检索结果-内蒙古大学图书馆

中南林业科技大学学报 2012年第3期32卷 152-157页

作者：吴硕傅建敏乌云塔娜梁玉琴中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

利用从NCBI上下载的9 474条EST(Expressed Sequence Tags)序列,设计并开发EST-SSR引物,用于柿属种质资源的遗传多样性研究。下载的初始序列拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。用SSRHunter软件搜索到601条EST序列中含有540个SSR... 详细信息

利用从NCBI上下载的9 474条EST(Expressed Sequence Tags)序列,设计并开发EST-SSR引物,用于柿属种质资源的遗传多样性研究。下载的初始序列拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。用SSRHunter软件搜索到601条EST序列中含有540个SSR。SSR出现频率为10.96%,其中以2核苷酸为主。依据检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物100对,对9个柿属(Diospyros L.)种质资源样品进行了PCR扩增,其中42对引物有扩增带,占设计引物的42%,其中30对引物有多态性,占可扩增引物的71.4%。同时发现引物15是美洲柿(雄)的特异引物;引物30是青化北野柿的特异标记;引物69和引物80为美洲柿的特异引物;引物99是无核软枣的特异引物。

关键词：柿属 EST SSR标记遗传多样性

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云实叶片愈伤组织诱导中其酶活性及显微结构变化

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经济林研究 2012年第3期30卷 32-36页

作者：曾艳玲张琳谭运德杨睿周民民中南林业科技大学林学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 河南省林业科学研究院河南郑州450008

为给云实悬浮细胞培养、工厂化生产次生代谢产物奠定科学基础,以健壮云实当年生嫩叶为试材,接种在最佳诱导培养基上,对其生长过程进行解剖学观察,并分5个时间段研究苯丙氨酸裂解酶(PAL)、过氧化物酶(POD)、多酚氧化酶(PPO)活性变化。试... 详细信息

为给云实悬浮细胞培养、工厂化生产次生代谢产物奠定科学基础,以健壮云实当年生嫩叶为试材,接种在最佳诱导培养基上,对其生长过程进行解剖学观察,并分5个时间段研究苯丙氨酸裂解酶(PAL)、过氧化物酶(POD)、多酚氧化酶(PPO)活性变化。试验结果表明,内部变化早于外部变化,在肉眼观察到深绿色芽点之前1周,通过显微镜就已能观察到胚状体结构。PAL、POD和PPO活性在脱分化和再分化过程中分别呈现逐渐增强、先增强后减弱和逐渐减弱的趋势。云实悬浮细胞培养叶片愈伤组织取材最佳时期为接种28 d左右,此时愈伤组织疏松易分离,细胞生命力最为旺盛。

关键词：云实诱导愈伤组织酶解剖学

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柿EST-SSR引物的开发及筛选

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经济林研究 2012年第3期30卷 27-31页

作者：吴硕傅建敏乌云塔娜梁玉琴李芳东中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

为丰富柿树SSR引物来源,利用从NCBI下载的9 474条柿属EST序列开发柿EST-SSR引物,并用于分析7个柿品种的遗传多样性。EST序列经去除低质量及冗余片段后拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。共搜索到601条EST序列中含有540个SSR。... 详细信息

为丰富柿树SSR引物来源,利用从NCBI下载的9 474条柿属EST序列开发柿EST-SSR引物,并用于分析7个柿品种的遗传多样性。EST序列经去除低质量及冗余片段后拼接成1 390条重叠序列和4 097条无重复序列。共搜索到601条EST序列中含有540个SSR。SSR出现频率为10.96%,其中以2核苷酸为主(61.06%)。利用检出的SSR-ESTs序列设计SSR引物100对,对7个柿样品进行了PCR扩增,31对引物有扩增带,占设计引物的31%,其中14对引物有多态性,占可扩增引物的45.2%。同时发现引物68是临潼板柿的特异引物。引物68的P68-115、P68-160和P68-210处为临潼板柿的3个特异性标记位点,而引物28的P28-225是麻城秋艳的特异性标记位点。

关键词：柿 EST SSR标记

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柿属植物基因组DNA提取方法比较

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中南林业科技大学学报 2012年第4期32卷 170-173页

作者：梁玉琴李芳东傅建敏乌云塔娜吴硕中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试... 详细信息

针对柿属植物叶片富含单宁,常规CTAB法提取DNA质量低等问题,为了获得符合柿属植物SSR-PCR扩增要求的DNA,分别采用改良CTAB法和植物基因组DNA提取试剂盒两种方法,提取柿属植物DNA,结果显示:两种方法均可得到满足SSR-PCR扩增要求的DNA;试剂盒较改良CTAB法提取的DNA质量高、杂质少,DNA得率略低,但其操作步骤简单,耗时短,毒害小,因其费用较改良CTAB法高,各实验室可根据自身条件选择适宜方法提取柿属植物DNA。

关键词：柿属植物 DNA提取改良CTAB法基因组DNA提取试剂盒

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杜仲幼果和成熟果实转录组数据组装及基因功能注释

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中南林业科技大学学报 2012年第10期32卷 9-17页

作者：李铁柱杜红岩刘慧敏乌云塔娜王淋叶生晶中南林业科技大学生命科学与技术学院湖南长沙410004 中国林业科学研究院经济林研究开发中心河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙410004

对杜仲幼果和成熟果实进行测序后,共获得了53 080 588个reads片段,包含了4 777 252 920个核苷酸序列信息,对reads进行拼接,共获得了921 902个Contig片段,序列信息达到了129 461 462 nt;在Contig数据的基础上,进一步采用over-lap的方法... 详细信息

对杜仲幼果和成熟果实进行测序后,共获得了53 080 588个reads片段,包含了4 777 252 920个核苷酸序列信息,对reads进行拼接,共获得了921 902个Contig片段,序列信息达到了129 461 462 nt;在Contig数据的基础上,进一步采用over-lap的方法进行拼接,共获得了190 518个Scaffold片段,序列信息达到了67 868 367 nt;在Scaffold数据的基础上,进一步拼接,数据共获得了64 474个Unigene片段,序列信息达到了39 120 703 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲幼果和成熟果实转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类;Unigene根据GO功能大致可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类44分支;利用KEGG数据库作为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成119类,包括生化代谢通路、植物—真菌互作、DNA剪切、植物激素生物合成、苯丙氨酸生物合成、萜类化合物与类固醇类化合物合成、脂类代谢、RNA降解等。

关键词：杜仲幼果成熟果实转录组基因功能

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杜仲果实和叶片转录组数据组装及基因功能注释

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中南林业科技大学学报 2012年第11期32卷 122-130页

所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同... 详细信息

所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同理,对Scaffold进一步拼接后,获得了49 610条Unigene,总长度为37616 729 nt;Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类;杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类42分支;以KEGG数据库为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成125类,包括脂类代谢,DNA剪切,植物激素生物合成,苯丙氨酸生物合成,萜类化合物与类固醇类化合物合成等。

关键词：杜仲果实叶片转录组基因功能

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杜仲分子育种研究新进展

杜仲分子育种研究新进展

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2012中国杜仲产业发展高峰论坛

作者：乌云塔娜中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室

杜仲是我国特有的优质天然橡胶树种,也是名贵的中药材树种。本文全面总结了杜仲分子育种方面的最新研究进展。首先，通过杜仲叶片和果实的转录组测序及深度分析获得了大量基因的表达规律，如杜仲胶、α-亚麻酸、苯丙素类、黄酮类、类胡... 详细信息

杜仲是我国特有的优质天然橡胶树种,也是名贵的中药材树种。本文全面总结了杜仲分子育种方面的最新研究进展。首先，通过杜仲叶片和果实的转录组测序及深度分析获得了大量基因的表达规律，如杜仲胶、α-亚麻酸、苯丙素类、黄酮类、类胡萝卜素等重要活性物质生物合成途径的相关基因的表达规律及关键酶基因信息，果实和叶片差异表达基因和特异表达基因的信息;发现了杜仲胶合成上游相关基因有124条，并分离克隆了28条杜仲胶合成上游途径MEP和MVA途径的重要基因cDNA全长，揭示其表达规律和序列特征，筛选其关键酶基因;杜仲胶合成下游相关基因共74条，其中分离克隆了35条如乳胶管蛋白(MLP)、橡胶延伸因子(REF)、橡胶小颗粒蛋白SRPP和杜仲胶合成关键酶基因异戊二烯磷酸二合酶(TIDS)的cDNA全长，并揭示其表达规律、遗传多样性、基因定位及功能差异;构建了杜仲胶合成基因的RNA干扰表达载体和过量表达载体，并对杜仲和烟草进行转基因试验，筛选出了杜仲胶合成上游和下游关键酶基因，初步分析表明，将提高杜仲胶含量18.65％～26.54％。为杜仲的分子育种打下了扎实的基础。开发了杜仲EST-SSR引物154条，筛选出了有效引物33对，并对258个不同地区、不同生境、不同类型杜仲种质资源进行遗传检测，首次揭示了杜仲遗传多样性、遗传变异、遗传分化、不同地区间的基因交流程度等，为杜仲种质资源的科学、有效利用提供了重要的依据。

关键词：杜仲树分子育种基因表达种质资源

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油茶CoUXS1基因全长cDNA克隆及生物信息学分析

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中国农学通报 2012年第22期28卷 39-44页

作者：曾艳玲谭晓风王保明龙洪旭刘凯曾晓峰中南林业科技大学森林培养与保护教育部重点实验室长沙410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙410004

为了揭示油茶UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因的序列特点和结构功能,为该基因的深入研究和开发应用奠定基础。根据油茶种子EST文库中调取的UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术获得该基因全长cDNA克隆,并对其序列进行... 详细信息

为了揭示油茶UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因的序列特点和结构功能,为该基因的深入研究和开发应用奠定基础。根据油茶种子EST文库中调取的UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术获得该基因全长cDNA克隆,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明:该基因阅读框为1032bp,编码344个氨基酸,具有典型的UXS家族模体序列。与海岛棉GhUXS3基因亲缘关系最近,定位于细胞质,有较强的亲水性,将该基因命名为CoUXS1,GenBank登录号为JN017094。

关键词：油茶 UXS cDNA 系统进化分析结构域功能预测

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攸县油茶F2代4个优良单株花器特征观测及花粉特性分析

攸县油茶F2代4个优良单株花器特征观测及花粉特性分析

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：向晖袁德义高超廖婷唐静中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

为开展油茶杂交育种和认识种间杂交后代的特性,以(攸县油茶×‘湘林1号’)×‘茶陵166’的杂交后代4个优良单株为试材,研究了花器特征和花粉特性,结果表明：(1)4 株油茶单花开放历时为17～18 天,花期均在2月下旬至四月中旬;攸杂... 详细信息

为开展油茶杂交育种和认识种间杂交后代的特性,以(攸县油茶×‘湘林1号’)×‘茶陵166’的杂交后代4个优良单株为试材,研究了花器特征和花粉特性,结果表明：(1)4 株油茶单花开放历时为17～18 天,花期均在2月下旬至四月中旬;攸杂034 开花最早,花期最长,为55天;攸杂032 开花最晚,花期最短,仅为41 天.(2)攸杂032 的雄蕊数和胚珠数最多,分别为62 和19;攸杂034 的花丝和花柱最长,分别为8.67 和3.71.(3)4 株油茶的单花药花粉数量平均值分别为9 250、7 050、5 950、8300 粒;P/O 值分别为27171.9、23005.3、20400.0、29568.8,均属于专性异交型.(4)花粉在不同温度贮藏下,生活力差异较大,并随贮藏时间的延长,生活力总体呈现下降趋势,其中室温贮藏的花粉生活力下降趋势尤为明显,11 天后大部分花粉已丧失生活力;-20℃贮藏效果最好.

关键词：油茶花器特征花粉特性花粉生活力

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韦塔桉叶片脂肪酸的提取及成分的GC-MS分析

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桉树科技 2012年第3期29卷 29-33页

作者：杨巧丽谢耀坚谭晓风张婧吴志华国家林业局桉树研发中心广东湛江524000 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410000

以丙酮为提取溶剂,物料粒度为100-200目,料液比1：15,浸泡8 h,萃取时间为1.5 h,在超声功率为80 khz,30℃时对韦塔桉桉叶油进行提取,并用GC-MS对其成分进行分析。结果得到韦塔桉桉叶油的提取率为19.04%,经GC-MS分析得到韦塔桉桉叶油含有1... 详细信息

以丙酮为提取溶剂,物料粒度为100-200目,料液比1：15,浸泡8 h,萃取时间为1.5 h,在超声功率为80 khz,30℃时对韦塔桉桉叶油进行提取,并用GC-MS对其成分进行分析。结果得到韦塔桉桉叶油的提取率为19.04%,经GC-MS分析得到韦塔桉桉叶油含有10种脂肪酸,其中亚油酸和亚麻酸为不饱和脂肪酸。桉叶油中棕榈酸、亚油酸、亚麻酸及硬脂酸的绝对含量分别为0.82%、0.86%、0.15%、0.33%,占提取粗脂总量的2.16%。

关键词：韦塔桉脂肪酸提取 GC-MS

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