检索结果-内蒙古大学图书馆

植物研究 2022年第6期42卷 1005-1013页

作者：黄安瀛夏德安张洋那冬晨燕青魏志刚国家林业和草原局盐碱地研究中心北京100091 国家林业和草原局桉树研究开发中心湛江524022 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 山西师范大学生命科学学院临汾041000

为明确毛果杨WRKY家族成员PtrWRKY51基因功能,以Nisqually-1株系毛果杨为模板,克隆得到PtrWRKY51基因CDS序列。通过生物信息学分析,结合酵母自激活验证、亚细胞定位及模拟干旱胁迫下的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PtrWRKY51基因功能进行... 详细信息

为明确毛果杨WRKY家族成员PtrWRKY51基因功能,以Nisqually-1株系毛果杨为模板,克隆得到PtrWRKY51基因CDS序列。通过生物信息学分析,结合酵母自激活验证、亚细胞定位及模拟干旱胁迫下的实时荧光定量PCR(qRT-PCR)对PtrWRKY51基因功能进行初步研究。结果表明:PtrWRKY51全长579 bp,编码192 aa。生物信息学分析及亚细胞定位试验结果表明,PtrWRKY51蛋白为非跨膜碱性不稳定亲水蛋白,定位于细胞核,含有WRKY家族特有的保守结构域,是第IIc类WRKY转录因子;酵母自激活验证试验表明PtrWRKY51基因具有自激活活性;qRT-PCR分析表明,8%PEG6000模拟干旱胁迫下,该基因在胁迫12 h后茎部与叶部相对表达量达到最大值,根部则出现在24 h,研究可为PtrWRKY51抗逆及生物学功能进一步研究提供参考。

关键词：毛果杨 PtrWRKY51 生物信息学酵母自激活亚细胞定位抗旱表达分析

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基于重测序的‘蒙冠1号’、‘蒙冠2号’全基因组遗传变异分析

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分子植物育种 2024年第11期22卷 3585-3593页

作者：陆昕王晗慧曹丽李显玉乌志颜关岛杨素芝李英爽郑志民东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 赤峰市林业科学研究所赤峰024000 国家林业草原文冠果工程技术研究中心赤峰024000 赤峰市林业和草原局赤峰024000 赤峰市森林草原保护发展中心赤峰024000

为了研究不同文冠果品种之间的遗传变异,采用高通量重测序技术,对两个高产文冠果品种‘蒙冠1号’‘蒙冠2号’分别进行了全基因组测序,平均测序深度为93.35×和86.76×,覆盖率为99.96%,并与参考基因组比对,在两个品种中检测到了... 详细信息

为了研究不同文冠果品种之间的遗传变异,采用高通量重测序技术,对两个高产文冠果品种‘蒙冠1号’‘蒙冠2号’分别进行了全基因组测序,平均测序深度为93.35×和86.76×,覆盖率为99.96%,并与参考基因组比对,在两个品种中检测到了丰富的遗传变异,包括SNP和InDel。对存在遗传变异的基因进行GO富集,发现它们主要富集在细胞壁合成和胁迫响应。针对不同品种的差异,发现‘蒙冠1号’主要富集在细胞壁生物发生及生长发育通路,‘蒙冠2号’主要与胁迫响应和防御通路相关,推测这些基因的遗传变异是不同性状差异的原因。本研究结果一定程度上反映了文冠果两个品种之间在基因组水平的差异,为分子标记的开发提供了遗传基础,也为后续的分子育种及品种改良提供了理论指导和科学依据。

关键词：全基因组重测序蒙冠1号蒙冠2号遗传变异胁迫响应

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镉胁迫下美洲黑杨无性系‘中菏1号’转录组分析

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北京林业大学学报 2021年第7期43卷 12-21页

作者：宋润先李翔毛秀红王丽陈香丽姚俊修赵曦阳李善文东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室黑龙江哈尔滨150040 山东省林业科学研究院山东省林木遗传育种改良重点实验室山东济南250014 山东省林业监测规划院山东济南250014 单县国有故道林场山东单县274300

【目的】通过转录组测序和分析,发掘美洲黑杨无性系‘中菏1号’耐镉关键功能基因,揭示美洲黑杨在镉胁迫下的响应机制。【方法】以‘中菏1号’为试验材料,通过沙培试验法对处在不同质量浓度(0 mg/L(ZH1C0),10 mg/L(ZH1C1),20 mg/L(ZH1C2)... 详细信息

【目的】通过转录组测序和分析,发掘美洲黑杨无性系‘中菏1号’耐镉关键功能基因,揭示美洲黑杨在镉胁迫下的响应机制。【方法】以‘中菏1号’为试验材料,通过沙培试验法对处在不同质量浓度(0 mg/L(ZH1C0),10 mg/L(ZH1C1),20 mg/L(ZH1C2))Cd^(2+)环境下的无性系进行胁迫处理,而后采集叶片,提取RNA,并使用Illumina HiSeqTM2500系统对转录组进行高通量测序。【结果】主成分分析确定PC1作为区分不同Cd^(2+)浓度样本的标准;经过差异表达分析,在ZH1C0和ZH1C2之间共检测到4109条差异基因,其中2741条基因显著上调表达,1368条基因显著下调表达;在ZH1C1和ZH1C2之间检测到3710条差异基因,其中1969条基因显著上调表达,1741条基因显著下调表达;不同数据库之间的注释表明Cd^(2+)不仅会影响叶绿体、线粒体等细胞器的微结构,而且会干扰光合作用和呼吸作用中的电子传递。转录因子分析发现,WRKY、MYB、ZIP、ERF、bHLH在镉胁迫响应和耐受中具有重要作用。【结论】在‘中菏1号’中,异戊二烯化植物蛋白在阻止Cd^(2+)进入细胞内部发挥了重要作用;谷胱甘肽不仅可以促进细胞内Cd^(2+)的螯合,还可以缓解细胞内的氧化胁迫;ABC家族蛋白和MATE家族蛋白是‘中菏1号’体内转移Cd^(2+)螯合蛋白的关键载体。

关键词：镉胁迫美洲黑杨无性系‘中菏1号’ 转录组

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转BpLTP4烟草耐盐性分析

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生物技术通报 2020年第12期36卷 34-41页

作者：石晶静郭依萍于颖周美琪王超东北林业大学东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

从白桦(Betula platyphylla Suk)中克隆获得CDS为357 bp的BpLTP4。该BpLTP4蛋白为疏水性蛋白且具有一个潜在的跨膜区,蛋白三级结构含有一个疏水腔,该蛋白具有LTP家族基因特有的8个Cys残基结构。BpLTP4与其他物种LTP耐盐基因的亲缘关系... 详细信息

从白桦(Betula platyphylla Suk)中克隆获得CDS为357 bp的BpLTP4。该BpLTP4蛋白为疏水性蛋白且具有一个潜在的跨膜区,蛋白三级结构含有一个疏水腔,该蛋白具有LTP家族基因特有的8个Cys残基结构。BpLTP4与其他物种LTP耐盐基因的亲缘关系较近。qRT-PCR分析表明,NaCl胁迫处理48 h高度诱导BpLTP4表达。通过叶盘法获得BpLTP4过表达烟草转基因株系,用150 mmol/L NaCl胁迫处理转基因和野生型株系后发现,转基因株系耐盐能力高于野生型,其平均发芽率是WT的5.6倍;根长是WT的1.099倍;DAB、NBT、Evans blue染色均浅于WT,POD活性比WT增高了0.28倍,SOD活性较WT增高了0.12倍。BpLTP4响应盐胁迫处理,通过提高保护酶活性、清除活性氧、维持细胞完整性来提高转基因草的耐盐能力。

关键词：白桦 BpLTP4 耐盐性分析烟草

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杨树HDA902基因在低温胁迫应答反应中的功能

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植物研究 2020年第2期40卷 251-256页

作者：关韬刘超李开隆夏德安马旭俊东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

组蛋白去乙酰化酶在植物非生物胁迫应答反应中具有重要的调控作用。利用RT-PCR的方法从毛果杨中克隆了组蛋白去乙酰化酶基因HDA902。利用农杆菌介导法将其遗传转化到烟草中,并对转基因植株进行低温耐受性分析。研究结果表明,HDA902在烟... 详细信息

组蛋白去乙酰化酶在植物非生物胁迫应答反应中具有重要的调控作用。利用RT-PCR的方法从毛果杨中克隆了组蛋白去乙酰化酶基因HDA902。利用农杆菌介导法将其遗传转化到烟草中,并对转基因植株进行低温耐受性分析。研究结果表明,HDA902在烟草中的表达显著提高了转基因株系对低温的耐受性。叶片NBT和DAB染色结果表明,在低温处理后转基因烟草比野生型烟草产生较少的活性氧。丙二醛和脯氨酸含量测定结果表明,在低温条件下,转基因烟草叶片的脯氨酸含量显著高于野生型烟草,而丙二醛含量显著低于野生型烟草。这些研究结果表明,HDA902参与低温胁迫应答反应,其过量表达提高了植株耐低温的能力。

关键词：烟草 HDA902 低温胁迫耐受性

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大青杨PubZIP1基因的克隆及亚细胞定位与抗旱表达特性分析

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植物研究 2020年第2期40卷 233-242页

作者：刘晓杨佳张馨马苗苗杨静莉东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

从大青杨中克隆得到PubZIP1基因,通过基因测序结果可知,PubZIP1基因全长1083 bp,编码360个氨基酸。分析得出PubZIP1蛋白含有BZIP和DOG1两个结构域,其二级结构包括α-螺旋(62.50%)、无规卷曲(29.72%)、延伸链(5.56%)、β-折叠(2.22%)。... 详细信息

从大青杨中克隆得到PubZIP1基因,通过基因测序结果可知,PubZIP1基因全长1083 bp,编码360个氨基酸。分析得出PubZIP1蛋白含有BZIP和DOG1两个结构域,其二级结构包括α-螺旋(62.50%)、无规卷曲(29.72%)、延伸链(5.56%)、β-折叠(2.22%)。通过亚细胞定位试验表明PubZIP1基因位于细胞核。通过qRT-PCR分析表明,在模拟干旱的不同7%PEG6000胁迫时间下,分析结果表明胁迫后PubZIP1基因在大青杨根中的表达量呈下降趋势。而在大青杨茎和叶片中的表达量呈上升趋势,尤其是在叶片中明显被诱导表达。预测该基因可能主要在叶片中表达并行使功能。

关键词：大青杨 PubZIP1基因生物信息学亚细胞定位

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小黑杨PsnHB13基因在烟草中的遗传转化与功能分析

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植物研究 2020年第4期40卷 593-601页

作者：肖迪刘轶李开隆郑密曲冠证东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

克隆小黑杨HD-ZIP家族基因PsnHB13,对该基因进行生物信息学分析、过表达载体构建、烟草的遗传转化。结果表明小黑杨PsnHB13基因cDNA全长870 bp,编码289个氨基酸。成功构建植物过表达载体pROKⅡ-PsnHB13,并通过农杆菌介导的叶盘法将外源... 详细信息

克隆小黑杨HD-ZIP家族基因PsnHB13,对该基因进行生物信息学分析、过表达载体构建、烟草的遗传转化。结果表明小黑杨PsnHB13基因cDNA全长870 bp,编码289个氨基酸。成功构建植物过表达载体pROKⅡ-PsnHB13,并通过农杆菌介导的叶盘法将外源基因转入野生型烟草。检测结果显示PsnHB13已成功整合入烟草基因组中,并在mRNA水平表达。通过观察转基因烟草的生长,发现过表达PsnHB13基因的烟草与野生型相比出现叶面积变小、叶型变长,根系生长缓慢,花朵变小等明显表型。说明PsnHB13基因主要对烟草叶片、根系及花的生长发育起到负调控作用。本文为研究PsnHB13基因对杨树生长发育的影响提供理论基础。

关键词： PsnHB13 烟草叶型根长

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5个毛果杨PtrZFP基因的鉴定和表达分析

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植物研究 2020年第2期40卷 243-250页

作者：李亚博吕佳欣谭冰高彩球东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

ZFP转录因子是植物中的一类具有指环结构域的转录因子。从毛果杨中鉴定出5条ZFP基因(命名为PtrZFP1-5),对其特性和表达模式进行了分析,以期初步了解这些基因是否能对胁迫做出应答。对PtrZFP1-5基因进行生物学分析,进一步利用qRT-PCR技... 详细信息

ZFP转录因子是植物中的一类具有指环结构域的转录因子。从毛果杨中鉴定出5条ZFP基因(命名为PtrZFP1-5),对其特性和表达模式进行了分析,以期初步了解这些基因是否能对胁迫做出应答。对PtrZFP1-5基因进行生物学分析,进一步利用qRT-PCR技术分析NaCl、PEG6000和ABA胁迫处理后毛果杨根、茎和叶中5条基因的表达情况。PtrZFP1-5基因编码蛋白氨基酸残基数为258~338 aa,编码蛋白的分子量为27.7~37.3 kDa,理论等电点为4.87~8.61,5个基因不均等的分布在毛果杨基因组的3条染色体上。qRT-PCR结果显示,0.2 mol·L-1 NaCl、15%(w/v)PEG6000和100μmol·L-1 ABA胁迫处理后,5个PtrZFP基因在毛果杨根、茎和叶中的表达模式明显不同。PtrZFP1基因在3种胁迫后毛果杨中均被明显的上调表达;PtrZFP2基因在盐、渗透和ABA胁迫处理后,叶中的表达都明显被抑制;PtrZFP3基因受到干旱胁迫时在根中的响应最为明显;而叶和茎中,表达量在大部分胁迫的大部分时间点无明显改变。PtrZFP4基因也能在根和茎中对干旱胁迫做出明显应答。PtrZFP5基因在经受盐和ABA胁迫后,在叶中的表达受到明显抑制。PtrZFP1-5这5个基因至少能在一种器官中对一种胁迫处理做出应答,但参与的胁迫应答类型和机制可能不同。

关键词：锌指蛋白转录因子毛果杨非生物胁迫

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杨树ERF11转录因子基因应答渗透胁迫表达分析

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植物研究 2020年第3期40卷 433-440页

作者：刘悦赵凯吕冠斌姜廷波周博如东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

从小黑杨(Populus simonii×***)叶片中克隆出732 bp的ERF11转录因子基因(Potri.011G057000.1)cDNA,其编码的蛋白含有243个氨基酸,属于不稳定的亲水蛋白,不存在信号肽,不具跨膜能力,含AP2/ERF家族保守结构域。系统进化树表明,小黑杨... 详细信息

从小黑杨(Populus simonii×***)叶片中克隆出732 bp的ERF11转录因子基因(Potri.011G057000.1)cDNA,其编码的蛋白含有243个氨基酸,属于不稳定的亲水蛋白,不存在信号肽,不具跨膜能力,含AP2/ERF家族保守结构域。系统进化树表明,小黑杨ERF11蛋白与胡杨、麻疯树、蓖麻、橡胶树、木薯遗传距离较近,说明其亲缘关系较近。亚细胞定位结果表明,ERF11蛋白定位于细胞核中。ERF11基因表达具有组织特异性,并受胁迫诱导表达。其在根中相对表达水平明显比在茎和叶中表达水平高,在盐和甘露醇胁迫下,基因均表现上调表达。表明ERF11转录因子基因可能与植物应答高盐和干旱胁迫相关。

关键词：小黑杨转录因子基因表达胁迫

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日本落叶松LoERF017基因的克隆及生物信息学分析

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植物研究 2020年第4期40卷 602-612页

作者：马苗苗李成浩刘晓张馨杨静莉东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

从日本落叶松中克隆得到的LoERF017基因,该基因全长624 bp,共编码206个氨基酸。预测该基因所编码的蛋白只包括一个AP2结构域,其二级结构包括α-螺旋(30.43%),无规卷曲(54.11%),延伸链(12.56%),β-折叠(2.9%)。对该基因进行亚细胞定位,... 详细信息

从日本落叶松中克隆得到的LoERF017基因,该基因全长624 bp,共编码206个氨基酸。预测该基因所编码的蛋白只包括一个AP2结构域,其二级结构包括α-螺旋(30.43%),无规卷曲(54.11%),延伸链(12.56%),β-折叠(2.9%)。对该基因进行亚细胞定位,结果显示LoERF017基因定位在细胞核中。荧光定量PCR结果表明,LoERF017基因在日本落叶松中的表达有一定的组织特异性,该基因在根中的表达量最高,在茎中的表达量最低,在叶中的表达量居中。干旱胁迫下,LoERF017基因的表达量在根中呈上升趋势,复水后,该基因的表达量有下降趋势。可以初步预测该基因主要在日本落叶松根中表达并行使功能,并推测该基因可能与抗旱相关。

关键词：日本落叶松 LoERF017基因生物信息学非生物胁迫

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