检索结果-内蒙古大学图书馆

大豆U6启动子(YT9)在CRISPR/Cas9基因组编辑体系中的功能分析

分子植物育种 2023年第4期21卷 1189-1195页

作者：王怡婷赵莹李思琪于耸郑志民东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 东北农业大学农学院哈尔滨150030

CRISPR/Cas9基因编辑系统是一项可对基因组进行定点修饰的技术,其中U6启动子是该系统中驱动sg RNA转录的重要元件。为了筛选出适用于大豆CRISPR/Cas9系统的U6启动子,本研究利用早期以大豆U6启动子(命名为YT9)驱动sg RNA转录,以八氢番茄... 详细信息

CRISPR/Cas9基因编辑系统是一项可对基因组进行定点修饰的技术,其中U6启动子是该系统中驱动sg RNA转录的重要元件。为了筛选出适用于大豆CRISPR/Cas9系统的U6启动子,本研究利用早期以大豆U6启动子(命名为YT9)驱动sg RNA转录,以八氢番茄红素脱氢酶基因(GmPDS11和GmPDS18)为靶标基因构建的CRISPR/Cas9基因编辑载体,通过大豆子叶节途径进行遗传转化,结合表型观察、PCR产物测序等确认YT9启动子在基因编辑体系中的效果。结果表明,以大豆YT9启动子构建的CRISPR/Cas9基因编辑体系能够靶向敲除GmPDS11和GmPDS18双基因,双突变率达到3.8%,说明基于该启动子的CRISPR/Cas9基因编辑系统可以实现大豆靶向基因编辑功能,为优化大豆CRISPR/Cas9基因编辑体系提供基础。

关键词：大豆 GmU6 CRISPR/Cas9 转化率

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基于SSR标记的圆叶桉遗传多样性分析

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中南林业科技大学学报 2024年第10期44卷 157-164页

作者：赵婧仪漆晓晖曲冠证吴友军李卓周长品东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 中国林业科学研究院热带林业研究所热带林业研究国家林业和草原局重点实验室广东广州510520 阳江市国有阳江林场广东阳江529500

【目的】摸清国内圆叶桉Eucalyptus pulverulenta花卉资源遗传多样性概况,为种质资源利用及分子育种提供参考。【方法】利用多态性高的15个SSR标记,对7个来源的59株圆叶桉进行SSR基因分型和遗传多样性分析。【结果】1)59株圆叶桉在15个... 详细信息

【目的】摸清国内圆叶桉Eucalyptus pulverulenta花卉资源遗传多样性概况,为种质资源利用及分子育种提供参考。【方法】利用多态性高的15个SSR标记,对7个来源的59株圆叶桉进行SSR基因分型和遗传多样性分析。【结果】1)59株圆叶桉在15个SSR标记共检测到83个等位片段数(NA),平均每个标记的等位片段数为5.5个,每个标记的等位片段数2~10个,平均有效等位片段数(NE)2.4个。观测杂合度(HO)和期望杂合度(HE)的平均值为0.401和0.491,多态性信息量(PIC)的平均值为0.455,具有较高的多态性。圆叶桉群体间遗传分化系数(Fst)为0.208,即有20.8%的变异存在于不同群体间;2)个体间遗传距离范围为0.033~0.698,平均为0.377,群体间亲缘关系较近,遗传背景相对单一。圆叶桉群体分为两个亚组,与其天然分布范围一致;3)圆叶桉群体间的遗传一致度为0.533~0.987,来自云南佳艺园艺和云南绿梦花卉的圆叶桉遗传一致度最高,推测二者可能为来源相同的品种。分子方差分析(AMOVA)结果表明个体间变异是方差分量的主要来源。【结论】15个SSR标记遗传多态性较高,可用于圆叶桉的遗传分化研究。个体间的分型结果表明,国内市场上常见的圆叶桉均为有性繁殖的实生苗,不同来源圆叶桉群体间的遗传分化程度较小,遗传变异主要发生在个体间。本研究对圆叶桉进行遗传多样性和遗传结构分析,对种质资源的评价和利用都具有重要意义。

关键词：圆叶桉 SSR标记遗传多样性遗传关系

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油茶巢式交配子代油脂相关性状的遗传分析

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江西农业大学学报 2024年第2期46卷 379-388页

作者：王安妮王开良柴静瑜钟慧奇滕建华张磊俞文仙林萍中国林业科学研究院亚热带林业研究所/林木遗传育种全国重点实验室浙江杭州311400 浙江省林木育种技术研究重点实验室浙江杭州311400 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 浙江省金华市婺城区东方红林场浙江金华321025 浙江省杭州市富阳区农业农村局浙江杭州311400

【目的】探究油茶种内杂交和种间杂交的亲本选配机制,为油茶高含油率杂交育种选育提供指导。【方法】以油茶巢式交配设计的种内、种间杂交子代为材料,分别测定种仁含油率、木质素、纤维素和半纤维素含量,分析母本的一般配合力(GCA)、杂... 详细信息

【目的】探究油茶种内杂交和种间杂交的亲本选配机制,为油茶高含油率杂交育种选育提供指导。【方法】以油茶巢式交配设计的种内、种间杂交子代为材料,分别测定种仁含油率、木质素、纤维素和半纤维素含量,分析母本的一般配合力(GCA)、杂交组合的特殊配合力(SCA),解析重要性状的遗传效应。【结果】12个家系的种仁含油率为17.83%~53.55%,木质素含量为4.68%~18.12%,纤维素含量为3.66%~13.04%,半纤维素含量0.54%~12.20%。种仁含油率、木质素、纤维素和半纤维素含量的差异在组合间和母本内父本间达到了显著水平。含油率和木质素、半纤维素含量呈显著负相关关系,其相关系数为-0.489和-0.297。长林4号种仁含油率的GCA最高,达到1.57。各组合的SCA分析表明,含油率SCA为-6.38~4.28,其中含油率SCA高且其余3个性状SCA低的种内杂交组合有40×95和4×18。种间杂交组合含油率的SCA普遍较低,仅53×小2较高,为2.77。除木质素外,含油率、纤维素、半纤维素含量主要受显性效应控制,非加性方差大于加性方差,说明以这3个性状为目标的杂交育种中评估亲本的SCA比GCA更重要。4个性状的单株遗传力范围为10.84%~58.35%,家系遗传力为4.23%~.21.35%,均受到较强的环境效应影响。【结论】以配合力为参考指标,结合各组合的表型数据,选出可用于油茶高含油杂交种质创制的优良种内杂交组合40×95和4×18,种间杂交组合53×小2。

关键词：普通油茶小果油茶巢式交配设计油脂性状配合力遗传力

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过表达ERF76小黑杨的木材组分分析及影响

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山东林业科技 2023年第4期53卷 1-6页

作者：李鑫廖诗贤王宇婷姜廷波东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040

通过对过表达ERF76小黑杨木材的各项化学组分进行了相关检测并结合转录组数据FC对不同转基因株系化学组分存在的差异现象进行了相关解释并总结了FC与纤维素、半纤维素组分占比变化的规律。根据与野生型小黑杨(WT)化学组分差异大小,筛选... 详细信息

通过对过表达ERF76小黑杨木材的各项化学组分进行了相关检测并结合转录组数据FC对不同转基因株系化学组分存在的差异现象进行了相关解释并总结了FC与纤维素、半纤维素组分占比变化的规律。根据与野生型小黑杨(WT)化学组分差异大小,筛选得到ERF76过表达转基因株系(P1)并且比较其两年生与六年生木材化学组分变化,确定了ERF76基因过表达对化学组分的影响伴随植物生长发育并不断累积。针对组分变化的特点实行进一步实验。发现在碱蒸煮工艺处理后转基因木料得率较高。在氢氧化钠半纤维素提取实验中发现P1所含半纤维素中大多为聚合度较低的半纤维素。结合化学组分差异等因素从化学反应接触面积、木材本身性质两个方面揭示了转基因木料在碱法蒸煮工艺实验中具备高得率的原因。

关键词： ERF76 纤维素半纤维素半纤维素抽提木材组分

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水曲柳FmPLT基因家族的鉴定及表达分析

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北京林业大学学报 2022年第2期44卷 11-21页

作者：宋婷婷梁楠松吕义品崔靖弘于磊赵福江徐亮詹亚光东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 吉林省临江林业局吉林临江134600

【目的】PLT转录因子家族能够参与植物的再生过程,并且在植物的生长发育及器官建成中发挥着重要作用,本研究旨在探究PLT转录因子在水曲柳生长发育及非生物胁迫中发挥的作用,以期为林木优良基因选育工作提供更多思路。【方法】通过同源... 详细信息

【目的】PLT转录因子家族能够参与植物的再生过程,并且在植物的生长发育及器官建成中发挥着重要作用,本研究旨在探究PLT转录因子在水曲柳生长发育及非生物胁迫中发挥的作用,以期为林木优良基因选育工作提供更多思路。【方法】通过同源序列比对和基因克隆等方法对FmPLTs家族的成员进行鉴定及分析,之后对FmPLTs成员进行了详细的生物信息学分析,包括理化性质、系统进化关系和基因结构等;并进一步分析了FmPLTs成员在不同组织及种子萌发过程中的基因表达特征,以及其在非生物胁迫(氯化钠、聚乙二醇6000、碳酸氢钠和低温4℃)和植物激素处理脱落酸、赤霉素、生长素、水杨酸和茉莉酸甲酯下的诱导表达情况。【结果】水曲柳基因组中含有9个PLT基因家族成员,分别命名为FmPLT2、FmPLT3、FmPLT4、FmPLT4A、FmPLT5、FmPLT5A、FmPLT7、FmPLT8和FmPLT9。系统进化关系将其分为5组;其在根中表达量最高,在叶中表达量最低;在种子萌发第4天子叶变绿,下胚轴伸长,此时FmPLTs成员的表达量出现峰值;而在不同激素及非生物胁迫条件下,FmPLTs对低温、干旱、盐胁迫以及MeJA的处理响应明显。【结论】FmPLTs参与水曲柳种子萌发及器官发育,并能响应植物激素信号,同时积极参与植物非生物胁迫耐受性的调控,包括低温、高盐和干旱胁迫等;本研究初步揭示了水曲柳FmPLT家族成员响应植物激素和非生物胁迫的表达模式,同时为深入分析FmPLT基因家族基本功能及其调控机制奠定了基础。

关键词：水曲柳 PLT转录因子基因家族表达分析

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‘麦缘锦楸’叶色表型qRT-PCR内参基因筛选及验证

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林业科学研究 2022年第1期35卷 123-131页

作者：杨英英赵林姣杨桂娟张玉付鹏跃胡继文刘莹王楠三峡大学生物技术研究中心湖北宜昌443002 林木遗传育种国家重点实验室中国林业科学研究院林业研究所国家林业和草原局林木培育重点实验室楸树国家创新联盟北京100091 西南林业大学林学院云南昆明650224 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040

[目的]筛选不同叶色部位稳定表达的内参基因,为后期开展‘麦缘锦楸’叶色形成的分子机制奠定基础。[方法]以‘麦缘锦楸’不同叶色部位及灰楸对应部位叶片为材料,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了7个候选基因(CfUBC、CfActin11、C... 详细信息

[目的]筛选不同叶色部位稳定表达的内参基因,为后期开展‘麦缘锦楸’叶色形成的分子机制奠定基础。[方法]以‘麦缘锦楸’不同叶色部位及灰楸对应部位叶片为材料,利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了7个候选基因(CfUBC、CfActin11、CfPP2A、CfMADH、CfGADPH、CfEF-1及CbuActin)的相对表达量,利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等分析软件对内参基因进行了稳定性评价。分析了‘麦缘锦楸’和灰楸不同叶色部位中萜类合成相关基因(CfGES)的表达模式,验证了上述稳定性评价结果的可靠性。[结果]7个候选内参基因在‘麦缘锦楸’和灰楸叶片中均具有作为内参基因的性能,其中,CfMADH和CfEF-1在不同叶色部位的表达量最稳定,CfGADPH和CfActin11次之,CfUBC最差。以萜类合成相关基因CfGES验证内参稳定性发现,单独或组合使用CfEF-1及CfMADH为内参基因时,CfGES的表达差异与转录组数据趋势一致。[结论]单独或组合使用CfMADH和CfEF-1来校准‘麦缘锦楸’不同叶色部位的基因表达量,可显著提高实验结果的可靠性。

关键词： ‘麦缘锦楸’ 叶片内参基因 qRT-PCR

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彩叶杨树新品种‘辉煌1号’

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园艺学报 2021年第S02期48卷 3011-3012页

作者：姜静陈坤李艺迪陈肃刘桂丰东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

杨树‘辉煌1号’是由三倍体‘银中杨’雄株通过转PaGLK-RNAi获得的干扰表达株系中选育出的黄叶新品种,其叶片中PaGLK1的表达量降低,光合色素含量减少。茎干通直,皮孔圆形,夏季叶片上表面黄绿色,观赏效果佳,适宜在城市绿化中应用。

关键词：杨树叶色 RNAi 品种

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毛果杨PtSUT基因的全基因组鉴定及表达分析

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分子植物育种 2022年

作者：张红娇张双胡志宝常如慧陈嵩曹丽娜刘关君曲春浦许志茹东北林业大学生命科学学院东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学林学院贵州大学林学院

蔗糖转运蛋白(SUT)介导植物中蔗糖的吸收和转运，参与植物的生长和发育过程。然而，目前对毛果杨SUTs基因家族的功能研究还不够全面。在本研究中，通过生物信息学方法从毛果杨基因组中鉴定了5个PtSUTs基因，并对该家族成员的理化性质、... 详细信息

蔗糖转运蛋白(SUT)介导植物中蔗糖的吸收和转运，参与植物的生长和发育过程。然而，目前对毛果杨SUTs基因家族的功能研究还不够全面。在本研究中，通过生物信息学方法从毛果杨基因组中鉴定了5个PtSUTs基因，并对该家族成员的理化性质、表达模式、进化等进行分析。系统发育分析表明，5个PtSUTs成员可分为三个进化分枝，每个分枝内的基因具有相似的基因结构。PtSUTs家族成员均含有MFS结构域，具有高度相似的保守基序。PtSUTs含有510～600个氨基酸残基。实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析表明，5个PtSUTs基因在不同组织中的表达模式不同，均受外源氮素的影响。本研究为进一步鉴定毛果杨PtSUT蛋白的生物学功能提供了重要信息。

关键词：毛果杨蔗糖转运蛋白生物信息学分析氮素处理表达模式

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生物与非生物逆境胁迫下植物脂质调控机制及其研究进展

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中国油料作物学报 2023年第5期45卷 1062-1072页

作者：刘凤娇于耸刘冠黑龙江大学现代农业与生态环境学院黑龙江哈尔滨150080 东北林业大学生命科学学院东北盐碱植被恢复与重建教育部重点实验室黑龙江哈尔滨150040 东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040

病虫害等生物逆境胁迫与温度、水分等非生物胁迫是影响植物生长发育与产量的关键因素。脂质参与到植物响应胁迫的各通路中,形成一套独特的反馈应答机制,如不饱和脂肪酸对生物胁迫中的抗病虫功能等。另外,非生物胁迫中脂肪酸衍生物还能... 详细信息

病虫害等生物逆境胁迫与温度、水分等非生物胁迫是影响植物生长发育与产量的关键因素。脂质参与到植物响应胁迫的各通路中,形成一套独特的反馈应答机制,如不饱和脂肪酸对生物胁迫中的抗病虫功能等。另外,非生物胁迫中脂肪酸衍生物还能够增加细胞内渗透调节,减少膜脂过氧化程度,提高植物的抗逆性。因此,脂质的含量与植物生长发育过程中的生物胁迫与非生物胁迫有密切联系。本文综合了国内外生物与非生物胁迫下植物脂质的调控机制及其研究进展,简要介绍了胁迫类型,重点总结了植物在各胁迫下脂质的变化及调控作用,意在加深对逆境下植物生理活动的了解,为进一步研究植物抗逆过程中脂质的调控提供参考。

关键词：植物生长发育响应胁迫脂质不饱和脂肪酸调控机制

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毛果杨WRKY40基因克隆及转基因拟南芥抗旱性分析

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分子植物育种 2022年

作者：黄珊陈雪冰刘关君魏志刚东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室黑龙江大学生命科学学院

PtrWRKY40基因从毛果杨(Populus trichocarpa)中克隆得到，其CDS全长957 bp，编码318个氨基酸，分子量为35.13 kDa，理论等电点为8.96。生物信息学分析结果表明：PtrWRKY40蛋白的二级结构主要是由无规卷曲(57.23%)，延伸链(10.69%)，α...

PtrWRKY40基因从毛果杨(Populus trichocarpa)中克隆得到，其CDS全长957 bp，编码318个氨基酸，分子量为35.13 kDa，理论等电点为8.96。生物信息学分析结果表明：PtrWRKY40蛋白的二级结构主要是由无规卷曲(57.23%)，延伸链(10.69%)，α-螺旋(29.87%)，β-折叠(2.20%)组成，是碱性亲水的不稳定蛋白；系统进化树的构建及基序分析发现，毛果杨与白杨的亲缘关系最近；亚细胞定位实验表明PtrWRKY40定位于细胞核。4% PEG6000模拟干旱胁迫结果表明，胁迫后的野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana)种子萌发率比转基因型拟南芥种子萌发率高。综上所述，预测该基因可能响应干旱胁迫。

关键词：

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