检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2008年第9期30卷 1228-1236页

作者：刘刚彭惠茹倪中福秦丹丹宋方威宋广树孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

高通量的基因型分析和芯片技术的发展使人们能够进一步研究哪些遗传差异最终影响基因的表达。通过表达数量性状座位(eQTL)作图方法可对基因表达水平的遗传基础进行解析。与传统的QTL分析方法一样,eQTL的主要目标是鉴别表达性状座位所在... 详细信息

高通量的基因型分析和芯片技术的发展使人们能够进一步研究哪些遗传差异最终影响基因的表达。通过表达数量性状座位(eQTL)作图方法可对基因表达水平的遗传基础进行解析。与传统的QTL分析方法一样,eQTL的主要目标是鉴别表达性状座位所在的染色体区域。但由于表达谱数据成千上万,而传统的QTL分析方法最多分析几十个性状,因此需要考虑这类实验设计的特点以及统计分析方法。本文详细介绍了eQTL定位过程及其研究方法,重点从个体选择、基因芯片实验设计、基因表达数据的获得与标准化、作图方法及结果分析等方面进行了综述,指出了当前eQTL研究存在的问题和局限性。最后介绍了eQTL研究在估计基因表达遗传率、挖掘候选基因、构建基因调控网络、理解基因间及基因与环境的互作的应用进展。

关键词： eQTL 个体选择基因芯片实验设计作图方法

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小麦杂交种与亲本之间穗下节间基因差异表达分析

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作物学报 2008年第5期34卷 770-776页

作者：张一倪中福姚颖垠孙其信中国农业大学作物杂种优势研究与利用教育部重点实验室/农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室/北京市作物遗传改良重点实验室北京100094

以株高和穗下节间长度表现杂种优势的小麦杂交组合矮9×冀矮8号的杂种及其亲本为材料,应用cDNA-AFLP技术分析杂种、亲本的穗下节间基因差异表达情况.分离差异表达基因段后,对其克隆、测序并在GenBank进行Blast-x分析和功能推测,发... 详细信息

以株高和穗下节间长度表现杂种优势的小麦杂交组合矮9×冀矮8号的杂种及其亲本为材料,应用cDNA-AFLP技术分析杂种、亲本的穗下节间基因差异表达情况.分离差异表达基因段后,对其克隆、测序并在GenBank进行Blast-x分析和功能推测,发现差异表达的基因包括分别受赤霉素和细胞分裂素诱导表达、与细胞分裂有关的基因cdc2和PAS1基因,它们在小麦杂种节间中分别特异表达和偏高亲表达.另有一个与细胞快速膨大有关的液泡质子泵H+-PPase基因在杂种中偏高亲表达.其他差异表达的基因包括蛋白激酶等与植物信号传递相关基因、与物质代谢相关的基因、参与基因转录调控的基因、与泛素参与的蛋白降解相关的基因等.小麦杂交种与亲本的穗下节间,大量基因涉及细胞分裂、膨大和物质代谢、转录调控等过程,初步推测它们的差异表达可能与穗下节间及株高杂种优势形成有关.

关键词：小麦节间 cDNA-AFLP 基因差异表达

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一个玉米(*** L.)杂交种增强表达的GA20氧化酶新基因(ZMGA20)的克隆和鉴定

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自然科学进展 2008年第8期18卷 874-882页

作者：杜金昆姚颖垠倪中福孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100094

杂种优势的形成与杂种一代中亲本基因的表达方式改变有关.为了深入探讨赤霉素合成关键酶基因以及赤霉素与杂种优势形成的关系,利用电子克隆结合RT-PCR的方法获得了玉米赤霉素生物合成关键酶GA20-氧化酶基因的全长cDNA序列(ZMGA20),根据... 详细信息

杂种优势的形成与杂种一代中亲本基因的表达方式改变有关.为了深入探讨赤霉素合成关键酶基因以及赤霉素与杂种优势形成的关系,利用电子克隆结合RT-PCR的方法获得了玉米赤霉素生物合成关键酶GA20-氧化酶基因的全长cDNA序列(ZMGA20),根据同源性比较和序列分析显示,该基因与小麦(CAA74330)、黑麦草(AAG43043)的氨基酸序列一致性最高,达到72%.它具有2-酮戊二酸双加氧酶典型的保守功能域,包括Fe2+结合域(His-229,Asp-231,His-287)和2-酮戊二酸结合域(NYYPPCEKP);前者是Fe2+的结合位点,后者结合共同的前体2-酮戊二酸.采用半定量RT-PCR检测ZMGA20在玉米杂种与亲本之间的差异表达,结果显示,在玉米的根、茎、未展开叶、20d的胚以及雌穗中,ZMGA20基因在杂交种和亲本间都表现为杂种增强的表达模式.在此基础上,对ZMGA20基因差异表达与杂种优势的关系进行了讨论.

关键词：玉米赤霉素 ZMGA20基因基因表达杂种优势

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中国粳稻核心种质耐低磷性的鉴定与筛选

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中国农业大学学报 2008年第6期13卷 1-5页

作者：穆平黄超李自超中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室／北京市作物遗传改良实验室北京100193 青岛农业大学生命科学学院山东青岛266109

鉴定粳稻耐低磷种质资源对我国粳稻耐低磷育种和耐低磷遗传研究具有重要意义。在田间低磷和正常施磷条件下,以单株相对籽粒产量为指标,对来自中国东北、华北、西北、华中、西南稻区的356份粳稻核心种质进行了耐低磷性鉴定。结果表明:东... 详细信息

鉴定粳稻耐低磷种质资源对我国粳稻耐低磷育种和耐低磷遗传研究具有重要意义。在田间低磷和正常施磷条件下,以单株相对籽粒产量为指标,对来自中国东北、华北、西北、华中、西南稻区的356份粳稻核心种质进行了耐低磷性鉴定。结果表明:东北稻区的平均相对籽粒产量最高,达0.81;华北稻区的相对籽粒产量最低。筛选出76个耐低磷材料、44个低磷敏感材料和236个中间类型材料;东北稻区耐低磷材料所占比例最高,西北稻区最低。

关键词：水稻核心种质耐低磷筛选

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15个普通小麦WRKY基因的克隆与表达分析

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自然科学进展 2008年第4期18卷 378-388页

作者：吴华玲倪中福姚颖垠郭刚刚孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100094

WRKY转录因子广泛参与了植物对生物与非生物胁迫应答反应、激素响应以及生长发育等一系列生理活动.但是,对小麦WRKY家族基因目前还缺少系统的克隆、表达和功能研究.文中采用EST的电子拼接方法,克隆了15个具有完整开放阅读框的小麦WRKY基... 详细信息

WRKY转录因子广泛参与了植物对生物与非生物胁迫应答反应、激素响应以及生长发育等一系列生理活动.但是,对小麦WRKY家族基因目前还缺少系统的克隆、表达和功能研究.文中采用EST的电子拼接方法,克隆了15个具有完整开放阅读框的小麦WRKY基因,分属于WRKY家族的3个大类.表达分析发现,除TaWRKY10基因在分蘖节中表达最强外,其他基因的表达水平都是在叶中最高;4个基因随着叶片的成熟和衰老表达量显著增强;8个基因对低温、高温、NaCl或PEG等逆境因子具有响应;另外,WRKY基因在小麦杂交种与亲本之间存在明显的表达差异,并且有些基因对PEG逆境因子的响应在杂种比在亲本中快.表明,小麦WRKY基因参与了叶片衰老和逆境胁迫的响应过程,所检测到WRKY基因在杂种和亲本中的表达差异可能会通过增强杂交种的抗逆性而促进小麦杂种优势的产生.

关键词：小麦 WRKY转录因子基因克隆基因表达杂种优势

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人工合成六倍体小麦(AABBDD)与亲本种之间基因组与基因区域的序列变异分析

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自然科学进展 2008年第1期18卷 45-50页

作者：聂利红韩宗福逯腊虎姚颖垠孙其信倪中福中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100094

为探讨六倍体小麦进化过程中基因组发生的变异,我们以两套不同世代(早代和高代)的人工合成六倍体及其母本(四倍体小麦,AABB)和父本(粗山羊草,DD)为材料,采用DNA—AFLP和SSCP方法分别对基因组与基因区域的序列变化进行了研究.结果发现,... 详细信息

为探讨六倍体小麦进化过程中基因组发生的变异,我们以两套不同世代(早代和高代)的人工合成六倍体及其母本(四倍体小麦,AABB)和父本(粗山羊草,DD)为材料,采用DNA—AFLP和SSCP方法分别对基因组与基因区域的序列变化进行了研究.结果发现,人工合成六倍体小麦基因组中来源于父本的条带发生丢失的数目更多,表明倍性较低的亲本(DD)基因组序列在多倍化过程中发生了更明显的变异,这与前人的研究结果一致.与DNA-AFLP结果相比较,采用SSCP方法检测到的变异比例明显较低,说明六倍体小麦进化过程中基因区域发生变异的频率较低,而DNA-AFLP检测到的丢失条带可能主要为非编码序列,特别是重复序列.分析还发现,有4个基因在杂交F1代就发生了变异,这说明这些基因变异是由于杂交引起的.生物信息学分析结果显示,在上述4个基因中,有3个位于2D染色体长臂上,并且位于相近的同一区域.本研究结果显示,在人工合成六倍体小麦进化过程中,基因区域的序列变异具有选择性,而不是随机的.

关键词：人工合成六倍体小麦多倍化基因组序列变异

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利用变性高效液相色谱(dHPLC)进行小麦等位基因差异表达分析

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自然科学进展 2008年第11期18卷 1256-1263页

作者：韩宗福倪中福王晓娜逯腊虎姚颖垠孙其信中国农业大学植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室教育部杂种优势研究与利用重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

等位基因变异是生物体基因组中普遍存在的现象,也是物种进化和育种的重要基础.等位基因可以通过编码区的改变或者表达来影响基因的功能,因此研究等位基因的表达具有重要的生物学意义.由于小麦基因组的复杂性,造成等位基因的鉴定比较困难... 详细信息

等位基因变异是生物体基因组中普遍存在的现象,也是物种进化和育种的重要基础.等位基因可以通过编码区的改变或者表达来影响基因的功能,因此研究等位基因的表达具有重要的生物学意义.由于小麦基因组的复杂性,造成等位基因的鉴定比较困难,这极大地制约了小麦等位基因表达研究的开展.利用CAU36和CAU328两个EST-SSR标记,结合变性高效液相色谱(dHPLC)分析技术,在35个小麦基因型中分别检测到4种和3种等位变异类型,并且以抽穗期的穗下节节间为材料,对其在4×6的小麦双列杂交组合杂交F1代中进行了表达分析.结果表明,这两个EST-SSR引物扩增的等位基因在多个组合中均存在显著的差异表达,且CAU36标记检测到的等位基因表达变化值与部分杂交种的株高之间存在显著的相关性.

关键词： EST—SSR 等位基因表达变异变性高效液相色谱小麦

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根癌农杆菌介导的抗除草剂转基因甘薯植株的获得

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农业生物技术学报 2008年第1期16卷 103-107页

作者：臧宁张美彦翟红李雪琴王玉萍刘庆昌中国农业大学植物遗传育种系农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京100094

以甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)品种栗子香的胚性悬浮细胞为受体材料,用根癌农杆菌介导法,获得了表达bar基因的抗除草剂转基因甘薯植株.根癌农杆菌(Agrobacteriurn tumefaciens)菌株LBA4404携带有bar基因的双元载体pCAM-BIA3300,共计... 详细信息

以甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)品种栗子香的胚性悬浮细胞为受体材料,用根癌农杆菌介导法,获得了表达bar基因的抗除草剂转基因甘薯植株.根癌农杆菌(Agrobacteriurn tumefaciens)菌株LBA4404携带有bar基因的双元载体pCAM-BIA3300,共计450个胚性细胞团用于遗传转化.在添加2mg/L 2,4-D、100mg/L Carb和0.5mg/L PPT(phosphinothricin)的固体MS培养基上选择培养8周后,得到了19个PPT抗性愈伤组织.将这19个抗性愈伤组织转移到添加1 mg/L ABA、100 mg/LCarb和0.5 mg/L PPT的固体MS培养基上,其中的10个抗性愈伤组织共再生出103株拟转基因植株.PCR分析表明,其中的69株为转基因植株.Southern blot分析表明,bar基因稳定地整合到转基因植株的基因组中.除草剂喷洒试验结果表明,转基因植株具有高度除草剂抗性.

关键词：甘薯农杆菌介导转化胚性悬浮细胞除草剂转基因植株

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水稻条纹叶枯病毒RNA干扰载体的构建

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华北农学报 2008年第4期23卷 10-13页

作者：张恭刘立峰周维王海光马峙英河北农业大学农学院河北保定071001 中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室北京100094

利用已公布的水稻条纹叶枯病毒的序列和siRNA Target Finder软件,获得了168条siRNA片段,利用这些片段在水稻基因组中BLAST(Basic local alignment search tool),最终获得6条与水稻基因组完全不匹配的干扰序列。选择其中的2条,通过化学... 详细信息

利用已公布的水稻条纹叶枯病毒的序列和siRNA Target Finder软件,获得了168条siRNA片段,利用这些片段在水稻基因组中BLAST(Basic local alignment search tool),最终获得6条与水稻基因组完全不匹配的干扰序列。选择其中的2条,通过化学合成干扰序列,利用pCAMBIA1301质粒构建了RNA干扰载体pASV1301-1,pASV1301-2,并成功地转化EHA105农杆菌,为进一步转化水稻、探索利用RNA干扰技术防治水稻条纹叶枯病奠定了基础。

关键词：水稻 RNA干扰载体构建抗病毒

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中国甘薯主要亲本遗传多样性的ISSR分析

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作物学报 2008年第6期34卷 972-977页

作者：李强刘庆昌翟红马代夫王欣李雪琴王玉萍中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京100094 中国农业科学院甘薯研究所国家甘薯改良中心江苏徐州221121

用ISSR标记分析了中国62份甘薯主要亲本的遗传多样性,明确了其遗传差异。结果表明,17个ISSR引物共检测出490条多态性谱带,平均每条引物检测出28.8条多态性谱带,说明ISSR标记是评价甘薯遗传多样性的有效途径之一。62份中国甘薯主要亲本... 详细信息

用ISSR标记分析了中国62份甘薯主要亲本的遗传多样性,明确了其遗传差异。结果表明,17个ISSR引物共检测出490条多态性谱带,平均每条引物检测出28.8条多态性谱带,说明ISSR标记是评价甘薯遗传多样性的有效途径之一。62份中国甘薯主要亲本遗传距离为0.158-0.924,平均为0.574,通过UPGMA法,可以聚为2大类,一类为国内自育亲本,一类为外引亲本,说明中国甘薯主要亲本遗传多样性较丰富,其中自育亲本与外引亲本之间遗传距离较远;亚洲亲本遗传多样性高于非洲和美洲亲本,并且与其他亲本间遗传距离较远;亚洲品种中,中国大陆亲本遗传距离最小,为0.419,与来自中国台湾的亲本差异较小,但与外引亚洲亲本遗传距离较远。因此,中国在未来甘薯育种中,可以国内自育亲本与外引亲本以及外引亚洲亲本与外引其他亲本配制组合,拓宽中国甘薯品种的遗传背景。

关键词：甘薯育种亲本遗传多样性 ISSR标记

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