检索结果-内蒙古大学图书馆

作者：李秋实徐江朱英杰孙超宋经元陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室北京 100193

目的：估测赤芝基因组大小。方法：以药典规定的灵芝正品来源赤芝Ganoderma lucidum作为研究对象,利用已完成全基因组测序的黑曲霉Aspergillus niger作为内标,通过机械破碎菌丝体的方法获得合适浓度的细胞核悬液,碘化丙啶荧光染色后成... 详细信息

目的：估测赤芝基因组大小。方法：以药典规定的灵芝正品来源赤芝Ganoderma lucidum作为研究对象,利用已完成全基因组测序的黑曲霉Aspergillus niger作为内标,通过机械破碎菌丝体的方法获得合适浓度的细胞核悬液,碘化丙啶荧光染色后成功应用流式细胞术进行基因组大小估测。结果：经过优化材料培养、样品制备、上机分析等实验条件,估测得出赤芝基因组大小48.98±0.60Mb,为赤芝基因组学研究提供重要数据。结论：该方法简捷稳定,在蕈菌范围内,赤芝基因组大小估测值首次得到其全基因组测序数据与光学图谱结果验证,为蕈菌基因组学研究提供重要技术平台。

关键词：赤芝菌丝体基因组蕈菌基因流式细胞术

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西洋参达玛烷合酶PqDS1基因的克隆和生物信息学分析

西洋参达玛烷合酶PqDS1基因的克隆和生物信息学分析

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2012中国吉林·国际人参大会(2012 International Conference on Ginseng·Jinlin China)

作者：郭溆罗红梅吴琼孙超宋经元陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室北京100193

目的:克隆植物皂苷生物合成途径中的关键限速酶基因达玛烷合酶(Dammarenediol synthase,DS),并对其进行生物信息学分析。方法:本研究根据课题组已获得的西洋参(Panax quinquefolius)根的转录组数据中的DS1转录本序列,利用RT-PCR方法获... 详细信息

目的:克隆植物皂苷生物合成途径中的关键限速酶基因达玛烷合酶(Dammarenediol synthase,DS),并对其进行生物信息学分析。方法:本研究根据课题组已获得的西洋参(Panax quinquefolius)根的转录组数据中的DS1转录本序列,利用RT-PCR方法获得西洋参DS1基因的全长cDNA序列;并对PqDS1蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三维结构预测分析。结果:研究结果表明,克隆获得的西洋参DS/基因长为2,310bp,编码769个氨基酸,命名为PqDS1,GenBank登录号GU997679;PqDS1蛋白大小约为88.3kDa,等电点为6.39,蛋白结构预测结果表明PqDS1蛋白含有一个跨膜区,不具有信号肽;序列比对和进化关系分析表明西洋参PqDS1与人参、三七的相似性高,且系统进化关系较近,与植物自然进化关系保持一致。结论:本研究成功克隆了西洋参PqDSI的全长序列,并对其进行了生物信息学分析,为进一步阐明西洋参皂苷合成代谢途径奠定基础。

关键词：西洋参中药化学达玛烷合酶基因克隆皂苷合成生物信息学

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当归及其混伪品ITS2条形码鉴定

当归及其混伪品ITS2条形码鉴定

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2012转化医学与中药现代化高峰论坛

作者：辛天怡姚辉韩建萍宋经元陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室北京100193

目的：对常用中药当归及其混伪品进行分子鉴定，以确保该药材的质量及临床安全用药.方法：对ITS2序列进行PCR扩增，并将纯化后的PCR产物进行双向测序，运用CodonCode Aligner拼接后，基于HMMer注释方法去掉两端的5.8S区和28S区获得ITS2... 详细信息

目的：对常用中药当归及其混伪品进行分子鉴定，以确保该药材的质量及临床安全用药.方法：对ITS2序列进行PCR扩增，并将纯化后的PCR产物进行双向测序，运用CodonCode Aligner拼接后，基于HMMer注释方法去掉两端的5.8S区和28S区获得ITS2条形码，用MEGA5.0软件进行相关数据分析，构建NJ树.结果：当归与其混伪品ITS2条形码间存在明显差异，基于ITS2条形码构建的NJ树能够将当归及其混伪品区分开.结论：ITS2条形码可有效地鉴别中药当归及其混伪品，为保证其临床用药安全提供了新的技术手段.

关键词：当归条形码分子鉴定临床应用

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蛇床及其近缘物种的ITS2分子鉴定

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中国现代中药 2012年第3期14卷 9-11页

作者：殷秀梅罗焜刘美子罗红梅濒危药材繁育国家工程实验室中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 西南大学园艺园林学院重庆400716

目的:对传统中药蛇床子基原植物及其近缘物种的ITS2条形码序列进行分析,探讨药用植物蛇床子的分子鉴定方法。方法:采用PCR技术扩增蛇床ITS2基因片段,进行双向测序,运用CodonCodeAligner拼接后,用MEGA5.0软件进行相关数据分析,构建NJ树... 详细信息

目的:对传统中药蛇床子基原植物及其近缘物种的ITS2条形码序列进行分析,探讨药用植物蛇床子的分子鉴定方法。方法:采用PCR技术扩增蛇床ITS2基因片段,进行双向测序,运用CodonCodeAligner拼接后,用MEGA5.0软件进行相关数据分析,构建NJ树。应用Schultz等建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果:蛇床与其近缘物种ITS2序列间存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及其ITS2二级结构均可以将蛇床及其近缘物种区分开。结论:ITS2可有效地鉴别蛇床及其近缘物种。

关键词：蛇床近缘物种 DNA条形码 ITS2 鉴定

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冬虫夏草菌寄主小金蝠蛾人工饲养成虫生物学特性

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第1期14卷 1172-1176页

作者：向丽陈士林代勇韩开华王强陈学平周祖基叶萌周宇爝中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室北京100193 成都中医药大学中药学院成都610091 成都恩威投资(集团)有限公司成都610041 四川农业大学林学园艺学院雅安625014

小金蝠蛾是冬虫夏草菌的优良寄主之一,人工培育成虫能否正常交尾及产卵直接关系到种源的持续利用,是目前冬虫夏草人工培育产业的制约因子之一。本文通过对人工饲养小金蝠蛾两个世代(R1、R2)成虫的形态、羽化、交尾、产卵、寿命等生物学... 详细信息

小金蝠蛾是冬虫夏草菌的优良寄主之一,人工培育成虫能否正常交尾及产卵直接关系到种源的持续利用,是目前冬虫夏草人工培育产业的制约因子之一。本文通过对人工饲养小金蝠蛾两个世代(R1、R2)成虫的形态、羽化、交尾、产卵、寿命等生物学特征与其野生亲本进行比较,研究人工培育条件下小金蝠蛾成虫的交尾、产卵能力,为人工培育种源及种群的可持续利用提供依据。研究结果表明,人工饲养条件下小金蝠蛾成虫的平均体长、体重、含卵量、产卵量、寿命均为野生亲本>R1>R2,但在羽化、交尾、产卵等行为上野生亲本与R1、R2不存在明显差异;人工饲养两个世代幼虫的种群增长率分别为177.27%和117.56%,表明人工饲养条件下小金蝠蛾种群可实现持续利用。

关键词：小金蝠蛾人工饲养冬虫夏草菌生物学特性种群增长率

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灵芝GLUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析

灵芝GLUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析

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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会

作者：郭溆罗红梅陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所/濒危药材繁育国家工程实验室中国中医科学院中药研究所

本研究通过对灵芝的基因组测序结果进行分析,采用RT-PCR方法,对其中一条可能参与灵芝三萜合成的UDP-糖基转移酶基因转录本(GL25279)进行全长克隆,并对该基因编码蛋白的理化性质、蛋白二级结构及三维结构等进行了预测与分析。通过全长克... 详细信息

本研究通过对灵芝的基因组测序结果进行分析,采用RT-PCR方法,对其中一条可能参与灵芝三萜合成的UDP-糖基转移酶基因转录本(GL25279)进行全长克隆,并对该基因编码蛋白的理化性质、蛋白二级结构及三维结构等进行了预测与分析。通过全长克隆,得到一条开放阅读框为1 491 bp的eDNA序列,命名为GLUGT1。序列分析表明,该基因编码496个氨基酸,蛋白分子量为54.5544 kD,等电点为6.24,属于稳定蛋白。二级结构中α-螺旋占36.69%、β-折叠占11.49%、无规卷曲占51.81%。该蛋白不具有信号肽和跨膜区,最有可能定位在线粒体或者细胞质中。序列比对表明,该蛋白和云芝中的UDP-糖基转移酶EIW63452的相似度较高,为50%。本研究成功克隆并分析了灵芝UGT1的全长序列,为进一步研究灵芝三萜代谢途径奠定基础。

关键词：灵芝 UDP-糖基转移酶三萜合成

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本期专题讨论之一：中药资源可持续利用的技术研究

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世界科学技术-中医药现代化 2012年第1期14卷 1146-1146页

随着经济社会的发展,中药产业作为我国的民族产业,重要性日益突显。我国80%左右的中药材来自野生,其中大量的物种处于濒危状态,如冬虫夏草、川贝母、石斛、甘草、肉苁蓉等,资源走向衰竭。如何协调药材的可持续利用与生态环境保护的关系... 详细信息

随着经济社会的发展,中药产业作为我国的民族产业,重要性日益突显。我国80%左右的中药材来自野生,其中大量的物种处于濒危状态,如冬虫夏草、川贝母、石斛、甘草、肉苁蓉等,资源走向衰竭。如何协调药材的可持续利用与生态环境保护的关系,是中药资源可持续利用的关键问题之一。

关键词：可持续利用中药资源专题讨论生态环境保护中药产业经济社会冬虫夏草中药材

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人参HMGR基因克隆与表达分析

人参HMGR基因克隆与表达分析

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中药与天然药高峰论坛暨第十二届全国中药和天然药物学术研讨会

作者：罗红梅宋经元李雪莹孙超李春芳陈士林中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室北京100193 山东中医药高等专科学校烟台 264199 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室北京100193 中国中医科学院中药研究所北京100700

3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶 A 还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme-A reductase,HMGR)是甲羟戊酸途径中的第一个限速酶,直接催化人参皂苷的生物合成,是人参皂苷生物合成途径的限速酶之一.本研究克隆了人参(Panax ginseng)中... 详细信息

3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶 A 还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl Coenzyme-A reductase,HMGR)是甲羟戊酸途径中的第一个限速酶,直接催化人参皂苷的生物合成,是人参皂苷生物合成途径的限速酶之一.本研究克隆了人参(Panax ginseng)中一个新HMGR(命名为PgHMGR2)的编码区序列,并对其编码的蛋白进行生物信息学预测及基因表达分析.PgHMGR2与GenBank中的另一条HMGR的序列同源性仅为71.6％,因此,PgHMGR2是人参中HMGR基因家族的一个新成员.PgHMGR2基因全长l,770 bp,编码589个氨基酸残基.生物信息学预测PgHMGR2蛋白不含信号肽,包含两个跨膜区,具有HMGR催化作用的活性中心结构域.PgHMGR2与西洋参(Panax quinquefolius)的HMGR (ACV65036)具有99％的序列相似性.本研究是国内外首次获得的人参PgHMGR2基因的全长序列,为进一步鉴定PgHMGR2的功能奠定基础.

关键词： 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶人参人参皂苷合成生物学

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基于ITS2序列的积雪草及其混伪品的分子鉴定

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中国现代中药 2012年第3期14卷 12-14页

作者：陈晓辰陈倩韩建萍濒危药材等高育国家工程实验室中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所北京100193 湖北中医药大学湖北武汉430061

目的:快速准确的鉴别中药积雪草及其混伪品。方法:采用ITS2序列片段,对其进行PCR扩增、测序,运用CodonCode Aligner、MEGA4.1等软件进行序列拼接和分析,构建积雪草及其混伪品的NJ树。应用Koetschan等建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2... 详细信息

目的:快速准确的鉴别中药积雪草及其混伪品。方法:采用ITS2序列片段,对其进行PCR扩增、测序,运用CodonCode Aligner、MEGA4.1等软件进行序列拼接和分析,构建积雪草及其混伪品的NJ树。应用Koetschan等建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果:积雪草及其混伪品ITS2序列之间存在明显差异,不同积雪草样品在NJ树上独立聚为一支。结论:运用ITS2序列可以准确鉴定积雪草及其伪品。

关键词：积雪草 ITS2 混伪品分子鉴定

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多基原药材秦艽ITS2条形码鉴定研究

多基原药材秦艽ITS2条形码鉴定研究

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2012年中国药学大会暨第十二届中国药师周

作者：罗焜马培姚辉辛天怡胡燕郑司浩黄林芳刘军宋经元中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所濒危药材繁育国家工程实验室北京100193 广州白云山奇星药业有限公司广州510310

DNA 条形码技术的快速发展将促进我国中药材的质量控制和标准化建设，是国际生物分类和鉴定研究中引人注目的新方向，但目前为止该技术相关报道多采用中药材基原植物叶片进行鉴定研究，直接应用于中药材鉴定较少，业内广泛关注的采用DNA... 详细信息

DNA 条形码技术的快速发展将促进我国中药材的质量控制和标准化建设，是国际生物分类和鉴定研究中引人注目的新方向，但目前为止该技术相关报道多采用中药材基原植物叶片进行鉴定研究，直接应用于中药材鉴定较少，业内广泛关注的采用DNA 条形码技术鉴定中药材过程涉及的(i)如何从根茎类中药材中提取DNA;(ii)不同产地样本种内变异情况;(iii)采用DNA 条形码鉴定中药材时稳定性和准确性等研究报道不足。在此背景下，本文选取多基原中药材秦艽作为研究对象，广泛收集其主产区不同基原和其常见混伪品及其近缘种共86 个样品，改良传统DNA 试剂盒提取方法，对比植物DNA 条形码热点候选序列优劣，结果显示改良后的试剂盒法秦艽药材DNA 全部提取成功，通过BLAST 1 法100％成功鉴定秦艽药材及其混伪品，同时基于本研究建立的鉴定流程成功将药店购买秦艽药材样品鉴定到基原物种。

关键词：秦艽药材 ITS2 物种鉴定稳定性准确性

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