检索结果-内蒙古大学图书馆

西北农林科技大学学报（自然科学版） 2023年第9期51卷 58-69页

作者：靳春慧文小卉刘羽婷李月王丽丽刘立洋董新宇李慧玉林木遗传育种国家重点实验室东北林业大学林学院黑龙江哈尔滨150040

【目的】克隆小黑杨(Populus×xiaohei *** et Liang)RAV1和RAV2基因,分析这2个基因在非生物胁迫下的表达模式,为进一步研究小黑杨基因功能提供理论依据。【方法】以抗逆性强的小黑杨根为试材,克隆2个RAV家族成员。利用生物信息学... 详细信息

【目的】克隆小黑杨(Populus×xiaohei *** et Liang)RAV1和RAV2基因,分析这2个基因在非生物胁迫下的表达模式,为进一步研究小黑杨基因功能提供理论依据。【方法】以抗逆性强的小黑杨根为试材,克隆2个RAV家族成员。利用生物信息学方法对小黑杨2个RAV基因的理化性质、保守基序、保守结构域、系统进化进行分析,并采用半定量RT-PCR方法探讨这2个基因在小黑杨顶芽、叶、木质部、韧皮部、根、第1~14片叶、第1~11茎节中的表达情况,以及在CdCl2、NaCl、NaHCO3、PEG和ABA胁迫下的表达特性。【结果】从小黑杨中克隆出2个RAV基因,命名为PsnRAV1和PsnRAV2。PsnRAV1编码405个氨基酸,预测分子质量约为99.46 ku,等电点5.06,不存在信号肽;PsnRAV2编码407个氨基酸,预测分子质量约为99.33 ku,等电点5.06,存在信号肽;2个基因均位于细胞核上。保守结构域和保守基序分析结果表明,小黑杨RAV蛋白具有RAV家族特有的AP2和B3这2个保守蛋白结构域,基序1、2、3是构成2个结构域的主要基序。系统进化分析表明,20种植物的RAV蛋白分为3组,其中PsnRAV1和PsnRAV2与毛果杨(Populus trichocarpa)RAV同源性很高。半定量RT-PCR分析结果显示,2个PsnRAVs基因在小黑杨的顶芽、叶、木质部、韧皮部和根中均有表达;且随着叶和茎的发育,2个基因的表达量均呈现升高的趋势。在CdCl2、NaCl、NaHCO3模拟的重金属及盐胁迫下,2个基因的表达模式虽不相同,但在根部均受到诱导;在PEG模拟的干旱胁迫下,PsnRAV1和PsnRAV2在叶片和根部均有响应,其中在根部受到的诱导更为明显,尤以PsnRAV2的表达更为显著;此外,PsnRAV1和PsnRAV2也受到ABA的诱导,其在叶中的表达量在初期表现为上升,而后期下降。【结论】2个PsnRAVs基因与小黑杨的抗逆性密切相关,可能参与了小黑杨的非生物胁迫应答,其中PsnRAV2在胁迫下的作用更为显著。

关键词：小黑杨 RAV 生物信息学非生物胁迫基因表达分析林木遗传育种

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棘孢木霉Myb27转录因子基因特性分析、原核表达及产物纯化

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吉林农业大学学报 2024年第1期46卷 49-57页

作者：韩静安一博季世达田桢刘志华东北林业大学林学院哈尔滨150040 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040 沈阳农业大学林学院沈阳110866

以棘孢木霉CGMCC11653菌株菌丝体总RNA反转录的cDNA为模板,克隆全长717 bp转录因子Myb27基因编码序列,其编码238氨基酸组成的多肽。用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域并进行亚细胞定位、氨基酸多序列比对和进化关系分析,结果... 详细信息

以棘孢木霉CGMCC11653菌株菌丝体总RNA反转录的cDNA为模板,克隆全长717 bp转录因子Myb27基因编码序列,其编码238氨基酸组成的多肽。用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域并进行亚细胞定位、氨基酸多序列比对和进化关系分析,结果表明:其相对分子质量为27000,属于Myb-like DNAbinding结构域的蛋白,亚细胞定位在细胞核中。链格孢菌毒素诱导条件下Myb27的表达有显著变化,可能参与棘孢木霉抗链格孢菌毒素胁迫应答反应的正向调控。构建原核表达载体pMAL-Emyb27,转化大肠杆菌ER2523获得转化子ER2523-Emyb27,其成功诱导的最适条件为0.1 mmol/L IPTG 37℃连续诱导培养3 h;用PBS+10 mmol/L麦芽糖洗脱层析柱可得到与MBP标签融合的单一可溶性69500重组rMyb27蛋白。可见Myb27转录因子调控抗病基因的表达所结合的顺式作用元件提供体外重组蛋白,为调控棘孢木霉抗杨树叶枯病链格孢菌毒素胁迫的机理提供理论依据。

关键词：棘孢木霉转录因子链格孢菌毒素胁迫特性分析原核表达

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巨桉转录因子ZF-HD基因家族及其功能初步分析

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林业科学研究 2024年第4期37卷 73-84页

作者：张双王学君曾炳山许志茹范春节东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 中国林业科学研究院热带林业研究所林木遗传育种全国重点实验室国家林业和草原局热带林木培育重点实验室广东广州510520 东北林业大学林木遗传育种全国重点实验室黑龙江哈尔滨150040 中南林业科技大学岳麓山实验室湖南长沙410000

[目的]解析转录因子ZF-HD在桉树生长发育中的作用,进而深入了解其在桉树中如何发挥功能。[方法]在本研究中利用生物信息学鉴定巨桉ZF-HD基因家族成员,并对其染色体定位、理化性质、基因结构、蛋白保守结构域和表达模式进行分析。[结果]... 详细信息

[目的]解析转录因子ZF-HD在桉树生长发育中的作用,进而深入了解其在桉树中如何发挥功能。[方法]在本研究中利用生物信息学鉴定巨桉ZF-HD基因家族成员,并对其染色体定位、理化性质、基因结构、蛋白保守结构域和表达模式进行分析。[结果]桉树中共发现10个基因家族成员,编码78~343个氨基酸,几乎所有成员都属于碱性蛋白质,主要定位于细胞核,且motif1在ZF-HD家族中非常保守,其启动子顺式作用元件主要为激素应答、生长发育和逆境应答等响应元件。ZF-HD基因家族成员在不同组织、不定根诱导和不定芽诱导过程中的表达分析表明,大多数家族成员在不同组织中存在着差异表达,且家族成员主要在顶端等初生生长阶段表达。且巨桉ZF-HD家族部分成员在不定根和不定芽诱导阶段表达量显著上升,亚细胞定位分析与预测结果相同。同时EgrZHD2定位于细胞核,且在茎尖的表达量较高,随着茎顶端向下其表达量显著下降。[结论]巨桉ZF-HD基因家族成员在桉树不定根和不定芽诱导等发育中起着重要的调控作用。EgrZHD2作为重要的转录因子作用于桉树的初生生长以及不定根诱导等生物学过程。

关键词：巨桉转录因子 ZF-HD 发育表达模式生物信息学分析

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长白落叶松种子园遗传多样性分析

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森林工程 2022年第3期38卷 16-25页

作者：邱新宇张磊张含国闫平玉东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

为分析长白落叶松生产群体的遗传多样性及其变化趋势,为落叶松优良种质资源收集、保护和多世代遗传改良提供科学依据。该文从270对松科SSR(Simple Sequence Repeat)通用引物中筛选出多态性高的30对引物,利用SSR分子标记对林口县青山林... 详细信息

为分析长白落叶松生产群体的遗传多样性及其变化趋势,为落叶松优良种质资源收集、保护和多世代遗传改良提供科学依据。该文从270对松科SSR(Simple Sequence Repeat)通用引物中筛选出多态性高的30对引物,利用SSR分子标记对林口县青山林场长白落叶松种子园105个单株进行遗传分析。结果表明,30对引物共检测到258对等位基因,群体平均观测等位基因数(Average number of observed alleles,N_(a))为2.833,平均有效等位基因数(Average number of effective alleles,N_(e))为1.814,平均观测杂合度(Average observed heterozygosity,H_(o))为0.404,平均期望杂合度(Average expected heterozygosity,H_(e))为0.401;群体内近交系数(Inbreeding coefficient in population,F_(is))、群体总近交系数(Total inbreeding coefficient in population,F_(it))均为负值,表现出群体轻微杂合子过量,未出现近交衰退现象;Shannon多样性指数(I)为0.694,多态性信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)为0.3541,具有较高遗传多样性,遗传变异主要源于群体内;UPGMA聚类图以0.692为阈值,可以将105个单株分为4个类群。该研究筛选出的SSR引物具有较好通用性,长白落叶松种子园遗传多样性较高,无性系群体遗传变异水平没有降低。

关键词：长白落叶松 SSR标记通用性遗传多样性聚类分析

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红松胚性愈伤组织增殖的激素配比、糖源类型和增殖周期效应研究

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植物研究 2022年第4期42卷 704-712页

作者：任毓辉聂帅彭春雪杨玲沈海龙东北林业大学林学院林木遗传育种国家重点实验室哈尔滨150040

为了解决红松(Pinus koraiensis)胚性愈伤组织增殖过程中生长状态差、体胚产量不高等问题,本研究利用红松胚性愈伤组织1-100细胞系为材料,通过调节红松增殖培养基中激素、碳源和增殖培养周期,探索其对红松体胚发生能力的影响及其生理生... 详细信息

为了解决红松(Pinus koraiensis)胚性愈伤组织增殖过程中生长状态差、体胚产量不高等问题,本研究利用红松胚性愈伤组织1-100细胞系为材料,通过调节红松增殖培养基中激素、碳源和增殖培养周期,探索其对红松体胚发生能力的影响及其生理生化特性变化。结果如下:①红松胚性愈伤组织最佳增殖条件激素浓度为1 mg·L^(-1) NAA+0.25 mg·L^(-1)6-BA,最佳碳源为蔗糖,最佳增殖培养周期为14 d,在此条件下获得的体胚产量最多(166个·g^(-1));②在优化增殖培养过程中,储藏物质为红松体胚发生提供了能量来源;激素种类及其浓度、碳源种类、增殖培养周期之间可溶性蛋白质量分数没有显著差异;③红松愈伤组织中CAT活性过高不利于愈伤组织的体胚发生,可能是H_(2)O_(2)等代谢产物积累过多,产生毒害作用。

关键词：红松胚性愈伤组织体细胞胚胎发生增殖培养基

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鹅掌楸LcPIN1a基因的克隆及其对植株生长发育的影响

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第6期48卷 51-61页

作者：郝兆东马筱筱王丹丹陆叶施季森陈金慧林木遗传育种全国重点实验室南方现代林业协同创新中心南京林业大学林草学院

【目的】PIN-FORMED(PIN)属于生长素转运蛋白，能够介导生长素的极性运输，在植物的生长和发育过程中扮演着关键角色。本研究旨在解析鹅掌楸PIN1基因对植物生长和发育的影响。【方法】通过蛋白序列同源比对、系统发育树构建以及蛋白结... 详细信息

【目的】PIN-FORMED(PIN)属于生长素转运蛋白，能够介导生长素的极性运输，在植物的生长和发育过程中扮演着关键角色。本研究旨在解析鹅掌楸PIN1基因对植物生长和发育的影响。【方法】通过蛋白序列同源比对、系统发育树构建以及蛋白结构域预测的方法，鉴定鹅掌楸中PIN1的同源蛋白LcPIN1s。然后，通过转录组数据解析LcPIN1s基因的组织特异性表达情况，并通过实时荧光定量逆转录PCR(RT-qPCR)方法研究LcPIN1s在不同苗龄再生植株的根、茎和叶组织中的表达动态。此外，通过转录组数据解析LcPIN1s基因在低温、高温以及干旱胁迫条件下的时序动态表达，并进一步利用RT-qPCR方法研究LcPIN1s响应干旱胁迫与内源ABA合成之间的关联。最后，通过克隆鹅掌楸叶片中高表达的PIN1同源基因LcPIN1a,构建由CaMV35S启动子驱动的过表达载体(35S:LcPIN1a),通过异源转化拟南芥(Arabidopsis thaliana)和同源转化杂种鹅掌楸(Liriodendron×sinoamericanum),筛选并获得的异源过表达(LcPIN1a-HO)和同源过表达(LcPIN1a-OE)阳性再生植株，分别进行生长和发育性状的测定和分析。【结果】通过生物信息学方法在鹅掌楸基因组中成功鉴定到了3个PIN1同源蛋白，分别命名为LcPIN1a、LcPIN1b和LcPIN1c。组织特异性表达分析显示，LcPIN1a主要在叶片中高表达，而LcPIN1b和LcPIN1c主要在茎和根以及成年后的雌蕊中高表达。另外，鹅掌楸3个PIN1同源基因均受到低温(4℃)和干旱(质量分数15%PEG6000)处理的诱导而表现出先上调后下调的表达模式，但在高温(40℃)胁迫下则会急剧下调表达。利用聚乙二醇(PEG)、脱落酸(ABA)以及ABA合成抑制剂氟啶酮(Flu)处理，发现LcPIN1s在响应干旱诱导时表现出不同的模式，即LcPIN1a不依赖于内源ABA的合成，而LcPIN1b和LcPIN1c则依赖于内源ABA的合成。最后，通过对拟南芥异源过表达株系(LcPIN1a-HO)再生植株的生长性状统计分析发现，其在根长和株高方面均显著低于野生型，同时雄蕊数发生显著变异，从野生型的6枚雄蕊变为以5枚为主。在杂交鹅掌楸过表达株系(LcPIN1a-OE)中，其体胚成苗率显著降低，并且成苗后的再生植株在根长和株高方面均显著低于野生型，同时根系结构发生明显变化，主根不明显。【结论】鹅掌楸PIN1蛋白在植株的营养和生殖生长方面发挥重要作用，过量表达不利于植株的正常生长和发育。

关键词：鹅掌楸生长素转运蛋白 PIN1基因生长发育

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幼化和外源激素对娜塔栎嫩枝扦插生根的影响及其生根解剖学观察

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南京林业大学学报(自然科学版) 2024年第2期48卷 129-136页

作者：卜晓婷付威李淑娴徐志标彭大庆徐林桥林木遗传育种全国重点实验室林木遗传与生物技术教育部重点实验室江苏省林木遗传和高效培育重点实验室南京林业大学林草学院南方现代林业协同创新中心江苏省盐城林场

【目的】研究幼化、激素处理对娜塔栎(Quercus texana)嫩枝扦插生根的影响，观察生根过程中插穗不定根的形成过程，探究娜塔栎扦插生根困难的原因，为娜塔栎的扦插繁殖提供理论依据和技术借鉴。【方法】以幼化(6年生母树平茬后的苗木)、... 详细信息

【目的】研究幼化、激素处理对娜塔栎(Quercus texana)嫩枝扦插生根的影响，观察生根过程中插穗不定根的形成过程，探究娜塔栎扦插生根困难的原因，为娜塔栎的扦插繁殖提供理论依据和技术借鉴。【方法】以幼化(6年生母树平茬后的苗木)、6年生母树上剪取的当年生半木质化娜塔栎插条为材料，分别用不同质量浓度的吲哚丁酸(IBA)+萘乙酸(NAA)+间苯三酚(THB)的混合溶液浸泡插穗基部10 min,以清水处理相同时间为对照(CK),于扦插75 d后计算各处理插穗的愈伤率、生根率、根系指数和根系效果指数；同时，以幼化半木质化娜塔栎插条为材料，对不同生根阶段的插穗用FAA标准固定液固定，采用石蜡切片技术对插穗不定根的形成过程进行解剖观察。【结果】植物激素处理能显著提高娜塔栎扦插的生根效果，幼化及6年生母树插穗的生根率均表现出处理组的生根率高于对照组，其中生根率最高可达43.3%。双因素方差分析表明，幼化处理是影响娜塔栎扦插生根的重要因素，且各指标的综合分析排序发现，幼化插穗生根效果大于6年生母树插穗的。利用石蜡切片法观察娜塔栎生根过程茎部的解剖构造，发现刚剪取的插穗不含有潜伏状根原基，属于诱导根原基生根类型；存在愈伤生根和皮部生根的，属混合生根类型；解剖学观察还发现茎部韧皮部中连续的环状厚壁细胞阻碍了不定根的伸长生长。【结论】以IBA 500 mg/L+NAA 250 mg/L+THB 50 mg/L的混合溶液处理幼化娜塔栎插穗基部10 min,其扦插生根效果最佳；但是否为最适浓度需进一步验证。插穗属于诱导根原基生根类型；韧皮部存在环状连续的韧皮纤维(厚壁细胞)是导致其生根困难的原因之一。不定根原基发生的方式有两种：一种是愈伤组织内发生不定根原基，另一种是形成层附近的细胞分裂形成根原基。

关键词：娜塔栎扦插激素处理幼化处理解剖学观察

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白桦木质部汁液产量及组分变异规律解析

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森林工程 2024年第6期40卷 91-100页

作者：姜文硕伏梦焦智渲辛颖曾凡锁东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 林木遗传育种全国重点实验室(东北林业大学) 哈尔滨150040 东北林业大学林学院哈尔滨150040

白桦汁液采集时间大多在早春阶段,容易采集且产量高,为探讨温度对白桦木质部汁液变化的影响及不同发育时期汁液组分质量浓度的变化,以黑龙江省东北林业大学帽儿山实验林场白桦天然次生林为研究对象,通过收集2022年和2023年的白桦汁液,... 详细信息

白桦汁液采集时间大多在早春阶段,容易采集且产量高,为探讨温度对白桦木质部汁液变化的影响及不同发育时期汁液组分质量浓度的变化,以黑龙江省东北林业大学帽儿山实验林场白桦天然次生林为研究对象,通过收集2022年和2023年的白桦汁液,统计春季汁液流量。对2023年白桦不同发育时期汁液中的碳水化合物、氨基酸、总三萜、可溶性蛋白、pH以及钾、钙、钠、镁离子质量浓度进行分析,解析汁液组分变异规律。通过连续2 a取汁的白桦与当年取汁的白桦汁液组分质量浓度对比分析,探索连续取汁是否对白桦生长发育产生影响。结果表明,白桦汁液在4—6月中产量整体呈现先增后降的趋势,高峰期集中在4—5月份,且温度的升高会促进产汁。白桦木质部汁液的总三萜、碳水化合物、氨基酸、蛋白质组分质量浓度在整个物候发育时期均呈现先升后降再升的趋势,均在旺盛生长期时达到最低值。随物候发育白桦汁液pH整体呈下降趋势,在完全展叶前不断酸化。离子质量浓度整体呈先上升后下降的趋势。持续取汁不会对白桦汁液中总三萜、氨基酸、蛋白质质量浓度造成显著影响,会使碳水化合物质量浓度及pH降低。研究结果可为黑龙江省东部山地白桦汁液的科学采集提供指导依据。

关键词：白桦木质部汁液物候组分质量浓度离子质量浓度

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楸树DELLA基因家族生信分析及CbuGRAS9的功能分析

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植物研究 2024年第1期44卷 139-151页

作者：王珊珊王瑞樊二勤付鹏跃曲冠证王楠林木遗传育种全国重点实验室东北林业大学哈尔滨150040 中国林业科学研究院北京100091

通过鉴定楸树(Catalpa bungei)DELLA家族基因并分析CbuGRAS9的基因功能,为楸树生殖调控性状的遗传改良提供理论依据。基于楸树基因组数据,鉴定并克隆了5个与拟南芥(Arabidopsis thaliana)同源的CbuDELLAs基因;利用ExPASy、SWISS-MODEL、... 详细信息

通过鉴定楸树(Catalpa bungei)DELLA家族基因并分析CbuGRAS9的基因功能,为楸树生殖调控性状的遗传改良提供理论依据。基于楸树基因组数据,鉴定并克隆了5个与拟南芥(Arabidopsis thaliana)同源的CbuDELLAs基因;利用ExPASy、SWISS-MODEL、Plant-mPloc、PlantCare等在线工具对CbuDELLAs蛋白进行等电点、蛋白结构、亚细胞定位及启动子顺式作用元件预测;以9-1(Catalpa bungei‘Luoqiu No.1’)和‘百日花’楸树(Catalpa‘Bairihua’)为材料,分析了CbuDELLAs基因的表达量差异,并通过异源转化拟南芥证实了CbuGRAS9的分子功能,利用酵母双杂交文库筛选了与CbuGRAS9互作的蛋白。结果表明:5个CbuDELLAs蛋白的氨基酸数目为455~588,蛋白相对分子质量为5.04~6.43 kDa,等电点为4.81~5.14;CbuDELLAs蛋白均含有DELLA和GRAS保守结构域,全部为亲水性蛋白。亚细胞定位预测结果显示CbuDELLAs蛋白均定位于细胞核中。启动子顺式作用元件分析发现,这5个DELLAs基因启动子区均含有参与赤霉素反应的顺式作用元件。qRT-PCR结果显示‘,百日花’楸中CbuDELLAs基因表达量显著高于对照9-1楸,其中CbuGRAS9为差异最显著的基因,CbuGRAS9转基因株系的开花时间被明显推迟。鉴定到与CbuGRAS9互作的蛋白质主要富集在核糖体、氨基酸合成、次级代谢、光合作用、TCA循环等代谢通路。

关键词：楸树 DELLAs 生物信息学分析功能分析互作蛋白

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基于小样本学习和骨架提取算法的干旱胁迫杨树苗表型解析

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农业工程学报 2024年第19期40卷 177-185页

作者：周磊张慧春边黎明南京林业大学机械电子工程学院南京210037 南京林业大学林业资源高效加工利用协同创新中心南京210037 南京林业大学林木遗传育种全国重点实验室/南方现代林业协同创新中心/林木遗传与生物技术教育部重点实验室南京210037

杨树是木材生产加工的重要来源和防护林建设的重要树种,中国的杨树人工林栽培规模居世界首位。然而,全球变暖加剧使得干旱成为杨树培育中最为严重的典型的非生物胁迫,给木材原料形成、森林资源保护带来挑战。该研究采用低成本的机器视... 详细信息

杨树是木材生产加工的重要来源和防护林建设的重要树种,中国的杨树人工林栽培规模居世界首位。然而,全球变暖加剧使得干旱成为杨树培育中最为严重的典型的非生物胁迫,给木材原料形成、森林资源保护带来挑战。该研究采用低成本的机器视觉成像研究干旱胁迫杨树苗表型快速解析方法。首先,提出了基于YOLOv8-pose的杨树骨架提取算法,识别植株上的叶片个体及内部的关键节点,实现植株整体形态结构信息的提取。其次,引入小样本学习技术,提出基于极少量人工标注的训练数据集扩充方法,大幅降低YOLOv8-pose模型训练的人工标注成本。然后,依据杨树骨架信息计算每个叶片主叶脉、叶柄的倾角,并将倾角信息转换为频数分布,便于人工智能算法建模。最后,研究并对比了传统机器学习及深度学习分类器,选择最优算法建立干旱胁迫等级分级模型。结果表明,小样本学习YOLOv8-pose模型在叶片识别、关键点提取任务中表现优异(交并比阈值为0.5时的平均精度分别为0.798和0.914);基于一维卷积神经网络分类模型和倾角频数分布特征的杨树苗干旱胁迫等级分级模型优于其他对比方法,分类准确率为0.850。该研究提出的杨树表型解析方法可为缺水杨树识别、抗旱杨树筛选提供新的技术支持。

关键词：植物表型深度学习杨树干旱胁迫骨架提取

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