检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物防治学报 2024年第5期40卷 1022-1035页

作者：王明越何杉张丽霞王思佳苑志博吴迪王传珍潘佳亮包盛波王琦牛犇东北林业大学林木遗传育种全国重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 中农绿康(北京)生物技术有限公司北京102101 烟台市森林资源监测保护服务中心烟台264000 国家林业和草原局森林和草原病虫害防治总站林草有害生物监测预警国家林业和草原局重点实验室沈阳110034 中国农业大学植物病理学系北京100193

松材线虫病生防细菌路德维希肠杆菌EnterobacterludwigiiAA4能够有效地定殖并杀死松材线虫。大肠杆菌共有型菌毛(Escherichia coli common pilus,ECP)在动植物共生与病原细菌中普遍存在,能够通过增强细菌与宿主细胞之间及生物膜群落中... 详细信息

松材线虫病生防细菌路德维希肠杆菌EnterobacterludwigiiAA4能够有效地定殖并杀死松材线虫。大肠杆菌共有型菌毛(Escherichia coli common pilus,ECP)在动植物共生与病原细菌中普遍存在,能够通过增强细菌与宿主细胞之间及生物膜群落中细菌之间的相互作用,提高共生与病原细菌的定殖能力。大肠杆菌共有型菌毛由ecp基因簇编码。为了探究ecp基因簇在菌株AA4定殖松材线虫中的功能,本研究通过BLAST比对分析,鉴定了菌株AA4中的ecp基因簇;利用Red重组技术构建了菌株AA4的ecp基因簇缺失突变体,并对上述突变体定殖松材线虫的能力与定殖相关表型进行了分析。研究结果表明,ecp基因簇缺失突变体菌毛装配能力显著减弱,运动性、生物膜形成能力以及在松材线虫上的定殖能力显著降低。因此,AA4的ecp基因簇可能通过调节菌毛装配,影响其运动性与生物膜形成能力,进而实现对菌株AA4定殖松材线虫的调控。上述研究结果将为揭示松材线虫病生防路德维希肠杆菌AA4定殖松材线虫的分子机制奠定理论基础,为松材线虫病生防微生物制剂的研发与高效应用提供科学依据。

关键词： ecp基因簇菌毛路德维希肠杆菌松材线虫定殖

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木豆类黄酮代谢通路关键基因家族的鉴定与表达分析

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农业生物技术学报 2021年第12期29卷 2289-2303页

作者：杜婷婷宋治华董碧莹曹红燕刘腾跃杨琬珑祁萌陈婷王梦莹孟冬杨清付玉杰北京林业大学林学院北京林业大学林木分子育种高精尖创新中心东北林业大学林业植物生态学教育部重点实验室

黄酮类化合物是植物体内重要的次生代谢产物,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中均发挥着重要作用。木豆(Cajanus cajan)是一种生长在喀斯特地域高酸铝土壤的木本豆科先锋树种,富含多种类黄酮等次生代谢物。本研究针对鉴定类黄酮生物合成... 详细信息

黄酮类化合物是植物体内重要的次生代谢产物,在植物生长发育和抵御逆境胁迫中均发挥着重要作用。木豆(Cajanus cajan)是一种生长在喀斯特地域高酸铝土壤的木本豆科先锋树种,富含多种类黄酮等次生代谢物。本研究针对鉴定类黄酮生物合成的关键通路,筛选和鉴定了木豆中8类关键酶基因家族,分别是苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase, PAL)、肉桂酸4-羟化酶(cinnamic acid-4-hydroxylase, C4H)、4-香豆酸辅酶A连接酶(4-coumarate-CoA ligase, 4CL)、查尔酮合成酶(chalcone synthase, CHS)、查尔酮异构酶(chalcone isomerase, CHI)、黄烷酮-3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase, F3H)、黄酮醇合成酶(flavonol synthase, FLS)、二氢黄酮醇4-还原酶(dihydroflavonol 4-reductase, DFR),并利用生物信息学软件对其进行了系统发育、基因结构、蛋白结构和启动子顺式作用元件分析以及胁迫条件下的代谢通路基因表达调控分析。系统进化分析显示,PAL、C4H、4CL、CHI基因家族中的部分成员能够与大豆(Glycine max)中的基因聚类在一起,而CHS、FLS、DFR基因家族中仅体现出家族内部成员之间存在序列相似性。蛋白结构分析表明,每个基因家族均含有特殊的保守结构域。启动子顺式作用元件分析结果显示,6类基因家族中含茉莉酸甲酯(MeJA)响应元件的基因占总基因的50%以上。同时,针对木豆的生境特点,本研究对其在铝胁迫和茉莉酸甲酯处理下的8类基因家族进行了RNA-seq分析,结果显示铝胁迫处理下,相对表达量较高的CcPAL2、CcC4H1、CcCHS5～7和CcCHS12均显著上调,而CcCHI4～5和CcFLS7均呈现明显下调趋势,表明铝胁迫下木豆的查尔酮可能积累,推测其可能在抗铝方面发挥一定作用。MeJA处理中,CcC4H1、CcCHS5、CcCHS7、CcCHI4显著上调,而CcF3H下调为对照的0.6倍;同时,下游分支通路中的CcFLS1、CcFLS5、CcFLS6均显著上调,以上结果表明MeJA也可能促进了柚皮素和黄酮醇的积累,推测该物质可能在MeJA信号调控通路中可能发挥着重要作用。以上类黄酮生物合成酶基因在不同阶段的表达变化经qPCR验证与转录组测序结果一致。本研究揭示了类黄酮生物合成关键酶在不同胁迫下的表达模式,为进一步探究查尔酮、黄酮醇等类黄酮物质在逆境胁迫中的调控作用提供参考依据。

关键词：类黄酮代谢通路基因家族分析铝胁迫茉莉酸甲酯处理

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镉胁迫下美洲黑杨无性系‘中菏1号’转录组分析

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北京林业大学学报 2021年第7期43卷 12-21页

作者：宋润先李翔毛秀红王丽陈香丽姚俊修赵曦阳李善文东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 山东省林业科学研究院山东省林木遗传育种改良重点实验室山东济南250014 山东省林业监测规划院山东济南250014 单县国有故道林场山东单县274300

【目的】通过转录组测序和分析,发掘美洲黑杨无性系‘中菏1号’耐镉关键功能基因,揭示美洲黑杨在镉胁迫下的响应机制。【方法】以‘中菏1号’为试验材料,通过沙培试验法对处在不同质量浓度(0 mg/L(ZH1C0),10 mg/L(ZH1C1),20 mg/L(ZH1C2)... 详细信息

【目的】通过转录组测序和分析,发掘美洲黑杨无性系‘中菏1号’耐镉关键功能基因,揭示美洲黑杨在镉胁迫下的响应机制。【方法】以‘中菏1号’为试验材料,通过沙培试验法对处在不同质量浓度(0 mg/L(ZH1C0),10 mg/L(ZH1C1),20 mg/L(ZH1C2))Cd^(2+)环境下的无性系进行胁迫处理,而后采集叶片,提取RNA,并使用Illumina HiSeqTM2500系统对转录组进行高通量测序。【结果】主成分分析确定PC1作为区分不同Cd^(2+)浓度样本的标准;经过差异表达分析,在ZH1C0和ZH1C2之间共检测到4109条差异基因,其中2741条基因显著上调表达,1368条基因显著下调表达;在ZH1C1和ZH1C2之间检测到3710条差异基因,其中1969条基因显著上调表达,1741条基因显著下调表达;不同数据库之间的注释表明Cd^(2+)不仅会影响叶绿体、线粒体等细胞器的微结构,而且会干扰光合作用和呼吸作用中的电子传递。转录因子分析发现,WRKY、MYB、ZIP、ERF、bHLH在镉胁迫响应和耐受中具有重要作用。【结论】在‘中菏1号’中,异戊二烯化植物蛋白在阻止Cd^(2+)进入细胞内部发挥了重要作用;谷胱甘肽不仅可以促进细胞内Cd^(2+)的螯合,还可以缓解细胞内的氧化胁迫;ABC家族蛋白和MATE家族蛋白是‘中菏1号’体内转移Cd^(2+)螯合蛋白的关键载体。

关键词：镉胁迫美洲黑杨无性系‘中菏1号’ 转录组

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斜盖伞诱导子促进灵芝三萜积累及其调控机制

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菌物学报 2023年第6期42卷 1370-1385页

作者：张宇薇廖望仪宋荣孝彭龙袁志林中国林业科学研究院林木遗传育种国家重点实验室北京100091 南京林业大学林学院江苏南京210037 中国林业科学研究院亚热带林业研究所浙江杭州311400 浙江物产长乐创龄生物科技有限公司浙江杭州311400

近年来,灵芝产业高速发展,但其主要药效成分灵芝三萜的含量较低,是影响其品质的重要原因,因此探索一种提高灵芝三萜含量的生物技术手段极具应用前景。本研究以6株斜盖伞Clitopilus spp.真菌为材料分别制备多种类型的真菌诱导子,将其添... 详细信息

近年来,灵芝产业高速发展,但其主要药效成分灵芝三萜的含量较低,是影响其品质的重要原因,因此探索一种提高灵芝三萜含量的生物技术手段极具应用前景。本研究以6株斜盖伞Clitopilus spp.真菌为材料分别制备多种类型的真菌诱导子,将其添加到灵芝菌丝体液体摇瓶中,研究对灵芝菌丝体生物量和灵芝三萜积累的影响。其中,Clitopilus ***-YX-7-A的高压灭菌发酵液(HSLFB)、*** NL-19的菌丝干粉(NL-19DMP)、*** 84496的发酵液提取物(84496 FBE)和Clitopilus ***-YX-7-A的菌丝提取物(HSL ME)显著提高了灵芝菌丝体生物量和灵芝三萜含量,相对于对照组,生物量分别提高了450.09%、64.64%、46.97%和66.14%,灵芝三萜分别提高了53.01%、25.58%、25.17%和20.47%,灵芝三萜总产量则分别提高了585.15%、104.65%、86.43%和110.45%。进一步研究表明,经HSL FB、NL-19 DMP和HSL ME处理后,灵芝三萜生物合成途径关键酶基因hmgs、hmgr、mvd、fps、sqs和osc的表达量显著上调;但84496 FBE处理之后仅上调了hmgs和sqs的表达量。且6个基因的平均表达量与灵芝三萜总产量的提升率呈显著的正相关性(R^(2)=0.972,P<0.05)。本研究证实了斜盖伞诱导子能够有效提升灵芝菌丝体生物量和灵芝三萜含量,其中*** NL-19和Clitopilus ***-YX-7-A均为栎类树种的根系共生菌。本研究进一步为开发斜盖伞真菌作为微生物菌剂提供了基础,同时为提高栎树人工林的生产力和创建“以菌养菌”的药用真菌品质提升技术体系提供了重要策略。

关键词：斜盖伞真菌真菌诱导子灵芝三萜生物合成诱导机制

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11个杨树品种SSR指纹图谱构建及遗传关系研究

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西北林学院学报 2023年第2期38卷 107-112页

作者：贯春雨陈肃邢政华李树森王福森齐齐哈尔大学黑龙江齐齐哈尔161001 东北林业大学林木遗传育种与生物技术教育部重点实验室黑龙江哈尔滨150040 黑龙江省林业科学院齐齐哈尔分院黑龙江齐齐哈尔161005

利用杨树基因组序列设计的SSR引物对11份杨树品种材料进行遗传多样性分析,并构建指纹图谱。结果表明,共27对引物具有多态性,引物多态性比率占69.23%;获得多态性谱带38个,多态性比率为84.4%。SSR遗传多样性分析结果为,有效等位基因数平均... 详细信息

利用杨树基因组序列设计的SSR引物对11份杨树品种材料进行遗传多样性分析,并构建指纹图谱。结果表明,共27对引物具有多态性,引物多态性比率占69.23%;获得多态性谱带38个,多态性比率为84.4%。SSR遗传多样性分析结果为,有效等位基因数平均值1.5789,基因多样性指数平均值为0.3217,Shannon多样性指数平均值为0.4714。11份杨树品种的遗传距离0.53~0.93,平均值为0.73。聚类分析表明,在遗传距离0.76处可将所有供试材料分为5个类群,分别包含2、4、2、1、2份供试材料。研究表明,供试材料遗传多样性较高;利用SSR标记构建了不同杨树利用的指纹图谱,可用于杨树品种间的鉴定。研究结果可为杨树品种知识产权保护和杂交育种提供理论依据。

关键词：杨树分子标记 SSR 遗传多样性聚类分析

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FmJAZ1基因瞬时侵染水曲柳对JA通路相关基因表达的影响

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广西植物 2021年第4期41卷 662-670页

作者：杨少彤刘宗林屈申于磊詹亚光东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

该文对水曲柳JAZ蛋白家族的一员FmJAZ1的功能及对其上下游基因影响进行了初步分析。首先,利用无缝克隆的方法构建FmJAZ1-pROK2-GUS过表达载体,利用三亲杂交的方法将载体转入农杆菌;然后,使用农杆菌对水曲柳组培苗进行瞬时侵染,得到FmJAZ... 详细信息

该文对水曲柳JAZ蛋白家族的一员FmJAZ1的功能及对其上下游基因影响进行了初步分析。首先,利用无缝克隆的方法构建FmJAZ1-pROK2-GUS过表达载体,利用三亲杂交的方法将载体转入农杆菌;然后,使用农杆菌对水曲柳组培苗进行瞬时侵染,得到FmJAZ1过表达的侵染苗;最后,在侵染后36 h使用茉莉酸合成途径抑制剂(DIECA)对侵染苗进行处理,分别取0、1、3、6、18、21、24 h七个时间点的样品,通过荧光定量PCR对FmJAZ1、FmJAZ2、GL1、EIN3、MYC25个基因的表达进行了分析。结果表明:农杆菌瞬时侵染水曲柳幼苗后,FmJAZ1表达显著升高,为空载侵染的3.2倍,说明FmJAZ1瞬时转入水曲柳并完成基因表达,侵染有效。经过DIECA处理的侵染苗FmJAZ1的相对表达量初期下降并出现明显波动,18 h后恢复平稳,证明它是JA通路的作用基因。同时检测了4个JA通路相关基因的表达,在1 h时JAZ2、GL1表达下调,其余均有轻微上调,随后各基因表达均有上调。FmJAZ1瞬时转化水曲柳后FmJAZ1过表达,说明瞬时侵染有效;DIECA处理后FmJAZ1表达显著下调说明FmJAZ1的合成受JA调控。在水曲柳中,FmJAZ1抑制转录因子GL1、EIN3、MYC2、FmJAZ2的表达,且FmJAZ2的合成也受JA调控。综上结果表明,JAZs不仅调节JA通路的关键蛋白,还参与其他信号通路的调节,最终通过体内JA的表达与其他相关信号分子的协同表达来调节植物的生长发育及其对应激的反应。

关键词：水曲柳 FmJAZ1 基因瞬时侵染 JA通路基因表达

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“互联网+专题研讨”研究生教学模式的探讨——以最新分子生物学原理与技术课程为例

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黑龙江畜牧兽医 2021年第9期 156-160页

作者：许志茹曲春浦徐启江安铁洙刘关君东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 东北林业大学东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

最新分子生物学原理与技术是生命科学学院硕士研究生的专业必修课程,不仅可以让学生了解及掌握生命科学领域最新的研究技术和方法,还可以为硕士期间的科研工作提供指导。为了适应"互联网+"时代高等教育教学改革的新趋势及硕... 详细信息

最新分子生物学原理与技术是生命科学学院硕士研究生的专业必修课程,不仅可以让学生了解及掌握生命科学领域最新的研究技术和方法,还可以为硕士期间的科研工作提供指导。为了适应"互联网+"时代高等教育教学改革的新趋势及硕士研究生大类招生的培养目标,提高课程的课堂教学质量,笔者从教学内容、教学方法、教学过程及考核方式等方面进行研究和实践,综合评价了最新分子生物学原理与技术课程"互联网+专题研讨"教学模式在培养学生及时追踪学科发展前沿意识、创新思维、自主学习能力等方面的作用。结果"互联网+专题研讨"教学模式激发了硕士研究生的课程学习和追踪学科前沿进展的兴趣,培养了学生团结协作、分析问题和解决问题的能力,为开展相关研究工作奠定了坚实基础。同时,此教学模式的实施也提高了教师的课堂教学质量和教学效果。

关键词：最新分子生物学原理与技术 “互联网+专题研讨” 教学模式课程体系考核方式

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拟南芥和水稻葡萄糖磷酸变位酶基因家族的生物信息学分析

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分子植物育种 2025年第3期23卷 705-713页

作者：曹丽王晗慧孙敬彭于耸郑志民东北林业大学生命科学学院东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

葡萄糖磷酸变位酶(phosphoglucomutase,PGM)属于磷酸己糖变位酶家族,其主要功能是高度特异的催化葡萄糖-1-磷酸(Glc-1-P)和葡萄糖-6-磷酸(Glc-6-P)的相互转化,尤其在蔗糖的代谢和淀粉的合成中发挥着至关重要的作用。为了进一步研究单子... 详细信息

葡萄糖磷酸变位酶(phosphoglucomutase,PGM)属于磷酸己糖变位酶家族,其主要功能是高度特异的催化葡萄糖-1-磷酸(Glc-1-P)和葡萄糖-6-磷酸(Glc-6-P)的相互转化,尤其在蔗糖的代谢和淀粉的合成中发挥着至关重要的作用。为了进一步研究单子叶和双子叶植物中PGMs基因家族的功能,本研究以拟南芥和水稻为代表,采用生物信息学的手段,详细地分析了AtPGMs和OsPGMs基因家族的理化性质、蛋白质结构、亚细胞定位、保守基序、系统进化以及组织表达特异性情况。结果表明,拟南芥和水稻中的PGMs基因家族具有较高的相似性,A tPGMs和OsPGMs编码的蛋白均为亲水性蛋白。系统发育树分析显示,AtPGMs和OsPGMs家族基因在进化上分成两个大的分支,并且具有较高的保守性,均含有预测的8个保守基序;AtPGMs和OsPGMs蛋白质均以无规卷曲和α-螺旋为主要的二级结构成分;蛋白质磷酸化预测结果显示,磷酸化数目最多的均为丝氨酸,最少的均为酪氨酸。组织表达分析显示,拟南芥PGMs基因家族在幼苗、叶、芽和角果中具有相对较高的表达量,OsPGMs在子房、胚和茎中具有相对较高的表达量。本研究为进一步探索高等植物PGMs基因家族的生物学功能提供一定的理论基础和参考依据。

关键词： PGMs 拟南芥(A rabidopsis thaliana) 水稻(Oryza sativa) 基因家族生物信息学

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文冠果DREB转录因子家族鉴定及非生物胁迫表达分析

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分子植物育种 2023年第15期21卷 4948-4961页

作者：陆昕苟亚夫李显玉乌志颜关岛杨素芝李英爽郑志民东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 赤峰市林业科学研究所赤峰024000 国家林业草原文冠果工程技术研究中心赤峰024000 赤峰市林业和草原局赤峰024000 赤峰市森林草原保护发展中心赤峰024000

转录因子(TF)对于调节植物靶基因的表达起到关键作用。脱水响应元件结合因子(DREB)是植物特异性转录因子家族,其成员参与调控植物对各种非生物胁迫的反应。然而,DREB家族尚未在油料树种文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)中得以鉴定... 详细信息

转录因子(TF)对于调节植物靶基因的表达起到关键作用。脱水响应元件结合因子(DREB)是植物特异性转录因子家族,其成员参与调控植物对各种非生物胁迫的反应。然而,DREB家族尚未在油料树种文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)中得以鉴定,文冠果是中国北方最重要的耐逆树种之一。因此,本研究旨在以文冠果全基因组测序数据为基础,系统鉴定并表征文冠果中的DREB家族成员,利用转录组测序的方法分析XsDREB基因对于非生物胁迫的特异性响应。在本研究共获得54个文冠果DREB家族成员,它们均编码AP2结构域且大多数成员基因中缺乏内含子,可根据系统发育情况分为6个亚组。此外,RNA-seq结果显示14个XsDREB基因在冷胁迫下上调或下调,8个基因被发现参与盐胁迫响应。本研究结果为进一步研究文冠果DREB基因的功能奠定了基础,并将有利于文冠果的遗传改良。

关键词：文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge) DREB 转录因子系统发育分析非生物胁迫响应

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PtrWRKY51基因的克隆及抗旱表达特性分析

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植物研究 2022年第6期42卷 1005-1013页

作者：黄安瀛夏德安张洋那冬晨燕青魏志刚国家林业和草原局盐碱地研究中心北京100091 国家林业和草原局桉树研究开发中心湛江524022 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 山西师范大学生命科学学院临汾041000

为明确毛果杨WRKY家族成员PtrWRKY51基因功能,以Nisqually-1株系毛果杨为模板,克隆得到PtrWRKY51基因CDS序列。通过生物信息学分析,结合酵母自激活验证、亚细胞定位及模拟干旱胁迫下的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PtrWRKY51基因功能进行... 详细信息

为明确毛果杨WRKY家族成员PtrWRKY51基因功能,以Nisqually-1株系毛果杨为模板,克隆得到PtrWRKY51基因CDS序列。通过生物信息学分析,结合酵母自激活验证、亚细胞定位及模拟干旱胁迫下的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PtrWRKY51基因功能进行初步研究。结果表明:PtrWRKY51全长579 bp,编码192 aa。生物信息学分析及亚细胞定位试验结果表明,PtrWRKY51蛋白为非跨膜碱性不稳定亲水蛋白,定位于细胞核,含有WRKY家族特有的保守结构域,是第IIc类WRKY转录因子;酵母自激活验证试验表明PtrWRKY51基因具有自激活活性;qRT-PCR分析表明,8%PEG6000模拟干旱胁迫下,该基因在胁迫12 h后茎部与叶部相对表达量达到最大值,根部则出现在24 h,研究可为PtrWRKY51抗逆及生物学功能进一步研究提供参考。

关键词：毛果杨 PtrWRKY51 生物信息学酵母自激活亚细胞定位抗旱表达分析

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