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2017年第十五届中国北方实验动物科技年会

作者：罕园园徐昕陆彩霞匡德宣仝品芬王文广孙晓梅李娜代解杰中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心云南省科学技术院云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南大学第一医院云南省第二人民医院暨云南省红十字会医院

建立树鼩骨骼系统的三维可视化模型,为树鼩的骨骼系统疾病诊断提供依据。使用日本东芝Aquillon one320排螺旋CT进行扫描,100KV,80mA,球管转数0.35s/转,螺距1.35,图像为0.5mm,层间隔为0.5mm,使用骨算法重建。在并行计算环境中采用Vitrea... 详细信息

建立树鼩骨骼系统的三维可视化模型,为树鼩的骨骼系统疾病诊断提供依据。使用日本东芝Aquillon one320排螺旋CT进行扫描,100KV,80mA,球管转数0.35s/转,螺距1.35,图像为0.5mm,层间隔为0.5mm,使用骨算法重建。在并行计算环境中采用Vitrea软件包,选择Musculoskeletal CT选项,采用容积成像(VR)、多平面成像(MPR)、曲面成像(CPR)技术进行三维重建。结果重建后的可视化模型结构明显、清楚,可以真实地在计算机中重现出树鼩的骨骼系统三维模型。在此模型中,在头骨背面可见五条隆起的嵴,侧面观可见四个大孔:位于前端的外鼻孔、前颌骨后上方的眶下孔、由颧弓所范围着的眼窝和鼓泡外侧的外耳道。此外,可见一些较小的头骨孔,如视神经孔、颌下神经孔。利用该成像技术可定量测定各主要骨骼的长度、前后径、左右径和身长、尾长等数据。尤其是还获得了以往通过解剖难以测量准确的数据:如腭长、臼齿列长等较细微的数据,以及解剖不易获得脊椎前后径及左右径的数据。同时还利用三维可视化技术发现了树鼩存在有骨盆形态不对称、胸廓增大、骨折、跟腱周围滑膜囊钙化的骨骼异常情况。所建立的CT三维可视化技术可确定树鼩骨骼系统的特殊特征,对树鼩骨骼系统无侵入性的生态分类、鉴定、进化分析均有重要意义。

关键词：树鼩 CT三维重建骨骼系统

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ERAP1基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关联研究

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中华临床医师杂志（电子版） 2013年第22期7卷 41-43页

作者：曹丹凤马千里周竞贤钱旭李盈甫俞建昆姚宇峰史荔中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118 昆明医科大学第三附属医院胸外科昆明市延安医院心血管外科昆明医科大学第一附属医院干疗科

目的探讨内质网氨肽酶1(endoplasmic reticulum aminopeptidase 1,ERAP1)基因多态性与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的相关性。方法入选NSCLC患者224例,健康体检人群207例。采用Taq Man探针基因分型方法对ERAP1基因SNP rs26653和rs26618两个位点进行基因分型,并构建单倍型,评估上述两个SNPs及单倍型与NSCLC的相关性。结果病例组和对照组ERAP1基因rs26618和rs26653基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05)。病例组和对照组rs26618/rs26653单倍型CG、TC的单倍型频率差异有统计学意义(P<0.05)。结论 ERAP1基因与NSCLC的发生有关,rs26618/rs26653-CG单倍型可能增加NSCLC的患病风险,rs26618/rs26653-TC单倍型对NSCLC可能具有保护性作用。

关键词：癌,非小细胞肺内质网氨肽酶类多态性,单核苷酸单倍性

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树鼩IL-2基因序列的克隆及分子特征分析

树鼩IL-2基因序列的克隆及分子特征分析

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首届昆明灵长类动物模型学术论坛

作者：黄晓燕代解杰李明利徐娟高跃东王文广殷安国李晓飞孙晓梅中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 中国科学院昆明动物研究所动物模型与人类疾病机理重点实验室免疫生物学实验室云南昆明650223 中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心云南昆明650223 中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重点实验室云南昆明650223 中

树鼩作为人类疾病良好模型己受到广泛关注,但对其白细胞介素一2方面的研究尚属空白.本实验以培养的树鼩淋巴细胞总RNA为材料,通过RT-PCR技术克隆出长度约为465bp的树鼩IL-2完整开放阅读框(ORF),并通过Clustal W等软件对其序列和分子特... 详细信息

树鼩作为人类疾病良好模型己受到广泛关注,但对其白细胞介素一2方面的研究尚属空白.本实验以培养的树鼩淋巴细胞总RNA为材料,通过RT-PCR技术克隆出长度约为465bp的树鼩IL-2完整开放阅读框(ORF),并通过Clustal W等软件对其序列和分子特征进行了分析,发现树鼩IL-2 cDNA编码一个由154个氨基酸组成的蛋白质,采用MEGA5.0构建进化树发现,树鼩与人、恒河猴亲缘关系较近.

关键词： Tree shrews Interleukin 2 Cloning Structure Function

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脂联素基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关联

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昆明医科大学学报 2014年第9期35卷 52-55页

作者：李盈甫钱旭周竞贤陈楠虎月燕马千里昆明医科大学第一附属医院干疗科云南昆明650032 昆明市延安医院心血管外科云南昆明650051 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 昆明医科大学第三附属医院心胸外科云南昆明650106

目的探讨脂联素(adiponectin,Acrp30,ADIPO)基因启动子区域多态性与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的相关性.方法采用Taq Man探针基因分型方法对NSCLC患者(n=179)与健康体检人群(n=242)进行ADIPO基因启动子区域SNP-12140和SNP-11426两个位点进行基因分型,评估这2个SNPs与NSCLC发生的相关性,同时根据肺癌病理类型进行分层分析,评估这2个位点与NSCLC中与鳞癌和腺癌的相关性.结果病例组和对照组NSCLC基因SNP-12140位点基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05),SNP-11426位点基因型和等位基因频率在病例组和对照组中无差异(P>0.05).在鳞癌和腺癌中SNP-12140和SNP-11426无差异(P>0.05).结论脂联素基因启动子区域SNP-11426与NSCLC的发生有关,其中A等位基因可能减少NSCLC的患病风险(OR=0.622,95%CI:0.398～0.971),但是该位点与肺癌的病理类型无相关性.

关键词：癌非小细胞肺脂联素多态性单核苷酸

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成年树鼩骨骼系统CT三维可视化模型建立及分析

成年树鼩骨骼系统CT三维可视化模型建立及分析

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第十六届中国西部实验动物管理与学术研讨会

作者：罕园园徐昕陆彩霞匡德宣仝品芬王文广孙晓梅李娜代解杰中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心云南昆明、650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 云南省科学技术院云南昆明650118 云南大学第一医院云南省第二人民医院暨云南省红十字会医院昆明650051

目的建立树鼩骨骼系统的三维可视化模型,为树鼩的骨骼系统疾病诊断提供依据.方法使用日本东芝Aquillonone320排螺旋CT进行扫描,100KV,80mA,球管转数0.35s/转,螺距1.35,图像为0.5mm,层间隔为0.5mm,使用骨算法重建.在并行计算环境中采用...

目的建立树鼩骨骼系统的三维可视化模型,为树鼩的骨骼系统疾病诊断提供依据.方法使用日本东芝Aquillonone320排螺旋CT进行扫描,100KV,80mA,球管转数0.35s/转,螺距1.35,图像为0.5mm,层间隔为0.5mm,使用骨算法重建.在并行计算环境中采用Vitrea软件包,选择Musculoskeletal CT选项,采用容积成像(VR)、多平面成像(MPR)、曲面成像(CPR)技术进行三维重建.结果重建后的可视化模型结构明显、清楚,可以真实地在计算机中重现出树鼩的骨骼系统三维模型.在此模型中,在头骨背面可见五条隆起的嵴,侧面观可见四个大孔：位于前端的外鼻孔、前颌骨后上方的眶下孔、由颧弓所范围着的眼窝和鼓泡外侧的外耳道.此外,可见一些较小的头骨孔,如视神经孔、颌下神经孔.利用该成像技术可定量测定各主要骨骼的长度、前后径、左右径和身长、尾长等数据.尤其是还获得了以往通过解剖难以测量准确的数据：如腭长、臼齿列长等较细微的数据,以及解剖不易获得脊椎前后径及左右径的数据.同时还利用三维可视化技术发现了树鼩存在有骨盆形态不对称、胸廓增大、骨折、跟腱周围滑膜囊钙化的骨骼异常情况.结论所建立的CT三维可视化技术可确定树鼩骨骼系统的特殊特征,对树鼩骨骼系统无侵入性的生态分类、鉴定、进化分析均有重要意义.

关键词：

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成年树鼩骨骼系统CT三维可视化模型建立及分析

成年树鼩骨骼系统CT三维可视化模型建立及分析

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第八届北京实验动物科学国际论坛

作者：罕园园徐昕陆彩霞匡德宣仝品芬王文广孙晓梅李娜代解杰中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心云南昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室，云南昆明650118 云南省科学技术院，云南昆明650118 云南大学第一医院云南省第二人民医院暨云南省红十字会医院昆明650051

目的:建立树鼩骨骼系统的三维可视化模型,为树鼩的骨骼系统疾病诊断提供依据. 方法:使用日本东芝Aquillonone320排螺旋CT进行扫描,100KV,80mA,球管转数0.35s/转,螺距1.35,图像为0.5mm,层间隔为0.5mm,使用骨算法重建.在并行计算环境... 详细信息

目的:建立树鼩骨骼系统的三维可视化模型,为树鼩的骨骼系统疾病诊断提供依据. 方法:使用日本东芝Aquillonone320排螺旋CT进行扫描,100KV,80mA,球管转数0.35s/转,螺距1.35,图像为0.5mm,层间隔为0.5mm,使用骨算法重建.在并行计算环境中采用Vitrea软件包,选择Musculoskeletal CT选项,采用容积成像(VR)、多平面成像(MPR)、曲面成像(CPR)技术进行三维重建. 结果:重建后的可视化模型结构明显、清楚,可以真实地在计算机中重现出树鼩的骨骼系统三维模型.在此模型中,在头骨背面可见五条隆起的嵴,侧面观可见四个大孔:位于前端的外鼻孔、前颌骨后上方的眶下孔、由颧弓所范围着的眼窝和鼓泡外侧的外耳道.此外,可见一些较小的头骨孔,如视神经孔、颌下神经孔.利用该成像技术可定量测定各主要骨骼的长度、前后径、左右径和身长、尾长等数据.尤其是还获得了以往通过解剖难以测量准确的数据:如腭长、臼齿列长等较细微的数据,以及解剖不易获得脊椎前后径及左右径的数据.同时还利用三维可视化技术发现了树鼩存在有骨盆形态不对称、胸廓增大、骨折、跟腱周围滑膜囊钙化的骨骼异常情况. 结论:所建立的CT三维可视化技术可确定树鼩骨骼系统的特殊特征,对树鼩骨骼系统无侵入性的生态分类、鉴定、进化分析均有重要意义.

关键词：骨骼系统疾病动物模型电子计算机断层扫描三维可视化技术

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疫苗生产用细胞基质探讨分析

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中国保健营养 2016年第28期26卷 2-2页

作者：高垚李琦涵中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室 650118 云南省昆明医科大学 650504 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室 650118

生产疫苗用细胞基质直接影响着疫苗终产品的质量,鉴于现在人们对疫苗质量的高度关注,本文就疫苗生产中的一个关键组成部分--细胞基质做一个综合性的论述,为疫苗的生产和研发提供一些理论性的参考.

关键词：疫苗细胞基质安全

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2022年昆明市4株柯萨奇病毒A组6型全基因组特征分析

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中国病毒病杂志 2024年第6期14卷 547-554页

作者：陈俊薇冯昌增楚昭阳刘煜菡张名李丽马绍辉云南大学生命科学学院云南昆明650504 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所、云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 昆明市妇幼保健院检验科云南昆明650031

目的对4株2022年云南省手足口病监测中鉴定出的CVA6病毒分离株(coxsackievirus A6,CVA6)进行全基因组序列和遗传进化分析,为CVA6的流行病学和疾病防控提供基础数据。方法采用人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells,RD细胞)对4... 详细信息

目的对4株2022年云南省手足口病监测中鉴定出的CVA6病毒分离株(coxsackievirus A6,CVA6)进行全基因组序列和遗传进化分析,为CVA6的流行病学和疾病防控提供基础数据。方法采用人横纹肌肉瘤细胞(human rhabdomyosarcoma cells,RD细胞)对4株云南CVA6病毒分离株进行病毒增殖,收获增殖病毒。提取病毒RNA,应用反转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RTPCR)扩增其VP1(viral protein 1,VP1)序列,并由昆明擎科生物科技公司完成VP1序列测定,利用NCBI在线网站BLAST比对鉴定其血清型。设计针对CVA6全基因组各片段的引物,分段扩增序列并测序获得各段序列,使用DNAStar 7.1软件中的SeqMan拼接序列,采用Mega 7.0、Simplot 3.5.1等软件对其全基因组序列和基因重组进行分析。结果4株云南CVA6病毒分离株全基因组核苷酸和氨基酸序列一致性分别为96.83%~98.38%和98.73%~99.36%,均属于在中国内地近年流行的优势基因型D3基因亚型中的D3a分支。4株云南CVA6病毒分离株在非结构区与肠道病毒A114型(enterovirus A114,EV-A114)原型株V13-0285、柯萨奇A组5型(coxsackievirus A5,CVA5)原型株Swartz、CVA16原型株G-10、CVA4原型株High Point、CVA14原型株G-14聚类在一起。结论4株CVA6病毒分离株在非结构区与其他肠道病毒A组血清型原型株之间可能有重组事件发生,4株云南CVA6病毒分离株均属于中国内地流行的优势基因型D3a,近几年云南地区的CVA6流行株传播可能为多条传播链共循环。

关键词：柯萨奇病毒A组6型云南株全基因组序列系统进化分析重组分析

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