豆产量的病害,我国东北地区以3号生理小种(SCN Race 3)为主。QTL定位是挖掘抗性基因最有效的方法之一,与SCN相关的QTL报道较多,其由不同遗传群体获... 详细信息

大豆胞囊线虫病(Soybean cyst nematode,Heterodera glycines Ichinohe)是一种严重影响大豆产量的病害,我国东北地区以3号生理小种(SCN Race 3)为主。QTL定位是挖掘抗性基因最有效的方法之一,与SCN相关的QTL报道较多,其由不同遗传群体获得,但在不同遗传群体间较难重复。研究采用图谱整合软件BioMercatorV4.2挖掘SCN Race 3抗性基因。将收集整理的10篇文献发表的33个QTL整合在遗传图谱GmComposite2003上,通过元分析方法得到一致性QTL,最终获得3个抗性候选区段,发现18个SCN抗性基因,其中17个PK型基因和1个LRR型基因,分别位于7、15和18染色体中。对潜在SCN抗性基因分析蛋白结构域发现,17个PK型基因分别含有丝/苏氨酸蛋白激酶活性、钙依赖蛋白激酶活性、分裂原活化蛋白激酶活性、半胱氨酸蛋白激酶和组/精/赖氨酸蛋白激酶活性。这些基因编码蛋白结构域与植物抗病相关,结果可为抗SCN基因挖掘和选育抗SCN品种(系)提供理论基础。

关键词：大豆胞囊线虫病 QTL 抗性位点元分析候选基因

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不同发育时期大豆豆荚性状QTL动态分析

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东北农业大学学报 2020年第10期51卷 1-9页

作者：滕卫丽郭志文郑立娜付雪王博董莹莹张丹洋刘赫禹冯文婧赵雪韩英鹏李文滨东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

文章选用母本东农46和父本L-100构建重组自交群体127个家系为试验材料,利用全基因组重测序技术构建高密度遗传连锁图谱,结合群体豆荚长、宽、厚性状R3~R8时期表型数据,利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件完备区间作图法分析非条件和条件QT... 详细信息

文章选用母本东农46和父本L-100构建重组自交群体127个家系为试验材料,利用全基因组重测序技术构建高密度遗传连锁图谱,结合群体豆荚长、宽、厚性状R3~R8时期表型数据,利用QTL IciMapping 4.1.0.0软件完备区间作图法分析非条件和条件QTL加性和上位性效应。结果表明,在豆荚3个性状发育过程中,共检测到40个非条件加性效应QTL,贡献率为4.35%~25.52%;检测到12个条件加性效应QTL,贡献率为3.80%~23.32%。同时检测到多个QTL位点在不同性状或不同生育时期表达,如QPL-7-1、QPL-12-2和QPL-20-1(QPW-20-1)等。通过上位性分析检测到豆荚长度143对、宽度185对和厚度34对QTL位点,贡献率最高分别达29.69%、24.73%和25.17%,表明多基因效应在豆荚生长发育过程中发挥重要作用。

关键词：大豆豆荚性状 QTL 加性效应上位性效应

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大豆GmDAO1基因的功能预测及表达分析

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基因组学与应用生物学 2017年第6期36卷 2480-2485页

作者：李冬梅张宇航李永光李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

本研究通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtDAO1在大豆中的同源基因,获得了GmDAO1基因序列。通过对GmDAO1基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,我们发现GmDAO1基因CDS序列全长951bp,编码316个氨基酸。GmDAO1编码的蛋... 详细信息

本研究通过在大豆基因组数据库中检索拟南芥AtDAO1在大豆中的同源基因,获得了GmDAO1基因序列。通过对GmDAO1基因编码的氨基酸序列及启动子序列进行生物信息学分析,我们发现GmDAO1基因CDS序列全长951bp,编码316个氨基酸。GmDAO1编码的蛋白为亲水性蛋白,具有1个N-糖基化位点、3个激酶磷酸化位点与1个豆蔻酰化位点。结构域分析表明GmDAO1含有双加氧酶与2OG-Fe(II)加氧酶结构域,是2-酮戊二酸依赖性双加氧酶基因(2-ODD)家族的成员。GmDAO1预测的启动子区域含有与激素、胁迫、光应答、生物钟调控和转录因子结合相关的顺式作用元件。系统进化分析结果表明DAO1在豆科植物进化过程中比较保守。组织特异性表达分析结果显示GmDAO1在叶片中表达量最低,在根中表达量最高。因此我们推测其可能参与生长素的代谢途径。

关键词：大豆 GmDAO1基因 2-酮戊二酸依赖性双加氧酶生长素生物信息学

来源：评论

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