检索结果-内蒙古大学图书馆

植物研究 2019年第1期39卷 139-147页

作者：丁一巍詹亚光张佳薇何利明东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

为初步探究水曲柳根发育中PLT转录因子的基因功能及遗传调控机理,以水曲柳转录组数据为基础,参考拟南芥AtPLT2和AtPLT3基因序列,通过PCR技术从水曲柳中克隆了两个PLT转录因子基因,通过同源比对将它们命名为FmPLT2和FmPLT3,分别编码532和... 详细信息

为初步探究水曲柳根发育中PLT转录因子的基因功能及遗传调控机理,以水曲柳转录组数据为基础,参考拟南芥AtPLT2和AtPLT3基因序列,通过PCR技术从水曲柳中克隆了两个PLT转录因子基因,通过同源比对将它们命名为FmPLT2和FmPLT3,分别编码532和497个氨基酸残基。生物信息学分析表明,其相对分子质量分别为59和55kDa,等电点分别为5.98和5.79,均为亲水性不稳定蛋白,均含有2个AP2保守结构域。系统进化分析结果显示,其与同属木犀科的油橄榄OePLT2和OeOLT3转录因子的同源性最高,亲缘关系最近。亚细胞定位预测显示,FmPLT2和FmPLT3蛋白都主要集中于细胞核中。通过qRT-PCR技术分析FmPLT2和FmPLT3在不同组织部位及生根期间的表达情况,结果表明:FmPLT2和FmPLT3具有相似的组织特异性表达,在根中表达含量均最高,在叶中的表达含量均最低;FmPLT2在生根期间的表达量变化极为显著,21天时的表达量是0天时的32倍,但FmPLT3的表达量变化并不显著,表明FmPLT2不仅在根发育中起重要作用,还可能参与细胞增殖和生长等多个发育途径。

关键词：水曲柳 PLT转录因子基因克隆表达分析根发育

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水曲柳FmWRKY44基因克隆及表达分析

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植物研究 2019年第4期39卷 529-538页

作者：李新宇何利明詹亚光东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

克隆水曲柳FmWRKY44基因,探究其在非生物胁迫和激素胁迫中的作用。利用水曲柳干旱转录组序列设计特异引物,克隆FmWRKY44基因的完整ORF序列,并对该序列及其编码产物进行生物信息学分析,采用qRT-PCR技术分析FmWRKY44表达模式。克隆了一个... 详细信息

克隆水曲柳FmWRKY44基因,探究其在非生物胁迫和激素胁迫中的作用。利用水曲柳干旱转录组序列设计特异引物,克隆FmWRKY44基因的完整ORF序列,并对该序列及其编码产物进行生物信息学分析,采用qRT-PCR技术分析FmWRKY44表达模式。克隆了一个水曲柳WKRY基因,编码区长1383bp,编码460氨基酸。对其编码蛋白分析发现其为稳定亲水蛋白,亚细胞定位预测主要在细胞核,进行保守域及同源性分析分析,属于WRKYⅠ类家族,命名为FmWRKY44。qRT-PCR分析发现,FmWRKY44在种子中高度表达,并不同程度响应低温、高温、盐和干旱4种非生物胁迫。同时发现FmWRKY44与NAA、ABA、GA3、JA植物激素响应,水曲柳FmWRKY44基因积极响应低温、高温胁迫。

关键词：水曲柳 WRKY基因基因克隆表达分析

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杨树重金属相关异戊二烯化植物蛋白(HIPPs)基因的鉴定及表达分析

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植物研究 2019年第6期39卷 935-946页

作者：王琪许志茹陈瑾元张双黄佳欢刘关君东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040

金属伴侣在植物的生理活动中发挥关键作用,负责结合金属离子并将其转运至靶蛋白以维持细胞的金属离子稳态。目前关于HIPP(heavy metal-associated isoprenylated plant protein)金属伴侣蛋白的特性和功能分析多集中于模式植物拟南芥。... 详细信息

金属伴侣在植物的生理活动中发挥关键作用,负责结合金属离子并将其转运至靶蛋白以维持细胞的金属离子稳态。目前关于HIPP(heavy metal-associated isoprenylated plant protein)金属伴侣蛋白的特性和功能分析多集中于模式植物拟南芥。本研究在毛果杨(Populus trichocarpa)中鉴定了14个PtHIPPs蛋白,均具有两个保守的金属离子结合基序MXCXXC,氨基末端可以形成βαββαβ二级结构,羧基末端具有保守的异戊二烯化基序;一些PtHIPPs还具有赖氨酸和/或甘氨酸富集区。根据基因结构、蛋白质的保守基序和进化树分析,PtHIPPs蛋白可分为3个亚组。PlantGenIE的组织特异性表达数据及荧光定量PCR鉴定结果显示,毛果杨PtHIPPs基因及小黑杨(Populus simonii×Populus nigra)PnHIPPs基因具有特定的组织表达特异性且存在差异。此外,利用缺铜及过量铜离子处理小黑杨植株不同时间后,不同组织部位中PnHIPPs基因的表达模式发生改变。本研究为鉴定木本模式植物杨树HIPPs蛋白在维持铜离子稳态过程中发挥的作用提供了参考依据。

关键词：杨树 HIPPs蛋白生物信息学分析铜胁迫基因表达

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杨树天冬氨酸转氨酶基因家族鉴定及表达分析

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南方农业学报 2019年第3期50卷 506-514页

作者：王宇晨曲春浦刘关君东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

【目的】鉴定杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT)基因家族成员,并检测其组织表达特异性,为研究ASPAT在杨树初级氮素同化中的生物学功能提供参考依据。【方法】从杨树基因组数据库中筛选鉴定ASPAT基因家族成员,利用生物信息学软件分析各基因家族... 详细信息

【目的】鉴定杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT)基因家族成员,并检测其组织表达特异性,为研究ASPAT在杨树初级氮素同化中的生物学功能提供参考依据。【方法】从杨树基因组数据库中筛选鉴定ASPAT基因家族成员,利用生物信息学软件分析各基因家族成员序列和基因结构及编码蛋白的理化性质、亚细胞定位和保守基序等,并利用实时荧光定量PCR检测正常施氮处理(1 mmol/L NH4NO3)下其在杨树根、茎和叶中的组织表达特异性。【结果】从杨树基因组中共鉴定出9个ASPAT基因家族成员,包括7个真核型ASPAT(AAT)基因(PtASPAT1～PtASPAT7)和2个原核型ASPAT(PAT)基因(PtASPAT8～PtASPAT9),编码区(CDS)序列长度1215～1791 bp,编码的氨基酸数目304～480个,外显子数7～14个,编码蛋白的等电点5.66～8.99,相对分子质量33.11～53.31 kD,脂融指数76.36～93.54,分别定位于叶绿体、线粒体和胞质中,除PtASPAT6和PtASPAT7为不稳定蛋白,其他均为稳定蛋白。拟南芥和杨树的ASPAT蛋白可聚为两大类,Ⅰ类为AAT蛋白,包括PtASPAT1～PtASPAT7和AtASPAT1～AtASPAT5;Ⅱ类为PAT蛋白,包括PtASPAT8、PtASPAT9和拟南芥PAT(AtPAT)。PtASPAT1～PtASPAT6均含有5个保守基序,PtASPAT7缺少2个保守基序,PtASPAT8和PtASPAT9均仅含有1个与AtPAT相同的保守基序。9个杨树ASPAT蛋白均含有磷酸吡哆醛结合位点(SGTHNYSSK)、同源二聚体多肽结合位点(GAVAER)和催化残留活性位点(K)。正常氮素处理下,PtASPAT1基因在杨树根、茎和叶中表达量无明显差异;PtASPAT2～PtASPAT9基因在根部的表达量较在茎和叶中的高,尤其是PtASPAT4和PtASPAT8基因表达量较高。【结论】杨树ASPAT基因家族成员主要在根部表达,尤其是PtASPAT4和PtASPAT8基因在杨树根部的初级氮素同化中发挥重要作用。

关键词：杨树天冬氨酸转氨酶(ASPAT) 基因家族生物信息学基因表达

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杨树PtBBE9a基因异源过表达功能分析

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江苏农业科学 2020年第23期48卷 66-70页

作者：施天元程玉祥东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040

小檗碱桥酶(berberine bridge enzyme,简称BBE)是一类典型的黄素双共价氧化酶家族,参与植物生长发育的多个生物过程。PtBBE9a是笔者所在课题组前期从杨树发育木质部分离、鉴定的糖蛋白。PtBBE9a基因表达在杨树木质部呈现高丰度水平,并... 详细信息

小檗碱桥酶(berberine bridge enzyme,简称BBE)是一类典型的黄素双共价氧化酶家族,参与植物生长发育的多个生物过程。PtBBE9a是笔者所在课题组前期从杨树发育木质部分离、鉴定的糖蛋白。PtBBE9a基因表达在杨树木质部呈现高丰度水平,并且随着茎木质化程度的增强而升高。组织β-葡萄糖苷酸酶(GUS)活性染色结果显示,PtBBE9a启动子活性集中在ProPtBBE9a::GUS转基因拟南芥幼苗的顶端分生组织、成熟果荚皮及根组织。通过构建PtBBE9a-GFP过表达载体发现,PtBBE9a过表达拟南芥比野生型拟南芥早开花。进一步研究发现,转基因拟南芥的叶片数少于野生型拟南芥,而其茎木质素含量高于野生型拟南芥。推测PtBBE9a可能通过调控拟南芥生长发育周期而产生早花表型。

关键词：杨树 PtBBE9a基因异源过表达启动子转基因拟南芥 BBE

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植物环状RNA研究进展

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安徽农业科学 2021年第15期49卷 4-9页

作者：赵佳明樊二勤王智王军辉曲冠证东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室楸树国家创新联盟北京100091 中国检验检疫科学研究院北京100176

环状RNA(circular RNA,circRNA)主要是真核细胞通过反向剪接作用使3′末端和5′末端共价结合而形成的一条单链非编码RNA分子,它是一种特殊的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),在多种生物体中广泛存在。综述了植物中circRNA鉴定方法、分... 详细信息

环状RNA(circular RNA,circRNA)主要是真核细胞通过反向剪接作用使3′末端和5′末端共价结合而形成的一条单链非编码RNA分子,它是一种特殊的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),在多种生物体中广泛存在。综述了植物中circRNA鉴定方法、分子特征以及潜在的生物学功能等方面,表明circRNA可能在生物胁迫、非生物胁迫以及生长和发育中发挥重要作用,并以动物中circRNA的研究进展为基础,对植物中circRNA的局限性和应用前景进行讨论。

关键词：环状RNA 非编码RNA circRNA鉴定分子特征生物学功能

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生防细菌杀松材线虫的作用机制及应用

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中国森林病虫 2021年第4期40卷 26-33页

作者：张弘弢赵宇李晓岩牛犇东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 牡丹江师范学院化学化工学院黑龙江牡丹江157011

由松材线虫Bursaphelenchus xylophilus引起的松树枯萎病是一种世界性森林病害,严重威胁松属Pinus植物的健康。生防细菌可以通过多种作用方式杀死松材线虫,如产生毒素、分泌胞外蛋白酶消解线虫体表组织、干扰线虫行为模式以及捕食线虫... 详细信息

由松材线虫Bursaphelenchus xylophilus引起的松树枯萎病是一种世界性森林病害,严重威胁松属Pinus植物的健康。生防细菌可以通过多种作用方式杀死松材线虫,如产生毒素、分泌胞外蛋白酶消解线虫体表组织、干扰线虫行为模式以及捕食线虫与动员真菌捕食线虫等。围绕上述几种主要作用机制,介绍生防细菌杀线虫作用机理研究的最新进展以及杀线菌株在松材线虫病防治中的应用现状,指出生防细菌杀线虫的作用机理研究与应用中存在的问题,展望未来杀线虫机理研究与松材线虫病生防细菌制剂的研发前景。

关键词：松材线虫生防细菌作用机制应用

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刚毛柽柳S-腺苷甲硫氨酸合成酶(ThSAMS)基因的克隆及表达分析

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植物研究 2019年第1期39卷 113-122页

作者：张悦赵鑫侯峥王艳敏王玉成王超东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 黑龙江省林业科学研究所哈尔滨150081

通过对刚毛柽柳转录组分析,克隆获得了一条与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性高的基因,命名为ThSAMS。序列分析结果表明:ThSASM基因全长cDNA为1185bp,编码394个氨基酸,编码蛋白相对分子质量为97.85kDa,理论等电点为5.02。通过生... 详细信息

通过对刚毛柽柳转录组分析,克隆获得了一条与S-腺苷甲硫氨酸合成酶(SAMS)基因同源性高的基因,命名为ThSAMS。序列分析结果表明:ThSASM基因全长cDNA为1185bp,编码394个氨基酸,编码蛋白相对分子质量为97.85kDa,理论等电点为5.02。通过生物信息学分析表明,ThSASM基因编码的氨基酸与其他物种SAMS基因编码的氨基酸具有很高的同源性,其中与枣的同源性最高,达95%。实时荧光定量PCR(quantitativereal-timePCR,qRT-PCR)分析表明,ThSASM表达受NaCl、聚乙二醇(PEG)和ABA处理做出应答,暗示ThSASM可能参与了刚毛柽柳对盐和干旱的胁迫应答,为进一步研究SAMS基因在植物胁迫应答中的功能及作用机制提供了参考依据。

关键词：刚毛柽柳 ThSAMS基因 S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因表达

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170个红松无性系生长及结实性状变异及选择

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林业科学研究 2019年第1期32卷 58-64页

作者：蒋路平王景源张鹏梁德洋张秦徽王碧莹裴晓娜赵曦阳林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学林学院黑龙江哈尔滨150040 吉林省临江林业局吉林临江134600

[目的]选育高产、优质红松无性系营建坚果用材林。[方法]以吉林省临江林业局闹枝林场170个红松无性系为材料,对38年生树高、胸径、单株材积、单株球果数、单塔出籽量、单株出籽量、千粒质量、球果鲜质量和发芽率进行测定分析。[结果]方... 详细信息

[目的]选育高产、优质红松无性系营建坚果用材林。[方法]以吉林省临江林业局闹枝林场170个红松无性系为材料,对38年生树高、胸径、单株材积、单株球果数、单塔出籽量、单株出籽量、千粒质量、球果鲜质量和发芽率进行测定分析。[结果]方差分析结果表明:除发芽率外(P=0.280),无性系间各性状差异均达到极显著水平(P<0.01);无性系间各指标表型变异系数变化范围为3.57%～66.09%;除发芽率外(0.07),各性状重复力均超过0.45;树高、胸径和单株材积间达到极显著正相关(0.680遗传增益分别为79.42%和32.20%;根据结实性状对无性系进行评价,初选出的17个无性系千粒质量和单株出籽量的遗传增益分别为2.19%～142.99%;结合生长和结实性状对无性系进行评价选择,初选的17个无性系各指标遗传增益变化范围为2.23%～137.44%。[结论]综合上述结果,利用生长性状、结实性状及生长与结实相结分别初选出适用于不同育种目标的17个优良无性系,其中无性系138均被选出,表明该无性系生长及结实均较优良。

关键词：红松生长性状结实性状变异重复力遗传增益

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小黑杨基因组的初步组装及SSR信息分析

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植物研究 2019年第1期39卷 156-160页

作者：周玉敏王遂刘轶李开隆由香玲湖北生态工程职业技术学院武汉430200 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

小黑杨是人们以小叶杨和欧洲黑杨为亲本培育出的杂交种,兼具双亲生长速度快、抗性强的优点。本研究通过二代测序技术,对小黑杨进行全基因组测序,初步组装出小黑杨基因组,并以此为基础,识别分析其SSR序列,为小黑杨品种划分、表型性状关... 详细信息

小黑杨是人们以小叶杨和欧洲黑杨为亲本培育出的杂交种,兼具双亲生长速度快、抗性强的优点。本研究通过二代测序技术,对小黑杨进行全基因组测序,初步组装出小黑杨基因组,并以此为基础,识别分析其SSR序列,为小黑杨品种划分、表型性状关联等提供参考。结果表明,共组装得到了366 876条总计368.96 Mbp的contig序列;对其中不小于2 000 bp的21 788条的非冗余contig进行SSR分析,共识别出18 111条SSR序列,其中一、二、三核苷酸重复基序较多。对得到的SSR序列设计引物,共得到12 838对引物,供今后实验使用。

关键词：小黑杨基因组 SSR

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