检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：罗焜马培姚辉宋经元陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室

植物DNA条形码(DNA barcoding)研究是近10年来进展最迅速的学科前沿之一,该技术已促进传统药用植物鉴定领域发生重大变革,随着该技术的发展,复合序列的使用方式已成为业内广泛关注的热点问题。2006年Newmnaster等提出"分级鉴定&qu... 详细信息

植物DNA条形码(DNA barcoding)研究是近10年来进展最迅速的学科前沿之一,该技术已促进传统药用植物鉴定领域发生重大变革,随着该技术的发展,复合序列的使用方式已成为业内广泛关注的热点问题。2006年Newmnaster等提出"分级鉴定"模式的复合序列使用构想,但该构想一直未有具体序列工作流程证实其效果。本研究采用国际通用的条形码rbcL、matK和psbA-tmH序列对百合科药用植物42属266种489样本进行鉴定研究,并对比"分级鉴定法"与"联合序列法"优劣。单一序列结果显示rbcL序列PCR成功率最高;psbA-trnH序列种间遗传距离明显大于种内,同时其物种水平鉴定成功率最高。复合序列使用方法考察结果说明,基于3条序列的"分级鉴定法"较"联合序列法"鉴定范围扩大了17倍,其物种水平鉴定成功样本数目扩大了14倍。本研究结果表明以rbcL序列为第一级鉴定序列,psbA-tmH、matK序列为第二级鉴定序列的分级DNA条形码鉴定模式非常适合百合科药用植物鉴定研究

关键词：百合科药用植物 DNA条形码分级鉴定

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龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析

龙骨马尾杉PcFPS1基因克隆及序列分析

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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会

作者：张鑫罗红梅殷秀梅宋经元中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室

龙骨马尾杉[Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching]为石杉科(Huperziaceae)马尾杉属植物,又称龙骨石松、大千金草、大伸筋草、裤带藤等,始载于《云南植物研究》,主要分布于热带地区,多年生常绿草本,丛生,外形犹如马尾。其中药化学成分包... 详细信息

龙骨马尾杉[Phlegmarirus carinatus(Desv.)Ching]为石杉科(Huperziaceae)马尾杉属植物,又称龙骨石松、大千金草、大伸筋草、裤带藤等,始载于《云南植物研究》,主要分布于热带地区,多年生常绿草本,丛生,外形犹如马尾。其中药化学成分包含石松生物碱及萜类成分,全草入药。龙骨马杉中含有的石杉碱甲(HupA)被临床证明是一种高效、高选择性的中枢乙酰胆碱酯酶抑制剂,具有治疗多种神经退行性疾病的潜在作用,可用于临床治疗重症肌无力、轻度老年痴呆症等。本研究对龙骨马尾杉(Phlegmarirus carinatus)法呢二磷酸合成酶(Famesyl diphosphate synthase,FPS)基因PcFPS1编码区进行克隆及序列分析。根据本实验室已获得的龙骨马尾杉转录组数据,从中获得1条编码FPS的转录本,采用RT-PCR方法获得该基因的编码区序列,并对PcFPS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。序列分析表明,所克隆的PcFPS1基因编码区长为1,119 bp,编码372个氨基酸残基,PcFPS1与挪威云杉(Picea abies)的FPS具有70%的序列相似性。生物信息学预测PcFPS1蛋白基本不含跨膜区,具有萜类合酶保守结构域,不含信号肽。本研究是国内外首次获得龙骨马尾杉PcFPS1基因的编码区序列,且为第一次在蕨类植物中克隆到FPS基因,为进一步研究PcFPS1在石杉科植物萜类及甾醇类化合物生物合成途径中的功能及鉴定酶活性位点奠定基础。

关键词：龙骨马尾杉法呢二磷酸合成酶 PcFPS1蛋白

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宁夏枸杞及其同属近缘物种ITS2条形码鉴定

宁夏枸杞及其同属近缘物种ITS2条形码鉴定

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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会

作者：辛天怡姚辉马晓冲韩建萍林余霖宋经元中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室

宁夏枸杞是药典规定的枸杞子药材的唯一基原,其近缘物种枸杞由于价格低廉,常作为枸杞子在市场上出售,是宁夏枸杞的主要混淆品。本研究收集宁夏枸杞及其同属近缘物种枸杞、黑果枸杞共74个样本(64份药材样本,10份叶片样本),采用植物基因组... 详细信息

宁夏枸杞是药典规定的枸杞子药材的唯一基原,其近缘物种枸杞由于价格低廉,常作为枸杞子在市场上出售,是宁夏枸杞的主要混淆品。本研究收集宁夏枸杞及其同属近缘物种枸杞、黑果枸杞共74个样本(64份药材样本,10份叶片样本),采用植物基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,扩增其ITS2序列并进行双向测序。所得序列经CodonCodeAligner拼接后,去掉两端的5.8S区和28S区,采用MEGA5.0软件进行序列比对,计算种内和种间K2P距离,并构建NJ树。结果表明,宁夏枸杞ITS2序列长度为230 bp,种内平均K2P距离0.004,远小于其与近缘物种种间平均K2P遗传距离0.049。NJ树显示,宁夏枸杞60个样本聚为一支,枸杞及黑果枸杞各自聚为一支,能够明显和宁夏枸杞区分开。因此,ITS2序列作为条形码为宁夏枸杞及其同属近缘物种的鉴别提供了新的技术手段,并能够保障临床用药安全。

关键词：宁夏枸杞 ITS2 DNA条形码鉴定

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基于ITS条形码序列的唐古特大黄遗传多样性分析

基于ITS条形码序列的唐古特大黄遗传多样性分析

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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会

作者：马晓冲宋经元辛天怡姚辉林余霖韩建萍中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室

通过克隆ITS序列对四川若尔盖白河牧场栽培的唐古特大黄进行序列比对和基因组内、基因组间的变异分析,为大黄属植物分子鉴定和遗传多样性研究奠定基础。本研究收集29个唐古特大黄叶片样本,采用植物基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,扩增... 详细信息

通过克隆ITS序列对四川若尔盖白河牧场栽培的唐古特大黄进行序列比对和基因组内、基因组间的变异分析,为大黄属植物分子鉴定和遗传多样性研究奠定基础。本研究收集29个唐古特大黄叶片样本,采用植物基因组DNA提取试剂盒进行DNA提取,扩增并克隆ITS序列进行双向测序,获得102条ITS克隆序列。所得序列经CodonCodeAligner拼接后,去掉低质量序列及引物区,采用MEGA5.0软件进行序列比对,计算种内和种间K2P距离,并构建NJ树。结果表明,唐古特大黄ITS序列G+C含量为57.00%-67.51%。29个样品基因组内平均K2P距离范围从0.000-0.2245,有69.0%的样品基因组内序列变异较小,有4个样品基因组内序列变异极大,最高达0.2245±0.1119。基因组间平均KP遗传距离值为0.1198±0.0714,31%的样品基因组内的遗传距离大于或接近基因组间的遗传距离。NJ树显示,102条克隆序列聚成两个大支,基因组内变异丰富。因此,ITS序列作为条形码为唐古特大黄遗传多样性分析提供了新的技术手段,显示出唐古特大黄基因组内存在丰富的遗传变异。

关键词：唐古特大黄 ITS DNA条形码遗传多样性

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现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用

现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用

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海峡两岸暨CSNR全国第十届中药及天然药物资源学术研讨会

作者：陈士林朱孝轩陈晓辰牛云云张鑫宋经元罗红梅孙超中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室

本文综述了DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克隆等现代生物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定等研究中的应用案例,表明现代生物技术为人参属药用植物的分子水平研... 详细信息

本文综述了DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克隆等现代生物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定等研究中的应用案例,表明现代生物技术为人参属药用植物的分子水平研究提供保证,揭示了人参属药用植物转录组及功能基因等遗传信息,加速了人参属药用植物基因组图谱绘制,为阐明人参属植物中重要次生代谢产物——人参皂苷合成的分子机制以及实现体外合成重要天然产物及未来新药物的研发奠定基础。

关键词：人参属药用植物现代生物技术 DNA条形码转录组高通量测序人参皂苷次生代谢合成途径功能基因

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三萜皂苷合成生物学元件的开发:三七鲨烯环氧酶编码基因克隆及表达模式分析

三萜皂苷合成生物学元件的开发:三七鲨烯环氧酶编码基因克隆及表...

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2012年中国药学大会暨第十二届中国药师周

作者：牛云云朱孝轩罗红梅孙超黄林芳陈士林中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室

中药合成生物学是将合成生物学思路引入中药天然产物次生代谢途径研究的一门新兴学科,其发展初期的首要任务是进行元件的开发与标准化,建立标准化的合成生物学元件库。三七Panax notoginseng作为人参属重要的药用植物,具有较高的药用价... 详细信息

中药合成生物学是将合成生物学思路引入中药天然产物次生代谢途径研究的一门新兴学科,其发展初期的首要任务是进行元件的开发与标准化,建立标准化的合成生物学元件库。三七Panax notoginseng作为人参属重要的药用植物,具有较高的药用价值,其主要活性成分是三萜皂苷。鲨烯环氧酶(Squaleneepoxide)被认为是三萜皂苷与植物甾醇次生代谢途径中的关键限速酶,是三萜皂苷合成生物学研究的重要元件之一。本研究克隆获得三七中参与三萜皂苷与植物甾醇合成途径的两种类型的鲨烯环氧酶编码基因(PnSE1、PnSE2);对其进行生物信息学分析,并通过实时荧光定量PCR(Real-time PCR)方法检测其在四年生三七不同组织部位的表达模式,以及受茉莉酸甲酯(MeJA)诱导处理后,基因的表达模式变化。PnSE1基因与PnSE2基因预测编码蛋白分别包含537和545个氨基酸,序列相似性为79%,但N端(前70个氨基酸)序列不保守。PnSE1基因在根、茎、叶、花中均有表达,以花中表达丰度最高;PnSE2基因表达只在花中显著,其余组织较弱。PnSE1基因响应MeJA诱导,诱导24小时后在叶中的表达量增加;相同诱导条件下,PnSE2基因未响应诱导,表达水平无显著变化。结果表明,PnSE1和PnSE2基因具不同的表达模式,在三七次生代谢产物合成中起不同作用,推测PnSE1基因有可能参与三萜皂苷合成途径,PnSE2基因则在甾醇合成途径中起催化作用。

关键词：合成生物学三七鲨烯环氧酶三萜皂苷基因表达

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肉苁蓉访花昆虫种类研究

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中国中药杂志 2012年第4期37卷 447-449页

作者：王霞徐荣陈君乔海莉徐常青刘同宁徐环李中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家重点实验室北京100193 宁夏永宁县本草苁蓉种植基地宁夏银川750100 中国农业大学农学与生物技术学院北京100193

目的:研究肉苁蓉花期访花昆虫种类。方法:田间捕捉肉苁蓉访花昆虫,扫描电镜观察肉苁蓉花粉形态和昆虫携带花粉种类。昆虫形态鉴定结合田间观察其行为,明确访花昆虫种类及其访花目的。结果:宁夏种植基地肉苁蓉主要访花昆虫共计35种,隶属... 详细信息

目的:研究肉苁蓉花期访花昆虫种类。方法:田间捕捉肉苁蓉访花昆虫,扫描电镜观察肉苁蓉花粉形态和昆虫携带花粉种类。昆虫形态鉴定结合田间观察其行为,明确访花昆虫种类及其访花目的。结果:宁夏种植基地肉苁蓉主要访花昆虫共计35种,隶属6目、14科。其中传粉昆虫5科24种,包括膜翅目的蜜蜂科、隧蜂科、地蜂科、准蜂科、切叶蜂科共21种和双翅目的食蚜蝇科3种。夜间未发现有昆虫访问肉苁蓉花序。结论:明确肉苁蓉传粉昆虫及访花昆虫种类,为肉苁蓉种子生产提供指导意义。

关键词：肉苁蓉访花昆虫访花目的

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采用ITS/ITS2条形码鉴定羌活药材的准确性与稳定性研究

采用ITS/ITS2条形码鉴定羌活药材的准确性与稳定性研究

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海峡两岸暨CSNR全国第十届中药及天然药物资源学术研讨会

作者：辛天怡姚辉罗焜向丽马晓冲韩建萍林余霖宋经元陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室

本文首次对ITS/ITS2条形码鉴定羌活药材的稳定性与准确性进行研究,选用31份羌活药材样本,提取基因组DNA,通过PCR扩增ITS序列,PCR产物双向测序,所得序列采用CodonCode Aligner进行拼接。ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型的HMMer注释方法... 详细信息

本文首次对ITS/ITS2条形码鉴定羌活药材的稳定性与准确性进行研究,选用31份羌活药材样本,提取基因组DNA,通过PCR扩增ITS序列,PCR产物双向测序,所得序列采用CodonCode Aligner进行拼接。ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型的HMMer注释方法获得。混伪品序列下载自GenBank。采用MEGA5.0软件对羌活药材及其混伪品进行序列比对,计算种内和种间距离,构建邻接(NJ)树。结果表明,羌活药材ITS序列长度为603-604bp,ITS2序列长度均为228bp,羌活药材ITS/ITS2序列单倍型与其两种基原植物叶片序列一致,并全部涵盖GenBank中相应物种提交的序列。二者种内平均K2P距离均远远小于其与混伪品的种间平均K2P距离;邻接(NJ)树显示羌活药材基原植物羌活、宽叶羌活与其混伪品均可明显区分,表现出良好单系性。因此ITS/ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别羌活药材,为其种质资源鉴定及临床安全用药提供了重要的分子依据。

关键词：羌活 ITS/ITS2 鉴定稳定性准确性

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现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用

现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用

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2012中国吉林·国际人参大会(2012 International Conference on Ginseng·Jinlin China)

作者：陈士林朱孝轩陈晓辰牛云云张鑫宋经元罗红梅孙超中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室北京 100193

关键词：人参属药用植物现代生物技术物种鉴定次生代谢产物酶功能

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分级鉴定模式下百合科药用植物DNA条形码鉴定研究

分级鉴定模式下百合科药用植物DNA条形码鉴定研究

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海峡两岸暨CSNR全国第10届中药及天然药物资源学术研讨会

作者：罗煜马培姚辉宋经元陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所，濒危药材繁育国家工程实验室，北京 100193

植物DNA条形码(DNA barcoding)研究是近10年来进展最迅速的学科前沿之一，该技术已促进传统药用植物鉴定领域发生重大变革，随着该技术的发展，复合序列的使用方式已成为业内广泛关注的热点问题。2006年Newmaster等提出“分级鉴定”模... 详细信息

植物DNA条形码(DNA barcoding)研究是近10年来进展最迅速的学科前沿之一，该技术已促进传统药用植物鉴定领域发生重大变革，随着该技术的发展，复合序列的使用方式已成为业内广泛关注的热点问题。2006年Newmaster等提出“分级鉴定”模式的复合序列使用构想，但该构想一直未有具体序列工作流程证实其效果。
　　本研究采用国际通用的条形码rbcL、matK和psbA-trnH序列对百合科药用植物42属266种489样本进行鉴定研究。并对比“分级鉴定法”与“联合序列法”优劣。单一序列结果显示rbcL序列PCR成功率最高;psbA-trnH序列种间遗传距离明显大于种内，同时其物种水平鉴定成功率最高。复合序列使用方法考察结果说明，基于3条序列的“分级鉴定法”较“联合序列法”鉴定范围扩大了17倍，其物种水平鉴定成功样本数目扩大了14倍。本研究结果表明以rbcL序列为第一级鉴定序列，psbA-trnH、matK序列为第二级鉴定序列的分级DNA条形码鉴定模式非常适合百合科药用植物鉴定研究。

关键词：百合科药用植物 DNA条形码分级鉴定

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