检索结果-内蒙古大学图书馆

中华微生物学和免疫学杂志 2016年第5期36卷 333-339页

作者：王艳翠李嘉琪王晶晶郭磊宋杰宁若彤郑惠文王辉刘龙丁中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的了解肠道病毒68（EV68）中国流行株VP1基因序列的特征。方法通过Clustal W法与多个国家EV68的VP1核酸序列进行比对，邻接法（Neighbor-Joining）构建系统进化树，与标准株Fermon相比，对该段区域编码的氨基酸序列进行分析。结果截至... 详细信息

目的了解肠道病毒68（EV68）中国流行株VP1基因序列的特征。方法通过Clustal W法与多个国家EV68的VP1核酸序列进行比对，邻接法（Neighbor-Joining）构建系统进化树，与标准株Fermon相比，对该段区域编码的氨基酸序列进行分析。结果截至2015年底，中国已经分离出80株EV68。在进化上，突变主要发生在BC和DE环中，中国分离株VP1突变位置在83、89、91、94、96、97、98、102、109、139、141、142、143、144、147。并且大多数分离株VP1编码的氨基酸序列在140位置发生缺失。由进化树可以得出位于B、C进化分支的中国分离株分别为53株和21株。结论与标准株Fermon相比，发现在BC-loop和DE-loop发生了很大变化，然而BC-loop和DE-loop这两个区域与病毒的抗原性和毒力有关。中国EV68分离株位于B和C分支上。

关键词： EV68病毒 VP1基因 BC-loop DE—loop 系统进化树

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细胞自噬对甲型流感病毒H1 N1感染A549细胞过程中病毒复制及Ⅰ型干扰素表达的影响

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中华微生物学和免疫学杂志 2017年第2期37卷 85-90页

作者：李嘉祺胡雅洁宋杰李洪哲王晶晶郭磊郑惠文宁若彤范海涛杨泽宁刘龙丁中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的通过研究细胞自噬在甲型流感病毒H1 N1感染细胞过程中对病毒复制及Ⅰ型干扰素表达的影响,为进一步阐明流感病毒感染机制提供实验资料.方法利用自噬抑制剂三甲基腺嘌呤（3-methyladenine,3-MA）抑制细胞自噬,流式细胞术检测3-MA对... 详细信息

目的通过研究细胞自噬在甲型流感病毒H1 N1感染细胞过程中对病毒复制及Ⅰ型干扰素表达的影响,为进一步阐明流感病毒感染机制提供实验资料.方法利用自噬抑制剂三甲基腺嘌呤（3-methyladenine,3-MA）抑制细胞自噬,流式细胞术检测3-MA对细胞凋亡的影响,激光共聚焦显微镜观察H1N1感染A549细胞后的自噬现象,利用real-time PCR检测自噬被抑制前后病毒拷贝数的变化以及Ⅰ型干扰素（typeⅠinterferon,IFN-Ⅰ）产生通路各基因mRNA表达量的变化.分析细胞自噬对病毒复制及干扰素表达的影响.结果当H1N1感染A549细胞后可诱导细胞产生不完全自噬,导致自噬体积累.当自噬被3-MA抑制后,TLR3-TLR7-MyD88-IRF7-IFN-α/β信号通路各基因mRNA表达量上调,与此同时病毒拷贝数及血凝滴度下调.结论 H1N1可能通过诱导不完全自噬逃逸了机体的抗病毒固有免疫应答,促进了自身复制和存活.

关键词：细胞自噬甲型流感病毒 A549细胞 Ⅰ型干扰素

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CXCL5对DSS诱导的小鼠炎症性肠病的影响

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中华微生物学和免疫学杂志 2018年第3期38卷 187-192页

作者：宋杰胡雅洁李嘉祺胡云光郭磊梅俊杰刘龙丁中国医学科学院&北京协和医学院、医学生物学研究所、云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的本研究旨在探究CXC趋化因子配体5[chemokine （C-X-C motif） ligand 5, CXCL5]在葡聚糖硫酸钠（dextran sulfate sodium，DSS）诱导的炎症性肠病（inflammatory bowel disease, IBD）中的作用及其机制。方法使用3%DSS自由饮用构建小鼠IBD模型，分析CXCL5敲除对小鼠体重、临床症状、存活率、病理损伤和炎性因子分泌的影响。结果研究结果发现，DSS诱导的急性肠炎小鼠血清中的CXCL5明显高于正常对照组，敲除CXCL5后，DSS对小鼠的影响为体重减轻、存活期延长、病理损伤减轻、炎症减弱、炎症因子释放减少。结论以上结果说明，CXCL5可能在DSS诱导的小鼠急性肠炎中促进了炎症因子的释放从而加剧了病理损伤，这一研究结果初步提示CXCL5可能是肠炎治疗的一个重要候选靶标。

关键词：炎症性肠病 CXC趋化因子配体5 炎症因子

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易发生聚集的重组HBcAg病毒样颗粒的纯化

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中国生物工程杂志 2020年第5期40卷 40-47页

作者：谢航航白红妹叶超陈永俊袁明翠马雁冰中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的:探索针对易发生聚集的重组HBcAg病毒样颗粒(VLP)的有效纯化方案。方法:培养的大肠杆菌经IPTG诱导重组HBcAg蛋白的表达,菌体超声破碎后的离心沉淀用含有不同浓度尿素的PBS缓冲液重悬溶解,经密度梯度离心并结合电镜观察对VLPs行为进... 详细信息

目的:探索针对易发生聚集的重组HBcAg病毒样颗粒(VLP)的有效纯化方案。方法:培养的大肠杆菌经IPTG诱导重组HBcAg蛋白的表达,菌体超声破碎后的离心沉淀用含有不同浓度尿素的PBS缓冲液重悬溶解,经密度梯度离心并结合电镜观察对VLPs行为进行分析鉴定。以Sepharose 4 FF凝胶过滤层析在选定的尿素条件下纯化沉淀溶解液,纯化获得的目的蛋白进一步在含30%山梨醇的PBS中脱盐去除尿素。整个过程以SDS-PAGE及电镜进行各步骤样品中目的蛋白的分析。结果:含有1mol/L尿素的PBS缓冲溶液重悬超声沉淀,可有效溶解聚集的VLPs,在蔗糖密度梯度离心中显示典型HBcAg VLPs的行为,且电镜观察颗粒形态结构完整。经1mol/L尿素下凝胶过滤,VLPs进一步获得纯化。在脱尿素过程中流动相采用含30%山梨醇的PBS,有效避免了VLPs在尿素去除后重新聚集。结论:尿素与山梨醇的联合应用,为具有聚集现象的VLPs纯化制备提供了一种有效解决方案。

关键词：病毒样颗粒纯化聚集尿素山梨醇

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柯萨奇B组1型云南分离株MSH／KM9／2009全基因组序列分析

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病毒学报 2013年第3期29卷 293-298页

作者：刘建生邵聪文潘玥朱艳菊邓新强廖宏玮刘雅灵马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

对2009年分离自云南省昆明市脑膜脑炎儿童的1株柯萨奇B组1型病毒MSH-KM9-09,进行了全基因组的序列测定,并对其分子变异和进化特点进行了分析。采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerasechain reaction,RT-PCR),分段扩... 详细信息

对2009年分离自云南省昆明市脑膜脑炎儿童的1株柯萨奇B组1型病毒MSH-KM9-09,进行了全基因组的序列测定,并对其分子变异和进化特点进行了分析。采用逆转录-聚合酶链反应(Reverse transcription-polymerasechain reaction,RT-PCR),分段扩增覆盖病毒全长序列的8个重叠片段(未包括多聚腺苷酸尾),并进行序列测定和分析。CVB1MSH-KM9-09病毒株基因组全长7 384个核苷酸(nt),5'端和为3'端分别为741nt和94nt的非编码区,5'和3'非编码区间为一个6 549nt长的开放阅读框,编码一个含2 183个氨基酸的多聚蛋白,编码区内未见核苷酸的插入或缺失。与GenBank库中现有CVB1全基因组序列M16560、pmMC、Tucson B1和CVB1/Nm相比对,整个基因组的核苷酸同源性分别为80.9%、81.6%、80.5%和80%,氨基酸同源性分别为95.6%、95.8%、96.2%和95.6%。首次完成中国CVB1病毒全基因组核苷酸序列的测定,经核苷酸序列同源性比对和进化树分析,证实MSH/KM9/2009株属于CVB1基因型。

关键词：柯萨奇病毒B组1型全基因组同源性序列分析

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2009年云南省2株肠道病毒71型分离株全基因组序列遗传特性分析

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病毒学报 2012年第2期28卷 108-113页

作者：李华邵聪文潘玥柯华昕马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

对2009年云南省肠道病毒71型分离株KMM09和KM186-09进行全基因组序列测序,并与我国及其它国家流行的EV71基因型进行比较和进化分析。KMM09和KM186-09基因组长为7409bp,编码2193个氨基酸,VP1系统进化分析显示2009年云南分离株属于C4基因... 详细信息

对2009年云南省肠道病毒71型分离株KMM09和KM186-09进行全基因组序列测序,并与我国及其它国家流行的EV71基因型进行比较和进化分析。KMM09和KM186-09基因组长为7409bp,编码2193个氨基酸,VP1系统进化分析显示2009年云南分离株属于C4基因型的C4a亚型。在结构区,与其它基因型相比较,C基因型之间的核苷酸和氨基酸的同源性高于其它基因型;而在非结构区,C4与B基因型和CA16原型株G10同源性高于其它C基因亚型。通过RDP3重组软件和blast比对分析,发现EV71C4基因型与B3基因型,与CA16原型株G10的基因组在非结构区存在重组。EV71全基因组序列的比较和分析,对了解引起我国手足口病暴发或流行C4基因亚型EV71毒株的遗传特性具有重要意义。

关键词：肠道病毒71型全基因组遗传特性

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云南省人乳头状瘤病毒16型E6/E7基因的变异分析

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病毒学报 2012年第6期28卷 645-651页

作者：杨丽娟岳耀斐陈俊英潘玥赵玉娇马绍辉孙强明中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

研究人乳头状瘤病毒16型E6和E7基因在云南省的变异情况。采集获得2 000例妇科门诊样品,提取DNA,以MY09/MY11为外引物,GP5+/GP6+为内引物,采用nest-PCR法对样品HPV-DNA高变区L1区的相应基因进行扩增、测序和分型,筛选得到20例HPV-16型病... 详细信息

研究人乳头状瘤病毒16型E6和E7基因在云南省的变异情况。采集获得2 000例妇科门诊样品,提取DNA,以MY09/MY11为外引物,GP5+/GP6+为内引物,采用nest-PCR法对样品HPV-DNA高变区L1区的相应基因进行扩增、测序和分型,筛选得到20例HPV-16型病毒DNA,对其进行E6和E7基因特异性扩增,测序。结果显示20例HPV-16型E6基因中有10例在178位核苷酸发生碱基突变,突变频率为50%,E7基因中有10例在647位核苷酸发生碱基突变,突变频率为50%。进化树分析结果表明在云南省流行的HPV-16型中主要为亚洲变异型,没有发现非洲1型,非洲2型。

关键词：子宫颈癌 HPV-16 进化树分析基因变异 E6基因 E7基因

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2009年云南省柯萨奇病毒B5：分离株A210／KM／09全基因序列分析

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中华流行病学杂志 2014年第3期35卷 307-311页

作者：刘建生邵聪文赵卫中张云昆吉玛朱艳菊马忠飞马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所昆明650118 云南省重大传染病疫苗研发重点实验室

目的分析柯萨奇病毒B5（CVB5）云南分离株A210／K2~I／09全基因序列及其遗传特性。方法设计针对CVB5引物，提取病毒RNA，RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列，利用Mega4．1、RDP3和SimPlot3．5．1软件分析全基因序列。结果CVB5A210／KM... 详细信息

目的分析柯萨奇病毒B5（CVB5）云南分离株A210／K2~I／09全基因序列及其遗传特性。方法设计针对CVB5引物，提取病毒RNA，RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列，利用Mega4．1、RDP3和SimPlot3．5．1软件分析全基因序列。结果CVB5A210／KM／09全基因组核苷酸序列长度为7372bp，编码含2185个氨基酸残基的多聚蛋白；A210／KM／09全基因组核苷酸及所推导的氨基酸与CVB5／CCl0／10同源性最高，其同源性分别为92．5％和97.3％；而与其他CVB5毒株如17Y、19CSF、20CSF、1954／85／US、2000／CSF／KOR、03001N、CoxB5／Henard2010、CVB5／SD／09和Faulkner核苷酸和氨基酸同源性分别为80．1％～92．5％和95．0％～97.3％；A210／KM／09与其他CVB5毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为75.3％～96.3％和85．3％～100．O％，其中与VP3、3D区段核苷酸的同源性最低。基于CVB5全长VPl基因序：列进行种系进化分析，可将CVB5分为A、B、C和D4个基因型，其中C基因型可再分为C1～C4基因亚型，D基因型可再分为D1～D4基因亚型。中国CVB5流行株主要聚集在C4基因亚型，国外流行株主要聚集在D1、C2亚型。结论A210／KM／09分离株为C4基因型。

关键词：柯萨奇B组5型病毒全基因组序列分析进化树图

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2009年云南省 Echo30分离株 KM／A363／09全基因组序列分析

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中华微生物学和免疫学杂志 2014年第5期34卷 388-392页

作者：白巍陈俊英潘玥朱艳菊邵聪文刘建生马绍辉中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

目的：对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM／A363／09进行全基因组测序和分析，了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物，提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列，利用Gen... 详细信息

目的：对2009年从中国云南省1名脑炎患儿粪便标本中分离到的Echo30云南分离株KM／A363／09进行全基因组测序和分析，了解该株病毒的遗传特性。方法设计针对Echo30引物，提取病毒RNA、RT-PCR扩增和产物直接测序获得全基因组序列，利用Geneious和Mega5．1软件进行核苷酸、氨基酸序列比对及其系统进化分析，应用RDP3和SimPlot3．5．1重组软件对序列进行重组分析。结果该分离株全基因组核苷酸序列长度为7425 bp，编码2194个氨基酸。其核苷酸和氨基酸序列与其原型株Bastianni的同源性分别为81．2％和95．8％；与其他Echo30型毒株的各区段核苷酸和氨基酸同源性分别为81．2％～88．6％和95．8％～97．8％；进化分析发现KM／A363／09毒株属于中国Echo30分支中的一支。而且发现KM／A363／09株基因序列在非结构区可能存在重组事件。结论云南分离株KM／A363／09属于中国Echo30分支中的一支，而中国分离株已经发生一定的进化。

关键词： Echo30 全基因序列序列分析 Echovirus 30

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单纯疱疹病毒1型与阿尔茨海默病的研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2021年第2期41卷 149-153页

作者：高杨李雪琦李琦涵中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所云南省重大传染病疫苗研发重点实验室昆明650118

单纯疱疹病毒1型(herpes simplex virus type 1,HSV-1)感染常引起口唇疱疹,但近年来其引发的生殖器疱疹越来越多,且与阿尔茨海默病等神经系统疾病的发生密切相关。阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)是一种慢性进行性的中枢神经系统变... 详细信息

单纯疱疹病毒1型(herpes simplex virus type 1,HSV-1)感染常引起口唇疱疹,但近年来其引发的生殖器疱疹越来越多,且与阿尔茨海默病等神经系统疾病的发生密切相关。阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)是一种慢性进行性的中枢神经系统变性病,其发病机制尚未完全阐明,目前也缺乏能够明确改善该疾病的药物。关于AD的HSV-1致病假说由来已久,但一直没有确切的证据证明两者之间的联系,本文将对HSV-1导致AD发病机制的研究进展进行简单综述。

关键词：单纯疱疹病毒1型阿尔茨海默病 β淀粉样蛋白 tau蛋白

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