检索结果-内蒙古大学图书馆

中国现代中药 2023年第6期25卷 1207-1217页

作者：王清武立伟范潘慧徐志超罗红梅孙伟王瑀郑司浩宋经元姚辉中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193 东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 中国中医科学院中药研究所北京100700 中国中药有限公司北京102600 中药资源教育部工程研究中心北京100193

目的:研究响应脱落酸(ABA)的甘草碱性亮氨酸拉链(GubZIPs)转录因子的基因表达差异,克隆并分析甘草关键酶基因的启动子序列,为解析bZIP转录因子调控甘草活性成分生物合成提供参考。方法:采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析甘... 详细信息

目的:研究响应脱落酸(ABA)的甘草碱性亮氨酸拉链(GubZIPs)转录因子的基因表达差异,克隆并分析甘草关键酶基因的启动子序列,为解析bZIP转录因子调控甘草活性成分生物合成提供参考。方法:采用实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析甘草毛状根中GubZIPs转录因子基因在外源ABA处理下的表达模式及在3年生甘草中的空间表达差异;利用TBtools软件从甘草基因组中提取关键酶基因的启动子片段并克隆,利用生物信息学分析启动子上潜在的关键调控元件。结果:甘草GubZIP1、GubZIP5、GubZIP33和GubZIP56基因在不同的ABA处理条件下表达模式不同,其中GubZIP1和GubZIP33的响应最为显著。分析GubZIPs基因在甘草不同组织的表达差异发现,GubZIP1和GubZIP5在根部高水平表达,GubZIP33和GubZIP56在叶中高水平表达。基于甘草基因组克隆获得甘草生物合成途径中关键酶查耳酮异构酶(CHI)、查耳酮合成酶(CHS)、β-香树脂醇合酶(β-AS)基因的启动子序列,分析结果显示,CHI基因的启动子区域有2个G-box和1个A-box顺式作用元件,CHS基因的启动子区域有2个ABRE和1个G-box顺式作用元件,β-AS基因的启动子区域有1个ABRE和1个G-box顺式作用元件。结论:甘草毛状根中GubZIP1、GubZIP5、GubZIP33和GubZIP56基因对ABA均有显著响应,采用50 mg·L^(–1)的ABA处理3 h是研究甘草中ABA相关通路较为适宜的方案。此外甘草的关键酶基因启动子上存在可与bZIP转录因子结合和响应ABA等激素的顺式作用元件;研究结果可为深入解析响应ABA的bZIP转录因子调控甘草活性成分生物合成的分子机制提供参考。

关键词：甘草毛状根亮氨酸拉链转录因子空间表达关键酶基因启动子

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艾比湖盐碱地肉苁蓉与锁阳土壤微生物群落分析

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药学学报 2021年第4期56卷 1178-1187页

作者：郑燕孙晓缪雨静江媛阿里穆斯黄林芳中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193 中药资源教育部工程研究中心北京100193 江西中医药大学江西南昌330000 大理大学云南大理671000 民族医药教育部重点实验室(中央民族大学) 中央民族大学药学院北京100081

为探讨极端生境-盐碱地下两种典型寄生药用植物肉苁蓉与锁阳的土壤微生物群落特点,本文基于微生物组-生态因子策略,对新疆艾比湖的肉苁蓉与锁阳土壤进行16S扩增子测序,分析土壤微生物群落的组成,并结合核心微生物组丰度及生态气候因子... 详细信息

为探讨极端生境-盐碱地下两种典型寄生药用植物肉苁蓉与锁阳的土壤微生物群落特点,本文基于微生物组-生态因子策略,对新疆艾比湖的肉苁蓉与锁阳土壤进行16S扩增子测序,分析土壤微生物群落的组成,并结合核心微生物组丰度及生态气候因子进行冗余分析和相关性分析。结果表明肉苁蓉土壤微生物群落多样性显著高于锁阳,肉苁蓉与锁阳核心微生物组为海单胞菌属Marinomona、盐单胞菌科Halomonadaceae、根瘤菌目Rhizobiales、嗜盐单胞菌属Halomonas及Acidimicrobiales。可区别二者土壤微生物群落的6个特异性生物标记物为微球菌科Micrococcacea、Echinicola及Glutamicibacter、Galbibacter,假交替单胞菌属Pseudoalteromonas、Marinobacterium_rhizophilum。冗余分析和相关性分析结果表明最干季度平均温度与最冷季度平均温度、粘土含量及土壤质地分类是影响肉苁蓉与锁阳土壤微生物群落组成的主要生态因子。本文为后期寻找肉苁蓉与锁阳的微生物分子标记,促进品质提高提供理论依据。

关键词：肉苁蓉锁阳土壤微生物群落生态因子

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基于全基因组的穿心莲NRAMP基因家族鉴定与生物信息学分析

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亚热带植物科学 2023年第3期52卷 175-182页

作者：范潘慧武立伟孙伟王瑀高巍邢建永宋经元姚辉中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193 中国中医科学院中药研究所北京100700 华润三九(六安)中药材产业发展有限公司安徽六安237000 华润三九现代中药制药有限公司广东惠州516000 中药资源教育部工程研究中心北京100193

自然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance associated macrophage protein,NRAMP)是一类广泛存在于动植物及微生物中重要的膜转运蛋白,在植物重金属离子转运和重新利用中起着重要作用。为探究穿心莲Andrographis paniculata的NRAM... 详细信息

自然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural resistance associated macrophage protein,NRAMP)是一类广泛存在于动植物及微生物中重要的膜转运蛋白,在植物重金属离子转运和重新利用中起着重要作用。为探究穿心莲Andrographis paniculata的NRAMP基因家族生物学特性,本研究根据拟南芥NRAMP家族的蛋白序列,从穿心莲全基因组中筛选鉴定了7个NRAMP家族成员,命名为ApNRAMP1~ApNRAMP7,并分析其基因结构和编码蛋白的理化性质等相关信息。结果表明,ApNRAMPs基因编码蛋白的长度为513~553 aa,分子量在56.00~60.54 kD之间,所有成员均定位于细胞膜上。系统进化分析表明,NRAMP基因家族分为2个亚家族。基因结构分析发现,属于GroupⅡ的ApNRAMP3~ApNRAMP6含有3个内含子,而属于GroupⅠ的ApNRAMP1、ApNRAMP2、ApNRAMP7则含有12个内含子;保守基序分析发现,Motif1~8保守基序存在于所有的ApNRAMPs编码的蛋白序列。蛋白结构预测分析发现,Ap NRAMPs蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲构成,三维结构较为相似。该研究结果为进一步解析ApNRAMPs基因参与镉胁迫响应的分子机制提供参考。

关键词：穿心莲 NRAMP基因家族鉴定生物信息学全基因组

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基于SNP双峰法的人参花西洋参花三七花及其混合物的快速鉴定

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中国现代中药 2021年第1期23卷 37-43页

作者：曹佩王刚白璇姣韩建萍中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193

目的:建立人参花、西洋参花、三七花及两两之间混合物的快速鉴定方法。方法:收集市售人参花、西洋参花和三七花共计22份,获取样品内转录间隔区2(ITS2)序列。通过数据比对发现,在19~47 bp存在这3种花的单核苷酸多态性(SNP)位点,据此建立... 详细信息

目的:建立人参花、西洋参花、三七花及两两之间混合物的快速鉴定方法。方法:收集市售人参花、西洋参花和三七花共计22份,获取样品内转录间隔区2(ITS2)序列。通过数据比对发现,在19~47 bp存在这3种花的单核苷酸多态性(SNP)位点,据此建立混合粉末的双峰法检测方法,判断混合物的物种组成。结果:市售22份商品的DNA条形码序列经BLAST鉴定均为正品,但经SNP位点分析发现,有2份西洋参花样品(S1和S7)SNP位点处出现双峰[胸腺嘧啶(T)/胞嘧啶(C)]、(C/T),判断掺杂有人参花。结论:SNP双峰法可以作为BLAST分析的补充手段,应用于混合物的鉴定,为花茶类产品的市场监管提供参考。

关键词：人参花西洋参花三七花单核苷酸多态性混合物

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DNA条形码技术在中药全产业链的应用进展

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药学学报 2020年第8期55卷 1784-1791页

作者：娄千辛天怡宋经元中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193 北京中医药大学北京102488 中药资源教育部工程研究中心北京100193

DNA条形码技术是通过一段标准的DNA序列进行生物物种鉴定的方法,在中药鉴定领域应用广泛,推动中药鉴定学的"文艺复兴"。中药全产业链包括上游中药种植、采收环节,中游中药材、中药饮片、中成药生产环节,以及下游中药流通与使... 详细信息

DNA条形码技术是通过一段标准的DNA序列进行生物物种鉴定的方法,在中药鉴定领域应用广泛,推动中药鉴定学的"文艺复兴"。中药全产业链包括上游中药种植、采收环节,中游中药材、中药饮片、中成药生产环节,以及下游中药流通与使用环节。DNA条形码技术以其准确、通用、客观的特点在中药全产业链各关键环节发挥作用。在产业链上游,对中药种子种苗、药用植物进行鉴定,保证源头正确;在产业链中游,对中药材、中药饮片以及中成药组方药进行鉴定,保证企业投料正确、临床用药安全;在产业链下游,参与构建中药溯源体系,实现中药"来源可查,去向可追",跟踪中药生产全过程,保障消费者权益,有助于中药监督管理。结合近年来具体研究实例,本文介绍DNA条形码技术在中药全产业链过程的应用,对促进中药产业现代化、推动中药国际化进程具有重要意义。

关键词： DNA条形码技术中药全产业链物种鉴定溯源

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DNA条形码技术在国家药品抽验中的应用研究

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药学学报 2021年第5期56卷 1497-1508页

作者：辛天怡闫海霞李冉郡娄千郝利军廖保生刘颖陈晶陈有根杜小伟郭洪祝傅欣彤宋经元中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193 北京市药品检验研究所国家药品监督管理局中成药质量评价重点实验室中药成分分析与生物评价北京市重点实验室北京102206 西南交通大学生命科学与工程学院四川成都610031 中国中医科学院中药研究所北京100700 中药资源教育部工程研究中心北京100193

国家药品抽验工作中发现中成药红金消结胶囊、红金消结片和柴黄颗粒处方中部分饮片来源复杂,存在掺伪现象,但常规检验方法难以确定混伪品基原物种。故本研究收集其处方中部分中药,包括柴胡、八角莲、黑蚂蚁和鼠妇虫饮片及相关药材样品18... 详细信息

国家药品抽验工作中发现中成药红金消结胶囊、红金消结片和柴黄颗粒处方中部分饮片来源复杂,存在掺伪现象,但常规检验方法难以确定混伪品基原物种。故本研究收集其处方中部分中药,包括柴胡、八角莲、黑蚂蚁和鼠妇虫饮片及相关药材样品184份,采用DNA条形码技术进行基原物种鉴定。结果显示,115份市售柴胡类药材及饮片获得111条ITS2序列,其中71份为柴胡(Bupleurum chinense)、3份为狭叶柴胡(***)、31份为同属混伪品,另检出非同属伪品臭椿(Ailanthus altissima)1份、防风(Saposhnikovia divaricata)2份、一枝黄花(Solidago decurrens)3份;22份市售八角莲药材样本获得21条ITS2序列,其中15份为混伪品南方山荷叶(Diphylleia sinensis)、6份为八角莲(Dysosma versipellis)等鬼臼属植物;22份市售黑蚂蚁饮片基因组DNA降解均未能获得COI序列;38份市售鼠妇虫饮片样本获得24条COI序列,其中9份为平甲虫(寻常卷甲虫Armadillidium vulgare)、11份为光滑鼠妇(Porcellio laevis)、2份为中华蒙潮虫(Mongoloniscus sinensis),另有2份不能判定物种。本研究证实中药材DNA条形码分子鉴定技术适用于中成药处方投料的基原鉴定,有助于建立中药材、中药饮片、中成药生产流通使用全过程追溯体系。

关键词：国家药品抽验 DNA条形码 ITS2 COI 市场监控

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基于网络药理学的2-(2-苯乙基)色酮类成分潜在作用靶点及作用机制预测

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世界科学技术-中医药现代化 2021年第7期23卷 2170-2180页

作者：肖梦君高志晖王灿红魏建和中国医学科学院&北京协和医学院药用植物研究所\中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室\濒危药材繁育国家工程实验室北京100193 中国医学科学院&北京协和医学院药用植物研究所海南分所\海南省南药资源保护与开发重点实验室\国家中医药管理局沉香可持续利用重点研究室海口570311

目的基于网络药理学方法预测2-(2-苯乙基)色酮类化合物的潜在作用靶点及可能干预疾病的作用机制。方法通过CNKI、Elsevier、Pub Med等数据库检索有生物活性的2-(2-苯乙基)色酮化合物,基于Swiss ADME平台进行ADME筛选;利用Swiss Target P... 详细信息

目的基于网络药理学方法预测2-(2-苯乙基)色酮类化合物的潜在作用靶点及可能干预疾病的作用机制。方法通过CNKI、Elsevier、Pub Med等数据库检索有生物活性的2-(2-苯乙基)色酮化合物,基于Swiss ADME平台进行ADME筛选;利用Swiss Target Prediction获得化合物的作用靶点;运用Metascape平台分析靶点富集的疾病类型、生物过程及通路;使用Cytoscape 3.8构建"活性化合物-靶点-疾病"网络图;通过Auto Dock进行分子对接验证。结果最终获得72个活性化合物,对应292个靶点,可能作用于抑郁、肿瘤、高血压等多种疾病,主要富集通路有与神经系统相关的神经活性配体-受体互作、5-羟色胺(5-hydroxytryptamine,5-HT)能突触等;与肿瘤相关的癌症通路、细胞周期等;与炎症免疫相关的TRP通道的炎症介质调节、IL-17信号通路等。核心靶点有HTR2B、HTR3A、ABCG2、PTGS2、DRD2、COMT等,分子对接验证显示结合能均小于-7.0 k J·mol^(-1),化合物与靶点的结合活性较好。结论本研究表明2-(2-苯乙基)色酮类化合物可能对神经精神类疾病、肿瘤、炎症等有干预治疗作用,体现了该类化合物多靶点、多通路、多功效的特点,为系统开展其药效及作用机制研究提供了参考。

关键词： 2-(2-苯乙基)色酮类化合物网络药理学潜在作用靶点干预疾病

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基于ISSR技术的白木香奇楠种质遗传多样性分析

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分子植物育种 2021年第15期19卷 5204-5212页

作者：张玉秀杨云吕菲菲康勇刘洋洋陈旭玉刘培卫魏建和中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所海南省南药资源保护与开发重点实验室国家中医药管理局沉香可持续利用重点研究室海口570311 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室濒危药材繁育国家工程实验室北京100193

本研究采用ISSR分子标记技术分析白木香奇楠种质的遗传多样性和亲缘关系。以4种常见的奇楠种质的16个居群为试验材料,普通白木香为对照,利用筛选出的10条ISSR引物进行PCR扩增,利用PopGene 32软件对不同居群的ISSR标记结果进行多态性分析... 详细信息

本研究采用ISSR分子标记技术分析白木香奇楠种质的遗传多样性和亲缘关系。以4种常见的奇楠种质的16个居群为试验材料,普通白木香为对照,利用筛选出的10条ISSR引物进行PCR扩增,利用PopGene 32软件对不同居群的ISSR标记结果进行多态性分析,通过NTsys 2.1软件的UPGMA方法聚类并构建亲缘关系树。研究结果显示:(1)10条ISSR引物共扩增出93条DNA条带,其中多态性条带77条,多态性程度达82.8%;(2)奇楠种质居群内的多态性位点百分率(PPB)、有效等位基因数(Ne)和Shannon's指数(I)等均显著低于普通白木香;奇楠居群间遗传分化系数(Gst)为0.8154,居群间每代个体的基因流系数(Nm)为0.1132;(3)除种质T41外,其他奇楠种质不同居群间的遗传一致性高、遗传距离小,在聚类图上各自聚为一支。白木香奇楠种质在物种水平上具有较高的遗传多样性,而在居群水平上的遗传多样性水平偏低,遗传变异较少。居群间(种质间)存在较大的遗传变异,且居群间基因流动性水平低。从特异性、一致性和稳定性来看,A11、R21和B31更符合林木新品种审定的要求。本研究的开展为白木香奇楠品种的引种栽培及良种选育提供了一定的分子生物学依据。

关键词：白木香奇楠 ISSR 遗传多样性

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相近石韦叶绿体基因组学分析

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中国实验方剂学杂志 2020年第5期26卷 123-131页

作者：杨楚虹崔英贤聂丽萍姚辉王瑀刘霞武汉理工大学化学化工与生命科学学院武汉430070 中国医学科学院&北京协和医学院药用植物研究所国家中医药管理局中药资源保护重点研究室北京100193

目的:测定相近石韦Pyrrosia assimilis叶绿体基因组,分析其序列特征并探讨相近石韦本草基因组学研究。方法:应用高通量测序技术对相近石韦进行了叶绿体全基因组测序,利用生物信息学方法分析其结构特征和系统发育关系。结果:相近石韦叶... 详细信息

目的:测定相近石韦Pyrrosia assimilis叶绿体基因组,分析其序列特征并探讨相近石韦本草基因组学研究。方法:应用高通量测序技术对相近石韦进行了叶绿体全基因组测序,利用生物信息学方法分析其结构特征和系统发育关系。结果:相近石韦叶绿体基因组呈环形双链结构,全长154964 bp,鸟嘌呤和胞嘧啶(GC)总量41.2%;共注释到131个基因,包括88个蛋白编码基因,35个转运RNA(tRNA)基因和8个核糖体RNA(rRNA)基因;共检测到43个散在重复序列和56个简单重复序列(SSR);编码亮氨酸的密码子使用频率最高,编码色氨酸的密码子数最少;叶绿体基因组全局比对分析筛选出5个高变异区(psb A,rrn16,pet A-psbJ,ndh C-trnM和psb M-petN);系统发育树显示相近石韦与波氏石韦***亲缘关系较近。结论:相近石韦叶绿体基因组中非编码区变异高于编码区,大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)变异大于反向重复区(IR),筛选出的5个高变区可作为石韦属物种鉴定的候选DNA条形码。相近石韦的叶绿体基因组学研究为其他石韦属药用植物在分子鉴定、遗传基因转化、抗性蛋白表达及次生代谢途径解析等方面的研究提供了参考。

关键词：本草基因组学相近石韦叶绿体基因组石韦属结构特征 DNA条形码系统发育树

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通体结香技术处理30 d产沉香的品质监测

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中国现代中药 2022年第6期24卷 1074-1082页

作者：何欣张燕孟慧魏建和吕菲菲刘培卫李浩凌陈波黄良明杨云中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室/濒危药材繁育国家工程实验室北京100193 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所海南分所海南省南药资源保护与开发重点实验室/国家中医药管理局沉香可持续利用重点研究室海南海口570311

目的:研究通体结香技术诱导沉香形成的作用过程。方法:根据《中华人民共和国药典》2020年版沉香质量标准,对通体结香技术处理30 d内产生的沉香样品进行性状、沉香四醇质量分数、结香面积比率、特征图谱分析,并对部分特征型倍半萜类和芳... 详细信息

目的:研究通体结香技术诱导沉香形成的作用过程。方法:根据《中华人民共和国药典》2020年版沉香质量标准,对通体结香技术处理30 d内产生的沉香样品进行性状、沉香四醇质量分数、结香面积比率、特征图谱分析,并对部分特征型倍半萜类和芳香类化合物进行含量测定。结果:通体结香技术处理白木香第4~5天,木间韧皮部和射线细胞出现树脂类物质,形成环形沉香层,沉香结香率由4.31%急剧上升至8.11%。结香30 d可形成明显的沉香层结构,薄层色谱和特征图谱结果与对照药材一致。沉香四醇质量分数在结香30 d内由0.001%增长至0.034%,整体呈上升趋势。部分芳香类化合物和沉香特征性倍半萜类化合物分别在第1~8天和第9~16天开始产生并累积。结论:通体结香技术处理30 d能够诱导沉香快速形成和稳定积累。

关键词：沉香通体结香技术动态监测形成规律

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