检索结果-内蒙古大学图书馆

基础医学与临床 2016年第7期36卷 962-968页

作者：朱丽媛赵阿妮张靖侯琳阴彬彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的 n PTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能。方法利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到n PTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-... 详细信息

目的 n PTB基因座上T-uc.33这一超保守长非编码RNA的鉴定及其在小鼠神经系统发育过程中的功能。方法利用生物信息学方法和实验对现存的481个超保守区域(UCRs)进行数据挖掘和检测,筛选到n PTB基因座上存在的UCR,即T-uc.33,并用RACE扩增T-uc.33的RNA转录本全长;用实时荧光定量PCR检测T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织发育及神经干细胞分化不同时间点的表达谱;用siRNAs转染细胞法检测T-uc.33对n PTB所起的调控作用。结果筛选并鉴定了n PTB基因座上的T-uc.33为真实转录的超保守长非编码RNA,全长为807 nt;T-uc.33和n PTB在小鼠脑组织中的表达呈显著正相关(P<0.01),并随着脑组织发育从胚胎到成年期呈现先升高后降低的趋势,在体外神经干细胞分化过程也存在差异表达;敲低T-uc.33可显著降低n PTB的表达(P<0.01)。结论 T-uc.33为n PTB基因座上的超保守长非编码RNA,对n PTB起到正向调控作用,潜在地影响小鼠脑组织发育和神经干细胞的分化过程。

关键词：超保守区域(UCR) nPTB 神经发育长非编码RNA(lncRNA)

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Exendin-4减轻Aβ1-42引起的大鼠工作记忆损伤

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基础医学与临床 2017年第1期37卷 109-110页

作者：潘艳芳应小平原丽彭小忠陕西中医药大学基础医学院病理教研室陕西咸阳712046 山西医科大学生理学系山西太原030001 中国医学科学院基础医学研究所生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

淀粉样β蛋白（amyloidβprotein,Aβ）在阿尔茨海默病（Alzheimer＇s disease,AD）的发生发展过程中起了关键作用[1],然而,目前仍缺乏拮抗Aβ的有效的治疗手段。近年来研究发现Exendin-4能减缓神经退行性疾病的发展过程,

关键词： Exendin-4 Aβ1-42 记忆损伤 protein 神经退行性疾病大鼠减轻淀粉样β蛋白

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利用CRISPR／Cas9技术敲除HeLa细胞中YAF2基因

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医学研究杂志 2016年第11期45卷 22-27页

作者：丛晓杰马晓骊陈虹黄秉仁陈等中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系、医学分子生物学国家重点实验室 100005

目的利用CRISPR/Cas9技术建立YAF2(YY1 associated factor 2)基因敲除的宫颈癌He La细胞株,用于YAF2基因在宫颈癌细胞中分子功能的研究。方法首先利用CRISPR/Cas9序列设计网站,设计两对靶向YAF2基因第2外显子不同位点的向导RNA(single-g... 详细信息

目的利用CRISPR/Cas9技术建立YAF2(YY1 associated factor 2)基因敲除的宫颈癌He La细胞株,用于YAF2基因在宫颈癌细胞中分子功能的研究。方法首先利用CRISPR/Cas9序列设计网站,设计两对靶向YAF2基因第2外显子不同位点的向导RNA(single-guide RNA,sgRNA)。化学合成sgRNA寡核苷酸序列,分别克隆至质粒p X335中,测序确认插入片段正确的克隆。先用一对重组载体转染He La细胞,7天后,再用另一对转染He La细胞,第2对转染3天后,取培养细胞的2/3提取基因组DNA,对敲除位点附近的片段进行PCR扩增后通过DNA测序对敲除效率进行分析,剩余细胞在96孔平板上通过有限稀释法筛选YAF2敲除的细胞株。用蛋白质免疫印迹实验初步鉴定YAF2蛋白质表达缺失的细胞克隆,提取其基因组DNA,对敲除位点附近的序列进行PCR扩增,将扩增产物克隆至p GEM-T easy载体,通过DNA测序确认YAF2基因纯合敲除的细胞株。结果成功构建两对针对人YAF2基因第二外显子的p X335-sgRNA质粒;PCR产物测序证明两对重组载体均有YAF2基因敲除活性;得到2株YAF2敲除的He La细胞株。结论利用CRISPR/Cas9技术在He La细胞中成功敲除YAF2基因,为在He La细胞中研究YAF2的分子功能奠定基础。

关键词： CRISPR/Cas9 YAF2 HeLa

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天然反义转录物及其在神经胶质瘤中的功能

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中国生化药物杂志 2016年第5期36卷 1-4,221页

作者：朱丽媛彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系/医学分子生物学国家重点实验室北京100005

天然反义转录物(natural antisense transcripts,NATs)被定义为在自然状态下生物体内产生的内源性RNA,其通常是通过与靶分子进行序列互补而形成天然的正义-反义转录物配对的双链RNA。NATs普遍存在于原核和真核生物中,可以在转录水平、... 详细信息

天然反义转录物(natural antisense transcripts,NATs)被定义为在自然状态下生物体内产生的内源性RNA,其通常是通过与靶分子进行序列互补而形成天然的正义-反义转录物配对的双链RNA。NATs普遍存在于原核和真核生物中,可以在转录水平、转录后水平、翻译水平等多个层次经由不同机制调节基因的表达。此外,NATs也与恶性肿瘤的发生发展密切相关,一些NATs在正常组织与神经胶质瘤组织中的表达存在显著差异。NATs可能成为神经胶质瘤诊断、预后以及治疗效果的一种新的标志物,同时NATs也是潜在的新的胶质瘤基因治疗的靶点。本文对NATs的分类及其在神经胶质瘤中的功能及可能的机制做具体阐述。

关键词：天然反义转录物(NATs) 神经胶质瘤癌症

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基于液相色谱-质谱联用技术的胶质瘤细胞代谢组学分析

基于液相色谱-质谱联用技术的胶质瘤细胞代谢组学分析

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中国化学会第十一届全国生物医药色谱及相关技术学术交流会

作者：张瑞胡佩珊臧清策岳小飞周帜徐晓宇韩为张瑞萍再帕尔·阿不力孜中国医学科学院/北京协和医学院药物研究所天然药物活性物质与功能国家重点实验室中国医学科学院/北京协和医学院基础医学研究所生物化学与分子生物学国家重点实验室

根据美国中央脑瘤登记处CBTRUS的报告(2008-2012),虽然每年美国每10万人中仅有28.57人患中枢神经系统肿瘤,但是中枢神经系统恶性肿瘤中的82%是几乎无法治愈的胶质瘤。成人中最常见的神经胶质瘤的变体为胶质母细胞瘤,即使通过手术治疗,... 详细信息

根据美国中央脑瘤登记处CBTRUS的报告(2008-2012),虽然每年美国每10万人中仅有28.57人患中枢神经系统肿瘤,但是中枢神经系统恶性肿瘤中的82%是几乎无法治愈的胶质瘤。成人中最常见的神经胶质瘤的变体为胶质母细胞瘤,即使通过手术治疗,胶质母细胞瘤的患者确诊后的五年生存率仅为5.1%,所以迫切需要精准化的预测、诊断和治疗[1]。肿瘤形成相关联的代谢改变包含在细胞代谢的所有阶段。近年来实验和临床事实都支持胶质瘤

关键词：神经胶质瘤高效液相色谱-串联质谱代谢组学

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C57BL/6J小鼠慢性束缚应激抑郁症模型的建立

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中国医学科学院学报 2015年第1期37卷 8-11页

作者：孙楠楠沙龙泽许琪中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的通过慢性束缚应激（CRS）建立C57BL/6J小鼠抑郁症模型。方法 C57BL/6J小鼠经体重、糖水偏好、旷场实验初筛后从中选择20只小鼠并随机分为正常对照（NC）组和CRS组2组,每组10只。对CRS组小鼠进行连续21 d,每天4 h的束缚刺激,并最终... 详细信息

目的通过慢性束缚应激（CRS）建立C57BL/6J小鼠抑郁症模型。方法 C57BL/6J小鼠经体重、糖水偏好、旷场实验初筛后从中选择20只小鼠并随机分为正常对照（NC）组和CRS组2组,每组10只。对CRS组小鼠进行连续21 d,每天4 h的束缚刺激,并最终进行糖水偏好检测和强迫游泳检测。结果 CRS组小鼠在水中不动的时间为（131.70±21.65）s,明显长于NC组的（68.88±8.43）s（P=0.0304）。CRS组小鼠0～24 h和0～48 h的糖水偏好百分比分别为（66.21±3.24）%和（73.25±1.50）%,均明显低于NC组的（79.46±3.85）%（P=0.0196）和（80.20±2.26）%（P=0.0248）。结论通过慢性束缚应激成功建立C57BL/6J小鼠抑郁症模型。

关键词：抑郁症慢性束缚应激 C57BL/6J小鼠行为学检测

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TXNDC5介导缺血清诱导的HeLa细胞增殖抑制

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中国医学科学院学报 2014年第5期36卷 470-476页

作者：张红飞张洁雯孔丽娟王乐朱宁郭思超邱川闫雪静陈梅红中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的研究TXNDC5在缺血清诱导的HeLa细胞增殖抑制过程中的作用。方法在人HeLa细胞中分别过表达TXDNC5或用干扰小RNA(siRNA)抑制TXDNC5的表达后,对其进行正常或缺血清培养,采用Western blot法检测TXDNC5蛋白水平,荧光实时定量PCR检测TXDNC... 详细信息

目的研究TXNDC5在缺血清诱导的HeLa细胞增殖抑制过程中的作用。方法在人HeLa细胞中分别过表达TXDNC5或用干扰小RNA(siRNA)抑制TXDNC5的表达后,对其进行正常或缺血清培养,采用Western blot法检测TXDNC5蛋白水平,荧光实时定量PCR检测TXDNC5 mRNA水平,细胞增殖检测试剂盒(MTS法)检测活细胞数,流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡。结果缺血清诱导HeLa细胞增殖抑制时,TXNDC5 mRNA水平下降(P<0.05),蛋白水平显著升高,TXNDC5 mRNA的稳定性不受影响,而放线菌酮则可消除缺血清诱导TXNDC5蛋白水平升高的作用。在HeLa细胞中过表达TXNDC5对细胞增殖速度无影响。抑制TXNDC5的表达能减弱缺血清诱导的HeLa细胞增殖抑制(P<0.05),使S期细胞比例略有增加(P<0.05),但对细胞凋亡没有明显影响。结论 TXNDC5介导了缺血清诱导的HeLa细胞增殖抑制。

关键词： TXNDC5 HeLa细胞缺血清细胞增殖

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对胆囊收缩素受体A基因进行深度测序寻找精神分裂症相关位点

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中国医学科学院学报 2014年第5期36卷 466-469页

作者：陈凤萍吴霖沈岩许琪中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的对与精神分裂症相关的胆囊收缩素受体A基因(CCKAR)进行深度测序,寻找精神分裂症相关位点。方法采用Haloplex目标富集系统对8个病例样本与8个正常对照样本进行CCKAR区域的深度测序,利用IGV软件去除结果中的假阳性,然后利用Unphased... 详细信息

目的对与精神分裂症相关的胆囊收缩素受体A基因(CCKAR)进行深度测序,寻找精神分裂症相关位点。方法采用Haloplex目标富集系统对8个病例样本与8个正常对照样本进行CCKAR区域的深度测序,利用IGV软件去除结果中的假阳性,然后利用Unphased软件进行分析。结果深度测序后得到103个变异位点,其中30个变异位点位于CCKAR基因上,发现了可能与精神分裂症相关的位点rs191275118。结论发现了新的可能与精神分裂症相关的位点,对CCKAR基因研究资料进行了补充。

关键词：精神分裂症胆囊收缩素受体A基因深度测序变异位点

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利用RIP-Chip筛选结合多聚胞嘧啶结合蛋白2的microRNAs

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基础医学与临床 2014年第6期34卷 834-839页

作者：韩为林细华阴彬彭小忠中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的通过核糖核蛋白免疫沉淀-芯片技术(RIP-Chip)在人正常神经胶质细胞(HA)和神经胶质瘤细胞(T98G和U87MG)中筛选与多聚胞嘧啶结合蛋白2(PCBP2)相互作用的microRNA(miRNA)。方法选择兔抗人PCBP2抗体,用Western blot法检测PCBP2蛋白在HA... 详细信息

目的通过核糖核蛋白免疫沉淀-芯片技术(RIP-Chip)在人正常神经胶质细胞(HA)和神经胶质瘤细胞(T98G和U87MG)中筛选与多聚胞嘧啶结合蛋白2(PCBP2)相互作用的microRNA(miRNA)。方法选择兔抗人PCBP2抗体,用Western blot法检测PCBP2蛋白在HA、T98G和U87MG细胞中的表达。用兔Ig G作为阴性对照,收集3种细胞的RIP蛋白和RNA样品,通过Western blot检测PCBP2蛋白富集效果,利用Nano Drop定量并经Agilent2100检测RNA完整性。选择Affymetrix miRNA 3.0芯片对RNA样品进行杂交,筛选富集4倍以上且P<0.05的miRNA。结果用PCBP2抗体进行RIP-Chip实验,最终筛选和PCBP2相互作用的103条miRNA,1条前体miRNA和1条核仁小分子RNA;其中15条存在PCBP2的结合位点。结论 PCBP2可以通过识别靶序列或者以核糖核蛋白复合物形式在细胞内结合成熟的miRNA、前体miRNA或核仁小分子RNA。

关键词： PCBP2 microRNA RIP-Chip 神经胶质瘤

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SUN结构域家族蛋白研究进展

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中国细胞生物学学报 2014年第10期36卷 1413-1421页

作者：沙志强许琪中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

SUN(Sad-1,UNC-84)结构域家族蛋白是一种广泛分布于酵母、线虫等真核生物的膜蛋白,主要定位于细胞核膜以及内质网。由于在酵母中发现Sad-1突变后的表型与线虫中UNC-84突变的表型一致,并且两者C-端有近一半的同源相似性,因此得名SUN结构... 详细信息

SUN(Sad-1,UNC-84)结构域家族蛋白是一种广泛分布于酵母、线虫等真核生物的膜蛋白,主要定位于细胞核膜以及内质网。由于在酵母中发现Sad-1突变后的表型与线虫中UNC-84突变的表型一致,并且两者C-端有近一半的同源相似性,因此得名SUN结构域,其家族成员也都具有SUN结构域。根据SUN结构域所在家族成员中蛋白质一级序列位置的不同,分为经典及非经典家族蛋白,经典的家族蛋白一般通过与KASH(Klarsicht、ANC-1、Syne homology)蛋白相互作用行使功能。越来越多的研究结果表明,SUN蛋白可能参与核膜锚定、核膜重塑、细胞迁移和DNA损伤修复等过程,其形成的复合体与人类进行性肌营养不良等疾病的发生发展也有紧密联系。该文就SUN家族各成员蛋白的结构特性以及功能特点的研究进展进行简要综述。

关键词： SUN结构域核膜锚定细胞迁移进行性肌营养不良

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