检索结果-内蒙古大学图书馆

经济林研究 2014年第1期32卷 13-20页

作者：王淋乌云塔娜叶生晶中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心河南郑州450003 国家林业局中南林业调查规划设计院湖南长沙410014

杜仲橡胶是具有橡塑二重性的优异高分子聚异戊二烯材料。3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶(HMGS)是萜类物质合成MVA途径中重要的中间体。为了揭示EuHMGS对聚异戊二烯的分子调控机制的重要作用,对杜仲HMGS基因进行全面的生物信息学分析。... 详细信息

杜仲橡胶是具有橡塑二重性的优异高分子聚异戊二烯材料。3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶(HMGS)是萜类物质合成MVA途径中重要的中间体。为了揭示EuHMGS对聚异戊二烯的分子调控机制的重要作用,对杜仲HMGS基因进行全面的生物信息学分析。杜仲HMGS基因编码452个氨基酸残基,属于不稳定的疏水性蛋白质。进化关系分析结果表明,杜仲HMGS基因与双子叶植物葡萄和拟南芥的HMGS基因亲缘关系较为接近;杜仲HMGS基因组中含有有11个外显子,10个内含子;其启动子序列中含有大量脱落酸(ABRE)、水杨酸(TCA-element)、乙烯(ERE)等顺式作用元件。

关键词：杜仲 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合成酶序列分析

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离子注入对伞树种子发芽的影响

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经济林研究 2014年第2期32卷 156-158页

作者：龚洪恩吕芳德司芳芳和红晓中国林业科学研究院亚热带林业实验中心江西分宜336600 中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学经济林培育与利用湖南省2011协同创新中心湖南长沙410004 湘西自治州林业科学研究所湖南吉首416000

为给今后的研究和生产提供参考,利用LZD-1000型离子注入机对伞树种子进行处理,测定其发芽势和发芽率。结果表明:经N和Ti离子处理后,伞树种子的发芽势和发芽率均降低,其变化呈"降—升—降"的"马鞍型"曲线,且这2个指... 详细信息

为给今后的研究和生产提供参考,利用LZD-1000型离子注入机对伞树种子进行处理,测定其发芽势和发芽率。结果表明:经N和Ti离子处理后,伞树种子的发芽势和发芽率均降低,其变化呈"降—升—降"的"马鞍型"曲线,且这2个指标与离子注入剂量之间均呈现极显著相关,200×1014 ion/cm2的低剂量离子注入对种子发芽较有利,N离子源效果更好。

关键词：伞树离子注入发芽率相关性

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油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

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第二届中国林业学术大会-S9 木本粮油产业化

作者：谭晓风谢禄山张琳中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

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油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

油桐种子EST文库构建及主要表达基因的分析

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第二届中国林业学术大会——S9 木本粮油产业化

作者：谭晓风谢禄山张琳中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

油桐是中国的高品质工业油料树种,种子含油率52%-64%,桐油是一种优良的干性植物油,其主要成分是一种共轭三烯酸即桐酸(9,11,13-十八碳三烯酸),桐酸遇空气氧化成膜。为了研究与桐油合成相关的基因表达和分离基因,我们以发育中的对年桐种... 详细信息

油桐是中国的高品质工业油料树种,种子含油率52%-64%,桐油是一种优良的干性植物油,其主要成分是一种共轭三烯酸即桐酸(9,11,13-十八碳三烯酸),桐酸遇空气氧化成膜。为了研究与桐油合成相关的基因表达和分离基因,我们以发育中的对年桐种子为材料构建了cDNA文库,并随机挑取3107个克隆进行5'-端测序构建表达序列标签EST文库,并进一步应用生物信息学方法在NCBI数据库中与其他植物核酸非冗余数据进行同源性比对,结果表明有2205个cDNA与其他植物种的基因有高度同源性,有482种基因得到初步鉴定,另有342个克隆可能为目前功能尚未知的基因。EST文库的功能分类研究发现与油脂合成相关的基因有油酸脱饱和酶基因,ω-3脂肪酸脱饱和酶基因,3-酮脂酰辅酶A硫解酶基因,β-酮脂酰ACP合成酶Ⅰ基因,脂烯酰ACP还原酶基因,酯酶/脂肪酶/硫酯酶家族蛋白基因,多不饱和脂肪酸合成酶亚基B基因,烯酰CoA水合酶/异构酶家族蛋白基因等;此外有种子贮藏蛋白基因,钙油体蛋白基因,油体蛋白基因,豆球蛋白基因,清蛋白基因等;还有大量的核糖体RNA基因,花粉过敏源基因;许多EST序列与转移蛋白、基因表达、发育调控、抗性、生长物质及发育有关。有338个单一表达的序列涉及普通物质的生化代谢。基因种类的表达数量与趋势与油桐种子进入发育后期相一致。建立油桐种子EST文库并对桐油合成相关基因进行研究对发展工业用油具有重大意义。

关键词：油桐桐酸 cDNA文库 EST文库表达基因

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中国梨S-RNase基因启动子的TAIL-PCR克隆及功能预测

中国梨S-RNase基因启动子的TAIL-PCR克隆及功能预测

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第六届全国梨科研、生产与产业化论坛会

作者：乌云塔娜刘学英中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

根据梨S-RNase基因的5′端保守序列设计3个反向特异引物,以中国砂梨（Pyrus pyrifolia）品种金花、懋功及白梨（Pyrus Brestchneideri）品种鸭梨基因组DNA为模板,TAIL-PCR分别扩增出长度为854bp、1448bp和1137bp的S13-RNase、S12-RNase、S21-RNase基因启动子序列;利用PLACE和PlantCARE软件对其进行顺式调控元件预测发现,该启动子具有典型的TATAbox和CAAT box,并位于转录起始位点的上游-33～-27bp及-78～-75bp处;此外,在核心启动子上游还存在光应答调控元件（Box4,I-box,G-box）、脱落酸应答元件ABRE、真菌诱导子应答元件Box-W1、赤霉素应答元件P-box、水杨酸应答元件TCA-element以及参与胚乳表达元件GCN4otif等,由此可知该启动子可能受光照、脱落酸、真菌、赤霉素、水杨酸等多种条件的共同调节。Clustal X对S13-RNase、S12-RNase、S21-RNase基因启动子序列与日本梨S2-RNase、S3-RNase、S4-RNase、S5-RNase基因进行序列比对,发现S-RNase启动子TATA盒上游存在-约200bp的同源区域,且这一区域内可能存在雌蕊特异表达顺式作用元件。MEG4.0构建系统发育树表明梨属和苹果属S-RNase等位基因多态性可能在亚科的分化之前就已形成。

关键词： TAIL-PCR 梨S-RNase基因启动子功能

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柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

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经济林研究 2017年第2期35卷 38-44页

作者：傅建敏索玉静刘慧敏谭晓风中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 国家林业局泡桐研究开发中心河南郑州450003 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003

为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密... 详细信息

为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用Codon W、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析。结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9%~27.8%,有效密码子数在49.58~50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36~59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾。

关键词：柿属植物叶绿体密码子偏好性最优密码子

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中国梨新SFBB-gamma基因的鉴定及序列分析

中国梨新SFBB-gamma基因的鉴定及序列分析

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第六届全国梨科研、生产与产业化论坛会

作者：乌云塔娜李洪果包梅荣谭晓风中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室中南林业科技大学林学院

分离鉴定了鸭梨、红皮酥、中梨二号和兰州软儿4个梨品种的SFBB-gamma基因,并对其序列进行了生物信息学分析。SFBB-gamma基因的特异性引物对4个梨品种进行PCR扩增结果表明,4个品种均扩增出一条1250bp左右的条带;通过DNA测序和生物信息学... 详细信息

分离鉴定了鸭梨、红皮酥、中梨二号和兰州软儿4个梨品种的SFBB-gamma基因,并对其序列进行了生物信息学分析。SFBB-gamma基因的特异性引物对4个梨品种进行PCR扩增结果表明,4个品种均扩增出一条1250bp左右的条带;通过DNA测序和生物信息学分析方法从4个梨品种中分离鉴定了SFBB21(EU422961)、SFBB26(EU422961)、SFBB31(EU422959)、SFBBd-gamma(EU422962)基因。聚类分析中发现,仁果类SFBB基因和核果类SFB基因明显地分成两类,仁果类中梨SFBB基因和苹果SFBB基因又各分成一类,这与物种的亲缘关系相符合。新鉴定的梨SFBB基因中从白梨中分离鉴定的SFBB21-gamma基因与梨其他SFBB-gamma基因的亲缘关系最远。该研究为梨自交不亲和机理研究和遗传改良提供理论基础。

关键词：中国梨自交不亲和性 SFBB基因

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杜仲甲羟戊酸激酶(EuMK)基因鉴定及生物信息学分析

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经济林研究 2014年第1期32卷 6-12页

作者：乌云塔娜王淋叶生晶中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 国家林业局中南林业调查规划设计院湖南长沙410014

甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MK)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的限速酶之一。为了探明EuMK对杜仲胶生物合成的调控机制,对EuMK所编码蛋白质氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质... 详细信息

甲羟戊酸激酶(mevalonate kinase,MK)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的限速酶之一。为了探明EuMK对杜仲胶生物合成的调控机制,对EuMK所编码蛋白质氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二、三级结构、结构保守域以及基因组内含子和外显子结构特征等进行了全面的生物信息学分析,结果发现EuMK蛋白质序列均存在3个与甲羟戊酸底物结合及催化反应有关的保守结构域;EuMK的氨基酸组成中性的疏水性蛋白居多数,属于稳定的疏水性蛋白;无明显的跨膜结构,均在膜外;二级结构为混合型结构的蛋白质。EuMK均含有4个外显子,3个内含子;EuMK基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析发现,含有大量基本顺式作用元件TATAbox,CAATbox,还含有光(AE-box、CGT-motif、Box 4、G-box)、生长素(ERE、ABRE、TCA-element)响应等多个顺式调控元件。

关键词：杜仲甲羟戊酸激酶反式聚异戊二烯生物信息学

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杜仲EuACOTS基因家族的鉴定及生物信息学分析

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经济林研究 2013年第4期31卷 1-8页

乙酰CoA酰基转移酶(acetylCoA Cacetyltransferase,ACOT)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的起始酶,为了揭示生物合成杜仲胶的机制,对杜仲ACOTS基因家族进行全面的生物信息学分析。EuACOTS家族含有3个基因,分... 详细信息

乙酰CoA酰基转移酶(acetylCoA Cacetyltransferase,ACOT)是萜类化合物生物合成甲羟戊酸(mevalonate pathway,MVA)途径的起始酶,为了揭示生物合成杜仲胶的机制,对杜仲ACOTS基因家族进行全面的生物信息学分析。EuACOTS家族含有3个基因,分别记为EuACOT8、EuACOT9、EuACOT10。对其氨基酸序列的理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性以及同源进化等性质进行了分析,结果发现EuACOTS蛋白质的性质结构均较为相似,均存在2个硫解酶的特异保守序列,均属于稳定的疏水蛋白,无明显的跨膜区。在对EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件潜在功能的预测分析中发现,EuACOTS基因家族启动子顺式作用元件进行比较发现启动子作用既有保守性,又有特异性,其中EuACOTS家族含有大量基本顺式作用元件TATAbox,CAATbox以及光(AE-box、Box I、MNF1)、乙烯(ERE)、真菌诱导(Box-W1)和脱落酸(ABRE)等多个顺式调控元件。

关键词：杜仲乙酰CoA 酰基转移酶生物信息学

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翅荚木苗期生长模型及其生长参数研究

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江西农业大学学报 2008年第1期30卷 81-85页

作者：何小勇赵思东袁德义张琳柳新红王军锋中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室浙江省林业科学研究院浙江杭州310023 浙江省丽水市林业科学研究所浙江丽水323000

以翅荚木3个不同种源为研究对象，对其苗期生长量进行测定，采用Logistic方程拟合其苗高和地径生长规律，建立生长模型，并根据拟合曲线的相关系数求相应种源的苗期物候和生长参数，进行比较分析。结果表明：利用Logistic方程可较好地... 详细信息

以翅荚木3个不同种源为研究对象，对其苗期生长量进行测定，采用Logistic方程拟合其苗高和地径生长规律，建立生长模型，并根据拟合曲线的相关系数求相应种源的苗期物候和生长参数，进行比较分析。结果表明：利用Logistic方程可较好地拟合翅荚木种源苗期生长的动态变化，其相关系数在0．9971～0．9992之间，达到极显著相关；3个种源的地径线性生长期和生长速率差异不大，但苗高线性生长期差异较大，湖南通道种源明显小于其它2个种源8～9d；苗高线性生长量不同种源间也存在一定的差异，湖南通道种源为108．6753cm，广西苹果种源为119．8689cm，而广东翁源种源高达130．8458cm，是湖南通道种源的120．40％。

关键词：翅荚木种源苗期生长模型

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