检索结果-内蒙古大学图书馆

中国油料作物学报 2015年第4期37卷 453-461页

作者：王艳赵雪姜振峰张东雪韩英鹏滕卫丽李文滨东北农业大学/大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

应用高分辨率熔解曲线（high resolution melting curve,HRM）技术进行基因分型简单有效,灵敏度高、特异性强。优化并建立基于HRM的大豆SNP基因分型体系,是准确进行SNP研究的前提和基础。本研究利用添加内标后的小片段法进行SNP基因分... 详细信息

应用高分辨率熔解曲线（high resolution melting curve,HRM）技术进行基因分型简单有效,灵敏度高、特异性强。优化并建立基于HRM的大豆SNP基因分型体系,是准确进行SNP研究的前提和基础。本研究利用添加内标后的小片段法进行SNP基因分型体系优化研究,结果表明在设计SNP引物时,最好使其PCR产物长度为50～80bp,熔解温度在72～82℃,Tm值介于55～62℃之间;10μLPCR反应体系中应包含25ngDNA模板,0.6pmolSNP引物,1μLLCGreen染料;PCR反应后,应在各点样孔分别加入3pmol的高、低温内标,然后进行变性处理和HRM分析。同时利用建立的基因分型体系对重组自交系群体（RIL）进行了基因分型检测,能完全将其分成亲本的两种基因型,提高了SNP基因分型的准确性和效率。本研究建立的SNP基因分型体系为今后进行大豆SNP标记开发、高密度遗传图谱构建、QTL定位等研究提供了基础。

关键词：大豆 SNP HRM 基因分型小片段法

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大豆光周期效应GmGBP1基因启动子多态性分析

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中国油料作物学报 2018年第2期40卷 174-180页

作者：赵琳姚愈恒王阔郑艳红李英华李敏敏张可欣杨雪丁福全李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

GmGBP1基因是植物开花途径中的重要基因,其启动子也受到短日照条件的强烈诱导。但是目前大豆GmGBP1基因启动子序列的多态性变异以及其与开花期的关系还不清楚。本试验对开花习性不同的36份大豆种质资源的GmGBP1基因启动子序列进行了克... 详细信息

GmGBP1基因是植物开花途径中的重要基因,其启动子也受到短日照条件的强烈诱导。但是目前大豆GmGBP1基因启动子序列的多态性变异以及其与开花期的关系还不清楚。本试验对开花习性不同的36份大豆种质资源的GmGBP1基因启动子序列进行了克隆测序,发掘了GmGBP1基因启动子序列的自然等位变异,探讨了GmGBP1基因启动子序列的自然变异与开花期的关系。研究结果表明,多态性位点SNP-796与开花期密切相关,其中SNP-796G为缩短大豆生育时期的优异等位变异。主要的3个单倍型与开花期也表现出极显著(P<0.01)的相关性,单倍型2和单倍型3为缩短大豆花期的优异单倍型。

关键词： GmGBP1启动子多态性始花期关联分析

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根癌农杆菌介导大豆转Bt-cryIA抗虫基因

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中国油料作物学报 2013年第1期35卷 29-35页

作者：蓝岚吴帅申丽威王志坤孟凡立宋波拓云刘珊珊东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

通过根癌农杆菌介导法,以子叶节为外植体将抗虫基因cryIA转入东农50大豆品种中,对获得的T0、T1和T2植株采用PCR、RT-PCR及Southern杂交法进行分子检测,并对转基因大豆进行食心虫室内抗性鉴定。经PCR鉴定,T0植株有4株为阳性植株,T1有3株... 详细信息

通过根癌农杆菌介导法,以子叶节为外植体将抗虫基因cryIA转入东农50大豆品种中,对获得的T0、T1和T2植株采用PCR、RT-PCR及Southern杂交法进行分子检测,并对转基因大豆进行食心虫室内抗性鉴定。经PCR鉴定,T0植株有4株为阳性植株,T1有3株为阳性植株,T2有9株为阳性植株。对3株T1阳性植株进行RT-PCR检测,均扩增得到1 800bp目标片段,Southern杂交分析显示,有2株出现杂交信号,分别为单拷贝和双拷贝。室内抗虫鉴定表明转基因植株食心虫抗性明显优于对照品种,在蛋白质及脂肪酸含量等品质性状上,与对照没有显著差异。证明cryIA基因已整合到受体大豆基因组中,该基因在大豆T1转基因植株中能够正常转录,抗虫基因cryIA的导入可以提高东农50对大豆食心虫的抗性,其后代的遗传稳定性还有待于进一步的研究。

关键词：大豆根癌农杆菌子叶节 cryIA 遗传转化

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大豆基因组WRKY31同源基因的生物信息学分析

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大豆科学 2014年第5期33卷 642-647页

作者：孙晶盛碧涵韩英鹏赵雪王强孟宪新魏淑红李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守。通过克隆大豆WRKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个W... 详细信息

WRKY转录因子是一类参与多种生物和非生物胁迫的诱导性转录调控因子,在植物进化上高度保守。通过克隆大豆WRKY31基因全长和生物信息学分析,发现WRKY31在大豆基因组中存在3个同源基因,分别位于第6、12和13号染色体上;WRKY31蛋白含有1个WRKY结构域（343-419 aa）和C2H2型锌指结构,属于第二类WRKY基因。RT-PCR分析表明,GmWRKY31在大豆的叶、花、豆荚、根、根瘤中的组织内均有表达,且在花中表达量最高,豆荚中最低。通过MEGA 5.0软件分析,大豆和芸豆WRKY蛋白亲缘关系更近,位于同一分支上,而它的2个拷贝Glyma06g46420.2和Glyma12g10350.1位于另一个分支上,亲缘关系较近。蛋白结构及功能预测表明WRKY31是一类转录因子,参与胁迫反应;系统进化分析表明其基因在进化过程中功能上发生了重大分化。

关键词：大豆 WRKY31 胁迫 WRKY结构域系统进化

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大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析

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大豆科学 2012年第6期31卷 869-873,877页

作者：宋仙萍赵琳张彦威卢清瑶谷月娇李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属... 详细信息

利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA(34-106)和GRAS(158-513)2个结构域。氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响。

关键词：大豆 GAI基因 DELLA结构域 GRAS结构域

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不同生育时期大豆异黄酮合成相关酶基因表达的分析

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大豆科学 2012年第6期31卷 887-893页

作者：王艳武林孙梦阳韩英鹏赵雪滕卫丽李文滨东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

通过Real-time PCR分析了不同生育时期7个大豆异黄酮合成相关酶基因(PAL,C4H,4CL,CHS,CHI,IFS和F3H)的相对表达情况。并利用高效液相色谱法测定了籽粒发育过程中豆荚(含籽粒)中异黄酮及其组分的含量,同时利用SAS 8.2分析了F5∶11重组自... 详细信息

通过Real-time PCR分析了不同生育时期7个大豆异黄酮合成相关酶基因(PAL,C4H,4CL,CHS,CHI,IFS和F3H)的相对表达情况。并利用高效液相色谱法测定了籽粒发育过程中豆荚(含籽粒)中异黄酮及其组分的含量,同时利用SAS 8.2分析了F5∶11重组自交系群体(RILs)豆荚中异黄酮含量与部分基因相对表达量间的相关性。结果表明:从营养生长进入生殖生长阶段,部分基因(PAL,CHI,IFS和F3H)的相对表达量普遍有显著提高;PAL,C4H,CHS和IFS基因在叶片中的相对表达量高峰出现在R1期,大部分基因在2个品种豆荚中相对表达量差异显著的时期为R6期。在R6期,豆荚中PAL基因的相对表达量与染料木素(GT)和总异黄酮含量(TI)呈显著正相关。CHS基因的相对表达量与大豆黄素(DZ)、染料木素(GT)和总异黄酮含量(TI)呈显著正相关,但是与黄豆黄素(GC)呈显著负相关,IFS基因的相对表达量与大豆黄素(DZ)含量呈显著正相关;F3H基因的相对表达量与所有异黄酮成分均呈显著负相关。研究明确了相应基因的表达情况,对于理解异黄酮含量变异的遗传机制具有重要意义。

关键词：大豆异黄酮异黄酮合成相关酶基因 Real-time PCR 相对表达量

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大豆苗期根系根际酶谱原位分析

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东北农业大学学报 2022年第11期53卷 1-9页

作者：姜振峰李珊珊温明星孙亚男赵宛瀛刘志华东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室/农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030 东北农业大学资源与环境学院哈尔滨150030

利用室内根盒培养建立的原位根际酶活检测方法,分析生长习性不同的Charleston(有限生长习性)、东农594(亚有限生长习性)和DN50(亚有限生长习性)3个大豆品种在正常土壤(有机质含量高)和退化土壤(有机质含量低)条件下根系表型特征,分析大... 详细信息

利用室内根盒培养建立的原位根际酶活检测方法,分析生长习性不同的Charleston(有限生长习性)、东农594(亚有限生长习性)和DN50(亚有限生长习性)3个大豆品种在正常土壤(有机质含量高)和退化土壤(有机质含量低)条件下根系表型特征,分析大豆根系碳代谢途径关键酶(β-葡萄糖苷酶)活性变化,明确不同类型土壤影响大豆根系生长发育的规律。结果表明,不同生长习性大豆品种对土壤适应性存在基因型差异,根系表型和土壤环境关系密切。大豆根际β-葡萄糖苷酶活性较土壤中β-葡萄糖苷酶活性高。活性表现为沿根系基部逐渐增加,到根尖活性最大的分布规律,在根尖形成酶活性热点。沿根系生长方向的β-葡萄糖苷酶扩散宽度与酶活性强度在不同类型土壤中分布规律一致,均为由基部到根尖逐渐增加。研究结果明确大豆根际碳代谢关键酶活性变化特点,可为大豆生长发育及高产新品种选育提供根系角度理论支持。

关键词：大豆根系根际酶活性原位酶谱

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大豆GmC4H基因的克隆及同源基因的生物信息学分析

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基因组学与应用生物学 2016年第10期35卷 2768-2774页

作者：张东雪王艳井妍吴德鹏李冬梅韩英鹏赵雪李文滨武小霞东北农业大学农学院大豆生物学教育部重点实验室/东北农业大学农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

本研究分别在大豆品种中豆27和九农20中克隆大豆肉桂酸-4-羟化酶基因（Glyma．20G114200），得到长度为1797bp的C4H基因eDNA序列。比对两者eDNA序列发现4个碱基差异位点。通过对二者氨基酸序列进行理化性质及结构与功能分析发现，C4H基... 详细信息

本研究分别在大豆品种中豆27和九农20中克隆大豆肉桂酸-4-羟化酶基因（Glyma．20G114200），得到长度为1797bp的C4H基因eDNA序列。比对两者eDNA序列发现4个碱基差异位点。通过对二者氨基酸序列进行理化性质及结构与功能分析发现，C4H基因编码蛋白的5—24位氨基酸之间和32—55位氨基酸之间存在跨膜区域；C4H蛋白含有细胞色素P450结构域。大豆C4H基因的四个拷贝分别分布于第2、第10、第14和第20号染色体上，Glyma．20G114200与Glyma．10G275600的蛋白质同源性高，而另外两个同源基因Glyma．02G236500和Glyma．14G205200的蛋白质同源性高。结果表明，可能大豆4个C4H同源基因在进化过程中发生了功能的较大分化。

关键词：大豆异黄酮 C4H 生物信息学分析

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大豆木质素相关基因Glyma06g28890基因功能预测及表达分析

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基因组学与应用生物学 2016年第10期35卷 2763-2767页

作者：李冬梅王涛李永光李文滨东北农业大学大豆研究所大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室哈尔滨150030

拟南芥At PRXs基因家族属于过氧化物酶类,在植物木质素形成过程中发挥了重要的作用。本研究对ATPRX在大豆中的同源基因Glyma06g28890进行基因结构功能预测和表达分析,发现了Glyma06g28890和At PRXs相同,具有一个保守的Plant peroxidase... 详细信息

拟南芥At PRXs基因家族属于过氧化物酶类,在植物木质素形成过程中发挥了重要的作用。本研究对ATPRX在大豆中的同源基因Glyma06g28890进行基因结构功能预测和表达分析,发现了Glyma06g28890和At PRXs相同,具有一个保守的Plant peroxidase结构域,并且与ATPRX25具有最高的相似度;通过启动子顺式作用元件统计,发现在基因启动子序列中含有厌氧诱导调节、激素响应、分生组织表达以及植物防御相关的元件。Glyma06g28890在大豆的组织特异性表达分析结果表明,它在植物内木质素广泛分布的组织内,如根和茎内都有较高水平的表达。

关键词：大豆木质素 Glyma06g28890 植物防御

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大豆抗胞囊线虫锌指蛋白基因GmC_(2)H_(2)-2like克隆与初步功能分析

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华北农学报 2024年第3期39卷 195-207页

作者：曲硕刘芳宋庚晨胡世豪房瑶瑶赵雪韩英鹏东北农业大学农学院农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室黑龙江哈尔滨150030

为了研究锌指蛋白C_(2)H_(2)在大豆胞囊线虫病(SCN)胁迫应答中起到的重要作用,为进一步研究抗大豆胞囊线虫奠定重要基础。利用东农L-10(抗SCN)、黑农37(感SCN)接种SCN3根系转录组数据,筛选出差异表达基因GmC_(2)H_(2)-2like。倒置荧光... 详细信息

为了研究锌指蛋白C_(2)H_(2)在大豆胞囊线虫病(SCN)胁迫应答中起到的重要作用,为进一步研究抗大豆胞囊线虫奠定重要基础。利用东农L-10(抗SCN)、黑农37(感SCN)接种SCN3根系转录组数据,筛选出差异表达基因GmC_(2)H_(2)-2like。倒置荧光显微镜下观察该GmC_(2)H_(2)-2like定位情况,对该基因进行生物信息学分析,克隆并构建其超表达载体转化大豆毛状根,研究其对胞囊线虫病的抗性功能。结果表明,GmC_(2)H_(2)-2like编码410个氨基酸残基,分子质量为45.77 ku,等电点为8.73,含47个磷酸化位点,蛋白二级结构含α-螺旋(25.61%)、无规则卷曲(57.32%)、延伸链(13.66%)和β-转角(3.14%)4种结构;亚细胞定位结果发现,其编码蛋白位于细胞核;分析超表达转GmC_(2)H_(2)-2like大豆毛状根发现,其根部组织的单位面积胞囊线虫数量显著低于空载体对照,表明GmC_(2)H_(2)-2like具有抑制胞囊线虫的功能。

关键词：大豆胞囊线虫 GmC_(2)H_(2)-2like 生物信息学亚细胞定位

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