检索结果-内蒙古大学图书馆

中国比较医学杂志 2013年第7期23卷 36-40,49页

作者：黄晓燕徐娟王文广殷安国李晓飞孙晓梅夏雪山代解杰中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室树鼩种子资源中心云南昆明650118 昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明650500

目的建立检测树鼩IL-2基因TaqMan探针实时荧光定量PCR方法。方法以经ConA诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为材料,设计特异性引物,通过RT-PCR技术克隆出树鼩IL-2基因,以构建的树鼩IL-2基因质粒为标准品,建立标准曲线,并进行灵敏度检测。结... 详细信息

目的建立检测树鼩IL-2基因TaqMan探针实时荧光定量PCR方法。方法以经ConA诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为材料,设计特异性引物,通过RT-PCR技术克隆出树鼩IL-2基因,以构建的树鼩IL-2基因质粒为标准品,建立标准曲线,并进行灵敏度检测。结果建立了树鼩IL-2基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法,此法检测灵敏度高,线性范围可达102～109拷贝/ul。结论成功建立了树鼩IL-2实时荧光定量PCR方法,此方法灵敏度高、特异性强,检测周期短,为探讨IL-2作用的分子作用机制奠定基础。

关键词：树鼩 IL-2 实时荧光定量 PCR

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树鼩IL-2全长编码序列的克隆及分子特征分析

树鼩IL-2全长编码序列的克隆及分子特征分析

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中国西部第十二届实验动物管理与学术研讨会

作者：黄晓燕徐娟王文广殷安国李晓飞孙晓梅夏雪山代解杰中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所树鼩种质资源中心云南省重大传染病疫苗研发重点实验室云南昆明 650118 昆明理工火学生命科学与技术学院云南昆明 650500

树鼩作为多种人类疾病模型已受到广泛关注,而免疫因子对于树鼩模型评价至关重要,但目前对其白细胞介素-2(IL-2)的研究鲜有报道.该实验以经ConA (Concanavalin)诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为模板,RT-PCR克隆出465 bp的树鼩IL-2全长编码... 详细信息

树鼩作为多种人类疾病模型已受到广泛关注,而免疫因子对于树鼩模型评价至关重要,但目前对其白细胞介素-2(IL-2)的研究鲜有报道.该实验以经ConA (Concanavalin)诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为模板,RT-PCR克隆出465 bp的树鼩IL-2全长编码序列,并采用Clustal W软件分析其序列和分子特征.结果表明树鼩IL-2cDNA编码一个由154个氨基酸组成的蛋白质,其cDNA及氨基酸序列与人的同源性分别为93％及80％,且其整体结构与人IL-2相似.MEGA5.0软件构建的进化树表明,树鼩与人及恒河猴的亲缘关系较近.Pymol软件对树鼩和人IL-2氨基酸序列进行的三维结构模建表明,两者的IL-2分子三维空间结构基本相似,表面火部分区域所带电荷相同,但在某些区域差异较火,且树鼩多出一个糖基化位点,这些差异对抗体的结合可能存在影响.该研究为今后树鼩IL-2单克隆抗体的制备及功能研究奠定了基础.

关键词：人类疾病模型树鼩白细胞介素-2 基因序列单克隆抗体分子特征

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2008年柯萨奇病毒A组16型昆明分离株KMM08全基因组序列分析

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中华流行病学杂志 2012年第2期33卷 220-225页

作者：马绍辉潘玥何春艳陈俊英施海晶孙强明李琦涵中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的分析柯萨奇病毒A组16型（CA16）昆明分离株KMM08全基因序列，了解其遗传特性。方法设计针对CA16引物，提取病毒RNA，RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列。利用Mega4．1，RDP3和SimPlot3．5．1等软件分析全基因序列。结果获得KMM08全... 详细信息

目的分析柯萨奇病毒A组16型（CA16）昆明分离株KMM08全基因序列，了解其遗传特性。方法设计针对CA16引物，提取病毒RNA，RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列。利用Mega4．1，RDP3和SimPlot3．5．1等软件分析全基因序列。结果获得KMM08全基因组核苷酸序列长度为7409bp，编码含2193个氨基酸残基的多聚蛋白；与其他CA16参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为79．0％～98．2％和94．5％～99．3％，其中SZ—HK08-3与国际标准株G10核苷酸和氨基酸同源性分别79．1％和94．8％；而与肠道病毒71型（EV71）标准株BrCr同源性分别为78．7％和89．0％。在各个区段上，KMM08与***08—3的核苷酸和氨基酸同源性分别为97．0％～99．0％和98．0％-100．0％，同源性最高；与G10的核苷酸和氨基酸同源性分别为74．2％～86．9％和90．9％～97．0％；与Ev71BrCr核苷酸和氨基酸同源性分别在65．0％～84．9％和71．0％。95．2％。进化分析发现KMM08属于B基因型的一个分支。RDP3和SimPlot3．5．1软件分析发现Tainan．5079—98序列发现重组信号，而KMM08未发现。结论KMM08分离株为B基因型；CA16与EV71在非结构区发生重组。

关键词：柯萨奇病毒A组16型全基因组序列分析

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2009年云南省2株肠道病毒71型分离株全基因组序列遗传特性分析

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病毒学报 2012年第2期28卷 108-113页

作者：李华邵聪文潘玥柯华昕马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

对2009年云南省肠道病毒71型分离株KMM09和KM186-09进行全基因组序列测序,并与我国及其它国家流行的EV71基因型进行比较和进化分析。KMM09和KM186-09基因组长为7409bp,编码2193个氨基酸,VP1系统进化分析显示2009年云南分离株属于C4基因... 详细信息

对2009年云南省肠道病毒71型分离株KMM09和KM186-09进行全基因组序列测序,并与我国及其它国家流行的EV71基因型进行比较和进化分析。KMM09和KM186-09基因组长为7409bp,编码2193个氨基酸,VP1系统进化分析显示2009年云南分离株属于C4基因型的C4a亚型。在结构区,与其它基因型相比较,C基因型之间的核苷酸和氨基酸的同源性高于其它基因型;而在非结构区,C4与B基因型和CA16原型株G10同源性高于其它C基因亚型。通过RDP3重组软件和blast比对分析,发现EV71C4基因型与B3基因型,与CA16原型株G10的基因组在非结构区存在重组。EV71全基因组序列的比较和分析,对了解引起我国手足口病暴发或流行C4基因亚型EV71毒株的遗传特性具有重要意义。

关键词：肠道病毒71型全基因组遗传特性

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树鼩呼肠孤病毒(Tupaia Orthoreovirus)的分离鉴定

树鼩呼肠孤病毒(Tupaia Orthoreovirus)的分离鉴定

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中国西部第十二届实验动物管理与学术研讨会

作者：徐娟黄晓燕李晓飞王文广殷安国夏雪山孙晓梅代解杰中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室树鼩种质资源中心云南昆明 650118 昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明 650500

致病性病毒严重危害树鼩(Tree shrew,Tupaia)生命健康,但却鲜见有关树鼩自然感染病毒的报道.该研究采集6份因腹泻死亡的野生树鼩粪便,用Vero细胞进行病毒分离,72 h后细胞发生病变,特征为颗粒增多、破碎、变圆固缩、拉网及脱落等;电镜观... 详细信息

致病性病毒严重危害树鼩(Tree shrew,Tupaia)生命健康,但却鲜见有关树鼩自然感染病毒的报道.该研究采集6份因腹泻死亡的野生树鼩粪便,用Vero细胞进行病毒分离,72 h后细胞发生病变,特征为颗粒增多、破碎、变圆固缩、拉网及脱落等;电镜观察显示该病毒为球形,双层农壳,完整直径～75 nm.纯化病毒经核酸PAGE 电泳后呈现10个核酸节段,并为典型的3:3:4排列.哺乳动物呼肠孤病毒(mammalian orthoreovirus,MRV) L1基因保守区RT-PCR检测、序列分析及进化树构建结果表明,该病毒株属于MRV,且与来源于蝙蝠的呼肠孤病毒分离株(T3/Bat/Germany/342/08)同源性最高.MRV是人兽共患病病毒,该实验首次从树鼩体内成功分离到MRV,对今后研究制定实验树鼩病毒学控制标准具有指导意义,同时为有效预防该病毒在树鼩与人类之间传播提供了实验依据.

关键词：树鼩呼肠孤病毒分离鉴定

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云南省人乳头状瘤病毒16型E6/E7基因的变异分析

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病毒学报 2012年第6期28卷 645-651页

作者：杨丽娟岳耀斐陈俊英潘玥赵玉娇马绍辉孙强明中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

研究人乳头状瘤病毒16型E6和E7基因在云南省的变异情况。采集获得2 000例妇科门诊样品,提取DNA,以MY09/MY11为外引物,GP5+/GP6+为内引物,采用nest-PCR法对样品HPV-DNA高变区L1区的相应基因进行扩增、测序和分型,筛选得到20例HPV-16型病... 详细信息

研究人乳头状瘤病毒16型E6和E7基因在云南省的变异情况。采集获得2 000例妇科门诊样品,提取DNA,以MY09/MY11为外引物,GP5+/GP6+为内引物,采用nest-PCR法对样品HPV-DNA高变区L1区的相应基因进行扩增、测序和分型,筛选得到20例HPV-16型病毒DNA,对其进行E6和E7基因特异性扩增,测序。结果显示20例HPV-16型E6基因中有10例在178位核苷酸发生碱基突变,突变频率为50%,E7基因中有10例在647位核苷酸发生碱基突变,突变频率为50%。进化树分析结果表明在云南省流行的HPV-16型中主要为亚洲变异型,没有发现非洲1型,非洲2型。

关键词：子宫颈癌 HPV-16 进化树分析基因变异 E6基因 E7基因

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云南省2009年埃可病毒6型分离株KM57—09全基因序列分析

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中华流行病学杂志 2012年第9期33卷 951-955页

作者：朱艳菊潘玥陈俊英马忠飞邓新强刘建生马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的对云南埃可病毒6型（Ech06）分离株KM57—09全基因序列进行分析和研究，了解其遗传特性。方法设计针对Ech06引物，提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列。利用Mega5．05、RDP3和SimPlot3．5．1等生物学软件分析全基因序... 详细信息

目的对云南埃可病毒6型（Ech06）分离株KM57—09全基因序列进行分析和研究，了解其遗传特性。方法设计针对Ech06引物，提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列。利用Mega5．05、RDP3和SimPlot3．5．1等生物学软件分析全基因序列。结果获得KM57—09全基因组核苷酸序列长度为7419bp，编码含2191个氨基酸残基的多聚蛋白；与其他Ech06参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为79．3％～80．2％和93．3％～94．4％，与原型株D’Amor核苷酸和氨基酸同源性分别为79．3％和93．6％。在基因组各个区段上，Ech06KM57—09分离株的2C和3A区，与HN-2-E25核苷酸同源性最高，分别为86-3％和85．0％，而其5’UTR、VP4、3D和3’UTR区则与CoxB5-Henan-2010核苷酸同源性最高，分别为91．7％、81．2％、89．7％和96．9％。在VP1区上，与中国其他省份分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为80．0％～96．0％和95．8％～99．0％，而与其他国家分离株的核苷酸和氨基酸同源性分别为77．6％～96．0％和95．2％-99．0％。进化分析发现Ech06可分为5个分支，中国分离株分属C和E分支，其中KM57—09属于E分支，且5个分支之间核苷酸的差异为15．6％～23．3％。3D基因序列种系进化分析以及RDP3和SimPlot3．5．1软件分析发现KM57—09序列在非结构区可能存在重组。结论Ech06可分为5个基因型，KM57—09分离株属于E基因型；中国大陆曾存在不同Ech06株传播链的流行。

关键词：埃可病毒6型全基因组序列分析

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树鼩IL-2 TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立

树鼩IL-2 TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立

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中国西部第十二届实验动物管理与学术研讨会

作者：黄晓燕徐娟王文广殷安国李晓飞孙晓梅夏雪山代解杰中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室树鼩种子资源中心云南昆明 650118 昆明理工大学生命科学与技术学院云南昆明 650500

目的：建立检测树鼩IL-2基因TaqMan探针实时荧光定量PCR方法.方法：以经ConA诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为材料,设计特异性引物,通过RT-PCR技术克隆出树鼩IL-2基因,以构建的树鼩IL-2基因质粒为标准品,建立标准曲线,并进行灵敏度检测.... 详细信息

目的：建立检测树鼩IL-2基因TaqMan探针实时荧光定量PCR方法.方法：以经ConA诱导培养的树鼩淋巴细胞总RNA为材料,设计特异性引物,通过RT-PCR技术克隆出树鼩IL-2基因,以构建的树鼩IL-2基因质粒为标准品,建立标准曲线,并进行灵敏度检测.结果：建立了树鼩IL-2基因mRNA表达实时荧光定量PCR检测方法,此法检测灵敏度高,线性范围可达102～109拷贝/ul.结论：成功建立了树鼩IL-2实时荧光定量PCR方法,此方法灵敏度高、特异性强,检测周期短,为探讨IL-2作用的分子作用机制奠定基础.

关键词：树鼩人类疾病模型免疫调节白细胞介素-2 实时荧光定量PCR

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烟酰胺腺嘌呤二核苷酸与氢氧化铝联合佐剂对HBsAg诱导小鼠体液免疫应答的影响

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中国生物制品学杂志 2012年第9期25卷 1143-1146页

作者：王琳王海漩李建芳李彦涵胡凝珠胡云章中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所疫苗研究室云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的研究烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide adenine dinucleotide,NAD)与氢氧化铝联合佐剂对HBsAg诱导小鼠体液免疫应答的影响。方法将NAD与氢氧化铝按不同剂量联合后,与不同剂量的HBsAg混合,分别经肌肉注射免疫ICR小鼠1针或2针(间隔2... 详细信息

目的研究烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(Nicotinamide adenine dinucleotide,NAD)与氢氧化铝联合佐剂对HBsAg诱导小鼠体液免疫应答的影响。方法将NAD与氢氧化铝按不同剂量联合后,与不同剂量的HBsAg混合,分别经肌肉注射免疫ICR小鼠1针或2针(间隔2周),每只注射0.2 ml,并设阴性对照组(生理盐水)、单纯抗原对照组、单纯铝佐剂对照组和单纯NAD对照组,共23组,每组6只。分别于末次免疫后2、4、6、8、10、12周采血,分离血清,采用ELISA法检测小鼠血清中抗HBsAg IgG水平;试验期内,观察小鼠是否发生异常状况;14周后,取最佳剂量免疫组及阴性对照组小鼠心、肝、脾、肺组织做组织切片,进行病理分析。结果阴性对照组在各时间点均未检测到抗HBsAg IgG抗体,除联合佐剂12组外,其余各组血清抗HBsAg IgG抗体水平均在末次免疫后第6周达峰值,随着时间的延长,抗体水平呈下降趋势;联合佐剂14组(HBsAg 2μg+氢氧化铝100μg+NAD 2.5μg)产生的抗体水平最高,且持续时间较长,其对HBsAg的体液免疫增强效应显著优于单纯抗原对照组、单纯铝佐剂对照组及单纯NAD佐剂对照组(P<0.05)。试验期内,各组小鼠均未出现异常反应;最佳剂量免疫组(14组)及阴性对照组组织切片观察结果显示,均为发生病变。结论 NAD与氢氧化铝联合佐剂能显著增强HBsAg诱导的小鼠特异性体液免疫应答,在免疫剂量范围内,联合佐剂安全性良好。

关键词： NAD 氢氧化铝佐剂乙型肝炎表面抗原体液免疫应答

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ERAP1基因多态性与非小细胞肺癌遗传易感性的关联研究

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中华临床医师杂志（电子版） 2013年第22期7卷 41-43页

作者：曹丹凤马千里周竞贤钱旭李盈甫俞建昆姚宇峰史荔中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118 昆明医科大学第三附属医院胸外科昆明市延安医院心血管外科昆明医科大学第一附属医院干疗科

目的探讨内质网氨肽酶1(endoplasmic reticulum aminopeptidase 1,ERAP1)基因多态性与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的相关性。方法入选NSCLC患者224例,健康体检人群207例。采用Taq Man探针基因分型方法对ERAP1基因SNP rs26653和rs26618两个位点进行基因分型,并构建单倍型,评估上述两个SNPs及单倍型与NSCLC的相关性。结果病例组和对照组ERAP1基因rs26618和rs26653基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05)。病例组和对照组rs26618/rs26653单倍型CG、TC的单倍型频率差异有统计学意义(P<0.05)。结论 ERAP1基因与NSCLC的发生有关,rs26618/rs26653-CG单倍型可能增加NSCLC的患病风险,rs26618/rs26653-TC单倍型对NSCLC可能具有保护性作用。

关键词：癌,非小细胞肺内质网氨肽酶类多态性,单核苷酸单倍性

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