检索结果-内蒙古大学图书馆

糖皮质激素治疗与中重度溃疡性结肠炎患者肠道菌群的相关性:单中心回顾性研究

协和医学杂志 2019年第3期10卷 216-222页

作者：李映荷孟祥辰阎鹏光杨红李骥钱家鸣李景南中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院消化内科北京100730 中国医学科学院肠道微生态与临床转化研究重点实验室北京100005

目的分析接受及不接受糖皮质激素治疗的中重度溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者肠道菌群的差异,并探讨肠道菌群对静脉糖皮质激素疗效的预测价值。方法回顾性分析2016年11月1日至2018年6月30日期间,在北京协和医院消化内科门诊... 详细信息

目的分析接受及不接受糖皮质激素治疗的中重度溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)患者肠道菌群的差异,并探讨肠道菌群对静脉糖皮质激素疗效的预测价值。方法回顾性分析2016年11月1日至2018年6月30日期间,在北京协和医院消化内科门诊就诊或住院治疗的中重度UC患者临床资料。根据采集粪便样本时患者是否正在使用糖皮质激素,将患者分为激素组和无激素组。无激素组患者入院后接受静脉激素、口服激素或免疫抑制剂治疗,根据3d后的疗效,将入院后接受足量静脉激素治疗的患者分为治疗有效组和无效组。采用16S rRNA扩增子测序方法对粪便菌群测序分析,采用香农指数评估肠道菌群α多样性,采用Metastats分析比较不同组患者肠道菌群的物种构成差异。结果共35例符合入选和排除标准的中重度UC患者入选本研究,无激素组20例,激素组15例。无激素组中13例患者在采集粪便样本后接受静脉足量糖皮质激素治疗,其中有效组8例,无效组5例。激素组和无激素组患者的肠道菌群α多样性(香农指数:无激素组3. 57±0. 73,激素组3. 03±1. 15,P=0. 123)及物种组成无统计学差异。激素治疗有效组和无效组患者的肠道菌群α多样性亦无统计学差异(香农指数:有效组3. 69±0. 61,无效组3. 15±1. 01,P=0. 248),但无效组的乳杆菌属(无效组0. 0015±0. 0000,有效组0. 0141±0. 0002,P=0. 010)和双歧杆菌属(无效组0. 0178±0. 0005,有效组0. 1716±0. 0382,P=0. 011)相对丰度显著低于有效组,而志贺菌属(无效组0. 4161±0. 0750,有效组0. 1093±0. 0173,P=0. 008)和普雷沃氏菌属类群9 (无效组0. 0176±0. 0004,有效组0. 0018±0. 0000,P=0. 044)的相对丰度则显著高于有效组。结论中重度UC患者肠道菌群的α多样性及物种组成可能与是否激素暴露无关,但治疗前肠道菌群的物种组成可能是静脉激素疗效的潜在预测指标。

关键词：溃疡性结肠炎肠道菌群糖皮质激素

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Regional Differences of the Urinary Proteomes in Healthy Chinese Individuals

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Chinese Medical Sciences Journal 2019年第3期34卷 157-167页

作者：吴建强秦伟伟潘利王小蓉张彪单广良高友鹤中国医学科学院北京协和医院医学科学研究中心中国医学科学院北京协和医学院中国医学科学院基础医学研究所病理生理学系中国医学科学院北京协和医学院北京师范大学生命科学学院生物化学与分子生物学系基因工程药物与生物技术北京重点实验室中国医学科学院基础医学研究所流行病与卫生统计学系中国医学科学院北京协和医学院

Objective Urine is a promising biomarker source for clinical proteomics *** physiological differences are common in multi-center clinical *** this study,we investigate whether significant differences are present in the urinary proteomes of individuals from different regions in *** In this study,morning urine samples were collected from healthy urban residents in three regions of China(Haikou,Xi’an and Xining)and urinary proteins were preserved using a membrane-based method(Urimem).The urine proteomes of 27 normal samples were analyzed using LC-MS/MS and compared among three *** annotation of the differential proteins among the three areas was analyzed using the DAVID online database,and pathway enrichment of the differential urinary proteins was analyzed using *** We identified 1898 proteins from Urimem samples using label-free proteome quantification,of which 56 urine proteins were differentially expressed among the three regions(P<0.05).Hierarchical clustering analysis showed that inter-regional differences caused less significant changes in the urine proteome than intersex *** gender stratification,16 differential proteins were identified in male samples and 84 differential proteins were identified in female *** these differential proteins,several proteins have been previously reported as urinary disease *** Urimem will facilitate urinary protein storage for large-scale urine sample *** differences are a confounding factor influencing the urine proteome and should be considered in future multicenter biomarker studies.

关键词： urine proteomics biobank biomarkers regional differences

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新型抗结核化合物体内外活性评价方法的研究进展

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中国医药生物技术 2021年第3期16卷 256-259页

作者：杨瑞芳蒙建州李传友首都医科大学附属北京胸科医院北京市结核病胸部肿瘤研究所细菌免疫室北京101149 中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所国家新药(微生物)筛选实验室北京100050

结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性呼吸道传染病,是全球十大死因之一,也是由单一传染源导致死亡的主要原因,排名高于艾滋病。2019年因TB死亡的人数是120万人[1]。MTB具有特殊的生理特... 详细信息

结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性呼吸道传染病,是全球十大死因之一,也是由单一传染源导致死亡的主要原因,排名高于艾滋病。2019年因TB死亡的人数是120万人[1]。MTB具有特殊的生理特征,包括生长缓慢、自然状态下基因突变率较高以及用药后易形成持留菌株等,导致TB治疗用药周期较长、患者的依从性较差,因此耐药MTB的检出率不断攀升。

关键词：结核分枝杆菌 tuberculosis 持留菌艾滋病体内外活性结核病依从性基因突变率

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新型抗结核化合物体内外活性评价方法的研究进展

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结核病与胸部肿瘤 2021年第4期 322-326页

结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性呼吸道传染病,是全球十大死因之一,也是由单一传染源导致死亡的主要原因,排名高于艾滋病。2019年因TB死亡的人数是120万人[1]。MTB具有特殊的生理特... 详细信息

结核病(tuberculosis,TB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)引起的慢性呼吸道传染病,是全球十大死因之一,也是由单一传染源导致死亡的主要原因,排名高于艾滋病。2019年因TB死亡的人数是120万人[1]。MTB具有特殊的生理特征,包括生长缓慢、自然状态下基因突变率较高以及用药后易形成持留菌株等,导致TB治疗用药周期较长。

关键词： tuberculosis 持留菌体内外活性艾滋病结核病抗结核化合物基因突变率生长缓慢

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青稞酥油饮食对小鼠肠道菌群以及葡聚糖硫酸钠诱导的小鼠结肠炎症状的影响

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基础医学与临床 2021年第2期41卷 203-208页

作者：李春美赵微解相宏张伟虹杨佳卉李军刘晓军中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室北京100005 山西医科大学基础医学院微生物学与免疫学教研室山西太原030001 北京大学第三医院消化科北京100191

目的探求青稞酥油饮食对小鼠肠道微生物分布及葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠慢性溃疡性结肠炎的影响。方法定制饮食,将标准鼠繁殖料(N鼠料)中的大豆油和玉米次粉替换为等比例的酥油和生青稞粉,以制成定制饲料(C鼠料)。将28只5周龄雄性小... 详细信息

目的探求青稞酥油饮食对小鼠肠道微生物分布及葡聚糖硫酸钠(DSS)诱导的小鼠慢性溃疡性结肠炎的影响。方法定制饮食,将标准鼠繁殖料(N鼠料)中的大豆油和玉米次粉替换为等比例的酥油和生青稞粉,以制成定制饲料(C鼠料)。将28只5周龄雄性小鼠随机分为4组,每组7只:1)NW组:饲养以N鼠料和水;2)ND组:饲养以N鼠料和1.8%DSS;3)CW组:饲养以C鼠料和水;4)CD组:饲养以C鼠料和1.8%DSS。以7 d 1.8%DSS溶液之后换10 d蒸馏水为1个周期,共进行3个周期完成建模。匹拉米洞法测定小鼠粪便隐血进行DAI评分,选取结肠组织HE染色及粪便微生物16S rRNA高通量测序。结果青稞酥油饮食可提高正常小鼠肠道菌群丰度,改善肠道菌群组成,其中别样棒菌属增加。加入DSS诱导溃疡性结肠炎模型后,青稞酥油饮食组DAI评分显著增高(P<0.05),组织学检测结肠黏膜糜烂溃疡且肠组织腺体排列混乱,小鼠肠道菌群丰度和多样性降低(P<0.05),但梭菌属、萨特氏菌属增加(P<0.05)。结论青稞酥油饮食可增加正常小鼠肠道菌群丰度,改善肠道菌群组成,但对于DSS诱导的慢性溃疡性结肠炎炎性反应无显著改善。

关键词：青稞酥油饮食 DSS诱导溃疡性结肠炎 16S rRNA高通量测序肠道菌群

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2型糖尿病患者与非糖尿病人群肠道菌群差异的研究

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中华临床营养杂志 2019年第6期27卷 342-348页

作者：刘诗璇薛勇袁涛付勇李乃适董颖越朱宝利赵维纲中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院内分泌科国家卫生健康委员会内分泌重点实验室1100730 中国科学院微生物研究所北京100101

目的探究北京地区2型糖尿病与非糖尿病人群肠道菌群的差异。方法选取在北京协和医院就诊的2型糖尿病患者83例,同时选取64例非糖尿病人群作为对照组,收集研究对象及对照组的粪便样本,采用宏基因组测序技术进行肠道菌群的测定,比较2型糖... 详细信息

目的探究北京地区2型糖尿病与非糖尿病人群肠道菌群的差异。方法选取在北京协和医院就诊的2型糖尿病患者83例,同时选取64例非糖尿病人群作为对照组,收集研究对象及对照组的粪便样本,采用宏基因组测序技术进行肠道菌群的测定,比较2型糖尿病组与对照组的肠道微生物的差异。结果两组样本共检测出11个菌门,其中放线菌门(Actinobacteria)(P=0.013)、厚壁菌门(Firmicutes)(P=0.005)、梭杆菌门(Fusobacteria)(P=0.001)、变形菌门(Proteobacteria)(P<0.001)的物种多样性差异有统计学意义,其中放线菌门、梭杆菌门及变形菌门均在2型糖尿病患者中富集,厚壁菌门在对照组中富集。两组样本共检测出152个菌属,两组间有菌群丰度差异的菌属共有31个,在2型糖尿病组中,罗氏菌属(Roseburia)、真杆菌属(Eubacterium)、粪便杆菌属(Faecalibacterium)水平下降,双歧杆菌属(Bifidobacterium)、乳酸杆菌属(Lactobacillus)、大肠埃希菌(Escherichia)水平均增加。结论2型糖尿病组与对照组的肠道菌群物种构成存在显著差异,调节2型糖尿病患者的肠道菌群,可能有助于改善2型糖尿病患者病情。

关键词： 2型糖尿病肠道菌群宏基因组分析

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培养条件对克柔念珠菌MALDI-TOF MS鉴定结果的影响分析

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中国真菌学杂志 2020年第5期15卷 262-267页

作者：黄晶晶范欣肖盟徐志鹏张戈徐英春中国医学科学院北京协和医院检验科北京100730 侵袭性真菌病机制研究与精准诊断北京市重点实验室北京100730 首都医科大学附属北京朝阳医院感染和临床微生物科北京100020

目的探究不同的培养时间、培养温度、培养基种类及培养气体环境对克柔念珠菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定结果的影响。方法收... 详细信息

目的探究不同的培养时间、培养温度、培养基种类及培养气体环境对克柔念珠菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定结果的影响。方法收集中国侵袭性真菌耐药监测网(CHIF-NET)2012-2013年中17所医院克柔念珠菌25株,每株菌平行接种在沙堡弱氯霉素琼脂平板(SDA-C)、血琼脂平板等6种培养基,28℃和35℃2种孵育温度,空气和5%CO22种气体环境中孵育,以真菌rDNA ITS测序为金标准,孵育24 h和48 h后,使用Vitek MALDI-TOF质谱仪(简称Vitek MS)和Bruker Autoflex Speed型MALDI-TOF质谱仪(简称Bruker MS)分别进行菌种鉴定,并对其鉴定正确率进行分析。结果克柔念珠菌孵育24 h和48 h时Vitek MS鉴定正确率均为100%,Bruker MS鉴定正确率分别是98.86%和87.43%。28℃SDA-C上生长的克柔念珠菌种水平鉴定准确率较35℃生长的菌株高。比较各种培养基,孵育48 h时SDA-C上生长的克柔念珠菌Bruker MS鉴定正确率(100%)最高。结论克柔念珠菌接种在SDA-C上,28℃空气培养24 h质谱鉴定效果最佳。常规细菌培养基上生长的克柔念珠菌,Bruker MS鉴定分值≥1.700即可认为菌种鉴定可靠。

关键词：克柔念珠菌鉴定培养条件 MALDI-TOF MS

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新型冠状病毒(2019-nCoV)感染患者肺损伤相关的临床及生化指标研究

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中国科学：生命科学 2020年第3期50卷 258-269页

作者：刘映霞杨扬张聪黄凤鸣王福祥袁静王召钦李金秀李建明冯程张政王力非彭凌陈莉秦宇豪赵丹丹谭曙光尹路徐军周丛照蒋澄宇刘磊南方科技大学附属第二医院深圳市第三人民医院国家感染性疾病临床医学研究中心深圳市病原微生物与免疫重点实验室感染病国家重点学科深圳518112 中国科学技术大学合肥微尺度物质科学国家实验室生命科学学院合肥230027 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005 中国科学院微生物研究所北京100101 北京协和医院急诊科北京100731

Ⅱ新型冠状病毒(2019-n Co V)2019年12月在湖北省武汉市暴发,并迅速传播到中国多地及其他国家.在本研究中,我们报告了来自中国深圳早期的2019-n Co V感染患者的流行病学、临床指标、生化指标和影像学特征,以及可用于预测疾病严重程度的... 详细信息

Ⅱ新型冠状病毒(2019-n Co V)2019年12月在湖北省武汉市暴发,并迅速传播到中国多地及其他国家.在本研究中,我们报告了来自中国深圳早期的2019-n Co V感染患者的流行病学、临床指标、生化指标和影像学特征,以及可用于预测疾病严重程度的潜在生物标记物.所有12例2019-n Co V感染患者均发展为肺炎,其中一半患者进一步发展为急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS).最常见的生化指标异常是低白蛋白(albumin, ALB)血症、淋巴细胞(lymphocytes, LYM)计数减少、淋巴细胞百分比和中性粒细胞(neutrophils, NEU)百分比降低、C反应蛋白(C-reactive protein, CRP)和乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase, LDH)水平升高,以及CD8细胞计数降低.从患者呼吸道特别是下呼吸道检测到的2019-n Co V病毒滴度与肺部疾病的严重程度正相关. ALB,LYM, LYM(%), LDH, NEU(%)和CRP的水平与急性肺损伤程度高度相关.年龄、病毒滴度、肺损伤评分和血液生化指标(ALB, CRP, LDH, LYM(%), LYM及NEU(%))可能是疾病严重程度的预测指标.此外, 2019-n Co V感染患者的血浆血管紧张素Ⅱ水平显著升高,并且与病毒滴度和肺损伤程度线性相关.该研究结果提供了多种潜在的可用于诊断的生物标志物,并提出了血管紧张素Ⅱ受体阻滞剂(angiotensin Ⅱ receptor blocker, ARB)药物或可作为治疗2019-n Co V感染的潜在药物进行深入研究.

关键词： 2019-nCoV 血管紧张素Ⅱ 急性呼吸窘迫综合征

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Identification of CDK6 and RHOU in Serum Exosome as Biomarkers for the Invasiveness of Non-functioning Pituitary Adenoma

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Chinese Medical Sciences Journal 2019年第3期34卷 168-176页

作者：于姗王小爽曹开灿包新杰余佳中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室RNA与造血调控重点实验室生物化学与分子生物学系南方医科大学南方医院胸外科中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院神经外科

Objective To explore circulating biomarkers for screening the invasiveness of non-functioning pituitary adenomas(NF-PAs).Methods The exosomal RNAs were extracted from serum of patients with invasive NF-PA(INF-PA)or noninvasive NF-PA(NNF-PA).Droplet digital PCR was adapted to detect the mRNA expression of candidate genes related to tumor progression or invasion,such as cyclin dependent kinase 6(CDK6),ras homolog family member U(RHOU),and spire type actin nucleation factor 2(SPIRE2).Student’s t-test was used to analyze the statistical difference in the mRNA expression of candidate genes between the two *** operating characteristic(ROC)curve was used to establish a model for predicting the invasiveness of *** accuracy,sensitivity,specificity and precision of the model were then obtained to evaluate the diagnostic *** CDK6(0.2600±0.0912 vs.0.1789±0.0628,t=3.431,P=0.0013)and RHOU mRNA expressions(0.2696±0.1118 vs.0.1788±0.0857,t=2.946,P=0.0052)were upregulated in INF-PAs patients’serum exosomes as compared to *** CDK6,the area under the ROC curve(AUC)was 0.772(95%CI:0.600-0.943,P=0.005),the accuracy,sensitivity,specificity and precision were 77.27%,83.33%,75.00%and 55.56%to predict the invasiveness of *** RHOU,the AUC was 0.757(95%CI:0.599-0.915,P=0.007),the accuracy,sensitivity,specificity and precision were 72.73%,83.33%,68.75%and 50.00%.In addition,the mRNA levels of CDK6 and RHOU in serum exosomes were significantly positively correlated(r=0.935,P<0.001).After combination of the cut-off scores of the two genes,the accuracy,sensitivity,specificity and precision were 81.82%,83.33%,81.25%and 62.50%.Conclusions CDK6 and RHOU mRNA in serum exosomes can be used as markers for predicting invasiveness of *** of the two genes performs better in distinguishing INF-PAs from *** results indicate CDK6 and RHOU play important roles in the invasiveness of NF-PAs,and the established diagnostic method is valua

关键词： pituitary adenoma invasiveness exosome droplet digital PCR biomarkers RHOU CDK6

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抑制BHK21细胞STYK1/NOK基因的转录组分析

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天津医药 2020年第4期48卷 241-247页

作者：高婧雅张骊谢炎郭庆军田大治李俊杰蒋文涛刘力天津医科大学一中心临床学院 300192 天津市第一中心医院移植外科卫生部危重病急救医学重点实验室天津市器官移植重点实验室天津市器官移植研究中心中国医学科学院移植医学重点实验室北京协和医学院中国医学科学院基础医学研究所微生物系

目的转录组分析抑制丝氨酸-苏氨酸-酪氨酸激酶1(STYK1/NOK)后仓鼠肾正常细胞BHK21的基因表达,并分析其可能作用的信号通路.方法BHK21细胞分为空载体组(转染6μg空载体pBs/U6)、低转染浓度组(2μg si-STYK1/NOK质粒+4μg空载体pBs/U6)和... 详细信息

目的转录组分析抑制丝氨酸-苏氨酸-酪氨酸激酶1(STYK1/NOK)后仓鼠肾正常细胞BHK21的基因表达,并分析其可能作用的信号通路.方法BHK21细胞分为空载体组(转染6μg空载体pBs/U6)、低转染浓度组(2μg si-STYK1/NOK质粒+4μg空载体pBs/U6)和高转染浓度组(6μg si-STYK1/NOK质粒).转染48 h后,Western blot检测STYK1/NOK蛋白表达,基于检测结果,选取空载体组和高转染浓度组提取总RNA进行转录组测序.将测序所得的序列进行过滤比对,获得差异表达基因后,应用R软件进行生物功能(GO)分析和KEGG信号通路分析.应用STRING蛋白质互作数据库中的互作关系进行差异基因蛋白互作网络的分析.采用qRT-PCR验证关键差异表达基因亚甲基四氢叶酸脱氢酶2(Mthfd2)、转录激活因子5(Atf5),ⅡA分泌型磷脂酶A2(Pla2g2a)、6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-双磷酸酶3(Pfkfb3)的表达.CCK-8法检测空载体组和高转染浓度组细胞增殖情况.结果Western blot结果表明高转染浓度组明显抑制STYK1/NOK蛋白表达.高转染浓度组与空载体组相比,共发现差异表达基因44个,包括19个上调基因和25个下调基因.GO富集分析发现差异表达基因主要影响生物调控、细胞进程、代谢调控、细胞生物过程、细胞、细胞部分、胞外区、配体和催化活性.KEGG通路分析发现差异表达基因主要集中作用于免疫系统、癌症、细胞周期、信号转导和氨基酸代谢等方面.qRT-PCR结果表明,高转染浓度组Mthfd2、Atf5的相对表达量显著上调(P<0.05),Pfkfb3、Pla2g2a的相对表达量显著下调(P<0.05),与测序结果相一致.细胞增殖实验表明高转染浓度组细胞增殖明显高于空载体组(P<0.01).结论抑制BHK21细胞STYK1/NOK表达后,致使BHK21细胞原癌基因表达增强,抑癌基因表达减少,促进细胞增殖.

关键词：转录组基因表达谱丝氨酸-苏氨酸-酪氨酸激酶1 BHK21细胞差异表达基因

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