检索结果-内蒙古大学图书馆

分析化学 2017年第5期45卷 674-680页

作者：王中华陈艳华徐婧陈蕙莉周霞肖新华平凡贺玖明再帕尔·阿不力孜张瑞萍中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室中央民族大学生命与环境科学学院生物成像与系统生物学研究中心中国医学科学院/北京协和医学院北京协和医院

系统地比较了3种常用的离子化技术电喷雾电离（ESI）、大气压化学电离（APCI）、大气压光致电离（APPI）对脂类化合物的离子化效率、检测灵敏度和覆盖范围,以探讨多重离子化液相色谱-质谱（LC-MS）方法在血清脂质组学研究中的适用性。... 详细信息

系统地比较了3种常用的离子化技术电喷雾电离（ESI）、大气压化学电离（APCI）、大气压光致电离（APPI）对脂类化合物的离子化效率、检测灵敏度和覆盖范围,以探讨多重离子化液相色谱-质谱（LC-MS）方法在血清脂质组学研究中的适用性。血清样本经甲基叔丁基醚萃取后,采用Ascentiss Express C;色谱柱（150 mm×2.1 mm,2.7μm）和二元线性梯度洗脱分离,流动相（A）为乙腈-水（3:2,V/V,含0.1%甲酸,10 mmol/L甲酸铵）,B为异丙醇-乙腈（9:1,V/V,含0.1%甲酸,10 mmol/L甲酸铵）,分别采用ESI、APCI和APPI离子源正、负离子模式进行质谱检测。结果表明,ESI离子源对脂肪酸类、甘油脂类、甘油磷脂类化合物、鞘磷脂类化合物的离子化效率最高,对异戊烯醇脂类化合物的离子化效率与APPI离子源相当,APPI离子源对胆固醇（酯）类化合物的检测灵敏度最高,APCI离子源对各类化合物的检测灵敏度均低于ESI或APPI离子源;采用ESI和APPI离子源相结合的LC-MS脂质组学分析方法可以提高分析方法的整体灵敏度和血清中脂类信息检测的完整性。

关键词：血清脂质组学电喷雾电离大气压化学电离大气压光致电离液相色谱-质谱联用

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自建MALDI-TOF MS微生物鉴定数据库专家共识

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中华检验医学杂志 2019年第6期42卷 414-419页

作者：罗燕萍徐英春王辉喻华崔生辉鲁辛辛马莜玲胡继红苏建荣陈茶赵建宏顾兵马小军林勇平王明贵王皓峰张樱周巍陈荣李松杨文航解放军总医院第一临床中心临床检验中心北京100853 广东省中医院检验科广州510120 河北医科大学第二医院检验科石家庄050000 徐州医科大学附属医院检验科徐州221004 广州医科大学附属第一医院检验科广州510530 复旦大学附属华山医院抗生素研究所上海200040 梅里埃诊断产品(上海)有限公司上海201315 河北省食品检验研究院石家庄310012 中国医学科学院北京协和医学院检验科北京100032 北京大学人民医院检验科北京100044 四川省人民医院检验科成都610072 中国食品药品检定研究院微生物检测室北京100050 北京同仁医院检验科北京100041 中国科技大学附属第一医院检验科北京230001 北京医院卫生部临床检验中心北京100730 首都医科大学附属北京友谊医院检验中心北京100050

自20世纪80年代末开始,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorptionionization time-of-flightmass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术以其对微生物种属鉴定的快速、准确、低成本优势,逐步在临床微生物鉴定领域得到广泛认可。该技术对微生物鉴定的理论基础是将设备采集的未知样品图谱与数据库中已知菌种的图谱进行统计学聚类分析,获得鉴定结果。

关键词： MALDI-TOF 微生物鉴定基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱数据库 MS 专家聚类分析鉴定结果

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两种台式高通量测序平台应用于癫痫患者基因突变检测的对比研究

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国际遗传学杂志 2018年第1期41卷 1-6页

作者：司锘王蓉蓉张俐俐李小玲汪涵卢超霞柳青张学中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室麦库西克-张孝骞协和遗传医学中心中国医科大学细胞生物学系中国医学科学院北京协和医院神经科

目的应用Illumina MiSeq和Ion Torrent PGM两种台式高通量测序平台,使用同样的序列捕获系统,结合两个平合各自配备的标准化试剂及软硬件设备,对癫痫患者进行突变检测,对比两个平台在使用成本、操作难易度、突变检测效果等方面的表现,从... 详细信息

目的应用Illumina MiSeq和Ion Torrent PGM两种台式高通量测序平台,使用同样的序列捕获系统,结合两个平合各自配备的标准化试剂及软硬件设备,对癫痫患者进行突变检测,对比两个平台在使用成本、操作难易度、突变检测效果等方面的表现,从而针对癫痫多基因诊断panel优化检测流程、指导测序平台选择。方法获取患者知情同意后采集30名癫痫患者外周血,提取基因组DNA。其中8名患者DNA采用Ion Xpress;Plus gDNA Fragment Library Preparation,另22名患者基因组DNA采用Dlumina TruSeq DNA LT sample prep kit进行文库制备,之后使用NimbleGen定制序列捕获系统对428个目的基因的编码区进行富集。构建完成的文库分别采用Ion Torrent PGM和Illumina MiSeq测序平台测序。Ion Torrent PGM平台产出数据用Ion Torrent Suite3. 2软件进行序列比对及SNPs和Indels提取,Illumina MiSeq平台产出数据用BWA-MEM和Samtools软件进行序列比对和变异提取。结果 Illumina MiSeq平台测序每次运行最多可完成12个样品的测序,总数据量超过5Gb,平均测序深度达137×,靶区域覆盖度为96.4%,平均每个样本提取2056±9. 042个变异,从样本制备到数据产出周期约6天。Ion Torrent PGM平台一张318 v2芯片可得到1. 4 Gb数据量,8个样本平均测序深度达70×,靶区域覆盖度为96. 1%,平均每个样本提取3028±678. 9个变异,从样品制备到数据产出周期约6天。PGM平台使用成本低于MiSeq,而MiSeq平台操作易用性及测序质量优于PGM平台。结论靶序列捕获结合下一代测序技术可以实现对癫痫致病基因的批量快速检测,两种台式高通量测序仪均可满足检测需求,Ion Torrent PGM平台应用灵活、成本经济。Iliumina MiSeq平台单次运行产出数据大,数据准确性高,适用于大批量样品检测。

关键词：台式高通量测序平台 MiSeq测序仪 PGM测序仪

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浅谈生物样本的质量保证与质量控制

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中华临床实验室管理电子杂志 2017年第1期5卷 36-45页

作者：郭丹王安琪孙健徐英春中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院生物标本中心 100730 中国医学科学院北京协和医学院中心实验室 100730 中国医学科学院北京协和医学院病理科 100730 中国医学科学院北京协和医学院检验科 100730

随着转化医学的快速发展,临床生物样本库的建设和应用得到日益发展与重视,而生物样本的质量保证和质量控制是样本库建设的核心目标。影响生物样本质量的主要因素可分为分析前和分析中两大因素,涉及捐赠者的生物学和环境因素、样本的采... 详细信息

随着转化医学的快速发展,临床生物样本库的建设和应用得到日益发展与重视,而生物样本的质量保证和质量控制是样本库建设的核心目标。影响生物样本质量的主要因素可分为分析前和分析中两大因素,涉及捐赠者的生物学和环境因素、样本的采集、处理、运输、储存、分发、分析等各环节。这些环节同时与人员、仪器、材料、方法、环境等要素相互作用共同影响着生物样本的质量。因此,单一因素控制和质量分析是无法保证高质量的样本以及相应的产出和临床转化应用,需要通过建立完善的质量管理体系给予多因素、全流程控制,并在生物样本库领域建立国际标准化的认证和认可,才能促进生物样本质量和研究水平快速提升,为疾病标志物检测、个体化医疗、药物研发等转化医学研究提供支持。

关键词：临床生物样本库质量控制质量保证转化医学

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艰难梭菌耐药性及耐药机制研究进展

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临床荟萃 2018年第5期33卷 377-380页

作者：范欣陈新飞肖盟徐英春首都医科大学附属北京朝阳医院感染和临床微生物科北京100020 中国医学科学院北京协和医院检验科侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730

艰难梭菌是导致抗生素相关性腹泻和医院感染性腹泻的最主要病原菌。在欧美等发达国家及地区,艰难梭菌感染都有较高的发病率和死亡率,因此受到高度关注。相比,国内艰难梭菌的研究数据还相对匮乏,尤其临床对其对常用抗生素的耐药性还认识... 详细信息

艰难梭菌是导致抗生素相关性腹泻和医院感染性腹泻的最主要病原菌。在欧美等发达国家及地区,艰难梭菌感染都有较高的发病率和死亡率,因此受到高度关注。相比,国内艰难梭菌的研究数据还相对匮乏,尤其临床对其对常用抗生素的耐药性还认识不足。因此,本文就艰难梭菌的耐药性和耐药机制的最新研究进展进行综述。

关键词：艰难梭菌抗药性

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13例ATP敏感性钾通道基因突变所致新生儿糖尿病的分子遗传学及临床特征分析

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中华糖尿病杂志 2017年第6期9卷 350-355页

作者：王彤于淼卢超霞张化冰平凡张茜许建萍冯凯李文慧郑佳王晓晶肖新华中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院内分泌科国家卫计委内分泌重点实验室100730 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室麦库西克-张孝骞协和遗传医学中心

目的研究中国人群中由编码ATP敏感性钾通道（KATP）基因突变导致的新生儿糖尿病（NDM）患者的临床特点以及基因型-临床表型关系.方法纳入2007年8月至2016年8月就诊于北京协和医院的可疑NDM患者23例,详细收集临床资料,运用Sanger测序... 详细信息

目的研究中国人群中由编码ATP敏感性钾通道（KATP）基因突变导致的新生儿糖尿病（NDM）患者的临床特点以及基因型-临床表型关系.方法纳入2007年8月至2016年8月就诊于北京协和医院的可疑NDM患者23例,详细收集临床资料,运用Sanger测序技术对分别编码KATP通道Kir6.2亚单位和SUR1亚单位的KCNJ11和ABCC8基因进行测序,明确分子遗传学诊断;对明确由KCNJ11或ABCC8基因突变导致的NDM患者,尝试行口服格列本脲替代胰岛素转换治疗.结果共遗传学确诊KATP-NDM患者13例：KCNJ11突变（KCNJ11-NDM）9例,ABCC8突变（ABCC8-NDM）4例.发现4个新的KATP基因致病位点,分别为KCNJ11 p.I182M和ABCC8 p.Q211R、p.I585F、p.R653W.在9例KCNJ11-NDM中,2例为暂时性NDM（TNDM）,7例为永久性NDM（PNDM）,其中3例合并神经、肌肉发育迟缓（iDEND综合征）.4例ABCC8-NDM均为PNDM,其中2例合并iDEND综合征.共9例（69.2%）患者成功停用胰岛素,转换为格列本脲单药降糖治疗.即使在KATP基因同一位点、发生相同或不同氨基酸类型突变,所导致的NDM在临床轻重程度、对磺脲类药物的反应均存在较大差异.结论深入研究NDM的基因型-临床表型关系有助于更好地理解糖尿病（特别是NDM）的发病机制与临床转归.尽早确诊KATP-NDM并起始磺脲类药物治疗对预防iDEND综合征患者的神经肌肉系统发育异常具有重要意义.

关键词：新生儿糖尿病 ATP敏感性钾通道磺脲类药物

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9例家族性高胆固醇血症患者LDLR基因突变检测并一个新突变报道

9例家族性高胆固醇血症患者LDLR基因突变检测并一个新突变报道

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第六届北京市罕见病学术大会暨2018京津冀罕见病学术大会

作者：孟晓露司锘申育奇汪奇何疆春卢超霞吴炜张抒扬张学中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室麦库西克-张孝骞协和遗传医学中心中国人民解放军总医院心血管内科中国人民解放军海军总医院心脏中心中国医学科学院北京协和医院心内科

目的：检测9例家族性高胆固醇血症(familial hypercholesterolemia,FH)患者LDLR基因突变情况,为该病的临床诊断与遗传咨询提供依据。方法：收集患者及父母外周血样本提取基因组DNA,针对LDLR基因设计特异性引物,采用聚合酶链式反应(PCR)... 详细信息

目的：检测9例家族性高胆固醇血症(familial hypercholesterolemia,FH)患者LDLR基因突变情况,为该病的临床诊断与遗传咨询提供依据。方法：收集患者及父母外周血样本提取基因组DNA,针对LDLR基因设计特异性引物,采用聚合酶链式反应(PCR)扩增LDLR基因的全部编码及侧翼序列,对扩增产物进行直接测序。

关键词：家族性高胆固醇血症 LDLR基因基因检测突变

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河北地区侵袭性酵母样真菌的菌株分布及药敏分析

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中国真菌学杂志 2019年第4期14卷 222-227页

作者：栗方李志荣赵颖赵建宏张延海董爱英刘金禄郭彦言孙艳赵文申谢守军魏宏莲张金艳任宏涛王建升吴相锟光晓刘冬青杜红丽郭映辉徐英春肖盟杨文航徐晓琳河北燕达医院感染与疾病控制部廊坊065201 首都医科大学附属北京朝阳医院感染与微生物科北京100020 河北医科大学第二医院河北省临床检验中心石家庄050000 中国医学科学院北京协和医院检验科侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730 河北燕达医院廊坊065201 华北理工大学附属医院唐山063000 河北北方学院附属第一医院张家口075000 河北省唐山市工人医院唐山063000 沧州市中心医院沧州061001 邯郸市中心医院邯郸056001 承德医学院附属医院承德067000 河北医科大学第二医院石家庄050000 河北医科大学第四医院石家庄050019 邢台市人民医院邢台054001 河北省人民医院石家庄050057 河北省武安市第一人民医院武安056300 邯郸市第一医院邯郸056002 衡水市人民医院衡水053000 河北省儿童医院石家庄050030

目的调查河北地区16家三级教学医院侵袭性酵母样真菌的菌株构成、分布及其体外药敏特点,为临床抗真菌药物的合理应用提供依据。方法收集河北地区2016~2017年侵袭性酵母样真菌感染患者的菌株,对菌种构成进行分析,采用Sensititre YeastOn... 详细信息

目的调查河北地区16家三级教学医院侵袭性酵母样真菌的菌株构成、分布及其体外药敏特点,为临床抗真菌药物的合理应用提供依据。方法收集河北地区2016~2017年侵袭性酵母样真菌感染患者的菌株,对菌种构成进行分析,采用Sensititre YeastOne显色药敏板对9种抗真菌药进行药敏试验。结果共检出侵袭性酵母样真菌260株,其中白念珠菌是最主要的致病菌,占42.31%;非白念珠菌占57.69%,主要包括热带念珠菌19.23%、近平滑念珠菌18.08%和光滑念珠菌9.23%。白念珠菌对氟康唑、伏立康唑、伊曲康唑的耐药率分别为2.8%、1.9%和0.9%;热带念珠菌对氟康唑和伏立康唑的耐药率均为12.8%;近平滑念珠菌复合体对氟康唑和伏立康唑的耐药率分别为14.9%和10.6%;白念珠菌、热带念珠菌和近平滑念珠菌复合体对棘白菌素类抗菌物的耐药率几乎0%。结论侵袭性酵母样真菌感染中最常见的是白念珠菌感染,但是非白念珠菌感染已经超过50%。白念珠菌对抗真菌药物仍然有较高的敏感性,但对唑类药物的敏感率在不同种的念珠菌中存在差异。棘白菌素类对白念珠菌、热带念珠菌和近平滑念珠菌有很高的抗菌活性。

关键词：侵袭性酵母样真菌菌株分布药敏试验

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2016～2017年河北地区侵袭性真菌感染的病原菌分布特征

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中国真菌学杂志 2019年第5期14卷 257-263页

作者：栗方李志荣赵建宏赵颖张延海董爱英刘金禄郭彦言孙艳赵文申谢守军魏宏莲张金艳任宏涛王建升吴相锟光晓刘冬青杜红丽郭映辉徐英春肖盟杨文航徐晓琳河北燕达医院感染与疾病控制部廊坊065201 首都医科大学附属北京朝阳医院感染与微生物科北京100020 河北医科大学第二医院河北省临床检验中心石家庄050000 中国医学科学院北京协和医院检验科侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730 河北燕达医院廊坊065201 华北理工大学附属医院唐山063000 河北北方学院附属第一医院张家口075000 河北省唐山市工人医院唐山063000 沧州市中心医院沧州061001 邯郸市中心医院邯郸056001 承德医学院附属医院承德067000 河北医科大学第二医院石家庄050000 河北医科大学第四医院石家庄050019 邢台市人民医院邢台054001 河北省人民医院石家庄050057 河北省武安市第一人民医院武安056300 邯郸市第一医院邯郸056002 衡水市人民医院衡水053000 河北省儿童医院石家庄050030

目的了解2016~2017年河北地区16家三级教学医院侵袭性真菌感染现状,为临床诊治和感染防控提供数据资料。方法各参与单位收集引起侵袭性真菌感染的酵母菌和丝状真菌菌株,中心实验室应用Vitek MS质谱分析进行菌株复核鉴定,对Vitek MS不能... 详细信息

目的了解2016~2017年河北地区16家三级教学医院侵袭性真菌感染现状,为临床诊治和感染防控提供数据资料。方法各参与单位收集引起侵袭性真菌感染的酵母菌和丝状真菌菌株,中心实验室应用Vitek MS质谱分析进行菌株复核鉴定,对Vitek MS不能有效鉴定的疑难和罕见菌株采用ITS和/或钙调蛋白CaM测序分析。结果16家医院共检出侵袭性真菌493株,其中酵母菌268株(54.36%),丝状真菌225株(45.64%)。酵母菌主要是白念珠菌41.79%,其次是热带念珠菌、近平滑念珠菌和光滑念珠菌。丝状真菌主要是烟曲霉58.22%,其次是黄曲霉/米曲霉和黑曲霉。侵袭性真菌复核正确率(373/493)75.66%。结论引起的侵袭性真菌感染中最常见的是念珠菌为主的酵母菌和曲霉菌为主的丝状真菌。采用微生物质谱鉴定结合ITS/CaM区测序方法可以有效提高真菌的鉴定正确率,为临床侵袭性真菌的治疗提供参考依据。

关键词：侵袭性真菌酵母菌丝状真菌分布特征

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桃过敏原组分检测蛋白质芯片的制备及验证

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基础医学与临床 2017年第11期37卷 1507-1512页

作者：翟康乐周俊雄李新新陈慧尹佳何维张建民中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室北京100005 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院变态反应科北京100730 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院过敏性疾病精准诊疗研究北京市重点实验室北京100730

目的制备用于检测血清中针对几种桃过敏原组分抗体的蛋白质芯片,为针对桃过敏原组分过敏患者的临床诊断提供快速可靠的方法。方法合成6种常见的桃过敏原组分的编码基因,分别将其插入p GAPZαA酵母表达载体,AvrⅡ单酶切线性化后,电转毕... 详细信息

目的制备用于检测血清中针对几种桃过敏原组分抗体的蛋白质芯片,为针对桃过敏原组分过敏患者的临床诊断提供快速可靠的方法。方法合成6种常见的桃过敏原组分的编码基因,分别将其插入p GAPZαA酵母表达载体,AvrⅡ单酶切线性化后,电转毕赤酵母SMD1168,表达和纯化相应的桃过敏原组分蛋白,并制备蛋白质芯片;用蛋白芯片检测临床血清样本中针对桃过敏原组分蛋白的抗体,与ImmunoCAP法相比,验证蛋白质芯片检测的灵敏度和特异性。结果用酵母表达系统成功表达并纯化了4种桃过敏原组分Pru p 1、Pru p 3、Pru p 4和Pru p 7,制备了能进行质量控制的检测血清桃过敏原组分抗体的蛋白质芯片。检测了疑似桃过敏患者血清41例,结果以ImmunoCAP法为金标准,蛋白芯片检测血清Pru p 1、Pru p 3和Pru p 4抗体的灵敏度分别为40%、100%和100%,特异性为78%、50%和100%;对上述3种组分抗体的综合检测灵敏度为86%,特异性为96%。针对缺乏ImmunoCAP检测结果的Pru p 7抗体,蛋白芯片检测出6份阳性的血清样本,均为桃过敏患者。结论桃过敏原组分检测芯片在灵敏度和特异性方面与ImmunoCAP相当,血清用量少,优化后有望成为临床桃过敏检测的一种新方法。

关键词：蛋白质芯片桃过敏原组分检测血清

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