检索结果-内蒙古大学图书馆

基因组学与应用生物学 2024年第11期43卷 1779-1793页

作者：景新阳莫家远王楠刘永刚牟玉莲林鑫黄雷朱振东李奎青岛农业大学动物科技学院青岛266109 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部畜禽生物组学重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所深圳518124 广西大学动物科学技术学院南宁530004 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 云南农业大学动物科技学院昆明650201 天津农学院动物科学与动物医学学院天津300392

肌肉生长抑制素(Myostatin,Mstn)作为TGF-β超家族的成员,是一种调控骨骼肌生长发育的负调节因子,其失活可以促进肌肉的发育,在个体上表现为双肌臀等表型。为了探究Mstn基因敲除对肌肉细胞和组织转录组的影响,本研究利用CRISPR/Cas9技... 详细信息

肌肉生长抑制素(Myostatin,Mstn)作为TGF-β超家族的成员,是一种调控骨骼肌生长发育的负调节因子,其失活可以促进肌肉的发育,在个体上表现为双肌臀等表型。为了探究Mstn基因敲除对肌肉细胞和组织转录组的影响,本研究利用CRISPR/Cas9技术构建了3个Mstn基因敲除的C2C12细胞株,并采集了12只Mstn基因敲除小鼠(Mus musculus)(6公6母)的腓肠肌,分别进行转录组测序分析。结果显示,Mstn基因敲除C2C12细胞增殖能力显著高于野生型细胞的。在Mstn基因敲除的C2C12细胞、公鼠和母鼠中分别鉴定到329、240、265个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。Mstn基因敲除公鼠和母鼠中鉴定到50个共有DEGs,在下调表达基因中,Myh7、Lmod2、Barx2、Myh2、Myl3和Smtnl1基因显著富集到27条肌肉功能相关通路;Dgat2和Slc27a1显著富集到8条脂质代谢相关通路。Mstn基因敲除C2C12细胞和小鼠中鉴定到4个共有DEGs,其中Fam83d基因是成肌细胞增殖、分化的关键调控基因。综上所述,Mstn基因敲除既可以通过下调Myh7、Lmod2和Fam83d等基因参与肌肉发育调控,也能够通过下调Dgat2和Slc27a1基因调控脂质代谢。

关键词：小鼠(Mus musculus) C2C12细胞 Mstn基因骨骼肌脂质代谢

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基于卷积神经网络的互花米草识别研究

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中国农机化学报 2023年第4期44卷 159-166,F0002页

作者：李岩舟何艳洲覃锋钱万强吴媚乔曦广西大学机械工程学院南宁市530004 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部农业基因数据分析重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所广东深圳518120 广西壮族自治区计量检测研究院南宁市530004

互花米草的侵入对我国的生态系统多样性造成了巨大损失,如何准确地识别零散斑块的互花米草对其早期监测及预警具有重要意义。采用低空无人机遥感技术,以广西北海地区春季时期红树林中的互花米草为研究对象,利用AlexNet、VGG16、GoogleNe... 详细信息

互花米草的侵入对我国的生态系统多样性造成了巨大损失,如何准确地识别零散斑块的互花米草对其早期监测及预警具有重要意义。采用低空无人机遥感技术,以广西北海地区春季时期红树林中的互花米草为研究对象,利用AlexNet、VGG16、GoogleNet、ResNet50、EfficientNetB0五种卷积神经网络,分别对包含互花米草、红树林及其他地物背景的图像数据集进行模型的训练、验证与测试,然后将训练好的五种网络模型对整个试验区域的互花米草及地物背景进行识别并标记,得到互花米草的分布图。基于混淆矩阵和运算时间的综合定量评估结果表明,ResNet50网络模型总体上优于另外四种网络模型,识别准确率最高,达到了96.96%,且在测试集上耗时仅为5.47 s。将识别结果图与互花米草实际分布图进行对比,ResNet50网络模型的识别结果与互花米草的实际分布基本重合。

关键词：无人机遥感互花米草卷积神经网络零散斑块

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苹果蠹蛾几丁质脱乙酰基酶2的基因克隆、表达模式和分子特性

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中国农业科学 2021年第10期54卷 2105-2117页

作者：石国良武强杨念婉黄聪刘万学钱万强万方浩青岛农业大学植物医学学院中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室中国农业科学院深圳农业基因组研究所/农业农村部基因组分析实验室/广东岭南现代农业科学与技术实验室

【目的】研究苹果蠹蛾(Cydia pomonella)几丁质脱乙酰基酶2(chitin deacetylase 2,CDA2)的分子特性和表达模式,为新型杀虫剂靶标筛选提供理论依据。【方法】基于苹果蠹蛾转录组和基因组数据,通过同源比对获得苹果蠹蛾CDA2的相关信息;新... 详细信息

【目的】研究苹果蠹蛾(Cydia pomonella)几丁质脱乙酰基酶2(chitin deacetylase 2,CDA2)的分子特性和表达模式,为新型杀虫剂靶标筛选提供理论依据。【方法】基于苹果蠹蛾转录组和基因组数据,通过同源比对获得苹果蠹蛾CDA2的相关信息;新鉴定的CpCDA2a和CpCDA2b与其他昆虫中已鉴定的CDA2氨基酸序列进行多序列比对,并采用MEGA7软件邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树;通过生物信息软件预测CpCDA2a和CpCDA2b两个剪切体的蛋白功能域和三维结构并分析其差异,并通过在线软件对其分子量、等电点和亲/疏水性等蛋白理化性质及糖基化修饰位点等方面进行分析比较;采用荧光定量PCR检测CpCDA2a和CpCDA2b两个剪切体在苹果蠹蛾不同发育时期及其幼虫不同组织的表达情况,以及注射蜕皮激素后其表达量的变化趋势。【结果】获得了苹果蠹蛾CDA2的两个可变剪切体CpCDA2a和CpCDA2b的全长CDS序列及其内含子和外显子位置信息;分析发现两个剪切体的蛋白序列均具有信号肽、几丁质结合域(ChBD)、低密度脂蛋白受体域(LDLa)和几丁质脱乙酰基催化域(CDA)等功能域。多序列比对和聚类分析结果表明,不同昆虫间CDA2差异剪切类型非常类似,相同目昆虫的序列以较高的置信度聚为一支。三维结构模拟与比较发现两个剪切体的ChBD功能域在结构上存在较大差异;理化性质分析显示两个剪切体的亲/疏水性和糖基化位点也存在差异。不同发育时期表达量分析表明,CpCDA2a主要在幼虫期高表达,CpCDA2b主要在蛹的前期和中期高表达,而且在幼虫蜕皮前和蜕皮后CpCDA2a和CpCDA2b表达量均会显著上调;不同组织的表达量分析表明,CpCDA2a和CpCDA2b均在表皮中表达量最高,而CpCDA2b在头部的表达量也较高。对注射蜕皮激素后幼虫中CpCDA2a和CpCDA2b表达量分析显示,与对照相比在注射蜕皮激素后CpCDA2a的表达量在24 h和48 h均有所上调,但差异不显著,而CpCDA2b在24 h和48 h均显著上调。【结论】苹果蠹蛾CDA2的转录本存在两个可变剪切体CpCDA2a和CpCDA2b,根据对其分子特性、发育阶段和组织表达谱、以及注射蜕皮激素后表达动态等方面的综合分析,推测两者均参与苹果蠹蛾蜕皮和新表皮形成过程,但由于可变剪切的序列差异导致的蛋白结构和理化性质上的差异造成了两者在功能上的分化。

关键词：苹果蠹蛾几丁质脱乙酰基酶2 可变剪切分子特性表达模式蜕皮激素功能分化

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氢纳米气泡水的应用研究进展

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现代食品科技 2024年第10期40卷 389-397页

作者：田玉万晓宝宋可王俊豪郝海红国家兽药残留基准实验室华中农业大学湖北武汉430070 农业农村部畜禽产品质量安全风险评估实验室华中农业大学湖北武汉430070 华中农业大学深圳营养与健康研究院广东深圳518000 中国农业科学院深圳农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心广东深圳518000

氢气是一种无色、无味、难溶于水且高度易燃的双原子气体,在某些情况下可充当还原剂。大量研究表明,氢气对代谢性疾病、神经退行性疾病、缺血再灌注损伤以及肿瘤等百余种疾病均具有潜在治疗作用。但是氢气在水中不仅溶解度低而且停留时... 详细信息

氢气是一种无色、无味、难溶于水且高度易燃的双原子气体,在某些情况下可充当还原剂。大量研究表明,氢气对代谢性疾病、神经退行性疾病、缺血再灌注损伤以及肿瘤等百余种疾病均具有潜在治疗作用。但是氢气在水中不仅溶解度低而且停留时间短暂,这也是限制富氢水广泛应用的主要因素,而纳米气泡由于内部压力高、表面带负电等特点可以增加氢气在水中的溶解度及停留时间,并增强其抗氧化能力。纳米气泡技术的发展也推动了国内外学者对氢纳米气泡水的研究以及开发应用,该文主要对现有氢纳米气泡水的最新研究进展进行总结概述,以期为氢纳米气泡水今后的应用研究提供参考。

关键词：氢纳米气泡水氢气医学农业环境

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基因编辑技术在猪分子育种中的研究进展与前景展望

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中国猪业 2025年第2期20卷 35-50页

作者：李云蕾叶凯文熊明福李健刘亚星李超程孔思远张永生石河子大学动物科技学院新疆石河子832000 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部畜禽生物组学重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所广东深圳518000

作为最早被驯化的物种之一,猪的育种改良始终是生猪产业发展的核心驱动力。与生猪传统育种的周期长、性状筛选效率低等不足相比,基因编辑技术能做到精准定位目标基因位点,实现各类如生长发育、抗病能力和繁殖性状等经济性状的定向改良,... 详细信息

作为最早被驯化的物种之一,猪的育种改良始终是生猪产业发展的核心驱动力。与生猪传统育种的周期长、性状筛选效率低等不足相比,基因编辑技术能做到精准定位目标基因位点,实现各类如生长发育、抗病能力和繁殖性状等经济性状的定向改良,显著提高生猪的育种效率。此外,在当前严峻的传统育种背景下,基因编辑技术的应用还有助于解决我国生猪生产中面临的挑战。不过由于基因编辑技术的种类繁多,其原理又各不相同,有较高技术门槛;因此,本文系统梳理了当前基因编辑技术的作用原理、主要类型、应用现状,探讨与分析生物伦理安全问题及当前面临的机遇与挑战。在确保生物安全的前提下,为保障肉类安全供给,推动我国生猪种业实现跨越式发展提供一定参考。

关键词：基因编辑猪分子育种应用发展前景抗病能力繁殖性状

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CLSI、EUCAST和中国耐药判定标准概述

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生物技术通报 2022年第9期38卷 47-58页

作者：阮紫涵黄安雄王秀娟黄玲利郝海红华中农业大学国家兽药残留基准实验室武汉430070 华中农业大学农业农村部畜禽产品质量安全风险评估实验室武汉430070 华中农业大学深圳营养与健康研究院深圳518000 中国农业科学院深圳农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心深圳518000

制定耐药判定标准的意义在于对药敏试验结果进行解释,以选择合适的药物和最佳的给药方案对动物进行治疗,是控制耐药性产生的重要手段。目前许多发达国家都成立了制定耐药判定标准的机构,其中最具影响力和权威的是美国临床和实验室标准... 详细信息

制定耐药判定标准的意义在于对药敏试验结果进行解释,以选择合适的药物和最佳的给药方案对动物进行治疗,是控制耐药性产生的重要手段。目前许多发达国家都成立了制定耐药判定标准的机构,其中最具影响力和权威的是美国临床和实验室标准协会以及欧盟药敏试验标准委员会两大机构。中国耐药性监测的研究起步较晚,主要借鉴美国临床和实验室标准协会所设立的耐药判定标准。2017年,在欧洲临床微生物和感染病学会和欧洲药敏试验委员会的支持下中国成立了华人药物敏感性试验委员会。近年来,在中国兽医药品监察所的带领下,各研究机构人员在耐药判定标准及耐药性监测方面也取得了突破性的进展,为控制中国抗菌药物耐药性的发展奠定了坚实的基础。本文首先介绍了耐药判定标准的定义和意义,为微生物研究者提供基本的理解;然后分别综述美国临床和实验室标准协会与欧盟药敏试验标准委员会的基本情况,并比较两者在兽用抗菌药物耐药判定标准制定上的差异;最后对中国兽用抗菌药物耐药性监测和耐药判定标准制定方面的成果进行分析总结。总体来说,中国在兽用抗菌药物耐药性控制方面处于稳步增长状态,已经制定的许多耐药判定标准对控制耐药性的发展具有重要意义。但仍有许多兽用抗菌药物缺乏相应的耐药判定标准,需要更多的研究者在未来找到更加快速、简便和准确的方法,不断填补、更新兽用抗菌药物的耐药判定标准。

关键词：兽用抗菌药 CLSI EUCAST 折点差异

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计算机视觉与深度学习在猪只识别中的研究进展

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华中农业大学学报 2023年第3期42卷 47-56页

作者：刘峰吴文杰刘小磊王欣然方亚平李国亮杜小勇华中农业大学信息学院/农业农村部智慧养殖技术重点实验室/农业智能技术教育部工程研究中心/湖北省农业大数据工程技术研究中心武汉430070 华中农业大学深圳营养与健康研究院深圳518000 中国农业科学院深圳农业基因组研究所/岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心深圳518000 农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室武汉430070

探索人工智能领域新技术与生猪养殖相结合,是当前智慧养殖领域的一个重要研究方向。其中,如何自动地识别猪只个体身份与行为,是当前生猪养殖行业要解决的一个关键问题。为推动计算机视觉和深度学习技术在猪只健康状态智能化监测方面的应... 详细信息

探索人工智能领域新技术与生猪养殖相结合,是当前智慧养殖领域的一个重要研究方向。其中,如何自动地识别猪只个体身份与行为,是当前生猪养殖行业要解决的一个关键问题。为推动计算机视觉和深度学习技术在猪只健康状态智能化监测方面的应用,本文先分析了基于计算机视觉与深度神经网络的人的身份及行为识别模型的研究进展,然后对利用计算机视觉与深度神经网络识别猪只个体身份及行为的方法进行了归纳总结,并指出已有方法中存在的问题,最后提出了下一步的重点研究方向:(1)在猪只运动不可控及关键特征部位受到污染的情况下,准确提取其身份及行为特征的方法研究;(2)针对猪只身份及行为特征的基于计算机视觉的原创性深度学习模型的研究;(3)能够同时检测猪只身份及行为的多任务神经网络的研究;(4)适用于多场景的基于基础姿态及动作的通用型猪只行为识别方法的研究;(5)基于边缘计算的猪只个体身份及行为识别的部署方法研究。

关键词：身份识别行为识别深度学习计算机视觉智慧养殖猪脸识别自动监测

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基于酶介导双重指数扩增技术(EmDEA)的小火蚁快速检测方法的开发

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环境昆虫学报 2024年第5期46卷 1059-1067页

作者：韩蕊滕祎李献锋王临静魏霜张雍哲乔曦刘海军吴尧马骏万方浩刘聪辉钱万强青岛农业大学植物医学学院山东省环境友好型农业有害生物防治工程技术研究中心山东省生物入侵与生态安全高校特色实验室中澳农业与环境健康联合研究院山东青岛266109 岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心农业农村部农业基因数据分析重点实验室中国农业科学院(深圳)农业基因组研究所广东深圳518120 广州海关技术中心广州510623 苏州晶睿科技有限公司江苏苏州215000

小火蚁Wasmannia auropunctata是危害性最严重的入侵蚂蚁之一,对动植物、生态、经济甚至是人类都容易造成严重影响,是我国的重大检疫害虫之一。本研究为实现小火蚁的现场快速精准检测,通过自研程序筛选出小火蚁全基因组中的特异性片段,... 详细信息

小火蚁Wasmannia auropunctata是危害性最严重的入侵蚂蚁之一,对动植物、生态、经济甚至是人类都容易造成严重影响,是我国的重大检疫害虫之一。本研究为实现小火蚁的现场快速精准检测,通过自研程序筛选出小火蚁全基因组中的特异性片段,具有更高的特异性,基于酶介导双重指数扩增技术(EmDEA)筛选了适用的引物、RNA探针,全部反应所需时间小于20 min,并验证了其特异性和灵敏度。结果显示这种方法可在短时间内达到极高检测灵敏度与特异性,最低检出限约为4 ng。这种方法极大程度降低对设备的依赖,简单、快速、特异,为小火蚁的基层检测与现场诊断提供技术支持。

关键词：小火蚁酶介导双重指数扩增技术(EmDEA) 特异性引物 RNA探针快速鉴定精准检测

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利用双向导入系解析再生稻蒸煮食味品质的遗传基础

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分子植物育种 2023年第5期21卷 1624-1632页

作者：胡慧高若愚何丽萍田雨李志新徐俊英杨隆维邱先进刘章勇徐建龙长江大学农学院农业农村部长江中游作物绿色高效生产重点实验室(部省共建)荆州434025 湖北省宜昌市农科院宜昌443004 中国农业科学院作物科学研究所北京100081 中国农业科学院深圳农业基因组研究所岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心深圳518210 海南省崖州湾种子实验室三亚572024

为解析再生稻蒸煮食味品质的遗传基础,本研究连续两年考察了以籼稻(Indica)‘明恢63’和粳稻(Japonica)‘02428’构建的双向导入系的头季和再生季的蒸煮食味品质。结果表明‘,明恢63’的头季直链淀粉含量(amylose content in the first ... 详细信息

为解析再生稻蒸煮食味品质的遗传基础,本研究连续两年考察了以籼稻(Indica)‘明恢63’和粳稻(Japonica)‘02428’构建的双向导入系的头季和再生季的蒸煮食味品质。结果表明‘,明恢63’的头季直链淀粉含量(amylose content in the first season,FAC)和头季碱消值(alkali spread value in the first season,FASV)与‘02428’有显著差异,其再生季胶稠度(gel consistency in the ratoon season,RGC)与再生季碱消值(alkali spread value in the ratoon season,RASV)与‘02428’有显著差异,最终‘明恢63’的直链淀粉含量变化率(amylose content ratio,ACR)和碱消值变化率(alkali spread value ratio,ASVR)与‘02428’有显著差异。双向导入系的所有性状均表现为连续分布,同一性状在两季间表现出显著正相关。结合双向导入系高密度基因型数据,共定位到30个影响再生稻蒸煮食味品质的数量性状位点(quantitative trait locus,QTL),其中7个QTL在两年间稳定表达,1个QTL在头季和再生季被重复鉴定到,5个QTL在两个遗传背景下稳定表达。最后,利用分离群体验证了第11号染色体6.19~6.97 Mb的真实性。本研究结果为分子育种改良再生稻的蒸煮食味品质提供了基因资源。

关键词：再生稻蒸煮食味品质双向导入系数量性状位点

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种猪采食行为与生长性状关联分析与实现

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华中农业大学学报 2022年第4期41卷 240-247页

作者：王婷婷黎煊赵书红雷明刚刘望宏刘诗尧农业农村部智慧养殖技术重点实验室武汉430070 农业农村部种猪质量监督检验测试中心(武汉) 武汉430070 华中农业大学深圳营养与健康研究院/中国农业科学院深圳农业基因组研究所/岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心深圳518000

为便于开展种猪采食性状研究及满足测定设备智能化发展需求,设计了一套基于物联网技术和Web技术的种猪性能测定信息管理系统。系统选取CAN总线进行数据双向传输,采用B/S(Browser/Server)前后端分离架构,前端基于Reactjs技术栈,后端采用f... 详细信息

为便于开展种猪采食性状研究及满足测定设备智能化发展需求,设计了一套基于物联网技术和Web技术的种猪性能测定信息管理系统。系统选取CAN总线进行数据双向传输,采用B/S(Browser/Server)前后端分离架构,前端基于Reactjs技术栈,后端采用flaskweb框架和MySQL数据库进行系统开发;2次测试结果表明,系统数据传输可靠性高,各功能模块满足预期设计要求,满足种猪性能测定实际使用需求;以杜洛克种猪为研究对象,分析采食性状与生长性状间的表型相关,并构建种猪达100 kg体质量日龄偏最小二乘回归(partial leastsquare,PLS)预测模型,交叉验证结果显示PLS测试集平均决定系数为0.68,平均MAE为3.2 d,使用试验数据对PLS模型进行测试,测试结果表明可以将采食性状与生长性状结合对种猪生长速度进行预测。

关键词：种猪信息管理采食行为生长性能智能化设备精确育种

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