为了初步探索东北狍(Capreolus pygargus)小核糖核蛋白B(small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1,SNRPB)基因的结构与功能,试验以东北狍狍茸顶端组织cDNA为模板,采用RT-PCR和分子克隆技术成功获得包含东北狍SNRPB基因...
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为了初步探索东北狍(Capreolus pygargus)小核糖核蛋白B(small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1,SNRPB)基因的结构与功能,试验以东北狍狍茸顶端组织cDNA为模板,采用RT-PCR和分子克隆技术成功获得包含东北狍SNRPB基因全部编码区的cDNA序列,对该基因的编码序列进行同源性分析和构建系统进化树,并初步预测和分析其编码氨基酸序列的结构特征。结果表明:东北狍SNRPB基因与白尾鹿德克萨斯亚种(Odocoileus virginianus texanus)的亲缘关系最近,与小鼠(Mus musculus)的亲缘关系最远,基因编码序列全长723 bp,编码240个氨基酸,蛋白质相对分子质量为24.62。SNRPB蛋白是一种能在细胞核内发挥生物学作用的不稳定碱性亲水蛋白,具备一个由内向外的跨膜螺旋结构,没有信号肽,含有11个磷酸化位点和1个乙酰化位点。蛋白质的二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角构成,所占比例分别为64.17%、18.75%、12.08%、5.00%。SNRPB蛋白氨基酸序列的N端含有LSM蛋白家族的Sm_B结构域,上有RNA结合位点,可参与前体mRNA剪接、端粒复制和mRNA降解等生物途径。
为探究细胞侵袭抑制因子(suppressor of cancer cell invasion,SCAI)基因编码蛋白的生物学特性及基因mRNA在马鹿(Cervus canadensis)鹿茸组织中的表达水平,试验采用PCR方法克隆马鹿SCAI基因编码序列区(CDS区)全长序列,测序后进行核苷酸...
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为探究细胞侵袭抑制因子(suppressor of cancer cell invasion,SCAI)基因编码蛋白的生物学特性及基因mRNA在马鹿(Cervus canadensis)鹿茸组织中的表达水平,试验采用PCR方法克隆马鹿SCAI基因编码序列区(CDS区)全长序列,测序后进行核苷酸序列同源性比对并构建系统进化树;通过生物信息学方法分析SCAI蛋白的组成、结构和理化性质等;利用实时荧光定量PCR方法检测SCAI基因mRNA在鹿茸组织中的表达水平。结果表明:马鹿SCAI基因CDS全长1821 bp,与白尾鹿亲缘关系较近;与鸡亲缘关系较远。SCAI基因编码606个氨基酸,相对分子质量为70337.48。理论等电点为8.85,平均亲水性为-0.433,为亲水性蛋白。SCAI蛋白中存在57个潜在磷酸化位点,不存在信号肽,亚细胞主要定位于细胞核中,不属于分泌蛋白。SCAI蛋白的二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比最大,为不稳定蛋白。马鹿SCAI基因在茸皮层中的相对表达量最高,其次为软骨层,在间充质和前软骨层中相对表达量最低。说明SCAI基因参与了马鹿鹿茸的生长发育。
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