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水稻(Oryza sativa L.)α-淀粉酶基因的进化及组织表达模式

作物学报 2010年第1期36卷 17-27页

作者：廖登群张洪亮李自超 John BENNETT 中国农业大学/农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室/北京市作物遗传改良重点实验室北京100193 Plant Breeding Genetics and Biotechnology DivisionInternational Rice Research Institute School of Biological Sciences University of Sydney

α-淀粉酶在植物特别是谷类萌发种子淀粉降解中具有重要作用。水稻α-淀粉酶基因的结构、进化和表达研究已有报道,但多集中于OsAmy1和OsAmy3这两个亚族内基因间以及发芽种子中。不同亚族间的基因结构、进化及更多组织和时期的表达特点... 详细信息

α-淀粉酶在植物特别是谷类萌发种子淀粉降解中具有重要作用。水稻α-淀粉酶基因的结构、进化和表达研究已有报道,但多集中于OsAmy1和OsAmy3这两个亚族内基因间以及发芽种子中。不同亚族间的基因结构、进化及更多组织和时期的表达特点尚缺乏细致研究。本研究通过TblastN同源性比对及保守结构域分析揭示水稻基因组含有11个α-淀粉酶基因。生物信息学分析、系统进化树构建及半定量RT-PCR分析表明,该家族基因在结构上发生了明显的分化,具有清晰的进化层次,OsAmy5A和OsAmy4A是家族中较原始状态的基因;在表达和功能上也发生了明显分化,进化水平较高的基因发生了明显的时空表达特异性分化。OsAmy1A、OsAmy3A及OsAmy3D和OsAmy3E分别在保证种子植物世代传递、维持种子休眠过程中胚的微弱生命活动及保证种子萌发过程中能量的稳定持续供应上具有重要作用。

关键词：水稻 α-淀粉酶基因结构进化表达

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开颖、闭颖小麦浆片的显微观察

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中国农学通报 2010年第23期26卷 163-167页

作者：黄修文田宝坤李保云周海鹰农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室/北京市作物遗传改良重点实验室/作物杂种优势研究与利用教育部重点实验室/中国农业大学北京100193

为了研究小麦开颖、闭颖授粉的原因,为探索小麦开颖、闭颖授粉机理奠定基础。此研究以开颖授粉小麦漯麦4号和闭颖授粉小麦花培3号为材料,在小麦抽穗期取浆片,用冷冻切片法观察两个品种浆片的厚度,并测量浆片的厚度,发现漯麦4号浆片的厚... 详细信息

为了研究小麦开颖、闭颖授粉的原因,为探索小麦开颖、闭颖授粉机理奠定基础。此研究以开颖授粉小麦漯麦4号和闭颖授粉小麦花培3号为材料,在小麦抽穗期取浆片,用冷冻切片法观察两个品种浆片的厚度,并测量浆片的厚度,发现漯麦4号浆片的厚度是花培3号的1.67倍。对浆片进行整体透明处理,用微分干涉差显微镜观察浆片整体外形和浆片的中部细胞,对比高度和宽度,发现两者浆片在高度和宽度上无明显差异;同时对比浆片表面中部细胞的大小,发现两者浆片的中部细胞大小也无明显差异。

关键词：小麦开颖授粉闭颖授粉浆片

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普通小麦品种(系)以及杂交组合后代株系籽粒无机磷含量的分布

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麦类作物学报 2010年第6期30卷 1038-1042页

作者：秦丽燕赵琰杨伟段晓亮贾晨亮梁荣奇刘广田中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

为了调查普通小麦品种(系)以及杂交组合后代株系籽粒无机磷含量的分布情况,为低植酸小麦种质资源筛选、亲本选配和后代选择提供参考,利用钼蓝显色法测定了338个普通小麦品种(系)、232个近缘种杂交后代株系,以及4个普通小麦杂交组合的第... 详细信息

为了调查普通小麦品种(系)以及杂交组合后代株系籽粒无机磷含量的分布情况,为低植酸小麦种质资源筛选、亲本选配和后代选择提供参考,利用钼蓝显色法测定了338个普通小麦品种(系)、232个近缘种杂交后代株系,以及4个普通小麦杂交组合的第四代(或第五代)株系的籽粒无机磷含量。结果表明,338个普通小麦品种(系)、232个近缘种杂交后代株系(共570份材料)的籽粒无机磷含量主要分布在0.46～0.93μg·mg^(-1)之间,低无机磷(低于0.15μg·mg^(-1))和高无机磷(高于0.93μg·mg^(-1))的材料都比较少,分别只占材料总数的3.16%和1.23%。4个杂交组合群体无机磷含量的平均值分别为0.65、0.59、0.45和0.58μg·mg^(-1),与其亲本材料一样,没有高无机磷或者低无机磷含量的株系。这表明从中等无机磷含量的亲本杂交后代中难以筛选到高无机磷(低植酸)的株系。

关键词：小麦籽粒无机磷含量植酸

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17个小麦F_2群体中单株籽粒GMP含量的分布

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麦类作物学报 2010年第4期30卷 745-748页

作者：毛善锋梁荣奇尤明山李保云刘广田中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

为给GMP性状在后代中的选择提供依据,以17个小麦杂交组合的F2群体为材料,分析了单株籽粒GMP含量在不同组合F2群体中的分布状况。结果表明,不同组合的F2代单株籽粒GMP含量的分布是连续的,呈正态或偏态分布,符合数量性状遗传特点。在不同... 详细信息

为给GMP性状在后代中的选择提供依据,以17个小麦杂交组合的F2群体为材料,分析了单株籽粒GMP含量在不同组合F2群体中的分布状况。结果表明,不同组合的F2代单株籽粒GMP含量的分布是连续的,呈正态或偏态分布,符合数量性状遗传特点。在不同亲本的组合后代中,F2代单株籽粒GMP表现出不同的分布倾向,70.6%的组合以超高亲和倾高亲分布为主,出现23.5%近中亲和5.9%倾低亲分布,无超低亲分离现象。因此,在具有不同GMP含量亲本的杂交组合后代分离群体中,能够筛选出高GMP含量的育种材料。

关键词：小麦 F2群体 GMP 分布

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利用SDS-PAGE和AS-PCR标记鉴定簇毛麦HMW-GS基因

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中国农学通报 2010年第15期26卷 38-43页

作者：刘守斌梁荣奇尤明山李保云刘广田中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

通过SDS-PAGE和AS-PCR标记对簇毛麦HMW-GS进行鉴定,对于快速鉴别导入到普通小麦中的簇毛麦HMW-GS和改良普通小麦品质具有重要意义。利用SDS-PAGE对中国春、钱尼、簇毛麦、6个中国春-簇毛麦二体附加系、普通小麦-簇毛麦3V异代换系进行HMW... 详细信息

通过SDS-PAGE和AS-PCR标记对簇毛麦HMW-GS进行鉴定,对于快速鉴别导入到普通小麦中的簇毛麦HMW-GS和改良普通小麦品质具有重要意义。利用SDS-PAGE对中国春、钱尼、簇毛麦、6个中国春-簇毛麦二体附加系、普通小麦-簇毛麦3V异代换系进行HMW-GS组成分析,进一步确定簇毛麦HMW-GS基因位于1V染色体。根据已发表的普通小麦HMW-GS基因序列同源性比较结果,设计了3对分别扩增普通小麦x-型亚基基因、y-型亚基基因以及所有HMW-GS基因的特异引物。经过对簇毛麦HMW-GS基因进行扩增发现,这3个AS-PCR标记都能很好地鉴别簇毛麦HMW-GS编码基因,并从分子水平上把簇毛麦HMW-GS基因定位于簇毛麦1V染色体上。

关键词：簇毛麦高分子量谷蛋白亚基 AS-PCR标记多态性

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关联分析定位水稻第4号染色体的芒性基因并结合连锁分析精细定位Awn4.1

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科学通报 2010年第Z2期55卷 2677-2681页

作者：胡广隆张冬玲潘慧乔李本吴建涛周雪崖张群远周雷姚国新李俊周李金杰张洪亮李自超中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室生物信息学教育部重点实验室信息国家实验室生物信息学研究部清华大学自动化系 Division of Statistical Genomics Washington University School of Medicine

芒性是水稻一个重要的驯化相关性状,但目前还没有其精细定位及关联分析的报道.利用303份栽培稻微核心种质材料和一个200株的BC5F2分离群体,考察其芒性表现和基因型,通过关联分析和连锁分析相结合的方法定位水稻第四号染色体的芒性基因.... 详细信息

芒性是水稻一个重要的驯化相关性状,但目前还没有其精细定位及关联分析的报道.利用303份栽培稻微核心种质材料和一个200株的BC5F2分离群体,考察其芒性表现和基因型,通过关联分析和连锁分析相结合的方法定位水稻第四号染色体的芒性基因.首先,运用logistic回归进行标记与性状的初步关联分析,在第4号染色体上发现了5个关联位点,包括了前人所发现的所有位点.然后,在其中一个位点Awn4.1的区间内加密标记,通过连锁分析与关联分析相结合的策略将芒基因Awn4.1精细定位在330kb的区间内,为克隆芒基因Awn4.1打下基础.结果表明,利用核心种质材料,结合连锁分析与关联分析方法能够更加高效和准确地定位水稻基因.

关键词：水稻芒关联分析连锁分析基因定位

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普通小麦品种(系)籽粒的铁含量分布

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中国农学通报 2010年第23期26卷 126-129页

作者：赵琰秦丽燕杨伟梁荣奇尤明山刘广田中国农业大学农学与生物技术学院植物遗传育种系农业生物技术国家重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室农业部作物基因组与遗传改良重点实验室北京100193

为了初步调查和评价中国普通小麦品种籽粒铁蛋白含量的分布状况,从中国品种中筛选铁含量高的基因型,为下一步高铁小麦品种的培育奠定基础。随机选取了83个不同的小麦栽培品种(系),利用原子吸收分光光度法测量小麦籽粒中的铁含量。结果表... 详细信息

为了初步调查和评价中国普通小麦品种籽粒铁蛋白含量的分布状况,从中国品种中筛选铁含量高的基因型,为下一步高铁小麦品种的培育奠定基础。随机选取了83个不同的小麦栽培品种(系),利用原子吸收分光光度法测量小麦籽粒中的铁含量。结果表明,这些品种的小麦籽粒铁含量变化范围较广,从5.64mg/kg到59.5mg/kg,平均值为30.13mg/kg,变异系数14.56,变异幅度比较大;籽粒铁含量为10～50mg/kg的品种占85.55%,而籽粒铁含量高于50mg/kg的仅占10.84%,在品种间呈现中间多、两头少的分布趋势;四月糙、金裹银、灰三糙等3个农家品种的铁含量超过了50mg/kg,说明在农家品种中存在着高铁含量的种质资源。农大3753等4个"有色"品种铁含量在40mg/kg左右,属于中高水平。

关键词：小麦籽粒铁含量分布

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利用SRAP标记构建甘薯分子连锁图谱

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作物学报 2010年第8期36卷 1286-1295页

作者：李爱贤刘庆昌王庆美张立明翟红刘树震中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点开放实验室北京市作物遗传改良重点实验室教育部作物杂种优势研究与利用重点实验室北京100193 山东省农业科学院作物研究所山东济南250100 山东省济南市农业局山东济南250021

以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本,低淀粉甘薯品种郑薯20为父本,杂交得到的F1分离群体的240个单株为作图群体,利用SRAP标记技术,共得到770个母本的多态性标记和523个父本的多态性标记,用JoinMap3.0软件和"双假测交"策略,分别... 详细信息

以高淀粉甘薯品种漯徐薯8号为母本,低淀粉甘薯品种郑薯20为父本,杂交得到的F1分离群体的240个单株为作图群体,利用SRAP标记技术,共得到770个母本的多态性标记和523个父本的多态性标记,用JoinMap3.0软件和"双假测交"策略,分别构建了2个亲本的分子连锁图谱。其中漯徐薯8号的图谱包括由473个SRAP标记组成的81个连锁群,总图距为5802.46cM,标记间平均图距为10.16cM;郑薯20的图谱包括由328个SRAP标记组成的66个连锁群,总图距为3967.90cM,标记间平均图距为12.02cM。该高密度分子连锁图谱的构建,为甘薯分子标记辅助选择、基因定位及克隆研究奠定了基础。

关键词：甘薯分子连锁图谱 SRAP标记

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关联分析定位水稻第4号染色体的芒性基因并结合连锁分析精细定位Awn4.1

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科学通报 2010年第27期55卷 2777-2781页

作者：胡广隆张冬玲潘慧乔李本吴建涛周雪崖张群远周雷姚国新李俊周李金杰张洪亮李自超中国农业大学农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室北京市作物遗传改良重点实验室北京100193 生物信息学教育部重点实验室信息国家实验室生物信息学研究部清华大学自动化系北京100084 Division of Statistical Genomics Washington University School of Medicine

关键词：水稻芒关联分析连锁分析基因定位

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玉米子粒体积和比重的QTL分析

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玉米科学 2010年第5期18卷 19-22页

作者：白光红杨小红李林任元高玉峰章建新严建兵李建生新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052 中国农业大学国家玉米改良中心农业部作物基因组学与遗传改良重点实验室北京100193

以玉米杂交种豫玉22的父母本综3和87-1构建的294个玉米F9:10家系为材料,通过北京上庄(2006年)和昌平(2007年)两年随机区组田间试验和分子标记分析,研究了玉米子粒体积和比重两个重要产量性状的遗传变异。采用复合区间作图法,2006年定位... 详细信息

以玉米杂交种豫玉22的父母本综3和87-1构建的294个玉米F9:10家系为材料,通过北京上庄(2006年)和昌平(2007年)两年随机区组田间试验和分子标记分析,研究了玉米子粒体积和比重两个重要产量性状的遗传变异。采用复合区间作图法,2006年定位到了与子粒体积和比重相关的5个QTL,2007年定位到了与子粒体积和比重相关的10个QTL,有3个QTL两年均检测到,其中5个QTL与子粒体积相关,7个QTL与子粒比重相关。

关键词：玉米子粒体积子粒比重 QTL

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