检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2020年第7期42卷 669-679页

作者：毛洋丁寄葳陈淑敏岑山李晓宇中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所免疫生物学室北京100050

长散在核重复序列1 (long interspersed nuclear element-1, LINE-1)是迄今为止发现的人体基因组中唯一具有自主转座活性的逆转录转座子,其转座常引起宿主基因组不稳定,从而导致包括癌症在内的各种严重基因疾病的发生。宿主因子在宿主抗... 详细信息

长散在核重复序列1 (long interspersed nuclear element-1, LINE-1)是迄今为止发现的人体基因组中唯一具有自主转座活性的逆转录转座子,其转座常引起宿主基因组不稳定,从而导致包括癌症在内的各种严重基因疾病的发生。宿主因子在宿主抗LINE-1转座中发挥着重要作用。宿主因子SLFN14作为免疫系统重要组成员,具有抗病毒活性。本实验室研究发现SLFN14对于LINE-1的转座具有抑制作用。为进一步探究其具体的作用机制,通过对LINE-1复制周期中的转录、翻译、逆转录、整合环节进行实验分析,证实SLFN14能够通过影响LINE-1 mRNA转录过程及其半衰期,降低LINE-1 mRNA的水平,从而影响LINE-1蛋白及cDNA表达水平,最终导致LINE-1复制受阻。同时,通过对SLFN14活性中心的定位,本研究还发现SLFN14的抗LINE-1活性与其核糖核酸内切酶结构域和核糖体结合结构域密切相关。上述研究结果展示了SLFN14调控LINE-1复制的机制,进一步完善了宿主因子调控网络,为控制因LINE-1复制引起的基因组不稳定提供了新思路。

关键词：转座逆转录转座子 LINE-1 SLFN14 5’-UTR内部启动子区

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阿奇霉素及其杂质J对斑马鱼毒性的转录组学分析

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中国抗生素杂志 2022年第3期47卷 241-244页

作者：陈宁黄权华苏军权张苗青张靖溥深圳华润九新药业有限公司深圳518049 中国医学科学院/北京协和医学院医药生物技术研究所国家卫生健康委员会抗生素生物工程重点实验室抗感染药物研究北京市重点实验室北京100050

目的阿奇霉素在酸中的主要降解产物为3’-去克拉定糖阿奇霉素(杂质J)。本研究旨在利用模式动物斑马鱼,比较阿奇霉素及其杂质J体内诱导的毒性反应差异。方法斑马鱼幼鱼(3 dpf)给予不同浓度的阿奇霉素和杂质J,3 d后,计算并比较两种化合... 详细信息

目的阿奇霉素在酸中的主要降解产物为3’-去克拉定糖阿奇霉素(杂质J)。本研究旨在利用模式动物斑马鱼,比较阿奇霉素及其杂质J体内诱导的毒性反应差异。方法斑马鱼幼鱼(3 dpf)给予不同浓度的阿奇霉素和杂质J,3 d后,计算并比较两种化合物的LD;和LD;利用转录组学分析,比较阿奇霉素和杂质J导致机体表达谱的变化,并寻找显著性差异基因(DEGs);通过基因本体(GO)数据库对显著性差异基因进行功能归类分析,比较两种化合物对体内生物过程影响的可能差异。结果阿奇霉素和杂质J对斑马鱼的致死作用相似;二者均可导致幼鱼基因表达谱发生明显改变,但在转录水平可调节的DEGs个数不同;阿奇霉素单独调节的DEGs(ctsc、gnpda、gck和tmem127),在显著差异性GO生物过程(变化倍数> 3,P<0.05)中,主要归类于调控与代谢相关和细胞生长相关的生物过程,而杂质J单独调节的DEGs(cxcl8b.1)在显著差异性GO生物过程中,归类于与免疫调控相关的生物过程;qRT-PCR结果显示验证了阿奇霉素单独调节的ctsc、gnpda、gck和tmem127基因以及杂质J单独调节的cxcl8b.1基因的表达变化与RNA-seq测序结果相似。结论阿奇霉素和杂质J诱导斑马鱼幼鱼毒性反应的作用机制可能有所不同,为进一步探讨阿奇霉素在临床应用中产生不良反应的机制明确了方向。

关键词：阿奇霉素杂质J 斑马鱼毒性转录组学分析

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COVID-19治疗药物的研究进展

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药学学报 2020年第6期55卷 1081-1090页

作者：杨璐王辉强李玉环中国医学科学院、北京协和医学院医药生物技术研究所中国医学科学院抗病毒药物研究重点实验室北京100050 中国医学科学院、北京协和医学院医药生物技术研究所抗感染药物研究北京市重点实验室北京100050

新型冠状病毒肺炎COVID-19(corona virus disease 2019)是由新型冠状病毒SARS-CoV-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)感染所致的疾病。目前尚无特异性针对该病毒的抗病毒药物,临床上仍以支持治疗和对症治疗为主。直... 详细信息

新型冠状病毒肺炎COVID-19(corona virus disease 2019)是由新型冠状病毒SARS-CoV-2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)感染所致的疾病。目前尚无特异性针对该病毒的抗病毒药物,临床上仍以支持治疗和对症治疗为主。直接靶向病毒和靶向宿主是抗病毒药物研发的两个策略,目前针对COVID-19治疗药物的研发,在这两个方向也都有相关的研究进展。现就文献报道的潜在抗SARS-CoV-2药物进行综述,旨在从靶向病毒和靶向宿主两个角度,讨论这些药物的抗病毒作用和潜力。同时结合中药在治疗新冠肺炎中发挥的作用,探讨和展望COVID-19药物治疗的策略。

关键词：新型冠状病毒新型冠状病毒肺炎抗病毒药物作用机制

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利用荧光偏振方法的IDOL/LDLR蛋白相互作用评价体系的建立

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中国医药生物技术 2022年第2期17卷 97-103页

作者：李霓韩江雪姜新海许艳妮司书毅中国医学科学院北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室北京100050 中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所国家新药(微生物)筛选实验室北京100050

目的利用荧光偏振方法建立体外低密度脂蛋白受体的诱导型降解因子(IDOL)/低密度脂蛋白受体(LDLR)的蛋白相互作用评价体系。方法通过PCR扩增获得人IDOL蛋白全长cDNA,并与pET-30a(+)原核表达质粒进行重组,转化至大肠杆菌系统进行表达并... 详细信息

目的利用荧光偏振方法建立体外低密度脂蛋白受体的诱导型降解因子(IDOL)/低密度脂蛋白受体(LDLR)的蛋白相互作用评价体系。方法通过PCR扩增获得人IDOL蛋白全长cDNA,并与pET-30a(+)原核表达质粒进行重组,转化至大肠杆菌系统进行表达并纯化。将FITC荧光标记的LDLR多肽片段与His-IDOL共同孵育,利用荧光偏振方法,分别对多肽浓度、蛋白浓度以及反应时间进行优化,建立体外IDOL/LDLR的蛋白相互作用评价体系。结果将pET-30a-IDOL重组质粒进行大肠杆菌原核表达,获得人全长IDOL蛋白。将His-IDOL重组蛋白进行His Trap柱亲和纯化,并与FITC-LDLR进行反应,最终确定500 nmol/L FITC-LDLR和2μmol/L His-IDOL于25℃、100 r/min振荡、避光孵育1 h为IDOL/LDLR相互作用最适反应体系。结论利用荧光偏振方法成功构建了IDOL/LDLR蛋白相互作用评价体系,该体系为基于IDOL/LDLR相互作用的抗动脉粥样硬化的小分子抑制剂的开发和评价提供了实验基础。

关键词： LDLR的诱导型降解因子低密度脂蛋白受体荧光偏振转录后调控蛋白相互作用

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ANGPTL3与动脉粥样硬化

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中国医药生物技术 2022年第2期17卷 158-163页

作者：张月李玥王丽洪斌中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所卫健委抗生素生物工程重点实验室北京100050

心血管疾病(cardiovascular disease,CVDs)是全世界普遍存在的一种疾病,其发病率和死亡率均居于首位[1]。高脂血症作为发生此类疾病的高危因素之一,可直接引起严重的心血管疾病,例如动脉粥样硬化等。其中脂蛋白代谢紊乱,血浆脂质如低密... 详细信息

心血管疾病(cardiovascular disease,CVDs)是全世界普遍存在的一种疾病,其发病率和死亡率均居于首位[1]。高脂血症作为发生此类疾病的高危因素之一,可直接引起严重的心血管疾病,例如动脉粥样硬化等。其中脂蛋白代谢紊乱,血浆脂质如低密度脂蛋白胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)异常升高可增加动脉内斑块的聚集,提高动脉粥样硬化性心血管疾病的患病风险。

关键词：动脉粥样硬化性心血管疾病血浆脂质患病风险低密度脂蛋白胆固醇动脉内高脂血症异常升高

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头孢曲松及其杂质对斑马鱼肝脏的毒性

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癌变．畸变．突变 2024年第1期36卷 35-41,47页

作者：张锐马媛媛韩莹崇小萌刘馨妍谢广云梁一帆姚尚辰张靖溥中国医学科学院/北京协和医学院医药生物技术研究所北京100050 中国食品药品检定研究院化学药品检定所抗生素室北京102629 中国疾病预防控制中心职业卫生与中毒控制所北京100050

目的:研究头孢曲松及其杂质对斑马鱼肝脏的毒性。方法:选用受精后72 h的野生型斑马鱼和肝脏特异性荧光标记的转基因斑马鱼作为实验动物。分别用不同浓度的(0、1、2、5 mmol/L)头孢曲松和杂质A、B、C、D,以及不同浓度的(0、0.1、0.5、1 m... 详细信息

目的:研究头孢曲松及其杂质对斑马鱼肝脏的毒性。方法:选用受精后72 h的野生型斑马鱼和肝脏特异性荧光标记的转基因斑马鱼作为实验动物。分别用不同浓度的(0、1、2、5 mmol/L)头孢曲松和杂质A、B、C、D,以及不同浓度的(0、0.1、0.5、1 mmol/L)杂质E处理两种幼鱼2 d后,观察幼鱼肝脏形态和肝脏荧光强度;采用整体油红O染色观察野生型斑马鱼肝脏脂肪含量变化;进一步利用转录组测序技术对各受试物处理组斑马鱼进行转录组测序,筛选差异表达基因,并进行信号通路富集分析。结果:活体观察显示,与对照组比较,头孢曲松及其杂质A和C主要使斑马鱼幼鱼肝脏区扩大或荧光强度增强(P<0.05或0.01),杂质B、D和E主要使幼鱼肝脏区减小或荧光强度减弱(P<0.05或0.01)。整体油红O染色显示头孢曲松及其杂质均能导致斑马鱼肝脏脂肪堆积。头孢曲松给药组利用转录组测序筛选出差异表达基因共735个,杂质A组共237个,杂质C组共237个。KEGG通路分析提示各受试物组差异表达基因主要富集通路不同。头孢曲松差异基因主要富集于代谢通路和卟啉等通路中;杂质A组差异基因主要富集于色氨酸代谢等信号通路;杂质C组差异基因主要富集于钙信号通路等信号通路。结论:头孢曲松及其杂质A、B、C、D和E可导致不同程度斑马鱼肝功能发生变化,并造成肝脏组织损伤。

关键词：头孢曲松肝毒性斑马鱼差异表达基因杂质

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铁死亡及其在结直肠癌中的作用和机制

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中国医药生物技术 2022年第2期17卷 150-153页

作者：周惠敏赵午莉张业繁邵荣光中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所肿瘤室北京100050 国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院肿瘤医院北京100021

不同于细胞凋亡、细胞坏死、细胞焦亡和自噬等死亡方式,铁死亡(ferroptosis)是由铁依赖的脂质活性氧(lipid reactive oxygen species,L-ROS)介导的调节性细胞死亡(regulated cell death,RCD)途径。其发生机制主要为Fe^(2+)将电子转移给... 详细信息

不同于细胞凋亡、细胞坏死、细胞焦亡和自噬等死亡方式,铁死亡(ferroptosis)是由铁依赖的脂质活性氧(lipid reactive oxygen species,L-ROS)介导的调节性细胞死亡(regulated cell death,RCD)途径。其发生机制主要为Fe^(2+)将电子转移给细胞内的氧原子,氧原子产生ROS,使得细胞膜或细胞器膜上的长链不饱和脂肪酸中的磷脂分子被过氧化,生成脂质过氧化物(lipide peroxide,LPO),进而使生物膜变薄和曲率增加,导致细胞膜破裂而细胞死亡[1]。铁死亡的主要特征表现为细胞内游离Fe^(2+)介导的Fenton反应、细胞膜的脂质过氧化反应以及抗脂质氧化分子被抑制等。铁死亡参与了多种疾病的发生发展过程,如缺血性器官损伤、抗病毒免疫、神经系统疾病和肿瘤等[2]。同时,铁死亡在各种结直肠疾病的发生与发展中也发挥有重要作用,包括肠道缺血/再灌注损伤、炎性肠病以及结直肠癌等[3]。

关键词：炎性肠病细胞焦亡脂质过氧化反应神经系统疾病脂质过氧化物结直肠癌细胞坏死磷脂分子

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高脂饮食诱导的肥胖小鼠肝脏转录组分析

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中国医药生物技术 2023年第5期18卷 385-392页

作者：王玉全孙烨陶思名陈菁青邱业峰谢实勇刘宁中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所中国药学微生物菌种保藏管理中心北京100050 中国医学科学院北京协和医学院医学实验动物研究所编辑部北京100021 中国农业大学动物营养学国家重点实验室北京100293 军事医学研究院实验动物中心北京100071 北京市畜牧总站 100101

目的对长期高脂饮食饲喂构建的肥胖小鼠肝脏组织进行转录组分析,探讨肝脏功能对肥胖发生的作用机制。方法利用长期高脂饮食饲喂构建小鼠肥胖模型,通过形态观察,体重、体脂及血糖检测进行模型评价。建模成功后对小鼠脂肪组织和肝脏组织进... 详细信息

目的对长期高脂饮食饲喂构建的肥胖小鼠肝脏组织进行转录组分析,探讨肝脏功能对肥胖发生的作用机制。方法利用长期高脂饮食饲喂构建小鼠肥胖模型,通过形态观察,体重、体脂及血糖检测进行模型评价。建模成功后对小鼠脂肪组织和肝脏组织进行HE染色,观察组织病理改变,并通过转录组检测小鼠肝脏组织基因表达变化。结果高脂饮食饲喂小鼠8周后小鼠体重及血糖水平明显增加,脂肪组织脂质累积,脂肪细胞肥大,呈现肥胖表型。对肝脏组织进行转录组测序分析发现肥胖小鼠肝脏组织基因表达存在明显改变,基于P_adjust≤0.05和log2FC值筛选获得一些关键差异表达基因供后续深入研究。结论肝脏功能在肥胖及其相关疾病发生发展中发挥重要作用。

关键词：高脂饮食小鼠肥胖肝脏转录组学

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ICP-MS同时测定注射用亚锡替曲膦中磷和锡的含量

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中国医药生物技术 2025年第1期20卷 89-94页

作者：连晓芳郭鑫左利民姜艺菲刘惠一肖菁姚静山广志中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所分析测试中心北京100050 湖南省药品检验检测研究院生物安全所长沙410001 中国食品药品检定研究院化学药品检定所抗肿瘤与放射药品室北京102629

目的建立一种通过同时测定注射用亚锡替曲膦中磷(P)和锡(Sn)元素含量计算替曲膦和氯化亚锡含量的电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)方法。方法通过2%硝酸溶解、超声、离心等简单的前处理,使用ICP-MS对注射用亚锡替曲膦中两种元素进行测定。I... 详细信息

目的建立一种通过同时测定注射用亚锡替曲膦中磷(P)和锡(Sn)元素含量计算替曲膦和氯化亚锡含量的电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)方法。方法通过2%硝酸溶解、超声、离心等简单的前处理,使用ICP-MS对注射用亚锡替曲膦中两种元素进行测定。ICP-MS的采集模式选择动能歧视(KED)模式,P的测定以钒为内标,Sn的测定以锑为内标,重复采样三次取平均值。结果方法学验证显示,P和Sn在0~10μg/mL浓度之间与其相对应的计数值呈现良好的线性关系,相关系数(r)分别为1.000和0.9999,P的定量限和检测限分别为3.073×10^(-2)μg/mL和1.014×10^(-2)μg/mL,Sn的定量限和检测限分别为9.850×10^(-4)μg/mL和3.251×10^(-4)μg/mL,P和Sn元素的加标回收率分别为101.0%和100.3%,RSD分别为5.35%(n=9)和4.68%(n=9)。结论ICP-MS法简便、快速,能够较好满足注射用亚锡替曲膦中氯化亚锡和替曲膦含量测定的要求。

关键词：电感耦合等离子体质谱法替曲膦氯化亚锡动能歧视模式

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Streptomyces thermotolerans ATCC 11416的基因组挖掘

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中国医药生物技术 2025年第3期20卷 241-252页

作者：任雅飞江志波赫卫清郝天怡北方民族大学化学与化学工程学院化工技术基础国家民委重点实验室/宁夏低品质资源高值化利用技术研发人才小高地银川750021 中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所卫健委抗生素生物工程重点实验室/中国医学科学院合成生物学重点实验室北京100050

目的对耐热链霉菌*** ATCC 11416进行全基因组测序,并通过生物信息学软件对基因组信息进行分析,对其蕴藏的次级代谢产物生物合成基因簇(BGC)进行预测,并借助于比较基因组学等手段进行研究。方法培养*** ATCC 11416的菌丝体,提取基因组D... 详细信息

目的对耐热链霉菌*** ATCC 11416进行全基因组测序,并通过生物信息学软件对基因组信息进行分析,对其蕴藏的次级代谢产物生物合成基因簇(BGC)进行预测,并借助于比较基因组学等手段进行研究。方法培养*** ATCC 11416的菌丝体,提取基因组DNA,利用Illumina和PacBio平台进行全基因组测序。基因组序列通过anti-SMASH等预测次级代谢产物的BGC,推测其可能产生的化合物类型,利用定量qPCR初步判断目标BGC的表达情况,同时利用TBtools软件进行全基因组比对分析。结果*** ATCC 11416的基因组由1个线状染色体组成,基因组大小为8279432 bp,推测包含7356个基因,GC含量为71.65%,含有66个tRNA和18个rRNA序列,还鉴定出多种重复序列。从基因组中鉴定出26个次级代谢产物的BGC,其中Cluster 8是负责合成卡波霉素的BGC。利用qPCR检测并与Cluster 8中的关键基因表达情况比对发现Cluster 1、7、13、14、15、19和21中的功能基因表达活性较高,Cluster 5、6、9、11、12、16、18和24中的功能基因表达较低,而Cluster 2、3、4、10、17、20、22、23和25基因簇中的功能基因几乎不表达,为可能的沉默基因簇。Cluster 4、10、17、20、23和26与已知基因簇的同源性较低,很可能负责新化合物的合成。基因组比较分析发现,*** ATCC 11416与*** ATCC 23877具有较高同源性,两者都具有产生十六元环大环内酯类抗生素的潜力,在基因组比较中发现存在多处翻转、易位等基因组重排现象。结论链霉菌*** ATCC 11416具有中等基因组长度,包含了26个BGC,其中蕴含多种同源性低的沉默基因簇,为后续通过分子生物学手段激活这些沉默基因簇来获得新化合物奠定基础。

关键词：耐热链霉菌ATCC 11416 基因组生物合成基因簇

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