检索结果-内蒙古大学图书馆

基础医学与临床 2022年第7期42卷 1020-1025页

作者：张宇飞朱基彦瞿思遥张祝琴刘德培中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室生物化学与分子生物学系北京100005

目的通过构建铜缺乏的细胞模型探究是否存在铜依赖的酶参与铜缺乏导致的心肌肥厚的发生。方法使用CRISPR/Cas9技术,构建Ctr1基因敲除的大鼠心肌细胞株H9c2(Ctr1^(-/-));收集野生型(WT)、Ctr1^(-/-)、铜螯合剂TTM处理的H9c2细胞中的蛋白... 详细信息

目的通过构建铜缺乏的细胞模型探究是否存在铜依赖的酶参与铜缺乏导致的心肌肥厚的发生。方法使用CRISPR/Cas9技术,构建Ctr1基因敲除的大鼠心肌细胞株H9c2(Ctr1^(-/-));收集野生型(WT)、Ctr1^(-/-)、铜螯合剂TTM处理的H9c2细胞中的蛋白质,通过铜亲和树脂蛋白质结合实验联合质谱分析筛选铜依赖的酶;通过Western blot检测缺铜细胞中该酶的下游信号通路。结果成功构建Ctr1基因敲除的H9c2细胞株,该细胞株中铜含量显著降低(P<0.05);质谱分析筛选出能与铜相互作用的去泛素化酶OTUB1;铜缺乏的H9c2细胞中泛素化水平升高;铜缺乏条件下H9c2细胞中OTUB1靶蛋白DEPTOR水平下降;mTOR信号通路激活。结论去泛素化酶OTUB1参与铜缺乏的细胞应答,提示其可能参与铜缺乏引起的心肌肥厚的发生。

关键词：铜心肌肥厚 OTUB1

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肝细胞癌中EZH2基因相关的表观遗传调控机制

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基础医学与临床 2022年第6期42卷 864-870页

作者：赵钰珊冀梦蝶董昱诚郭鑫宋博渊陈阳中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005

目的结合肝细胞癌公共数据分析与生物实验,初步探索肝细胞癌中EZH2基因的表观遗传调控机制。方法使用TCGA公共数据分析EZH2基因表达与肝细胞癌进展和预后之间的关系。随后,使用ATP细胞活性检测法、结晶紫法分析EZH2抑制剂GSK343对肝细... 详细信息

目的结合肝细胞癌公共数据分析与生物实验,初步探索肝细胞癌中EZH2基因的表观遗传调控机制。方法使用TCGA公共数据分析EZH2基因表达与肝细胞癌进展和预后之间的关系。随后,使用ATP细胞活性检测法、结晶紫法分析EZH2抑制剂GSK343对肝细胞癌细胞系HepG2细胞活性和增殖的影响。之后,分析TCGA公共数据样本中EZH2高表达组和低表达组之间的差异表达基因。其后,使用ENCODE中的ChIP-seq公共数据分析EZH2下游靶基因转录起始位点上的组蛋白修饰特征。最后,用RT-qPCR检测受到EZH2调控的下游靶基因的基因表达。结果EZH2基因表达与肝细胞癌1~3期的病程进展显著相关(P<0.05);生存分析表明EZH2基因高表达与肝细胞癌预后不良显著相关(P<0.05);EZH2抑制剂能够显著抑制肝细胞癌细胞系HepG2的体外细胞活力和增殖能力(P<0.05);EZH2结合的基因转录起始位点上富集组蛋白修饰H3K27me3;163个基因在其转录起始位点附近存在EZH2结合信号,同时这些基因也在EZH2高表达组和低表达组之间显著差异表达;实验验证ADRA1A是EZH2的下游靶基因。结论在肝细胞癌中EZH2基因可以通过表观遗传调控影响其下游靶基因的表达。

关键词：肝细胞癌 zeste同源蛋白2增强子表观遗传调控

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NF-κB抑制剂通过逆转LPS诱导的BMPRⅡ下调改善肺血管重构

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生理学报 2020年第5期72卷 541-550页

作者：周美君邢岩江杨隽中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院医学分子生物学国家重点实验室中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础医学院细胞生物学系医学分子生物学国家重点实验室浙江大学医学院基础医学院生理学系浙江大学医学院附属第二医院心内科

动脉性肺动脉高压(pulmonary arterial hypertension, PAH)的发生、发展与骨形态发生蛋白受体II型(bone morphogenetic protein receptor type II, BMPRII)编码基因的遗传突变和核因子κB (nuclear factorκB, NF-κB)通路介导的炎症反应密切相关。本文旨在研究NF-κB通路抑制剂对脂多糖(lipopolysaccharide, LPS)诱导的肺动脉内皮细胞损伤的作用。用1μg/mL的LPS处理人肺动脉内皮细胞,用免疫印迹和qPCR检测BMPRII和白介素8 (interleukin-8, IL-8)的表达水平。腹腔注射野百合碱(monocrotaline, MCT)建立大鼠PAH模型,用免疫荧光染色法检测肺动脉内皮细胞BMPRII和IL-8的表达情况,检测模型大鼠心脏血流动力学变化和肺血管重构情况。结果显示,LPS可引起人肺动脉内皮细胞BMPRII的表达下调和IL-8的表达上调,NF-κB抑制剂BAY11-7082 (10μmol/L)可逆转LPS的作用。在MCT-PAH大鼠模型中,肺动脉内皮细胞BMPRII表达下调,IL-8表达上调,右心室/(左心室+室间隔)重量比值[weight ratio of right ventricle to left ventricle plus septum, RV/(LV+S)]和右心室收缩压(right ventricular systolic pressure, RVSP)显著升高,心输出量(cardiac output, CO)和三尖瓣环收缩期位移(tricuspid annular plane systolic excursion, TAPSE)明显降低,肺血管壁明显增厚,连续21天腹腔注射BAY11-7082 (5 mg/kg)可逆转上述变化。以上结果提示,LPS通过NF-κB信号通路下调BMPRII的表达水平,促进PAH的发生、发展,因此NF-κB信号通路可作为PAH潜在治疗靶点。

关键词：肺动脉高压骨形态发生蛋白受体Ⅱ型核因子κB信号通路 BAY11-7082

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mTOR活化上调MGST1并增强细胞抗氧化能力

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基础医学与临床 2022年第4期42卷 553-559页

作者：李杰浦洋张梦迪张鹏举许寅喆中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生理学系北京100005 解放军总医院第一医学中心肝胆胰外科医学部全军肝胆外科研究所全军数字肝胆外科重点实验室北京100853

目的探讨雷帕霉素靶蛋白(mTOR)过度活化导致细胞抗氧化能力增强的分子机制。方法使用Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中的芯片数据分析mTOR活化细胞与对照细胞的差异基因并进行功能通路富集分析。使用反应活性氧(ROS)诱导剂高剂量... 详细信息

目的探讨雷帕霉素靶蛋白(mTOR)过度活化导致细胞抗氧化能力增强的分子机制。方法使用Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中的芯片数据分析mTOR活化细胞与对照细胞的差异基因并进行功能通路富集分析。使用反应活性氧(ROS)诱导剂高剂量亚精胺处理细胞,观察mTOR高活化细胞TSC2敲除的小鼠胚胎成纤维细胞(tsc2^(-/-)MEFs)的抗氧化能力。利用差异表达基因之间的蛋白质相互作用筛选核心基因。使用q-PCR和Western blot验证该核心基因在tsc2^(-/-)MEFs中的表达情况。在tsc2^(-/-)MEFs中构建该核心基因的敲低细胞系并检测该基因对细胞增殖和抗氧化能力的影响。利用The Cancer Genome Atlas(TCGA)的RNA-seq和临床数据分析该基因对肝癌和黑色素瘤患者预后的影响。结果mTOR活化细胞中参与氧化还原通路的基因显著上调。mTOR活化的细胞对高剂量亚精胺更耐受(P<0.05)。分析筛选出该通路中差异表达的核心基因MGST1(P<0.05)。MGST1的表达在mTOR活化细胞中较对照细胞系显著增强(P<0.05)。在Rapamycin处理的mTOR活化细胞中,MGST1的表达水平下降。tsc2^(-/-)MEFs敲低MGST1后对氧化应激更敏感(P<0.05)。在TCGA的肝癌和黑色素瘤数据中发现,MGST1高表达的患者生存期低于低表达患者(P<0.01)。结论mTOR活化可以促进MGST1的表达使细胞的抗氧化能力增强。

关键词： mTOR 氧化应激 MGST1

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中国遗体捐献的过去、现在与未来

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基础医学与临床 2021年第9期41卷 1356-1359页

作者：张翰林王乃利张迪刘润竹崔欢唐珂韵曹承刚马超中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院人体解剖与组织胚胎学系北京100005 北京协和医学院北京100730 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院实验教学中心形态实验室北京100005

解剖实验课程的顺利进行离不开遗体,遗体捐献是国内大体标本的主要来源。自20世纪70年代起,志愿遗体捐献在国内逐步推广,为解剖教学的开展和医学生的培养提供了重要支持。本文从早期起步、伦理与法律、资料统计与问卷调查、人文关怀与... 详细信息

解剖实验课程的顺利进行离不开遗体,遗体捐献是国内大体标本的主要来源。自20世纪70年代起,志愿遗体捐献在国内逐步推广,为解剖教学的开展和医学生的培养提供了重要支持。本文从早期起步、伦理与法律、资料统计与问卷调查、人文关怀与人文教育、问题与对策5个方面,对中国遗体捐献的实施与研究情况进行了文献回顾,为国内遗体捐献事业的发展提供参考与借鉴。

关键词：遗体捐献中国解剖实验解剖学教学

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基于随机森林算法的中国女性尿失禁发病危险因素研究

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中华妇产科杂志 2021年第8期56卷 554-560页

作者：庞海玉朱兰徐涛刘青李兆艾龚健王玉玲汪俊涛夏志军郎景和中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院医学科学研究中心疑难重症及罕见病国家重点实验室 100730 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院妇产科国家妇产疾病临床研究中心 100730 中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院流行病及统计学系 100005 甘肃省妇幼保健院妇产科兰州730050 山西省儿童医院山西省妇幼保健院妇产科太原030013 南京医科大学附属无锡妇幼保健院妇产科 214001 广东省佛山市妇幼保健院妇产科 528000 贵阳市妇幼保健院妇产科 550001 中国医科大学附属盛京医院妇产科沈阳110004

目的应用机器学习中的随机森林算法探讨中国女性尿失禁(UI)发病的危险因素,并评价各危险因素对于UI发病的预测效果。方法采用多阶段分层整群抽样,在全国调查55477例成年女性UI情况;基线调查于2014年2月至2016年1月完成,2018年6月至12月... 详细信息

目的应用机器学习中的随机森林算法探讨中国女性尿失禁(UI)发病的危险因素,并评价各危险因素对于UI发病的预测效果。方法采用多阶段分层整群抽样,在全国调查55477例成年女性UI情况;基线调查于2014年2月至2016年1月完成,2018年6月至12月电话随访;最终纳入基线无UI且随访UI诊断指标数据完整的对象。采用欠采样技术,按照1∶1的比例从随访时未发生UI的人群中随机抽取与随访对新发UI相等人数作为对照,将这些调查对象的研究数据按照7∶3的比例随机分成训练集和测试集。将单因素分析中P<0.2的候选变量,带入训练集并采用随机森林算法建模,在训练集筛选UI发病的危险因素,根据重要性对危险因素排序,并在测试集中验证。结果共30658例(55.26%,30658/55477)完成随访,中位随访时间3.7年。纳入本研究的24985例基线无UI的对象中,随访调查UI发病人数为1757例(7.03%,1757/24985),其中压力性UI 1117例(4.47%,1117/24985),急迫性UI 243例(0.97%,243/24985),混合性UI 397例(1.59%,397/24985)。随机森林模型固定特征数量为2个、决策树数量为300棵时,平均袋外估计误差率最低,此时模型分类准确率为64.3%,敏感度为64.2%,特异度为64.4%。根据Gini系数平均下降量,得到预测UI发病的前10位影响因素依次为:年龄、分娩次数、分娩方式、体质指数(BMI)、绝经状态、糖尿病史、教育程度、盆腔手术史、城乡分布、婚姻状况。结论应用机器学习中的随机森林算法,从复杂的多因素中识别出预测中国女性UI发病的前10位影响因素,依次为:年龄、分娩次数、分娩方式、BMI、绝经状态、糖尿病史、教育程度、盆腔手术史、城乡分布、婚姻状况。

关键词：尿失禁危险因素随机分配算法机器学习纵向研究随机森林

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探索式教学模式在研究生生物医学大型仪器课程中的应用和评价

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基础医学与临床 2021年第3期41卷 459-462页

作者：孙海丹郭正光周军骈红茹杨明珠王欣郑直中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院中心实验室北京100005

目的尝试和评价生物医学大型仪器理论与实验课程的探索式教学(IT)模式,为该教学模式的常规实施提供依据。方法在课程中开展IT小实验,总结其设计、实施、效果等;采用教育测量学理论和统计学方法对问卷进行评价,采用信度、相关性和区分度... 详细信息

目的尝试和评价生物医学大型仪器理论与实验课程的探索式教学(IT)模式,为该教学模式的常规实施提供依据。方法在课程中开展IT小实验,总结其设计、实施、效果等;采用教育测量学理论和统计学方法对问卷进行评价,采用信度、相关性和区分度对问卷进行质量分析。结果IT小实验分别在2017级和2018级研究生选学本课程的部分学生中开展,取得了初步成果。参加人数达23人;问卷信度良好(α=0.852);27题项中有23题,与中间值比较,均有显著性差异(P<0.05)。结论问卷具有较好的区分度、信度、相关性和总体覆盖性,可用于评价教学中IT模式的需求。IT实验的合理设计、难度适中和时间安排是影响其实施效果的主要因素。

关键词：创新思维探索式教学问卷教学效果

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基于人工智能的心血管疾病预测模型研究现状

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蚌埠医科大学学报 2025年第1期50卷 6-13页

作者：彭石娟王小满高琴陈厚早蚌埠医科大学卫生管理学院安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学基础医学院生理学教研室安徽蚌埠233030 蚌埠医科大学心脑血管疾病基础与临床重点实验室安徽蚌埠233030 中国医学科学院基础医学研究所暨北京协和医学院生物化学与分子生物学系重大疾病共性机制研究国家重点实验室北京100005

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,... 详细信息

心血管疾病(CVD)是全球的主要死因,早期预测对CVD.预防、诊断和治疗至关重要。二十世纪末,研究者根据不同权重将多种危险因素组成风险评分来预测CVD风险,以便确定最有可能从预防性干预措施中获益的人群,为一些国家带来重大利益。然而,传统的风险模型通常无法捕捉危险因素之间的非线性关系。人工智能(AI)技术,特别是监督式机器学习和深度学习,为CVD预测提供了新视角和工具。近几年,基于电子病历、多模态影像等临床数据和衰老大数据可以准确地预测CVD的发病和死亡风险,因此,本文将从传统评分、基于AI的临床数据和衰老大数据的CVD预测模型研究现状分别进行阐述,为促进AI结合CVD提供思路。

关键词：心血管疾病人工智能预测模型衰老生物学年龄

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人肝癌细胞系HepG2和Huh7中的基因组拷贝数变异分析

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基础医学与临床 2023年第6期43卷 960-966页

作者：冀梦蝶苑赞卞晓翠杨玉容郭鑫王琦陈阳中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系医学分子生物学国家重点实验室北京100005 华中农业大学信息学院农业生物信息湖北省重点实验室湖北武汉430070

目的利用人肝细胞癌拷贝数变异和转录组实验,结合临床公共数据,探索肝细胞癌的拷贝数变异对肝癌发生发展的影响。方法用光学基因组图谱技术识别肝癌细胞系HepG2和Huh7中的拷贝数变异,随后分析两种细胞系拷贝数变异基因的功能,并根据富... 详细信息

目的利用人肝细胞癌拷贝数变异和转录组实验,结合临床公共数据,探索肝细胞癌的拷贝数变异对肝癌发生发展的影响。方法用光学基因组图谱技术识别肝癌细胞系HepG2和Huh7中的拷贝数变异,随后分析两种细胞系拷贝数变异基因的功能,并根据富集通路绘制蛋白质相互作用网络。选取两个细胞系核心网络中的关键基因,分析肝细胞癌拷贝数变异与基因表达之间的关系。GEPIA数据库分析基因表达与患者临床生存的关系。用RNA-seq实验和公共数据验证基因的表达水平。结果HepG2细胞主要存在拷贝数增加,相关基因富集在雌激素信号通路、金黄色葡萄球菌感染等通路;Huh7细胞系中既有拷贝数增加又有减少,相关基因主要富集嗅觉传导、细胞因子-细胞因子受体相互作用等通路。关键基因SRC、MAPK3和MAP3K7拷贝数与基因表达成正比,并且高表达这些基因的患者生存期显著降低(P<0.05)。相比于HEK293T细胞系,SRC、MAP3K7基因在两个肝癌细胞系的表达显著升高(P<0.001),提示了肝细胞癌的特异性变异,MAPK3无差异。结论肝细胞癌拷贝数变异基因SRC、MAP3K7的表达与患者的预后显著相关,可能影响肝细胞癌的发生发展和异质性。

关键词：肝细胞癌拷贝数变异光学基因组图谱技术基因表达

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国家发育和功能人脑组织资源库捐献者初步分析

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临床神经外科杂志 2021年第3期18卷 242-246页

作者：王乃利张翰林王雪张迪仇文颖马超中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所基础学院人体解剖与组织胚胎学系北京100005 中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所实验教学中心形态实验室中国医学科学院北京协和医学院基础医学研究所八年制临床医学专业中国医学科学院神经科学中心国家发育和功能人脑组织资源库

目的初步分析国家发育和功能人脑组织资源库的人口统计学特征,介绍脑库的管理与运行经验。方法对协和脑库自2012年12月—2020年12月的捐献登记数及实际遗体捐献数、实际脑组织捐献数进行统计,并对完成人脑组织捐献者的人口统计学资料进... 详细信息

目的初步分析国家发育和功能人脑组织资源库的人口统计学特征,介绍脑库的管理与运行经验。方法对协和脑库自2012年12月—2020年12月的捐献登记数及实际遗体捐献数、实际脑组织捐献数进行统计,并对完成人脑组织捐献者的人口统计学资料进行总结与分析。结果截至2020年12月31日,协和脑库累计收集保存人脑样本346例。捐献者中,80岁以上者占59.8%,本科及大专文化的占比37.0%,硕士及以上者占比4.9%。死亡原因以恶性肿瘤(29.2%)与心脑血管疾病(28.3%)占比较高,神经系统疾病仅占所有脑组织捐献者的8.7%。取材延误时间较短,12 h以内的占比56.1%,24 h以内的占比85.8%。结论协和脑库脑组织捐献者的人口统计学资料的总结与分析,可以反映中国人脑组织库建设与运行的现状,也可以更有针对性地了解并识别可能的捐献群体,为脑库的建设提供参考。协和脑库的管理与运行经验,主要包括对登记者与捐献者的宣传,以及脑库的自身管理与加强合作等方面,可助力中国脑计划的实施。

关键词：人脑组织库捐献者统计分析

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