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中国畜牧杂志 2019年第11期55卷 52-58页

作者：汪楷庭周榆淞黄上真蒋尧付璐孟庆利马小军丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业农村部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽工程实验室北京100193 北京中育种猪有限责任公司北京102200

猪肉是世界第一大肉类消费品,通过提高饲料报酬来降低猪的养殖成本有巨大的经济意义。PLA2G4A基因作为早期脂肪分化的重要基因,已经在多个物种上进行研究。本实验以2016年出生于北京中育种猪有限责任公司的166头大白猪为材料,研究PLA2G4... 详细信息

猪肉是世界第一大肉类消费品,通过提高饲料报酬来降低猪的养殖成本有巨大的经济意义。PLA2G4A基因作为早期脂肪分化的重要基因,已经在多个物种上进行研究。本实验以2016年出生于北京中育种猪有限责任公司的166头大白猪为材料,研究PLA2G4A基因与平均日采食量、饲料转化率、剩余饲料采食量和平均日增重4个饲料报酬性状的关系。结果发现:猪PLA2G4A位于外显子1、12、13、21的4个SNP位点;内含子2、2、11、12、16的5个SNP位点,共计9个SNP位点;对这9个SNP和4个饲料报酬相关性状进行关联分析发现,位于内含子16的SNP位点与猪的平均日增重有极显著相关,而其他SNP位点与这4种饲料报酬性状均无显著相关。

关键词：猪 PLA2G4A基因饲料报酬关联分析

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DMU、GBS和Herdsman 3个软件育种值估计的比较

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中国畜牧杂志 2017年第7期53卷 29-35页

作者：张越杨宇泽张金鑫张锁宇邱小田唐韶青丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京100193 北京市畜牧总站北京100029 全国畜牧总站北京100125

猪育种管理软件为猪育种工作和养猪场的管理提供了便利,育种值估计是育种管理系统的核心。但在实际应用中,不同软件育种值估计不一致给一线育种工作者带来了困扰。本研究选取国内广泛使用的GBS、Herdsman育种管理软件和科学研究中常用的... 详细信息

猪育种管理软件为猪育种工作和养猪场的管理提供了便利,育种值估计是育种管理系统的核心。但在实际应用中,不同软件育种值估计不一致给一线育种工作者带来了困扰。本研究选取国内广泛使用的GBS、Herdsman育种管理软件和科学研究中常用的DMU程序,以大白猪、长白猪和杜洛克猪的育种数据和模拟数据为材料,研究3款软件估计育种值之间的差异。结果表明:在数据和遗传评估模型及初始参数一致的情况下,DMU4和GBS由于采取相同的算法,估计育种值一致性高达0.99以上,DMU5育种值估计与DMU4高度一致;DMUAI基于约束极大似然方法,在相同条件下育种值估计准确性略高于DMU4和GBS;由于模型和初始参数未知,本研究Herdsman育种值估计与GBS和DMU一致性偏低。但鉴于Herdsman算法与DMU4和GBS一致,可以预测在相同模型下,GBS、Herdsman与DMU育种值估计应无差异。研究同时表明,软件对遗传评估评估结果影响不大,主要是具体遗传评估模型的配置。

关键词：猪育种软件育种值相关性

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利用基因与环境互作提高猪基因组选择准确性

利用基因与环境互作提高猪基因组选择准确性

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第七届全国动植物数量遗传学学术研讨会

作者：宋海亮张勤丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京100193

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基于红外设备的母猪发情状态下体温变化研究

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畜牧兽医学报 2016年第1期47卷 85-91页

作者：秦永孝王玉梁高雪峰弥世荣邱小田张勤丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京100193 全国畜牧总站北京100125

旨在通过红外测温设备与常规电子温度计研究母猪发情前后体表温度和直肠温度的变化及环境风速、湿度和温度对其影响,为实现母猪发情鉴定的智能化提供依据。本研究选取杜洛克、长白、大白纯繁经产母猪共150头,分成5个批次,对其配种前后1... 详细信息

旨在通过红外测温设备与常规电子温度计研究母猪发情前后体表温度和直肠温度的变化及环境风速、湿度和温度对其影响,为实现母猪发情鉴定的智能化提供依据。本研究选取杜洛克、长白、大白纯繁经产母猪共150头,分成5个批次,对其配种前后10个时间点直肠温度和体表温度进行测定。结果表明：1）5-30cm,红外测温设备不同距离下体温测定结果差异不显著（P〈0.05）;2）不同部位红外测温结果差异显著,背部是理想的测温部位;3）母猪发情时直肠温度升高,配种时达到最高,而配种后直肠温度则显著降低（P〈0.05）,体表温度也是在配种时达到最高;4）发情状态能够显著影响直肠温度和体表温度（P〈0.05）,测定时间对直肠温度和体表温度没有显著影响,当环境温度、风速和湿度控制在适当范围,对直肠温度和体表温度变化影响不明显,反之,则影响显著。

关键词：发情直肠温度体表温度环境因素红外测温仪

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SNP芯片基因型填充至测序数据的策略

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中国科技论文 2016年第12期11卷 1431-1436页

作者：李乐义邵东东丁向东张勤中国农业大学动物科学技术学院北京100193 农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室北京100193 国家畜禽育种工程实验室北京100193

根据畜禽基因组信息,模拟了1条染色体测序数据、中密度和高密度SNP芯片数据。利用Beagle和FImpute将SNP芯片填充至测序数据,提出了一步法和两步法2种填充策略。结果表明,直接将中密度芯片填充至测序数据的一步法策略填充准确性较低,当... 详细信息

根据畜禽基因组信息,模拟了1条染色体测序数据、中密度和高密度SNP芯片数据。利用Beagle和FImpute将SNP芯片填充至测序数据,提出了一步法和两步法2种填充策略。结果表明,直接将中密度芯片填充至测序数据的一步法策略填充准确性较低,当公畜为参考群体时,两步法策略将后裔填充准确性由一步法时的0.691提高至0.863;当不同规模母畜为参考群体时,一步法策略下半同胞填充准确性为0.553～0.664,而两步法策略则大幅度提高到0.832～0.866。随着参考群体的增加,SNP芯片到测序数据的填充准确性可进一步提高,同样亲缘关系也有助于填充准确性提高。一步法填充策略下,Beagle填充准确性低于FImpute,但随着参考群体的扩大,差距逐步缩小,而在两步法策略下,Beagle与FImpute基因型填充准确性没有显著差异。

关键词：动物遗传育种与繁殖 SNP芯片基因型填充测序数据一步法两步法

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猪心脏脂肪酸结合蛋白基因多态性检测及与肉质性状的关联分析

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中国畜牧杂志 2016年第1期52卷 7-12页

作者：张越陆萌朱卫华许金根王金勇蓝静丁向东王重龙安徽省农业科学院畜牧兽医研究所安徽合肥230031 中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京100193 安徽科技学院动物科学学院安徽凤阳233100 农业部养猪科学重点实验室重庆荣昌402460

随着人们生活水平的提高,对肉品质的要求也越来越高。在影响猪肉品质的众多因素中,遗传因素起到了很重要的作用。心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)作为影响猪肉质性状的重要候选基因,曾在多个猪种上进行研究。本实验以3个安徽地方品种和... 详细信息

随着人们生活水平的提高,对肉品质的要求也越来越高。在影响猪肉品质的众多因素中,遗传因素起到了很重要的作用。心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)作为影响猪肉质性状的重要候选基因,曾在多个猪种上进行研究。本实验以3个安徽地方品种和1个杂交品种为材料(圩猪、皖南花猪、皖南黑猪、皖南黑猪与巴克夏的二元杂),将各品种的DNA分别混池,通过PCR扩增H-FABP基因的5′端调控区和全部4个外显子,进行测序检测SNPs,分别在5′端调控区和第2外显子各检测到1个SNP。这两个SNP位点与粗蛋白质、总脂肪、游离脂肪和16种氨基酸含量表型值关联分析表明,5′端调控区的SNP多态性与全部19个性状的关联结果未达显著水平(P>0.05),第2外显子处SNP多态仅与谷氨酸含量显著关联(P<0.05)。

关键词：猪肉质性状心脏脂肪酸结合蛋白基因(H—FABP) 基因多态性

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猪基因组选择网络平台介绍

猪基因组选择网络平台介绍

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中国畜牧兽医学会信息技术分会2016年学术研讨会

作者：宋海亮唐邵青张金鑫李乐义肖炜张勤丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京畜牧总站

家畜育种在畜牧业发展过程中扮演着极具重要的作用,在现代育种中,随着基因芯片技术的成熟,大量的芯片得到开发并广泛应用,基于芯片技术的基因组选择技术越来越受到广泛关注。由于可以利用覆盖整个基因组的信息,基因组选择准确性相较于... 详细信息

家畜育种在畜牧业发展过程中扮演着极具重要的作用,在现代育种中,随着基因芯片技术的成熟,大量的芯片得到开发并广泛应用,基于芯片技术的基因组选择技术越来越受到广泛关注。由于可以利用覆盖整个基因组的信息,基因组选择准确性相较于传统的育种方法要高,可以实现早期选种、准确预测,也可大大缩短世代间隔,加快了遗传进展。通常基因组选择实施中涉及芯片数据管理、芯片填充、育种值估计、反应变量计算、针对不同性状模型特异的基因组育种值估计等流程,繁琐而复杂。基于此,本研究以猪为例,开发了基因组选择网络平台系统,能够整合高密度SNP芯片信息,系谱信息、性能测定信息,使常规育种与分子育种无缝衔接,操作更加简单、方便。

关键词：猪基因组选择软件网络平台

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北京地区中小牛场DHI状况分析

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中国奶牛 2015年第21期 48-52页

作者：李乐义肖炜唐韶青杨宇泽丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京100193 北京市畜牧总站北京100107

生产性能测定(DHI)在现代奶牛养殖中发挥着重要的作用,而参测群体的群体结构以及DHI原始数据的准确性又对测定结果有很大的影响,并进而通过DHI最终影响奶牛养殖管理方面的分析与改进。本文通过分析近几年北京地区中小型牛场参测DHI的基... 详细信息

生产性能测定(DHI)在现代奶牛养殖中发挥着重要的作用,而参测群体的群体结构以及DHI原始数据的准确性又对测定结果有很大的影响,并进而通过DHI最终影响奶牛养殖管理方面的分析与改进。本文通过分析近几年北京地区中小型牛场参测DHI的基本情况,旨在得出北京地区除三元集团外其他中小型牛场的DHI现状,为北京地区奶牛DHI管理提供依据。

关键词：奶牛 DHI 北京地区

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基于红外测温设备的猪体温采集系统研究

基于红外测温设备的猪体温采集系统研究

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中国畜牧兽医学会信息技术分会第十届学术研讨会

作者：秦永孝乔宇飞张勤丁向东中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室南京丰顿科技有限公司

本文阐述了一种基于无线射频识别(RFID)技术与红外测温技术的猪体温智能测定方法,该方法主要应用于大群饲养中精确、实时的测定猪只体表温度,从而基于大数据判断猪只状态。系统主要采用RS485通信,选用红外快速筛选探头IS-RT05A作为传感... 详细信息

本文阐述了一种基于无线射频识别(RFID)技术与红外测温技术的猪体温智能测定方法,该方法主要应用于大群饲养中精确、实时的测定猪只体表温度,从而基于大数据判断猪只状态。系统主要采用RS485通信,选用红外快速筛选探头IS-RT05A作为传感器探头,通过与超高频RFID读卡器、920～925 MHz超高频无源电子耳标相结合实现个体体温的精确采集。

关键词：红外测温设备体温采集系统

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猪心脏脂肪酸结合蛋白基因多态性检测及与肉质性状的关联分析

猪心脏脂肪酸结合蛋白基因多态性检测及与肉质性状的关联分析

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2014年中国畜牧兽医学会养猪学分会学术研讨会

作者：张越陆萌王继英丁向东王重龙中国农业大学动物科学技术学院农业部动物遗传育种与繁殖重点实验室国家畜禽育种工程实验室北京 100193 山东省农业科学院畜牧兽医研究所济南 250000 安徽省农业科学院畜牧兽医研究所合肥 230000

随着人们生活水平的提高,对肉品质的要求也越来越高,在影响猪肉品质的众多因素中,遗传因素起到了很重要的作用.心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)作为影响猪肉质性状的重要候选基因,已经在多个猪种上进行了研究.本实验以我国地方猪种为材... 详细信息

随着人们生活水平的提高,对肉品质的要求也越来越高,在影响猪肉品质的众多因素中,遗传因素起到了很重要的作用.心脏脂肪酸结合蛋白基因(H-FABP)作为影响猪肉质性状的重要候选基因,已经在多个猪种上进行了研究.本实验以我国地方猪种为材料(圩猪、皖南花猪、皖南黑猪及其二元杂),将各品种的DNA分别混池,通过PCR扩增H-FABP基因的5'端调控区和全部4个外显子,进行测序检测SNPs,分别在5'端调控区和第2外显子各检测到1个SNP.该两个位点SNP多态性与蛋白质、总脂肪、游离脂肪酸和16种氨基酸表型值进行关联分析,5'端调控区的SNP多态性与全部19个性状的关联结果未达显著水平(P＞0.05),第2外显子处SNP多态与谷氨酸含量关联分析结果达到显著水平(P＜0.05).

关键词：猪肉质性状心脏脂肪酸结合蛋白基因基因多态性

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