检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2013年第6期35卷 771-777页

作者：杜新华高雪张路培高会江李俊雅许尚忠中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

piggyBac(PB)转座子作为一种遗传工具被广泛应用于多个物种的转基因及插入突变研究,目前PB转座子在牛中的相关研究还较少。为了获得PB转座子在牛基因组中的整合位点,总结其转座特征,文章构建了PB[CMV-EGFP]和pcDNA-PBase二元转座系统,... 详细信息

piggyBac(PB)转座子作为一种遗传工具被广泛应用于多个物种的转基因及插入突变研究,目前PB转座子在牛中的相关研究还较少。为了获得PB转座子在牛基因组中的整合位点,总结其转座特征,文章构建了PB[CMV-EGFP]和pcDNA-PBase二元转座系统,利用细胞核电转技术共转染牛耳组织成纤维细胞,经G-418筛选,获得了稳定转染EGFP的转基因细胞系;提取细胞基因组DNA,利用基因组步移技术扩增PB转座子5′Bac区插入位置的DNA序列;通过与牛基因组序列进行BLAST比对,得到PB转座子在牛基因组中的插入位点。文章共获得了8个有效的整合位点,但仅有5个位点定位到染色体1、2、11和X染色体上。序列分析表明:在牛基因组中,PB转座子可特异性的插入到"TTAA"位置,并整合到基因间的非调控区;分析整合位点"TTAA"相邻一侧的5个碱基组成,发现PB转座子5′端倾向于插入到GC(62.5%)碱基富集区。该研究表明,PB转座子可以在牛基因组中发生转座,获得的整合位点信息为利用PB转座子在牛上开展遗传学研究提供了理论参考。

关键词： piggyBac 转基因牛基因组整合位点

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牛睾丸差异表达基因Septin10的筛选、鉴定及组织表达研究

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畜牧兽医学报 2010年第1期41卷 27-32页

作者：李姣陈若愚高雪李俊雅张路培周正奎陈金宝许尚忠中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

本研究旨在筛选出决定或影响公牛睾丸周长(SC)的基因片段,并研究其功能和表达特征,为今后种公牛的选育提供理论基础。用mRNA差异显示技术从睾丸周长极显著差异(P<0.01)的睾丸组织中筛选差异表达的基因片段,并用反Northern杂交及荧光... 详细信息

本研究旨在筛选出决定或影响公牛睾丸周长(SC)的基因片段,并研究其功能和表达特征,为今后种公牛的选育提供理论基础。用mRNA差异显示技术从睾丸周长极显著差异(P<0.01)的睾丸组织中筛选差异表达的基因片段,并用反Northern杂交及荧光定量的方法鉴定筛选的结果,研究筛选出基因的组织表达谱。结果,筛选出1条差异表达片段A71,经测序和BLAST分析发现该片段与牛Septin10基因高度同源(99%),且该基因在肝脏等9个组织中都有表达,在2组睾丸组织中相对表达量差异显著(P<0.05)。分析结果表明,Septin10基因是牛睾丸差异表达基因,可作为一个研究牛繁殖性状的候选基因。

关键词：睾丸周长 DDRT-PCR Septin10 反Northern杂交荧光定量PCR 组织表达谱

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基于高密度SNP标记的肉牛人工选择痕迹筛查

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遗传 2012年第10期34卷 1304-1313页

作者：刘喜冬王志鹏樊惠中李俊雅高会江中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193 东北农业大学动物科学技术学院哈尔滨150030

近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下... 详细信息

近年来随着遗传改良工作的实施,人工选择大大提高了肉牛的生产性能并使其遗传基础发生巨大改变。文章基于Illumina BovineSNP50(54K)和BovineHD(770K)两款芯片数据,采用FST检验方法分析牛群的遗传分化,并筛查人工选择在牛的基因组留下的印记。通过全基因组范围内的扫描,共发现47 104个"离群"位点和3064个群体特异的人工选择"候选基因",如CLIC5、TG、CACNA2D1、FSHR等。通过基因注释对基因的生物学过程和分子功能进行富集分析。文章构建了我国肉牛的全基因组的选择信号图谱,为深入研究人工选择和理解生物进化提供线索,且研究结果也显示人工选择对基因组的影响在牛品种遗传改良中发挥了重要作用。

关键词：牛的基因组人工选择单核苷酸多态性基因注释

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牛生长性状、肉质性状和胴体性状间典型相关分析

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中国畜牧兽医 2010年第6期37卷 88-93页

作者：李姣张猛袁峥嵘李俊雅周正奎贺建宁高雪陈金宝许尚忠中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

通过对牛生长性状、肉质性状和胴体性状指标的研究,分析3组性状组内及组间的相关性,揭示牛不同类型性状间的相互影响。测量记录327头牛3组性状的表型值,利用简单相关分析和典型相关分析对3组性状相关性进行深入研究。17个性状间共有74... 详细信息

通过对牛生长性状、肉质性状和胴体性状指标的研究,分析3组性状组内及组间的相关性,揭示牛不同类型性状间的相互影响。测量记录327头牛3组性状的表型值,利用简单相关分析和典型相关分析对3组性状相关性进行深入研究。17个性状间共有74对存在极显著简单相关(P<0.01),多数相关系数低于0.5。典型相关分析结果表明,3组性状间第一、第二和第三典型相关系数均达到极显著水平(P<0.001),其中生长性状与肉质性状间、生长性状与胴体性状间、肉质性状与胴体性状间的第一和第二典型相关系数分别为0.525和0.350、0.993和0.623、0.698和0.394。结果显示,典型相关分析比简单相关能更准确、全面反映3组性状间的相关关系,为肉牛的选育提供科学依据。

关键词：牛生长性状肉质性状胴体性状典型相关简单相关

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BP神经网络在中国西门塔尔牛屠宰性状早期预测中的应用

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西南农业学报 2010年第5期23卷 1677-1682页

作者：张猛周正奎李姣袁峥嵘贺建宁高雪高会江陈金宝李俊雅许尚忠中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

本研究运用DPS(Data processing system数据处理系统)软件构建BP神经网络,选取156头中国西门塔尔牛屠宰前7个重要生产性状(平均日增重、宰前活重、体高、体长、胸围、腹围、管围)来预测中国西门塔尔牛胴体重和屠宰率两个屠宰性状,得到了... 详细信息

本研究运用DPS(Data processing system数据处理系统)软件构建BP神经网络,选取156头中国西门塔尔牛屠宰前7个重要生产性状(平均日增重、宰前活重、体高、体长、胸围、腹围、管围)来预测中国西门塔尔牛胴体重和屠宰率两个屠宰性状,得到了7-5-2 BP神经网络模型。通过对预测结果与实测结果进行统计分析从而对所构建的BP神经网络的有效性进行验证。仿真测试结果表明:胴体重和屠宰率的预测结果与实测结果的相关系数(R)分别达到0.8264和0.8967,胴体重和屠宰率预测相对误差分别为5.0%和2.1%,验证了该BP神经网络模型在中国西门塔尔牛屠宰性状早期预测中的可行性和实用性,对加快中国西门塔尔牛的选育进程,降低屠宰性状的测定成本具有一定意义。

关键词： BP神经网络中国西门塔尔牛屠宰性状预测

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鲁西牛和秦川牛体尺性状与胴体性状间典型相关分析

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河北农业大学学报 2010年第4期33卷 99-103页

作者：张猛李姣袁峥嵘贺建宁高雪高会江陈金宝李俊雅许尚忠中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

为揭示肉牛体尺性状与胴体性状两组变量之间相关本质,对鲁西牛和秦川牛的4个体尺性状和7个胴体性状分别进行典型相关分析,结果表明:鲁西牛和秦川牛的体尺性状和胴体性状间都存在较强的相关,其第1典型相关系数均达到极显著相关水平(P<... 详细信息

为揭示肉牛体尺性状与胴体性状两组变量之间相关本质,对鲁西牛和秦川牛的4个体尺性状和7个胴体性状分别进行典型相关分析,结果表明:鲁西牛和秦川牛的体尺性状和胴体性状间都存在较强的相关,其第1典型相关系数均达到极显著相关水平(P<0.01),典型相关系数分别是0.886和0.985,占到总相关信息的66.00%和92.92%,第2典型相关系数分别是0.738和0.802,累积占到总相关信息的87.73%和98.16%。鲁西牛体尺性状和胴体性状间第1对典型相关主要由胸围(A4)与胴体重(B1)引起,第2对典型相关主要由体高(A1)与后腿长(B5)引起,而秦川牛体尺性状和胴体性状间第1对典型相关主要由管围(A3)、胸围(A4)与胴体重(B1)、后腿长(B5)、胴体长(B7)引起,对2个品种牛两组性状的选育应侧重于这几个性状的表现,可以达到较理想的效果。

关键词：鲁西牛秦川牛体尺性状胴体性状典型相关分析

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荷斯坦牛白细胞抗原基因-DRB3(BoLA-DRB3)外显子2多态性及其与体细胞评分的关系

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农业生物技术学报 2009年第4期17卷 593-598页

作者：李春苗石万海储明星安永福陈宏权狄冉方丽安徽农业大学动物科技学院中国农业科学院北京畜牧兽医研究所农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室河北省畜牧兽医研究所北京奶牛中心

采用PCR-RFLP技术,用限制性内切酶BstYⅠ对河北省489头荷斯坦母牛和40头荷斯坦公牛白细胞抗原-DRB3基因(BoLA-DRB3)外显子2的284bp扩增产物进行多态性分析。荷斯坦母牛经BstYⅠ酶切产生3种基因型AA、AB和BB,其频率分别为0.078、0.380和0... 详细信息

采用PCR-RFLP技术,用限制性内切酶BstYⅠ对河北省489头荷斯坦母牛和40头荷斯坦公牛白细胞抗原-DRB3基因(BoLA-DRB3)外显子2的284bp扩增产物进行多态性分析。荷斯坦母牛经BstYⅠ酶切产生3种基因型AA、AB和BB,其频率分别为0.078、0.380和0.542;荷斯坦公牛经BstYⅠ酶切产生2种基因型AB和BB,其频率分别为0.250和0.750;荷斯坦母牛和公牛在该酶切位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(母牛:χ2=0.45,P=0.799>0.05;公牛:χ2=0.82,P=0.665>0.05);用最小二乘法分析BoLA-DRB3基因外显子2的多态性与荷斯坦母牛体细胞评分(somatic cell score,SCS)的关系,结果表明AA基因型SCS最小二乘均值极显著低于AB基因型所对应的值(P=0.0098<0.01),极显著低于BB基因型所对应的值(P=0.00009<0.0001);AB基因型SCS最小二乘均值极显著低于BB基因型所对应的值(P=0.0096<0.01);对乳房炎抗性,AA是最有利基因型,BB是最不利基因型。研究结果表明BoLA-DRB3基因外显子2的多态性是提高奶牛乳房炎抗性的一个潜在的DNA标记。

关键词：荷斯坦牛体细胞评分 BoLA-DRB3基因 PCR-RFLP

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荷斯坦母牛TLR1基因多态性及其与体细胞评分关系

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中国农业科学 2009年第6期42卷 2118-2125页

作者：李春苗石万海储明星安永福陈宏权狄冉方丽中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室安徽农业大学动物科技学院北京奶牛中心河北省畜牧兽医研究所

【目的】阐明Toll-like receptor 1(TLR1)基因多态性与荷斯坦母牛乳房炎抗性之间的关系,为奶牛乳房炎抗性的标记辅助选择提供依据。【方法】采用PCR-SSCP和PCR-RFLP检测208头荷斯坦母牛TLR1基因多态性,用最小二乘法分析基因多态性与荷... 详细信息

【目的】阐明Toll-like receptor 1(TLR1)基因多态性与荷斯坦母牛乳房炎抗性之间的关系,为奶牛乳房炎抗性的标记辅助选择提供依据。【方法】采用PCR-SSCP和PCR-RFLP检测208头荷斯坦母牛TLR1基因多态性,用最小二乘法分析基因多态性与荷斯坦母牛体细胞评分(somaticcell score,SCS)的关系。【结果】TLR1基因mRNA序列中存在G1409A、A1475C、G1550A和G1596A突变位点,其中G1596A突变使异亮氨酸变为缬氨酸;G1409A突变位点经BsiYⅠ酶切产生2种基因型AA和AB,频率分别为0.375和0.625,χ2检验表明荷斯坦母牛在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡;AA和AB基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05);A1475C突变位点经BstXⅠ酶切产生2种基因型CC和CD,频率分别为0.178和0.822,荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;CC和CD基因型SCS最小二乘均值差异不显著(P>0.05);G1550A突变位点经BsiYⅠ酶切产生3种基因型EE、EF和FF,频率分别为0.236、0.370和0.394,荷斯坦母牛在该位点偏离了Hardy-Weinberg平衡;EE、EF和FF基因型SCS最小二乘均值差异均不显著(P>0.05);G1596A突变位点经BclⅠ酶切产生3种基因型GG、GH和HH,频率分别为0.260、0.567和0.173,荷斯坦母牛在该位点处于Hardy-Weinberg平衡;HH基因型SCS最小二乘均值极显著低于GH基因型所对应的值(P<0.01),极显著低于GG基因型所对应的值(P<0.0001);GH基因型SCS最小二乘均值极显著低于GG基因型所对应的值(P<0.01)。【结论】对奶牛乳房炎抗性,HH是最有利基因型,GG是最不利基因型,初步证明TLR1基因G1596A多态位点的H等位基因是提高奶牛乳房炎抗性的一个潜在的DNA标记。

关键词：荷斯坦母牛 TLR1基因乳房炎体细胞评分 PCR-RFLP

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内蒙古敖汉旗地区基础母牛存栏量调查方案的研究

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中国畜牧兽医 2012年第4期39卷 134-138页

作者：刘喜冬王延晖高会江许尚忠李俊雅东北农业大学动物科学技术学院黑龙江哈尔滨150030 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193

对畜禽存栏量的调查是农业统计调查的重要内容之一,其统计调查方法主要是抽样调查。本研究旨在通过实例抽样调查,拟出合适的抽样方法对全国的基础母牛存栏量进行调查估计。采用二阶PPS(sampling with probability proportionalto size)... 详细信息

对畜禽存栏量的调查是农业统计调查的重要内容之一,其统计调查方法主要是抽样调查。本研究旨在通过实例抽样调查,拟出合适的抽样方法对全国的基础母牛存栏量进行调查估计。采用二阶PPS(sampling with probability proportionalto size)抽样、分层等比例抽样、分层二阶典型抽样对内蒙古敖汉旗肉牛存栏量进行调查,比较3种方法的准确度。结果表明,在此3种方法10%的样本量下进行比较时,3种抽样方法按相对误差大小顺序排列为:分层二阶典型抽样<分层等比例抽样<二阶PPS抽样,其相对误差分层二阶典型抽样比分层等比例抽样、二阶PPS抽样分别小60.38%、92.83%;置信区间按大小顺序排列为:分层二阶典型抽样<分层等比例抽样<二阶PPS抽样。总体而言,分层二阶典型抽样的准确度相对较高,相对误差最小,仅为0.0412。故在实际应用当中,分层二阶典型抽样目前较为适用。

关键词：肉牛存栏量分层抽样二阶抽样典型抽样

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中国西门塔尔牛CACNA2D1基因的遗传变异及其与屠宰性状的关联分析

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华北农学报 2011年第4期26卷 50-60页

作者：张猛张立敏周正奎袁峥嵘黄萌邓桂馨刘喜冬刘利李姣高雪高会江许尚忠李俊雅中国农业科学院北京畜牧兽医研究所中国农业科学院肉牛研究中心农业部畜禽遗传资源与利用重点开放实验室北京100193 西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 东北农业大学动物科技学院黑龙江哈尔滨150030

旨在研究中国西门塔尔牛CACNA2D1基因的遗传变异及其与屠宰性状的关系。本试验与所采用的传统的PCR-SSCP或者PCR-RFLP技术不同,首次借助高通量SNP芯片技术在136头中国西门塔尔牛群体中对CACNA2D1基因的遗传变异进行了研究。结果显示,在... 详细信息

旨在研究中国西门塔尔牛CACNA2D1基因的遗传变异及其与屠宰性状的关系。本试验与所采用的传统的PCR-SSCP或者PCR-RFLP技术不同,首次借助高通量SNP芯片技术在136头中国西门塔尔牛群体中对CACNA2D1基因的遗传变异进行了研究。结果显示,在中国西门塔尔牛CACNA2D1基因上总计发现12个有效SNP位点,其中4个位点Ho、He和PIC值较低属于中低度多态,8个位点属于高度多态。卡方适合性检验表明,10个位点处于HarDY-Weinberg平衡状态(P>0.05)。各位点遗传变异与屠宰性状进行关联分析显示,位点1不同基因型个体在肉色性状方面差异显著(P<0.05),位点2不同基因型个体在大腿肉厚方面差异显著(P<0.05),位点3不同基因型个体在胴体重、屠宰率、眼肌面积和大腿肉厚几个重要屠宰性状差异显著(P<0.05),在肉色性状达到了差异极显著(P<0.01)。位点3杂合子AB基因型为优势基因型,其他位点AA为优势基因型。本研究表明,CACNA2D1基因可以作为中国西门塔尔牛部分屠宰性状候选基因,尤其是位点3可以作为中国西门塔尔牛屠宰性状的重要潜在分子标记,从而为中国西门塔尔牛现代育种提供一定参考。

关键词：中国西门塔尔牛 CACNA2D1基因 SNP芯片技术屠宰性状关联分析

来源：评论

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