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经济动物学报 2015年第1期19卷 55-59+62页

作者：宋兴超张海华徐超王雷丛波刘琳玲杨福合中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室

水貂毛色表型主要由存在于染色体上的遗传基因决定,探究调控水貂毛色相关基因的突变特性,对丰富水貂毛色遗传学研究的分子机制具有重要理论意义。与其它哺乳动物一样,水貂毛色类型也主要与皮肤中的黑色素种类、数量、合成及分布比例相关... 详细信息

水貂毛色表型主要由存在于染色体上的遗传基因决定,探究调控水貂毛色相关基因的突变特性,对丰富水貂毛色遗传学研究的分子机制具有重要理论意义。与其它哺乳动物一样,水貂毛色类型也主要与皮肤中的黑色素种类、数量、合成及分布比例相关,许多基因对黑色素的产生和分布起主要调控作用,这些基因主要包括MLPH、TYR和MC1R,另外,Agouti基因在水貂毛色形成过程中也具有重要作用。文中综述了水貂染色体、我国家养水貂主要毛色遗传基因型与毛色类型及目前毛色分子遗传调控机制的研究进展,进一步提出了从细胞学、分子标记水平解析水貂毛色遗传规律的研究思路,为今后彩色水貂育种工作提供重要理论依据。

关键词：水貂毛色遗传基因型调控机制分子标记

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温度对毛皮动物生产性能的影响

温度对毛皮动物生产性能的影响

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2015中国遗传学会大会

作者：陈明帅徐超宋兴超杨颖李志鹏王凯英邢秀梅赵家平中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室

环境温度直接影响动物体温调节和病原微生物生长,进而影响动物健康状况、生产性能和生长速度。我国是毛皮动物饲养大国,地域广阔、纬度横跨范围广,不同地区温度差异大,造成所产毛皮动物毛皮质量差异较大,不同野生毛皮动物均有各自适宜... 详细信息

环境温度直接影响动物体温调节和病原微生物生长,进而影响动物健康状况、生产性能和生长速度。我国是毛皮动物饲养大国,地域广阔、纬度横跨范围广,不同地区温度差异大,造成所产毛皮动物毛皮质量差异较大,不同野生毛皮动物均有各自适宜生长的地理环境纬度,有的种类分布较广,如貉、黄鼬等,有的有着明显的地理限制,如紫貂分布在北纬40度以北、水貂分布在北纬30度以北。毛皮质量决定着毛皮动物经济价值大小,同一物种在不同纬度由于温度和光照不同,其毛皮品质也不相同,价格存在差别。如东北地区生产的貉皮、水貂皮,毛足绒厚,针绒毛密度大;往南则针绒毛密度降低,导致东北皮的价格高于河北皮和山东皮。同一地区不同生长环境下也会造成毛皮质量有差异,如哈尔滨江北林区黄鼬毛皮的保温性能比平原区的效果要好,原因在于林区进入冬季时间早,持续时间长,需要更保暖的毛被来维持动物生理活动。毛皮动物由于具有丰厚的皮毛,对低温的承受能力较强,耐低温不耐高温。在炎热环境中,散热困难,引起体温升高和采食量下降。为适应环境,毛皮动物脱冬毛换夏毛,皮板变薄、针绒毛密度减少,毛皮品质下降。夏季,大部分母兽刚经历生产期,母兽体况损失大,处在体质恢复期,需要大量营养补充体能;仔畜则刚断奶,分窝应激较大,幼兽生长期也需要较多的营养物质。夏季温度较高,微生物活动频繁,饲料易腐败变质,饲料营养损失增加,为避免营养损失导致饲料保存成本上升;温度较高病原体也生长迅速,苍蝇蚊子和脱落毛发四散,促进疾病传播;氨气等有害气体浓度升高易导致呼吸道损伤,温度过高还容易导致中暑,导致高温时疾病发生率和死亡率升高,所以夏季防暑,是毛皮动物饲养的重要环节。与高温相比,低温对毛皮动物的负面影响较小,除造成自动饮水困难和保持体温消耗热量较多外,低温能刺激毛囊发育,增加皮张毛密度和品质,还对饲料保存、抑制病原微生物活动具有较好作用。同时较低温度能起到自然选择作用,协助淘汰病弱动物(如阿留申貂),保证种兽质量。综合考虑低温对毛皮动物利大于弊,许多大型养殖场纷纷在黑龙江建厂以利用当地丰富冷资源。繁殖力对毛皮动物的饲养有着至关重要的作用,毛皮动物繁殖季节大多在冬末春初气温由冷变暖时,前期适当温差刺激有利于动物发情配种,后期较温暖气候有利于仔兽成活。繁殖季节气温变化异常易造成动物发情紊乱、降低产仔成活率。同时温度对不同生态物种繁殖力影响较大,一般高纬度地区分布的毛皮动物,在低纬度地区饲养往往失去繁殖能力,如水貂在北纬30度以南饲养;低纬度地区分布的毛皮动物,在高纬度地区饲养,往往也因气温条件不适宜而造成繁殖能力降低或因冬季低温造成越冬困难,如海狸鼠、麝鼠等。常年发情动物高温能导致产仔数明显下降,如长毛兔,獭兔等。因此在毛皮动物养殖管理过程中,生产者应针对生产需要采取适宜措施,合理利用冷暖资源,建造符合其最适生存的模拟环境,减少损失提高经济效益。

关键词：温度毛皮动物毛皮质量繁殖力

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乌苏里貉agouti基因鉴定及分子结构特征分析

乌苏里貉agouti基因鉴定及分子结构特征分析

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2015中国遗传学会大会

作者：张浩徐超宋兴超王凯英张林波邢秀梅赵家平中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室吉林农业大学

为探明乌苏里貉agouti基因序列结构特征及其毛色分化的调控机制。我们提取乌苏里貉皮肤组织基因进行扩增,获得了乌苏里貉gaouti基因完整的开放性阅读框,并对该序列通过blast在线比对及生物信息学的预测和分析。结果表明,所获得的乌苏里... 详细信息

为探明乌苏里貉agouti基因序列结构特征及其毛色分化的调控机制。我们提取乌苏里貉皮肤组织基因进行扩增,获得了乌苏里貉gaouti基因完整的开放性阅读框,并对该序列通过blast在线比对及生物信息学的预测和分析。结果表明,所获得的乌苏里貉agouti基因序列的长度为396bp,与赤狐和家犬agouti基因相似度分别为98%、97%,利用Bioedit软件对该序列进行初步分析,该序列编码区碱基组成表现为C>A>G>T,其中G+C百分含量为56.6%,多于A+T百分含量。由CDS推导共编码131个氨基酸,利用ProtParam程序预测MC1R蛋白理论分子质量为14.41Ku,等电点(PI)为9.68,不稳定系数为73.51,脂肪系数为72.29,总平均亲水性系数为-0.35,表明该蛋白为亲水性蛋白。利用POSORTⅡ在线服务器和Softberry网站分析发现乌苏里貉MC1R基因编码的蛋白不存在典型的跨膜结构区,定位于细胞质膜外。蛋白质的信号肽分析结果显示有一个长达21个氨基酸的信号肽,信号肽的剪切部位在20-21。用磷酸化位点在线预测软件NetPhos2.0发现agouti有10个潜在的Ser磷酸化位点,1个Thr磷酸化位点。利用MegA5.0程序对乌苏里貉、赤狐、家犬、猪牛、羊和马的agouti基因编码区序列分子进化分析,分别采用邻近法(NJ)、最小进化法(ME)和非对组算数平均法(UPGMA)3种方法构建进化树结果基本相同,乌苏里貉与赤狐、家犬遗传距离最近,这与传统的动物分类学一致。对乌苏里貉agouti基因编码区序列的获得及分子结构特征的分析,为揭示貉毛色多样性的分子遗传学机制奠定了基础。

关键词：貉 agouti 生物信息学

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基因芯片技术在肺结核药物研究与诊断中的应用

基因芯片技术在肺结核药物研究与诊断中的应用

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2015中国遗传学会大会

作者：张浩徐超杜站宇赵静邢秀梅赵家平张林波吉林农业大学中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室昌黎县畜牧局

肺结核是由结核分枝杆菌引发的肺部感染性疾病,全世界每年约有300万人死于结核病,我国是世界上结核疫情最严重的国家之一。基因芯片技术基于核酸杂交理论,将探针分子固定于支持物上,后与标记样品分子进行杂交反应,通过检测每个探针分子... 详细信息

肺结核是由结核分枝杆菌引发的肺部感染性疾病,全世界每年约有300万人死于结核病,我国是世界上结核疫情最严重的国家之一。基因芯片技术基于核酸杂交理论,将探针分子固定于支持物上,后与标记样品分子进行杂交反应,通过检测每个探针分子的信号强度技术进而获取样品分子的数量和序列信息。随着芯片合成技术、生物信息学和高通量测序技术的发展,基因芯片技术也在向全基因组表达图谱分析的行列迈进。例2013年Venkataraman等人利用新的原位合成寡聚核苷酸芯片的方法,分析结核分枝杆菌基因组,是目前为止最全面的结核基因组信息,其中包括一些未明确功能的基因。基因芯片技术在肺结核药物研究的应用,主要包括药物作用机制的筛查、药物的筛选,以及在抗结核药物毒理学研究的三个方面。对于结核分枝杆菌来说,传统的:PCR等技术仅能对单个或少数几个选定基因进行研究。而基因芯片技术可对全基因组范围内进行序列测定和表达水平分析,辅助生物信息学与药物化学信息,继而从蛋白质、核酸等生物大分子寻找适合的药物作用靶点,适宜的作用靶点同时是筛选药物和合成药物的起点。在抗结核药物毒理学的研究上,芯片技术将药物毒性与基因表达特征相联系,因此可通过基因表达特征来分析药物潜在毒性,来代替传统的啮齿类动物实验。基因芯片技术在结核诊断的功能有两个:一是作为结核分子诊断的一个有效途径,通过检测病原微生物的遗传物质,分析基因的表达和功能,达到诊断和分型的目的,相比于传统痰检和分离培养的方法更为准确;二是代替传统方法,加快了筛选结核相关基因的速度。肺结核的发生和发展是一个多阶段复杂的过程,是许多结核相关基因共同作用的结果,要想完全了解它的发病机理和侵染过程,需要研究的不是一个或几个基因,而是整个基因组从起始到发病的上千个基因的动态变化。将基因芯片技术运用到涉及多基因改变的肺结核研究中,可以更全面地了解结核病的发生发展机制,抗肺结核药物作用机制筛查、抗结核药物筛选、抗结核药物毒理学研究、药物基因组学、肺结核诊断、寻找结核相关基因等各个抗结核热点领域提供理论依据和技术支持。

关键词：基因芯片肺结核分子诊断

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眼白化病I型遗传基因研究进展

眼白化病I型遗传基因研究进展

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2015中国遗传学会大会

作者：杜站宇徐超赵静宋兴超刘晗璐张林波邢秀梅赵家平中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室吉林农业大学昌黎县畜牧局

人类的眼白化病Ⅰ型基因(ocular albinismtype 1,Oa1,GPR143)突变导致白化病X-连锁症状,患者的皮肤显示正常,但存在眼白化缺陷,比如虹膜半透明、畏光、眼发育不全以及眼球震颤等。小鼠眼白化病模型(抑制Oa1基因的表达)再现了人类的眼白... 详细信息

人类的眼白化病Ⅰ型基因(ocular albinismtype 1,Oa1,GPR143)突变导致白化病X-连锁症状,患者的皮肤显示正常,但存在眼白化缺陷,比如虹膜半透明、畏光、眼发育不全以及眼球震颤等。小鼠眼白化病模型(抑制Oa1基因的表达)再现了人类的眼白化病。Oa1基因表达的蛋白OA1主要存在于成熟黑素小体的膜和前黑素小体的内吞溶酶体,是非典型的G-蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptor,GPCR),与其他GPCRs不同,它主要是连接细胞内溶酶体和黑素小体,N-末端位于细胞腔内朝向细胞器,C-末端朝向细胞质。对人皮肤黑素细胞进行免疫沉淀反应后显示OA1是带有Gαi亚基的异源三聚体(Gαi1,Gαi2,Gαi3),在黑素小体发育的第Ⅱ阶段OA1会激活Gα3,Gα3的作用是阻止膜泡转运进入黑素小体,在黑素小体发育的第Ⅲ、Ⅳ阶段Oa1蛋白水平较低,敲除小鼠Oa1基因或者抑制Gαi3亚型蛋白表达都显示了RPE黑素小体宏大现象。有研究指出,黑素小体宏大表现为较正常黑素小体体积大,呈球状体,且黑素小体腔内纤维条纹减少,色素沉积密集。推测正是由于Oa1基因突变或Gαi3亚型蛋白未被激活,膜泡在黑素小体的第Ⅲ、Ⅳ阶段不断的转运到黑素小体,才导致黑素小体宏大。另有研究指出Oa1基因突变后,导致黑素小体表型上的畸形,并伴随黑素小体腔内纤维减少的原因是由于Pmel17的表达减少,Pmel17(pre-melanosomal protein 17,Pmel17)是构成黑素小体腔内纤维结构的关键蛋白,纤维结构作为色素沉积场所。OA1参与了α-MSH-Mitf的信号级联反应,α-MSH激活并维持小眼相关转录因子(Microphthalmia-Associtated Transcription Factor,Mitf)的高表达,在Oa1基因表达缺失后,α-MSH将不能长时间维持MITF的高表达,而Pmel17的表达对MITF的表达有依赖作用,Pmel17的表达减少使形成黑素小体的结构纤维减少,在一定程度上影响了黑素小体结构和色素沉积。Oa1基因突变导致人类眼白化病症的研究已有报道,但在哺乳动物中的研究并不多见,在马科和犬科动物中的眼白化病症是否是由于Oa1基因突变所导致还没有相关报道,对Oa1基因的研究有助于进一步解开不同物种中的白化病机理。

关键词：眼白化基因 Oa1 黑素小体黑素小体宏大

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黑貉育种核心群建立及皮肤转录组研究

黑貉育种核心群建立及皮肤转录组研究

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2015中国遗传学会大会

作者：徐超宋兴超赵静杜站宇鲍坤王全凯邢秀梅赵家平中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室昌黎县畜牧局吉林农业大学

貉(Raccoon dog,Nyctereutes procyonoides)是食肉目、犬科、貉属、貉种的一种珍贵的大毛细皮毛皮动物,主要分布于中国、独联体各国、芬兰、朝鲜、蒙古、日本等国家。中国各省区均有分布,在毛皮动物养殖中以长江为界分为北貉和南貉,北... 详细信息

貉(Raccoon dog,Nyctereutes procyonoides)是食肉目、犬科、貉属、貉种的一种珍贵的大毛细皮毛皮动物,主要分布于中国、独联体各国、芬兰、朝鲜、蒙古、日本等国家。中国各省区均有分布,在毛皮动物养殖中以长江为界分为北貉和南貉,北貉体型大毛绒丰厚,经训化后已成为养殖的主要品种,养殖中常称为乌苏里貉(实际包括部分朝鲜貉和阿穆尔貉等)。貉野生型色型为青褐色,20世纪八九十年代,中国农业科学院特产研究所利用乌苏里貉白色突变培育成功了我国现有的白貉品种——吉林白貉。到目前为止,貉养殖产业中仅有两个品种(培育品种-吉林白貉,地方品种-乌苏里貉)。2008年乌苏里貉中又有一新的有经济价值突变——纯黑色突变,是继吉林白貉后又一个有可能培育成功的彩貉新品种。我们利用黑色突变体以常规育种技术为主要手段以分子育种技术为补充开展了黑貉的品种选育,首先利用纯黑色突变个体为素材与优质乌苏里貉杂交获得稳定的黑貉遗传基础群,进一步以黑色性状为首选目标对被毛颜色不纯、精选时体重低于5500g、5月10日后出生、窝活仔数小于3个的进行严格淘汰,精选优秀个体以1年为一个世代组成育种核心群进行闭锁繁育。毛色性状是貉重要的经济性状。为了确定参加黑貉毛色绒调节的基因,采用Illumina Hiseq2000测序平台对乌苏里貉和黑貉的皮肤进行了全基因表达谱研究,总计产出14,184,916,200nt数据,将所得到的乌苏里貉和黑貉的皮肤Unigenes进行了差异表达分析,并对照GO数据库进行了分类整理。发现黑貉相对乌苏里貉有31个基因表达显著上调,51个基因显著下调,并对这些差异基因进行KEGG通路注释,发现它们参与了包括黑色素生物合成、黑色素瘤、MAPK信号通路、Wnt信号通路等多种色素沉积相关通路。貉子皮肤转录谱的获取可以为未来深入研究貉控制毛色基因表达网络提供基础。通过黑貉育种核心群的建立和皮肤转录谱的研究,为培育具有中国特色的黑貉新品种奠定基础,将有助于我国裘皮业可持续发展。

关键词：黑貉彩貉育种核心群皮肤转录组

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眼白化病Ⅰ型遗传基因研究进展

眼白化病Ⅰ型遗传基因研究进展

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2015中国遗传学会大会

作者：杜站宇徐超赵静宋兴超刘晗璐张林波邢秀梅赵家平中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室长春130112 吉林农业大学长春130118 中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室长春130112 昌黎县畜牧局秦皇岛066600 吉林农业大学长春130118

人类的眼白化病Ⅰ型基因(ocular albinism type 1,Oa1,GPR143)突变导致白化病X-连锁症状,患者的皮肤显示正常,但存在眼白化缺陷,比如虹膜半透明、畏光、眼发育不全以及眼球震颤等.小鼠眼白化病模型(抑制Oa1基因的表达)再现了人类的眼白... 详细信息

人类的眼白化病Ⅰ型基因(ocular albinism type 1,Oa1,GPR143)突变导致白化病X-连锁症状,患者的皮肤显示正常,但存在眼白化缺陷,比如虹膜半透明、畏光、眼发育不全以及眼球震颤等.小鼠眼白化病模型(抑制Oa1基因的表达)再现了人类的眼白化病.Oa1基因表达的蛋白OA1主要存在于成熟黑素小体的膜和前黑素小体的内吞溶酶体,是非典型的G-蛋白偶联受体(G-protein-coupled receptor, GPCR),与其他GPCRs不同,它主要是连接细胞内溶酶体和黑素小体,N-末端位于细胞腔内朝向细胞器,C-末端朝向细胞质.

关键词：眼白化基因 Oa1 黑素小体黑素小体宏大

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4种犬科动物黑素皮质激素受体1基因序列比对及遗传进化分析

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中国畜牧兽医 2014年第1期41卷 25-29页

作者：徐超宋兴超岳志刚李光玉赵蒙赵伟刚魏海军赵家平中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室吉林长春130112

基于GenBank中已公布的家犬(Canis familiaris)、赤狐(Vulpes vulpes)、北极狐(Alopex lagopus)和貉(Nyctereutes procyonoides)黑素皮质激素受体1(MC1R)基因序列,利用BioEdit 7.0等生物信息软件,对4种犬科动物MC1R基因进行序列比对和遗传进化分析。结果表明,家犬、赤狐、北极狐及貉MC1R基因为单一外显子,编码区序列长度均为954bp,碱基组成表现为C>G>T>A,且G+C百分含量高于A+T;编码区碱基序列中共检测到20个突变位点,包括16个单一突变和4个简约突变,转换类型多于颠换,核苷酸和氨基酸序列同源性较高;赤狐与北极狐间的遗传距离最短,邻近法(NJ)、最小进化法(ME)和非对组算数平均法(UPGMA)3种方法构建的进化树基本一致,赤狐与北极狐首先聚为一簇,貉比家犬、赤狐和北极狐分化时间更早。

关键词：犬科动物黑素皮质激素受体1 序列比对遗传进化

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赤狐黑色素皮质激素受体-1基因结构特征预测及分子进化分析

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中国畜牧兽医 2013年第1期40卷 9-13页

作者：宋兴超杨福合巴恒星徐超鲍坤邢秀梅魏海军中国农业科学院特产研究所农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学国家重点实验室吉林长春130112

为进一步分析黑色素皮质激素受体-1(melanocortin-1 receptor,MC1R)基因的分子特性,利用生物信息学方法对Gen-Bank中已报道的赤狐MC1R基因完整编码区序列的碱基组成特点及其编码蛋白的结构特征进行了预测及分析,构建了12个物种MC1R蛋白... 详细信息

为进一步分析黑色素皮质激素受体-1(melanocortin-1 receptor,MC1R)基因的分子特性,利用生物信息学方法对Gen-Bank中已报道的赤狐MC1R基因完整编码区序列的碱基组成特点及其编码蛋白的结构特征进行了预测及分析,构建了12个物种MC1R蛋白的系统进化树。结果表明,赤狐MC1R基因编码区序列长度为954bp,共编码317个氨基酸,为单一外显子,G+C含量高于A+T,编码的蛋白质是一种分子质量为34.8694ku,等电点为9.13的亲水性稳定碱性蛋白;存在7个强跨膜区、7个广泛磷酸化位点和1个潜在的蛋白激酶C磷酸化位点(第157位的苏氨酸),α-螺旋为其主要二级结构元件;属于G蛋白偶联受体家族一员,包括多个潜在重要功能基序;同源性分析与分子进化树结果均表明,赤狐与北极狐、狗和貉的亲缘关系最近。

关键词：赤狐黑色素皮质激素受体-1基因结构特征生物信息学

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梅花鹿鹿茸双向电泳蛋白提取条件筛选

梅花鹿鹿茸双向电泳蛋白提取条件筛选

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聚焦品牌、建立诚信、推广产业模式、提升产品价值——第四届（2013）中国鹿业发展大会

作者：刘华淼邢秀梅杨福合中国农业科学院特产研究所吉林省特种经济动物分子生物学国家重点实验室农业部特种经济动物遗传育种与繁殖重点实验室吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室

根据鹿茸组织血液含量较高、骨化较为严重的特点,设计了三种适合双向电泳的鹿茸提取方法。筛选出2D-cleanup纯化为梅花鹿鹿茸双向电泳的最佳提取方法。

关键词：鹿茸蛋白质组蛋白提取

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