检索结果-内蒙古大学图书馆

中国生物制品学杂志 2021年第12期34卷 1516-1519页

作者：张学(综述) 江文文(审校) 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

腺苷酸环化酶毒素(adenylate cyclase toxin,ACT)是百日咳杆菌分泌的重要毒力因子之一,可通过削弱吞噬细胞、中性粒细胞和T细胞等免疫细胞的杀菌能力来协助百日咳杆菌逃避宿主免疫系统的攻击。虽然ACT是一种具有腺苷酸环化酶活性和溶血... 详细信息

腺苷酸环化酶毒素(adenylate cyclase toxin,ACT)是百日咳杆菌分泌的重要毒力因子之一,可通过削弱吞噬细胞、中性粒细胞和T细胞等免疫细胞的杀菌能力来协助百日咳杆菌逃避宿主免疫系统的攻击。虽然ACT是一种具有腺苷酸环化酶活性和溶血素活性的毒性蛋白,但可通过基因技术方法去除其毒力因素,成为无细胞百日咳(acel-l ular pertussis,aP)疫苗的一种潜在保护性抗原和佐剂。本文就ACT的生物特性及其在aP疫苗中的潜在应用作一综述。

关键词：腺苷酸环化酶毒素生物特性百日咳疫苗免疫原性佐剂

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抗片形吸虫病疫苗的研究进展

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中国生物制品学杂志 2024年第4期37卷 497-504页

作者：李慈怀(综述) 陈凤孙强明(审校) 大理大学公共卫生学院云南大理671000 云南省大理白族自治州血吸虫病防治研究所云南大理671000 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

片形吸虫病是由片形吸虫感染引起的人畜共患病,该病会引发机体的急慢性损伤,严重危害畜牧业发展,造成极大经济损失,目前用于治疗片形吸虫病的药物单一,且有耐药性产生,因此,急需更经济、可行的方式对家畜片形吸虫进行防治,以减少或避免... 详细信息

片形吸虫病是由片形吸虫感染引起的人畜共患病,该病会引发机体的急慢性损伤,严重危害畜牧业发展,造成极大经济损失,目前用于治疗片形吸虫病的药物单一,且有耐药性产生,因此,急需更经济、可行的方式对家畜片形吸虫进行防治,以减少或避免人畜患病。疫苗是一种经济、有效的预防病原体感染的手段,有可能在片形吸虫病的预防中起到重要作用。本文就片形吸虫的抗原免疫应答机制及其疫苗研发现状作一综述,以期为片形吸虫病的防治提供科学参考和理论依据。

关键词：片形吸虫病危害疫苗

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云南省6株柯萨奇A组16型病毒的全基因组分析

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热带医学杂志 2025年第3期25卷 337-342,F0003页

作者：楚昭阳陈俊薇冯昌增刘煜菡张名李丽马绍辉中国医学科学院&北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 云南大学生命科学学院云南昆明650504 昆明市妇幼保健院检验科云南昆明650031

目的分析2022年云南省6株柯萨奇A组16型病毒(CVA16)分离株的全基因组特征,为CVA16的分子流行病学研究及相关疾病的防控提供参考数据。方法2022年从昆明市妇幼保健院的200份手足口病患儿临床粪便样品中共分离到22株CVA16毒株,将22株CVA1... 详细信息

目的分析2022年云南省6株柯萨奇A组16型病毒(CVA16)分离株的全基因组特征,为CVA16的分子流行病学研究及相关疾病的防控提供参考数据。方法2022年从昆明市妇幼保健院的200份手足口病患儿临床粪便样品中共分离到22株CVA16毒株,将22株CVA16的病毒蛋白1(VP1)区域进行扩增及测序,发现该22株CVA16的VP1基因的同源性很高,均达到95%以上,随机选择6株进行全基因组扩增和测序。通过MEGA7.0、DNAStar7.1和SimPlot3.5.1等软件对全基因组序列进行分析。结果6株分离株分别命名为167/YN/CHN/2022、174/YN/CHN/2022、183/YN/CHN/2022、217/YN/CHN/2022、218/YN/CHN/2022和231/YN/CHN/2022,经对扩增的部分VP1进行鉴定,均为CVA16。6条CVA16基因序列已上传至GenBank数据库,基因登录号为PP532683-PP532688。6株CVA16分离株的全基因组长为7358~7405 nt,5’UTR区均为741 nt,3’UTR区长为35~82 nt,5’UTR区和3’UTR区之间是一个长为6582 nt的开放阅读框,与其他CVA16相比未见核苷酸插入与缺失,编码区编码一个含有2194个氨基酸残基的多聚蛋白。根据VP1系统进化分析,6株CVA16分离株均位于B1a进化分支。该6株分离株之间的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为94.8%~98.6%和97.9%~99.3%,与中国内地其他流行株的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为86.5%~97.8%和97.5%~99.5%。与其原型株相比,6株毒株共发生44处氨基酸变异,且在BC环和EF环发生氨基酸置换。重组分析显示,该6株CVA16分离株重组信号较弱,可能未发生新的重组。结论从2022年云南省手足口病患儿临床样本中分离到的6株CVA16均属于B1基因亚型的B1a分支。

关键词：柯萨奇A组16型病毒全基因组序列分析

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单纯疱疹病毒2型衣壳支架蛋白ICP35原核表达载体的构建及其表达特性分析

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微生物与感染 2022年第1期17卷 9-17页

作者：王建斌李雪琦王丽春吴化叶程继帅牟唐维李琦涵中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

本研究旨在构建单纯疱疹病毒2型(herpes simplex virus type 2,HSV-2)衣壳支架蛋白ICP35的原核表达载体,并分析其在HSV-2增殖中的表达特性。以HSV-2基因组DNA为模板,采用聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增HSV-2 ICP35的编码基因UL26.5,并克隆至原核表达载体pET-32a(+),转化大肠埃希菌BL21(DE3)进行诱导表达,将纯化的重组ICP35免疫家兔后获得抗体,采用免疫荧光检测ICP35在HSV-2增殖中的表达特性。结果显示,HSV-2 UL26.5基因的PCR产物大小约为1065 bp,原核表达重组蛋白的相对分子质量约为6.3×10^(4),免疫家兔的血清抗体可特异性识别HSV-2 ICP35。免疫荧光检测结果显示,HSV-2 ICP35可在感染后8 h出现于细胞核周围,12 h表达量进一步增加并向细胞核内聚集,16 h后在细胞核、细胞质内均可检测到聚集成斑点状的衣壳支架蛋白。结果表明,HSV-2 ICP35原核表达载体的成功构建及对其在HSV-2增殖中表达特性的分析,将为研究UL26.5基因的功能、蛋白相互作用、病毒与宿主的相互作用及筛选药物靶标等奠定基础。

关键词：单纯疱疹病毒2型衣壳支架蛋白ICP35 UL26.5 原核表达载体表达特性

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2019年云南省手足口病相关的柯萨奇病毒A组10型分离株的全基因组分析

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中国病毒病杂志 2022年第4期12卷 290-295页

作者：许丹菡郭伟张名冯昌增唐靖月马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

目的分析2019年云南省昆明市手足口病相关的2株柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus A10,CVA10)分离株3R3/YN/CHN/2019(简称3R3)和4R3/YN/CHN/2019(简称4R3)的基因组特征。方法对云南省2019年2例手足口病患儿的临床样本中分离到的2株CVA1... 详细信息

目的分析2019年云南省昆明市手足口病相关的2株柯萨奇病毒A组10型(coxsackievirus A10,CVA10)分离株3R3/YN/CHN/2019(简称3R3)和4R3/YN/CHN/2019(简称4R3)的基因组特征。方法对云南省2019年2例手足口病患儿的临床样本中分离到的2株CVA10毒株进行全基因组序列测定。利用MEGA7.0.26、Geneious9.1.4和SimPlot3.5.1软件分析全基因序列。结果3R3和4R3毒株的基因组全长均为7413 nt,全基因组核苷酸和氨基酸序列相似性分别为97.5%和99.4%。与CVA10原型株AF081300/Kowalik/USA全基因组进行比对分析,核苷酸序列相似性均为79.6%,而氨基酸序列相似性分别为95.1%和95.3%;与其他中国大陆CVA10全基因组序列的核苷酸相似性为93.2%~98.2%,氨基酸相似性为98.5%~99.4%。进化分析发现,2株毒株与近年来中国大陆CVA10流行株同属F基因型,位于F3亚型,与分离株KF999764/JL12-51/CHN/2012的同源性最高,形成一个小分支。经Simplot软件分析未发现明显的基因重组。结论3R3和4R3株属F3基因亚型。CVA10在中国大陆有不同传播链存在。

关键词：手足口病柯萨奇病毒A组10型全基因组进化分析

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Ⅰ型登革病毒在中国的传播及进化

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中国生物制品学杂志 2021年第5期34卷 522-527页

作者：李代英鲁明朱海莲何丽存顾冉张娟陈俊英潘玥孙强明中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118 云南省虫媒传染病防控研究重点实验室云南普洱665000

目的研究近年来中国境内登革病毒(Dengue virus,DENV)流行株分布与东南亚株的联系,分析传播规律,追溯传入源头,探讨其系统发育和分子进化特征。方法以公共卫生科学数据中心公布的病例数分析国内Ⅰ型DENV(Dengue virus-1,DENV-1)感染及... 详细信息

目的研究近年来中国境内登革病毒(Dengue virus,DENV)流行株分布与东南亚株的联系,分析传播规律,追溯传入源头,探讨其系统发育和分子进化特征。方法以公共卫生科学数据中心公布的病例数分析国内Ⅰ型DENV(Dengue virus-1,DENV-1)感染及分布情况,收集NCBI中自1985年来在中国境内流行的405株DENV-1毒株全基因序列,使用在线工具MAFFT进行序列对比,并通过ATGC网站在线PhyML构建进化树。基于进化树分析结果挑选40余个代表性毒株与东南亚代表株序列,使用MEGA X软件进行系统进化树分析;随后对中国DENV-1流行株序列进行重组进化分析。结果自2004—2017年间国内共有66 623人感染登革热,其中广东省每年均有DENV-1病例报道,自2012年以来,DENV-1引起的病例数呈现了迅速增加的情况,地域范围不断扩大。国内流行株与东南亚国家流行株存在密切联系,不断出现输入病例,同时也存在广东省向东南亚地区输出DENV-1的可能。云南省存在由边境从中南半岛地区国家传入DENV流行株,并之后在云南长期流行的现象。云南省输入毒株与广东省输入的DENV毒株差异较大,可认为其DENV毒株输入来源不同。24个代表株的重组分析结果表明,虽然2017年广东株MN018297部分序列与2014年广东株KP723476相似,但未发现更多的重组现象。结论通过将中国境内DENV-1毒株汇总后进行系统进化树的构建,分析并挑选出代表性株后进行分析,发现了DENV毒株传入中国主要经由的省份,并结合氨基酸位点的比对分析DENV在中国境内流行分支,为研究DENV-1在中国的传播和进化提供了参考。

关键词：登革病毒登革热传播系统进化分析

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一株埃可病毒16型510/YN/CHN/2010的全基因组分析

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中国病原生物学杂志 2021年第11期16卷 1239-1243页

作者：郭伟许丹菡冯昌增张名鲁明朱海莲保国红马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南省第一人医院

目的分析一株埃可病毒16型(Echovirus 16,E16)云南分离株510/YN/CHN/2010全基因组序列及其遗传特性。方法设计针对E16的引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒目的基因并测序,利用BioEdit 7.2.3、MEGA 7.0和Simplot 3.5.1软件分析其全基因组... 详细信息

目的分析一株埃可病毒16型(Echovirus 16,E16)云南分离株510/YN/CHN/2010全基因组序列及其遗传特性。方法设计针对E16的引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒目的基因并测序,利用BioEdit 7.2.3、MEGA 7.0和Simplot 3.5.1软件分析其全基因组。结果E16510/YN/CHN/2010全基因组核苷酸序列全长7432 nt,是编码含2196个氨基酸的多聚蛋白。其全VP1和全基因组与原型株Harrington的核苷酸和氨基酸同源性分别为80.68%、49.33%和81.26%、97.26%。与其他埃可病毒原型株的全基因组核苷酸和氨基酸同源性分别为75.72%~88.44%和83.01%~87.65%。系统进化分析将E16分为3个基因型,分离株510/YN/CHN/2010和其他中国分离株均属于B基因型。重组分析显示,510/YN/CHN/2010株可能在非结构编码区的P2段重组。结论510/YN/CHN/2010分离株为E16 B基因型,可能为重组株。

关键词：埃可病毒16型全基因组测序重组分析进化分析

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2022年昆明市407例手足口病病例病原学监测分析

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中国病毒病杂志 2024年第1期14卷 71-76页

作者：李丽张倩马绍辉张磊昆明市妇幼保健院检验科云南昆明650031 昆明市儿童医院检验科云南昆明650100 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

目的了解2022年云南省昆明市手足口病病例的病原构成,为手足口病的预防和控制提供科学依据。方法收集2022年6―9月昆明市儿童医院诊断为手足口病患儿的407份粪便样品,采用巢式反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase cha... 详细信息

目的了解2022年云南省昆明市手足口病病例的病原构成,为手足口病的预防和控制提供科学依据。方法收集2022年6―9月昆明市儿童医院诊断为手足口病患儿的407份粪便样品,采用巢式反转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法对粪便样品进行肠道病毒核酸检测,利用通用肠道病毒引物扩增其VP1区基因并测序,采用SPSS 11.5,肠道病毒定型和Mega 6.0等软件分析数据。结果407份粪便样品中,肠道病毒阳性检出率为74.69%(304/407),有13种肠道病毒被检测到,其中,柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)所占比例最高,达42.43%(129/304),其次是CVA16(35.53%,108/304)、CVA5(11.84%,36/304)、CVA12(2.30%,7/304)、CVA2(1.97%,6/304)、CVA10(1.31%,4/304),CVA4、柯萨奇病毒B组5型(coxsackievirus B5,CVB5)和埃可病毒11型(echovirus 11,E11)均各占0.99%(3/304),CVB2占0.66%(2/304),CVA8、E3和肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV-A71)均各占0.33%(1/304)。其中CVA6和CVA16分别属于B1a和D3a基因型。结论2022年昆明市儿童医院手足口病由13种肠道病毒引起,其中CVA6和CVA16为优势病原体并属于中国流行株。

关键词：手足口病病原学肠道病毒柯萨奇病毒A组6型柯萨奇病毒A组16型系统发育

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2016年云南省埃可病毒7型分离株K1641/YN/CHN/2016全基因组序列分析

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中国病毒病杂志 2022年第1期12卷 42-46页

作者：张名许丹菡冯昌增郭伟王晓辉何陆涛马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

目的对2016年云南省埃可病毒7型(echovirus 7,E-7)的分离株K1641/YN/CHN/2016(简称K1641)进行全基因组序列测定并分析其分子变异和遗传进化特性。方法利用KMB17细胞分离病毒,提取病毒RNA,进行RT-PCR,并测序拼接获得全基因组序列。利用... 详细信息

目的对2016年云南省埃可病毒7型(echovirus 7,E-7)的分离株K1641/YN/CHN/2016(简称K1641)进行全基因组序列测定并分析其分子变异和遗传进化特性。方法利用KMB17细胞分离病毒,提取病毒RNA,进行RT-PCR,并测序拼接获得全基因组序列。利用Mega 5、Geneious Basic 5.4.1和SimPlot 3.5.1等软件分析全基因组序列。结果获得的K1641株全基因组序列长度为7 428 bp,编码含2 193个氨基酸的多聚蛋白。K1641全基因组核苷酸和氨基酸同源性与中国分离株40/Longyou/ZJ最为同源,分别为95.9%和98.9%;而与其他中国E-7流行株VP1的核苷酸和氨基酸同源性分别为95.1%~99.7%和82.5%~99.3%;与原型株VP1的核苷酸和氨基酸同源性为78.4%和93.1%。K1641与其他E-7毒株的各区段核苷酸一致性和氨基酸同源性分别为73.5%~97.3%和85.3%~100.0%,K1641与40/Longyou/ZJ的各区段核苷酸一致性和氨基酸同源性均超过90.0%,并且,氨基酸的同源性要高于核苷酸一致性。基于E-7全长VP1序列的种系进化分析,可分为8个簇,本次分离株K1641与2013中国分离株40/Longyou/ZJ关系较近,属于进化树上的一个分支。进行相似性分析,在位置350~600,与E-6/RO-24-9-79(LS451294)显示出99%的高相似性;其他位置与中国分离株40/Longyou/ZJ有较高(>92%)的相似性。结论 K1641分离株为E-7,与E-6/RO-24-9-79株可能存在重组事件发生,对E-7遗传特性研究具有参考意义。

关键词：埃可病毒7型全基因组序列分型种系发生

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柯萨奇病毒B组1型TaqMan一步法荧光定量 RT-PCR检测方法的建立

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中国病毒病杂志 2022年第1期12卷 26-30页

作者：许丹菡张名冯昌增郭伟何秀莲张光贤禇嘉祐杨昭庆马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明650118

目的建立柯萨奇病毒B组1型(coxsackievirus B1,CV-B1)特异的TaqMan一步法荧光定量RT-PCR检测方法。方法根据CV-B1的VP1序列,设计特异性引物和TaqMan探针。将目的基因插入pMD19;载体,在DH5α感受态细胞中扩增,体外转录后获得RNA标准品... 详细信息

目的建立柯萨奇病毒B组1型(coxsackievirus B1,CV-B1)特异的TaqMan一步法荧光定量RT-PCR检测方法。方法根据CV-B1的VP1序列,设计特异性引物和TaqMan探针。将目的基因插入pMD19;载体,在DH5α感受态细胞中扩增,体外转录后获得RNA标准品,建立标准曲线。并对检测方法的灵敏度、特异性、重复性进行评价。结果该方法在10^(2)-10^(11)拷贝/μl的模板范围内具有良好的线性关系(R^(2)=1.000),扩增效率E=107.5%。灵敏度达1×10^(2)拷贝/μl,只对CV-B1有特异性扩增曲线,且重复性较好。结论建立的实时荧光定量RT-PCR方法具有较高的灵敏度、特异性和重复性,可作为CV-B1的快速检测和绝对定量分析。

关键词：柯萨奇病毒B组1型 TaqMan 实时荧光定量PCR 分子诊断

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