检索结果-内蒙古大学图书馆

科学通报 2011年第25期56卷 2212-2222页

作者：张哲张勤丁向东中国农业大学动物科技学院农业部动物遗传育种与繁殖重点开放实验室畜禽育种国家工程实验室北京100193

基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择,也是一种标记辅助选择.此方法能够在提高育种值估计准确性的同时,通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展.随着畜禽高密度全基因组SNP芯片的问世,基因组选择方法正在影响着传统... 详细信息

基因组选择是同时对高密度全基因组标记的选择,也是一种标记辅助选择.此方法能够在提高育种值估计准确性的同时,通过早期选种缩短世代间隔、降低近交、加速遗传进展.随着畜禽高密度全基因组SNP芯片的问世,基因组选择方法正在影响着传统的畜禽遗传评估体系.在多数奶业发达国家,基因组选择方法正逐渐取代传统奶牛遗传评估方法,成为奶牛遗传评估的"标准"方法.近年来,针对基因组选择的方法、影响因素、应用策略和育种方案的研究大量涌现.基因组选择已经成为当前动物、植物及水产生物遗传育种领域的研究热点.本文综述了基因组选择的计算方法、准确性的来源及影响因素以及基因组选择在畜禽遗传育种中的应用现状,同时对当前存在的问题进行总结,并对基因组选择的理论发展和应用前景进行展望.

关键词：基因组选择基因组育种值标记辅助选择畜禽育种

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鸡类囊胚获得及其生物学特性研究

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中国科学（C辑） 2005年第3期35卷 214-219页

作者：李佳潘求真李俊英韩红兵孙书锋杨君徐曙光田亮连正兴杨宁李宁中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室

鸡胚是研究胚胎发育、组织分化、基因表达与调控良好的实验模型, 是动物功能基因组学研究的重要材料. 实验选取白来航蛋鸡所产新鲜种蛋, 采用纸环法收集胚盘, 机械打碎后进行悬浮培养, 获得了哺乳动物囊胚样结构, 命名为类囊胚. 体外培... 详细信息

鸡胚是研究胚胎发育、组织分化、基因表达与调控良好的实验模型, 是动物功能基因组学研究的重要材料. 实验选取白来航蛋鸡所产新鲜种蛋, 采用纸环法收集胚盘, 机械打碎后进行悬浮培养, 获得了哺乳动物囊胚样结构, 命名为类囊胚. 体外培养12～24 h是类囊胚发育的高峰期, 其直径显著增加近1倍. FBS可促进类囊胚的发育, 而卵黄在12 h前对类囊胚发育没有明显影响, 但到24 h时可促进类囊胚的贴壁生长. 经碱性磷酸酶(AKP)染色初步显示类囊胚中含有大量碱性磷酸酶活性的胚胎干细胞, 胚胎干细胞特异性表面标志SSEA-1免疫荧光染色后呈阳性, 进一步肯定了类囊胚中ES细胞的存在, 最终从贴壁类囊胚中分化出神经样和成纤维样等多种类型细胞. 由此可以得出: 悬浮培养鸡胚盘细胞可以形成含有胚胎干细胞的、类似哺乳动物囊胚样的结构, 并能保持其内胚胎干细胞的特性和分化潜能.

关键词：特性研究生物学胚胎干细胞基因表达与调控碱性磷酸酶活性鸡类功能基因组学悬浮培养哺乳动物囊胚发育细胞特异性鸡胚盘细胞胚胎发育组织分化实验模型体外培养荧光染色 ES细胞分化潜能高峰期 PBS 成纤维

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猪MHC-DQB、DRB近端调控区序列及其多态性

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Acta Genetica Sinica 2005年第3期32卷 282-288页

作者：徐如海王昆孙东晓丁向东刘培琼张勤中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100094 贵州大学动物科技学院贵阳550025

根据人MHC-DRB和MHC-DQB基因组序列和猪MHC-DRB和MHC-DQB基因外显子1设计引物,应用PCR扩增及克隆测序技术,首次得到了猪MHC-DRB和MHC-DQB基因的5'上游近端调控区(URR)序列。分析发现所得序列中存在与MHCⅡ类基因表达调控有关... 详细信息

根据人MHC-DRB和MHC-DQB基因组序列和猪MHC-DRB和MHC-DQB基因外显子1设计引物,应用PCR扩增及克隆测序技术,首次得到了猪MHC-DRB和MHC-DQB基因的5'上游近端调控区(URR)序列。分析发现所得序列中存在与MHCⅡ类基因表达调控有关的高度保守的W、X、Y、CCAAT及类TATA调控元件,调控元件的空间组织顺序也与其他物种相应序列的相同。利用SSCP技术在313头猪中共发现12个DRB-URR复等位基因和14个DQB-URR复等位基因,序列比对结果表明在这些复等位基因中存在丰富的多态位点,为进一步深入研究猪MHCⅡ类基因近端调控区的多态性及抗病育种研究奠定了基础。

关键词：猪MHC—DRB 猪MHC-DQB 5′URR 调控元件复等位基因多态位点

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猪2、7和8号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)检测

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生物化学与生物物理进展 2008年第11期35卷 1291-1297页

作者：巩元芳卢昕王志鹏李珊邱小田张勤农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室中国农业大学动物科技学院北京100193 河北科技师范学院动物科学系昌黎066600

以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量... 详细信息

以3个品种(长白猪、大白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头仔猪组成资源群体,在猪2、7和8号染色体上共选取35个微卫星标记,采用基于线性混合模型的方差组分分析方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测.通过似然比检验,并以自由度为2的卡方分布作为检验统计量的分布,共发现22个在P<5%水平下显著的QTL,其中在2号染色体上有9个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞体积、血红蛋白含量、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、平均血小板体积、血小板分布宽度和血小板压积,在7号染色体有7个,分别影响白细胞总数、中性粒细胞数、平均红细胞血红蛋白浓度、血红蛋白含量、血小板总数、平均红细胞体积和红细胞分布宽度变异,在8号染色体上有6个,分别影响中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、平均红细胞血红蛋白浓度、血小板总数、血小板压积和平均红细胞体积.为尽可能地避免由于多重检验所造成的假阳性率的升高,我们采用了控制假检出率(false discovery rate,FDR)的方法来对这22个QTL进行进一步检验,发现有14个达到FDR<5%显著水平,其中又有9个达到FDR<1%显著水平.

关键词：猪血常规指标数量性状基因座(QTL) 方差组分分析假检出率(FDR)

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猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状基因座(QTL)定位

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中国农业科学 2011年第2期44卷 395-401页

作者：张陈华蔡绍倩巩元芳卢昕殷宗俊张勤安徽农业大学动物科技学院中国农业大学动物科技学院/农业部畜禽遗传育种重点开放实验室

【目的】检测定位猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状位点。【方法】以3个品种(大白猪、长白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头试验猪组成资源群体,在猪10号染色体上共选取13个微卫星标记,采用基于线性混合模型方法,对影响与猪... 详细信息

【目的】检测定位猪10号染色体上影响血常规指标的数量性状位点。【方法】以3个品种(大白猪、长白猪、松辽黑猪)16个公猪家系共计368头试验猪组成资源群体,在猪10号染色体上共选取13个微卫星标记,采用基于线性混合模型方法,对影响与猪白细胞、红细胞和血小板相关的共计18项血常规指标的数量性状基因座(quantitative trait loci,QTL)进行了检测。通过似然比检验,利用置换法确定显著性阈值。【结果】(1)13个标记在群体中绝大多数的微卫星属于中度多态的遗传标记,所有微卫星标记在3个品种中的平均等位基因数为3.1754,平均杂合度为0.5215,平均多态信息含量为0.5999,平均香浓指数为1.3222。(2)达到了染色体极显著水平的3个QTL(P<0.01),分别是影响着红细胞压积(HCT)、血红蛋白含量(HGB)和平均红细胞体积(MCV),影响血小板总数(PLT)的QTL也达到染色体显著水平(P<0.05)。【结论】定位的4个影响猪血常规的QTL集中在10号染色体81—136cM区域,临近的标记分别为SW249、SWR136、S0070和SW1894。

关键词：猪微卫星 QTL定位血常规指标

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化学激活对猪体外成熟卵母细胞孤雌发育的影响

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中国农业科学 2005年第5期38卷 1029-1033页

作者：田见晖蔡元刘国世曾申明成文敏朱士恩刘焕营吴常信中国农业大学动物科技学院/农业部畜禽遗传育种重点开放实验室中国农业大学动物科技学院/农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100094 兰州730070 甘肃农业大学动物科技学院

探索了离子霉素结合细胞松驰素B(cytochalasinB,CB)、放线菌酮(cycloheximide,CHX)以及6-二甲基嘌呤(6-dimethylaminopurine,6-DMAP)等化学物质,对猪卵母细胞激活后发育的影响。试验1,体外成熟卵母细胞分别用15、20、25、30μmol·... 详细信息

探索了离子霉素结合细胞松驰素B(cytochalasinB,CB)、放线菌酮(cycloheximide,CHX)以及6-二甲基嘌呤(6-dimethylaminopurine,6-DMAP)等化学物质,对猪卵母细胞激活后发育的影响。试验1,体外成熟卵母细胞分别用15、20、25、30μmol·L-1的离子霉素处理40min或电激活(1.3kV·cm-1,80μs,1次脉冲),结果表明,20μmol·L-1组的激活率(69.93±5.80)%显著高于15μmol·L-1组(P<0.05),但与其它各组差异不显著(P>0.05)。试验2,卵母细胞采用20μmol·L-1离子霉素分别激活10、20、30、40、50min,再用2mmol·L-16-DMAP处理6h,其中,40min组的卵裂率、囊胚率[(72.40±13.02)%、(25.37±11.43)%]较高,但与其它各组差异不显著(P>0.05)。试验3,卵母细胞经离子霉素(20μmol·L-1、40min)激活后,分别用7.5μg·ml-1CB、10μg·ml-1CHX、2mmol·L-16-DMAP、7.5μg·ml-1CB+10μg·ml-1CHX和7.5μg·ml-1CB+2mmol·L-16-DMAP处理6h,2mmol·L-16-DMAP组的激活率、卵裂率和囊胚率[(86.05±4.29)%、(61.77±8.10)%和(21.62±3.31)%]显著高于7.5μg·ml-1CB组(P<0.05)与另外几组差异不显著(P>0.05)。试验4,卵母细胞由离子霉素(20μmol·L-1、40min)激活后,用2mmol·L-16-DMAP分别处理3.5、5.5、7.5h,5.5h组的卵裂率和囊胚率[(66.59

关键词：猪卵母细胞体外成熟孤雌激活离子霉素

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cDNA芯片差异表达基因检测的非转换方法(英文)

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Acta Genetica Sinica 2006年第1期33卷 80-88页

作者：张纪刚殷宗俊张勤中国农业大学动物科技学院农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100094

cDNA微阵列数据中包含许多变异因素,用于检测差异表达基因和其它统计分析前,必须将这些“噪音”剔除。对数比法(背景校正、对数比转换和数据标准化)已经被广泛应用于cDNA微阵列数据分析中,然而这种方法却存在着一些亟待解决的缺陷。对... 详细信息

cDNA微阵列数据中包含许多变异因素,用于检测差异表达基因和其它统计分析前,必须将这些“噪音”剔除。对数比法(背景校正、对数比转换和数据标准化)已经被广泛应用于cDNA微阵列数据分析中,然而这种方法却存在着一些亟待解决的缺陷。对此,该文提出一种非转换方法,它可免去对数比的转化过程,直接在背景校正后进行数据标准化,可以有效剔除实验“噪音”。研究结果表明:在检测差异表达基因的效率方面,非转换方法比常规的对数比法具有更好的稳健性和更高的检测功效,基因检出率和准确性大大提高。

关键词： cDNA芯片差异表达基因对数比转换非转换方法标准化

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猪整合素β_1基因CRS-PCR多态性与产仔数的关联性分析

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遗传 2012年第7期34卷 879-886页

作者：郭良勇傅金銮王爱国中国农业大学动物科学技术学院畜禽育种国家工程实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100193

文章采用CRS-RFLP技术对长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种的整合素β1基因第5外显子T32207C位点及第7外显子A35230G位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析。结果表明:32207多态位点的基因型效应对3个品种... 详细信息

文章采用CRS-RFLP技术对长白猪、大白猪和杜洛克猪3个品种的整合素β1基因第5外显子T32207C位点及第7外显子A35230G位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析。结果表明:32207多态位点的基因型效应对3个品种的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)影响均不显著;35230多态位点的基因型效应对大白猪和长白猪头胎、二胎及所有胎次的TNB和NBA的影响达到显著(P<0.05)或者极显著水平(P<0.01),基因型GG、AG与AA对产仔数的影响存在差异,其效应为GG,AG>AA。可见整合素β1基因35230位点的G等位基因对大白猪和长白猪的产仔数性状有显著影响。

关键词： CRS-PCR 整合素β1基因多态性产仔数猪

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猪HB-EGF基因多态性与产仔数的关联性分析

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中国农业科学 2009年第1期42卷 274-282页

作者：马喜山王爱国刘桂芬傅金恋中国农业大学动物科学技术学院/农业部畜禽遗传育种重点开放实验室

【目的】研究猪HB-EGF基因的多态性及其与产仔数的关系,寻找与猪产仔数相关的分子遗传标记,以加快猪育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术研究HB-EGF基因外显子多态性,利用最小二乘均数法对其与产仔数的关系进行分析,同时对两个多态位点... 详细信息

【目的】研究猪HB-EGF基因的多态性及其与产仔数的关系,寻找与猪产仔数相关的分子遗传标记,以加快猪育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术研究HB-EGF基因外显子多态性,利用最小二乘均数法对其与产仔数的关系进行分析,同时对两个多态位点的方差组分进行了分析。【结果】在两对引物(E5和E7)中各检测到一个多态位点,均出现3种基因型(AA、BB、AB)。E5位点:对于大白猪,在3～8胎中,BB型个体的TNB和NBA均显著高于AA型个体(P<0.05),在所有胎次中,BB型个体的TNB显著高于AA型个体(P<0.05),NBA极显著高于AA型个体(P<0.01),TNB和NBA的遗传主要受基因加性效应的影响;对于长白猪,在4个阶段中3种基因型个体的TNB和NBA之间差异不显著(P>0.05)。E7位点:对于大白猪,在3～8胎和所有胎次中,AA型个体的TNB均显著高于BB型个体(P<0.05),TNB的遗传主要受基因加性效应的影响;对于长白猪,在3～8胎和所有胎次中,AB型个体的NBA均显著高于BB型个体。【结论】对于大白猪,E5位点BB基因型可作为在TNB和NBA性状上的标记基因型,E7位点BB基因型可以作为TNB性状的标记基因型。

关键词：猪肝素结合性表皮生长因子多态性产仔数

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放线菌酮对绵羊体外成熟卵母细胞同期化及发育的影响

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中国畜牧杂志 2010年第13期46卷 22-25页

作者：王晓英褚大鹏吴中红王芬露孙绪磊成文敏许晓玲田见晖中国农业大学动物科技学院农业部畜禽遗传育种重点开放实验室北京100193

实验筛选了绵羊卵母细胞同期化培养的放线菌酮(CHX)浓度,研究了CHX处理后减数分裂进程的改变和CHX处理时间对减数分裂恢复能力的影响,并比较了体外成熟不同阶段CHX处理对后期发育的影响。结果表明:20μg/mLCHX处理24h后处于GV期的卵母... 详细信息

实验筛选了绵羊卵母细胞同期化培养的放线菌酮(CHX)浓度,研究了CHX处理后减数分裂进程的改变和CHX处理时间对减数分裂恢复能力的影响,并比较了体外成熟不同阶段CHX处理对后期发育的影响。结果表明:20μg/mLCHX处理24h后处于GV期的卵母细胞比率与对照组差异不显著(P>0.05),但显著高于5、10μg/mL组(P<0.05);CHX处理24h再正常培养16、20h的成熟率显著高于正常培养12h组(P<0.05),但与对照组差异不显著(P>0.05);卵母细胞经CHX处理8、16、24h后再正常培养20h,其中8h和16h组卵的成熟率显著(P<0.05)低于对照组和24h组;体外成熟不同阶段用CHX处理后体外受精的卵裂率、囊胚率也显著低于对照组(P<0.01)。因此20μg/mLCHX可较大程度地抑制卵母细胞减数分裂,CHX处理后卵母细胞减数分裂进程将加快,但影响其后期发育。

关键词：放线菌酮卵母细胞体外成熟同期化绵羊

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