检索结果-内蒙古大学图书馆

林业科学研究 2013年第5期26卷 578-587页

作者：蒋瑶戚晓利赵树堂卢孟柱中国林业科学研究院林业研究所林木遗传育种国家重点实验室北京100091 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410002 佳木斯大学生命科学学院黑龙江佳木斯154007

为了分析AP1的表达调控模式,本研究克隆了拟南芥花异常株系AFDL的AP1启动子,启动子元件预测结果表明:AP1启动子中含有3个结合MADS调控因子的CArG box(从5'依次编号为CArG1、CArG2、CArG3),通过删减AP1启动子长度以及改变CArG box数... 详细信息

为了分析AP1的表达调控模式,本研究克隆了拟南芥花异常株系AFDL的AP1启动子,启动子元件预测结果表明:AP1启动子中含有3个结合MADS调控因子的CArG box(从5'依次编号为CArG1、CArG2、CArG3),通过删减AP1启动子长度以及改变CArG box数量构建了5个GUS表达载体并转化野生型拟南芥。测序结果显示:AFDL的AP1启动子在核苷酸序列上与野生型拟南芥完全一致,这表明AP1在AFDL中的表达显著降低并不是启动子序列突变引起的;转基因植株的GUS表达模式说明了CArG1在花发育早期及后期激活基因的表达,CArG2在整个后期都对基因的表达有抑制作用,而CArG3在花发育初期就能抑制基因的表达,并且在中后期仍然保持了对下游基因的抑制作用,CArG box1、2、3对AP1的表达有显著但非决定性的影响。此外,还推测在AP1启动子0-3 579 bp范围之外存在影响AP1在第4轮花器官表达的调控元件,-3 579 bp至-1 752 bp区域可促进AP1的表达,而AP1启动子-1 759 bp至-1 359 bp区域除CArG2外的其它元件对调节其表达无明显作用。

关键词：启动子 APETALA1 CArG box 分生组织形态建成 GUS染色

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杜仲成熟果实和幼果MVA途径基因表达差异分析

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经济林研究 2013年第4期31卷 45-51页

作者：王淋乌云塔娜叶生晶中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心河南郑州450003 国家林业局中南林业调查规划设计院湖南长沙410014

甲基戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)是萜类物质合成的关键途径之一。为了探明杜仲胶的生物合成机制,利用杜仲幼果及成熟果实转录组数据库,确定了MVA途径的EuACOT、EuHMGS、EuHMGR、EuMK、EuPMK、EuMDP基因,并对其表达量进行了全面分... 详细信息

甲基戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)是萜类物质合成的关键途径之一。为了探明杜仲胶的生物合成机制,利用杜仲幼果及成熟果实转录组数据库,确定了MVA途径的EuACOT、EuHMGS、EuHMGR、EuMK、EuPMK、EuMDP基因,并对其表达量进行了全面分析。结果表明:在杜仲幼果和成熟果实转录组中,萜类物质合成(MVA)途径共涉及基因30条,分别为EuACOT 7条、EuHMGS 3条、EuHMGR 11条、EuMK 2条、EuPMK 2条、EuMDP 5条;其中,EuHMGR4、EuHMGR5在杜仲幼果中有特异表达;EuACOT7、EuHMGR10在杜仲成熟果实中有特异表达;EuACOT2-EuACOT6、EuHMGS1-EuHMGS3、EuHMGR1、EuHMGR2、EuHMGR8、EuHMGR10、EuMK1、EuMK2、EuPMK1、EuMDP1-EuMDP5在杜仲幼果和成熟果实中的表达量具有显著差异。

关键词：杜仲萜类物质合成途径基因表达幼果成熟果实差异分析

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杜仲MEP途径系列基因的基因结构预测

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经济林研究 2013年第4期31卷 39-44页

作者：刘慧敏乌云塔娜杜红岩中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心河南郑州450003

为深入了解杜仲MEP途径基因的功能,以杜仲转录组和基因组序列为基础,预测了MEP途径系列基因的基因结构,包含两端非编码区、内含子和外显子的确定。结果表明:EuDXS2基因基因组全长为9 455 bp,包含9个内含子和10个外显子,5′端非编码区和... 详细信息

为深入了解杜仲MEP途径基因的功能,以杜仲转录组和基因组序列为基础,预测了MEP途径系列基因的基因结构,包含两端非编码区、内含子和外显子的确定。结果表明:EuDXS2基因基因组全长为9 455 bp,包含9个内含子和10个外显子,5′端非编码区和3′端非编码区的长度分别为1 853 bp和2 000 bp;EuDXR基因的基因组全长6 822 bp,包含11个内含子和12个外显子,5′端非编码区和3′端非编码区的长度为1 120 bp和2 163 bp;EuCMK基因的基因组全长为19 835 bp,包含10个内含子和11个外显子,5′端非编码区和3′端非编码区的长度分别为5 000 bp和424 bp;EuMDS基因的基因组全长为11 771 bp,包含2个内含子和3个外显子,5′端非编码区和3′端非编码区的长度均为5 000 bp;EuHDS基因的基因组全长为13 359 bp,包含18个内含子和19个外显子,5′端非编码区和3′端非编码区的长度均为2 000 bp;EuHDR基因的基因组全长为7 844bp,包含8个内含子和9个外显子,5′端非编码区和3′端非编码区的长度分别为1 347 bp和3 000 bp。

关键词：杜仲 MEP途径基因结构

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杜仲MEP途径系列基因5′端非编码区的顺式作用元件预测

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经济林研究 2013年第4期31卷 9-15页

作者：乌云塔娜刘慧敏杜红岩中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 国家林业局杜仲工程技术研究中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004

为深入了解杜仲MEP途径基因5′端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5′端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5′端非编码区预测出共有22... 详细信息

为深入了解杜仲MEP途径基因5′端非编码区的功能,在杜仲转录组和全基因组序列的基础上,利用生物信息学方法系统预测了MEP途径系列基因5′端非编码区顺式作用元件的结构和功能。生物信息学分析表明:EuDXS2基因5′端非编码区预测出共有22种共220个顺式作用元件,其中包含启动子顺式元件145个TATA-box和39个CAAT-box的可能位点;EuDXR基因5′端非编码区预测出21种共127个顺式作用元件,68个TATAbox和32个CAAT-box;EuCMK基因5′端非编码区预测出24种共134个顺式作用元件,包含32个CAAT-box和68个TATA-box;EuMDS基因5′端非编码区共预测出30种共104个顺式作用元件,其中43个CAAT-box和23个TATA-box;EuHDS基因5′端非编码区预测出35种共126个顺式作用元件,包括29个CAAT-box和34个TATA-box;EuHDR基因5′端非编码区预测出24种共115个顺式作用元件,包含19个CAAT-box和67个TATA-box。

关键词：杜仲 MEP途径 5’端非编码区顺式作用元件

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杜仲MVA途径相关基因的鉴定及荧光定量PCR引物筛选

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中南林业科技大学学报 2013年第8期33卷 50-56页

作者：叶生晶乌云塔娜田大伦许靖诗中南林业科技大学生命科学与技术学院湖南长沙410004 南方林业生态应用技术国家工程实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

杜仲富含萜类物质,MVA途径是萜类物质合成的重要途径之一。从杜仲果实转录组数据KEGG中杜仲MVA途径共被注释30条Unigene,根据NCBI中的BLAST比较,分别鉴定了乙酰COA酰基转移酶,羟甲基戊二酰辅酶a合成酶,羟甲基戊二酰辅酶a还原酶,甲羟戊... 详细信息

杜仲富含萜类物质,MVA途径是萜类物质合成的重要途径之一。从杜仲果实转录组数据KEGG中杜仲MVA途径共被注释30条Unigene,根据NCBI中的BLAST比较,分别鉴定了乙酰COA酰基转移酶,羟甲基戊二酰辅酶a合成酶,羟甲基戊二酰辅酶a还原酶,甲羟戊酸激酶,磷酸甲羟戊酸激酶,二磷酸甲羟戊酸脱羧酶基因,被注释7条,3条,11条,2条,2条,5条。表达差异分析表明,以上基因中分别为5条,3条,4条,1条,5条为幼果和成熟果实差异表达基因。对差异表达基因序列进行软件设计、引物特异性分析和实验验证,最终筛选出10对适合杜仲MVA途径SYBR GreenI荧光定量PCR的引物,为MVA途径基因表达差异研究及萜类物质积累的分子机理研究提供重要依据。

关键词：杜仲萜类合成MVA途径荧光定量PCR 引物筛选

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油茶花芽分化及雌雄配子体发育研究

油茶花芽分化及雌雄配子体发育研究

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全国油茶技术协作组第一届油茶学术交流会

作者：袁德义邹锋谭晓风何春燕袁军范晓明中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室

以'湘林1号'油茶为试材,运用石蜡切片法对其花芽分化及雌雄配子体发育进行解剖观察,并对其花芽发育与外部形态的相关性进行分析.结果表明:(1)湘林1号'花芽分化大致可以划分为6个时期:即前分化期、萼片形成期、花瓣形成期、... 详细信息

以'湘林1号'油茶为试材,运用石蜡切片法对其花芽分化及雌雄配子体发育进行解剖观察,并对其花芽发育与外部形态的相关性进行分析.结果表明:(1)湘林1号'花芽分化大致可以划分为6个时期:即前分化期、萼片形成期、花瓣形成期、雌雄蕊形成期、子房与花药形成期和雌雄蕊成熟期.(2)湘林1号'的花药为4室;药壁发育属于基本型;腺质绒毡层;小孢子母细胞减数分裂中胞质分裂为同时型,四分体排列多为正四面体;开花前7～9天花粉成熟,成熟花粉为2-细胞花粉粒.(3)胚珠为倒生胚珠,薄珠心,具双层珠被;大孢子母细胞经减数分裂形成二分体,其中只有合点端的大孢子具功能,经过3次有丝分裂形成7细胞8核胚囊,胚囊发育为葱型.(4)在花芽发育过程中,不仅雌雄性细胞的形成之间有比较稳定的对应关系,而且它们与其外部形态特征之间也有着相对稳定的关系.根据它们的时序性对应关系,可以通过花芽或花的外部形态特征来对其内部的性细胞发育进程进行即时判别.

关键词：油茶花芽分化生长发育

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林下套种墨西哥玉米草的营养价值研究

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中南林业科技大学学报 2013年第12期33卷 27-31页

作者：陈丽莉陈斌刘兴锋罗迎社谷振军张党权中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学流变力学与材料工程研究所湖南长沙410004 湘西州林业科学研究所湖南吉首416000 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

近年来我国可用林地逐渐减少,开发林下经济作物是缓解这一矛盾的新兴发展方向。以此为背景,采用饲用牧草与小乔木的套种技术,于油茶林下种植墨西哥玉米草,并分析2个不同生长时期玉米草中粗蛋白、有机质等9种营养物质含量的差别。林下种... 详细信息

近年来我国可用林地逐渐减少,开发林下经济作物是缓解这一矛盾的新兴发展方向。以此为背景,采用饲用牧草与小乔木的套种技术,于油茶林下种植墨西哥玉米草,并分析2个不同生长时期玉米草中粗蛋白、有机质等9种营养物质含量的差别。林下种植中等生长期墨西哥玉米草与短生长期玉米草的水分及挥发物含量分别为14.91%和12.87%,粗灰分含量分别为5.11%和5.45%,钙含量分别为0.26%和0.33%,磷含量分别为0.23%和0.26%,粗脂肪含量分别为13.41 g/kg和19.29 g/kg,粗纤维含量分别为284.55 g/kg和235.28 g/kg,干物质含量分别为85.09%和87.13%,有机质含量分别为94.90%和94.55%,粗蛋白含量分别为7.0%和12.87%。分析结果表明,林下种植的玉米草营养物质含量与传统种植的玉米草营养物质含量没有显著差别,并且短生长期的玉米草的饲用价值要高于中等生长期玉米草。

关键词：林下经济作物林下套种林下饲草墨西哥玉米草营养价值

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油桐花芽总RNA提取方法的改良及SOC1同源基因片段的克隆分析

油桐花芽总RNA提取方法的改良及SOC1同源基因片段的克隆分析

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第三届中国林业学术大会

作者：罗敏孙颖陈显李建安中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004

油桐花芽中含大量的蛋白质、多糖、多酚等次生代谢产物,花芽高质量RNA提取较为困难.本文采用改良CTAB+RNAiso-mate法进行油桐花芽总RNA的提取实验研究.并通过蛋白核酸检测仪检测其纯度与得率,结果表明,改良的CTAB+RNAiso-mate方法提取的... 详细信息

油桐花芽中含大量的蛋白质、多糖、多酚等次生代谢产物,花芽高质量RNA提取较为困难.本文采用改良CTAB+RNAiso-mate法进行油桐花芽总RNA的提取实验研究.并通过蛋白核酸检测仪检测其纯度与得率,结果表明,改良的CTAB+RNAiso-mate方法提取的RNA质量好,条带整齐、清晰,完整性及纯度好,A260/A280比值约为1.97,得率约70μg·g-1.在提取到的高质量RNA基础上,采用RT-PCR成功克隆了油桐SOC1同源基因片段,片段长度为611bp,与蓖麻、杨树、大豆的SOC1同源基因相似度分别为85％、84％、78％,进化树分析得出油桐与蓖麻亲缘关系较近.

关键词：油桐花芽总核糖核酸提取技术 SOC1基因基因克隆

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油茶EMF2基因的全长cDNA克隆及序列分析

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经济林研究 2013年第2期31卷 7-12页

作者：邬萌萌谭晓风周荣詹文勇胡孝义安徽农业大学林学与园林学院安徽合肥230036 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 安徽省油茶良种工程技术研究中心安徽舒城231340

EMF2基因是植物营养组织中的主要开花抑制基因,在植物花器官发育过程中发挥重要的作用。为给油茶性状表观遗传学调控研究提供参考依据,以"华鑫"油茶的组培幼苗为试验材料,采用3′RACE和5′RACE技术对油茶EMF2基因进行克隆及... 详细信息

EMF2基因是植物营养组织中的主要开花抑制基因,在植物花器官发育过程中发挥重要的作用。为给油茶性状表观遗传学调控研究提供参考依据,以"华鑫"油茶的组培幼苗为试验材料,采用3′RACE和5′RACE技术对油茶EMF2基因进行克隆及序列分析。结果表明:该基因全长2 210 bp,其中开放阅读框为1 866 bp,编码621个氨基酸,该基因被命名为Co-EMF2。多序列比对后发现,Co-EMF2具有EMF2基因特有的保守序列和相关特征,且与其它植物的EMF2基因具有较高的相似性。文中进而对其蛋白质序列和理化性质进行了分析,结果表明:其蛋白质属不稳定蛋白,等电点为6.17,是疏水性蛋白,亚细胞定位预测结果表明其位于细胞核中。

关键词：油茶 EMF2基因基因克隆全长cDNA 序列分析

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17油桐β-酮脂酰-CoA合成酶(KCS)基因的克隆与序列分析

17油桐β-酮脂酰-CoA合成酶(KCS)基因的克隆与序列分析

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第三届中国林业学术大会

作者：刘美兰谭晓风龙洪旭周俊琴湖南省长沙市经济林育种与栽培国家林业局重点实验室(中南林业科技大学) 410004

以油桐种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了1条KCS基因的全长cDNA,命名为Vf_KCS.生物信息学分析结果表明,KCS基因的CDS长度为1338bp,编码446个氨基酸;该基因编码的蛋白质具有3个酶活性位点、6个产... 详细信息

以油桐种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了1条KCS基因的全长cDNA,命名为Vf_KCS.生物信息学分析结果表明,KCS基因的CDS长度为1338bp,编码446个氨基酸;该基因编码的蛋白质具有3个酶活性位点、6个产物结合位点、5个丙二酰-CoA结合位点和多个二聚体形成位点;Vf_KCS有2个明显的跨膜螺旋拓扑结构和3个疑似跨膜螺旋拓扑结构;二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲构成,该蛋白为亲水性蛋白;Vf_KCS编码的氨基酸序列与其它物种的KCS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与葡萄的KCS基因相似度最高达89.69％,与其他植物的KCS基因所编码的氨基酸同源性大多在80％以上;通过进化树分析表明Vf_KCS与拟南芥亲缘关系最为接近.综合各项生物信息分析结果表明本研究得到一个完整的油桐KCS基因,其功能有待进一步验证.

关键词：油桐 β-酮脂酰 CoA合成酶基因克隆序列分析生物信息学

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