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世界华人消化杂志 2003年第7期11卷 1006-1008页

作者：杨艳杰成军陈东风刘妍杨倩王建军中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 中国人民解放军第三军医大学大坪医院消化内科重庆市400038

0引言乙型肝炎是一种严重威胁人类健康的疾病,呈全球性分布,目前全世界有3.5亿人感染乙型肝炎病毒(HBV),其中相当一部分感染者发展为慢性肝炎,少数还发展为肝硬化甚至肝癌,至今仍缺乏有效控制[1-5].造成这一局面的原因很多,其中关于HBV... 详细信息

0引言乙型肝炎是一种严重威胁人类健康的疾病,呈全球性分布,目前全世界有3.5亿人感染乙型肝炎病毒(HBV),其中相当一部分感染者发展为慢性肝炎,少数还发展为肝硬化甚至肝癌,至今仍缺乏有效控制[1-5].造成这一局面的原因很多,其中关于HBV与肝细胞之间相互作用的分子生物学机制的研究进展相对滞后是严重影响新型治疗技术和新型药物开发与研究的重要原因之一.进一步弄清HBV DNA的复制、转录及调节的过程,对于我们研究乙型肝炎的发病机制具有重要意义.本文仅就乙型肝炎病毒核心启动子(CP)结构及调节近几年的研究进展作一综述.

关键词：乙型肝炎病毒核心启动子结构调节基因突变生物学病毒复制

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表达谱基因芯片技术研究甘草甜素上调白介素-18基因的表达

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世界华人消化杂志 2004年第4期12卷 855-858页

作者：王建军李宝伟成军刘妍徐志强杨倩纪冬党晓燕王春花中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 中国人民解放军总医院麻醉科北京市100853

目的:了解甘草甜素调节白介素-18(IL-18)基因启动子的活性,为甘草甜素的作用机制提供理论依据. 方法:应用基因表达谱芯片技术对于甘草甜素刺激HepG2 细胞之后的基因表达谱进行研究.聚合酶链反应(PCR)扩增IL-18基因启动子,命名为IL-18P.... 详细信息

目的:了解甘草甜素调节白介素-18(IL-18)基因启动子的活性,为甘草甜素的作用机制提供理论依据. 方法:应用基因表达谱芯片技术对于甘草甜素刺激HepG2 细胞之后的基因表达谱进行研究.聚合酶链反应(PCR)扩增IL-18基因启动子,命名为IL-18P.以T-A克隆法,将IL- 18P基因片段连入载体pGEM-T.将获得的质粒pT-IL- 18P,与报告质粒pCAT3-basic分别用KpnⅠ和BglⅡ双酶切后构建IL-18启动子报告基因表达载体pCAT3-IL-18P, 以重组表达质粒pCAT3-IL-18P瞬时转染HepG2细胞,以转染pCAT3 basic的HepG2细胞为阴性对照,甘草甜素刺激后24 h后收获细胞.用酶联免疫黏附法(ELISA)检测细胞中氯霉素乙酰转移酶(CAT)的表达活性. 结果:表达谱基因芯片研究结果表明,甘草甜素可上调IL- 18基因表达水平达2.815倍.构建的报告载体pCAT3-IL- 18P经过序列分析和酶切鉴定正确.pCAT3-IL-18P和甘草甜素瞬时转染的HepG2细胞的CAT表达活性是CAT3空载体的7.7倍,pCAT3-IL-18P的1.5倍. 结论:甘草甜素可以上调IL-18启动子的活性,进而上调IL-18基因的表达.为深入了解甘草甜素的免疫调节作用及其在病毒的清除过程中的作用机制提供新的理论依据.

关键词：表达谱基因芯片技术甘草甜素白介素-18 基因表达酶联免疫黏附法 ELISA

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乙型肝炎病毒表面抗原基因启动子Ⅰ结构及调节研究

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世界华人消化杂志 2003年第7期11卷 1002-1004页

作者：李强成军程明亮钟彦伟中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心、全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 贵阳医学院附属医院传染科贵州省贵阳市550004

0引言乙型肝炎病毒(HBV)持续感染导致全球性健康问题.世界人口约6%是病毒携带者,HBV也是导致肝硬化和肝癌的危险因素.HBV要持续感染人体,必须要有持续的病毒复制,HBV基因表达精确调节对病毒复制起关键作用.HBV基因组分为结构基因序列和... 详细信息

0引言乙型肝炎病毒(HBV)持续感染导致全球性健康问题.世界人口约6%是病毒携带者,HBV也是导致肝硬化和肝癌的危险因素.HBV要持续感染人体,必须要有持续的病毒复制,HBV基因表达精确调节对病毒复制起关键作用.HBV基因组分为结构基因序列和调节基因序列两大部分.调节基因序列和结构基因序列相互重叠,即使结构基因序列本身也有部分重叠,因此,HBV具有结构紧密的特点.HBV序列是在C、S1、S2、和X启动子控制下转录的.除了表面抗原基因启动子Ⅰ (SP Ⅰ),所有其他启动子缺乏TATA盒.两个增强子和负调控元件进一步控制HBV RNA合成,所有转录调控元件插入蛋白编码的基因区.SP Ⅰ作为指导2.4kb mRNA转录的启动子序列,在HBV复制中具有十分重要的作用.

关键词：乙型肝炎病毒表面抗原基因启动子结构调节研究 surface protein 基因序列负调控元件持续感染病毒复制转录性健康问题启动子序列重叠危险因素世界人口控制精确调节基因表达关键作用

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应用表达谱芯片技术筛选NS5ATP9反式调节基因的研究

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世界华人消化杂志 2004年第2期12卷 323-326页

作者：李强梁耀东成军王琳王建军张健刘妍程明亮中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 贵阳医学院传染科贵州省贵阳市550004

目的:应用基因表达谱芯片技术研究丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活蛋白9(NS5ATP9)的反式调节基因.方法:构建NS5ATP9基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5ATP9,应用基因表达谱芯片技术对pcDNA3.1(-)-NSSATP9转染的HepG2(人肝母细胞瘤细胞... 详细信息

目的:应用基因表达谱芯片技术研究丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活蛋白9(NS5ATP9)的反式调节基因.方法:构建NS5ATP9基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5ATP9,应用基因表达谱芯片技术对pcDNA3.1(-)-NSSATP9转染的HepG2(人肝母细胞瘤细胞系)细胞和转染空载体pcDNA3.1(-)的相同细胞的差异表达mRNA进行检测和分析.结果:HepG2细胞经转染NS5ATP9后,有16条差异基因表达水平发生显著改变,其中3条基因表达增强,13条基因表达降低.这些差异表达的基因与细胞的增生、分化、凋亡及细胞的信号转导密切相关.结论:应用基因表达谱芯片成功筛选了丙型肝炎病毒NS5ATP9作用HepG2细胞后差异表达基因,为阐明NS5ATP9的作用提供了新的依据.

关键词：表达谱芯片技术 NS5ATP9反式调节基因肝炎病毒 HCV 基因功能丙型肝炎

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丙型肝炎病毒结构基因转基因小鼠引起肝脏脂肪变

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世界华人消化杂志 2002年第9期10卷 1022-1026页

作者：成军任进余李莉陆志檬李克洪源陆荫英王刚刘妍张玲霞陈菊梅中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 上海第二医科大学瑞金医院临床免疫室上海20004

目的:建立持续表达和诱导表达型丙型肝炎病毒(HCV)结构基因(包括核心蛋白和包膜蛋白E1、E2编码基因)的转基因小鼠动物模型,探讨HCV结构基因表达导致肝脏脂肪变的病理改变.方法:以含有近全长HCVcDNA的质粒为模板,通过多聚酶链反应(PCR)... 详细信息

目的:建立持续表达和诱导表达型丙型肝炎病毒(HCV)结构基因(包括核心蛋白和包膜蛋白E1、E2编码基因)的转基因小鼠动物模型,探讨HCV结构基因表达导致肝脏脂肪变的病理改变.方法:以含有近全长HCVcDNA的质粒为模板,通过多聚酶链反应(PCR)技术扩增HCV结构基因的DNA片段(约2.2kb),克隆到真核表达载体pcDNA4HisMas和pMT/BiP/V5-HisA中,分别构建成持续表达型表达载体pcDNA4HisMas-HCVCore-E2和诱导表达型表达载体pMT/BiP/V5-HisA-HCVCore-E2.以限制性内切酶分析和目的DNA片段的核苷酸序列分析,证实构建HCV结构基因的真核表达载体正确无误.以脂质体体外转染COS-7细胞系,利用抗-HCVE2的多克隆抗体进行Westernblot杂交分析,证实转染细胞中有HCVE2蛋白的表达.利用小鼠受精卵细胞核微注射方法,导入线性化表达载体的DNA,利用假孕小鼠的受精卵植入方法,建立了表达HCV结构基因的转基因小鼠模型.对于持续表达型转基因小鼠的死胎、6月龄以及硫酸铜诱导表达型的转基因小鼠模型的肝脏组织,进行HE染色和病理学特征的分析.结果:构建了持续性表达和可诱导性表达型的HCV结构基因表达载体pcDNA4HisMas-HCVCore-E2和pMT/BiP/V5-HisA-HCVCore-E2,体外转染COS-7细胞证实转染细胞中有HCVE2抗原的表达.对于持续表达型转基因小鼠死胎肝脏病理学特征进行分析,发现肝组织尚未分化发育完成,肝内有大量造血细胞,肝细胞空泡变性,单个核细胞聚集现象.对于持续表达HCV结构基因的6月龄转基因小鼠的肝脏进行病理学分析,发现中央静脉区肝细胞小泡型脂肪变性,中央静脉周围细胞溶解坏死,中央静脉明显扩大,少数组织中亦见大泡型脂肪变性.对于可诱导型转基因小鼠的肝脏进行病理学分析,发现肝小叶内中央静脉周围坏死区累及5-10个小叶,周围无淋巴细胞浸润,交界区可见多数肝细胞核异常,或固化,或呈花环状,或溶解为淡蓝色无定形基质.泡浆内残留大量脂肪小泡,肝脏脂肪变与核异常有一移行过程.结论:建立了表达HCV结构基因的转基因小鼠,发现HCV结构基因的转基因小鼠肝脏有典型的脂肪变病理改变,为进一步研究HCV感染引起的慢性丙型肝炎合并脂肪变的特征和机制研究奠定了基础.

关键词：动物模型丙型肝炎病毒结构基因转基因肝脏脂肪变

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应用抑制性消减杂交技术筛选HBV DNA聚合酶中RNase H的反式调节基因

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世界华人消化杂志 2004年第7期12卷 1564-1568页

作者：王春花郎振为成军吴煜杨艳杰张黎颖党晓燕首都医科大学北京佑安医院病理科北京市100054 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039

目的:应用抑制性消减杂交(SSH)技术构建HBV DNA聚合酶(DNA P)末端蛋白反式激活基因. 方法:以RNase H表达质粒pcDNA3.1(-)-RNase H转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI 酶切... 详细信息

目的:应用抑制性消减杂交(SSH)技术构建HBV DNA聚合酶(DNA P)末端蛋白反式激活基因. 方法:以RNase H表达质粒pcDNA3.1(-)-RNase H转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI 酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库, 并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析. 结果:文库扩增后得到38个白色克隆,经菌落PCR分析, 得到36个200-1 000 bp插入片段.对所得片段测序,并进行同源性分析,显示33种已知基因编码蛋白和3种未知功能基因序列,可能是RNase H反式激活靶基因, 结论:成功构建HBV RNase H反式激活基因差异表达的cDNA消减文库.

关键词：抑制性消减杂交技术筛选 HBVDNA聚合酶 RNaseH 反式调节基因大肠杆菌

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酵母双杂交技术筛选白细胞中HCV核心蛋白结合蛋白基因

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世界华人消化杂志 2004年第1期12卷 86-88页

作者：邵清成军白雪帆王琳张健梁耀东刘敏李强中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 中国人民解放军第四军医大学唐都医院传染科陕西省西安市710039

目的:用酵母双杂交技术筛选白细胞中与丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白结合蛋白的基因. 方法:用多聚酶链反应(PCR)法扩增HCV核心蛋白基因, 连接入酵母表达载体pGBKT-7中构建诱饵质粒,转化酵母细胞AH109并在其内表达,然后与转化了人白细胞文... 详细信息

目的:用酵母双杂交技术筛选白细胞中与丙型肝炎病毒(HCV)核心蛋白结合蛋白的基因. 方法:用多聚酶链反应(PCR)法扩增HCV核心蛋白基因, 连接入酵母表达载体pGBKT-7中构建诱饵质粒,转化酵母细胞AH109并在其内表达,然后与转化了人白细胞文库质粒的酵母细胞Y187进行配合,在营养缺陷型培养基上进行双重筛选阳性菌落,增菌后提取质粒,转化入大肠杆菌,提取质粒并测序,进行生物信息学分析. 结果:成功克隆出核心蛋白基因并在酵母细胞中表达,配合后选出在四缺(SD/-Trp-Leu-Ade-His)培养基和铺有X- α-半乳糖(X-α-gal)的四缺培养基上均能生长并变成蓝色的真阳性菌落共6个,其中2个高尔基复合体关联蛋白1,1 个Ran结合蛋白M,1个pellino同族体2,2个未知功能蛋白基因(KIAA1949). 结论:成功克隆出丙型肝炎病毒核心蛋白的结合蛋白,为进一步研究HCV的作用提供了新线索.

关键词：酵母双杂交技术筛选白细胞 HCV核心蛋白结合蛋白基因丙型肝炎病毒

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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因1的克隆

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世界华人消化杂志 2004年第1期12卷 78-81页

作者：刘敏成军王琳张树林邵清张健梁耀东中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 西安交通大学第一医院传染科陕西省西安市710061

目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)及生物信息学技术(bioinformatics)筛选并克隆丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS5A反式激活新型靶基因,进一步阐明HCV感染相关疾病的发病机制. 方法:以HCV NS5A蛋白表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A 转染HepG2细... 详细信息

目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)及生物信息学技术(bioinformatics)筛选并克隆丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS5A反式激活新型靶基因,进一步阐明HCV感染相关疾病的发病机制. 方法:以HCV NS5A蛋白表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A 转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为平行对照,提取mRNA并进行抑制性消减杂交分析.应用分子生物学技术,结合生物信息学技术,分析并克隆HCV NS5A反式激活作用的新的靶基因. 结果:对于所获基因片段序列分析表明,其中之一为新型基因片段,从转染pcDNA3.1(-)-NS5A的HepG2细胞提取总RNA,以逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)技术扩增获得该新基因的全长序列,并测序证实,命名为NS5ATP1. NS5ATP1基因的编码序列全长为1011个核苷酸(nt),编码产物由336个氨基酸残基(aa)组成. 结论:HCV NS5ATP1是一种典型的病毒基因组编码的具有反式激活作用的蛋白,而SSH是一种鉴定、分离组织细胞中选择性表达基因的技术.通过这种技术,发现了HCV NS5ATP1反式激活作用的新的靶基因,这一发现,为进一步研究HCV NS5ATP1蛋白反式激活作用的分子生物学机制和探索新型治疗技术奠定了基础.

关键词：丙型肝炎病毒非结构蛋白 NS5A反式激活基因1 克隆

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基因表达谱芯片技术筛选NS5A-TP4蛋白反式调节基因

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世界华人消化杂志 2004年第2期12卷 311-314页

作者：杨倩成军刘妍王建军洪源张树林中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039 西安交通大学第一医院传染科陕西省西安市710061

目的:对新基因NS5A-TP4转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析,探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制及其生物学功能.方法:应用生物信息学(bioinformatics)技术,分析我室通过抑制性消减杂交技术筛选得到的新基因NS5A-TP4的全长编码序列... 详细信息

目的:对新基因NS5A-TP4转染肝癌细胞的基因表达谱进行分析,探索该基因表达对肝细胞基因表达的调节机制及其生物学功能.方法:应用生物信息学(bioinformatics)技术,分析我室通过抑制性消减杂交技术筛选得到的新基因NS5A-TP4的全长编码序列,并NS5A-TP4构建基因的真核表达载体pcDNA3.1(-)-NS5A-YP4.应用基因表达谱芯片技术对重组表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5A-TP4转染的HepG2细胞和空载体处理的相同细胞差异表达的mRNA进行检测.结果:确定基因NS5A-TP4由762nt组成,编码253aa的蛋白.基因表达谱芯片所检测的1152条目的基因均为GenBank中登录的基因,NS5A-TP4表达质粒转染的细胞有18条差异表达基因,其中12条基因表达增强,6条基因表达降低.这些差异表达的基因与细胞信号转导、凋亡、生长调节密切相关.结论:基因表达谱芯片技术可为初步探索新基因的功能提供重要的资料.本实验结果为进一步阐明NS5A-TP4生物学功能及HCV-NS5A的致病机制提供了理论依据.

关键词：基因表达谱芯片 NS5A-TP4蛋白反式调节基因生物信息学

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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS5A反式激活基因2基因组DNA结构分析及其不同剪切体的克隆化研究

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世界华人消化杂志 2004年第4期12卷 801-804页

作者：杨倩成军刘妍洪源王建军张树林西安交通大学第一医院传染科陕西省西安市710061 中国人民解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心全军病毒性肝炎防治研究重点实验室北京市100039

目的:HCV NS5A病毒蛋白反式激活作用的新的靶基因NS5ATP2及其不同剪接体基因序列的确立、克隆化研究. 方法:依据我室构建的NS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,利用生物信息学技术获得,提取HepG2 细胞的总RNA,进行反转录(RT-PCR),... 详细信息

目的:HCV NS5A病毒蛋白反式激活作用的新的靶基因NS5ATP2及其不同剪接体基因序列的确立、克隆化研究. 方法:依据我室构建的NS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库,利用生物信息学技术获得,提取HepG2 细胞的总RNA,进行反转录(RT-PCR),扩增产物与原核表达载体连接,进行测序鉴定. 结果:经测序鉴定成功获得新基因的编码序列,并意外发现了NS5ATP2的不同剪接体,对NS5ATP2基因组进行分析,获得剪接体的编码序列,并成功进行了克降化研究. 结论:利用分子生物信息学技术,发现并鉴定了HCV NS5A反式激活作用的新的靶基因NS5ATP2(615)及其可变剪接体NS5ATP2(216),为研究新基因的生物学功能及丙肝发病机制提供新的依据.

关键词：丙型肝炎病毒非结构蛋白 NS5A 靶基因基因差异 DNA结构剪切体克隆化编码序列

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