天然药物的主要来源包括植物、动物和微生物等生物物种。这些物种的准确鉴定是天然药物研发的基础。本文提出一种全新的物种鉴定方法:时珍法(analysis of whole-genome,AGE),即从物种全基因组寻找特异靶标序列,精准识别特异靶标序列,实...
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天然药物的主要来源包括植物、动物和微生物等生物物种。这些物种的准确鉴定是天然药物研发的基础。本文提出一种全新的物种鉴定方法:时珍法(analysis of whole-genome,AGE),即从物种全基因组寻找特异靶标序列,精准识别特异靶标序列,实现物种准确鉴定的分子诊断方法。笔者详细阐述了时珍法利用不同物种基因组序列必然存在差异的原理实施物种鉴定,提出该方法的实施策略可分为研究和应用两个层面,分析其特点评判该方法具有原理可靠、特异性强、适用性广等优势,进一步论述了在体系构建过程涉及的基因组获取、生物信息分析、数据库构建等三个关键问题。综上所述,本文为生物信息软件和商品试剂盒的后续开发提供理论基础和方法指导,表明时珍法在不同对象、不同学科、不同行业等方面具有巨大应用潜力。
“龙血竭”是龙血树属(Dracaena)植物树干产生的红色树脂,被称为“云南红药”。国药批准的国产“龙血竭”基原植物为天门冬科的柬埔寨龙血树(*** ex Gagnep.)和剑叶龙血树(***(Lour.)***)。由于文献对两种龙血树的界定不清,在其名称上...
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“龙血竭”是龙血树属(Dracaena)植物树干产生的红色树脂,被称为“云南红药”。国药批准的国产“龙血竭”基原植物为天门冬科的柬埔寨龙血树(*** ex Gagnep.)和剑叶龙血树(***(Lour.)***)。由于文献对两种龙血树的界定不清,在其名称上存在混淆使用。本研究对两种龙血树及其混淆种进行原始文献和模式标本考证,并利用龙血树属19种33个质体基因组数据开展系统发育重建。结果显示,19种龙血树可分成3个分支,其中,产龙血竭的物种位于分支Ⅰ和分支Ⅲ,柬埔寨龙血树样品分成两个独立的分支,即海南分支和云南分支。基于原始文献和模式标本考证,确认剑叶龙血树的形态与长花龙血树(***(Medik.)Roxb.)基本一致,可能是长花龙血树的一个新异名。本文结合龙血树质体基因组的系统发育和形态证据,明确了柬埔寨龙血树是蔡希陶等最早发现的国产龙血竭的基原植物,并确认岩棕(*** Regel)和广西龙血树(未知种2)也是国产龙血竭的资源植物。
本试验基于液相色谱-四极杆线性离子阱质谱的广泛靶向代谢组学方法,结合聚类分析和正交偏最小二乘判别分析等方法,比较分析姜黄(Curcuma longa L.)三个品种的姜黄素类代谢物的变化。结果所有样品共检出46个姜黄素类化合物,其中高含姜黄(...
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本试验基于液相色谱-四极杆线性离子阱质谱的广泛靶向代谢组学方法,结合聚类分析和正交偏最小二乘判别分析等方法,比较分析姜黄(Curcuma longa L.)三个品种的姜黄素类代谢物的变化。结果所有样品共检出46个姜黄素类化合物,其中高含姜黄(GJH)和川姜黄(CJH)均检出46个姜黄素类代谢物,而云姜黄(YJH)检出36个。通过组间峰面积分析发现,共有41个代谢物包括指标性成分姜黄素和代表性成分去甲氧基姜黄素、双去氧基姜黄素、二氢姜黄素及四氢姜黄素的相对含量均从高到低依次为:高含姜黄、川姜黄、云姜黄。通过层次聚类和自组织映射聚类分析发现,高含姜黄与川姜黄样品可以聚为一类与云姜黄区别分开,提示高含姜黄与川姜黄质量相似而与云姜黄差异较大。结果表明,高含姜黄的代表性姜黄素类代谢物的含量高于川姜黄和云姜黄,且与川姜黄的姜黄素类代谢物组成相似,是除川姜黄外的又一高质量姜黄新品系,可为姜黄药材提供新的来源。
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