检索结果-内蒙古大学图书馆

中国抗生素杂志 2022年第9期47卷 933-938页

作者：乔涵胡辛欣聂彤颖杨信怡游雪甫李聪然中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所抗感染药物研究北京市重点实验室北京100050 中国食品药品检定研究院北京102629

目的筛选铜绿假单胞菌临床分离株的碳青霉烯类异质性耐药菌株,并分析相关机制。方法采用E-test纸条法、群体分析法(PAP)法对30株铜绿假单胞菌临床分离株进行亚胺培南异质性耐药的初筛和复筛、肉汤微量稀释法测定异质性耐药菌株对亚胺培... 详细信息

目的筛选铜绿假单胞菌临床分离株的碳青霉烯类异质性耐药菌株,并分析相关机制。方法采用E-test纸条法、群体分析法(PAP)法对30株铜绿假单胞菌临床分离株进行亚胺培南异质性耐药的初筛和复筛、肉汤微量稀释法测定异质性耐药菌株对亚胺培南及其他药物的MIC值、全基因组测序分析碳青霉烯类异质性耐药菌株的可能耐药机制。结果通过E-test纸条法和PAP法鉴别筛选出8株亚胺培南异质性耐药铜绿假单胞菌,检测发现异质性耐药菌株对多黏菌素B、头孢他啶、美罗培南耐药率较高,对环丙沙星等更敏感。全基因组测序分析发现碳青霉烯类异质性耐药铜绿假单胞菌无可确证的基因突变,但可能与延伸因子P基因有关。

关键词：异质性耐药铜绿假单胞菌亚胺培南碳青霉烯类耐药机制

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一种新型KPC-2抑制剂:PHT427

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Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences 2023年第12期32卷 989-997页

作者：李晓辉王倩刘琛楠韩江雪刘思含刘天俊王倩关艳肖春玲王潇刘忆霜中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所国家新药(微生物)筛选实验室北京100050 中国海洋大学药学院海洋药物教育部重点实验室山东青岛266003 首都医科大学附属北京胸科医院结核病胸部肿瘤研究所药物学研究室北京101149

KPC-2型β-内酰胺酶对超广谱头孢菌素和碳青霉烯类抗生素具有耐药性,并已成为治疗革兰氏阴性菌感染的全球重大威胁,因此寻找新型抗菌剂和新的抗感染策略非常重要。我们前期经筛选发现PHT427是一种有效的NDM-1抑制剂,进一步研究发现其对K... 详细信息

KPC-2型β-内酰胺酶对超广谱头孢菌素和碳青霉烯类抗生素具有耐药性,并已成为治疗革兰氏阴性菌感染的全球重大威胁,因此寻找新型抗菌剂和新的抗感染策略非常重要。我们前期经筛选发现PHT427是一种有效的NDM-1抑制剂,进一步研究发现其对KPC-2也有明显的抑制活性。结果显示PHT427能够显著抑制KPC-2,IC50值为2.04μM,并且与美罗培南联用对大肠杆菌BL21(DE3)/p ET28a(+)-bla KPC-2具有明显的协同作用。荧光淬灭和SPR结果表明PHT427能够与KPC-2发生相互作用。分子对接与定点突变的结果进一步表明Arg220、Thr235和Thr237是促进这种相互作用的关键氨基酸残基。研究表明PHT427是一种具有潜力的KPC-2抑制剂并且能够协助碳青霉烯类抗生素抑制KPC-2产生菌。

关键词： KPC-2 PHT427 抗生素耐药抑制剂

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URA3基因影响青蒿酸酿酒酵母工程菌中试发酵产量

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生物工程学报 2022年第2期38卷 737-748页

作者：郭未蔚艾丽梅胡栋陈亚军耿梦馨郑玲辉白利平中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所卫健委抗生素生物工程重点实验室/中国医学科学院药物合成生物学重点实验室北京100050 浙江海正药业股份有限公司浙江抗菌药物重点实验室浙江台州318000

CRISPR/Cas9基因编辑技术已经被广泛应用于工程酿酒酵母的基因插入、基因替换和基因敲除,通过使用选择标记进行基因编辑具有简单高效的特点。前期利用CRISPR/Cas9系统敲除青蒿酸生产菌株酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)1211半乳糖... 详细信息

CRISPR/Cas9基因编辑技术已经被广泛应用于工程酿酒酵母的基因插入、基因替换和基因敲除,通过使用选择标记进行基因编辑具有简单高效的特点。前期利用CRISPR/Cas9系统敲除青蒿酸生产菌株酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)1211半乳糖代谢负调控基因GAL80,获得菌株*** 1211-2,在不添加半乳糖诱导的情况下,青蒿酸摇瓶发酵产量达到了740 mg/L。但在50 L中试发酵实验中,*** 1211-2很难利用对青蒿酸积累起到决定性作用的碳源-乙醇,青蒿酸的产量仅为亲本菌株*** 1211的20%–25%。我们推测因遗传操作所需的筛选标记URA3突变,影响了其生长及青蒿酸产量。随后我们使用重组质粒pML104-KanMx4-u连同90 bp供体DNA成功恢复了URA3基因,获得了工程菌株*** 1211-3。*** 1211-3能够在葡萄糖和乙醇分批补料的发酵罐中正常生长,其青蒿酸产量超过20 g/L,与亲本菌株产量相当。研究不但获得了不加半乳糖诱导的青蒿酸生产菌株,同时首次发现了营养缺陷型标记URA3基因显著影响乙醇补料的中试发酵中青蒿酸的产生,也为酵母作为底盘来进行其他天然产物的生产提供了借鉴。

关键词：工程酿酒酵母青蒿酸 CRISPR/Cas9 URA3

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基于分子对接技术筛选新型冠状病毒变异体XBB.1.5 RBD抑制剂

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中国医药生物技术 2024年第4期19卷 308-314页

作者：吕瑞杰王晨宇唐梦佳吕旭东杨兆勇张志斐华北理工大学药学院唐山063210 中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所微生物代谢室北京100050

目的利用虚拟筛选技术筛选出可抑制新冠病毒变异体XBB.1.5 S蛋白受体结合区域(RBD蛋白)与血管紧张素转化酶2(ACE2)结合的小分子抑制剂,从而阻断新冠病毒对宿主的识别。方法在Mcule小分子数据库中下载486387个配体小分子。使用Jarvis-Pat... 详细信息

目的利用虚拟筛选技术筛选出可抑制新冠病毒变异体XBB.1.5 S蛋白受体结合区域(RBD蛋白)与血管紧张素转化酶2(ACE2)结合的小分子抑制剂,从而阻断新冠病毒对宿主的识别。方法在Mcule小分子数据库中下载486387个配体小分子。使用Jarvis-Patrick聚类后采用AutoDock Vina软件进行基于质心的分子对接。结果确定了XBB.1.5 RBD蛋白与ACE2相互作用的关键氨基酸残基,深入分析了5个候选物小分子与XBB.1.5 RBD蛋白的结合模式,化合物1与XBB.1.5 RBD蛋白的TYR489和SER490残基形成π-π堆积和氢键相互作用;化合物2与TYR449、SER494和TYR501通过氢键和π-π堆积结合;化合物3主要与TYR451形成氢键;化合物4与TYR427通过π-π堆积结合;化合物5则与ARG381、GLN387和ASN395残基形成π-阳离子堆积和氢键。上述相互作用均干扰了XBB.1.5 RBD与ACE2的结合,起到抑制作用。通过ADMET模拟分析,预测了候选化合物的生物利用度、遗传毒性和致癌性,最终得到了潜在的抑制剂分子。结论从数据库中筛选出潜在的新型冠状病毒变异体XBB.1.5 RBD蛋白的小分子结构,进而阻断S蛋白与ACE2之间的结合,为抗新型冠状病毒药物研究及处方筛选提供参考。

关键词：变异体XBB.1.5,新型冠状病毒 S蛋白受体结合区域分子对接虚拟筛选

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PCSK9转录后表达调控抑制剂的发现及活性研究

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中国医药生物技术 2024年第3期19卷 231-239页

作者：庞晨绪王雪蕾杨雨欣刘一婷王丽洪斌中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所中国医学科学院药物合成生物学重点实验室/国家卫生健康委抗生素生物工程重点实验室北京100050

目的建立PCSK9转录后表达调控抑制剂高通量筛选模型筛选获得靶向PCSK9转录后水平的小分子抑制剂,通过其活性研究发现具有潜在降脂活性的PCSK9抑制剂。方法将PCSK9 mRNA的3'UTR区连接至荧光素酶报告基因下游以构建PCSK9转录后调控抑... 详细信息

目的建立PCSK9转录后表达调控抑制剂高通量筛选模型筛选获得靶向PCSK9转录后水平的小分子抑制剂,通过其活性研究发现具有潜在降脂活性的PCSK9抑制剂。方法将PCSK9 mRNA的3'UTR区连接至荧光素酶报告基因下游以构建PCSK9转录后调控抑制剂高通量筛选模型,并对其进行优化与评价。应用该模型进行大规模筛选,进而利用荧光定量PCR、Western blot、流式细胞检测等方法对活性化合物调控PCSK9的表达及其介导的低密度脂蛋白受体(LDLR)的表达水平和低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)摄取作用的变化进行检测。结果利用上述模型筛选获得6个活性化合物,并对其量效关系进行分析,结果显示这些化合物均可呈剂量依赖性下调筛选模型荧光素酶活性;利用HepG2细胞对其调控PCSK9的表达水平进行检测,结果显示化合物IMB-57可显著抑制PCSK9基因mRNA水平和蛋白水平;进而对LDLR表达水平及摄取功能进行检测,结果显示IMB-57可显著增加细胞LDLR蛋白水平及其介导的细胞对LDL-C的摄取作用;初步分子机制分析结果证实IMB-57通过影响PCSK9基因mRNA的稳定性从而抑制其表达。结论活性化合物IMB-57具有显著的PCSK9抑制活性且可显著增加肝细胞LDL-C的摄取,有望发展为潜在的具有降脂活性的PCSK9小分子抑制剂,同时也证实本工作构建模型的可靠性,可用于具有全新机制的PCSK9抑制剂的发现。

关键词： PCSK9 转录后表达调控低密度脂蛋白受体低密度脂蛋白胆固醇动脉粥样硬化

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抗肿瘤抗体药物研究进展

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中国医药生物技术 2025年第2期20卷 190-194页

作者：马兴佳盛唯瑾刘秀均中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室北京100050

癌症现已成为全球人类死亡的主要原因之一,威胁着众多患者的生命健康。放疗和化疗是癌症的主要治疗手段,但亦具有局限性,并且常常伴有严重的副作用,因此,针对癌症的治疗需要新的治疗策略。目前,基于抗体的蛋白质已成为一类重要的生物疗... 详细信息

癌症现已成为全球人类死亡的主要原因之一,威胁着众多患者的生命健康。放疗和化疗是癌症的主要治疗手段,但亦具有局限性,并且常常伴有严重的副作用,因此,针对癌症的治疗需要新的治疗策略。目前,基于抗体的蛋白质已成为一类重要的生物疗法,这在很大程度上归功于抗体框架的稳定性、特异性和适应性。事实上,抗体具有结合抗原和内源性免疫受体的固有能力,因此,单克隆抗体的几种衍生物,包括双特异性抗体、抗体药物偶联物和抗体片段,已证明对治疗人类疾病有效,尤其是在肿瘤学领域。本篇综述基于抗体的结构和功能,围绕单克隆抗体、抗体药物偶联物和双特异性抗体的研究现状展开论述。

关键词：抗肿瘤药单克隆抗体抗体药物偶联物双特异性抗体

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前蛋白转化酶枯草溶菌素9抑制剂的研究进展

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中国动脉硬化杂志 2022年第8期30卷 645-653页

作者：王伟志司书毅许艳妮中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所国家新药(微生物)筛选实验室卫健委抗生素生物工程重点实验室北京市100050

前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9)是一种主要在肝细胞中表达的分泌型丝氨酸蛋白酶。PCSK9能够与低密度脂蛋白受体(LDLR)结合形成复合物,并通过溶酶体途径使LDLR降解,从而减少细胞表面LDLR的数量,最终导致血浆低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)水... 详细信息

前蛋白转化酶枯草溶菌素9(PCSK9)是一种主要在肝细胞中表达的分泌型丝氨酸蛋白酶。PCSK9能够与低密度脂蛋白受体(LDLR)结合形成复合物,并通过溶酶体途径使LDLR降解,从而减少细胞表面LDLR的数量,最终导致血浆低密度脂蛋白胆固醇(LDLC)水平升高。近年来,PCSK9抑制剂成为一个治疗高胆固醇血症及动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)药物研发的新热点。目前全球上市了三款PCSK9抑制剂,包括依洛尤单抗(Evolocumab)、阿利珠单抗(Alirocumab)及小干扰RNA药物Inclisiran(Leqvio)。本文对PCSK9的结构、功能、抑制剂的研究进展进行了综述。

关键词：前蛋白转化酶枯草溶菌素9 动脉粥样硬化低密度脂蛋白受体高胆固醇血症

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以人载脂蛋白B为靶点的基因表达下调剂筛选模型的建立与应用

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中国抗生素杂志 2021年第10期46卷 922-927页

作者：张秀敏王雪蕾王丽杜郁洪斌国家卫健委抗生素生物工程重点实验室中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所北京100050 中国医学科学院药物合成生物学重点实验室中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所北京100050

目的构建以人ApoB为靶点的基因表达调节剂的高通量筛选模型,筛选apoB基因表达下调剂。方法以人基因组DNA为模板,通过PCR扩增apoB基因上游的启动子序列,将扩增的DNA片段克隆至荧光素酶报告基因质粒pGL4.17,采用脂质体介导的方法将重组质... 详细信息

目的构建以人ApoB为靶点的基因表达调节剂的高通量筛选模型,筛选apoB基因表达下调剂。方法以人基因组DNA为模板,通过PCR扩增apoB基因上游的启动子序列,将扩增的DNA片段克隆至荧光素酶报告基因质粒pGL4.17,采用脂质体介导的方法将重组质粒转染人肝癌细胞HepG2,经G418抗性筛选,获得稳定转染细胞株。应用槲皮素对筛选模型进行评价,进而基于检测荧光素酶的表达活性变化筛选人apoB基因表达下调剂。结果PCR扩增得到人apoB基因上游的启动子序列,构建完成相应的重组荧光素酶报告基因质粒pGL4-apoB-P,建立了稳定转染细胞株ApoB-Luc HepG2。以槲皮素为阳性化合物进行模型评价,Z'因子为0.77,符合高通量筛选的要求。应用该模型对5688个微生物发酵液粗提物进行筛选,获得了2株阳性菌株。结论建立了人apoB基因表达下调剂筛选模型,并应用于微生物来源样品的筛选。

关键词：载脂蛋白B 动脉粥样硬化报告基因启动子高通量筛选微生物发酵液

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基于虚拟筛选的新型吲哚胺2,3-双加氧酶抑制剂的发现及活性评价

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中国医药生物技术 2023年第3期18卷 193-201页

作者：刘伊彤周睿姜艺菲连晓芳郑瑞芳山广志中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所分析测试中心北京100050 中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所免疫生物学室北京100050 新疆维吾尔自治区药物研究所新疆维吾尔药重点实验室乌鲁木齐830004

目的应用药效团模型及分子对接的综合虚拟筛选策略,对Specs及Chembridge数据库进行筛选并进行生物学活性评价,以期发现新型吲哚胺2,3-双加氧酶(IDO1)抑制剂。方法基于已报道IDO1抑制剂,利用Discovery Studio 2019软件的Pharmacophores(H... 详细信息

目的应用药效团模型及分子对接的综合虚拟筛选策略,对Specs及Chembridge数据库进行筛选并进行生物学活性评价,以期发现新型吲哚胺2,3-双加氧酶(IDO1)抑制剂。方法基于已报道IDO1抑制剂,利用Discovery Studio 2019软件的Pharmacophores(Hiphop)模块构建药效团模型。通过最优药效团模型初步筛选了Specs及Chembridge数据库,后采用LibDock及CDOCKER程序靶向IDO1活性位点进行层级分子对接,最终保留了40个苗头化合物,并在100μmol/L浓度下进行了细胞水平IDO1酶抑制活性初筛。选取初筛抑制率大于50%的11个化合物进行细胞水平及生化水平抑酶活性的进一步测定。采用SPR及分子对接模型进一步确证及阐明化合物与IDO1酶之间的相互作用方式。结果发现羟基嘧啶类化合物29在细胞水平及生化水平上均呈现了IDO1酶抑制活性,EC50和IC50分别为(53.93±1.22)μmol/L和(179±8.12)μmol/L。SPR研究进一步确证了化合物29与IDO1之间的直接结合(KD=65.92μmol/L)。分子对接模型研究显示羟基嘧啶基团与IDO1的卟啉环之间存在较为丰富的相互作用,是靶向识别的关键基团。结论羟基嘧啶类化合物29是一类新型IDO1抑制剂,可作为IDO1酶抑制剂的先导物,通过进一步结构改造及优化,有望获得高效、结构新颖的IDO1抑制剂及新型肿瘤免疫治疗药物。

关键词：吲哚胺2,3-双加氧酶抑制剂药效团模型分子对接酶活性评价

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抗肿瘤核苷类似物研究进展

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中国医药生物技术 2024年第2期19卷 151-154页

作者：刘璐盛唯瑾刘秀均中国医学科学院北京协和医学院医药生物技术研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室北京100050

癌症是一种以细胞异常增殖为特征的疾病,全球大约有六分之一的死亡是由癌症造成的。化疗是目前癌症治疗的主要手段之一,其中核苷类似物在化疗药物中占重要地位,主要结构为嘌呤或嘧啶核苷。目前,临床常用的药物并不能长久有效地控制癌症... 详细信息

癌症是一种以细胞异常增殖为特征的疾病,全球大约有六分之一的死亡是由癌症造成的。化疗是目前癌症治疗的主要手段之一,其中核苷类似物在化疗药物中占重要地位,主要结构为嘌呤或嘧啶核苷。目前,临床常用的药物并不能长久有效地控制癌症进展,而且核苷类似物存在选择性低,副作用较大等缺点,具有很大的改造空间,是药物研究的热点之一。本文论述了核苷类似物分类以及近年的研究进展。

关键词：核苷类似物抗肿瘤药物化疗

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