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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：严方方谭晓风龙洪旭中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙 410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙 410004

β-酮脂酰-ACP合酶－KAS是脂肪酸合成中的一种缩合酶.本研究以近成熟的油桐种子为材料,利用改良CTAB法提取总RNA,并根据GenBank 中蓖麻等已知的β-酮脂酰-ACP合酶基因KASⅢ 的序列设计引物,利用简并PCR、RACE 等技术克隆得到油桐种子中... 详细信息

β-酮脂酰-ACP合酶－KAS是脂肪酸合成中的一种缩合酶.本研究以近成熟的油桐种子为材料,利用改良CTAB法提取总RNA,并根据GenBank 中蓖麻等已知的β-酮脂酰-ACP合酶基因KASⅢ 的序列设计引物,利用简并PCR、RACE 等技术克隆得到油桐种子中KASⅢ基因全长cDNA.该基因序列全长1901bp,开放阅读框为1209bp,编码403个氨基酸,通过与其他物种的KASⅢ氨基酸序列比对,油桐KASⅢ基因与与麻疯树的同源性最高,达90％.软件预测表明,KASⅢ蛋白等电点为5.78,存在跨膜结构域,整个蛋白质基本上是表现出亲水性的.

关键词：油桐 KASⅢ 基因克隆序列分析:结构预测

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基于SRAP的赣南油茶良种分子鉴别研究

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中南林业科技大学学报 2012年第3期32卷 147-151页

作者：韩欣张党权王志平宋志丹谷振军王金路邝先松田晔林中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学长沙市经济林工程技术研究中心湖南长沙410004 抚州市林业科学研究所江西抚州344000 赣州市林业科学研究所江西赣州341000 北京农学院园林学院北京102206

油茶是我国南方的主要木本食用油料树种,赣南油茶良种是我国重要的油茶资源组成部分。利用SRAP(序列相关扩增多态性)标记技术,对我国油茶良种分子鉴别进行探索性研究。以14个赣南油茶良种为对象,提取叶片基因组DNA作为模板,筛选出稳定... 详细信息

油茶是我国南方的主要木本食用油料树种,赣南油茶良种是我国重要的油茶资源组成部分。利用SRAP(序列相关扩增多态性)标记技术,对我国油茶良种分子鉴别进行探索性研究。以14个赣南油茶良种为对象,提取叶片基因组DNA作为模板,筛选出稳定性高的引物组合;采用SRAP-PCR的优化反应体系,对获得的清晰可重复的条带进行{0,1}数据转换,并根据SRAP的谱带特征建立了赣南油茶良种的分子鉴别体系,为油茶良种的分子鉴定提供了理论依据和技术基础。

关键词：赣南油茶分子鉴别 SRAP 良种

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五节芒CCoAOMT和4CL的克隆和表达分析

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华北农学报 2012年第4期27卷 29-35页

作者：常瑞娜汪杏芬陈鸿鹏南京大学生命科学院江苏南京200091 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所上海200032 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

木质素是细胞壁的重要组成部分,在植物的生长发育和抵御病原微生物的侵害方面发挥着重要的作用,但木质素结构稳定,成为生物质能源转化的障碍。以五节芒(Miscanthus floridulus)为材料克隆得到了木质素合成过程中的关键酶CCoAOMT基因全长... 详细信息

木质素是细胞壁的重要组成部分,在植物的生长发育和抵御病原微生物的侵害方面发挥着重要的作用,但木质素结构稳定,成为生物质能源转化的障碍。以五节芒(Miscanthus floridulus)为材料克隆得到了木质素合成过程中的关键酶CCoAOMT基因全长CDS序列和4CL基因的CDS半长序列,并对其CDS和氨基酸序列与其他物种进行了比对分析。相应的qRT-PCR分析显示,2个基因在五节芒的幼苗期、抽穗期的茎节、成熟叶片、幼穗都有表达,且与木质素的合成有一定的相关性。间苯三酚溶液染色结果亦显示,2个基因的表达规律与茎秆的木质化进程一致。五节芒CCoAOMT和4CL基因的克隆和表达分析将为进一步研究其生物学功能和改良能源作物奠定基础。

关键词：五节芒木质素咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT) 4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)

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柿属植物叶绿体DNA提取方法优化

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中南林业科技大学学报 2015年第12期35卷 25-28,33页

作者：傅建敏梁玉琴孙鹏姬燕晓谭晓风中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 武汉大学生命科学学院湖北武汉430072 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

利用Percoll密度梯度离心法,对4种柿属植物君迁子*** L.、油柿*** Cheng、浙江柿*** Metc.、金枣柿*** spp.进行叶绿体DNA(cp DNA)提取方法的优化,结果显示优化后的柿属植物cp DNA提取方法具有高效、简便、重复性好、稳定性高的特点;经... 详细信息

利用Percoll密度梯度离心法,对4种柿属植物君迁子*** L.、油柿*** Cheng、浙江柿*** Metc.、金枣柿*** spp.进行叶绿体DNA(cp DNA)提取方法的优化,结果显示优化后的柿属植物cp DNA提取方法具有高效、简便、重复性好、稳定性高的特点;经检验,利用此方法提取的cp DNA质量好,浓度与纯度均较高,能够满足后续叶绿体PCR扩增、基因组测序等分子生物学试验。

关键词：柿属植物叶绿体 DNA提取 Percoll密度梯度离心

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植物营养学在经济林研究中的运用

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经济林研究 2011年第3期29卷 107-110页

作者：袁军谭晓风袁德义中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 北京林业大学研究生院北京100083

植物营养学是研究植物对营养物质的吸收、运输、转化和利用规律及植物与外界环境之间营养物质和能量交换的学科,在农林生产中运用广泛。文中结合植物营养学科的研究概况及趋势,简要介绍其在经济林品种选育、营养诊断与施肥、树体调控及... 详细信息

植物营养学是研究植物对营养物质的吸收、运输、转化和利用规律及植物与外界环境之间营养物质和能量交换的学科,在农林生产中运用广泛。文中结合植物营养学科的研究概况及趋势,简要介绍其在经济林品种选育、营养诊断与施肥、树体调控及抗逆研究中的运用,并对今后经济林营养学的研究方向进行了探讨。

关键词：经济林植物营养学应用前景综述

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转录组数据组装及功能注释

转录组数据组装及功能注释

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：乌云塔娜刘慧敏杜红岩中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙 410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004 中国林业科学院经济林研究中心河南郑州 450009

对优良品种进行了转录组测序、组装和功能注释.对杜仲国审良种‘华仲6号’果实和叶片进行转录组测序和生物信息学分析,共获得了106,264,108个reads、7,491,046,464Nucleotides (nt)、1316317个Contig、292591个Scaffold、185403个Unigene 片段;对All-Unigene功能注释分别获得了67119个、67119个和4948个CDS、protein 和EST 的Unigene;GO、COG、KEGG 分类分别注释了72893、42359、43715个Unigene.

关键词：杜仲转录组测序生物信息学分析功能注释

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‘湘林’系列油茶授粉品种配置模式研究

‘湘林’系列油茶授粉品种配置模式研究

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：乌云塔娜刘慧敏杜红岩中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中国林业科学院经济林研究中心河南郑州 450009

油茶被认为自交不亲和树种,故在优质丰产栽培过程中必须配置授粉品种。但目前尚未搞清油茶自交不亲和性机理、类型及程度,严重影响了优良品种的授粉品种及配置模式选择。本研究以59个‘湘林’系列油茶品种为研究对象,在品种开花物候期观... 详细信息

油茶被认为自交不亲和树种,故在优质丰产栽培过程中必须配置授粉品种。但目前尚未搞清油茶自交不亲和性机理、类型及程度,严重影响了优良品种的授粉品种及配置模式选择。本研究以59个‘湘林’系列油茶品种为研究对象,在品种开花物候期观察,花粉量和花粉活力测定的基础上,通过品种间授粉亲和程度的调查研究,建立了‘湘林’系列油茶品种的授粉品种配置模式。结果表明：59个‘湘林’系列油茶品种开花物候期主要集中在10月底开始到11月底,可分成5个盛花期重叠组;59个湘林系列油茶品种的花粉量大小存在差异,6800～200个/花药,花粉活力也存在差异,100％～57％;综合考虑盛花期、花粉量、花粉活力等因素,共分出5个授粉组合,在每个组合所预选的授粉品种中,根据其杂交授粉亲和程度,分别筛选出了9个、2个、4个、2个、2个授粉品种,授粉座果率达70％～100％。该研究系统研究油茶品种间授粉亲和性及授粉模式,为湘林系列油茶高产栽培提供了重要的理论依据。

关键词：普通油茶授粉品种杂交亲和性

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油茶分子育种基础研究进展

油茶分子育种基础研究进展

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中国林学会林木遗传育种分会第七届全国林木遗传育种学术大会

作者：谭晓风曾艳玲经济林培育与保护教育部重点实验室(中南林业科技大学) 湖南长沙410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

油茶是原产我国的特色油料树种,主要栽培分布于秦岭、淮河以南的南方丘陵酸性红壤地区.茶油富含不饱和脂肪酸,是世界上最优质的食用植物油之一.国外基本上没有油茶的研究,油茶研究全部集中在我国.1995年以前,我国油茶育种研究都是常规... 详细信息

油茶是原产我国的特色油料树种,主要栽培分布于秦岭、淮河以南的南方丘陵酸性红壤地区.茶油富含不饱和脂肪酸,是世界上最优质的食用植物油之一.国外基本上没有油茶的研究,油茶研究全部集中在我国.1995年以前,我国油茶育种研究都是常规育种技术,为油茶产业化发展提供优良品种.由于油茶基因组大,自交不亲和,杂合度高,进入盛果期时间长,导致油茶常规育种周期长,很难对一个或多个性状进行有效遗传改良,而且常伴随遗传累赘,开展分子育种研究很有必要.中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室从1995年开始利用分子标记从事山茶属植物分子标记开发和分子分类、分子鉴别的研究,开启了以分子标记为基础的油茶分子生物学的研究.2001年,本实验室利用油茶近成熟种子构建了第一个油茶cDNA文库,并通过对cDNA克隆的随机测序构建了油茶近成熟种子的EST文库,获得了2327个EST序列,注释已知功能基因763条,未知功能基因1216条;以部分基因的EST序列为基础,开展了部分重要基因克隆的研究,真正开启了以油茶功能基因研究的油茶分子育种的基础研究.2009年,本实验室根据油茶分子育种研究的需要,以油茶果实和种子为材料,开启了油茶转录组、表达谱、重要代谢途径和分子调控的系列研究,共注释油茶非冗余基因10845个;确认了油茶果实膨大期与油茶种子近成熟期基因表达差异非常大;绘制了油茶糖酵解途径、油茶脂肪酸合成代谢途径、油茶α-亚麻酸代谢途径等重要代谢途径,揭示了相关基因表达调控的基本规律.根据油茶EST和转录组数据信息,开展了油茶重要基因克隆和基因功能研究,克隆了包括提升油茶种子油产量、改良油茶产品品质、提高抗逆性能等重要基因53个,为油茶分子设计育种提供科学依据和物质基础.2006年开始,利用部分重要克隆基因,开展了对野生型拟南芥和突变性拟南芥的转基因试验研究;2010年以后,开展了以提高产油产量、改善茶油品质和提高抗逆性能的油菜转基因试验研究，进一步确认克隆的油茶重要基因的功能及其对相关性状的调控,为进一步开展油茶分子设计育种提供理论依据和技术支持.正在开展油茶基因芯片设计开发研究和油茶组织培养和再生体系的研究.总之,油茶分子育种还处于初级阶段,今后还有必要开展油茶基因组、蛋白质组、代谢组的研究;尽快制作油茶专用基因芯片,开展不同组织器官、不同时期、不同发育阶段等基因表达差异的研究;尽快建立油茶转基因技术体系和分子设计育种的试验研究,培育种仁含油率高、脂肪酸含量更趋合理、适应性更强的油茶优质高产新品种.

关键词：油茶分子育种品种资源

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槲皮素合成关键酶基因的序列特征

槲皮素合成关键酶基因的序列特征

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

分离鉴定了3条槲皮素和山奈素合成途径全长cDNA,并对其序列特征进行了详细分析.查尔酮合成酶(EuCHS),cDNA全长为1191bp,编码397个氨基酸,分子量为43.33kD,理论等电点为6.23;氨基酸组成中以亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸为主的疏水性稳定蛋白质... 详细信息

分离鉴定了3条槲皮素和山奈素合成途径全长cDNA,并对其序列特征进行了详细分析.查尔酮合成酶(EuCHS),cDNA全长为1191bp,编码397个氨基酸,分子量为43.33kD,理论等电点为6.23;氨基酸组成中以亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸为主的疏水性稳定蛋白质;EuCHS 二级结构α-螺旋占、β-折叠、螺环结构为主的混合型结构,属cond-enzymes 超家族.查尔酮异构酶基因(EuCHI),cDNA全长为777bp,编码259个氨基酸,EuCHI 分子量为27.63 kD,理论等电点为4.81;氨基酸组成中以苏氨酸、甘氨酸、缬氨酸为主的疏水性稳定蛋白质;EuCHI 二级结构以螺环结构、α-螺旋和β-折叠为主的混合型结构的蛋白质,属chalone 超家族.类黄酮-3’-羟化酶(EuF3’H)基因其全长cDNA为1551bp,编码517个氨基酸,EuF3H 分子量为56.71kD,理论等电点为8.72;氨基酸组成以亮氨酸、丙氨酸、甘氨酸为主的,疏水性的稳定蛋白质,EuF3H 属分泌蛋白;EuF3’H 二级结构以α-螺旋占和螺环结构结构为主的混合型结构的蛋白质,属Cypx 超家.

关键词：槲皮素全长cDNA 查尔酮合成酶(EuCHS) 查尔酮异构酶基因(EuCHI)

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8个中国梨品种S基因型的分子鉴定

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果树学报 2007年第6期24卷 757-760页

作者：梁文杰谭晓风张琳曾艳玲姜傲芳曹玉芬李秀根中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙410004 中国农业科学院果树研究所辽宁兴城125100 中国农业科学院郑州果树研究所郑州450009

为鉴定8个中国梨品种的S基因型,使用梨自交不亲和基因(S-RNase)特异引物"FTQQYQ"和"anti-ⅡWP-NV",对8个梨品种的基因组DNA进行特异扩增,并对扩增片段进行回收、克隆、测序。使用生物信息学软件对各序列分析和经同... 详细信息

为鉴定8个中国梨品种的S基因型,使用梨自交不亲和基因(S-RNase)特异引物"FTQQYQ"和"anti-ⅡWP-NV",对8个梨品种的基因组DNA进行特异扩增,并对扩增片段进行回收、克隆、测序。使用生物信息学软件对各序列分析和经同源性搜索分析后,确定了各品种的S基因型。结果分别是:兰州花长把为S19S22,青面为S1S18,黄面为S1S12,早蜜为S19S29,大面黄为S1S19,无子黄为S28S16,大青皮为S34S19及金锤子为S16S19。

关键词：梨自交不亲和性 S基因型鉴定

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